Pcr擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法
【專利摘要】本發(fā)明涉及一種生物【技術(shù)領(lǐng)域】的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,包括如下步驟:以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為模板,設(shè)計PCR引物;其中,正向PCR引物位于質(zhì)粒啟動子(目的基因?qū)?yīng)啟動子)上游,反向PCR引物位于質(zhì)粒轉(zhuǎn)錄終止子(目的基因?qū)?yīng)終止子)下游;以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為PCR模板,通過所設(shè)計的PCR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;回收PCR產(chǎn)物;選取PCR產(chǎn)物,按照Lonza公司核轉(zhuǎn)試劑盒標(biāo)準(zhǔn)操作程序進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染。與核轉(zhuǎn)質(zhì)粒相比,核轉(zhuǎn)PaGene能夠顯著降低懸浮動物細(xì)胞的死亡率;PaGene在保證核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞較低死亡率的情況下,轉(zhuǎn)染效率亦沒有顯著降低或降低很少。
【專利說明】PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明屬于生物【技術(shù)領(lǐng)域】,具體涉及一種PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法。
【背景技術(shù)】
[0002]核酸轉(zhuǎn)染細(xì)胞(非編碼小RNA、信使RNA、或者質(zhì)粒)被廣泛應(yīng)用于功能基因組學(xué)研究、疫苗研究、轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究、干細(xì)胞研究、炎癥性疾病治療研究等方面;用于細(xì)胞系或者原代細(xì)胞轉(zhuǎn)染的方法可以分為兩類:一類是基于病毒的轉(zhuǎn)染方法;另一類是不基于病毒的轉(zhuǎn)染方法。對于不基于病毒的轉(zhuǎn)染方法,電轉(zhuǎn)(Electrophoration)是其中最重要的方法之一(特別是對于懸浮細(xì)胞),電轉(zhuǎn)的基本原理是通過電擊造成細(xì)胞質(zhì)膜短暫的通透,以便于核酸能夠進(jìn)入細(xì)胞。作為電轉(zhuǎn)的升級版,核轉(zhuǎn)(Nucleofection)綜合了電擊以及細(xì)胞特異的溶液,能夠保證細(xì)胞較理想的轉(zhuǎn)染效率以及細(xì)胞活力,特別是對于那些很難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞。
[0003]Kasum1-1細(xì)胞系是來自于一位患M2型急性髓系白血病(Acute myeloid leukemiaM2)的日本男孩的外周血,該細(xì)胞系在白血病發(fā)病機(jī)理的研究中被廣泛使用。然而,研究人員在Kasum1-1細(xì)胞的常規(guī)核轉(zhuǎn)實(shí)踐中發(fā)現(xiàn),用質(zhì)粒核轉(zhuǎn)總是會誘導(dǎo)更加嚴(yán)重的細(xì)胞死亡以及更低的轉(zhuǎn)染效率,質(zhì)粒核轉(zhuǎn)所導(dǎo)致的高死亡率有可能影響所轉(zhuǎn)染目的基因生物作用的客觀準(zhǔn)確解讀,現(xiàn)有技術(shù)中亟需一種可靠的核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞的方法,以便進(jìn)行涉及Kasum1-1核轉(zhuǎn)的相關(guān)功能實(shí)驗(yàn)。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004]本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一種PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法。本發(fā)明的方法保證了目的基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞后,能夠較客觀的觀察感興趣基因本身對懸浮動物細(xì)胞所造成的生物影響,排除了核轉(zhuǎn)質(zhì)粒后所造成的非特異細(xì)胞死亡對基因真實(shí)生物作用的掩蓋。
