專利名稱::結合cxcr7表位的抗體的制作方法結合CXCR7表位的抗體相關專利申請的交叉引用本申請要求于2006年10月8日提交的美國臨時專利申請第60/852,745號的優(yōu)先權權益,其通過引用并入本文。
背景技術:
:趨化因子組成小細胞因子的家族,所述小細胞因子尤其在炎癥中產(chǎn)生并調節(jié)白細胞募集、活化和增殖(Baggiolini,M.#v(,A/v./mm朋o/.55:97-179(1994);Springer,T.A.,尺ev.尸/yw'o/.57:827-872(1995);以及Schall,T.J.和K.B.Bacon,Cmr(9p/"./mmimo/.6:865-873(1994))。趨化因子能選擇性誘導血液的有形成份(除紅細胞以外)的趨化性,所述有形成份包括白細胞如嗜中性粒細胞、單核細胞、巨噬細胞、嗜酸性粒細胞、嗜堿性粒細胞、肥大細胞和淋巴細胞(包括T細胞和B細胞)。除剌激趨化性之外,其他變化可被反應細胞中的趨化因子選擇性誘導,所述變化包括與白細胞活化、生長和增殖相關的細胞形狀變化、胞內(nèi)游離鈣離子(C^+)濃度短暫升高、顆粒胞吐、整聯(lián)蛋白(integrin)上調、生物活性脂質(如白三烯類)形成、細胞因子表達以及呼吸爆發(fā)。因此,趨化因子是炎癥反應的早期引發(fā)劑,導致炎癥介質釋放、對感染或炎癥部位的趨化性和外滲。趨化因子的兩個亞族被命名為CXC和CC趨化因子,以四個保守半胱氨酸殘基中前兩個的排列為特征來區(qū)分,所述前兩個殘基被一個氨基酸分隔(如在CXC趨化因子SDF-1、IL-8、IP-IO、MIG、PF4、ENA-78、GCP-2、GROcuGRO卩、GROy、NAP-2、NAP-4、I-TAC中)或為相鄰的殘基(如在CC趨化因子MIP-la、MIP-1卩、RANTES、MCP-l、MCP-2、MCP-3、1-309中)。大多數(shù)cxc趨化因子吸引嗜中性白細胞。例如,cxc趨化因子白介素8(IL-8)、血小板因子4(PF4)和嗜中性粒細胞活化肽2(NAP-2)是嗜中性粒細胞的有效化學吸引劑和活化劑。命名為MIG(Y干擾素誘導的單核因子)和IP-10(干擾素-Y可誘導的10kDa蛋白質)的CXC趨化因子在誘導活化外周血淋巴細胞的趨化性中特別有活性。CC趨化因子一般具有較低的選擇性并且可吸引多種白細胞類型,包括單核細胞、嗜酸性粒細胞、嗜堿性粒細胞、T淋巴細胞、粒細胞和自然殺傷細胞。CC趨化因子如人單核細胞趨化蛋白l-3(MCP-l、MCP-2和MCP-3)、RANTES(調節(jié)活化、正常T細胞表達和分泌)和巨噬細胞炎癥蛋白la和f3(MIP-la和MIP-lp)已經(jīng)被鑒定為單核細胞或淋巴細胞的化學吸引劑和活化劑,但似乎不是嗜中性粒細胞的化學吸引劑。CC和CXC趨化因子通過屬于七個跨膜G蛋白偶聯(lián)受體的超家族的受體起作用(Murphy'P.M.'泡謂co/細52:145-176(2000))。此G蛋白偶聯(lián)受體家族包括一大組包含7個跨膜區(qū)的整合膜蛋白。這些受體可與G蛋白偶聯(lián),所述G蛋白是異三聚調節(jié)蛋白,能結合GTP并例如通過胞內(nèi)介質的產(chǎn)生介導來自偶聯(lián)受體的信號轉導。此外,趨化因子受體可不依賴于G蛋白偶聯(lián)而起作用。例如,主要在紅細胞上表達的Duffy受體是一種混雜性趨化因子結合受體,其被認為起趨化因子作用,從循環(huán)環(huán)境中去除趨化因子。一般來說,趨化因子和趨化因子受體相互作用傾向于混雜,因為一個趨化因子可結合很多個趨化因子受體,而相反單個趨化因子受體可與數(shù)個趨化因子相互作用。趨化因子受體信號轉導和配體選擇性的很多方面以前未被了解。例如,有許多孤兒受體的功能以前還未被確定。例如,盡管早期認為RDC1是血管活性腸肽(VIP)的受體,但是直到最近才認為它是孤兒受體,因為它的內(nèi)源性配體還未被鑒定。參見,例如Cook#X,F五肪丄e敗300(2):149-152(1992)。最近,更名為CXCR7的RDC1被確定與趨化因子SDF-1和I-TAC兩者結合。參見,例如PCT/US04Z34807和美國專利申請第10/698,541、10/912,638和11/050,345號,它們中的每個全部內(nèi)容都通過引用并入本文。發(fā)明概述本發(fā)明提供了與CXCR7表位結合的抗體。在一些實施方案中,本發(fā)明提供了與以下結合的抗體由FSDISWPC(SEQIDNO:12)組成的多肽;或由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽;或如本文所述的其他CXCR7表位。在一些實施方案中,所述抗體與可檢測標記連接。在一些實施方案中,所述抗體為單克隆抗體。在一些實施方案中,所述抗體為人源化抗體。在一些實施方案中,所述抗體與由FSDISWPC(SEQIDNO:12)組成的多肽結合。在一些實施方案中,所述抗體與由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽結合。在一些實施方案中f斤述抗體與SDF-l競爭結合CXCR7。本發(fā)明還提供了包括藥學上可接受的賦形劑和抗體的藥物組合物,所述抗體與以下結合由FSDISWPC(SEQIDNO:12)組成的多肽;或由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽;或如本文所述的其他CXCR7表位。在一些實施方案中,所述抗體為單克隆抗體。在一些實施方案中,所述抗體為人源化抗體。在一些實施方案中,所述抗體與由FSDISWPC(SEQIDNO:12)組成的多肽結合。在一些實施方案中,所述抗體與由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽結合。本發(fā)明還提供了在生物樣品中檢測表達CXCR7的細胞的方法。在一些實施方案中,所述方法包括將所述生物樣品與抗體接觸并檢測所述抗體的存在,其中所述抗體與以下結合由FSDISWPC(SEQIDNO:12)組成的多肽;或由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽;或如本文所述的其他CXCR7表位。本發(fā)明還提供了治療、預防或改善疾病的方法(fortreating,preventingoramelioratingadisease),所述方法包括對有相應需要的個體施用抗體,其中所述抗體與以下結合由FSDISWPC(SEQIDNO:12)組成的多肽;或由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽;或如本文所述的其他CXCR7表位。.本發(fā)明還提供了抑制癌細胞增殖的方法。在一些實施方案中,所述方法包括對有相應需要的個體施用抗體,其中所述抗體與以下結合由FSDISWPC(SEQIDNO:12)組成的多肽;或由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽;或如本文所述的其他CXCR7表位。本發(fā)明還提供了抑制血管生成或血管化的方法。在一些實施方案中,所述方法包括對有相應需要的個體施用抗體,其中所述抗體與以下結合由FSDISWPC(SEQIDNQ:12)組成的多肽;或由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽;或如本文所述的其他CXCR7表位。在一些實施方案中,所述個體患有或易患關節(jié)炎。在一些實施方案中,所述個體患有癌癥。本發(fā)明還提供了鑒定CXCR7的調節(jié)劑的方法。在一些實施方案中,所述方法包括(a)將測試劑(testagent)與包含CXCR7的片段(例如含有SEQIDNO:30的不超過250個連續(xù)氨基酸)的多肽接觸,且其中所述多肽包括最小表位FSDISWP(SEQIDNO:39)或WPCNSSDCIV(SEQIDNO:40)或多肽FSDISWPC(SEQIDNO:12)或SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15);以及(b)選擇與所述多肽結合的劑,其中所述測試劑與所述多肽的結合指示所述測試劑是CXCR7活性的調節(jié)劑。在一些實施方案中,所述選擇步驟包括測量所述測試劑與SDF-1或I-TAC競爭結合所述多肽的能力。在一些實施方案中,所述多肽含有SEQIDNO:30的不超過50個連續(xù)氨基酸。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體與由SEQIDNO:2、8、9、11、12、14、15、16、17中的任一個或如本文所公開的其他形式組成的多肽結合。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體不包括在Balbanian等人,.說'o/og/c.CAew280(42):35760-35766(2005)中所公開的抗RDCl抗體(如抗體"9C4)。在一些實施方案中,與本文所述表位結合的抗體不包括抗體11G8或6E10和/或不包括在圖1中展示的可變區(qū)或在PCT/US06/15492中所述的其他抗CXCR7抗體。在一些實施方案中,所述抗體不包括在SEQIDNO:23、SEQIDNO:25、SEQIDNO:27或SEQIDNO:29中展示的可變區(qū)的互補決定區(qū)(CDR)。附圖簡述圖1描述了本發(fā)明的抗體(分別來自SEQIDNO:23、25、27和29的SEQIDNO:31-34)的一些互補決定區(qū)(CDR)的一些實施方案。圖2說明了肽對11G8染色435-CXCR7細胞的抑制結果。圖3說明了抗體11G8和6E10(分別是SEQIDNO:l-7、2、8-10、35-38、11、2、12-17、12、18、19、16、20和21)的肽競爭實驗的概述。定義本文命名為"CXCR7(也稱為"CCX-CKR2)的"RDC1是指假定七個跨膜結構域的G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)。參見,例如Burns等人,J£xpMet/.203(9):2201-13(2006)。CXCR7犬直向同源物(ortholog)最初在1991年得以鑒定。