本發(fā)明涉及檢測PCV2病毒的克隆體的構(gòu)建方法。
背景技術(shù):
豬圓環(huán)病毒病(Porcine circovirus disease,簡稱PCVD)是由豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)引起的一類豬病的總稱,主要包括斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征、豬皮炎腎病綜合征、豬呼吸道疾病綜合征和母豬的繁殖障礙。PCVD現(xiàn)已在全世界范圍內(nèi)發(fā)生和流行,其發(fā)病率可達(dá)60%,死亡率3%-10%,發(fā)病嚴(yán)重地區(qū)豬場在暴發(fā)本病時死淘率達(dá)到40%左右,給世界養(yǎng)豬業(yè)帶來了巨大的損失。為控制豬圓環(huán)病毒病的流行,目前,商品化全病毒滅活疫苗和亞單位疫苗已在世界各地養(yǎng)豬場應(yīng)用,并取得較好的效果。但是這些疫苗接種成本較高,并不能完全阻斷PCV2的傳播。
臨床上最常用的檢測PCV2病毒的方法是PCR方法,該方法往往需要陽性對照,通常的做法是使用PCV2強毒作為陽性對照,該做法存在兩個問題,一是可能散毒,且一旦散毒后無法區(qū)分?jǐn)U散的是檢測用強毒還是流行的野毒;二是目標(biāo)DNA難以定量;同樣,測定豬圓環(huán)病毒病免疫效果,間接免疫熒光是常用方法,通常以PCV2強毒感染的PK-15細(xì)胞作為檢測抗原,與PCV2病毒檢測方法相似,該方法同樣存在兩個問題,一是存在散毒風(fēng)險;二是作為目標(biāo)抗原的PCV2病毒缺乏識別標(biāo)記,當(dāng)存在PCV2、PCV1污染時,難以區(qū)分測得的抗體是針對PCV1、還是PCV2的抗體。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
為了避免野生病毒制作的診斷抗原可能存在的污染、難以標(biāo)準(zhǔn)化等問題,本發(fā)明目的是提出構(gòu)建帶KT3標(biāo)簽的PCV2感染性克隆和帶KT3標(biāo)簽的PCV2病毒。
本發(fā)明包括以下步驟:
1)引物設(shè)計:設(shè)計PCV2全長引物,所述PCV2全長引物的上、下游引物的5’端插入病毒基因組自帶的Sac II限制性內(nèi)切酶酶切位點;
設(shè)計在PCV2全基因組的ORF2的羧基端(C端)插入含猿猴病毒40大T抗原(KT3)標(biāo)簽(含11個aa:KPPTPPPEPET)的引入KT3的上下游引物引物;
以PCV2唯一的酶切位點Nco I設(shè)計一對鑒定pSK-KT3-dPCV2雙拷貝重組質(zhì)粒用引物;
2)PCV2病毒DNA的提?。?/p>
3)將步驟2)中獲得的病毒DNA使用步驟1)設(shè)計的引物利用重疊延伸PCR的方法,擴增帶KT3標(biāo)簽的PCV2全基因組;
4)膠回收PCR產(chǎn)物并連接至pMD?19-T Vector,獲得重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2;
5)將重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,獲得重組質(zhì)粒T-sPCV2-KT3;
6)構(gòu)建pSK-KT3-sPCV2單拷貝重組質(zhì)粒;
7)構(gòu)建pSK-KT3-dPCV2雙拷貝重組質(zhì)粒;
8)電轉(zhuǎn)化Dulac細(xì)胞并進(jìn)行傳代培養(yǎng),獲得帶KT3標(biāo)簽的rPCV2-KT3重組病毒。
本發(fā)明目設(shè)計一對引物在PCV2全基因組的ORF2的羧基端(C端)插入含猿猴病毒40大T抗原(KT3)標(biāo)簽(含11個aa:KPPTPPPEPET),利用重疊延伸PCR方法,獲得含KT3標(biāo)簽的全長序列,將其連接至pMD?19-T Vector,重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,獲得重組質(zhì)粒T-sPCV2-KT3。利用SacII限制性內(nèi)切酶對重組質(zhì)粒T-sPCV2-KT3進(jìn)行酶切和膠回收,pBluescript II SK(+) 載體以同樣限制性內(nèi)切酶酶切、去磷酸化并回收,將兩者的回收產(chǎn)物利用T4連接酶進(jìn)行過夜連接、轉(zhuǎn)化,獲得pSK-KT3-sPCV2單拷貝重組質(zhì)粒。利用PCV2基因組中唯一的限制性內(nèi)切酶Sac II、Nco I與Nde I進(jìn)行酶切,獲得三個目的片段,T4連接酶連接,獲得首尾依次串聯(lián)的雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2。以電轉(zhuǎn)染的方法轉(zhuǎn)入Dulac細(xì)胞,經(jīng)傳代培養(yǎng)最終獲得含KT3標(biāo)簽的rPCV2-KT3重組病毒。
