用于制備生物樣品以供分析的設(shè)備和方法相關(guān)申請的交叉引用本申請要求2013年12月12日提交的美國臨時專利申請61/915,124的優(yōu)先權(quán)，該申請的公開內(nèi)容全文以引用方式并入本文。

背景技術(shù)：
對多種類型的樣品(例如臨床、環(huán)境、食品和飲料樣品)進行例行測試以確定是否存在微生物。具體地，對多種樣品進行測試以確定病原微生物的存在。通常，需要對樣品進行多種類型的預(yù)處理(即，在檢測步驟之前的處理)以便提高目標(biāo)微生物的數(shù)量、降低非目標(biāo)微生物的數(shù)量、濃集微生物和/或降低樣品中潛在干擾物質(zhì)的量。預(yù)處理步驟可能是費力的，并且可能需要花費若干小時至若干天完成。已經(jīng)開發(fā)出多種材料和裝置用以減少完成樣品預(yù)處理所需的步驟數(shù)和時間。可能難以同時處理多個樣品，因為缺乏該程序所需的簡單高效的裝置。仍然需要用于制備一個或多個樣品以進行微生物檢測的簡單方法。

技術(shù)實現(xiàn)要素：
本公開涉及樣品中微生物的檢測。具體地，本公開提供了設(shè)備和對應(yīng)的使用方法，該設(shè)備和方法用于處理樣品以檢測與微生物相關(guān)聯(lián)的被分析物是否存在。有利地，該設(shè)備被構(gòu)造成使得它可降低樣品中干擾物質(zhì)的量、濃集微生物，并且可用于將樣品保持在高溫下以便裂解微生物細(xì)胞并釋放被分析物。任選地，隨后將濃集被分析物轉(zhuǎn)移到容器以便檢測被分析物。在一個方面，本公開提供了設(shè)備。設(shè)備可包括具有第一端部和與第一端部相對的第二端部的主體。主體可包括處理室、第一貯存器、第二貯存器、過濾器、第一單向閥以及第二單向閥。處理室可包括鄰近第一端部的開口。第一貯存器可設(shè)置成通過第一流體通路與處理室選擇性地流體連通。第二貯存器可設(shè)置成通過第二流體通路與處理室選擇性地流體連通。第一流體通路和第二流體通路可穿過過濾器。過濾器可具有在流體通路中朝向處理室取向的第一側(cè)以及與第一側(cè)相背對的第二側(cè)。第一單向閥可在第一流體通路中設(shè)置在過濾器和第一貯存器之間，并且可在處理室和第一貯存器之間提供選擇性流體連通。第二單向閥可在第二流體通路中設(shè)置在過濾器和第二貯存器之間，并且可在處理室和第二貯存器之間提供選擇性流體連通。在另一方面，本公開提供了處理樣品的方法。該方法可包括：將包括液體的樣品放置到設(shè)備的處理室中。設(shè)備可包括具有第一端部和與第一端部相對的第二端部的主體。主體可包括處理室、第一貯存器、第二貯存器、過濾器、第一單向閥以及第二單向閥。處理室可包括鄰近第一端部的開口。第一貯存器可設(shè)置成通過第一流體通路與處理室選擇性地流體連通。第二貯存器可設(shè)置成通過第二流體通路與處理室選擇性地流體連通。第一流體通路和第二流體通路可穿過過濾器。過濾器可具有在流體通路中朝向處理室取向的第一側(cè)以及與第一側(cè)相背對的第二側(cè)。第一單向閥可在第一流體通路中設(shè)置在過濾器和第一貯存器之間，并且可在處理室和第一貯存器之間提供選擇性流體連通。第二單向閥可在第二流體通路中設(shè)置在過濾器和第二貯存器之間，并且可在處理室和第二貯存器之間提供選擇性流體連通。該方法還可包括：從處理室推壓出液體的至少一部分以穿過過濾器；在推壓液體的至少一部分穿過過濾器之后，從第一貯存器推壓反沖刷液體的第一部分穿過過濾器并進入處理室中，以形成第一處理樣品；以及分析樣品的至少一部分以檢測微生物的指示，其中分析樣品的至少一部分包括分析第一處理樣品的至少一部分。在另一方面，本發(fā)明提供了設(shè)備。設(shè)備可包括具有第一端部和與第一端部相對的第二端部的主體。主體可包括多個液體樣品處理模塊，包括第一模塊和第二模塊。多個模塊中的每個模塊可包括處理室、第一貯存器、第二貯存器、過濾器、第一單向閥以及第二單向閥。