參見,Z^w/等人244:569-572(1989)。犬序列在Libert等人,/Vwc.Wev.18(7):1917(1990)中描述。小鼠序列在例如Heesen等人,/m;m,朋gew幼'c547:364-370(1998)中描述。人序列在例如Sreedharan等人,尸rac.Mz//.^cac/.USA88:4986-4990(1991)中描述,此文獻錯誤地將該蛋白描述成血管活性腸肽的受體。"CXCR7包括SEQIDNO:30以及作為SEQIDNO:30的保守性修飾變體的序列。參見,例如PCT/US04/34807。CXCR7的片段是上文列出的序列中的一個或其保守修飾變體的,至少5個、有時至少IO、20、50、100、200、300個或最多300個連續(xù)氨基酸的片段。與特定多肽"結合"的抗體是指與所述多肽競爭結合CXCR7(例如SEQIDNO:30)的抗體,如在細胞上表達并由FACS測量的。"受治療者"或"個體"是指包括人、非人靈長類、小鼠、大鼠、犬或其他哺乳動物的動物。"化學治療劑"是指當其對個體施用時足以引起癌性細胞生長的抑制、延緩或阻礙或者足以在癌性細胞中產(chǎn)生細胞毒性效應的劑。"抗體"是指包括來自特異性結合并識別抗原的免疫球蛋白基因或其片段的構架區(qū)的多肽。已識別的免疫球蛋白基因包括k、X、a、Y、5、s和)i恒定區(qū)基因,以及許多個免疫球蛋白可變區(qū)基因。輕鏈分為k或X。重鏈分為Y、P、a、5或£,它們分別依次定義免疫球蛋白類IgG、IgM、1gA、IgD和IgE。天然存在的免疫球蛋白具有常用的核結構,其中兩個相同的輕鏈(約24kD)和兩個相同的重鏈(約55或70kD)形成四聚體。每個鏈的氨基端部分稱為可變(V)區(qū)且可不同于每個鏈剩余部分的更保守的恒定(C)區(qū)。在輕鏈的可變區(qū)內(nèi)是稱為J區(qū)的C端部分。在重鏈的可變區(qū)內(nèi),除了J區(qū)之外還有D區(qū)。免疫球蛋白的大多數(shù)氨基酸序列變化限定于直接涉及抗原結合的被稱為高變區(qū)或互補決定區(qū)(CDR)的V區(qū)的三個單獨位置。從氨基端開始,這些區(qū)分別命名為CDR1、CDR2和CDR3。更保守的構架區(qū)(FR)將CDR固定在應有的位置上。從氨基端開始,這些區(qū)分別命名為FR1、FR2、FR3和FR4。CDR與FR區(qū)的位置和編號系統(tǒng)已被例如Kabat等人(Kabat等人,SequencesofProteinsofImmunologicalInterest(免疫學關注的蛋白序列),第5版,美國健康和人類服務部,美國政府印刷局(1991))所定義。示例性的免疫球蛋白(抗體)結構單位包括四聚體。每個四聚體由相同的兩對多肽鏈組成,每對具有一個"輕"鏈(約25kDa)和一個"重"鏈(約50-70kDa)。每個鏈的N端定義主要對抗原識別負責的約100至110個或更多個氨基酸的可變區(qū)。術語可變輕鏈(V。和可變重鏈(VH)分別是指這些輕鏈和重鏈。例如,抗體以完整的免疫球蛋白或以通過用各種肽酶消化產(chǎn)生的許多具有顯著特征的大量片段而存在。因此,例如胃蛋白酶在鉸鏈區(qū)的二硫鍵下消化抗體以產(chǎn)生F(ab),2—Fab的二聚體,其本身是經(jīng)二硫鍵連接于VH-CH,的輕鏈。F(ab)'2可在溫和條件下被還原以使鉸鏈區(qū)的二硫鍵斷裂,因而使F(ab),2二聚體轉化成Fab,單體。Fab,單體實質上是具有部分鉸鏈區(qū)的Fab(參見FUNDAMENTALlMMUNOLOGY(基礎免疫學)(Paul編,第3版,1993)。盡管各種抗體片段根據(jù)完整抗體的消化來定義,但是技術人員應理解,這些片段可用化學方法或通過使用重組DNA方法學來從頭合成。因此,本文所用的術語抗體還包括通過修飾完整抗體所產(chǎn)生的抗體片段或使用重組DNA方法學從頭合成的那些抗體片段(例如單鏈Fv)或使用噬菌體展示文庫所鑒定的那些抗體片段(參見,例如McCafferty等人,vVa/wrc348:552-554(1990))。對于單克隆或多克隆抗體的制備,可使用本領域中已知的任何技術(參見,例如Kohler禾卩Milstein,TVa^re256:495-497(1975);Kozbor等人,/w聽冊/ogvr。勿4:72(1983);Cole等人,MonoclonalAntibodiesandCancerTherapy(單克隆抗體和癌癥治療)第77-96頁(1985))。"單克隆"抗體是指來源于單一克隆的抗體。用于產(chǎn)生單鏈抗體的技術(美國專利第4,946,778號)可適于產(chǎn)生本發(fā)明多肽的抗體。同樣,轉基因小鼠或其他生物體如其他哺乳動物可用來表達人源化抗體??蛇x地,噬菌體展示技術可用來鑒定與所選抗原特異性結合的抗體和異聚(heteromeric)Fab片段(參見,例如McCafferty等人,Atowre348:552-554(1990);Marks等人,10:779-783(1992》。"嵌合抗體"是一種抗體分子,在所述抗體分子中(a)恒定區(qū)或其部分被改變、取代(replace)或交換(exchange)以使抗原結合位點(可變區(qū))與不同或改變的類、效應功能和/或種類的恒定區(qū)、或對嵌合抗體賦予新特性的完全不同的分子如酶、毒素、激素、生長因子、藥物等等連接;或(b)可變區(qū)或其部分被改變、取代或交換為具有不同或改變的抗原特異性的可變區(qū)。"人源化"抗體是保留非人類抗體的反應性而人中的免疫原性較小的抗體。這可例如通過保留非人CDR區(qū)并將抗體的剩余部分用其人類相應部分(counterpart)取代來實現(xiàn)。參見,例如Morrison等人,尸rac.Ato/.^cat/."&4,81:6851-6855(1984);Morrison和Oi,A/v./附w麗o/.,44:65-92(1988);Verhoeyen等人,Sc/e"ce,239:1534-1536(1988);Padlan,Mo/ec/mww",,28:489-498(1991);Padlan,ikfo/ec./mm朋.,31(3):169-217(1994)。術語"分離的"當應用于蛋白質時,表示所述蛋白質基本上不含其在自然狀態(tài)中所伴隨的其他細胞組分。優(yōu)選它處于均質的狀態(tài),即使一些痕量雜質可存在。它可在干燥物或水性溶液中。純度和均一性(homogeneity)通常使用分析化學技術如聚丙烯酰胺凝膠電泳法或高效液相色譜法來測定。為存在于制品中的主要物質的蛋白質是大致純化的。術語"純化的"表示蛋白質在電泳凝膠中基本上產(chǎn)生一條帶。具體來說,它表示所述蛋白質至少85%純、更優(yōu)選至少95%純、且最優(yōu)選至少99%純。短語與抗體"特異性地(或選擇性地)結合"或"與特異性地(或選擇性地)免疫反應"當涉及蛋白質、糖蛋白或肽時,是指為蛋白質和其他生物制品的異質群體(heterogeneouspopulation)(如細胞溶解產(chǎn)物)中蛋白質存在的決定因素的結合反應。因此,在指定的免疫測定條件下,特定的抗體以至少兩倍背景與具體蛋白質結合并且基本上不以顯著量與存在于樣品中的其他蛋白質結合。通常特異性或選擇性反應為至少兩倍背景信號或噪音,且更通常多于10至100倍背景。術語"類肽物(peptidomimetic)"和"模擬物"是指大致具有與天然或非天然存在的多肽相同的結構和功能特性的合成化學化合物(例如與CXCR7結合的試劑)。肽類似物通常作為具有類似于模板肽性質的性質的非肽藥物用于醫(yī)藥工業(yè)。這些類型的非肽化合物稱為"肽模擬物"或"類肽物"(Fauchere,/Wv.i>wgA仏15:29(1986);Veber和FreidingerT7A^第392頁(1985);和Evans等人</.AfedCAem.30:1229(1987),所述文獻通過引用并入本文)。結構上類似于治療上有用的肽的肽模擬物可用來產(chǎn)生等價物或者使治療或預防效果提高。一般來說,類肽物在結構上類似于如在所感興趣的多肽中發(fā)現(xiàn)的范例多肽(即具有生物學或藥理學活性的多肽),但具有一個或多個任選地被下述鍵取代的肽鍵,所述鍵選自由例如-CH2NH-、-CH2S-、-ch2-ch2-、-chk:h-(順式和反式)、-coch2-、-<:!1(0印(:112-和-^280-組成的組。所述模擬物可完全由合成的、非天然的氨基酸類似物組成,或者是部分天然的肽氨基酸和部分非天然的氨基酸類似物的嵌合分子。所述模擬物還可并入任何量的天然氨基酸保守性置換,只要這些置換也不大致改變所述模擬物的結構和/或活性。例如,模擬物組合物在本發(fā)明的范圍內(nèi),如果它能實現(xiàn)所感興趣多肽的至少一種結合活性或酶活性。"配體"是指能與受體結合的劑,例如多肽或其他分子。"保守性修飾變體"應用于氨基酸和核酸序列。關于特定核酸序列,"保守性修飾變體"是指編碼相同或基本上相同的氨基酸序列的那些核酸,或者在所述核酸不編碼氨基酸序列的情形,指基本上相同的序列。因為遺傳密碼的簡并性,許多個核酸序列將編碼任何給定的蛋白質。例如,密碼子gca、gcc、gcg和gcu均編碼氨基酸丙氨酸。因此,在丙氨酸被密碼子指定的每個位置,所述密碼子可變成所述的對應密碼子之一而不改變編碼的多肽。這種核酸變化是"沉默變化",它們是一類保守性修飾變化。編碼多肽的本文的每個核酸序列還描述了核酸的每一種可能的沉默變化。技術人員應認識到,核酸中的每個密碼子(除了通常是蛋氨酸的唯一密碼子的aug和通常是色氨酸的唯一密碼子的tgg之外)可經(jīng)修飾產(chǎn)生功能上相同的分子。因此,編碼多肽的核酸的每個沉默變化內(nèi)含在每個所述序列中。關于氨基酸序列,本領域技術人員應認識到,如果改變導致氨基酸被化學上類似的氨基酸所置換,則在編碼序列中改變、添加或缺失單個氨基酸或小百分比的氨基酸的對核酸、肽、多肽或蛋白序列的個別置換、缺失或添加是"保守性修飾變體"。提供功能上類似的氨基酸的保守性置換表在本領域中眾所周知。這些保守性修飾變體是多態(tài)變體、種間同系物和本發(fā)明的等位基因以外的,并且不排除多態(tài)變體、種間同系物和本發(fā)明的等位基因。