本發(fā)明借助分子克隆技術(shù),在體外構(gòu)建含猿猴病毒40大T抗原(KT3)的感染性克??;感染性克隆電轉(zhuǎn)化無PCV污染的PK-15細(xì)胞,獲得帶KT3標(biāo)簽的PCV2病毒。感染性克隆可用作PCV2感染PCR診斷的標(biāo)準(zhǔn)陽性對照;帶KT3標(biāo)簽的PCV2病毒既可用于臨床診斷中PCV2病毒分離的陽性對照,也可用于疫苗免疫效果評價中抗體水平測定的靶抗原。由于感染性克隆完全在體外構(gòu)建,電轉(zhuǎn)化過程也在完全可控的條件下進(jìn)行,因此所獲純凈的帶KT3標(biāo)簽的PCV2病毒,避免了野生病毒制作的診斷抗原可能存在的污染、難以標(biāo)準(zhǔn)化等問題。
本發(fā)明以上步驟1)中所述PCV2全長引物為:
P1-SacII-F 5’-GAATCACCGCGGGCTGGCTGAACTTTTGAAAGT-3’ ;
Sac II
P2-SacII-R 5’-GCAACTCCGCGGAAATTTCTGACAAACGTTACA-3’ 。
Sac II
所述引入KT3的上下游引物為:
所述鑒定pSK-KT3-dPCV2雙拷貝重組質(zhì)粒用引物為:
PCV2 -Nco I-F1 5’-CATACCATGGTGAAGAAGTGGTTGTTATTG-3’ ;
Nco I
PCV2 -Nco I-R1 5’-CATACCATGGTAACCATCCCACCACTTG-3’ 。
Nco I
以提取的DNA為模板,利用高保真酶與上游引物P1-SacII-F、下游引物P2-SacII-R擴增PCV2的全基因組(長度1767 bp)。用引物P1-SacII-F/ P4-KT3-Rp1擴增出一條580 bp的片段,用P3-KT3-Fp1/P2-SacII-R擴增出一條1200 bp的片段。將兩個PCR的產(chǎn)物,用PCR產(chǎn)物回收試劑盒回收目的片段。利用重疊延伸的方法,再以全長引物P1-SacII-F/P2-SacII-R擴增出帶有KT3標(biāo)簽的1800 bp的全長基因組。
步驟4)中通過連接pMD?19-T Vector,利用感受態(tài)細(xì)胞大腸桿菌DH5α轉(zhuǎn)化,獲得重組質(zhì)粒T-sPCV2-KT3。重組質(zhì)粒T-sPCV2-KT3利用SacII限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切和膠回收,pBluescript II SK(+) 載體同樣用限制性內(nèi)切酶SacII進(jìn)行酶切、去磷酸化并回收,將兩者的回收產(chǎn)物利用T4連接酶進(jìn)行過夜連接、轉(zhuǎn)化,獲得pSK-KT3-sPCV2單拷貝重組質(zhì)粒。利用PCV2上唯一的限制性內(nèi)切酶Sac II、Nco I與Nde I進(jìn)行酶切,獲得三個目的片段,T4連接酶連接,獲得首尾依次串聯(lián)的雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2。
步驟8)中所述將大量提取的雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2電轉(zhuǎn)化Dulac細(xì)胞,進(jìn)行傳代獲得感染性克隆rPCV2-KT3,進(jìn)行PCR鑒定和TCID50/mL的測定。
本發(fā)明的有益效果:豬圓環(huán)病毒病是我國養(yǎng)豬業(yè)最重要的傳染病之一,造成的經(jīng)濟損失難以估量。PCV2感染的實驗室診斷,主要以PCR方法為主,因此,診斷用標(biāo)準(zhǔn)化核酸的需求量巨大;同時,PCV2疫苗免疫效果的評價,間接免疫熒光方法又是最常用的方法之一,純凈、標(biāo)準(zhǔn)化、帶標(biāo)簽的PCV2自然具有巨大的市場需求,而帶KT3標(biāo)簽的PCV2病毒正好滿足了這一需求。本專利內(nèi)容為PCV2感染的確診、疫苗的評價提供了無可替代的新型工具,對我國豬圓環(huán)病毒病的防控將帶來革命性的影響。
附圖說明
圖1為重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2雙拷貝感染性克隆的構(gòu)建圖。
圖2為KT3-PCV2全基因組的PCR擴增產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠中的電泳條帶圖。
圖3為重組質(zhì)粒T-KT3-PCV2的PCR鑒定與酶切鑒定圖。
圖4為單拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-sPCV2的PCR鑒定與酶切鑒定圖。