處理室可包括鄰近第一端部的開口。第一貯存器可設(shè)置成通過第一流體通路與處理室選擇性地流體連通。第二貯存器可設(shè)置成通過第二流體通路與處理室選擇性地流體連通。第一流體通路和第二流體通路可穿過過濾器。過濾器可具有在流體通路中朝向處理室取向的第一側(cè)以及與第一側(cè)相背對的第二側(cè)。第一單向閥可在第一流體通路中設(shè)置在過濾器和第一貯存器之間，并且可在處理室和第一貯存器之間提供選擇性流體連通。第二單向閥可在第二流體通路中設(shè)置在過濾器和第二貯存器之間，并且可在處理室和第二貯存器之間提供選擇性流體連通。第一模塊可聯(lián)接到第二模塊。在另一方面，本發(fā)明提供了設(shè)備。設(shè)備可包括具有第一端部和與第一端部相對的第二端部的主體。主體可包括多個處理室。多個可包括多個處理室，包括第一處理室和第二處理室。每個處理室可包括鄰近第一端部的開口。設(shè)備還可包括第一貯存器、第二貯存器、第一過濾器、第二過濾器、第一單向閥、第二單向閥以及第三單向閥。第一貯存器可設(shè)置成通過第一流體通路與第一處理室選擇性地流體連通。第二貯存器可設(shè)置成通過第二流體通路與第一處理室選擇性地流體連通，并且通過第三流體通路與第二處理室選擇性地流體連通。第一過濾器可在主體中設(shè)置在第一處理室的至少一部分和第二貯存器之間。第一流體通路和第二流體通路可穿過第一過濾器。第一過濾器可具有在第一流體通路和第二流體通路中朝向第一處理室取向的第一表面。第二過濾器可在主體中設(shè)置在第二處理室的至少一部分和第二貯存器之間。第三流體通路可穿過第二過濾器。第二過濾器可具有在第三流體通路中朝向第二處理室取向的第一表面。第一單向閥可在第一流體通路中設(shè)置在第一過濾器和第一貯存器之間，并且可在第一處理室和第一貯存器之間提供選擇性流體連通。第二單向閥可在第二流體通路中設(shè)置在第一過濾器和第二貯存器之間，并且可在第一處理室和第二貯存器之間提供選擇性流體連通。第三單向閥可在第三流體通路中設(shè)置在第二過濾器和第一貯存器之間，并且可在第二處理室和第一貯存器之間提供選擇性流體連通。在另一方面，本公開提供了試劑盒。試劑盒可包括設(shè)備。設(shè)備可包括具有第一端部和與第一端部相對的第二端部的主體。主體可包括處理室、第一貯存器、第二貯存器、過濾器、第一單向閥以及第二單向閥。處理室可包括鄰近第一端部的開口。第一貯存器可設(shè)置成通過第一流體通路與處理室選擇性地流體連通。第二貯存器可設(shè)置成通過第二流體通路與處理室選擇性地流體連通。第一流體通路和第二流體通路可穿過過濾器。過濾器可具有在流體通路中朝向處理室取向的第一側(cè)以及與第一側(cè)相背對的第二側(cè)。第一單向閥可在第一流體通路中設(shè)置在過濾器和第一貯存器之間，并且可在處理室和第一貯存器之間提供選擇性流體連通。第二單向閥可在第二流體通路中設(shè)置在過濾器和第二貯存器之間，并且可在處理室和第二貯存器之間提供選擇性流體連通。在任何實施方案中，試劑盒還可包括選自以下各項的試劑：樣品重懸液、細(xì)胞裂解試劑、核酸擴增反應(yīng)中使用的試劑以及抗原檢測反應(yīng)中使用的試劑。在任何實施方案中，試劑盒還可包括預(yù)過濾器和/或培養(yǎng)裝置。字詞“優(yōu)選的”和“優(yōu)選地”是指某些情況下可提供某些有益效果的本發(fā)明實施方案。然而，在相同的情況下或其它情況下，其它實施方案也可能是優(yōu)選的。此外，對一個或多個優(yōu)選實施方案的表述并不暗示其它實施方案是不可用的，且并非意圖將其它實施方案排除在本發(fā)明范圍之外。術(shù)語“包括”及其變型形式在說明書和權(quán)利要求中出現(xiàn)這些術(shù)語的地方不具有限制的含義。本文使用的“一種(個)”、“所述(該)”、“至少一種(個)”以及“一種(個)或多種(個)”可互換使用。因此，例如“一種(個)”室可解釋為意指“一種或多種(一個或多個)”室。術(shù)語“和/或”意指所列要素中的一個或全部或者所列要素中的任何兩個或更多個的組合。另外，在本文中，通過端點表述的數(shù)值范圍包括該范圍內(nèi)所含的所有數(shù)值(例如，1至5包括1、1.5、2、2.75、3、3.80、4、5等)。上述的“

