1.一種高質(zhì)量咖啡葉片基因組DNA的高效提取方法,其特征在于,包括以下步驟:
①取咖啡樹枝尖新鮮嫩葉2~3片(約0.2~0.3g),放入2mL尖底離心管中,蓋上蓋子,將離心管浸入液氮1~3min后取出用鐵絲搗碎。立即加入0.1g PVP粉、0.5mL氯仿(AR)和1mL改良Extraction buffer溶液的混合液,再添加20μL β-巰基乙醇(2%)后于渦旋振蕩儀上搖勻;如果不溶,65℃水浴1h充分溶解。Extraction buffer溶液配方:350mM山梨醇,100mM Tris-HCl,100mM EDTA pH8.0,0.5%Na2S2O3;
②將溶化后的糊狀物在離心機(jī)上4℃、5000rpm離心10min,吸棄上層液相和下層氯仿。在每管沉淀物中加入600μL Lysis buffer溶液和12μL β-巰基乙醇(2%),混勻后放置65℃水浴鍋中溫浴30min。Lysis buffer溶液配方:0.2M Tris-HCl pH8,0.05M EDTA,2M NaCl,CTAB 2%;
③添加300μL酚及300μL的氯仿:異戊醇混合液,氯仿:異戊醇體積比(v/v)是24∶1,輕輕上下顛倒混勻,形成乳狀液后放入離心機(jī)4℃、12 000rpm離心15min;
④回收上層液相,重復(fù)第③步再抽提一次;
⑤將上層液相移至一個新的1.5mL尖底離心管,加入60μL 3M NaAc、600μL預(yù)冷的無水乙醇(使用前-20℃冰箱保存),輕輕上下顛倒混勻后放入離心機(jī)4℃、12 000rpm離心15min;
⑥吸棄液相,用1mL預(yù)冷的無水乙醇洗滌沉淀物2次,棄乙醇;將管倒扣于濾紙上,使乙醇流盡,風(fēng)干或自然涼干。加入50μL TE緩沖液或ddH2O溶解沉淀物。TE緩沖液配方:10mMTris-HCl pH8.0,1mM EDTA pH8.0;
⑦電泳檢測DNA的完整性,A260/280測定DNA濃度和純度。