圖5為雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2的PCR鑒定與酶切鑒定圖。
圖6為 rPCV2-KT3拯救病毒的PCR檢測結(jié)果圖。
圖7為以rPCV2-KT3克隆毒株接種Dulac細(xì)胞后的熒光鑒定照片。
圖8為以rPCV2-KT3克隆毒株接種Dulac細(xì)胞后的熒光鑒定照片。
圖9為以 rPCV2-KT3克隆毒株接種Dulac細(xì)胞后的熒光鑒定照片。
圖10為以PCV2陽性對照接種接種Dulac細(xì)胞后的熒光鑒定照片。
具體實施方式
本發(fā)明的具體技術(shù)方案如下:
(1)引物的設(shè)計:
根據(jù)PCV2基因序列,設(shè)計PCV2全長引物,其上、下游引物的5’端插入病毒基因組自帶的Sac II限制性內(nèi)切酶酶切位點:
P1-SacII-F 5’-GAATCACCGCGGGCTGGCTGAACTTTTGAAAGT-3’ ;
Sac II
P2-SacII-R 5’-GCAACTCCGCGGAAATTTCTGACAAACGTTACA-3’ 。
Sac II
另外一對引物在PCV2全基因組的ORF2的羧基端(C端)插入含猿猴病毒40大T抗原(KT3)標(biāo)簽(含11個aa:KPPTPPPEPET):
以PCV2唯一的酶切位點Nco I設(shè)計一對鑒定pSK-KT3-dPCV2雙拷貝重組質(zhì)粒:
PCV2 -Nco I-F1 5’-CATACCATGGTGAAGAAGTGGTTGTTATTG-3’ ;
Nco I
PCV2 -Nco I-R1 5’-CATACCATGGTAACCATCCCACCACTTG-3’ 。
Nco I
以上第一對引物可以擴增出PCV2的全長DNA序列1800 bp;P1-SacII-F/ P4-KT3-Rp1可擴增出一條580 bp的片段,P3-KT3-Fp1/P2-SacII-R擴增出一條1200 bp的片段。
將兩個PCR產(chǎn)物,用PCR產(chǎn)物回收試劑盒回收目的片段。經(jīng)核酸測定儀測出回收片段濃度,利用重疊延伸PCR方法,重新利用全長引物P1-SacII-F/P2-SacII-R擴增出帶有KT3標(biāo)簽的1800 bp的全長基因組,重組質(zhì)粒(pSK-KT3-dPCV2)雙拷貝感染性克隆的構(gòu)建圖如圖1所示。
(2)PCV2病毒DNA的提?。?/p>
取培養(yǎng)離心后的細(xì)胞培養(yǎng)液上清或反復(fù)凍融后的組織研磨液上清100 μL于1.5 mL指形管中,依次加入400 μL超純水、92 μL 10% SDS溶液和8 μL蛋白酶K(20 mg/mL),渦旋混勻后置58℃金屬浴30 min。再加入體積比為1:1的苯酚:氯仿600 μL,劇烈震蕩混勻,12000 r/min離心15 min,小心吸取上清400 μL,加入-20℃預(yù)冷的無水乙醇800 μL,反復(fù)顛倒數(shù)次,-20℃靜置20-30 min,12000 r/min離心10 min。棄上清,加入70%乙醇800 μL洗滌,12000 r/min離心5 min,棄上清,瞬離,棄殘液并晾干,加入30 μLRTE,37℃作用30 min,立刻使用或-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(3)利用重疊延伸PCR的方法,擴增帶KT3標(biāo)簽的PCV2全基因組:
①病毒DNA的擴增
在PCR管中分別加入下列試劑,組成50 μL的擴增反應(yīng)體系:
A、PCR擴增580 bp的目的片段
B、PCR擴增1200 bp的目的片段
C、將A和B的PCR擴增產(chǎn)物純化回收后,利用重疊延伸PCR的方法引入KT3標(biāo)簽,擴增1800 bp的PCV2全長序列:
PCR擴增參數(shù):98℃預(yù)變性10 s,98℃變性5 s,55℃退火1 min,72℃延伸2 min,30個循環(huán);72℃延伸10 min。PCR反應(yīng)結(jié)束后,于10℃保存。將擴增的PCR產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳檢測(濃度:1%,含溴化乙錠0.5 μg/mL)電泳,結(jié)果如圖2所示。
圖2中:
M:DL5000 DNA marker;
1: PCR product of PCV2b1B/121108YZ by P1-SacII-F/P4-KT3-Rp1 (580 bp)
2: PCR product of PCV2b1B/121108YZ by P3-KT3-Fp1/P2-SacII-R (1200 bp)
3: PCR product of rPCV2-KT3 by P1-SacII-F/P2-SacII-R (1800 bp)
