小rna組成的指紋圖譜在胃癌中的應(yīng)用
【專利摘要】本發(fā)明涉及小RNA組成的指紋圖譜在人胃癌診斷和治療中的應(yīng)用,由數(shù)個microRNA組成的指紋圖譜可非常有效地區(qū)分胃癌組織和癌旁(正常)組織,靈敏度高,特異性強,可有效用于胃癌診斷。
【專利說明】
小RNA組成的指紋圖譜在胃癌中的應(yīng)用
技術(shù)領(lǐng)域
[0001] 本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)、生物工程和檢測技術(shù)領(lǐng)域。具體地,本發(fā)明公開了一組小 RNA(miRNA ;microRNA)指紋圖譜在人胃癌診斷中的用途。
【背景技術(shù)】
[0002] 目前,中國已經(jīng)成為全球胃癌高發(fā)區(qū),每年新發(fā)病例40萬,死亡30萬,且超世界 平均水平兩倍以上。并且胃癌發(fā)病有明顯的地域性差別,在我國的西北與東部沿海地區(qū)胃 癌發(fā)病率比南方地區(qū)明顯為高。好發(fā)年齡在50歲以上,男女發(fā)病率之比為2:1。過去半個 世紀(jì),人們對胃癌的基礎(chǔ)和臨床研究投入了大量精力,對胃癌潛在致癌因素有了一定了解 (如幽門螺旋桿菌)、胃癌高危人群的有效篩查和早診率的提高、外科手術(shù)和多種治療手段 的應(yīng)用,胃癌患者的預(yù)后有了顯著的提高,但總體的5年生存率仍然徘徊于20%。此外,大 部分胃癌患者依然難以早期發(fā)現(xiàn),據(jù)我們前期研究顯示,胃癌患者初診時60%病例合并淋 巴結(jié)轉(zhuǎn)移,而超過5%患者存在臟器轉(zhuǎn)移,即使行根治性切除,大部分患者還會出現(xiàn)復(fù)發(fā)和 轉(zhuǎn)移。
[0003] 胃癌的分期系統(tǒng)是由美國癌癥聯(lián)合委員會AJCC于國際抗癌聯(lián)盟UICC共同制定, 以胃癌數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ),并確切指出淋巴結(jié)陽性患者的預(yù)后和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的數(shù)目有關(guān)。現(xiàn)代 的胃癌分期是基于原發(fā)腫瘤/淋巴結(jié)/遠處轉(zhuǎn)移(TNM)的系統(tǒng),而不是以腫瘤的大小為基 礎(chǔ)。
[0004] 對于胃癌的基礎(chǔ)和臨床研究已有相當(dāng)長的歷史,并且取得了顯著的進展,尤其是 miRNAs在胃癌中的研究,近幾年進展較快,業(yè)已發(fā)現(xiàn)miRNAs在胃癌發(fā)生、轉(zhuǎn)移、診斷、評估 療效和判斷預(yù)后等方面發(fā)揮了極其重要的作用。
[0005] MicroRNA(miRNA)是一類長度約22個核苷酸的非編碼單鏈小分子RNA,調(diào)節(jié)約 60%的人類編碼基因,介導(dǎo)和調(diào)節(jié)多種病理生理反應(yīng)。MiRNAs在胃癌發(fā)生中起到促癌或者 抑癌的功能,通過調(diào)控相關(guān)基因的表達促進或抑制胃癌的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移。
[0006] 因此,深入挖掘胃癌發(fā)病相關(guān)miRNAs,并闡明其作用機制和臨床意義,對于指導(dǎo)胃 癌診療和評估預(yù)后具有重要的指導(dǎo)意義。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0007] 本發(fā)明提供了一組與胃癌發(fā)病相關(guān)的miRNA,利用這些miRNA的表達量可以準(zhǔn)確 地區(qū)分胃癌組織和癌旁組織。
[0008] 本發(fā)明第一方面,提供了一種miRNA集合或組合,所述的miRNA集合或組合包括:
[0009] (a) SEQ ID N0. : 1-9 所示的 9 個序列;或
[0010] (b)與SEQ ID N0. : 1-9所示序列互補的9個互補序列;或
[0011] (c)來自(a)或(b)的組合,且來自(a)的序列與來自(b)的互補序列互相不為互 補。
[0012] 在另一優(yōu)選例中,所述的miRNA集合或組合還包括:
[0013] (al) -種或多種選自SEQ ID NO. :10-12所示的序列;或
[0014] (bl) -種或多種選自與SEQ ID NO. :10-12所示序列互補的互補序列;或
[0015] (c2)來自(al)或(bl)的組合,且來自(al)的序列與來自(bl)的互補序列互相 不為互補。
[0016] 在另一優(yōu)選例中,所述的miRNA集合或組合含有SEQ ID N0. : 1-9所示的全部序 列。
[0017] 在另一優(yōu)選例中,所述的miRNA集合或組合包括:
[0018] ⑴序列如SEQ ID N0:1-12所示的12個序列;或
[0019] (i i)與SEQ ID N0:1-12所示序列互補的12個序列。
[0020] 在另一優(yōu)選例中,所述的miRNA分離自人。
[0021] 在另一優(yōu)選例中,所述的序列可通過化學(xué)合成或構(gòu)建真核細胞表達載體進行表達 獲得。
[0022] 本發(fā)明第二方面,提供了一種分離的或人工構(gòu)建的前體miRNA集合或組合,所述 的前體miRNA集合或組合中的前體miRNA能在人細胞內(nèi)剪切并表達成本發(fā)明第一方面所述 的miRNA集合或組合中的miRNA。
[0023] 本發(fā)明第三方面,提供了一種分離的多核苷酸集合或組合,所述的多核苷酸集合 或組合中的多核苷酸能被人細胞轉(zhuǎn)錄成前體miRNA,所述的前體miRNA能在人細胞內(nèi)被剪 切且表達成本發(fā)明第一方面所述miRNA集合或組合中的miRNA ;
[0024] 較佳地,所述的多核苷酸具有式I所示的結(jié)構(gòu):
[0025] Seq 正向-X-Seq 反向式 I,
[0026] 式 I 中,