技術(shù)實現(xiàn)要素：
”并非旨在描述本發(fā)明的每個公開的實施方案或每種實施方式。以下描述更具體地舉例說明例示性實施方案。通觀申請全文，在幾個部分用實施例列表提供指導(dǎo)，列表中的實施例可按不同方式組合使用。在每種情況下，引用的列表都只用作代表性的組，并且不應(yīng)理解為排它性列表。下面將結(jié)合附圖和描述介紹上述及其它實施方案的更多細(xì)節(jié)。通過具體實施方式、附圖和權(quán)利要求書，其它特征、對象和優(yōu)點將變得顯而易見。附圖說明圖1為根據(jù)本公開的樣品處理設(shè)備的一個實施方案的局部分解頂部透視圖，樣品處理設(shè)備包括主體，主體具有第一端部和第二端部。圖2為圖1的樣品處理設(shè)備的頂視圖，其中移除了過濾器以便示出開口，該開口鄰近主體的第二端部，在處理室中以及在第一貯存器和第二貯存器中。圖3為沿線3─3截取的圖2的樣品處理設(shè)備的剖視圖。圖3a為圖3的樣品處理設(shè)備的第二端部的詳細(xì)視圖。圖4a-4f示出圖1的設(shè)備的一系列剖視圖，這些剖視圖示出根據(jù)本公開的處理樣品的方法的一個實施方案中的步驟。圖5為根據(jù)本公開的用于處理多個樣品的設(shè)備的一個實施方案的局部分解頂部透視圖，設(shè)備包括多個樣品處理模塊。圖6為用于處理多個樣品的設(shè)備的另選實施方案的頂部透視圖，設(shè)備包括多個樣品處理模塊。圖7為用于處理多個樣品的設(shè)備的另一個另選實施方案的頂部透視圖，設(shè)備包括多個樣品處理模塊，每個樣品處理模塊包括端口。圖8為用于處理多個樣品的設(shè)備的另一個另選實施方案的頂部透視圖，設(shè)備包括多個樣品處理模塊，每個樣品處理模塊包括端口。圖9為用于處理多個樣品的設(shè)備的一個實施方案的頂部透視圖，設(shè)備包括與共用貯存器選擇性地流體連通的多個樣品處理模塊。圖10為圖9的設(shè)備的頂視圖。盡管上述各圖示出了本公開的若干個實施方案，但是如討論所述，還可以想到其它實施方案。在所有情況下，本公開是示例性地而非限制性地介紹本發(fā)明。應(yīng)當(dāng)理解，本領(lǐng)域的技術(shù)人員可以設(shè)計出大量其它修改形式和實施方案，這些修改形式和實施方案均屬于本發(fā)明的范圍之內(nèi)并符合本發(fā)明原理的精神。附圖可能未按比例繪制。具體實施方式在詳細(xì)解釋本公開的任何實施方案之前，應(yīng)當(dāng)理解，本發(fā)明在其應(yīng)用中不僅限于下文描述內(nèi)容中提及或下文附圖中示出的構(gòu)造細(xì)節(jié)和部件布置方式。本發(fā)明能具有其它實施方案，并且能夠以多種方式實踐或進行。另外，應(yīng)當(dāng)理解，本文使用的措詞和術(shù)語是用于說明目的而不應(yīng)視為限制性的。本文使用的“包括”、“包含”或“具有”及其變型形式意在涵蓋其后所列出的項目及它們的等同形式以及額外項目。除非另外說明或限定，否則術(shù)語“連接”和“聯(lián)接”及其變型形式均按廣義使用，并且涵蓋直接和間接這兩方面的連接和聯(lián)接。此外，“連接”和“聯(lián)接”不限于物理或機械連接或聯(lián)接。應(yīng)當(dāng)理解，可采用其它實施方案，并且可以在不偏離本公開范圍的情況下作出結(jié)構(gòu)變化或邏輯變化。