下述八個組各包含互相為保守性置換的氨基酸1)丙氨酸(A)、甘氨酸(G);2)門冬氨酸(D)、谷氨酸(E);3)門冬酰胺(N)、谷氨酰胺(Q);4)精氨酸(R)、賴氨酸(K);5)異亮氨酸(I)、亮氨酸(L)、蛋氨酸(M)、纈氨酸(V);6)苯丙氨酸(F)、酪氨酸(Y)、色氨酸(W);7)絲氨酸(S)、蘇氨酸OO;和8)半胱氨酸(C)、蛋氨酸(M)(參見,例如Creighton,PratoVw(1984))。"序列同一性的百分比"通過經(jīng)比較窗比較兩個最佳比對序列來確定,其中多核苷酸序列在比較窗中的部分與用于兩個序列的最佳比對的參考序列(其不包括添加或缺失)相比可包括添加或缺失(即缺口)。百分比通過以下來計算確定兩個序列中存在的相同的核酸堿基或氨基酸殘基的位置數(shù)以得出匹配位置數(shù),然后用所述匹配位置數(shù)除以比較窗中的位置總數(shù)并將結果乘以100以得出序列同一性的百分比。在兩個或更多個核酸或多肽序列的上下文中的術語"相同的"或百分比"同一性"是指當經(jīng)比較窗或使用下述序列比較算法中的一種或通過手動比對和視覺檢查所測量的指定區(qū)內(nèi)比較和比對最大對應性時,相同的或具有相同的氨基酸殘基或核苷酸的特定百分比(即在特定區(qū)域內(nèi),例如本發(fā)明的完整多肽序列或本發(fā)明的多肽的胞外結構域的60%同一性、任選地65%、70%、75%、80%、85%、90%或95%同一性)的兩個或多個序列或子序列。然后這些序列被稱為"大致相同的"。這種定義還指測試序列的互補序列。任選地,同一性在長度為至少約50個核苷酸的區(qū)域內(nèi)、或更優(yōu)選在長度為100至500個或1000個或更多個核苷酸的區(qū)域內(nèi)存在。對于序列比較,通常一個序列起參考序列的作用,測試序列與所述參考序列比較。當使用序列比較算法時,將測試序列和參考序列輸入到計算機中,如果必要則指定子序列坐標,并且指定序列算法程序參數(shù)。可使用默認程序參數(shù),或者可指定替代參數(shù)。然后序列比較算法基于程序參數(shù)來計算測試序列相對于參考序列的百分比序列同一性。本文所用的"比較窗"包括選自由例如全長序列或從20至600個、約50至約200個、或約100至約150個氨基酸或核苷酸組成的組的任一個連續(xù)位置數(shù)的區(qū)段(其中在最佳比對兩個序列后,序列可與具有相同連續(xù)位置數(shù)的參考序列進行比較)的參考。用于比較的序列比對方法在本領域中眾所周知。用于比較的最佳序列比對可例如通過Smith和Waterman(1970)爿c/v.M3仇2:482c的局部同源性算法、通過Needleman和Wunsch(1970)/7kfo/.歷o/.48:443的同源性比對算法、通過Pearson和Lipman(1988)尸rac.A^7.^cac/.WSL485:2444的相似性搜索方法、通過計算機化執(zhí)行這些算法(WisconsinGenetics軟件包中的GAP、BESTFIT、FASTA禾口TFASTA,GeneticsComputerGroup,575Science,Madison博士,WI)或者通過手動比對和視覺檢查(參見,例如Ausubel等人,CwreWPratoco/s/Kfo/ecw/ar歷o/ogy(分子生物學最新方案)(1995增補))來進行。適合于確定序列同一性和序列相似性百分比的算法的實例是BLAST和BLAST2.0算法,它們分別在Altschul等人(1977)Jc,'A25:3389-3402和Altschul等人(1990)JMo/.215:403-410中描述。用于進行BLAST分析的軟件可通過美國國家生物技術信息中心(http:〃www.ncbi.nlm.nih.gov/)公開得到。這種算法包括首先通過鑒定查詢序列中長度W的短字來鑒定高評分序列對(HSP),所述短字當與數(shù)據(jù)庫序列中相等長度的字比對時匹配或滿足某些正值閾值評分T。T被稱為鄰近字評分閾值(Altschul等人,同上)。這些初始的鄰近字匹配字串(hit)用作啟動搜索以發(fā)現(xiàn)包含它們的更長HSP的種子。然后沿著每個序列以兩個方向延伸字匹配字串,直至不可增加累積比對評分。對于核苷酸序列,累積評分使用參數(shù)M(匹配殘基對的獎勵評分;總是X))和N(錯配殘基的懲罰評分;總是O)來計算。對于氨基酸序列,累積評分使用評分矩陣計算。當出現(xiàn)以下情況時,則字匹配字串在每個方向的延伸停止累積比對評分從其最大達到值減少X量;累積評分由于一個或多個負評分殘基比對的累積而變?yōu)榱慊蛄阋韵?;或者到達任一個序列的末端。BLAST算法參數(shù)W、T和X確定比對的敏感性和速度。BLASTN程序(對于核苷酸序列)默認使用字長(W)11、期望值(E)10、N^5、N^4和兩鏈的比較。對于氨基酸序列,BLASTP程序默認使用字長3和期望值(E)IO和BLOSUM62評分矩陣(參見Henikoff和Henikoff(1989)尸rac.A^/.爿cad"&489:10915)比對(B)50、期望值(E)10、M=5、N二4和兩鏈的比較。,BLAST算法還進行兩個序列之間相似性的統(tǒng)計分析(參見,例如Karlin和Altschul(1993)尸rac.TVa".^a^.OX490:5873-5787)。BLAST算法所提供的一種相似性量度是最小總和概率CP(N)),其提供了兩個核苷酸或氨基酸序列之間的匹配隨機發(fā)生的概率的指示。例如,如果核酸與參考核酸的比較中的最小總和概率小于約0.2、更優(yōu)選小于約0.01、且最優(yōu)選小于約0.001時,則認為所述測試核酸與所述參考序列相似。如下所述,兩個核酸序列或多肽大致相同的指示是第一核酸所編碼的多肽與對抗第二核酸所編碼的多肽而產(chǎn)生的抗體具有免疫交叉反應性。因此,例如,如果多肽與第二多肽只是通過保守性置換而不同,則所述兩個肽通常大致相同。如下所述,兩個核酸序列大致相同的另一個指示是兩個分子或其互補序列在嚴格條件下互相雜交。兩個核酸序列大致相同的又一個指示是可使用相同的引物來擴增序列。發(fā)明詳述/,岸#本發(fā)明提供了與SDF-1與I-TAC趨化因子競爭CXCR7的結合的抗體的表位的鑒定。因此,本發(fā)明提供了結合涉及配體結合和/或信號轉尋的CXCR7表位的抗體。此外,還提供了與表位結合的劑的篩選方法,作為用于鑒定用來通過CXCR7受體調節(jié)信號轉導的拮抗劑和激動劑的方法。指定為11G8和6E10的抗體與SDF-1競爭對CXCR7的結合,因此對所述抗體結合的表位進行作圖(mapped)。測試表1中所示的肽與抗體競爭結合的能力。表l<table>tableseeoriginaldocumentpage16</column></row><table>SEQIDNO:2、11、12、14和18與抗體11G8競爭。SEQIDNO:2、8、9、15、16和17與抗體6E10競爭。確定抗體11G8的最小表位為FSDISWP(SEQIDNO:39),而抗體6E10的最小表位為WPCNSSDCIV(SEQIDNO:40)。//,錄柳齊沐本發(fā)明提供了與SEQIDNO:2、8、9、11、12、14、15、16、17中的任一個或如本文所述的其他表位結合的抗體。本發(fā)明提供了使用抗CXCR7的抗體治療、診斷和預后涉及CXCR7的疾病和病癥的試劑和方法。涉及CXCR7的疾病和病癥下文示例更多,并且包括但不限于癌癥、涉及過度或異常的血管生成的疾病和關節(jié)炎。在一些實施方案中,所述抗體是分離的。在一些實施方案中,所述抗體與CXCR7結合并與趨化因子SDF-1和I-TAC競爭結合CXCR7。CXCR7結合的競爭測定在例如PCT/US04/34807和美國專利公布第US2004/0170634和2005/0074826號中描述。抗體結合的競爭通過在肽的存在下與單獨抗體相比抗體結合的減少來確定。競爭通過如FACS所測量的0.5個對數(shù)、優(yōu)選1個對數(shù)、更優(yōu)選2個對數(shù)或更高對數(shù)的轉變(shift)來指不。在本發(fā)明的一些實施方案中,所述抗體與CXCR7結合但不與人外周血結合。例如,在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體不與下述細胞的至少一種結合嗜堿性粒細胞、單核細胞、漿細胞樣樹突狀細胞;8細胞或004+T細胞。CDR區(qū)與FR區(qū)的位置和編號系統(tǒng)以前已經(jīng)例如由Kabat等人(Kabat等人,SequencesofProteinsoflmmLmologicalInterest(免疫學關注的蛋白序列),第5版,美國健康和人類服務部,美國政府印刷局(1991))描述。CDR一般可使用NCBIIgBLAST算法來鑒定。本領域技術人員應認識到,不同的序列算法可提供CDR在特定抗體氨基酸序列中的位置的略微不同的描述。在一些情況下罩鏈CDR存在于氨基酸位置31-35(CDR1)、50-65(CDR2)和96-102(CDR3)。在一些情況下,輕鏈CDR存在于氨基酸位置24-34(CDRl)、50-56(CDR2)和89-97(CDR3)。在一些實施方案中,CDR如圖1中所述表示。特定抗體與另一個抗體識別相同表位的能力通常通過一個抗體競爭性抑制第二抗體與抗原例如與CXCR7或其片段或其融合體的結合的能力來確定。許多競爭性結合測定中的任一種可用來測量兩個抗體之間對同一抗原的競爭。示例性測定是Biacore測定。簡要來說,在這些測定中,結合位點可通過測試相互作用物(如不同抗體)抑制另一個的結合的能力從結構上作圖。以充分的濃度注射兩份連續(xù)抗體樣品可鑒定同一結合表位的競爭抗體對。在每次注射下所述抗體樣品應該有可能達到有效的飽和。第二抗體注射的凈結合顯示結合表位分析。可用兩個響應水平來描述由于表位不同造成的完全競爭相對非競爭結合的界限。第二抗體注射的結合響應相對于相同和不同結合表位的結合的相對量確定表位重疊的程度??贵w可識別線性或構象表位,因此當識別不同和遠端的表位時,抗體可以是競爭性的。本領域已知的其他常規(guī)的免疫測定可用于本發(fā)明。例如,抗體可使用夾心ELISA測定通過其結合的表位加以區(qū)分。這通過使用捕獲抗體將孔的表面涂層來進行。然后將亞飽和濃度的加標簽(tagged)抗原加至所述捕獲表面。這種蛋白將通過特異性抗體表位相互作用與抗體結合。在洗滌后,將已與可檢測部分(例如HRP,而標記的抗體被定義為檢測抗體)共價連接的第二抗體加至ELISA。