[0027] Seq正向為能在人細胞中表達成所述的miRNA的核苷酸序列,
[0028] Seq反向為與Seq正向基本上互補或完全互補的核苷酸序列;
[0029] X為位于Seq正向和Seq反向之間的間隔序列,并且所述間隔序列與Seq正向和 Seq反向不互補,
[0030] 并且式I所示的結(jié)構(gòu)在轉(zhuǎn)入人細胞后,形成式II所示的二級結(jié)構(gòu):
[0031]
[0032] 式II中,Seq正向、Seq反向和X的定義如上述,
[0033] | |表示在Seq正向和Seq反向之間形成的堿基互補配對關(guān)系。
[0034] 本發(fā)明第四方面,提供了一種載體,它含有本發(fā)明第一方面所述的miRNA集合或 組合,或本發(fā)明第三方面所述的多核苷酸集合或組合。
[0035] 本發(fā)明第五方面,提供了一種miRNA芯片,所述的miRNA芯片包括:
[0036] 固相載體;以及
[0037] 有序固定在所述固相載體上的寡核苷酸探針,所述的寡核苷酸探針特異性地對應(yīng) 于SEQ ID N0:1-9所示全部序列。
[0038] 在另一優(yōu)選例中,所述的特異性地對應(yīng)指的是所述的寡核苷酸探針上的序列分別 與SEQ ID NO. :1-9所示的序列互補或基本互補;或分別與SEQ ID NO. :1-9所示序列相同。
[0039] 在另一優(yōu)選例中,所述的芯片還含有特異性針對一種或多種選自SEQ ID NO. :10-12所示序列的寡核苷酸探針。
[0040] 在另一優(yōu)選例中,所述的寡核苷酸探針含有:
[0041] 互補結(jié)合區(qū);和/或
[0042] 與固相載體相連的連接區(qū)。
[0043] 在另一優(yōu)選例中,所述的寡核苷酸探針特異性地對應(yīng)于SEQ ID N0:1-12所示的全 部序列。
[0044] 本發(fā)明第六方面本發(fā)明第一方面所述miRNA集合或組合;和/或本發(fā)明第五方面 所述miRNA芯片的用途,用于制備區(qū)分胃癌組織和癌旁組織的芯片或試劑盒。
[0045] 本發(fā)明第七方面,提供了一種試劑盒,所述的試劑盒中含有本發(fā)明第五方面所述 的miRNA芯片和/或用于本發(fā)明第一方面所述miRNA集合或組合的檢測試劑。
[0046] 在另一優(yōu)選例中,所述的試劑盒還含有本發(fā)明第一方面所述的miRNA集合或組合 用于陽性對照。
[0047] 在另一優(yōu)選例中,所述的試劑盒中還包括說明書,所述的說明書記載了利用本發(fā) 明miRNA芯片對SEQ ID NO. :1-12所示序列進行測試的方法。
[0048] 本發(fā)明第八方面,提供了一種篩選治療胃癌候選藥物的方法,所述方法包括以下 步驟:
[0049] (a)在實驗組中,在待測物質(zhì)存在下培養(yǎng)胃癌細胞;并且在對照組中,在與所述實 驗組條件相同但不存在所述待測物質(zhì)的情況下培養(yǎng)相同的胃癌細胞;
[0050] (b)測定所述實驗組中胃癌細胞的miRNA的表達水平,并與對照組中胃癌細胞的 miRNA的表達水平進行比較;
[0051] 其中,如果與所述對照組相比,所述實驗組中的所述miRNA的表達水平發(fā)生了趨 向于癌旁組織細胞的表達水平的變化,則表明所述待測物質(zhì)是抗胃癌的候選藥物。
[0052] 在另一優(yōu)選例中,所述的miRNA為本發(fā)明第一方面所述的miRNA集合或組合。
[0053] 在另一優(yōu)選例中,所述的"發(fā)生了趨向于癌旁組織細胞的表達水平的變化"指對于 某一 miRNA而言,滿足下式:
[0054] Q ^ 0. 6
[0055] 其中,Q = abs (A1-A0) /abs (A2-A0)
[0056] 式中,
[0057] A0為癌旁細胞中所述miRNA表達水平;
[0058] A1為實驗組的所述miRNA表達水平;
[0059] A2為對照組的所述miRNA表達水平;
[0060] abs表示絕對值。
[0061] 在另一優(yōu)選例中,當(dāng)所述miRNA為胃癌上調(diào)型(即A2-A0 > 0)時,則A1-A0彡0 或Q < 0. 6 (較佳地< 0. 5)。
[0062] 在另一優(yōu)選例中,當(dāng)所述miRNA為胃癌下調(diào)型(即A2-A0 < 0)時,則A1-A0彡0 或Q < 0. 6 (較佳地< 0. 5)。
[0063] 在另一優(yōu)選例中,在所述方法中,在步驟(a)中還包括陽性對照組,即在與所述實 驗組條件相同且不存在所述待測物質(zhì)但存在已知治療胃癌藥物的情況下,培養(yǎng)相同的胃癌 細胞;
[0064] 并且,在步驟(b)中還包括將所述實驗組中胃癌細胞的一種或多種miRNA的表達 水平,并與所述陽性對照組中胃癌細胞的miRNA的表達水平進行比較。
[0065] 本發(fā)明第九方面,提供了一種體外非診斷性的判斷細胞或組織是否為胃癌細胞或 組織的方法,包括步驟:測定所述的細胞或組織中本發(fā)明第一方面所述miRNA集合或組合 中miRNA的表達水平,當(dāng)所述的miRNA表達水平與正常組織或癌旁組織相比,具有顯著的差 異,則說明該細胞或組織是胃癌細胞或組織。
[0066] 本發(fā)明第十方面,提供了一種診斷胃癌樣本的方法,包括步驟:測定樣本中本發(fā)明 第一方面所述miRNA集合或組合中miRNA的表達水平,當(dāng)所述的miRNA表達水平與正常樣 本相比,具有顯著的差異,則說明該樣本為胃癌樣本。
[0067] 應(yīng)理解,在本發(fā)明范圍內(nèi)中,本發(fā)明的上述各技術(shù)特征和在下文(如實施例)中具 體描述的各技術(shù)特征之間都可以互相組合,從而構(gòu)成新的或優(yōu)選的技術(shù)方案。限于篇幅,在 此不再一一累述。
【附圖說明】
[0068] 圖1顯示了通過SVM模型和留一法交叉驗證法對12個選定的miRNA對胃癌區(qū)分:
[0069] 圖1A為通過SVM模型的方法得出基于留一法交叉檢驗得出胃癌組與正常對照組 比較結(jié)果的R0C曲線圖,y軸表示靈敏性,X軸表示特異性,AUC = 0. 985 ;