[0005]本發(fā)明涉及一種PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,包括如下步驟:
[0006]步驟一,以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為模板,設(shè)計PCR引物;其中,正向PCR引物位于質(zhì)粒啟動子上游,反向PCR引物位于質(zhì)粒轉(zhuǎn)錄終止子下游;
[0007]步驟二,以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為PCR模板,通過所設(shè)計的PCR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;PCR擴(kuò)增所用的DNA聚合酶為具有校正功能的高保真DNA聚合酶;
[0008]步驟三,回收PCR產(chǎn)物,即PaGene,并定量及測定A260/A280、A260/A230比值;A260/A280和A260/A230比值需> 1.8,以保證PaGene具有較高的完整性和純度;
[0009]步驟四,選取PaGene,按照Lonza公司核轉(zhuǎn)試劑盒標(biāo)準(zhǔn)操作程序進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染,所用PaGene用與對應(yīng)質(zhì)粒相同摩爾數(shù)的劑量進(jìn)行核轉(zhuǎn),進(jìn)而完成PaGene核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞。
[0010]優(yōu)選地,所 述目的基因可為任何編碼蛋白的基因。
[0011]優(yōu)選地,所述重組目的基因的表達(dá)質(zhì)??蔀榉钦T導(dǎo)型表達(dá)蛋白的質(zhì)粒。
[0012]優(yōu)選地,所述方法包括如下步驟:[0013]懸浮動物細(xì)胞在含有適當(dāng)比例胎牛血清的懸浮動物細(xì)胞培養(yǎng)基中培養(yǎng),培養(yǎng)環(huán)境為37°C、5%C02 ;大腸桿菌(E.coli)工具菌株被用于質(zhì)粒的保存和擴(kuò)增;用相應(yīng)試劑盒抽提質(zhì)粒;所抽提質(zhì)粒被用于目的蛋白編碼基因的擴(kuò)增;所擴(kuò)增基因被命名為PaGene ;
[0014]所述基因用具有校正功能的DNA聚合酶和其對應(yīng)PCR引物進(jìn)行擴(kuò)增;正向引物位于基因啟動子上游,反向引物位于基因轉(zhuǎn)錄終止子下游;正反向引物的位置保證目的蛋白編碼基因在細(xì)胞內(nèi)能夠成功轉(zhuǎn)錄和翻譯;PaGene用相應(yīng)試劑盒純化,進(jìn)而用于核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞;
[0015]DNA濃度以及A260/A280和A260/A230,比值皆≥1.8,用相應(yīng)分光光度計測定,以反應(yīng)對應(yīng)核酸的完整性和純度;PaGene亦通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行質(zhì)控;
[0016]取懸浮動物細(xì)胞被用于核轉(zhuǎn);
[0017]核轉(zhuǎn)所用溶液及程序采用Lonza公司就對應(yīng)細(xì)胞系的說明書進(jìn)行或者采用常規(guī)核轉(zhuǎn)條件;核轉(zhuǎn)后,細(xì)胞被轉(zhuǎn)移至37°C預(yù)熱的懸浮動物細(xì)胞完全培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng);
[0018]進(jìn)而完成PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞;與核轉(zhuǎn)質(zhì)粒相比,核轉(zhuǎn)PaGene能夠顯著降低懸浮動物細(xì)胞的死亡率;PaGene在保證核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞較低死亡率的情況下,轉(zhuǎn)染效率沒有顯著降低或降低很少。
[0019]優(yōu)選地,所述懸浮動物細(xì)胞為Kasum1-1細(xì)胞、NB4細(xì)胞或THP-1細(xì)胞。
[0020]優(yōu)選地,所述PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞的方法包括如下步驟:
[0021]步驟一,以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為模板,設(shè)計PCR引物;其中,正向PCR引物位于質(zhì)粒啟動 子上游,反向PCR引物位于質(zhì)粒轉(zhuǎn)錄終止子下游;