4: Positive control: PCR product of rPCV2 by P1-SacII-F/P2-SacII-R (1767 bp)
5: Negative control。
從圖2可見:將PCV2b1B/121108YZ的DNA模板,利用設(shè)計的引物P1-SacII-F/P4-KT3-Rp1和P3-KT3-Fp1/P2-SacII-R 分別進(jìn)行PCR擴增,分別可以擴增出580 bp和1200 bp的目的片段。然后將擴增出的目的片段利用全長引物P1-SacII-F/P2-SacII-R,通過重疊延伸PCR技術(shù)再次進(jìn)行PCR擴增,最后可擴增出帶有KT3標(biāo)簽的1800 bp的目的片段,而陰性對照孔顯示陰性,說明PCV2b1B/121108YZ中的KT3標(biāo)簽引入成功。
②DNA片段的純化回收
PCR產(chǎn)物電泳鑒定正確后,切下目的條帶于1.5 mL指形管中,用Agarose gel DNA extraction kit(Axygen公司產(chǎn)品)按產(chǎn)品說明書回收目的片段,最后用15 μL超純水或緩沖液洗脫并測定DNA濃度,-20℃保存。
③回收產(chǎn)物連接pMD?19-T Vector
10 μL的連接體系:5 μL超純水,1 μL10×Rapid ligation buffer,2 μL膠回收DNA片段,1 μL載體,1 μL T4DNA連接酶,混勻后4℃連接過夜。
④重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化
用CaCl2法制備感受態(tài)大腸桿菌DH5α,冰浴4 h后供轉(zhuǎn)化試驗用。將200 μL感受態(tài)細(xì)胞與連接產(chǎn)物輕輕吹勻,冰浴30 min,42℃熱休克不超過90 s,立即冰浴3 min,補加37℃預(yù)熱的LB培養(yǎng)基至1 mL,上下緩慢顛倒數(shù)次,置37℃搖床100 rpm,45-60 min,5000 rpm離心5 min,棄去800 μL培養(yǎng)基,將剩余200 μL培養(yǎng)基重懸菌體,均勻涂布AIX平板,置37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)過夜。
⑤質(zhì)粒DNA小量制備
于AIX平板上無菌挑取單個白色菌落,接種于Amp/LB液體培養(yǎng)基并置37℃搖床220 rpm,培養(yǎng)14 h左右。用堿裂解法小提質(zhì)粒,取1 mL培養(yǎng)物,12000 rpm離心1 min,棄上清,加入100 μL預(yù)冷的溶液Ⅰ重懸細(xì)菌沉淀,加入200 μL現(xiàn)配的溶液Ⅱ,上下顛倒數(shù)次混勻后,冰浴不超過5 min,再加入150 μL預(yù)冷的溶液Ⅲ,上下顛倒混勻,冰浴3-5 min。12000 rpm離心10 min,小心吸取400 μL上清,用等體積的酚:氯仿(1:1)抽提一次,取上清,加入2倍體積的-20℃預(yù)冷的無水乙醇,上下輕柔顛倒數(shù)次后,-20℃靜置15-30 min,12000 rpm離心10 min,棄上清,用70%的乙醇洗滌一次,離心棄上清,瞬離,吸干。待乙醇揮發(fā)干凈后,加入30 μL含RNase A(20 μg/mL)的TE buffer(pH8.0),37℃水浴30 min,溶解DNA沉淀,-20℃凍存?zhèn)溆谩?/p>
按照步驟①中C的方法,取步驟⑤提取的質(zhì)粒進(jìn)行PCR擴增,通過限制性內(nèi)切酶Sac II酶切鑒定。經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳,若為陽性質(zhì)粒則可擴增出一條1800 bp的條帶,經(jīng)限制性內(nèi)切酶Sac II酶切可觀察到1800 bp和3000 bp的兩個條帶,如圖3所示。將陽性質(zhì)粒送至測序,測序結(jié)果證實含KT3標(biāo)簽的PCV2片段已成功克隆到pMD?19-T Vector上。
酶切鑒定:在指形管中,配制總體積為20 μL 的酶切體系:
圖3中:
M: DL5000 DNA marker;
1:PCR product of T-KT3-PCV2 by P1-SacII-F/P2-SacII-R (1800 bp);
2:T-KT3-PCV2 plasmid by SacII enzyme digestion (1800 bp、3000 bp);
3:Negative control。
由圖3可見:重組陽性質(zhì)粒T-KT3-PCV2通過全長引物 P1-SacII-F/P2-SacII-R進(jìn)行PCR鑒定,可擴增出一條1800 bp的目的片段。另外,通過限制性內(nèi)切酶SacII進(jìn)行酶切作進(jìn)一步鑒定,可以酶切出1800 bp和3000 bp的兩條目的片段,而陰性對照無條帶,說明重組質(zhì)粒T-KT3-PCV2構(gòu)建成功。
