技術(shù)特征：

1.一種評(píng)估抗菌肽抗菌力的系統(tǒng)，其特征在于，包括：

(a)第一輸入單元，用于多肽的建構(gòu)；

(b)第二輸入單元，用于磷酸雙脂層的建構(gòu)；

(c)第一處理單元，其與所述第一輸入單元以及所述第二輸入單元連接，該第一處理單元用于將第一輸入單元建構(gòu)的多肽與第二輸入單元建構(gòu)的磷酸雙脂層于水溶液環(huán)境中進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬；

(d)第二處理單元，該第二處理單元與所述第一處理單元相連接，用于計(jì)算該多肽在每格模擬快照(snapshot)中與膜內(nèi)脂鏈尾有碰觸之重原子數(shù)N_i及與膜內(nèi)脂鏈尾未碰觸之重原子數(shù)N_O，對(duì)模擬平衡后4納秒中所收集的快照做平均，得到<N_i>與<N_O>，進(jìn)而計(jì)算分配自由能ΔGp，其中所述重原子是指氫原子之外的所有原子；

(e)輸出單元，該輸出單元與所述第二處理單元連接，用于將預(yù)測(cè)信息-分配自由能ΔGp輸出；

其中，所述第一輸入單元、所述第二輸入單元、所述第一處理單元、所述第二處理單元及該輸出單元系通過(guò)計(jì)算機(jī)操作。

2.如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一輸入單元包含由軟件(如PyMol或Discovery Studio Visualizer)創(chuàng)造的模擬多肽，或由實(shí)驗(yàn)結(jié)果(如從X-ray crystallography或NMR)得知的多肽，模擬平衡的多肽包含利用模擬軟件(如NAMD、VMD、AMBER、GROMACS)以及常用力場(chǎng)(如CHARMM、AMBER、GROMOS、OPLS)來(lái)達(dá)到多肽在類(lèi)生理環(huán)境下的平衡狀態(tài)。

3.如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第二輸入單元包含以“CHARMM-GUI”服務(wù)器及相似軟件來(lái)建膜(磷酸雙脂層)，模擬平衡的磷酸雙脂層包含利用模擬軟件(如NAMD、VMD、AMBER、GROMACS)以及常用力場(chǎng)(如CHARMM、AMBER、GROMOS、OPLS)來(lái)達(dá)到磷酸雙脂層在類(lèi)生理環(huán)境下的平衡狀態(tài)。

4.如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一處理單元包含利用模擬軟件(如NAMD2.9版、VMD1.9.2版、AMBER14、GROMACS)以及常用力場(chǎng)(如CHARMM、AMBER、GROMOS、OPLS)來(lái)達(dá)到多肽穩(wěn)定插入磷酸雙脂層的平衡狀態(tài)。

5.如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述磷酸雙脂層由十六酰油酰磷脂酰膽堿(palmitoyloleoylPhosphatidyl choline,簡(jiǎn)稱(chēng)POPC)及/或十六酰油酰磷脂酰甘油酰甘油(palmitoyloleoyl-phosphatidylglycerol,簡(jiǎn)稱(chēng)POPG)所構(gòu)成。

6.如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述分子動(dòng)力學(xué)模擬用于調(diào)整所述多肽的方向，使其疏水面朝向預(yù)先平衡好的磷酸雙脂層，而親水面(即帶正電端)朝向另一端，然后當(dāng)兩者的質(zhì)心投影到與膜垂直的軸上相距為時(shí)，再展開(kāi)下沉而上浮表面模擬。

7.如權(quán)利要求6所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述下沉而上浮表面模擬包括螺旋構(gòu)型的多肽被微弱的拉力拖至膜內(nèi)磷酸雙脂上層磷原子之平均坐標(biāo)下方的位置并維持?jǐn)?shù)納秒。接著去除對(duì)螺旋構(gòu)型多肽的限制力，進(jìn)行10～35納秒的模擬，使其上浮至膜表面并且平衡。

8.一種應(yīng)用權(quán)利要求1的系統(tǒng)預(yù)測(cè)抗菌肽抗菌力的方法，其特征在于，包含以下步驟：

(a)通過(guò)第一輸入單元建構(gòu)多肽，并將該多肽置于水溶液環(huán)境中持續(xù)第一時(shí)間，進(jìn)行平衡反應(yīng)；

(b)通過(guò)第二輸入單元建構(gòu)磷酸雙脂層，并將該磷酸雙脂層置于水溶液環(huán)境中持續(xù)第二時(shí)間，進(jìn)行平衡反應(yīng)；