[0070] 圖1B為留一法交叉驗證結(jié)果基于SVM模型圖,y軸表示每個樣本的概率密度,X軸 表示SVM(支持向量機)算法之值,所有樣本(N = 61),被分為兩部分,紅色為癌癥樣本包括 21種胃癌細胞系,綠色為對照正常組織,錯誤率為4. 92% (61例樣品中錯3個)。
[0071] 圖2顯示了通過SVM模型和留一法交叉驗證法對9個選定的miRNA組合9A,對胃 癌區(qū)分:
[0072] 圖2A為通過SVM模型的方法得出基于留一法交叉檢驗得出胃癌組與正常對照組 比較結(jié)果的R0C曲線圖,y軸表示靈敏性,X軸表示特異性,AUC = 0. 988 ;
[0073] 圖2B為留一法交叉驗證結(jié)果基于SVM模型圖,y軸表示每個樣本的概率密度,X軸 表示SVM(支持向量機)算法之值,所有樣本(N = 61),被分為兩部分,紅色為癌癥樣本包括 21種胃癌細胞系,綠色為對照正常組織,錯誤率為6. 56% (61例樣品中錯4個)。
[0074] 圖3顯示了通過SVM模型和留一法交叉驗證法對9個選定的miRNA組合9B,對胃 癌區(qū)分:
[0075] 圖3A為通過SVM模型的方法得出基于留一法交叉檢驗得出胃癌組與正常對照組 比較結(jié)果的R0C曲線圖,y軸表示靈敏性,X軸表示特異性,AUC = 0. 924 ;
[0076] 圖3B為留一法交叉驗證結(jié)果基于SVM模型圖,y軸表示每個樣本的概率密度,X軸 表示SVM(支持向量機)算法之值,所有樣本(N = 61),被分為兩部分,紅色為癌癥樣本包括 21種胃癌細胞系,綠色為對照正常組織,錯誤率為13. 1 % (61例樣品中錯8個)。
【具體實施方式】
[0077] 本發(fā)明人通過廣泛而深入的研究,通過對近兩千個miRNA初篩以及近800個與胃 癌相關(guān)的miRNA的進一步篩選,首次篩選出數(shù)個特異性的miRNA,經(jīng)檢驗證明,將這些特異 性的miRNA標(biāo)志物進行一定的組合可非常有效地區(qū)分胃癌組織及癌旁組織。本發(fā)明提出了 miRNA組成的指紋圖譜在胃癌診斷中的應(yīng)用,而圍繞小RNA的表達可以通過熒光定量PCR反 應(yīng)檢測,提供在胃癌檢測中的應(yīng)用。在此基礎(chǔ)上,完成了本發(fā)明。
[0078] miRNA及其前體
[0079] 本發(fā)明提供了一組新的與胃癌相關(guān)的miRNA。如本文所用,所述的"miRNA"是指一 種RNA分子,從可形成miRNA前體的轉(zhuǎn)錄物加工而來。成熟的miRNA通常具有18-26個核 苷酸(nt)(更特別的約19-22nt),也不排除具有其它數(shù)目核苷酸的miRNA分子。miRNA通 ??杀籒orthern印跡檢測到。
[0080] 人來源的miRNA可被從人細胞中分離。如本文所用,"分離的"是指物質(zhì)從其原始 環(huán)境中分離出來(如果是天然的物質(zhì),原始環(huán)境即是天然環(huán)境)。如活體細胞內(nèi)的天然狀態(tài) 下的多聚核苷酸和多肽是沒有分離純化的,但同樣的多聚核苷酸或多肽如從天然狀態(tài)中同 存在的其他物質(zhì)中分開,則為分離純化的。
[0081] miRNA 可從前體 miRNA(Precursor miRNA,Pre-miRNA)加工而來,所述的前體 miRNA可折疊成一種穩(wěn)定的莖環(huán)(發(fā)夾)結(jié)構(gòu),所述的莖環(huán)結(jié)構(gòu)長度一般在50-100bp之間。 所述的前體miRNA可折疊成穩(wěn)定的莖環(huán)結(jié)構(gòu),莖環(huán)結(jié)構(gòu)的莖部兩側(cè)包含基本上互補的兩條 序列。所述的前體miRNA可以是天然的或是人工合成的。
[0082] 前體miRNA可被剪切生成miRNA,所述的miRNA可與編碼基因的mRNA的至少一部 分序列基本上互補。如本文所用,"基本上互補"是指核苷酸的序列是足夠互補的,可以以一 種可預(yù)見的方式發(fā)生相互作用,如形成二級結(jié)構(gòu)(如莖環(huán)結(jié)構(gòu))。通常,兩條"基本上互補" 的核苷酸序列互相之間至少有70%的核苷酸是互補的;優(yōu)選的,至少有80%的核苷酸是互 補的;更優(yōu)選的,至少有90%的核苷酸是互補的;進一步優(yōu)選的,至少有95%的核苷酸是互 補的;如98%、99%或100%。一般地,兩條足夠互補的分子之間可以具有最多40個不匹配 的核苷酸;優(yōu)選的,具有最多30個不匹配的核苷酸;更優(yōu)選的,具有最多20個不匹配的核 苷酸;進一步優(yōu)選的,具有最多10個不匹配的核苷酸,如具有1、2、3、4、5、8、11個不匹配的 核苷酸。
[0083] 如本文所用,"莖環(huán)"結(jié)構(gòu)也被稱作"發(fā)夾"結(jié)構(gòu),是指一種核苷酸分子,其可形成一 種包括雙鏈區(qū)域(莖部)的二級結(jié)構(gòu),所述的雙鏈區(qū)域由該核苷酸分子的兩個區(qū)域(位于 同一分子上)形成,兩個區(qū)域分列雙鏈部分的兩側(cè);其還包括至少一個"環(huán)"結(jié)構(gòu),包括非互 補的核苷酸分子,即單鏈區(qū)域。即使該核苷酸分子的兩個區(qū)域不是完全互補的,核苷酸的雙 鏈部分也可保持雙鏈狀態(tài)。例如,插入、缺失、取代等可導(dǎo)致一個小區(qū)域的不互補或該小區(qū) 域自身形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)或其它形式的二級結(jié)構(gòu),然而,該兩個區(qū)域仍可基本上互補,并在可預(yù) 見的方式中發(fā)生相互作用,形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)的雙鏈區(qū)域。莖環(huán)結(jié)構(gòu)是本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知 的,通常在獲得了一條具有一級結(jié)構(gòu)的核苷酸序列的核酸后,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠確定該 核酸是否能形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)。