如果這種抗體與捕獲抗體識別相同的表位,那么該抗體將不能與靶蛋白結合,因為該特定表位不再可用于結合。然而如果這種第二抗體識別靶蛋白上的不同表位,那么它將能夠結合,并且這種結合可通過使用有關底物定量活性的水平(因此定量結合的抗體)來檢測。背景通過使用單一抗體作為捕獲抗體和檢測抗體來定義,而最大信號可通過用抗原特異性抗體捕獲并用針對抗原上的標簽的抗體進行檢測來建立。通過使用背景和最大信號作為參考,可以以配對方式評價抗體從而確定表位特異性。使用上文所述的任一種測定,如果在第一抗體的存在時的第二抗體與抗原的結合下降至少30%,通常至少約40%、50%、60%或75%,且經(jīng)常至少約90%,則認為第一抗體競爭性抑制第二抗體的結合。制備多克隆抗體的方法為技術人員所已知。多克隆抗體可例如通過免疫劑和佐劑(如需要)的一次或多次注射在哺乳動物中產(chǎn)生。典型地,所述免疫劑和/或佐劑通過多次皮下或腹膜內(nèi)注射在哺乳動物中注射。所述免疫劑可包括核酸所編碼的蛋白質或其片段或其融合蛋白。將所述免疫劑與已知在被免疫的哺乳動物中具有免疫原性的蛋白軛合可以是有用的。這種免疫原性蛋白的實例包括但不限于鑰孔戚血藍蛋白(keyholelimpethemocyanin)、血清白蛋白、牛甲狀腺球蛋白和大豆胰蛋白酶抑制劑??墒褂玫淖魟┑膶嵗ǜナ贤耆魟┖蚆PL-TDM佐劑(單磷酰脂質A、合成型海藻糖雙白喉菌酸酯(trehaiosedicorynomycolate))。免疫方案可由本領域技術人員來選擇,而不需過多的實驗??蛇x地,所述抗體可以是單克隆抗體。單克隆抗體可使用雜交瘤方法如由Koher和Milstein,Atowre256:495(1975)描述的那些方法來制備。在雜交瘤方法中,小鼠、倉鼠或其他適合的宿主動物通常用免疫劑免疫以引發(fā)產(chǎn)生或能產(chǎn)生與所述免疫劑特異性結合的抗體的淋巴細胞。可選地,所述淋巴細胞可被體外免疫。所述免疫劑通常包括CXCR7多肽或其片段或融合體。一般來說,如果想要人來源細胞,則使用外周血淋巴細胞("PBL"),或者如果想要非人哺乳動物來源,使用脾細胞或淋巴結細胞。然后使用適合的融合劑如聚乙二醇將所述淋巴細胞與永生細胞系融合以形成雜交瘤纟田胞(Goding,MonoclonalAntibodies:PrinciplesandPractice(單克隆抗體原理和實踐),第59-103頁(1986))。永生細胞系通常是轉化的哺乳動物細胞,特別是嚙齒類動物、牛和人來源的骨髓瘤細胞。通常使用大鼠或小鼠骨髓瘤細胞系。雜交瘤細胞可在包含抑制未融合的永生細胞的生長或存活的一種或多種物質的適合培養(yǎng)基中培養(yǎng)。例如,如果親本細胞缺乏酶次黃嘌呤鳥嘌呤磷酸核糖轉移酶(HGPRT或HPRT),那么雜交瘤的培養(yǎng)基通常將包括次黃嘌呤、氨基喋呤和胸苷("HAT培養(yǎng)基"),這些物質防止HGPRT缺陷型細胞的生長。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體是與包含SEQIDNO:23和SEQIDNO:25或者SEQIDNO:27和SEQIDNO:29的抗體競爭結合CXCR7的嵌合抗體或人源化抗體。如上所述,抗體的人源化形式是嵌合的免疫球蛋白,其中人抗體的互補決定區(qū)(CDR)的殘基被來自具有期望的特異性、親和性和容量的非人物種(如小鼠、大鼠或兔)CDR的殘基所取代。例如,SEQIDNO:23和SEQIDNO:25或者SEQIDNO:27和SEQIDNO:29的CDR可插入到人抗體的構架中。人抗體可使用本領域已知的各種技術來制備,所述技術包括噬菌體展示文庫(Hoogenboom和Winter,乂Mo/.B/o/.227:381(1991);Marks等人,J.Afo/.S/o/.222:581(199]))。Cole等人和Boerner等人的技術也用于人單克隆抗體的制備(Cole等人,MonoclonalAntibodiesandCancerThempy(單克隆抗體和癌癥治療),第77頁(1985)和Boerner等人.,7/w/7m"o/.147(1):86-95(1991))。同樣地,人抗體可通過將人免疫球蛋白位點引入到轉基因動物(如內(nèi)源性免疫球蛋白基因已部分或完全失活的小鼠)中而制得。攻擊后,觀察到人抗體產(chǎn)生,這在包括基因重排、裝配和抗體譜的所有方面都非常類似于在人中所看到的。這種方法例如在美國專利第5,545,807;5,545,806;5,569,825;5,625,126;5,633,425;5,661,016號和下列科學出版物中描述Marks等人,S/o/Tfec/wo/ogv10:779-783(1992);Lonberg等人,Atowre368:856-859(1994);Morrison,Atowe368:812-13(1994);Fishwild等人,淑we腸,ec/mo/,14:845-51(1996);Neuberger,Ato,歷她c/mo/ogy14:826(1996);Lonberg和Huszar,/"temTev.7m畫朋/.13:65-93(1995)。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體是單鏈Fv(scFv)。scFv抗體的VH和Vl區(qū)(例如SEQIDNO:12和SEQIDNO:14或者SEQIDNO:16和SEQIDNO:18)包括折疊形成類似于在兩鏈抗體中存在的抗原結合位點的單鏈。折疊后,非共價相互作用使單鏈抗體穩(wěn)定。盡管一些抗體實施方案的Vh和VL區(qū)可直接連接在一起,但是技術人員應理解所述區(qū)域可被由一個或多個氨基酸組成的肽接頭分開。肽接頭及其用途在本領域中眾所周知。參見,例如Huston等人,尸rac.脂'"cw/.Scz'.固8:5879(1988);Bird等人^c/ewe242:4236(1988);Glockshuber等人^/oc/ze脂'^729:1362(1990);美國專利第4,946,778號、美國專利第5,132,405號和Stemmer等人,歷ofec/zm々w^14:256-265(1993)。一般來說,除了連接所述區(qū)域或在VH和V,j之間保持一些最小距離或其他空間關系之外,肽接頭不具有任何特異性生物活性。然而,可選擇肽接頭的組成氨基酸來影響分子的一些特性如折疊、凈電荷或疏水性。單鏈Fv(scFv)抗體任選地包括長度為不超過50個氨基酸、一般不超過40個氨基酸、優(yōu)選不超過30個氨基酸、且更優(yōu)選不超過20個氨基酸的肽接頭。在一些實施方案中,所述肽接頭是序列Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(SEQIDNO:41)的多聯(lián)體、優(yōu)選2、3、4、5或6個這種序列的多聯(lián)體。但是,應理解可在所述接頭中進行一些氨基酸置換。例如,可用纈氨酸取代甘氨酸。已經(jīng)描述了制備scFv抗體的方法。參見,Huse等人,&/ece246:1275-1281(1989);Ward等人,淑廳341:544-546(1989);和Vaughan等人,A^ww5/otec/2.14:309-314(1996)。簡短來說,從免疫動物的B細胞中分離mRNA并制備cDNA。使用對免疫球蛋白的重鏈和輕鏈的可變區(qū)特異性的引物擴增cDNA。純化PCR產(chǎn)物并連接核酸序列。如果需要接頭肽,則在重鏈和輕鏈核酸序列之間插入編碼所述肽的核酸序列。將編碼scFv的核酸插入到載體中并在適合的宿主細胞中表達。與期望的抗原特異性結合的scFv通常經(jīng)由噬菌體展示文庫的淘選而發(fā)現(xiàn)。淘選可通過數(shù)種方法中的任二種來進行。淘選可使用在其表面上表達期望抗原的細胞或使用涂有期望抗原的固體表面而方便地進行。方便地,所述表面可以是磁珠。將未結合的噬菌體從固體表面洗掉并洗脫結合的噬菌體。找出具有最高親和性的抗體由選擇過程的效率決定并依賴于可篩選的克隆數(shù)目和用來進行篩選的嚴格性。通常地,更高的嚴格性對應于更具選擇性的淘選。但是,如果條件過于嚴格,則噬菌體將不結合。在一輪淘選后,與CXCR7涂層的板或與在其表面上表達CXCR7細胞結合的噬菌體在大腸桿菌OE.co/0中增殖(expand)并經(jīng)受另一輪淘選。以這種方式,在3輪淘選中實現(xiàn)很多倍的富集。因此,即使當每輪的富集低時,多輪淘選仍將導致罕見噬菌體和所含遺傳物質的分離,所述遺傳物質編碼具有最高親和性或在噬菌體上更好地表達的scFv。無論所選的淘選方法如何,由噬菌體展示所提供的基因型和表型之間的物理聯(lián)系使測試cDNA文庫、即使大的克隆文庫的每個成員與抗原的結合成為可能。在一個實施方案中,所述抗體是雙特異性抗體。雙特異性抗體是對至少兩種不同的抗原具有結合特異性或對同一抗原上的兩個表位具有結合特異性的單克隆抗體(包括但不限于人或人源化抗體)。在一個實施方案中,一種結合特異性是針對CXCR7蛋白質,而另一種是針對另一種不同的癌癥抗原。可選地,四聚體型技術可產(chǎn)生多價試劑。在一些實施方案中,所述抗體與效應部分軛合。所述效應部分可以是任何數(shù)目的分子(包括可檢測的標記部分如放射性標記或熒光標記),或者可以是治療性部分。在其他實施方案中,所述治療性部分是細胞毒劑。在此方法中,將所述細胞毒劑靶向癌組織或細胞使得患病細胞數(shù)下降,因此使與癌癥相關的癥狀減輕。細胞毒劑有很多且是各種各樣的,包括但不限于細胞毒性藥物或毒素或這些毒素的活性片段。適合的毒素及其相應片段包括白喉A鏈、外毒素A鏈、蓖麻毒素A鏈、相思豆毒蛋白A鏈、麻風樹毒蛋白、巴豆毒蛋白、酚霉素、依諾霉素、auristatin及類似毒素。細胞毒劑還包括通過將放射性同位素與本發(fā)明抗體軛合而制備的放射化學試劑。///兗度縱本發(fā)明的抗體可使用許多種公認的免疫結合測定中的任一種用來檢測CXCR7或表達CXCR7的細胞(參見,例如美國專利4,366,241;4,376,110;4,517,288;和4,837,168)。對于一般免疫測定的綜述,還參見MethodsinCellBiology(細胞生物學方法),第37巻,Asai編,AcademicPress,Inc.NewYork(1993);Sw/c(://"^0〃附附麗0/0^><基礎和臨床免疫學)第7版,Stites和Terr編(1991)。