rs1800818在檢測新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血小板減少綜合征中的應用
【技術領域】
[0001] 本發(fā)明涉及生物醫(yī)學領域中rsl800818在檢測新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血小 板減少綜合征中的應用。
【背景技術】
[0002] 發(fā)熱伴血小板減少綜合征（Severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS)，也有人稱之為發(fā)熱，血小板和白細胞減少綜合征 (Fever, Thrombocytopenia and Leukopenia Syndrome，FTLS)，是出現在我國的一種新型布 尼亞病毒（發(fā)熱伴血小板減少綜合征布尼亞病毒，Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus，SFTSV，簡稱新布尼亞病毒）通過血液感染的新發(fā)傳染病，主要臨床表現為 急性發(fā)熱（多在38°C以上），血小板和白細胞減少，部分病例出現牙齦出血、皮膚瘀斑等出 血癥狀，少數患者可因多器官損害而死亡。該病尚無有效的疫苗和治療方法。已有研宄顯 示，健康人群中存在SFTSV隱性感染。
[0003] 單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism，SNP)是存在于某一（些） 群體、正常個體的基因組DNA中單堿基的序列差異，是繼限制性酶切長度多態(tài)性和微衛(wèi)星 之后的第三代遺傳標記。

【發(fā)明內容】

[0004] 本發(fā)明所要解決的技術問題是如何篩查新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血小板減少 綜合征患者。
[0005] 為解決上述技術問題，本發(fā)明首先提供了下述Al)-A6)中的任一種用途：
[0006] A1)檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質在制備篩查發(fā)熱伴血小 板減少綜合征患者產品中的應用；
[0007] A2)檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質在制備檢測發(fā)熱伴血小 板減少綜合征易感性產品中的應用；
[0008] A3)檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質在制備檢測與發(fā)熱伴血 小板減少綜合征相關的單核苷酸多態(tài)性的產品中的應用；
[0009] A4)檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質在制備鑒定或輔助鑒定 與發(fā)熱伴血小板減少綜合征相關的單核苷酸多態(tài)性的產品中的應用；
[0010] A5)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型在制備篩查發(fā)熱伴血小板減少綜合 征患者的產品中的應用；
[0011] A6)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型在制備檢測發(fā)熱伴血小板減少綜合 征易感性產品中的應用。
[0012]rsl800818是人染色體上的一個二等位多態(tài)性的SNP位點，該變異是轉換（A/G，在 其互補鏈上則為T/C)。所述rsl800818基因型是AA、AG或GG。所述AA是rsl800818位點 為A的純合型，所述GG是rsl800818位點為G的純合型，所述AG是rsl800818位點為A和 G的雜合型。所述檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型具體可通過檢測rsl800818 的核苷酸種類確定。
[0013] 上述用途中，所述檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質可包括擴 增包括rsl800818在內的基因組DNA片段的PCR引物對和/或單堿基延伸引物。
[0014] 上述用途中，所述GG和所述AG基因型的個體在發(fā)熱伴血小板減少綜合征患者群 體中的比例分別高于對應的基因型在新布尼亞病毒隱性感染者中的比例。
[0015] 上述用途中，所述發(fā)熱伴血小板減少綜合征具體為新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血 小板減少綜合征。
[0016] 為解決上述技術問題，本發(fā)明還提供了含有檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性 或基因型的物質的產品。
[0017] 本發(fā)明所提供的含有檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質的產 品，為a) _d)中的任一種：
[0018] a)檢測與發(fā)熱伴血小板減少綜合征相關的單核苷酸多態(tài)性或基因型的產品；
[0019] b)鑒定或輔助鑒定與發(fā)熱伴血小板減少綜合征相關的單核苷酸多態(tài)性或基因型 的廣品；
[0020] c)篩查發(fā)熱伴血小板減少綜合征患者產品；
[0021] d)檢測發(fā)熱伴血小板減少綜合征易感性產品。
[0022] 上述產品中，所述檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質可包括擴 增包括rsl800818在內的基因組DNA片段的PCR引物對和/或單堿基延伸引物。
[0023] 上述產品中，所述GG和所述AG基因型的個體在發(fā)熱伴血小板減少綜合征患者群 體中的比例分別高于對應的基因型在新布尼亞病毒隱性感染者中的比例。
[0024] 上述產品中，所述發(fā)熱伴血小板減少綜合征具體為新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血 小板減少綜合征。
[0025] 在本發(fā)明的實施例中，所述發(fā)熱伴血小板減少綜合征具體為中國人群發(fā)熱伴血小 板減少綜合征。
[0026] 本發(fā)明中，所述擴增包括rsl800818在內的基因組DNA片段的PCR引物對可由序 列表中SEQ ID No. 1所示的單鏈DNA和序列表中SEQ ID No. 2所示的單鏈DNA組成；所述 單堿基延伸引物的核苷酸序列可如序列表中SEQ ID No. 3所示。
[0027] 實驗證明，rsl800818的G等位在病例組中的比例高于該等位在對照組中的比 例，具有統(tǒng)計學差異，說明 rsl8〇〇8l8的G等位為發(fā)熱伴血小板減少綜合征的風險等位。 rsl800818的三個基因型中，GG基因型和AG基因型在病例組中的比例高于這兩個基因型在 對照組中的比例；AA基因型在病例組中的比例低于在對照組中的比例。與攜帶rsl800818 位點AA基因型的個體相比，攜帶rs 1800818位點GG基因型以及AG基因型的個體發(fā)熱伴血 小板減少綜合征發(fā)病風險增加，比值比（Odds ratio,0R)為3. 85，P〈0. 001，說明rsl800818 多態(tài)性位點與發(fā)熱伴血小板減少綜合征的發(fā)生顯著關聯。
[0028] 在實際應用中，可將檢測rs 1800818的多態(tài)性或基因型的物質與其它物質（如檢 測其它的與發(fā)熱伴血小板減少綜合征相關的單核苷酸多態(tài)性或基因型的物質）聯合在一 起制備篩查發(fā)熱伴血小板減少綜合征患者的產品。
[0029] 其中，檢測人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質可為通過下述至少 一種方法確定rsl800818的多態(tài)性或基因型所需的試劑和/或儀器：DNA測序、限制性 酶切片段長度多態(tài)性、單鏈構象多態(tài)性、變性高效液相色譜、SNP芯片、TaqMan探針技術 和 Sequenom MassArray 技術。其中，利用 Sequenom MassArray 技術確定 rsl800818 的 多態(tài)性或基因型所需的試劑和/或儀器包括PCR引物對、基于單堿基延伸反應的延伸 引物、磷酸酶（如奸堿性磷酸酶（shrimp alkaline phosphatase，SAP))、樹脂、芯片、 MALDI-TOF(matrix-assisted laser desorption/ionization - time of fligh，基質輔 助激光解吸附電離