此外，術(shù)語諸如“前部”、“后部”、“頂部”、“底部”等僅用于在元件彼此有關(guān)時描述元件，而絕非意在描述設(shè)備的具體取向、指明或暗示設(shè)備的必要或必需取向、或規(guī)定本文所述本發(fā)明在使用時將如何使用、安裝、顯示或定位。本公開總體上涉及樣品中微生物的檢測。具體地，本發(fā)明設(shè)備和方法可用于檢測樣品中存在的生物細(xì)胞或其組成。在任何實施方案中，該設(shè)備和方法用于檢測與微生物細(xì)胞(例如，細(xì)菌、酵母細(xì)胞、真菌細(xì)胞)相關(guān)聯(lián)的被分析物(例如，蛋白質(zhì)、抗原、多核苷酸)。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員還將認(rèn)識到，該設(shè)備和方法可用于對非生物被分析物進行隔離、凈化并任選地進行濃集。具體地，本公開總體涉及制備樣品以檢測是否存在被分析物。具體地，本公開提供了設(shè)備和方法，該設(shè)備和方法便于從液體樣品中移除潛在干擾物質(zhì)(例如，金屬離子、水合氫離子、氫氧根離子、生物分子諸如例如脂質(zhì)、蛋白質(zhì)和核酸)并且捕獲被分析物以供隨后分析。此外，在任何實施方案中，該設(shè)備和方法可用于濃集被分析物以便提供更快和/或更敏感的被分析物檢測。有利地，所得捕集到的被分析物相對地不含雜質(zhì)，并且適用于多種檢測方法(例如，免疫檢測方法和核酸檢測方法)。當(dāng)檢測方法包括裂解細(xì)胞(例如，使用熱量和/或化學(xué)裂解劑)以便檢測細(xì)胞內(nèi)被分析物(例如，蛋白質(zhì)或核酸)時，可在本發(fā)明設(shè)備中直接裂解樣品，然后進行隨后的檢測步驟。本公開包括用于處理單個樣品的方法和設(shè)備。本公開還包括用于同時或順序地處理多個樣品的方法和設(shè)備。樣品可以是包含或疑似包含能夠檢測到的被分析物(例如，生物被分析物)的任何樣品。合適樣品的非限制性示例包括細(xì)胞(例如，哺乳動物細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞、酵母細(xì)胞、絲狀真菌、細(xì)菌細(xì)胞)的懸浮液或培養(yǎng)物、環(huán)境樣品(例如，表面拭子)、食品(例如，原材料、加工過程中的樣品和成品樣品)、飲料、臨床樣品(例如，血液、尿液、痰液、組織、粘液、糞便、傷口滲出物、膿液)和水(例如，地表水、飲用水、工業(yè)用水)。合適生物被分析物的非限制性示例包括核酸(例如，與特定類型細(xì)胞或微生物相關(guān)的多核苷酸)或可檢測抗原(例如，蛋白質(zhì)、寡肽、酶、內(nèi)毒素、細(xì)胞膜成分，以及細(xì)胞壁成分)。檢測生物被分析物的分析程序在本領(lǐng)域中是已知的。要檢測的優(yōu)選的生物被分析物包括例如能夠在反應(yīng)(例如，PCR)中擴增的核酸。在任何實施方案中，樣品包括液體(例如，含水液體)。除了液體樣品外，其它測試樣品可包括液體以及溶于或懸浮于液體介質(zhì)中的一種或多種固體。所關(guān)注的樣品可包括工藝流、水、土壤、植物或其它植被、空氣、表面(例如，被污染的表面)等。樣本還可包括培養(yǎng)的細(xì)胞。樣品還可以包括來自培養(yǎng)裝置(例如，生物指示劑裝置)的表面和/或內(nèi)容物的樣品，包括細(xì)胞、孢子或酶。固體樣品也可用于本公開的設(shè)備和方法中。例如，可使固體樣品在液體(例如，水、緩沖劑、肉湯)中破裂(例如，通過共混、超聲處理、均化)和/或懸浮，然后將樣品放置到本公開的設(shè)備中。另選地，可使固體樣品在本公開的設(shè)備中的液體中破裂和/或懸浮。在任何實施方案中，含有樣品材料的樣品采集裝置(如拭子、海綿)可用于該方法中。另選地，可從樣品采集裝置洗脫(例如，沖洗出、刮出、擠壓出)樣品材料，然后將樣品材料用于該方法中。在一些實施方案中，液體或固體樣品可以在液體(例如，水、緩沖劑、肉湯)中稀釋。