因此,本發(fā)明提供了檢測表達CXCR7的細胞的方法。在一種方法中,對受治療者進行活組織檢查并體外測試收集的組織。然后將所述組織或來自所述組織的細胞與本發(fā)明的抗CXCR7抗體接觸。所形成的任何免疫復合物顯示CXCR7蛋白質在活組織檢查樣品中存在。為了便于進行這種檢測,可將抗體進行放射標記或使抗體與為可檢測標記(如熒光標記)的效應分子偶聯(lián)。在另一種方法中,所述細胞可使用成像系統(tǒng)在體內(nèi)被檢測。然后,確定標記的定位??墒褂糜糜谑乖\斷成像可視化的常規(guī)方法。例如,順磁性同位素可用于MRI。抗體的內(nèi)在化可能對延長生物體內(nèi)的壽命超過細胞外結合所提供的壽命是重要的,所述細胞外結合通過與循環(huán)清除偶聯(lián)的細胞外酶環(huán)境而易于清除。CXCR7蛋白質還可使用標準免疫測定法和本發(fā)明的抗體來檢測。標準方法包括,例如放射免疫測定、夾心免疫測定(包括ELISA)、免疫熒光測定、蛋白質印跡、親和色譜法(親和配體與固相結合)以及以標記抗體原位檢測。也可使用次級檢測劑,例如山羊抗小鼠FITC??蓱眉夹g的一般綜述可在Harlow禾卩Lane,J"W60c/Ze5:爿Z^6orator_yMowwa/(抗體實驗室手冊)(1988)中發(fā)現(xiàn)。本發(fā)明提供了檢測癌細胞的方法,其包括提供癌癥預后或診斷的方法。CXCR7在迄今為止所測試的幾乎每一種癌細胞中表達,而CXCR7的正常(非癌)表達似乎限于腎臟和一些腦細胞以及在胎肝的某些發(fā)育階段中。參見,例如PCT/US04/34807和美國專利申請第10/698,541和10/912,638號。因此,CXCR7在細胞中、特別是在非胎兒細胞和/或腎臟或腦細胞以外細'胞'中的表達,表明癌細胞的可能存在。CXCR7在組織細胞或組織的血管內(nèi)皮中的存在也表明癌癥的存在。在一些情況下,使用本領域已知的其他方法來證實包含表達CXCR7的細胞的樣品中癌細胞的存在。依照本發(fā)明的又一個方面,提供了用于選擇患有或疑似患有癌癥的受治療者的療程的方法。所述方法包括從受治療者獲得生物樣品,將所述樣品與特異性結合CXCR7的抗體或其結合抗原片段接觸,檢測抗體結合是否存在,以及選擇適于所述受治療者的癌癥的療程。在一些實施方案中,所述治療是對所述受治療者施用本發(fā)明的CXCR7抗體。本發(fā)明提供了診斷人疾病的方法,所述疾病包括但不限于癌癥,例如癌、神經(jīng)膠質瘤、間皮瘤、黑素瘤、淋巴瘤、白血病、腺癌、乳癌、卵巢癌、子宮頸癌、成膠質細胞瘤、白血病、淋巴瘤、前列腺癌和伯基特(Burkitt)淋巴瘤、頭頸癌、結腸癌、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、食道癌、胃癌、胰腺癌、肝膽管癌、膽嚢癌、小腸癌、直腸癌、腎癌、膀胱癌、前列腺癌、陰莖癌、尿道癌、睪丸癌、子宮頸癌、陰道癌、子宮癌、卵巢癌、甲狀腺癌、甲狀旁腺癌、腎上腺癌、胰臟內(nèi)分泌癌(pancreaticendocrinecancer)、類癌(carcinoidcancer)、骨癌、皮月夫癌、視網(wǎng)膜母纟田胞瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤(其它癌癥參見CANCER:PRINCIPLESANDPRACTICE(癌癥理論與實踐)(DeVita,V.T.等人編1997));以及腦和神經(jīng)元機能障礙,如阿爾茨海默病和多發(fā)性硬化;腎機能障礙;類風濕性關節(jié)炎;心臟同種異體移植物排斥;動脈粥樣硬化;哮喘;腎小球腎炎;接觸性皮炎;炎性腸??;結腸炎;牛皮癬;再灌注損傷;以及本文所述的其他病癥和疾病。CVOf7效謬伊浙Af魏,f菱沐謬伊微紹許多種不同的篩選方案可用于鑒定調節(jié)在細胞中、特別是哺乳動物細胞中、尤其在人細胞中CXCR7活性或功能的水平的劑。概括來說,篩選方法包括篩選多個劑(例如通過與CXCR7片段結合并防止本發(fā)明抗體與CXCR7片段結合或活化CXCR7)以鑒定與包括SEQIDNO:2、8、9、11、12、14、15、16、17任一或如本文所述的其他序列的多肽(包括含有這些序列的CXCR7的片段)相互作用的劑。在一些實施方案中,劑結合CXCR7的親和性為至少約1.5、2、3、4、5、10、20、50、100、300、500或1000倍于所述劑對另一種蛋白質的親和性。在一些實施方案中,包括本文所述的表位的CXCR7片段(以及任選地包括在N端和/或C端的更多非CXCR7氨基酸)不超過例如300、250、200、150、100、50、40、30、20或更少的氨基酸。在一些實施方案中,所述CXCR7片段是含有少于所有的全長CXCR7多肽的氨基酸的任何片段。l.趨化因子受體結合測定在一些實施方案中,CXCR7調節(jié)劑通過篩選與本發(fā)明抗體競爭結合CXCR7多肽或其片段的分子來鑒定。本領域技術人員應認識到有許多種進行競爭分析的方法。在一些實施方案中,含有CXCR7的樣品與本發(fā)明的標記抗體(例如至少包括SEQIDNO:23、SEQIDNO:25、SEQIDNO:27和/或SEQIDNO:29的CDR的抗體)預溫育,然后與潛在的競爭劑分子接觸。在測試化合物的存在下,與CXCR7結合的抗體量的變化(例如減少)表明所述測試化合物是潛在的CXCR7調節(jié)劑。初步篩選可通過篩選能與CXCR7結合的劑來進行,因為如此鑒定的至少某些劑有可能是趨化因子受體調節(jié)劑。結合測定通常包括將CXCR7與一種或多種測試劑接觸并給予足夠的時間使所述蛋白和測試劑形成結合復合物。所形成的任何結合復合物可使用許多種成熟分析技術中的任一種來檢測。蛋白結合測定包括但不限于免疫組織化學結合測定、流式細胞術、放射配體結合、銪標記的配體結合、生物素標記的配體結合或保持CXCR7構象的其他測定。這些測定中所用的趨化因子受體可被天然表達、克隆或合成。結合測定可用來鑒定激動劑或拮抗劑。例如通過將CXCR7與潛在的激動劑接觸并測量CXCR7活性,有可能鑒定刺激CXCR7活性的那些分子。2.細胞和試劑本發(fā)明的篩選方法可以以體外測定或基于細胞的測定來進行。體外測定例如使用包括CXCR7的膜部分或全細胞來進行?;诩毎臏y定可在表'達-CXCR7的任何細胞中進行?;诩毎臏y定涉及含有CXCR7的全細胞或細胞部分以篩選劑的結合或所述劑對CXCR7活性的調節(jié)。根據(jù)本發(fā)明方法可用的示例性細胞類型包括,例如包括白細胞的任何哺乳動物細胞,如嗜中性粒細胞、單核細胞、巨噬細胞、嗜酸性粒細胞、嗜堿性粒細胞、肥大細胞和淋巴細胞(如T細胞和B細胞)、白血病細胞、伯基特淋巴瘤細胞、腫瘤細胞、內(nèi)皮細胞、周細胞、成纖維細胞、心肌細胞、肌細胞、乳腺腫瘤細胞、卵巢癌細胞、子宮頸癌細胞、成膠質細胞瘤細胞、肝細胞、腎細胞和神經(jīng)元細胞,以及真菌細胞(包括酵母)。細胞可以是原代細胞或腫瘤細胞或其他類型的永生細胞系。當然,CXCR7可在不表達內(nèi)源型CXCR7或已經(jīng)誘導表達的細胞中表達。在一些情況下,CXCR7片段以及蛋白融合體可用來篩選。當想要與CXCR7配體競爭結合的分子時,所用的CXCR7片段是能結合本發(fā)明抗體的片段。可選地,CXCR7的任何片段可用作鑒定結合CXCR7的分子的靶。CXCR7片段可包括CXCR7的任何片段,例如CXCR7的至少20、30、40、50個氨基酸至包含除了一個之外的所有其余氨基酸的蛋白。通常地,配體結合片段將包括CXCR7的跨膜區(qū)和Z或大部分或所有的胞外結構域。3.信號轉導或粘附活性在一些實施方案中,由CXCR7活化觸發(fā)的信號轉導用來鑒定CXCR7調節(jié)劑。趨化因子受體的信號轉導活性可用很多方法來確定。例如,信號轉導是指由受體與天然存在的配體的結合(例如CXCR7結合SDF-1或I-TAC)引起的細胞功能或結構的變化,并可包括受體內(nèi)在化、受體介導的信號轉導(例如哺乳動物G蛋白的活化、細胞質游離鈣濃度快速并短暫增加的誘導)、細胞響應功能(例如趨化性的刺激或炎癥介質的釋放)及類似信號轉導。可選地,信號轉導可通過檢測趨化因子受體介導的細胞粘附來確定。趨化因子和趨化因子受體之間的相互作用可通過整聯(lián)蛋白親和性和親合力的修飾導致快速粘附。參見,例如Laudanna,/mww"o/og/ca/7ev/em186:37-46(2002)。信號轉導還可通過定性和定量地測定第二信使如環(huán)狀AMP或肌醇磷酸來測量,以及也可監(jiān)控磷酸化或脫磷酸化事件。參見,例如Premack等人.A^weAfe&d"e2:1174-1178(1996)和Bokoch,86:1649-1660(1995)。此外,也可監(jiān)控CXCR7活化的其他下游事件以確定信號轉導活性。下游事件包括由于趨化因子受體的刺激而發(fā)生的那些活性或表現(xiàn)。示例性的下游事件包括,例如變化的細胞狀態(tài)(例如從正常細胞到癌細胞或從癌細胞到非癌細胞)。細胞響應包括細胞的粘附(例如到內(nèi)皮細胞)。也可監(jiān)控CXCR7調節(jié)劑對血管生成中牽涉的成熟信號轉導級聯(lián)(例如VEGF介導的信號轉導)的效應。劑促進血管生成的能力可在例如如由Leung等人(1989)246:1306-1309討論的雞胚絨毛尿嚢膜中評價。另一種選擇是用如由Rastinejad等人.(1989)Cell56:345-355討論的大鼠角膜進行測定。其他測定在美國專利第5,840,693號中公開。還可應用卵巢血管生成模型(參見,例如Zimmerman,R.C.等人.(2003)J.C7/"./騰W.112:659-669;Zimmerman,R.C.等人.(2001)AZ/cwra化.紐62:15-25;和Hixenbaugh,E.A.等人.(1993)Aec.235:487-500)。其他篩選方法基于下述觀察結果某些調節(jié)蛋白的表達受CXCR7的存在或活化而誘導。因此,這些蛋白的檢測可用來間接確定CXCR7的活性。進行一系列ELISA研究來比較用CXCR7轉染的細胞和未轉染細胞的細胞培養(yǎng)基中各種分泌的蛋白的相對濃度。通過這些研究,確定了CXCR7誘導許多種不同調節(jié)蛋白的產(chǎn)生,所述調節(jié)蛋白包括生長因子、趨化因子、金屬蛋白酶和金屬蛋白酶抑制劑。