(4)單拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-sPCV2的構(gòu)建
①將鑒定正確的T-KT3-PCV2重組質(zhì)粒利用限制性內(nèi)切酶Sac II進(jìn)行酶切,重組質(zhì)粒通過0.8% 瓊脂糖凝膠電泳,用Agarose gel DNA extraction kit (Axygen公司) 按產(chǎn)品說明書進(jìn)行目的片段的回收,最后用20 μL緩沖液或超純水洗脫回收,并測定DNA的濃度。
②pBluescript II SK(+) 載體的酶切及去磷酸化
pBluescript II SK(+) 質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶Sac II酶切,將酶切后的線性質(zhì)粒用CIAP(Taraka公司)進(jìn)行去磷酸化,用10 μL滅菌超純水洗脫回收。然后將①和②回收的目的片段用T4連接酶進(jìn)行連接。
10 μL連接體系:
16℃金屬浴過夜連接,按照步驟(3)中④的方法進(jìn)行轉(zhuǎn)化。
③單拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-sPCV2的PCR鑒定與酶切鑒定
按照用步驟(3)中⑤的方法,小量制備質(zhì)粒,用步驟(1)中設(shè)計的PCV2全長引物P1-SacII-F /P2-SacII-R 進(jìn)行PCR鑒定,并用限制性內(nèi)切酶Bgl II和
Hind III酶切鑒定,配制總量為20 μL 的酶切體系。
A、Sac II限制性內(nèi)切酶酶切
B、Hind Ⅲ 限制性內(nèi)切酶酶切
如圖4所示,將鑒定正確的質(zhì)粒送至測序并進(jìn)行序列的比對。
圖4中:
M: DL5000 DNA marker;
1:PCR product of pSK-KT3-sPCV2 by P1-SacII-F/P2-SacII-R (1800 bp);
2:Recombinant plasmid (pSK-KT3-sPCV2) by BglII enzyme digestion (1800 bp、2692 bp);
3:Recombinant plasmid (pSK-KT3-sPCV2) by HindIII enzyme digestion (4492 bp);
4: Negative control。
由圖4可見:單拷貝重組陽性質(zhì)粒pSK-KT3-sPCV2通過PCR鑒定,利用全長引物 P1-SacII-F/P2-SacII-R可以擴增出一條1800 bp的目的片段。同時,利用限制性內(nèi)切酶BglII和HindIII分別酶切作進(jìn)一步鑒定,其中限制性內(nèi)切酶BglII可以酶切出1800 bp和2692 bp的兩條目的片段,而限制性內(nèi)切酶HindIII進(jìn)行單酶切出現(xiàn)一條4492 bp的條帶,而陰性對照無條帶,說明重組質(zhì)粒pSK-KT3-sPCV2構(gòu)建成功。
(5)單拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-sPCV2的大量制備
取陽性菌液,接種于500 mL Amp/LB液體培養(yǎng)基于37℃搖床220 rpm,培養(yǎng)16 h左右,按照 堿裂解法大量提取質(zhì)粒DNA,用聚乙二醇沉淀法純化質(zhì)粒DNA,測定質(zhì)粒DNA濃度及純度后分裝,-70℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(6)雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2的構(gòu)建
①單拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-sPCV2的酶切及目的片段的回收
利用PCV2上唯一的三個酶切位點(限制性內(nèi)切酶Sac II、Nco I與Nde I)進(jìn)行酶切,具體步驟如下:
A、Nco I與Nde I進(jìn)行雙酶切,酶切體系(50 μL):
B、Sac II與Nco I進(jìn)行雙酶切,酶切體系(50 μL):
C、Sac II與Nde I進(jìn)行雙酶切,酶切體系(50 μL):
37℃反應(yīng)2 h后,在0.8%的瓊脂糖凝膠電泳,用Agarose gel DNA extraction kit (Axygen公司) 按產(chǎn)品說明書進(jìn)行目的片段的回收,最后用30 μL緩沖液或超純水洗脫回收,并測定核酸DNA的濃度。
②連接反應(yīng)
