1.一種黃瓜綠斑駁花葉病LAMP引物,其特征在于包括:
正向外引物F3:5’TTTCCGCGAGTCCCTGTC3’;
反向外引物B3:5’AGTACGCTTTACGGCGTTAA3’;
正向內(nèi)引物FIP:
5’ACAGGACCGTTGAGGAAAGCG-TGCGTTACCCTCGTCTGTC3’;
其中所述正向內(nèi)引物FIP包含F(xiàn)1c和F2:
F1c:5’ACAGGACCGTTGAGGAAAGCG3’;
F2:5’TGCGTTACCCTCGTCTGTC3’;
反向內(nèi)引物BIP:
5’CGTTTCGCTTCTCAGCTCCACG-CGACTCAGCAGTCGTAGGA3’;
其中所述反向內(nèi)引物BIP包括含B1c和B2:
其中B1c:5’CGTTTCGCTTCTCAGCTCCACG3’;
B2:5’CGACTCAGCAGTCGTAGGA3’。
2.一種黃瓜綠斑駁花葉病LAMP試劑盒,其特征在于該試劑盒包括有:
其中所述引物包括:
正向外引物F3:5’TTTCCGCGAGTCCCTGTC3’;
反向外引物B3:5’AGTACGCTTTACGGCGTTAA3’;
正向內(nèi)引物FIP:
5’ACAGGACCGTTGAGGAAAGCG-TGCGTTACCCTCGTCTGTC3’;
其中所述正向內(nèi)引物FIP包含F(xiàn)1c和F2:
F1c:5’ACAGGACCGTTGAGGAAAGCG3’;
F2:5’TGCGTTACCCTCGTCTGTC3’;
反向內(nèi)引物BIP:
5’CGTTTCGCTTCTCAGCTCCACG-CGACTCAGCAGTCGTAGGA3’;
其中所述反向內(nèi)引物BIP包括含B1c和B2:
其中B1c:5’CGTTTCGCTTCTCAGCTCCACG3’;
B2:5’CGACTCAGCAGTCGTAGGA3’;
其中該試劑盒的產(chǎn)品規(guī)格:40次。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的黃瓜綠斑駁花葉病LAMP試劑盒,其特征在于所述的LAMP反應(yīng)液緩沖液由以下組分組成:
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的黃瓜綠斑駁花葉病LAMP試劑盒,其特征在于所述熒光染料為鈣黃綠素;所述酶溶液為Bst DNA聚合酶和AMV逆轉(zhuǎn)錄酶混合液。
5.一種黃瓜綠斑駁花葉病LAMP檢測方法,其特征在于包括以下步驟:
A、提取樣品RNA;
B、建立LAMP反應(yīng)體系:
按檢測所需的反應(yīng)量從權(quán)利要求2所述的試劑盒中分別取各種試劑,放入滅菌試管中,在冰上配制預(yù)混液;輕彈擊滅菌試管使其混勻,瞬時離心數(shù)秒使溶液集中在滅菌試管底部;20μL LAMP反應(yīng)體包括:
C、加樣:
在三個裝有20μL LAMP反應(yīng)體的滅菌試管中分別加入待檢測的待檢測樣品RNA、陰性對照反應(yīng)樣品、陽性對照反應(yīng)樣品各5μL,使各自的總量達到25μL,蓋上試管蓋輕擊混合,瞬時離心使反應(yīng)溶液集中在滅菌試管底部;其中陰性對照反應(yīng)使用黃瓜花葉病毒CGMMV的RNA,陽性對照反應(yīng)使用帶有CGMMVRNA的陽性對照,
D、擴增:
將步驟C中的滅菌試管放置在恒溫器中,在60-65℃下保持恒溫1小時,然后在80℃下保持恒溫5分鐘使酶滅活以終止反應(yīng);
E、檢測:
使用紫外線照射裝置從滅菌試管底部向上進行照射,佩戴紫外防護眼鏡從試管側(cè)面進行觀查;如果與陽性對照一樣發(fā)出綠光,則判定為陽性,如果與陰性對照一樣沒有發(fā)出熒光,而判定為陰性。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的黃瓜綠斑駁花葉病LAMP檢測方法,其特征在于步驟A中所述提取樣品RNA,具體按以下步驟提?。?/p>
a1、取0.1g的CGMMV和CMV感病組織加入1mL抽提緩沖液進行研磨;
a2、清洗納米磁珠:取出納米磁珠到PCR管中,用ddH2O反復(fù)清洗納米磁珠3次,在磁鐵的作用下吸去ddH2O;
a3、結(jié)合:加入100μL的樣品到PCR管中,用移液槍吸吐混勻樣品和納米磁珠,室溫下吸附;
a4、清洗:在磁鐵的作用下移去上清,納米磁珠清洗3次;
a5、裂解:加入50μL ddH2O到PCR管中,用移液槍吸吐混勻納米磁珠后,95℃,10min;
a6、取樣:用磁鐵吸附納米磁珠,待PCR管內(nèi)溶液澄清后,上清即為CGMMV和CMV的RNA。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的黃瓜綠斑駁花葉病LAMP檢測方法,其特征在于步驟E中紫外線照射裝置的紫外線范圍:波長240-260nm或350-370nm。
8.根據(jù)權(quán)利要求5所述的黃瓜綠斑駁花葉病LAMP檢測方法,其特征在于所述引物中外引物與內(nèi)引物的比例為1:2-1:10。
9.根據(jù)權(quán)利要求5所述的黃瓜綠斑駁花葉病LAMP檢測方法,其特征在于所述引物包括1.6μl正向外引物F3,1.6μl反向外引物B3,0.2μl正向內(nèi)引物FIP、0.2μl反向內(nèi)引物BIP。
10.根據(jù)權(quán)利要求5所述的黃瓜綠斑駁花葉病LAMP檢測方法,其特征在于步驟D中擴增溫度優(yōu)選為63℃。