[0022]步驟二,以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為PCR模板,通過所設(shè)計的PCR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;PCR擴(kuò)增所用的DNA聚合酶為具有校正功能的高保真DNA聚合酶;
[0023]步驟三,回收PCR產(chǎn)物,即PaGene,并定量及測定A260/A280、A260/A230比值;A260/A280和A260/A230比值需> 1.8,以保證PaGene具有較高的完整性和純度;
[0024]步驟四,選取PaGene,按照Lonza公司核轉(zhuǎn)試劑盒標(biāo)準(zhǔn)操作程序進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染,核轉(zhuǎn)程序?yàn)镻-19,核轉(zhuǎn)所用溶液為solution V,即kit V,所用PaGene用與對應(yīng)質(zhì)粒相同摩爾數(shù)的劑量進(jìn)行核轉(zhuǎn),進(jìn)而完成PaGene核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞。
[0025]優(yōu)選地,步驟一中,所述目的基因?yàn)镋GFP基因或螢火蟲熒光素酶基因。
[0026]優(yōu)選地,步驟一中,所述重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為BD Biosciences的質(zhì)粒pEGFP-N2 或 Promega 的質(zhì)粒 pGL3_Control。
[0027]優(yōu)選地,步驟二中,所述DNA聚合酶為Toyobo公司的KOD Plus ;
[0028]所述引物具體為=PaEGFP-正向的序列如SEQ ID N0.1所示,PaEGFP-反向的序列如SEQ ID N0.2所示;PaLuc-正向的序列如SEQ ID N0.3所示,PaLuc-反向的序列如SEQID N0.4 所示。
[0029]優(yōu)選地,其特征在于,步驟四中,所用PaGene劑量以2 μ g對應(yīng)質(zhì)粒所對應(yīng)等摩爾數(shù)的劑量進(jìn)行核轉(zhuǎn)。
[0030]優(yōu)選地,所述方法包括如下步驟:
[0031]Kasum1-1細(xì)胞在含有15%胎牛血清的RPMI1640培養(yǎng)基中培養(yǎng),培養(yǎng)環(huán)境為37°C、5%C02 ;大腸桿菌(Ε.coli)菌株TOPlO被用于質(zhì)粒的保存和擴(kuò)增;用NucleoBond Xtra Midi試劑盒抽提質(zhì)粒 pEGFP_N2 和 pGL3_Control ;用 AxyPrep? Plasmid Miniprep 試劑盒準(zhǔn)備空E.coli TOPlO的洗脫液;所抽提質(zhì)粒被用于EGFP和Iuciferase的擴(kuò)增;所擴(kuò)增基因分別被命名為PaEGFP和PaLuc ;
[0032]所述兩個基因用具有校正功能的DNA聚合酶KOD Plus和其對應(yīng)PCR引物進(jìn)行擴(kuò)增;正向引物位于基因啟動子上游,EGFP在pEGFP-N2的啟動子為Paw IE ;luciferase在pGL3-Control的啟動子為SV40啟動子;反向引物位于轉(zhuǎn)錄終止子下游,EGFP在pEGFP_N2的終止子為早期poly (A)信號;luciferase在pGL3_Control的終止子為SV40晚期poly (A)信號;正反向引物的位置保證PaEGFP和PaLuc能夠在細(xì)胞內(nèi)成功轉(zhuǎn)錄和翻譯;所述引物具體為:PaEGFP-正向的序列如SEQ ID N0.1所示,PaEGFP-反向的序列如SEQ ID N0.2所示;PaLuc-正向的序列如SEQ ID N0.3所示,PaLuc-反向的序列如SEQ ID N0.4所示;
[0033]PaGene用AxyPrep? PCR Clean-up試劑盒純化,進(jìn)而用于核轉(zhuǎn)Kasum1-Ι細(xì)胞;
[0034]DNA 濃度以及 A260/A280 和 A260/A230,比值皆≥ 1.8,用 Nano Drop NDlOOO 分光光度計測定,以反應(yīng)對應(yīng)核酸的完整性和純度;質(zhì)粒和PaGene亦通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行質(zhì)控;