[0084] 本發(fā)明所述的miRNA具有如SEQ ID Ν0:η所示的序列,其中η為選自1-12的正整 數(shù)。
[0085] 為了提高miRNA的穩(wěn)定性或其它性質(zhì),還可在所述的miRNA的至少一端加上至少 一個保護性堿基,如" TT "等。
[0086] 在本文中,miRNA、miRN、小RNA、microRNA、miR具有相同的含義。
[0087] 對于本發(fā)明所揭示的胃癌特異性的miRNA,可以通過常規(guī)的miRNA芯片技術(shù)進行 驗證,例如包括用常規(guī)方法或常規(guī)試劑盒抽提miRNA,然后進行檢測。代表性的試劑盒包括 (但并不限于):Ambion公司的miRNAs抽提試劑盒抽提。
[0088] 此外,還可通過特異性擴增并檢測擴增產(chǎn)物(或相應(yīng)的熒光信號等可檢測信號) 來檢測或驗證本發(fā)明的胃癌特異性的miRNA。優(yōu)選的高靈敏度和高特異性的的技術(shù)包括 (但并不限于):CN10267663A中所公開的技術(shù)。通常,所用引物的特異性結(jié)合區(qū)可根據(jù)所 需檢測的已知miRNA的序列進行設(shè)計,優(yōu)選地擴增時所用引物的特異性結(jié)合區(qū)通常是與 miRNA完全互補的互補序列。
[0089] miRNA集合或組合
[0090] 本發(fā)明提供了一種miRNA的集合或組合,所述的miRNA集合或組合可用于制備區(qū) 分胃癌組織和癌旁組織的芯片或試劑盒。如本文所用,術(shù)語"miRNA集合或組合"、"miRNA指 紋圖譜"可互換使用,均指的是能夠特異地、靈敏地區(qū)分胃癌組織和正常組織(癌旁組織) 的miRNA的總和。
[0091] 在本發(fā)明中,所述的miRNA集合或組合含有SEQ ID N0. : 1-9所示的全部序列,優(yōu) 選地,還可以包括一種或多種選自SEQ ID NO. :10-12中所示的序列。通常,本發(fā)明miRNA集 合或組合除了含有SEQ ID N0. : 1-9所有的序列以外,還可以任意的含有SEQ ID NO. :10-12 中一種或多種序列從而構(gòu)成新的miRNA集合或組合。
[0092] 在另一優(yōu)選例中,所述的miRNA集合或組合含有SEQ ID NO. :1-12所示的12個序 列。
[0093] 在另一優(yōu)選例中,所述miRNA集合或組合含有9個小RNA (SEQ ID N0. : 1-9)組成 的小RNA指紋圖譜,用于區(qū)分胃癌組織和癌旁組織。
[0094] 在另一優(yōu)選例中,所述miRNA集合或組合有9個小RNA(SEQ ID N0. : 1-9、10-12) 組成的小RNA指紋圖譜,用于區(qū)分胃癌組織和癌旁組織。
[0095] 本發(fā)明SEQ ID NO. :1-12所示的序列如下:
[0096]
[0097] 其中,HSA-MIR-196a/b在胃癌組織中表達上調(diào),而其他miRNA則在胃癌組織中下 調(diào)。
[0098] 應(yīng)理解,本發(fā)明的miRNA集合或組合可將SEQ ID N0. : 1-9所示的序列,較佳地SEQ ID NO. :1-12所示序列進行任意地組合,優(yōu)選為含有SEQ ID NO. :1-2所示的序列,從而通過 本領(lǐng)域常規(guī)技術(shù)設(shè)計制備針對這些miRNA集合或組合的寡核苷酸探針,并制備成miRNA芯 片或試劑盒以區(qū)別胃癌和癌旁(正常)組織。
[0099] 此外,本發(fā)明miRNA集合或組合還可作為所述miRNA芯片或試劑盒的陽性對照,獨 立包裝或經(jīng)固相載體固定后作為對照。
[0100] 反義寡核苷酸
[0101] 根據(jù)本發(fā)明所提供的miRNA序列,可以設(shè)計出了它們的反義寡核苷酸,所述的反 義寡核苷酸可在體內(nèi)下調(diào)相應(yīng)的miRNA的表達。如本文所用,"反義寡核苷酸(antisense-ol igonucleotides,AS-〇ns或AS0) "又稱為"反義核苷酸",是指長度約為18-26nt (更特別的 約19-22nt)的DNA分子或RNA分子或其類似物。
[0102] 在本發(fā)明中,所述的"反義寡核苷酸"還包括采用如基于核酸鎖或核酸鏈骨架修飾 技術(shù)等手段獲得的經(jīng)修飾的反義核苷酸,所述的修飾基本不改變反義寡核苷酸的活性,更 佳地,所述修飾可提高反義寡核苷酸的穩(wěn)定性、活性或治療效果。核酸鎖(locked nucle ic acid,LNA)通常是指通過一個亞甲基橋?qū)⒑颂堑?'氧原子和4'碳原子連接起來的修飾技 術(shù)。LNA能延長miRNA的血清半衰期,提高對靶標(biāo)親和性,減少脫靶作用的范圍和程度。基 于核酸鏈骨架的修飾技術(shù)發(fā)展出的反義藥物在可溶性,抗核酸酶降解等方面大有改善,且 易于大量合成。寡核苷酸的骨架修飾方法有多種,包括硫代法,例如將脫氧核苷酸鏈硫代修 飾為硫代脫氧核苷酸鏈。該方法是將DNA骨架上的磷酸鍵的氧原子用硫原子替代,可抵抗 核酸酶降解。應(yīng)理解,任何能夠保持所述反義寡核苷酸的大部分或全部活性的修飾都包含 在本發(fā)明中。
[0103] 作為本發(fā)明的優(yōu)選方式,對反義寡核苷酸進行核酸鎖修飾;更佳地還進行硫代修 飾。
[0104] 將本發(fā)明所述的反義寡核苷酸轉(zhuǎn)移到人體內(nèi)后,它們能夠明顯下調(diào)相關(guān)miRNA的 表達。
[0105] 多核苷酸構(gòu)建物