因此,所提供的某些篩選方法包括確定測試劑是否通過CXCR7調節(jié)某些生長因子、趨化因子、金屬蛋白酶和金屬蛋白酶抑制劑的產(chǎn)生。在某些情況下,所述測定使用在發(fā)現(xiàn)使CXCR7誘導性蛋白的產(chǎn)生增加的限制血清條件下生長的細胞(或其提取物)進行。下列蛋白是檢測的各種類別蛋白以及每種類別內(nèi)的特定蛋白的實例(1)生長因子(例如GM-CSF);(2)趨化因子(例如RANTES、MCP-1);(3)細胞因子(例如IL-6);(4)金屬蛋白酶(例如MMP3);和(5)金屬蛋白酶抑制劑(例如TIMP-1)。期望還可檢測到這些各種類別中的其他蛋白。這些具體蛋白可使用本領域已知的標準免疫檢測法來檢測。適于以高通量形式使用的一種方法例如是在多孔板中進行的ELISA。用于檢測TIMP-1的ELISA試劑盒可得自DakoCytomation(產(chǎn)品代號EL513)。檢測IL-6和MMP3的ELISA試劑盒可從RandDSystems獲得。特異性結合上文所列出的蛋白質的抗體的供應商的更多例子在下文實施例中提供。作為酶的蛋白質如金屬蛋白酶也可通過已知的酶測定來檢測。在其他實施方案中,測試潛在的CCX-CK2調節(jié)劑調節(jié)細胞粘附的能力。腫瘤細胞粘附內(nèi)皮細胞單層已被作為轉移侵入的模型進行研究(參見,例如Blood和Zetter,腸v/z隱—.爿cto,1032,89-119(19卯)。這些內(nèi)皮細胞單層模擬淋巴脈管系統(tǒng)并可用各種細胞因子和生長因子(例如TNFa和IL-l卩)剌激??稍陟o態(tài)粘附測定和在細胞處于流動條件下以模擬體內(nèi)脈管系統(tǒng)的力的測定中評價表達CXCR7的細胞粘附這種單層的能力。此外,評價粘附的測定還可在體內(nèi)進行(參見,例如vonAndrian,U.H.Mf'cra"Vrw/加.o".3(3):287-300(1996))。4,驗證最初通過前述篩選方法中的任一種所鑒定的劑可被進一步測試以驗證表觀活性。優(yōu)選地,這些研究用適合的動物模型來進行。這些方法的基本形式包括對用作人的疾病模型的動物施用在初始篩選時所鑒定的先導化合物,然后確定所述疾病(例如癌癥、心肌梗塞、創(chuàng)傷愈合或與血管生成相關的其他疾病)是否實際上得到調節(jié)和/或所述疾病或病癥是否得以改善。在驗證研究中應用的動物模型通常是任何種類的哺乳動物。適合動物的具體實例包括但不限于靈長類、小鼠、大鼠和斑馬魚。.在一些實施方案中,關節(jié)炎動物模型用來篩選和Z或驗證調節(jié)CXCR7的劑的治療用途。示例性的關節(jié)炎動物模型包括,例如膠原誘導的關節(jié)炎(CIA)動物模型。仗與CXC77裙互絲娜CXCR7調節(jié)劑(例如拮抗劑或激動劑)可包括,例如抗體(包括單克隆、人源化或本領域已知的結合蛋白的其他類型)、小有機分子、siRNA、CXCR7多肽或其變體、趨化因子(包括但不限于SDF-1和/或I-TAC)、趨化因子模擬物、趨化因子多肽等等。、經(jīng)測試為CXCR7調節(jié)劑的劑可以是任何小化學化合物或生物實體,如多肽、糖、核酸或脂質。可選地,調節(jié)劑可以是趨化因子或其他配體的遺傳上改變的形式或類肽形式。通常地,測試化合物將是小化學分子和肽。實質上任何化學化合物可在本發(fā)明的測定中用作潛在的調節(jié)劑或配體,盡管通常應用可溶解于水性或有機(尤其是基于DMSO)溶液的化合物。這些測定被設計成通過使測定步驟自動化以及提供任何適宜來源的化合物到測定中而篩選大型化學文庫,其通常平行運行(例如在機器人測定中在微量滴定板上以微量滴定形式)。應理解有很多化合物供應商,包括Sigma(St.Louis,MO)、Aldrich(St.Louis,MO)、Sigma層Aldrich(St.Louis,MO)、FlukaChemika-BiochemicaAnalytika(Buchs,Switzerland)及類似供應商。在一些實施方案中,所述劑具有少于1,500道爾頓、且在某些情況下少于1,000、800、600、500或400或300道爾頓的分子量。相對小尺寸的劑是所期望的,因為較小分子與具有較高分子量的劑相比,具有與良好藥動學特征(包括口服吸收)相容的物化特性的可能性更高。例如,根據(jù)滲透性和溶解性不太可能成功用作藥物的劑由Lipinski等人描述如下具有多于5個氫鍵供者(以OH和NH的總和表示);具有大于500的分子量;具有大于5的LogP(或MLogP大于4.15);和/或具有多于10個氫鍵受者(以N和O的總和表示)。參見,例如Lipinski等人./WvZ>MgDe//ve/7A"23:3-25(1997)。作為生物運載體底物的化合物種類通常是所述原則的例外。在一個實施方案中,高通量篩選方法包括提供包含大量潛在的治療化合物(潛在的調節(jié)劑或配體化合物)的組合化學文庫或肽文庫。然后將這些"組合化學文庫"或"配體文庫"在如本文所述的一種或多種測定中篩選以鑒定展示期望的特征活性的那些文庫成員(特別是化學物類或子類)。因此經(jīng)鑒定的化合物可用作常規(guī)的"先導化合物"或它們自身可用作潛在的或實際的治療劑。組合化學文庫是通過組合許多化學"結構單元"由化學合成或生物合成所產(chǎn)生的各種化學化合物的集合。例如,線性組合化學文庫如多肽文庫通過以給定化合物長度(即多肽化合物中的氨基酸數(shù)目)的每種可能方法組合一組化學結構單元(氨基酸)而形成。數(shù)百萬化學化合物可通過化學結構單元的這種組合混合來合成。組合化學文庫的制備和篩選為本領域技術人員眾所周知。這些組合化學文庫包括但不限于肽文庫(參見,例如美國專利5,010,175、Furka,乂尸e-.37:487-493(199)和Houghton等人,Atowrc354:84-88(1991))。也可使用產(chǎn)生化學多樣性文庫的其他化學物。這些化學物包括但不限于擬肽(例如PCT公布號WO91/19735)、編碼的肽(例如PCT公布WO93/20242)、隨機生物低聚物(例如PCT公布號WO92/00091)、苯并二氮口類(例如美國專利第5,288,514號)、多樣體(diversomer)如乙內(nèi)酰脲類、苯并二氮口類和二肽(Hobbs等人,/Voc.AW.XcadOS^卯:6909-6913(1993))、插烯多肽(Hagihara等人,J.^^r.CZem.Soc.114:6568(1992))、具有葡萄糖骨架的非肽類肽物(Hirschmann等人,J.^werC/2,.114:9217-9218(1992))、類似有機合成的小化合物文庫(Chen等人"CAew.Soc.116:2661(1994))、低聚氨基甲酸酯(Cho等人萬c/e"ce261:1303(1993))、和/或肽基膦酸酯(Campbe11等人,/Org.CT^w.59:658(1994))、核酸文庫(參見Ausubel、Berger禾BSambrook,所有同上)、肽核酸文庫(參見,例如美國專利5,539,083)、抗體文庫(參見,例如Vaughn等人,Atow所ofec/mo/ogy,14(3):309-314(1996)和PCT/US96/10287)、碳水化合物文庫(參見,例如Liang等人,Sc/e"ce,274:1520-1522(1996)和美國專利5,593,853)、小有機分子文庫(參見,例如benzodiazepines(苯并二氮口2類),BaumC&EN,1月18日,第33頁(1993);類異戊二烯,美國專利5,569,588;噻唑烷二酮(thiazolidinone)和間噻烷酮(metathiazanones)類,美國專利5,549,974;吡咯烷類,美國專利5,525,735和5,519,134;嗎啉代化合物,美國專利5,506,337;苯并二氮口類,5,288,514及類似物)。用于制備組合文庫的裝置商業(yè)上可獲得(參見,例如357MPS、390MPS,AdvancedChemTech,LouisvilleKY;Symphony,Rainin,Wobum,MA;433AAppliedBiosystems,FosterCity,CA;9050Plus,M川ipore,Bedford,MA)。此外,很多組合文庫本身商業(yè)上可獲得(參見,例如ComGenexJPrinceton凡J.;TriposJnc.,St.LouisAIO;3DPharmaceuticals,Exton,PA;MartekBiosciences,Columbia,MD等)。K艦、^夢主鄉(xiāng)C濃7效真游主欲方,本發(fā)明的抗體可體外、體內(nèi)或離體("Ww)(即從身體中移除,經(jīng)處理并回到身體)與表達CXCR7的細胞接觸。本發(fā)明的抗體可直接施用到哺乳動物受治療者以在體內(nèi)調節(jié)趨化因子受體活性。在一些實施方案中,所述抗體與SDF1和/或I-TAC競爭結合CXCR7。在一些實施方案中,所述抗體不包括SEQIDNO:23禾口/或SEQIDNO:25、或者SEQIDNO:27和/或SEQIDNO:29。在一些實施方案中,CXCR7抗體被施用到患有癌癥的受治療者。在_些情況下,CXCR7調節(jié)劑被施用來治療癌癥,例如癌、神經(jīng)膠質瘤、間皮瘤、黑素瘤、淋巴瘤、白血病、腺癌、乳癌、卵巢癌、子宮頸癌、成膠質細胞瘤、白血病、淋巴瘤、前列腺癌和伯基特淋巴瘤、頭頸癌、結腸癌、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、食道癌、胃癌、胰腺癌、肝膽管癌、膽嚢癌、小腸癌、直腸癌、腎癌、膀胱癌、前列腺癌、陰莖癌、尿道癌、睪丸癌、子宮頸癌、陰道癌、子宮癌、卵巢癌、甲狀腺癌、甲狀旁腺癌、腎上腺癌、胰臟內(nèi)分泌癌、類癌、骨癌、皮膚癌、視網(wǎng)膜母細胞瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤(其它癌癥參見CANCER:PRINCIPLESANDPRACTICE(癌癥理論與實踐)(DeVita,V.T.等人編1997));以及腦和神經(jīng)元機能障礙如阿爾茨海默病和多發(fā)性硬化;腎機能障礙;類風濕性關節(jié)炎;30心臟同種異體移植物排斥;動脈粥樣硬化;哮喘;腎小球腎炎;接觸性皮炎;炎性腸??;結腸炎;牛皮癬;再灌注損傷;以及本文所述的其他病癥和疾病。