[0035]Kasum1-1細(xì)胞與10 μ M等體積的eFluor670混合,并在37°C避光孵育IOmin ;之后加入4-5倍體積預(yù)冷的RPMI1640完全培養(yǎng)基,所述RPMI1640完全培養(yǎng)基為RPMI1640+15%胎牛血清,并且冰浴5min以終止標(biāo)記,之后用RPMI1640完全培養(yǎng)基洗滌3遍,所標(biāo)記細(xì)胞被用于后續(xù)核轉(zhuǎn);
[0036]2X IO6Kasum1-1細(xì)胞被用于核轉(zhuǎn),所述細(xì)胞預(yù)先標(biāo)記或沒有標(biāo)記細(xì)胞增殖染料eFluor670 ;
[0037]核轉(zhuǎn)所用溶液為solution V,即kit V,程序?yàn)镻-19 ;核轉(zhuǎn)后,細(xì)胞被轉(zhuǎn)移至37°C預(yù)熱的RPMI1640完全培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng);
[0038]對于PaEGFP和pEGFP_N2,每次核轉(zhuǎn)的劑量分別為680ng PaEGFP和2000ngPEGFP-N2,具有相同摩爾數(shù);SE.coli洗脫液亦被用于核轉(zhuǎn),以便檢測樣品中殘留的內(nèi)毒素是否對細(xì)胞有潛在的致死效果;對于PaLuc和pGL3-Control,核轉(zhuǎn)劑量分別為830ngPaLuc和2000ng pGL3_Control,相同摩爾數(shù);與PaGene相同質(zhì)量的對應(yīng)質(zhì)粒亦被用于核轉(zhuǎn),具體為 PEGFP-N2 680ng, pGL3_Control830ng ;
[0039]進(jìn)而完成PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞;與核轉(zhuǎn)質(zhì)粒相比,核轉(zhuǎn)PaGene能夠顯著降低Kasum1-1細(xì)胞的死亡率,核轉(zhuǎn)PaGene的Kasum1-1細(xì)胞能夠較好增殖,PaGene在保證核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞較低死亡率的情況下,轉(zhuǎn)染效率沒有顯著降低或降低很少。
[0040]本發(fā)明具有如下的有益效果:(I)與核轉(zhuǎn)質(zhì)粒相比,核轉(zhuǎn)PaGene能夠顯著降低懸浮動物細(xì)胞的死亡率;(2) PaGene在保證核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞較低死亡率的情況下,轉(zhuǎn)染效率亦沒有顯著降低或降低很少;本發(fā)明的方法保證了目的基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞后,能夠較客觀的觀察感興趣基因本身對懸浮動物細(xì)胞所造成的生物影響,排除了核轉(zhuǎn)質(zhì)粒后所造成的非特異細(xì)胞死亡對基因真實(shí)生物作用的掩蓋。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0041]通過閱讀參照以下附圖對非限制性實(shí)施例所作的詳細(xì)描述,本發(fā)明的其它特征、目的和優(yōu)點(diǎn)將會變得更明顯:
[0042]圖1為以質(zhì)粒為模板進(jìn)行基因PCR擴(kuò)增以及實(shí)驗(yàn)設(shè)計示意圖;[0043]圖2為PaGene及其對應(yīng)表達(dá)質(zhì)粒的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果;
[0044]圖3為核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞的細(xì)胞活力和GFP+比例結(jié)果;
[0045]圖4為核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞的顯微鏡觀察結(jié)果;
[0046]圖5為通過其它方法對核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞增殖能力的檢測結(jié)果;
[0047]圖6為核轉(zhuǎn)后Kasum1-1細(xì)胞表達(dá)外源蛋白的定量結(jié)果;
[0048]圖7為核轉(zhuǎn)后NB4和THP-1細(xì)胞的細(xì)胞活力和GFP+比例結(jié)果。
【具體實(shí)施方式】
[0049]下面結(jié)合具體實(shí)施例,進(jìn)一步闡述本發(fā)明。應(yīng)理解,這些實(shí)施例僅用于說明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下列實(shí)施例中未注明具體條件的試驗(yàn)方法,通常按照常規(guī)條件,例如薩姆布魯克等分子克隆:實(shí)驗(yàn)手冊第三版(科學(xué)出版社,2002)中所述的條件,或者按照各制造商所建議的條件。