合適樣品還包括含有細(xì)胞或先前含有細(xì)胞的細(xì)胞懸浮液介質(zhì)(例如，發(fā)酵培養(yǎng)液、半固體細(xì)胞培養(yǎng)基和組織培養(yǎng)基、濾液)。合適樣品還包括細(xì)胞裂解液。細(xì)胞裂解液可以通過化學(xué)手段(例如，洗滌劑、酶)、機械手段(超聲振動、均化、弗氏壓碎器)或通過本領(lǐng)域中已知的其它裂解細(xì)胞的手段產(chǎn)生。微生物(例如，細(xì)菌、真菌、病毒)是可檢測被分析物的來源。可在可來自如本文所述多種來源的測試樣品中對微生物進行分析。特別值得關(guān)注的微生物包括原核微生物和真核微生物，特別是革蘭氏陽性細(xì)菌、革蘭氏陰性細(xì)菌、真菌、原生動物、支原體、酵母、病毒以及甚至脂質(zhì)包膜病毒。特別相關(guān)的生物體包括以下各項的成員：腸桿菌(Enterobacteriaceae)科，或微球菌(Enterobacteriaceae)科，或以下種屬：葡萄球菌(Staphylococcus)屬、鏈球菌(Streptococcus)屬，假單胞菌(Pseudomonas)屬、腸球菌(Enterococcus)屬、沙門氏菌(Salmonella)屬、軍團菌(Legionella)屬、志賀菌(Shigella)、耶爾森氏菌(Yersinia)屬、腸桿菌(Enterobacter)屬、埃希氏菌(Escherichia)屬、芽孢桿菌(Bacillus)屬、李斯特菌(Listeria)屬、弧菌(Vibrio)屬、棒狀桿菌(Corynebacteria)屬，以及皰疹病毒、曲霉(Aspergillus)屬、鐮孢菌(Fusarium)屬和念珠菌(Candida)屬。特別有毒的生物體包括：金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)(包括耐藥菌株，諸如耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA))、表皮葡萄球菌(S.epidermidis、肺炎鏈球菌(Streptococcuspneumoniae)、無乳鏈球菌(S.agalactiae)、釀膿鏈球菌(S.pyogenes)、糞腸球菌(Enterococcusfaecalis)、耐萬古霉素腸球菌(VRE)、耐萬古霉素金黃色葡萄球菌(VRSA)、耐萬古霉素中間體金黃色葡萄球菌(VISA)，炭疽桿菌(Bacillusanthracis)、綠膿桿菌(Pseudomonasaeruginosa)、大腸桿菌(Escherichiacoli)、黑曲霉(Aspergillusniger)、煙曲霉(A.fumigatus)、棒曲霉(A.clavatus)、茄腐鐮孢(Fusariumsolani)、尖孢鐮刀菌(F.oxysporum)、厚孢鐮刀菌(F.chlamydosporum)、單核細(xì)胞增多性李斯特菌(Listeriamonocytogenes)、伊氏利斯特菌(Listeriaivanovii)、霍亂弧菌(Vibriocholera)、副溶血性弧菌(V.parahaemolyticus)、豬霍亂沙門氏菌(Salmonellacholeraesuis)、傷寒沙門氏菌(S.typhi)、鼠傷寒沙門氏菌(S.typhimurium)、白色念珠菌(Candidaalbicans)、光滑念珠菌(C.glabrata)、克魯斯念珠菌(C.kruse)、阪崎腸桿菌(Enterobactersakazakii)、大腸桿菌O157和耐多藥革蘭氏陰性桿菌(MDR)。革蘭氏陽性細(xì)菌和革蘭氏陰性細(xì)菌是特別值得關(guān)注的。甚至更值得關(guān)注的是革蘭氏陽性細(xì)菌，諸如金黃色葡萄球菌。另外，特別值得關(guān)注的是耐抗生素的微生物，包括MRSA、VRSA、VISA、VRE和MDR?，F(xiàn)在轉(zhuǎn)向附圖，圖1-3示出了根據(jù)本公開的樣品處理設(shè)備1000的若干視圖。