本發(fā)明還包括通過施用本發(fā)明抗體使任何有相應需要的受治療者中的血管生成減少。例如,通過使CXCR7與本發(fā)明抗體接觸而減少CXCR7活性,因此減少血管生成,這對抑制腫瘤、尤其是實體瘤的形成、生長和/或轉移是有用的。與調節(jié)的CXCR7和血管生成有關的實施方案的描述在例如美國專利申請第11/050,345號中描述。涉及-不需要的或有問題的血管生成的其他病癥包括類風濕性關節(jié)炎;牛皮癬;眼血管生成性疾病(ocularangiogenicdisease)如糖尿病性視網(wǎng)膜病變、早產(chǎn)兒視網(wǎng)膜病變、黃斑變性、角膜移植物排斥、新生血管性青光眼、晶狀體后纖維增生癥、潮紅;奧韋綜合征(Osler-WebberSyndrome);心肌血管生成;斑塊新生血管形成;毛細血管擴張;血友病性關節(jié);血管纖維瘤;過度或異常剌激內(nèi)皮細胞的疾病,包括腸粘連、克羅恩病(Crohn'sdisease),皮膚病(如牛皮癬、濕疹(excema)和硬皮病)、糖尿病、糖尿病性視網(wǎng)膜病變、早產(chǎn)兒視網(wǎng)膜病變、與年齡有關的黃斑變性、動脈粥樣硬化、硬皮病、創(chuàng)面肉芽(woundgranulation)和肥厚性癜痕即癜痕疙瘩,以及血管生成作為病理后果的疾病如貓抓病和潰瘍(幽門螺桿菌(/^//^^^"/^/on))也可用本發(fā)明的抗體來治療。血管生成抑制劑可用來預防或抑制粘連(尤其是腹膜內(nèi)或骨盆粘連如開放手術或腹腔鏡檢查(laproscopic)手術后形成的那些腹膜內(nèi)或骨盆粘連)和燒傷收縮(bumcontraction)。應使用血管生成抑制劑而有利治療的其他病狀包括預防移植后的癜痕化、肝硬變、急性呼吸窘迫綜合征后的肺纖維化或其他新生肺纖維化、暫時修復體的植入(implantationoftemporaryprosthetics)以及腦與硬膜(dura)之間的手術后的粘連。子宮內(nèi)膜異位、息肉病、心臟肥厚(hypertr叩hyy)以及肥胖癥也可通過抑制血管生成來治療。這些病癥可包括其他類型正常組織的大小或生長的增加,如子宮肌瘤、前列腺肥大和淀粉樣變性。本發(fā)明的抗體可預防性或治療性地用于本文所述的任一種病癥或疾病。用本發(fā)明的抗體減少CXCR7活性還可用于預防新生血管形成以有效治療宿主的病癥。因此,例如減少血管生成可用作血管病癥(例如血管瘤和動脈粥樣硬化斑塊內(nèi)的毛細血管增生)、肌病(例如心肌血管生成、心肌梗塞或平滑肌內(nèi)的血管生成)、關節(jié)(例如關節(jié)炎、血友病性關節(jié)等)和與血管生成有關的其他病癥的治療的一部分。促進血管生成還可有助于加速各種生理過程和需要增加血管化的疾病如創(chuàng)傷、骨折和燒傷的愈合、炎性疾病、缺血性心臟病(ischericheart)和外周血管疾病的治療。本發(fā)明的抗體還可用來增強創(chuàng)傷愈合。不期望將本發(fā)明限制在一種具體的作用機理,此作用機理可能是CXCR7的拮抗作用允許內(nèi)源性配體替換結合至低親和性受體,因此觸發(fā)增強的創(chuàng)傷愈合。例如,SDF-1與CXCR7和CXCR4兩者結合,但與CXCR4的結合具有較低的親和性。同樣地J-TAC與CXCR3結合的親和性低于I-TAC與CXCR7結合的親和性。通過防止這些配體與CXCR7的結合,CXCR7拮抗劑可允許這些配體與其他受體結合,因此增強創(chuàng)傷愈合。因此,增強創(chuàng)傷愈合的CXCR7拮抗作用可能由不同機理介導,而不是用激動劑刺激CXCR7活性來增強創(chuàng)傷愈合除治療與新生血管化有關的病癥和癥狀之外,血管生成的抑制可用來調節(jié)或防止與新生血管化有關的正常生理狀況的發(fā)生。因此,例如本發(fā)明方法可用作控制生育。依據(jù)本發(fā)明,降低在卵巢或子宮內(nèi)膜內(nèi)的CXCR7活性可減少與排卵、胚胎植入、胎盤形成等有關的新生血管化。血管生成的抑制劑還有其他的治療用途。例如,本發(fā)明的抗體可用于下述情況(a)脂肪組織消融與肥胖癥的治療。參見,例如Ko/om'w等人,A^&"MWc/"e10(6):625-632(2004);(b)先兆子癇(preclampsia)的治療。參見,例如,Levine等人~/.J.iV/ec/.350(7):672-683(2004);Maynard等人,JC//"./"w"Ul(5):649-658(2003);和(c)心血管疾病的治療。參見,例如March,等人,J尸/^w'o/.//ecrrtCz>c.尸/yw》/.287:H458-H463(2004);Rehman等人,C/rcw/a"o"109:1292-1298(2004)。F/.蘑席浙藥欺逝^漱本發(fā)明的藥物組合物可包括,例如本發(fā)明的抗體和藥學上可接受的載體。藥學上可接受的載體部分通過所施用的具體組合物以及通過施用所述組合物所用的具體方法來確定。因此,存在本發(fā)明藥物組合物的多種適合的制劑(參見,例如iew/"gto":尸/2mvwace她'cfl/5Wewces(雷明頓藥學),第17版.1985))。適于施用的制劑包括水溶液和非水溶液、等滲無菌溶液(可包含抗氧化劑、緩沖劑、抑菌劑和賦予制劑等滲的溶質)、以及水和非水無菌懸浮液(可包含懸浮劑、增溶劑、增稠劑、穩(wěn)定劑和防腐劑)。在本發(fā)明的實施中,組合物可例如口服、鼻、局部、靜脈內(nèi)、腹膜內(nèi)、皮下或鞘內(nèi)施用。化合物的制劑可在單位劑量或多劑量密封容器如安瓿和管形瓶中提供。溶液和懸浮液可由前述的這類無菌粉末、顆粒和片劑來制備。所述組合物可借助于例如用來遞送胰島素或對特定器官或腫瘤遞送化療的這類輸注泵來施用。本發(fā)明的組合物可使用注射器或導管直接注射到腫瘤中或在原發(fā)性腫瘤切除之前或之后注射到其部位;或者在原發(fā)性腫瘤切除后全身注射。本發(fā)明的組合物可根據(jù)需要局部或區(qū)域施用。對于延長的局部施用,所述抗體可以注射到腫瘤部位的控制釋放植入物施用。可選地,個體細胞用質粒離體轉染以便于表達本發(fā)明的抗體,之后注射到腫瘤部位。對于皮膚病狀的局部治療,酶抗體可用軟膏或凝膠施用到皮膚。在一些實施方案中,本發(fā)明的CXCR7抗體可與其他適合的治療劑包括如化學治療劑、放射等組合施用。用于組合治療的適合劑的選擇可根據(jù)常規(guī)藥學原理由本領域普通技術人員來進行。治療劑的組合可協(xié)同作用以實現(xiàn)各種病癥如癌癥、創(chuàng)傷、腎機能障礙、腦機能障礙或神經(jīng)元機能障礙的治療或預防。使用這種方法,我們能夠用每種劑的較低劑量實現(xiàn)治療效果,因此減少不良副作用的可能性。在本發(fā)明的背景下對患者所施用的劑量應足以在受治療者中隨時間引起有利的響應(例如減少腫瘤大小或腫瘤負荷)。任何患者的最佳劑量水平將取決于包括所用的特定調節(jié)劑的效力、患者的年齡、體重、身體活動和飲食的多種因素,取決于與其他藥物的可能組合,以及取決于具體疾病的嚴重度。劑量大小還由在具體受治療者中伴隨具體化合物或載體的施用的任何不良副作用的存在、性質和程度來確定。在確定待施用的抗體的有效量時,醫(yī)生可評價抗體的循環(huán)血漿水平、抗體毒性和抗抗體的抗體的產(chǎn)生。一般而言,對于典型的受治療者,抗體的劑量當量從約1ng/kg到10mg/kg。對于施用而言,當就受治療者的整體健康狀況(massandoverallhealth)進行應用時,本發(fā)明的抗體可以以由抗體的LD-50和抗體在不同濃度的副作用確定的比率來施用??贵w被接受者免疫系統(tǒng)的清除也可影響待施用的適合劑量。施用可經(jīng)由單劑量或分份劑量來完成??墒┯冒景l(fā)明抗體的組合物,以用于治療性或預防性治療。在治療性應用中,以足以治愈或至少部分阻礙疾病及其并發(fā)癥例如減少腫瘤大小等的量將組合物施用到遭受疾病(例如癌癥、關節(jié)炎或其他CXCR7相關的疾病或病癥)的患者。足以實現(xiàn)這個的量被定義為"治療有效劑量"。對這種用途有效的量取決于疾病的嚴重度和患者健康的一般狀態(tài)。所述組合物的單次施用或多次施用可依賴于按照患者需要并耐受的劑量和頻率來施用。無論如何,所述組合物應提供足夠量的本發(fā)明的劑以有效地治療患者。能夠預防或延緩癌癥在哺乳動物中的發(fā)展的調節(jié)劑的量被稱為"預防有效劑量"。預防性治療所需的具體劑量將取決于哺乳動物的醫(yī)療狀況和病史、所預防的具體癌癥以及其他因素如年齡、體重、性別、施用途徑、效力等。這種預防性治療可在例如以前患過癌癥的哺乳動物中使用以預防癌癥的復發(fā),或在懷疑很可能發(fā)展癌癥的哺乳動物中使用。本發(fā)明的抗體可單獨供應或與一種或多種其他藥物結合供應。可能的組合伴侶可包括,例如其它的抗血管生長因子和/或化學治療劑(例如細胞毒劑)或放射、癌癥疫苗、免疫調節(jié)劑、抗血管劑、信號轉導抑制劑、抗增殖劑或細胞凋亡誘導劑。本發(fā)明的抗體可與下述結合使用阻斷整聯(lián)蛋白接合的抗體和肽、抑制金屬蛋白酶的蛋白質和小分子(例如marmistat)、阻斷內(nèi)皮細胞內(nèi)的磷酸化級聯(lián)的劑(例如除莠霉素(herbamycin))、已知血管生成誘導劑的顯性失活受體(dominantnegativereceptor)、針對血管生成誘導劑的抗體或阻斷它們活性的其他化合物(例如蘇拉明)、通過其他方式作用的其他化合物(例如類視黃醇、IL-4、干擾素等)。事實上,由于這些因素可通過不同機理調節(jié)血管生成,所以與其他血管生成劑組合使用本發(fā)明的抗體可能更有效地(并且可能協(xié)同地)抑制期望組織中的血管生成??寡苌蓜┤鏜MP-2(基質金屬蛋白酶(matrix-metalloprotienase)2)抑制劑、MMP-9(基質金屬蛋白酶9)抑制劑、和cox-n(環(huán)氧合酶n)抑制劑可用來與本發(fā)明抗體和本文所述的藥物組合物結合使用。本發(fā)明的抗CXCR7抗體還可與下述劑一起使用信號轉導抑制劑如可抑制EGFR(表皮生長因子受體)響應的劑,例如EGFR抗體、EGF抗體和為EGFR抑制劑的分子;VEGF(血管內(nèi)皮生長因子)抑制劑如VEGF受體和可抑制VEGF的分子;和erbB2受體抑制劑如與erbB2受體結合的有機分子或抗體,例如HERCEPTINTM(Genentech,Inc.ofSouthSanFrancisco,Calif.,USA)。