回收目的片段4491 bp、483 bp和1626 bp三個片段用T4 DNA Ligation(Takara公司)進(jìn)行連接,16℃過夜連接。
③轉(zhuǎn)化連接產(chǎn)物
將10 μL連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,將培養(yǎng)物均勻地涂布于LB平板(100 μg/mL IPTG、200 μg/mL X-Gal),置37℃培養(yǎng)箱中15 min,待涂抹物充分吸收后,將平板倒置于培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)。挑選白色單菌落接種到Amp/LB液體培養(yǎng)基進(jìn)行少量擴增培養(yǎng)。
(7)雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2的PCR鑒定和酶切鑒定
①雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2的PCR鑒定
將過夜培養(yǎng)的菌液,通過菌液PCR的方法,利用PCV2-NcoI-F1/ PCV2-NcoI-R1引物進(jìn)行PCR初步鑒定。
PCR反應(yīng)體系(25 μL):
PCR擴增參數(shù):94℃預(yù)變性5 min;94℃變性1 min,55℃退火1 min,72℃延伸2 min,30個循環(huán);72℃延伸10 min。PCR反應(yīng)結(jié)束后,于10℃保存。將擴增的PCR產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳檢測(濃度:1%,含溴化乙錠0.5 μg/mL)電泳,結(jié)果如圖5所示。
②雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2的酶切鑒定
為了進(jìn)一步確定構(gòu)建的雙拷貝重組質(zhì)粒的正確性,分別用限制性內(nèi)切酶
Bgl II與Hind III進(jìn)行進(jìn)一步的酶切鑒定。陽性質(zhì)粒經(jīng)限制性內(nèi)切酶Bgl II酶切后會出現(xiàn)兩條帶,分別為1800 bp和4800 bp。限制性內(nèi)切酶Hind III酶切重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2,會出現(xiàn)一條6600 bp的單條帶,如圖5所示。
圖5中:
M: DL5000 DNA marker;
1:PCR product of pSK-KT3-dPCV2 by P1-SacII-F/P2-SacII-R (1800 bp);
2: Recombinant plasmid (pSK-KT3-dPCV2) by BglIIenzyme digestion (1800 bp、4800 bp);
3: Recombinant plasmid (pSK-KT3-dPCV2) by HindIII enzyme digestion (6600 bp);
4: Negative control。
由圖5可見:重組陽性質(zhì)粒 pSK-KT3-dPCV2通過PCR方法進(jìn)行初步鑒定,利用全長引物P1-SacII-F/P2-SacII-R可以擴增出一條1800 bp的目的片段。此外,利用限制性內(nèi)切酶BglII和HindIII分別酶切作進(jìn)一步鑒定,通過限制性內(nèi)切酶BglII可以酶切出1800 bp和4800 bp的兩條目的片段,限制性內(nèi)切酶HindIII可以切出一條6600 bp的目的片段,而陰性對照孔顯示陰性,說明重組質(zhì)粒 pSK-KT3-dPCV2構(gòu)建成功。
(8)雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2的大量制備
按照堿裂解法大量提取質(zhì)粒DNA,本步驟與本部分步驟(5)中單拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-sPCV2的大量制備方法相同,-70℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(9)雙拷貝重組質(zhì)粒pSK-KT3-dPCV2的電轉(zhuǎn)染
用大量提取的pSK-KT3-dPCV2的重組質(zhì)粒,待Dulac細(xì)胞長至匯合度為90%左右時進(jìn)行DNA 質(zhì)粒的電轉(zhuǎn)染。步驟如下:
將生長狀態(tài)良好、待長至匯合度90%左右的Dulac細(xì)胞,用0.25%胰酶消化后轉(zhuǎn)入離心管中,小心吹打混勻,1000 rpm離心5 min,棄去離心后的上清液,再用PBS洗滌3次,于最后一次洗滌后,將離心管瞬離,吸去管底少量的PBS。將10 μg質(zhì)粒DNA與800 μL低滲液充分混勻后作為轉(zhuǎn)染液,然后用轉(zhuǎn)染液將離心在管底的細(xì)胞輕柔重懸并吹打混勻,室溫靜置2 min。將細(xì)胞懸液加入到電轉(zhuǎn)杯中,放入電穿孔轉(zhuǎn)染儀中進(jìn)行電擊,電擊完成后,靜置5 min后取出。設(shè)定電轉(zhuǎn)參數(shù):電壓為350 V,時間為400 μs,脈沖數(shù)為2。將電轉(zhuǎn)杯中的轉(zhuǎn)染液加入6 mL的細(xì)胞培養(yǎng)液中,混勻后轉(zhuǎn)入6孔細(xì)胞板,在37℃,5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。同時設(shè)健康的Dulac細(xì)胞作為陰性對照。
(10)感染性克?。╮PCV2-KT3)的PCR檢測及間接免疫熒光(IFA)檢測
①感染性克隆rPCV2-KT3的PCR檢測
將轉(zhuǎn)染的細(xì)胞進(jìn)行連續(xù)傳代,盲傳至第8代與第12代時,收取病毒液提取病毒核酸DNA進(jìn)行PCR檢測,提取方法與步驟(2)相同,運用步驟(1)設(shè)計的PCV2全長引物進(jìn)行進(jìn)行PCR的擴增,結(jié)果如圖6所示。
圖6中:
M:DL5000 DNA marker;
1:PCR product of rPCV2-KT3 (F8) by P1-SacII-F/P2-SacII-R (1800 bp);
2:PCR product of rPCV2-KT3 (F12) by P1-SacII-F/P2-SacII-R (1800 bp);
3:Negative control。
由圖6可見:將盲傳至第8代和第12代的感染性克隆rPCV2-KT3通過PCR方法進(jìn)行檢測,利用全長引物by P1-SacII-F/P2-SacII-R均可擴增出1800 bp的目的條帶,而陰性對照孔顯示陰性,說明感染性克隆rPCV2-KT3已克隆成功。
②感染性克隆rPCV2-KT3的間接免疫熒光(IFA)檢測
收取第8代和第12代的感染性克隆rPCV2-KT3病毒液經(jīng)反復(fù)凍融3次后,-70℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
將無PCV1污染且長勢良好的健康Dulac細(xì)胞,消化后取適量分裝到96孔板中,于5% CO2的37℃恒溫培養(yǎng)箱中,培養(yǎng)18-24 h至細(xì)胞的對數(shù)生長期,棄去培養(yǎng)基,PBS洗滌3次,將PCV2細(xì)胞毒進(jìn)行連續(xù)10倍稀釋 (10-1-10-6) ,100 μL/孔,每個稀釋度做8孔,以PCV2 (本實驗室保存的PCV2b1B/Yangzhou/JS/121108YZ毒株)感染的Dulac細(xì)胞為陽性對照、健康的Dulac細(xì)胞為陰性對照,37℃吸附作用1.5 h,補加4% 胎牛血清(FBS)的DMEM培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)。60 h后結(jié)束培養(yǎng)并棄去培養(yǎng)液,5 min/次,用PBS洗滌96孔板,共洗滌3次,拍干或自然晾干,冷甲醇-20℃固定20 min,棄去固定液,自然晾干。
用PBS稀釋豬源PCV2陽性血清 (1:1000) 與兔抗KT3多克隆抗體 (1:250),加入96孔板各孔中,50 μL/孔,37℃孵育溫箱1 h,PBS洗滌3次/5 min,吸水紙上拍干;避光加入25 μL的1:200稀釋的FITC標(biāo)記的羊抗豬熒光二抗 (IgG),37℃溫箱避光孵育45 min后,PBS洗滌三次后拍干,再加入1:100稀釋的Anti-Rabbit IgG (Fc specific)-Texas RedTM, antibody produced in donkey二抗25 μL,37℃溫箱避光孵育45 min再洗滌3次,將96孔板放在倒置熒光顯微鏡下觀察結(jié)果,第8代和第12代的拯救病毒rPCV2-KT3與親本株P(guān)CV2的TCID50結(jié)果相似,TCID50/mL分別為105.8、106.0和106.0,可看到特異性的綠色熒光斑。
拯救病毒rPCV2-KT3的IFA結(jié)果可觀察到能與PCV2血清發(fā)生特異性反應(yīng)的綠色熒光斑,也能與KT3標(biāo)簽發(fā)生特異性反應(yīng)的紅色熒光斑,而對照的陰性健康細(xì)胞中無熒光,如圖7至10所示。說明拯救病毒rPCV2-KT3在盲傳的Dulac細(xì)胞中存在PCV2的病毒粒子,且KT3標(biāo)簽可隨著PCV2的滾環(huán)復(fù)制得到表達(dá)。
從圖7的以rPCV2-KT3克隆毒株接種Dulac細(xì)胞后的熒光鑒定照片可見:有綠色熒光。