[0106] 根據(jù)本發(fā)明所提供的人miRNA序列,可設(shè)計出在被導(dǎo)入后可被加工成可影響相應(yīng) 的mRNA表達的miRNA的多核苷酸構(gòu)建物,也即所述多核苷酸構(gòu)建物能夠在體內(nèi)上調(diào)相應(yīng) 的miRNA的量。因此,本發(fā)明提供了一種分離的多核苷酸(構(gòu)建物),所述的多核苷酸(構(gòu) 建物)可被人細胞轉(zhuǎn)錄成前體miRNA,所述的前體miRNA可被人細胞剪切且表達成所述的 miRNA〇
[0107] 作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方式,所述的多核苷酸構(gòu)建物含有式I所示的結(jié)構(gòu):
[0108] Seq正向-X-Seq反向式 I,
[0109] 式 I 中,
[0110] Seq正向為可在細胞中表達成所述的miRNA的核苷酸序列,Seq反向為與Seq正向基本 上互補的核苷酸序列;或者,3叫反自為可在細胞中表達成所述的miRNA的核苷酸序列,Seq正 向為與Seq正向基本上互補的核苷酸序列;
[0111] X為位于Seq正向和Seq反向之間的間隔序列,并且所述間隔序列與Seq正向和Seq反向 不互補;
[0112] 式I所示的結(jié)構(gòu)在轉(zhuǎn)入細胞后,形成式II所示的二級結(jié)構(gòu):
[0113]
[0114] 式II中,Seq正向、Seq反向和X的定義如上述;
[0115] | |表不在Seq正向和Seq反向之間形成的喊基互補配對關(guān)系。
[0116] 通常,所述的多核苷酸構(gòu)建物位于表達載體上。因此,本發(fā)明還包括一種載體,它 含有所述的miRNA,或所述的多核苷酸構(gòu)建物。所述的表達載體通常還含有啟動子、復(fù)制起 點和/或標(biāo)記基因等。本領(lǐng)域的技術(shù)人員熟知的方法能用于構(gòu)建本發(fā)明所需的表達載體。 這些方法包括體外重組DNA技術(shù)、DNA合成技術(shù)、體內(nèi)重組技術(shù)等。所述的表達載體優(yōu)選地 包含一個或多個選擇性標(biāo)記基因,以提供用于選擇轉(zhuǎn)化的宿主細胞的表型性狀,如卡拉霉 素、慶大霉素、潮霉素、氨芐青霉素抗性。
[0117] 芯片
[0118] miRNA表達譜芯片通常含有多達幾百個探針,涵蓋多種miRNA,利用DNA雙鏈同源 互補的原理在全基因組水平上檢測樣本中所含各種miRNA的含量。因此,可在同一時間對 待測樣本中全基因組范圍內(nèi)的miRNA的轉(zhuǎn)錄水平進行檢測。
[0119] 利用本發(fā)明所述的miRNA序列,還可以制備相應(yīng)的miRNA芯片,進而研究其表達譜 以及miRNAs的調(diào)節(jié)方式。
[0120] 在另一方面,本發(fā)明還提供一種用于分析miRNA表達譜的芯片,所述的芯片可用 于區(qū)分胃癌和癌旁組織。
[0121] 本發(fā)明的所述的miRNA芯片包括:
[0122] 固相載體;以及
[0123] 有序固定在所述固相載體上的寡核苷酸探針,所述的寡核苷酸探針特異性地對應(yīng) 于(互補或基本互補于)SEQ ID N0:1-9,較佳地還包括10-12所示的序列中的至少1種; 較佳地,所述的寡核苷酸探針至少特異性地對應(yīng)于(互補或基本互補于)SEQ ID NO. :1-12 所示的序列。
[0124] 具體地,可根據(jù)本發(fā)明所述的miRNA,設(shè)計出適合的探針,固定在固相載體上,形成 "寡核苷酸陣列"。所述的"寡核苷酸陣列"是指具有可尋址位置(即以區(qū)別性的,可訪問的 地址為特征的位置)的陣列,每個可尋址位置均含有一個與其相連的特征性寡核苷酸。根 據(jù)需要,可將寡核苷酸陣列分成多個亞陣。
[0125] 所述固相載體可采用基因芯片領(lǐng)域的各種常用材料,例如但不限于尼龍膜,經(jīng)活 性基團(如醛基、氨基等)修飾的玻片或硅片、未修飾的玻片、塑料片等。
[0126] 所述的miRNA芯片的制備可采用本領(lǐng)域已知的生物芯片的常規(guī)制造方法。例如, 如果固相載體采用的是修飾玻片或硅片,探針的5'端含有氨基修飾的聚dT串,可將寡核苷 酸探針配制成溶液,然后采用點樣儀將其點在修飾玻片或硅片上,排列成預(yù)定的序列或陣 列,然后通過放置過夜來固定,就可得到本發(fā)明的miRNA芯片。如果核酸不含氨基修飾,則 其制備方法也可參照:王申五主編的《基因診斷技術(shù)-非放射性操作手冊》;J. L. eris i,V. R. Iyer, P. 0. BROWN. Exploring the metabol ic and genetic control of gene express ion on a genomic scale. Science, 1997 ;278:680和馬立人,蔣中華主編·生物芯片·北 京:化學(xué)工業(yè)出版社,2000,1-130。
[0127] 另一方面,本發(fā)明還提供了一種通過miRNA芯片檢測人組織中miRNA表達譜的方 法,包括步驟:
[0128] (1)提供分離自人組織的RNA樣品,在所述的RNA上設(shè)置標(biāo)記物;
[0129] (2)將步驟(1)得到的RNA與所述的miRNA芯片接觸,使所述的RNA與固相載體上 的寡核苷酸探針發(fā)生雜交反應(yīng),從而在固相載體上形成"寡核苷酸探針-RNA"二元復(fù)合物;
[0130] (3)檢測步驟(2)形成的二元復(fù)合物的標(biāo)記物,從而確定人組織中相應(yīng)的miRNA的 表達譜。
[0131] 從人組織中提取RNA的方法是本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的方法,包括Trizol法。
[0132] 更優(yōu)選的,在步驟(1)中,在從人組織組織中分離出RNA樣品后,對RNA樣品進行 適當(dāng)處理,以富集具有一定長度的RNA,所述長度一般在10-100之間(小片段RNA)。在經(jīng)過 上述處理后,利用這些小片段RNA進行后續(xù)的雜交,這樣可提高芯片捕獲miRNA的準(zhǔn)確性。 本領(lǐng)域人員可方便地分離出具有一定片段長度的RNA,比如可采用凝膠電泳法來分離。