(c)通過(guò)第一處理單元，將所述第一輸入單元建構(gòu)的多肽與所述第二輸入單元建構(gòu)的磷酸雙脂層在水溶液環(huán)境中進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬；

(d)通過(guò)第二處理單元，計(jì)算所述多肽在每格模擬快照(snapshot)中與膜內(nèi)脂鏈尾有碰觸的重原子數(shù)N_i及與膜內(nèi)脂鏈尾未碰觸的重原子數(shù)N_O，對(duì)模擬平衡后4納秒中所收集的快照做平均，得到<N_i>與<N_O>，進(jìn)而計(jì)算分配自由能ΔGp；

(e)通過(guò)與所述第二處理單元連接的輸出單元，將分配自由能或預(yù)測(cè)的多肽活性信息輸出。

9.如權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，所述平衡反應(yīng)是將多肽置于模擬水環(huán)境中數(shù)百皮秒(ps)。

10.如權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，所述第一輸入單元包含由軟件(如PyMol或Discovery Studio Visualizer)創(chuàng)造的模擬多肽，或由實(shí)驗(yàn)結(jié)果(如從X-ray crystallography或NMR)得知的多肽，模擬平衡的多肽包含利用模擬軟件(如NAMD、VMD、AMBER、GROMACS)以及常用力場(chǎng)(如CHARMM、AMBER、GROMOS、OPLS)來(lái)達(dá)到多肽在類(lèi)生理環(huán)境下的平衡狀態(tài)。

11.如權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，所述第二輸入單元是包含以“CHARMM-GUI”服務(wù)器及相似軟件來(lái)建膜(磷酸雙脂層)，模擬平衡的磷酸雙脂層包含利用模擬軟件(如NAMD、VMD、AMBER、GROMACS)以及常用力場(chǎng)(如CHARMM、AMBER、GROMOS、OPLS)來(lái)達(dá)到磷酸雙脂層在類(lèi)生理環(huán)境下的平衡狀態(tài)。

12.如權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，所述第一處理單元包含利用模擬軟件(如NAMD、VMD、AMBER、GROMACS)以及常用力場(chǎng)(如CHARMM、AMBER、GROMOS、OPLS)來(lái)達(dá)到多肽穩(wěn)定插入磷酸雙脂層的平衡狀態(tài)。

13.如權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，所述磷酸雙脂層系由十六酰油酰磷脂酰膽堿(palmitoyloleoyl Phosphatidylcholine,簡(jiǎn)稱(chēng)POPC)及/或十六酰油酰磷脂酰甘油酰甘油(palmitoyloleoyl-phosphatidylglycerol,簡(jiǎn)稱(chēng)POPG)所構(gòu)成。

14.如權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，所述預(yù)測(cè)信息是指該多肽的抗菌性。

15.如權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，所述分子動(dòng)力學(xué)模擬用于調(diào)整具有螺旋構(gòu)型多肽的方向，使其疏水面朝向預(yù)先平衡好的磷酸雙脂層，而親水面(即帶正電端)朝向另一端，然后當(dāng)兩者的質(zhì)心投影到與膜垂直的軸上相距為時(shí)，再展開(kāi)“下沉而上浮表面”的模擬。

16.如權(quán)利要求15所述的方法，其特征在于，所述下沉而上浮表面模擬該螺旋構(gòu)型的多肽被微弱的拉力拖至膜內(nèi)磷酸雙脂上層磷原子的平均坐標(biāo)下方的位置并維持?jǐn)?shù)納秒。接著去除對(duì)螺旋構(gòu)型多肽的限制力，使其上浮至膜表面，再進(jìn)行10～35納秒的模擬。

17.如權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，所述分配自由能系為ΔGp＝-k_BTln(<N_i>/<N_o>)或ΔGp＝-k_BT(<lnN_i>/<lnN_o>)，其中k_B為波茲曼常數(shù)、T為溫度、N_i與N_o分別為每格模擬快照(snapshot)中與膜內(nèi)脂鏈尾有碰觸和未碰觸的多肽內(nèi)重原子的數(shù)量，<>表示4ns的移動(dòng)平均。

18.一種具有低溶血性的抗菌肽，其特征在于，所述抗菌肽如下列式I所示：

xAP1yBP2zCn(P3vD)式I；

其中x、y、z、v以及n均為正整數(shù)；

且x＝0～6、y＝0或4、z＝0～6、v＝0～4以及n＝0或1；

其中P1、P2以及P3是指-Trp-Leu-Lys-；

其中A、B以及C選自由Trp、Leu以及Lys所組成的群組；

其中D系指Lys。

19.如權(quán)利要求18所述的方法，其特征在于，所述抗菌肽選自由SEQ ID NO:2至SEQ ID NO:13所組成的群組。