設(shè)備1000包括主體100以及任選地包括柱塞200。主體100包括第一端部112和與第一端部相對的第二端部114。主體100還包括處理室120、第一貯存器130以及第二貯存器140。任選的柱塞200包括桿部分201和密封構(gòu)件202。在本公開的設(shè)備的任何實施方案中，主體100的第二端部114任選地包括用于將設(shè)備1000固定到基板(未示出)的固定裝置118(例如，雙面粘合帶)。主體100以及柱塞200的至少一部分(例如，桿部分201)可使用本領(lǐng)域中已知的材料和工藝來制造。例如，主體100和柱塞200可通過常規(guī)模塑工藝使用合適聚合物材料(例如，聚乙烯、聚丙烯、聚苯乙烯、聚碳酸酯、丙烯腈丁二烯苯乙烯(ABS)塑料)來制成。在任何實施方案中，制成主體100的材料是光學(xué)可透射的(即，材料是透明的或半透明的)。有利地，這允許使用設(shè)備1000的操作員在使用設(shè)備1000時觀察例如柱塞200的狀態(tài)或液面(例如，樣品液體、第一貯存器130和/或第二貯存器140中的液體)。任選地，在任何實施方案中，密封構(gòu)件202可使用本領(lǐng)域中已知的常規(guī)工藝(例如，模塑工藝)由更可適形的材料(例如，丁基橡膠、硅橡膠、油浸硅橡膠)制成。在這些實施方案中，密封構(gòu)件202使用多種手段(例如，壓配合、粘合劑手段諸如壓敏粘合劑、超聲波焊接)中的任一種來聯(lián)接到桿部分201。在任何實施方案中，密封構(gòu)件使用本領(lǐng)域中已知的“二次注射”模塑工藝來模塑到桿部分上。在任何實施方案中，柱塞的桿和密封構(gòu)件可由單種材料制成，該材料的順應(yīng)性足以在柱塞插入設(shè)備的主體中時形成不透液密封。處理室120具有鄰近主體100的第一端部112的開口124。開口124被構(gòu)造(例如，形狀和尺寸被設(shè)定)為接收柱塞200的至少一部分。處理室120、第一貯存器130和第二貯存器140包括限定相應(yīng)結(jié)構(gòu)的形狀和內(nèi)容積的至少一個壁。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員根據(jù)本公開將認(rèn)識到，處理室、第一貯存器和第二貯存器可限定如本文所述適用的多種形狀和大小。例如，圖1-3例示的實施方案的處理室120包括限定圓柱形處理室的壁122。第一貯存器130分別由壁122和132部分地限定。第二貯存器140分別由壁122和142部分地限定。因此，在任何實施方案中，第一貯存器130和/或第二貯存器140緊鄰處理室120。有利地，這種構(gòu)造(即，貯存器緊鄰處理室)提供基本上緊湊的設(shè)計。盡管以基本上線性陣列示出貯存器(第一貯存器130和第二貯存器140)和處理室120，但也可設(shè)想到其它布置(例如，其中貯存器和處理室形成三角形布置，未示出)。處理室120的至少一個壁(例如，壁122)和在例示的實施方案中的過濾器160(下文描述)限定第一操作容積(例如，處理室的內(nèi)容積)。第一操作容積可選自適用于處理典型樣品的多種容積。在任何實施方案中，第一操作容積至少為約0.02mL至約100mL。在任何實施方案中，第一操作容積至少為約0.02mL至約25mL。在任何實施方案中，第一操作容積至少為約0.02mL至約10mL。在任何實施方案中，第一操作容積為約1mL至約100mL。在任何實施方案中，第一操作容積為1mL至約5mL。在任何實施方案中，設(shè)備1000的主體100還包括指示預(yù)定容積的視覺標(biāo)記。在任何實施方案中，主體100可包括多個視覺標(biāo)記。圖1示出主體100，主體100包括分別指示處理室120的第一預(yù)定容積和第二預(yù)定容積的兩個視覺標(biāo)記(即，第一視覺標(biāo)記106和第二視覺標(biāo)記108)。