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快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒及其檢測方法

文檔序號:85694閱讀:268來源:國知局
專利名稱:快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒及其檢測方法
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒,以及使用該試劑盒快速檢測鯊魚弧菌的方法。
背景技術(shù)
弧菌是海水養(yǎng)殖動物的主要病原,現(xiàn)已查明鯊魚弧菌是引起近江牡蠣大量死亡的病原之一,也能引起海水養(yǎng)殖魚類疾病,該菌亦存在于天然海水中。監(jiān)測養(yǎng)殖動物和海水中的鯊魚弧菌是防治其引起疾病的重要措施。目前鑒定弧菌的技術(shù)有1、經(jīng)典的生理生化鑒定方法,該法繁瑣、耗時、且要求操作人員有良好的專業(yè)素養(yǎng);2、細(xì)菌快速自動鑒定系統(tǒng),該法需要昂貴的儀器設(shè)備和技術(shù)熟練的操作人員;3、基于核酸的檢測技術(shù),包括DNA探針和PCR技術(shù)(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)技術(shù)),相對上述檢測技術(shù)而言,具有快速、簡捷、靈敏等特點(diǎn),但目前還未見檢測鯊魚弧菌的PCR技術(shù)及檢測試劑盒專利。

發(fā)明內(nèi)容為了解決現(xiàn)有技術(shù)的不足之處,本發(fā)明的首要目的在于提供一種快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒,特別是提供一對鯊魚弧菌特異性引物VcS和VcA,使用該試劑盒可快速檢測多種樣品中是否存在鯊魚弧菌,從而為健康養(yǎng)殖提供科學(xué)依據(jù)。本發(fā)明建立了快速靈敏準(zhǔn)確檢測鯊魚弧菌的PCR檢測技術(shù)并研制了檢測試劑盒,以滿足生產(chǎn)中簡便、快捷和準(zhǔn)確的需要。
本發(fā)明的另一目的在于提供上述檢測試劑盒檢測鯊魚弧菌的方法。
本發(fā)明的目的是由下述技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的一種快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒,包括增菌培養(yǎng)基、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)試劑、電泳和顯色試劑(a)試劑A即增菌培養(yǎng)基含胰化蛋白胨,牛肉膏,酵母提取物和瓊脂粉,其重量比為5∶3∶1∶18。
(b)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)試劑包括反應(yīng)預(yù)混試劑B和試劑C。
試劑B含有10倍聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)緩沖液(含MgCl215mM)、特異引物對VcS和VcA、dNTP(四種脫氧核苷酸的混合物)、小牛血清蛋白和滅菌雙蒸水,含量分別為2.5~5.0μl、0.5~1.0μl(10μM)、0.5~1.0μl(10μM)、0.5~1.0μl(10μMeach)、0.5~1.0μl(5mg/ml)和19.375~38.75μl。
試劑CTaq酶,0.125~0.25μl(5個單位/μl)。
(c)電泳和顯色試劑,包括試劑D、試劑E和試劑F。
試劑D為50倍TAE(電泳緩沖液),含三羥基甲基氨基甲烷-乙酸和乙二胺四乙酸,濃度分別為0.04M和0.001M;試劑E為凝膠加樣緩沖液,含w/v為40%的蔗糖和0.25%的溴酚藍(lán)和二甲苯青FF;試劑F0.8~2%(W/V)瓊脂糖+0.5~1μg/ml溴化乙錠。
為了更好地實(shí)現(xiàn)本發(fā)明,所述特異引物對VcS和VcA如下特異引物VcS指5′ATCCGGCAATGCAGTGTTC 3′;特異引物VcA指5′ACCTACCCGCCTCCTTACGC 3′。
所述聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)試劑的優(yōu)選組成為試劑B5.0μl10×PCR Buffer,1.0μl VcS,1.0μl VcA,1.0μl dNTP(10mM each),1.0μl BSA,38.75μl ddH2O;試劑C0.25μl Taq酶。