從圖8的以rPCV2-KT3克隆毒株接種Dulac細(xì)胞后的熒光鑒定照片可見:有抗KT3標(biāo)簽--紅色熒光。
從圖9的以 rPCV2-KT3克隆毒株接種Dulac細(xì)胞后的熒光鑒定照片可見:有以上兩種組合的黃綠色熒光。
從圖10的以PCV2陽性對照接種Dulac細(xì)胞后的熒光鑒定照片可見:有綠色熒光。
而陰性對照即健康的Dulac細(xì)胞后的熒光鑒定后,照片中則無熒光。
<110>揚州大學(xué)
<120>帶KT3標(biāo)簽的重組病毒rPCV2-KT3的構(gòu)建方法
<160>6
<210>1
<211>33
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根據(jù)PCV2全長基因設(shè)計
<400>1
gaatcaccgc gggctggctg aacttttgaa agt
<210>2
<211>33
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根據(jù)PCV2全長基因設(shè)計
<400>2
gcaactccgc ggaaatttct gacaaacgtt aca
<210>3
<211>57
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根據(jù)KT3基因設(shè)計
<400>3
cattaggttt ccggttccgg cggcggggtc ggcggtttag ggttaagtgg ggggtct
<210>4
<211>57
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根據(jù)KT3基因設(shè)計
<400>4
accctaaacc gccgaccccg ccgccggaac cggaaaccta atgaataata aaaacca
<210>5
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根據(jù)鑒定pSK-KT3-dPCV2雙拷貝重組質(zhì)粒設(shè)計
<400>5
cataccatgg tgaagaagtg gttgttattg
<210>6
<211>28
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根據(jù)鑒定pSK-KT3-dPCV2雙拷貝重組質(zhì)粒設(shè)計
<400>6
cataccatgg taaccatccc accacttg
<110>揚州大學(xué)
<120>帶KT3標(biāo)簽的重組病毒rPCV2-KT3的構(gòu)建方法
<160>6
<210>1
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<212>DNA
<213>人工序列
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<223>根據(jù)PCV2全長基因設(shè)計
<400>1
gaatcaccgc gggctggctg aacttttgaa agt
<210>2
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<212>DNA
<213>人工序列
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<223>根據(jù)PCV2全長基因設(shè)計
<400>2
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<212>DNA
<213>人工序列
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<223>根據(jù)KT3基因設(shè)計
<400>3
cattaggttt ccggttccgg cggcggggtc ggcggtttag ggttaagtgg ggggtct
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<223>根據(jù)KT3基因設(shè)計
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<223>根據(jù)鑒定pSK-KT3-dPCV2雙拷貝重組質(zhì)粒設(shè)計
<400>5
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<223>根據(jù)鑒定pSK-KT3-dPCV2雙拷貝重組質(zhì)粒設(shè)計
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