[0133] 對RNA進行標(biāo)記也是本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的方法,其可通過在雜交時加入與RNA 特異性結(jié)合的標(biāo)記物的方法實現(xiàn),所述標(biāo)記物比如是標(biāo)記基團。所述的標(biāo)記基團包括但不 限于:地高辛分子(DIG)、生物素分子(Bio)、熒光素及其衍生生物分子(FITC等)、其它熒 光分子(如Cy3、Cy5等)、堿性磷酸酶(AP)、辣根過氧化物酶(HRP)等。這些標(biāo)記及其標(biāo)記 方法都已是本領(lǐng)域眾所周知的常規(guī)技術(shù)。
[0134] 將上述的RNA與miRNA芯片進行雜交時,可以先將miRNA芯片與預(yù)雜交緩沖液進 行預(yù)雜交。
[0135] 本發(fā)明所述的RNA與miRNA芯片之間的固相雜交按照本領(lǐng)域的經(jīng)典方法進行,本 領(lǐng)域一般人員依據(jù)經(jīng)驗容易確定有關(guān)緩沖液、探針和樣本濃度、預(yù)雜交溫度、雜交溫度以及 時間等的最適條件?;蛘咭部梢詤⒄铡斗肿涌寺嶒炛改稀分兴龅摹?br>[0136] 然后根據(jù)標(biāo)記信號在miRNA芯片上的位置、強度等信息獲取待測信息。若擴增產(chǎn) 物用熒光基團標(biāo)記,也可直接用熒光檢測設(shè)備(如激光共聚焦掃描儀Scanarray 3000等) 獲取待測信息。
[0137] 檢測試劑盒
[0138] 本發(fā)明還提供了一種試劑盒,所述的試劑盒中含有本發(fā)明的芯片。所述的試劑盒 可用于檢測miRNA的表達譜;或用于區(qū)分胃癌組織和癌旁(正常)組織。
[0139] 更優(yōu)選的,所述的試劑盒中還含有用于標(biāo)記RNA樣品的標(biāo)記物,以及與所述標(biāo)記 物相對應(yīng)的底物。
[0140] 此外,所述的試劑盒中還可包括用于提取RNA、PCR、雜交、顯色等所需的各種試劑, 包括但不限于:抽提液、擴增液、雜交液、酶、對照液、顯色液、洗液、抗體等。擴增液中還可含 有焚光染料,如EvaGreen、SYBRGreen等。所述的試劑盒中還可包括引物。
[0141] 另外,所述的試劑盒中還可包括使用說明書和/或芯片圖像分析軟件。
[0142] 本發(fā)明提到的上述特征,或?qū)嵤├岬降奶卣骺梢匀我饨M合。本案說明書所揭示 的所有特征可與任何組合物形式并用,說明書中所揭示的各個特征,可以被任何提供相同、 均等或相似目的的替代性特征取代。因此除有特別說明,所揭示的特征僅為均等或相似特 征的一般性例子。
[0143] 本發(fā)明的主要優(yōu)點在于:
[0144] (1)本發(fā)明提供了一類可用于區(qū)分胃癌組織和癌旁(正常)組織的新的miRNA指 紋圖譜;
[0145] (2)本發(fā)明的miRNA指紋圖譜,可非常有效地區(qū)分胃癌組織和癌旁(正常)組織, 靈敏度高、特異性強。
[0146] 下面結(jié)合具體實施例,進一步闡述本發(fā)明。應(yīng)理解,這些實施例僅用于說明本 發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下列實施例中未注明具體條件的實驗方法,通常按照 常規(guī)條件,例如Sambrook等人,分子克?。簩嶒炇沂謨裕∟ew York:Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。除非另外說明,否 則百分比和份數(shù)是重量百分比和重量份數(shù)。
[0147] 實施例1樣本的收集和信息分析
[0148] 本研究樣品為2011年至2013年期間,長征醫(yī)院收集所得存檔的石蠟樣本。所有 樣品收集經(jīng)過個人同意,并根據(jù)醫(yī)院的倫理委員會批準(zhǔn)協(xié)議,病理診斷結(jié)果經(jīng)兩名以上病 理醫(yī)師確認。所有病例均為腺癌,腫瘤組織或粘膜組織占到樣本的85%以上?;颊吲R床資 料包括發(fā)病年齡、性別、腫瘤部位、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、浸潤深度、組織分化和腫瘤?#分期(AJCC 第七版)等。
[0149] 共93個樣品參與了本實驗,包括40例胃癌樣本,32例正常組織樣本,中位年齡 59.5歲,以及21例胃癌細胞系。樣本從病人身體中移除并存儲于-80°C。其中樣本被分為 兩大部分,第一部分為訓(xùn)練樣本,包括20例胃癌樣本,12例正常組織樣本,共計32例樣本; 第二部分為檢測樣本,包括20例胃癌樣本,20例正常組織樣本,以及21種胃癌細胞系樣本, 共計61例樣本。
[0150] 實施例2總RNA抽提
[0151] 從石蠟FFPE組織切取7-8片5微米或者4片10微米的組織碎片,去除組織周圍 多余石蠟。剩余的組織常溫保存。
[0152] 切取的碎片勾衆(zhòng)后,參照 Deparaffinization solution(Qiagen,19093)說明書 先對石錯樣本進行脫錯;之后再參照miRNeasy FFPE kit(Qiagen,217504)說明書,抽提總 RNA〇
[0153] 電泳檢測質(zhì)量,用紫外分光光度法測定0D260nm和0D280nm,計算RNA濃度。-80°C 保存。
[0154] 實施例3加 PolyA尾并反轉(zhuǎn)錄
[0155] 將上述實施例2抽提得到的總RNA用含有0· 1 % Tween-20 (Sigma)的0· lxRNA儲 存緩沖液(Ambion、USA)稀釋成125ng/ul。
[0156] 用盛元公司生產(chǎn)的Sharpvue? miRNA cDNA合成盒(盛元公司產(chǎn)品編號: 9000004)為miRNA加上PolyA的尾,并且反轉(zhuǎn)錄為cDNA。具體步驟為:將1. 5ml離心管置 于冰上,加入66微升濃度為125ng/ul的總RNA,33微升盛元公司生產(chǎn)的Sharpvue? miRNA cDNA合成反應(yīng)液I (盛元公司產(chǎn)品編號:9000005) 11微升盛元公司生產(chǎn)的Sharpvue'? miRNA cDNA合成反應(yīng)液II (盛元公司產(chǎn)品編號:9000006),和去核酸酶的超純水至165微 升??俁NA量的終濃度為50ng/ul,輕柔混勻后分裝入3個0. 2ml的PCR管,每管50ul。 lOOOrpm離心10s后放入ABI9700PCR儀進行反應(yīng),反應(yīng)程序:37°C 15min,25°C 25min, 37°C 30min,85°C 5min,4°C 保持。