[0050]實(shí)施例1、PCR擴(kuò)增基因(PaGene)核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞
[0051] 申請人:發(fā)現(xiàn)表達(dá)質(zhì)粒核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞后,導(dǎo)致Kasum1-1細(xì)胞大量死亡; 申請人:經(jīng)過大量的實(shí)驗(yàn),意外地發(fā)現(xiàn),采用如下方法處理后能夠顯著減少核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞的死亡率、以及保持較理 想的細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率和較高的細(xì)胞增殖,以便為后續(xù)涉及Kasum1-1細(xì)胞核轉(zhuǎn)的相關(guān)功能實(shí)驗(yàn)提供可行的核轉(zhuǎn)方法;所述方法以表達(dá)質(zhì)粒為模板,通過PCR擴(kuò)增目的基因(PaGene);所擴(kuò)增PaGene包含基因啟動子、蛋白編碼區(qū)、以及轉(zhuǎn)錄終止子;保證PaGene能夠在細(xì)胞內(nèi)成功的轉(zhuǎn)錄和翻譯,之后用PaGene核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞。
[0052]本實(shí)施例涉及一種PaGene核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞的方法,主要以增強(qiáng)型綠色突光蛋白(Enhanced green fluorescent protein,EGFP)為工具報告基因,在 Kasum1-1 細(xì)胞中進(jìn)行的核轉(zhuǎn)實(shí)驗(yàn),具體內(nèi)容如下,以下實(shí)施例中涉及到的相關(guān)試劑及材料均可以通過公開的市售渠道獲得。
[0053]細(xì)胞系和大腸桿菌菌株
[0054]Kasum1-1細(xì)胞(能夠通過市售的公開渠道獲得)在含有15%胎牛血清(Gibco)的RPMI1640培養(yǎng)基中培養(yǎng)(Gibco),培養(yǎng)環(huán)境為37°C、5%C02。大腸桿菌(Escherochia coli,
E.coli)菌株 T0P10 (Invitrogen-Life Technologies)被用于質(zhì)粒的保存和擴(kuò)增。
[0055]質(zhì)粒和PCR 擴(kuò)增基因(PCR amplified gene, PaGene)的準(zhǔn)備
[0056]用NucleoBond Xtra Midi 試劑盒(Macherey-Nagel)抽提質(zhì)粒 pEGFP_N2 (BDBiosciences)和 pGL3_Control (Promega)0
[0057]用AxyPrep? Plasmid Miniprep 試劑盒(Axygen)準(zhǔn)備空 Ε.coli T0P10 的洗脫液(按照標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒抽提步驟。該空E.coli洗脫液中可能含有內(nèi)毒素,用以鑒定殘存的內(nèi)毒素是否在Kasum1-1細(xì)胞核轉(zhuǎn)過程中對細(xì)胞有致死作用)。所抽提質(zhì)粒被用于EGFP和螢火蟲熒光素酶基因(Firefly luciferase)的擴(kuò)增。所擴(kuò)增基因分別被命名為PaEGFP (PCR ampIiedEGFP)和 PaLuc (PCR amplified luciferase)。
[0058]具體來講,這兩個基因用具有校正功能的DNA聚合酶KOD Plus(Toyobo)和其對應(yīng)PCR引物(表1,引物合成于英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司)進(jìn)行擴(kuò)增。正向引物位于基因啟動子上游(EGFP在pEGFP-N2的啟動子為Pcmv ie ;luciferase在pGL3_Control的啟動子為SV40啟動子);反向引物位于轉(zhuǎn)錄終止子下游(EGFP在pEGFP-N2的終止子為早期poly (A)信號;luciferase在pGL3_Control的終止子為SV40晚期poly (A)信號)(圖1)。