典型地，視覺標(biāo)記通過以下方式來使用：將設(shè)備1000放置在相對平坦的水平面上，并且在視覺上確定存在于設(shè)備1000中的液體(圖1中未示出)的彎月面是否近似地與指示主體的一部分(例如，處理室120)盛著預(yù)定體積的液體的標(biāo)記中的一個(即，第一視覺標(biāo)記106或第二視覺標(biāo)記108)齊平。在例示的實施方案中，兩個視覺標(biāo)記指示處理室120的預(yù)定容積。在任何實施方案中，第一預(yù)定容積與第二預(yù)定容積的比可限定操作濃度比。在任何實施方案中，處理室的第一預(yù)定容積與第二預(yù)定容積的比可以為約2:1、約3:1、約4:1、約5:1、約10:1、約20:1、約50:1或約100:1。另選地或除此之外，在任何實施方案中，主體可包括指示第一貯存器的預(yù)定容積的可視標(biāo)記(未示出)和/或指示第二貯存器的預(yù)定容積的可視標(biāo)記(未示出)。在任何實施方案中，主體可包括指示第一貯存器和/或第二貯存器的第一預(yù)定容積和第二預(yù)定容積的多個視覺標(biāo)記。有利地，表明第一貯存器的第一預(yù)定容積的第一可視標(biāo)記可用于指示例如置于第一貯存器中的洗液(例如，水、緩沖劑)的填充體積，并且表明第二預(yù)定容積的第二可視標(biāo)記可用于指示洗液的適當(dāng)體積已經(jīng)從第一貯存器轉(zhuǎn)移到處理室中，如下文所描述。有利地，表明第二貯存器的預(yù)定容積的可視標(biāo)記可用于指示正在處理室中處理的樣品已經(jīng)利用適當(dāng)體積的液體洗滌和/或已經(jīng)得到充分濃集并且準(zhǔn)備好進行另外的處理，如下文所描述。處理室120的壁122以及柱塞200的至少一部分(例如，桿部分201和密封構(gòu)件202)被構(gòu)造成使得柱塞的至少部分能夠可移除地插入處理室中并且能夠可滑動地橫穿處理室的至少一部分。優(yōu)選地，柱塞200的一部分(例如，密封構(gòu)件202)當(dāng)在處理室120中與壁122接合時形成基本上不透流體的配合，從而當(dāng)柱塞插入處理室中并朝向主體100的第二端部114或第一端部112被推壓時，促進在處理室中形成正壓或負(fù)壓。第一貯存器130與處理室120流體連通。圖3a示出從第一貯存器130中的開口(即，圖2的開口131)向處理室120中的開口121b延伸穿過主體100的第一流體通路195的細(xì)部圖。過濾器160設(shè)置在第一流體通路195(即，在處理室120中鄰近主體100的第二端部114)中。過濾器具有在第一流體通路195中朝向處理室120取向的第一側(cè)162。在例示的實施方案中，過濾器160由保持結(jié)構(gòu)168(例如，通過例如摩擦配合或粘合劑固定在適當(dāng)位置的O形環(huán))固定在其可操作位置中。圖2中未示出過濾器160，以便示出開口(分別為121a、121b、131和141)和單向閥(分別為172和174)。第一貯存器130的至少一個壁(例如，壁132)和第一單向閥172(下文討論)限定第二操作容積(例如，第一貯存器的內(nèi)容積)。第二操作容積可選自適用于處理樣品的多種容積。在任何實施方案中，第一貯存器130含有用于稀釋、洗滌和/或重懸(例如，濃集)在處理室120中處理的樣品材料的液體(圖1中未示出)。因此，第二操作容積可基于使用設(shè)備的方法的多個因素來選擇。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員將認(rèn)識到，這些因素包括例如，洗滌樣品材料的次數(shù)、用于每個洗滌步驟的液體的體積、樣品材料在其中稀釋或重懸的最終體積。在任何實施方案中，第二操作容積小于第一操作容積。在任何實施方案中，第二操作容積近似等于第一操作容積。在任何實施方案中，第二操作容積大于第一操作容積。在任何實施方案中，第一貯存器130任選地可包括反沖刷液體136。