[0157] 取出PCR管,將3管RT產(chǎn)物合并,震蕩離心后_20°C保存或者直接用于qPCR反應(yīng)。
[0158] 實施例4熒光定量PCR檢測
[0159] 在15毫升的離心管中加入141微升實施例3得到的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,10542微升 盛元公司生產(chǎn)的熒光定量PCR酶反應(yīng)液(盛元公司產(chǎn)品編號:9000008, Sharpvue? 2x Universal qPCR Master Mix High Rox),4076微升去核酸酶超純水(盛元公司產(chǎn)品編號: 9000015),輕柔混勻。
[0160] 將盛元公司生產(chǎn)的小RNA反應(yīng)模板,Sharpvue?Human miRNA Array-Avl. 0 (盛 元公司產(chǎn)品編號:1000002),Sharpvue?Human miRNA Array-B vl.O(盛元公司產(chǎn)品編 號:1000003),Sharpvue?Human miRNA Array-C vl.0(盛元公司產(chǎn)品編號:1000004), Sharpvue?Human miRNA Array-D vl.0(盛元公司產(chǎn)品編號:1000005),Sharpvue?Human miRNA Array-E vl.O (盛元公司產(chǎn)品編號:1000006)從-20°C冰箱中取出,待回復(fù)到室溫后 打開包裝袋,置于離心機上,2000g離心5min (Thermo、ST16R,轉(zhuǎn)頭型號:M-20)。共1888個 小RNA反應(yīng)液,每個反應(yīng)模板上有3對陽性對照和1個空白對照。小心解開封膜。
[0161] 將前述步驟得到的混合液倒入加樣槽中,使用12道連續(xù)移液器將混合液逐行分 別加入盛元公司生產(chǎn)的小RNA反應(yīng)模板中,每孔7ul。加樣完畢后檢查每個孔液體量是否均 〇
[0162] 使用定量封板膜(ABI,4711971)封板后顛倒混勻,室溫1000g離心5min。
[0163] 放入定量PCR儀中(ABI,7900Ht Fast)做定量PCR。程序為:95°C 2min,后運行 96°〇58,60°(:11^11,3個循環(huán);之后961€58,60 1€58,37個循環(huán),溶解曲線。報告熒光設(shè)為 SYBR,參比熒光設(shè)為Rox。收集數(shù)據(jù),進行生物信息學(xué)分析。
[0164] 實施例5miRNA生物統(tǒng)計數(shù)據(jù)的計算分析
[0165] 小RNA數(shù)據(jù)分析圖表通過使用R和Bioconductor軟件包進行分析。在檢測的1888 個miRNA和兩個內(nèi)參對照(HSA-RNU6B和HSA-RNU48),對1888種miRNA進行進一步的分析。 確定了檢測GC的miRNA panel (2塊384孔板包含758個miRNA和10個內(nèi)參)。發(fā)現(xiàn)在檢 測的72例石蠟組織樣本以及21例細胞系中,758個miRNA的Ct值均低于35。每個miRNA 的ct值和平均值被差減背景、歸一化。
[0166] 為了去除樣品中RNA加入量的差異,分位數(shù)-median函數(shù)的分析方法用于處理原 始的ct值(Sing等人;2005),結(jié)果通過' arrayQual ityMetrics'進行數(shù)據(jù)分析。通過比 對去除腫瘤組織樣本(CZ-I 1-39號)和癌旁組織樣本(CZ-155N和CZ-428N)。
[0167] 因此,分析了 69例組織樣本和21例細胞系的miRNA表達。在隨后的統(tǒng)計分析,39 例腫瘤組織,30瘤旁脂肪組織和21例細胞系之間的miRNA比較,差異表達的miRNA通過使 用t檢驗分析所得,倍數(shù)變化2以上的被稱為差異表達。
[0168] 差異表達的miRNA通過使用三種計算機算法:支持向量法(SVM, Bioconductor package "el071"),KNN算法(Bioconductor package "class")和對角線線性判別分析 法(Bioconductor package "sfsmisc"),算法的性能采用留一交叉驗證程序,對不同數(shù)量 的預(yù)測標(biāo)志物進行初步評估。對每一組訓(xùn)練樣本中,miRNA基于胃癌組織和瘤旁組織比較 產(chǎn)生的t檢驗值和p值進行排名。前η的miRNA (η為2和35之間的閾值范圍)被用來構(gòu) 建基于對訓(xùn)練樣本的信息應(yīng)用得到其余的測試樣本的預(yù)算模型中。挑選FDR調(diào)整的ρ值低 于〇. 1,差異變化倍數(shù)變化大于2的miRNA。
[0169] miRNA的命名是根據(jù)miRBase Version 20的miRNA數(shù)據(jù)庫,在矛盾的情況下,遵循 miRNA數(shù)據(jù)庫。
[0170] 結(jié)果:12個miRNA組成的指紋圖譜被選為胃癌診斷的生物標(biāo)志物(表1)
[0171] 表 1
[0172]
[0173] 實施例6對所選定的12個miRNA進行診斷特異性、靈敏度的驗證
[0174] 對選定的12個miRNA用SVM的統(tǒng)計學(xué)方法進行驗證,如圖1所示。列表中所選的 miRNA對所有的樣品進行驗證,得到的R0C曲線,AUC為0. 985,所選擇的標(biāo)記物檢測胃癌組 織的靈敏度為97 %,特異性為90 %。
[0175] 實施例7從12個miRNA中進一步挑選關(guān)鍵miRNA