[0059]圖1,以質(zhì)粒為模板進(jìn)行基因PCR擴(kuò)增以及實(shí)驗(yàn)設(shè)計示意圖。IH向引物位于基因啟動子上游;反向引物位于基因終止子下游。用具有校IH功能的DNA聚合酶擴(kuò)增目的基因。PaGene進(jìn)一步被純化,并被用于Kasum1-1細(xì)胞核轉(zhuǎn)(同時亦包括其對應(yīng)表達(dá)質(zhì)粒的核轉(zhuǎn)比較)。表達(dá)質(zhì)粒的核轉(zhuǎn)劑暈為兩個:一個劑暈與PaGene等質(zhì)暈;另一個劑暈與PaGene等摩爾數(shù)。
[0060]正反向引物的位置保證PaEGFP和PaLuc能夠在細(xì)胞內(nèi)成功轉(zhuǎn)錄和翻譯。PaGene用AxyPrep? PCR Clean-up試劑盒(Axygen)純化,進(jìn)而用于核轉(zhuǎn)Kasum1-Ι細(xì)胞。
[0061]DNA 濃度以及 A260/A280 和 A260/A230 (比值皆大于 1.8)用 Nano Drop NDlOOO 分光光度計(Thermo Scientific)測定,以反應(yīng)對應(yīng)核酸的完整性和純度。
[0062]質(zhì)粒和PaGene亦通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行質(zhì)控(圖2)。圖2, PaGenes及其對應(yīng)表汰質(zhì)粒的掠脂糖凝膠電泳。(A),dEGFP-N2和PaEGFP的凝膠電泳。(B),DGL3_Control和PaLuc的凝膠電泳。DNA分子量參照DL2000和DL15, 000購自于Takara,對應(yīng)備帶分子量大小(堿基對,basepair,簡稱bp)標(biāo)記于電$永圖左偵!I。
[0063]表1 PaEGFP和PaLuc PCR擴(kuò)增所用的引物序列
[0064]
【權(quán)利要求】
1.一種PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,包括如下步驟: 步驟一,以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為模板,設(shè)計PCR引物;其中,正向PCR引物位于質(zhì)粒啟動子上游,反向PCR引物位于質(zhì)粒轉(zhuǎn)錄終止子下游; 步驟二,以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為PCR模板,通過所設(shè)計的PCR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;PCR擴(kuò)增所用的DNA聚合酶為具有校正功能的高保真DNA聚合酶; 步驟三,回收PCR產(chǎn)物,即PaGene,并定量及測定A260/A280、A260/A230比值;A260/A280和A260/A230比值需> 1.8,以保證PaGene具有較高的完整性和純度; 步驟四,選取PaGene,按照Lonza公司核轉(zhuǎn)試劑盒標(biāo)準(zhǔn)操作程序進(jìn)行懸浮動物細(xì)胞轉(zhuǎn)染,所用PaGene用與對應(yīng)質(zhì)粒相同摩爾數(shù)的劑量進(jìn)行核轉(zhuǎn),進(jìn)而完成PaGene核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞。
2.如權(quán)利要求1所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,所述目的基因可為任何編碼蛋白的基因。
3.如權(quán)利要求1所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,所述重組目的基因的表達(dá)質(zhì)??蔀榉钦T導(dǎo)型表達(dá)蛋白的質(zhì)粒。
4.如權(quán)利要求1所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,所述方法包括如下步驟: 懸浮動物細(xì)胞在含有適當(dāng)比例胎牛血清的懸浮動物細(xì)胞培養(yǎng)基中培養(yǎng),培養(yǎng)環(huán)境為37°C、5%C02 ;大腸桿菌(E.coli)工具菌株被用于質(zhì)粒的保存和擴(kuò)增;用相應(yīng)試劑盒抽提質(zhì)粒;所抽提質(zhì)粒被用于目的 蛋白編碼基因的擴(kuò)增;所擴(kuò)增基因被命名為PaGene ; 所述基因用具有校正功能的DNA聚合酶和其對應(yīng)PCR引物進(jìn)行擴(kuò)增;正向引物位于基因啟動子上游,反向引物位于基因轉(zhuǎn)錄終止子下游;正反向引物的位置保證目的蛋白編碼基因在細(xì)胞內(nèi)能夠成功轉(zhuǎn)錄和翻譯;PaGene用相應(yīng)試劑盒純化,進(jìn)而用于核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞; DNA濃度以及A260/A280和A260/A230,比值皆≥1.8,用相應(yīng)分光光度計測定,以反應(yīng)對應(yīng)核酸的完整性和純度;PaGene亦通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行質(zhì)控; 