使用快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒檢測鯊魚弧菌的方法,包括如下步驟(a)增菌取2.7g試劑A加過濾海水至100ml,調(diào)PH值為7.2~7.4,121℃滅菌15~20min后按常規(guī)方法制作細(xì)菌培養(yǎng)平板。
無菌操作取0.1~0.5克樣品(待檢水產(chǎn)動物組織或水樣等,要避免污染),勻漿(需要時)后涂布于用試劑A即增菌培養(yǎng)基所制平板,30℃培養(yǎng)12~18小時。
(b)PCR擴(kuò)增挑取平板上各種菌苔于100μl滅菌蒸餾水中重懸混勻后取1~2μl作為PCR擴(kuò)增的模板;取23.875~47.75μl試劑B與0.125~0.25μl試劑C混合;在熱循環(huán)儀上通過95℃裂解細(xì)菌并解鏈5分鐘;然后用94℃變性30~60秒,55~58℃復(fù)性30~60秒鐘,72℃延伸30~90秒鐘,如此循環(huán)25~35次,最后在72℃保溫8~12分鐘,將鯊魚弧菌的特異片段增加到108mol以上。
(c)電泳和顯色檢測取5~10μl擴(kuò)增后的樣品,與1~2μl試劑F(凝膠加樣緩沖液)混合,W/V為0.8~1.2%的瓊脂糖電泳和顯色,在紫外光下檢測是否有一條470核苷酸對的條帶,如果有一條470bp的條帶,說明樣品中含有鯊魚弧菌,反之則沒有鯊魚弧菌。
本發(fā)明的主要原理為試劑B和C為多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)試劑,通過試劑B中所含鯊魚弧菌DNA片段特異引物和試劑C中的熱聚合酶等成分,對樣品釋放出的DNA進(jìn)行特異性的擴(kuò)增,由于本發(fā)明所設(shè)計引物為鯊魚弧菌特異性引物,因此,如果樣品中含有鯊魚弧菌,那么它的DNA特異片段在經(jīng)過擴(kuò)增后,濃度將達(dá)到108mol(克分子)以上,這樣,在電泳和溴化乙錠染色后,紫外光檢測就可以探測到一定分子量的目的條帶。如果沒有鯊魚弧菌存在,則不能擴(kuò)增到同樣分子量的目的條帶。
本發(fā)明與其它弧菌病原檢測技術(shù)相比,具有如下優(yōu)點(diǎn)和有益效果(1)本發(fā)明方法檢測方便,省去了通常方法中要提取細(xì)菌DNA的步驟;(2)本發(fā)明方法檢測靈敏度極高,檢測下限低至10~102個細(xì)菌;(3)本發(fā)明提供的引物對于不含鯊魚弧菌的檢測樣本均無擴(kuò)增信號,說明其具有良好的特異性;(4)本發(fā)明可以應(yīng)用于多種樣品的檢測,可以檢測養(yǎng)殖動物受鯊魚弧菌感染情況,也可以監(jiān)測養(yǎng)殖水體環(huán)境中鯊魚弧菌。
圖1為鯊魚弧菌快速檢測試劑盒特征引物特異性檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖。
圖2為鯊魚弧菌快速檢測試劑盒靈敏度實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖。
具體實(shí)施方式下面實(shí)施例對進(jìn)一步對本發(fā)明的說明,但本發(fā)明的實(shí)施方式不限于此。
實(shí)施例1 按以下配方制作快速檢測溶藻弧菌的試劑盒(a)試劑A(增菌培養(yǎng)基)含有胰化蛋白胨,牛肉膏,酵母提取物和瓊脂粉,其重量比為5∶3∶1∶18。
(b)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(25μl體系)試劑包括反應(yīng)預(yù)混試劑B和試劑C,試劑B含有10倍聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)緩沖液(含MgCl215mM)、特異引物對VcS和VcA、dNTP(四種脫氧核苷酸的混合物)、小牛血清蛋白和滅菌雙蒸水,含量分別為2.5μl、0.5μl(10μM)、0.5μl(10μM)、0.5μl(10μM each)、0.5μl(5mg/ml)和19.375μl。
試劑CTaq酶,0.125μl(5個單位/μl)。
(c)電泳和顯色試劑,包括試劑D、試劑E和試劑F。
試劑D為50倍TAE(電泳緩沖液),含三羥基甲基氨基甲烷-乙酸和乙二胺四乙酸,濃度分別為0.04M和0.001M;試劑E為凝膠加樣緩沖液,含w/v為40%的蔗糖和0.25%的溴酚藍(lán)及二甲苯青FF;試劑F1%(W/V)瓊脂糖+0.5μg/ml溴化乙錠。
按照以下程序快速檢測鯊魚弧菌的方法(a)樣品增菌處理取2.7g試劑A加過濾海水至100ml,調(diào)PH值為7.2~7.4,121℃滅菌20min后按常規(guī)方法制作細(xì)菌培養(yǎng)平板。