本發(fā)明的抗CXCR7抗體還可與包括促進血管生成和/或創(chuàng)傷愈合的藥物的其他藥物組合。本領域技術人員應理解,所述抗體可結合一種或多種醫(yī)學外科上有用的物質或治療劑,例如當組合物應用到需要血管生成的期望部位時可進一步增強血管生成響應、和/或加速和/或有利地改變愈合過程的那些物質或治療劑。例如,為進一步促進血管生成、修復和/或組織生長,所述組合物可包含一些激素、生長因子或有絲分裂蛋白中的至少一種,例如成纖維細胞生長因子、血小板源生長因子、巨噬細胞源生長因子等。此外,所述組合物可包含抗微生物劑,例如抗生素如硫酸慶大霉素或紅霉素。其他醫(yī)學外科上有用的劑可包括抗炎藥、鎮(zhèn)痛藥、麻醉劑、mbifacient、酶、抗組織胺類和染料。本發(fā)明的抗CXCR7抗體還可與包括用于治療關節(jié)炎的藥物的其他藥物組合。這些劑的實例包括抗炎治療劑。例如,糖皮質類固醇如潑尼松龍和甲淡尼龍是常用的抗炎藥。非甾體類抗炎藥(NSAID)也用來抑制炎癥。NSAID抑制環(huán)氧合酶(COX)COX-l和COX-2,該酶對生成在炎癥部位過量產(chǎn)生的前列腺素是重要的。此外,促炎細胞因子、腫瘤環(huán)死因子a(TNFcO與包括關節(jié)炎的多種炎癥事件有關,并且抗TNFa治療正在臨床上應用。離舒,磨滯/或麻應雄,盆為了用于上文所述的診斷性、研究和治療性應用,本發(fā)明還提供了試劑盒。在診斷性應用和研究應用中,這些試劑盒可包括下述的任一種或全部.測定試劑、緩沖劑和本發(fā)明的抗CXCR7抗體。治療性產(chǎn)品可包括無菌鹽水或另一種藥學上可接受的乳劑和懸浮基質。此外,所述試劑盒可包括含有實施本發(fā)明方法的指導(即方案)的說明材料(instmctionalmaterial)。盡管所述說明材料通常包括書面或印刷的材料,但是它們并不限于這些。本發(fā)明包括能夠存儲這些說明書并將它們傳遞給最終用戶的任何介質。這些介質包括但不限于電子存儲介質(例如磁盤、磁帶、盒式存儲器(cartridge)、芯片)、光學介質(例如CDROM)及類似介質。這種介質可包括提供這些說明材料的網(wǎng)站地址。實施例眾所周知,制備G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)的抗體一直是困難的。我們使用了加拿大專利申請CA2350078中所概述的GenovacAGPE的方法。結合CXCR7的抗體通過用表達CXCR7(SEQIDNO:30)的cDNA接種小鼠來產(chǎn)生。簡短而言,將CXCR7克隆到表達載體中并通過基因槍方法用所述載體接種小鼠。在適合的時間點,B細胞被分離,通過標準技術與骨髓瘤細胞融合,然后在體外培養(yǎng)物中選擇融合的雜交瘤細胞??寺∨囵B(yǎng)物的上清液用于通過流式細胞術分析與用CXCR7穩(wěn)定轉染的細胞的結合。將陽性克隆擴增并使其經(jīng)受更多輪的流式細胞術篩選。確定了單克隆抗體6E10和11G8與CXCR7結合??贵w6E10和11G8在不內(nèi)源性產(chǎn)生CXCR7的轉染細胞系上以及在內(nèi)源性表達CXCR7的細胞如HeLa禾QMCF-7(ATCC,VA)上檢測CXCR7。此外,所述抗體能識別CXCR7的小鼠同系物。例如,抗體6E10和11G8在小鼠乳腺腫瘤細胞系4T1和Lewis肺癌細胞(ATCC,Va)上檢測CCX-CR2??贵w.6E10和11G8而不是同型對照在用CXCR7轉染的HEK293細胞系上檢測,但是不與用空載體轉染的HEK293細胞或表達其他趨化因子受體(例如CXCR2)的HEK293細胞結合。所述抗體也被中和,如經(jīng)放射性配體競爭結合測定所證實??贵w6E10和11G8兩者都與SDF-1和I-TAC兩者競爭結合小鼠和人CXCR7兩者??贵w11G8通常所顯示的趨化因子結合百分比抑制比抗體6E10的大。抗體6E0和1G8還在免疫組織化學(IHC)測定中在固定石蠟包埋的組織切片上識別CXCR7。在關于各種組織類型的實驗中,用抗體6E10和11G8染色的IHC與用在各自組織上并入放射標記的SDF或I-TAC的結合測定所確定的表達模式相匹配。例如,CXCR7染色在E13胎兒小鼠的切片中、而不是在E17胎兒或成年小鼠的切片中發(fā)現(xiàn)。還在穩(wěn)定表達人CXCR7的細胞的細胞離心物(cytospins)中觀察到CXCR7染色。確定了重鏈與輕鏈可變區(qū)編碼序列和預測的氨基酸序列。6E0的重鏈可變區(qū)包含于SEQIDNO:23(由SEQIDNO:22編碼)中。6E10的輕鏈可變區(qū)包含于SEQIDNO:25(由SEQIDNO:24編碼)中。11GS的重鏈可變區(qū)包含于SEQIDNO:27(由SEQIDNO:26編碼)中。11G8的輕鏈可變區(qū)包含于SEQIDNO:29(由SEQIDNO:28編碼)中。我們通過FACS已確定11G8和6E10抗體兩者都識別在細胞表面上表達的CXCR7受體。這表示為沿著FACS圖的X軸,熒光(florescent)信號(填充)相對于背景(明線)的增加(圖2)。為了探詢11G8和6E10與哪些氨基酸殘基識別并結合將來源于CXCR7序列的許多短肽(0.5-5嗎)用100(ilPBS中的任一種抗體(0.5-5pg)預溫育。然后這種混合物在室溫下與表達CXCR7的500,000個細胞溫育15分鐘。如果所述抗體識別由肽編碼的序列,那么所述肽就有效地競爭抗體,遠離與細胞相關的受體結合,從而導致隨后FACS圖上熒光(florescence)的下降。如果所述序列不與任一種抗體相互作用,那么觀察不到下降。這些讀數(shù)在圖2中示例,其中"無肽"表示不完全抗體染色,"肽2.2.1表示肽競爭,和"肽2.3.4表示沒有肽競爭。通過此測定中肽序列的輕微變化,辨別出抗體識別所必需的最小肽序列。圖3示例了與抗體11G8或6E10競爭的肽的概述。盡管為了清楚地理解,通過例證和實施例已經(jīng)較詳細地描述了本發(fā)明,但是依據(jù)本發(fā)明的教導,在不偏離所附權利要求的精神或范圍下對其可作出一些改變和調整,這對本領域普通技術人員來說是容易明顯的。在本說明書中所引用的所有出版物、數(shù)據(jù)庫、Genbank序列、專利和專利申請通過引用并入本文,如同明確且獨立地表明每個出版物、數(shù)據(jù)庫、Genbank序列、專利和專利申請都通過引用并入。權利要求1.一種抗體,其與以下多肽結合由FSDISWPC(SEQIDNO12)組成的多肽;或由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO15)組成的多肽,其中所述抗體不包括SEQIDNO23、SEQIDNO25、SEQIDNO27或SEQIDNO29中所展示的可變區(qū)的互補決定區(qū)(CDR)。2.根據(jù)權利要求1所述的抗體,其中所述抗體與可檢測標記連接。3.根據(jù)權利要求1所述的抗體,其為單克隆抗體。4.根據(jù)權利要求1所述的抗體,其為人源化抗體。5.根據(jù)權利要求1所述的抗體,其中所述抗體與由FSDISWPC(SEQIDNO:12)組成的多肽結合。6.根據(jù)權利要求1所述的抗體,其中所述抗體與由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽結合。7.根據(jù)權利要求1所述的抗體,其中所述抗體與SDF-1競爭結合CXCR7o8.—種藥物組合物,其包括藥學上可接受的賦形劑和根據(jù)權利要求1所述的抗體。9.根據(jù)權利要求8所述的藥物組合物,其中所述抗體為單克隆抗體。10.根據(jù)權利要求8所述的藥物組合物,其中所述抗體為人源化抗體。11.根據(jù)權利要求8所述的藥物組合物,其中所述抗體與由FSDISWPC(SEQIDNO:12)組成的多肽結合。12.根據(jù)權利要求8所述的藥物組合物,其中所述抗體與由SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成的多肽結合。13.—種在生物樣品中檢測表達CXCR7的細胞的方法^斤述方法包括將所述生物樣品與根據(jù)權利要求1所述的抗體接觸并檢測所述抗體的存在。14.一種治療、預防或改善疾病的方法,所述方法包括對有相應需要的個體施用根據(jù)權利要求1所述的抗體。15.根據(jù)權利要求14所述的方法,其中癌細胞在所述個體中的增殖在所述施用步驟后得以抑制。16.根據(jù)權利要求14所述的方法,其中血管生成或血管化在所述施用步驟后在所述個體中得以抑制。17.根據(jù)權利要求14所述的方法,其中所述個體患有或易患關節(jié)炎。18.根據(jù)權利要求14所述的方法,其中所述個體患有癌癥。19.一種用于鑒定CXCR7的調節(jié)劑的方法,其包括(a)將測試劑與含有SEQIDNO:30的不超過250個連續(xù)氨基酸的多肽接觸,且其中所述多肽包括FSDISWP(SEQIDNO:39)或WPCNSSDCIV(SEQIDNO:40)或FSDISWPC(SEQIDNO:12)或SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15);以及(b)選擇與所述多肽結合的劑,其中所述測試劑與所述多肽的結合指示所述測試劑是CXCR7活性的調節(jié)劑。20.根據(jù)權利要求19所述的方法,其中所述選擇步驟包括測量所述測試劑與SDF-1或I-TAC競爭結合所述多肽的能力。21.根據(jù)權利要求19所述的方法,其中所述多肽含有SEQIDNO:30的不超過50個連續(xù)氨基酸。22.根據(jù)權利要求19所述的方法,其中所述多肽由FSDISWPC(SEQIDNO:12)或SWPCNSSDCIVV(SEQIDNO:15)組成。全文摘要描述了結合CXCR7表位的抗體以及鑒定CXCR7調節(jié)劑的方法。文檔編號A61K39/395GK101528257SQ200780038960公開日2009年9月9日申請日期2007年10月12日優(yōu)先權日2006年10月18日發(fā)明者B·普雷馬克,M·彭弗德,Z·繆申請人:凱莫森特里克斯股份有限公司