取懸浮動物細(xì)胞被用于核轉(zhuǎn); 核轉(zhuǎn)所用溶液及程序采用Lonza公司就對應(yīng)細(xì)胞系的說明書進(jìn)行或者采用常規(guī)核轉(zhuǎn)條件;核轉(zhuǎn)后,細(xì)胞被轉(zhuǎn)移至37°C預(yù)熱的懸浮動物細(xì)胞完全培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng); 進(jìn)而完成PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞;與核轉(zhuǎn)質(zhì)粒相比,核轉(zhuǎn)PaGene能夠顯著降低懸浮動物細(xì)胞的死亡率;PaGene在保證核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞較低死亡率的情況下,轉(zhuǎn)染效率沒有顯著降低或降低很少。
5.如權(quán)利要求1所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,所述懸浮動物細(xì)胞為Kasum1-1細(xì)胞、NB4細(xì)胞或THP-1細(xì)胞。
6.如權(quán)利要求5所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,所述PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞的方法包括如下步驟: 步驟一,以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為模板,設(shè)計PCR引物;其中,正向PCR引物位于質(zhì)粒啟動子上游,反向PCR引物位于質(zhì)粒轉(zhuǎn)錄終止子下游; 步驟二,以重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為PCR模板,通過所設(shè)計的PCR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;PCR擴(kuò)增所用的DNA聚合酶為具有校正功能的高保真DNA聚合酶;步驟三,回收PCR產(chǎn)物,即PaGene,并定量及測定A260/A280、A260/A230比值;A260/A280和A260/A230比值需> 1.8,以保證PaGene具有較高的完整性和純度; 步驟四,選取PaGene,按照Lonza公司核轉(zhuǎn)試劑盒標(biāo)準(zhǔn)操作程序進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染,核轉(zhuǎn)程序?yàn)镻-19,核轉(zhuǎn)所用溶液為solution V,即kit V,所用PaGene用與對應(yīng)質(zhì)粒相同摩爾數(shù)的劑量進(jìn)行核轉(zhuǎn),進(jìn)而完成PaGene核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞。
7.如權(quán)利要求6所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,步驟一中,所述目的基因?yàn)镋GFP基因或螢火蟲熒光素酶基因。
8.如權(quán)利要求6所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,步驟一中,所述重組目的基因的表達(dá)質(zhì)粒為BD Biosciences的質(zhì)粒pEGFP_N2或Promega的質(zhì)粒pGL3-Control。
9.如權(quán)利要求6所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,步驟二中,所述DNA聚合酶為Toyobo公司的KOD Plus ; 所述引物具體為=PaEGFP-正向的序列如SEQ ID N0.1所示,PaEGFP-反向的序列如SEQID N0.2所示;PaLuc-正向的序列如SEQ ID N0.3所示,PaLuc-反向的序列如SEQ ID N0.4所示。
10.如權(quán)利要求6所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,步驟四中,所用PaGene劑量以2 μ g對應(yīng)質(zhì)粒所對應(yīng)等摩爾數(shù)的劑量進(jìn)行核轉(zhuǎn)。