無菌操作取近江牡蠣消化盲囊組織約0.1克,勻漿后涂布于所制平板,30℃培養(yǎng)16小時;(b)PCR擴(kuò)增取23.875μl試劑B與0.125μl試劑C混合;用滅菌牙簽挑取平板上各種菌苔于100μl滅菌蒸餾水中重懸混勻,取1μl作為PCR模板加入上述混合液中;在熱循環(huán)儀上對進(jìn)行擴(kuò)增,通過95℃裂解細(xì)菌并解鏈5分鐘,然后用94℃變性20秒,57℃復(fù)性40秒,72℃延伸45秒鐘,如此循環(huán)30次,最后在72℃保溫10分鐘。
(c)電泳和顯色檢測取5μl擴(kuò)增后的樣品,與1μl試劑F(凝膠加樣緩沖液)混合,1%瓊脂糖電泳和顯色,在紫外光下檢測是否有一條470核苷酸對的條帶,如果有一條470bp的條帶,說明樣品中含有鯊魚弧菌,反之則沒有。
實(shí)施例2 按以下配方制作快速檢測溶藻弧菌的試劑盒(a)試劑A(增菌培養(yǎng)基)含有胰化蛋白胨,牛肉膏,酵母提取物和瓊脂粉,其重量比為5∶3∶1∶18。
(b)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(50μl體系)試劑包括反應(yīng)預(yù)混試劑B和試劑C。
試劑B含有10倍聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)緩沖液(含MgCl215mM)、特異引物對VcS和VcA、dNTP(四種脫氧核苷酸的混合物)、小牛血清蛋白和滅菌雙蒸水,含量分別為5.0μl、1.0μl(10μM)、1.0μl(10μM)、1.0μl(10μM each)、1.0μl(5mg/ml)和38.75μl。
試劑CTaq酶,0.25μl(5個單位/μl)。
(c)電泳和顯色試劑,包括試劑D、試劑E和試劑F。
試劑D為50倍TAE(電泳緩沖液),含三羥基甲基氨基甲烷-乙酸和乙二胺四乙酸,濃度分別為0.04M和0.001M;
試劑E為凝膠加樣緩沖液,含w/v為40%的蔗糖和0.25%的溴酚藍(lán)及二甲苯青FF;試劑F1%(W/V)瓊脂糖+0.5μg/ml溴化乙錠。
按照以下程序快速檢測鯊魚弧菌的方法(a)樣品增菌處理取2.7g試劑A加過濾海水至1L,調(diào)PH值為7.2~7.4,121℃滅菌20min后按常規(guī)方法制作細(xì)菌培養(yǎng)平板。
無菌操作取牡蠣血液約0.1克,涂布于所制平板,30℃培養(yǎng)16小時。
(b)PCR擴(kuò)增取47.75μl試劑B與0.25μl試劑C混合;用滅菌牙簽挑取平板上各種菌苔于100μl滅菌蒸餾水中重懸混勻,取2μl作為PCR模板加入上述混合液中;在熱循環(huán)儀上通過95℃裂解細(xì)菌并解鏈5分鐘;然后用94℃變性30秒,57℃復(fù)性45秒,72℃延伸60秒鐘,如此循環(huán)30次,最后在72℃保溫10分鐘。
(c)電泳和顯色檢測取8μl擴(kuò)增后的樣品,與2μl試劑F(凝膠加樣緩沖液),1%瓊脂糖電泳和顯色,在紫外光下檢測是否有一條470核苷酸對的條帶,如果有一條470bp的條帶,說明樣品中含有鯊魚弧菌,反之則沒有。
如圖1所示,為鯊魚弧菌快速檢測試劑盒特征引物特異性檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,其中MDNA marker,1副溶血弧菌,2哈維氏弧菌,3、4、5三株不同來源的溶藻弧菌,6鯊魚弧菌,7解蛋白弧菌,8需鈉弧菌,9坎氏弧菌,10燦爛弧菌,11河流弧菌,12創(chuàng)傷弧菌,圖1顯示鯊魚弧菌快速檢測試劑盒特征引物只能對鯊魚弧菌PCR擴(kuò)增出目的片段,其特異性是非常高的。
如圖2所示,為鯊魚弧菌快速檢測試劑盒靈敏度實(shí)驗(yàn)結(jié)果,其中MDNAmarker,1~825μl體系PCR結(jié)果,每管加入模板量(鯊魚弧菌數(shù)/管,平板計數(shù)法);15×107,25×106,35×105,45×104,55×103,65×102,75×101,85×100,圖2顯示鯊魚弧菌快速檢測試劑盒在101級時就可以檢測出結(jié)果,結(jié)合增菌步驟一般在所取檢測樣品中只要含有數(shù)個鯊魚弧菌就可檢出。
SEQUENCE LISTING<110>暨南大學(xué)<120>快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒及其檢測方法<130>20<160>2<170>PatentIn version 3.2<210>1<211>19<212>DNA<213>Artficial sequence<220>
<223>鯊魚弧菌特異引物VcS<400>1atccggcaat gcagtgttc 19<210>2<211>20<212>DNA<213>Artificial sequence<220>
<223>鯊魚弧菌特異引物VcA<400>2acctacccgc ctccttacgc 20
權(quán)利要求