反沖刷液體從第一貯存器130被推壓穿過過濾器160，如下文所描述。當(dāng)被推壓穿過過濾器160時，反沖刷液體136可洗滌并任選地重懸沉積在過濾器上的顆粒物質(zhì)(例如，顆粒物質(zhì)諸如微生物)。在任何實施方案中，反沖刷液體136可包含水。在任何實施方案中，反沖刷液體136可包含表面活性劑。在任何實施方案中，反沖刷液體136可包含一種或多種溶質(zhì)(例如，鹽、糖)以維持預(yù)定離子強度或滲透強度。在任何實施方案中，過濾器160可被構(gòu)造成用于基本上防止生物細(xì)胞從處理室120傳送到第二貯存器140。在任何實施方案中，這可通過使用具有小于典型生物細(xì)胞的標(biāo)稱孔尺寸的過濾器160來實現(xiàn)。膜過濾器是適于作為本公開的設(shè)備的任何實施方案中的過濾器160使用的材料的非限制性示例。例如，具有0.45μm或0.2μm的標(biāo)稱孔隙率的膜過濾器適于攔住微生物細(xì)胞。例如，具有0.45μm或0.2μm的標(biāo)稱孔隙率的膜過濾器適于攔住微生物細(xì)胞。例如，具有高達約10μm的標(biāo)稱孔隙率的膜過濾器適于攔住酵母細(xì)胞、霉菌細(xì)胞、植物細(xì)胞或動物細(xì)胞。在任何實施方案中，過濾器160可被構(gòu)造(例如，按其位置、大小、形狀和標(biāo)稱孔尺寸)為基本上防止細(xì)胞濃集劑(例如，適于結(jié)合生物細(xì)胞的顆粒、諸如抗體綴合的顆粒)從處理室傳送到第一貯存器130和/或第二貯存器140。合適合適的細(xì)胞濃集劑的非限制性示例包括活性炭、羥基磷灰石(Berry等人；應(yīng)用環(huán)境微生物學(xué)(Appl.Environ.Microbiol)；63:40694074；1997)、磁珠(Oster等人，磁學(xué)與磁性材料雜志(J.MagnetismandMagneticMat)；225:145150；2001)、亞鐵磁性物質(zhì)、磁鐵礦、脫乙酰殼多糖以及親和載體。Appl.Environ.Microbiol.；63:40694074；1997)、磁珠(Oster等人,J.MagnetismandMagneticMat.；225:145150；2001)、亞鐵磁性物質(zhì)、磁鐵礦、脫乙酰殼多糖以及親和載體。合適的濃集劑的其它示例可見于美國專利申請公開2010/0062421中，該專利申請的公開內(nèi)容以引用方式并入本文。當(dāng)過濾器160被構(gòu)造成用于基本上防止細(xì)胞濃集劑通過時，過濾器的標(biāo)稱孔尺寸可大于結(jié)合到細(xì)胞濃集劑的細(xì)胞。通過防止細(xì)胞濃集劑通過，過濾器160可保持細(xì)胞濃集劑和附著到細(xì)胞濃集劑上的任何生物細(xì)胞可供用于在處理室120中進行處理，如本文所述。在這些實施方案中，適于過濾器160的孔尺寸可以是約1微米、約2微米、約5微米或更大。在這些實施方案中，本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員將認(rèn)識到，過濾器的孔尺寸可根據(jù)細(xì)胞濃集劑的大小(例如，中值直徑)來選擇。有利地，在這些實施方案中，使用具有更大孔尺寸的過濾器可實現(xiàn)更快速的過濾速率。第一單向閥172在第一流體通路195中設(shè)置在過濾器160和第一貯存器130之間。第一單向閥172在處理室120和第一貯存器130之間提供選擇性(例如，方向選擇性、操作選擇性)流體連通。適于用作第一單向閥172的單向閥包括例如碟型(Bellville-type)、傘型和鴨嘴型單向閥。操作選擇性可通過使用以下單向閥來維持，該單向閥具有必須超過以便允許流體穿過第一單向閥172的限定的開啟壓力(即，引起閥打開的閾值正壓或負(fù)壓)。因此，在任何實施方案中，第一單向閥172包括壓力致動的單向閥。方向選擇性...