11.如權(quán)利要求6所述的PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)懸浮動物細(xì)胞的方法,其特征在于,所述方法包括如下步驟: Kasum1-1細(xì)胞在含有15%胎牛血清的RPMI1640培養(yǎng)基中培養(yǎng),培養(yǎng)環(huán)境為37°C、5%C02 ;大腸桿菌(Ε.coli)菌株TOPlO被用于質(zhì)粒的保存和擴(kuò)增;用NucleoBond Xtra Midi試劑盒抽提質(zhì)粒 pEGFP_N2 和 pGL3_Control ;用 AxyPrep? Plasmid Miniprep 試劑盒準(zhǔn)備空E.coli TOPlO的洗脫液;所抽提質(zhì)粒被用于EGFP和Iuciferase的擴(kuò)增;所擴(kuò)增基因分別被命名為PaEGFP和PaLuc ; 所述兩個基因用具有校正功能的DNA聚合酶KOD Plus和其對應(yīng)PCR引物進(jìn)行擴(kuò)增;正向引物位于基因啟動子上游,EGFP在pEGFP-N2的啟動子為Paw IE ;Iuciferase在pGL3-Control的啟動子為SV40啟動子;反向引物位于轉(zhuǎn)錄終止子下游,EGFP在pEGFP_N2的終止子為早期poly (A)信號;luciferase在pGL3_Control的終止子為SV40晚期poly (A)信號;正反向引物的位置保證PaEGFP和PaLuc能夠在細(xì)胞內(nèi)成功轉(zhuǎn)錄和翻譯;所述引物具體為:PaEGFP-正向的序列如SEQ ID N0.1所示,PaEGFP-反向的序列如SEQ ID N0.2所示;PaLuc-正向的序列如SEQ ID N0.3所示,PaLuc-反向的序列如SEQ ID N0.4所示; PaGene用AxyPrep? PCR Clean-up試劑盒純化,進(jìn)而用于核轉(zhuǎn)Kasum1-Ι細(xì)胞; DNA濃度以及A260/A280和A260/A230,比值皆≥1.8,用Nano Drop NDlOOO分光光度計測定,以反應(yīng)對應(yīng)核酸的完整性和純度;質(zhì)粒和PaGene亦通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行質(zhì)控; Kasum1-1細(xì)胞與10 μ M等體積的eFluor670混合,并在37°C避光孵育IOmin ;之后加入4-5倍體積預(yù)冷的RPMI1640完全培養(yǎng)基,所述RPMI1640完全培養(yǎng)基為RPMI1640+15%胎牛血清,并且冰浴5min以終止標(biāo)記,之后用RPMI1640完全培養(yǎng)基洗滌3遍,所標(biāo)記細(xì)胞被用于后續(xù)核轉(zhuǎn); 2X 1O 6Ka sum 1-1細(xì)胞被用于核轉(zhuǎn),所述細(xì)胞預(yù)先標(biāo)記或沒有標(biāo)記細(xì)胞增殖染料eFluor670 ; 核轉(zhuǎn)所用溶液為solution V,即kit V,程序?yàn)镻-19 ;核轉(zhuǎn)后,細(xì)胞被轉(zhuǎn)移至37°C預(yù)熱的RPMI1640完全培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng);
對于PaEGFP和pEGFP-N2,每次核轉(zhuǎn)的劑量分別為680ng PaEGFP和2000ng pEGFP_N2,具有相同摩爾數(shù);空E.coli洗脫液亦被用于核轉(zhuǎn),以便檢測樣品中殘留的內(nèi)毒素是否對細(xì)胞有潛在的致死效果;對于PaLuc和pGL3-Control,核轉(zhuǎn)劑量分別為830ng PaLuc和2000ng pGL3-Control,相同摩爾數(shù);與PaGene相同質(zhì)量的對應(yīng)質(zhì)粒亦被用于核轉(zhuǎn),具體為pEGFP_N2 680ng, pGL3-Control830ng ; 進(jìn)而完成PCR擴(kuò)增基因核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞;與核轉(zhuǎn)質(zhì)粒相比,核轉(zhuǎn)PaGene能夠顯著降低Kasum1-1細(xì)胞的死亡率,核轉(zhuǎn)PaGene的Kasum1-1細(xì)胞能夠較好增殖,PaGene在保證核轉(zhuǎn)Kasum1-1細(xì)胞較低死亡率的情況下,轉(zhuǎn)染效率沒有顯著降低或降低很少。
【文檔編號】C12N15/87GK103740760SQ201410010269
【公開日】2014年4月23日 申請日期:2014年1月9日 優(yōu)先權(quán)日:2014年1月7日
【發(fā)明者】吳康, 范小勇, 黃家穎, 趙旭杰 申請人:上海市公共衛(wèi)生臨床中心