1.一種快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒,其特征在于包括增菌培養(yǎng)基、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)試劑、電泳和顯色試劑(a)增菌培養(yǎng)基即試劑A含胰化蛋白胨,牛肉膏,酵母提取物和瓊脂粉,其重量比為5∶3∶1∶18;(b)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)試劑包括反應(yīng)預(yù)混試劑B和試劑C;試劑B含有10倍聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)緩沖液、特異引物對VcS和VcA、dNTP、小牛血清蛋白和滅菌雙蒸水,含量分別為2.5~5.0μl、0.5~1.0μl、0.5~1.0μl、0.5~1.0μl、0.5~1.0μl和19.375~38.75μl;試劑CTaq酶,0.125~0.25μl;(c)電泳和顯色試劑,包括試劑D、試劑E和試劑F;試劑D為50倍TAE,含三羥基甲基氨基甲烷-乙酸和乙二胺四乙酸,濃度分別為0.04M和0.001M;試劑E為凝膠加樣緩沖液,含w/v為40%的蔗糖和0.25%的溴酚藍(lán)和二甲苯青FF;試劑F0.8~2%瓊脂糖+0.5~1μg/ml溴化乙錠。
2.根據(jù)權(quán)利要求
1所述的一種快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒,其特征在于所述特異引物對VcS和VcA如下特異引物VcS指5′ATCCGGCAATGCAGTGTTC 3′;特異引物VcA指5′ACCTACCCGCCTCCTTACGC 3′。
3.根據(jù)權(quán)利要求
1所述的一種快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒,其特征在于所述聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)試劑的組成為試劑B5.0μl 10×PCR Buffer,1.0μl VcS,1.0μl VcA,1.0μl dNTP,1.0μl BSA,38.75μl ddH2O;試劑 C0.25μl Taq酶。
4.一種使用快速檢測鯊魚弧菌的試劑盒檢測鯊魚弧菌的方法,其特征在于包括如下步驟(a)增菌取2.7g試劑A加過濾海水至100ml,調(diào)PH值為7.2~7.4,121℃滅菌15~20min后按常規(guī)方法制作細(xì)菌培養(yǎng)平板;無菌操作取0.1~0.5克樣品,勻漿后涂布于用試劑A即增菌培養(yǎng)基所制平板,30℃培養(yǎng)12~18小時;(b)PCR擴(kuò)增挑取平板上各種菌苔于100μl滅菌蒸餾水中重懸混勻后取1~2μl作為PCR擴(kuò)增的模板;取23.875~47.75μl試劑B與0.125~0.25μl試劑C混合;在熱循環(huán)儀上通過95℃裂解細(xì)菌并解鏈5分鐘;然后用94℃變性30~60秒,55~58℃復(fù)性30~60秒鐘,72℃延伸30~90秒鐘,如此循環(huán)25~35次,最后在72℃保溫8~12分鐘,將鯊魚弧菌的特異片段增加到108mol以上;(c)電泳和顯色檢測取5~10μl擴(kuò)增后的樣品,與1~2μl試劑F混合,W/V為0.8~1.2%的瓊脂糖電泳和顯色,在紫外光下檢測是否有一條470核苷酸對的條帶,如果有一條470bp的條帶,說明樣品中含有鯊魚弧菌,反之則沒有鯊角弧菌。
專利摘要
本發(fā)明提供了一種檢測鯊魚弧菌的試劑盒及其檢測方法,該試劑盒包括增菌培養(yǎng)基即試劑A;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)試劑包括反應(yīng)預(yù)混試劑B和試劑C;電泳和顯色試劑,包括試劑D、試劑E和試劑F。本發(fā)明還提供使用這種試劑盒快速檢測鯊魚弧菌的方法,其優(yōu)點(diǎn)是快速,準(zhǔn)確,靈敏度高;本發(fā)明提供的引物對于不含鯊魚弧菌的檢測樣本均無擴(kuò)增信號,說明其具有良好的特異性。本發(fā)明可以應(yīng)用于多種樣品的檢測,可以檢測養(yǎng)殖動物受鯊魚弧菌感染的情況,也可以監(jiān)測養(yǎng)殖水體環(huán)境中病原鯊魚弧菌。
文檔編號G01N21/31GK1995372SQ200610123591
公開日2007年7月11日 申請日期2006年11月16日
發(fā)明者張其中, 張占會 申請人:暨南大學(xué)導(dǎo)出引文BiBTeX, EndNote, RefMan
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