[0176] 對實施例5中所選定的miRNA進一步進行排列組合,篩選和測試出特異性、靈敏度 均能達到臨床檢測水平的miRNA組合。結(jié)果發(fā)現(xiàn)將部分特異性miRNA進行組合后,也能夠 較有效地診斷出胃癌組織,其中優(yōu)選的例子如下:
[0177] 7. 1當(dāng)選取SEQ ID N0. : 1-9所示的序列時,標(biāo)記為9A組,用SVM的統(tǒng)計學(xué)方法進 行驗證,如圖2所示。列表中所選的miRNA對所有的樣品進行驗證,得到的R0C曲線,AUC為 0. 988,所選擇的標(biāo)記物檢測胃癌組織的靈敏度為95. 1 %,特異性為95 %。
[0178] 7. 2當(dāng)選取SEQ ID N0. : 1-6、10-12所示的序列時,標(biāo)記為9B組,用SVM的統(tǒng)計學(xué) 方法進行驗證,如圖3所示。列表中所選的miRNA對所有的樣品進行驗證,得到的R0C曲線, AUC為0. 924,所選擇的標(biāo)記物檢測胃癌組織的靈敏度為95. 1 %,特異性為70 %。
[0179] 結(jié)論:當(dāng)選擇SEQ ID N0. : 1-9作為miRNA指紋圖譜的組合時,就能達到滿足臨床 要求的診斷特異性和靈敏度,而將指紋圖譜中miRNA的數(shù)量擴大到12個時,則所獲得的特 異性和靈敏度更高??梢姳景l(fā)明miRNA指紋圖譜能夠非常高效地區(qū)分胃癌組織和正常組織 (癌旁組織)。
[0180] 在本發(fā)明提及的所有文獻都在本申請中引用作為參考,就如同每一篇文獻被單獨 引用作為參考那樣。此外應(yīng)理解,在閱讀了本發(fā)明的上述講授內(nèi)容之后,本領(lǐng)域技術(shù)人員可 以對本發(fā)明作各種改動或修改,這些等價形式同樣落于本申請所附權(quán)利要求書所限定的范 圍。
【主權(quán)項】
1. 一種miRNA集合或組合,其特征在于,所述的miRNA集合或組合包括: (a) SEQ ID NO. : 1-9所示的9個序列;或 化)與SEQ ID NO. : 1-9所示序列互補的9個互補序列;或 (C)來自(a)或化)的組合,且來自(a)的序列與來自化)的互補序列互相不為互補。2. 如權(quán)利要求1所述的miRNA集合或組合,其特征在于,所述的miRNA集合或組合還包 括: (al) -種或多種選自SEQ ID NO. :10-12所示的序列;或 化1) 一種或多種選自與SEQ ID NO. :10-12所示序列互補的互補序列;或 (c2)來自(al)或化1)的組合,且來自(al)的序列與來自化1)的互補序列互相不為 互補。3. 如權(quán)利要求1所述的miRNA集合或組合,其特征在于,所述的miRNA集合或組合包 括: a)序列如SEQ ID NO: 1-12所示的12個序列;或 (i U與SEQ ID NO: 1-12所示序列互補的12個序列。4. 一種分離的或人工構(gòu)建的前體miRNA集合或組合,其特征在于,所述的前體miRNA集 合或組合中的前體miRNA能在人細胞內(nèi)剪切并表達成權(quán)利要求1所述的miRNA集合或組合 中的miRNA。5. -種分離的多核巧酸集合或組合,其特征在于,所述的多核巧酸集合或組合中的多 核巧酸能被人細胞轉(zhuǎn)錄成前體miRNA,所述的前體miRNA能在人細胞內(nèi)被剪切且表達成權(quán) 利要求1所述miRNA集合或組合中的miRNA ; 較佳地,所述的多核巧酸具有式I所示的結(jié)構(gòu): Seq正向-X-Seq反向 式I, 式I中, Seq正向為能在人細胞中表達成所述的miRNA的核巧酸序列, Seq反向為與Seq正向基本上互補或完全互補的核巧酸序列; X為位于Seq正向和Seq反向之間的間隔序列,并且所述間隔序列與Seq正向和Seq反 向不互補, 并且式I所示的結(jié)構(gòu)在轉(zhuǎn)入人細胞后,形成式II所示的二級結(jié)構(gòu):式H, 式II中,Seq正向、Seq反向和X的定義如上述, I表示在Seq正向和Seq反向之間形成的堿基互補配對關(guān)系。6. -種載體,其特征在于,它含有權(quán)利要求1所述的miRNA集合或組合,或權(quán)利要求5 所述的多核巧酸集合或組合。7. -種miRNA忍片,所述的miRNA忍片包括: 固相載體;W及 有序固定在所述固相載體上的寡核巧酸探針,所述的寡核巧酸探針特異性地對應(yīng)于 沈Q ID NO: 1-9所示全部序列。8. 權(quán)利要求1所述miRNA集合或組合、和/或權(quán)利要求7所述miRNA忍片的用途,其特 征在于,用于制備區(qū)分胃癌組織和癌旁組織的忍片或試劑盒。9. 提供了一種試劑盒,所述的試劑盒中含有權(quán)利要求7所述的miRNA忍片和/或用于 權(quán)利要求1所述miRNA集合或組合的檢測試劑。10. -種篩選治療胃癌候選藥物的方法,所述方法包括W下步驟: (a)在實驗組中,在待測物質(zhì)存在下培養(yǎng)胃癌細胞;并且在對照組中,在與所述實驗組 條件相同但不存在所述待測物質(zhì)的情況下培養(yǎng)相同的胃癌細胞; 化)測定所述實驗組中胃癌細胞的miRNA的表達水平,并與對照組中胃癌細胞的miRNA 的表達水平進行比較; 其中,如果與所述對照組相比,所述實驗組中的所述miRNA的表達水平發(fā)生了趨向于 癌旁組織細胞的表達水平的變化,則表明所述待測物質(zhì)是抗胃癌的候選藥物。11. 一種體外非診斷性的判斷細胞或組織是否為胃癌細胞或組織的方法,其特征在于, 包括步驟:測定所述的細胞或組織中權(quán)利要求1所述miRNA集合或組合中miRNA的表達水 平,當(dāng)所述的miRNA表達水平與正常組織或癌旁組織相比,具有顯著的差異,則說明該細胞 或組織是胃癌細胞或組織。
【文檔編號】C40B40/06GK105985955SQ201510053868
【公開日】2016年10月5日
【申請日】2015年2月2日
【發(fā)明人】譚若穎, 朱苗駿, 于觀貞, 王杰軍
【申請人】上海盛元生物技術(shù)有限公司, 常州盛達生物技術(shù)有限公司