技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了一種檢測FFPE樣本DNA含量及完整性的方法。該方法包括以下步驟：S1，根據(jù)FFPE樣本的內(nèi)參基因設(shè)計產(chǎn)物長度為Mbp和Nbp的兩對引物，其中，M<N；S2，取不同降解程度的樣本，使用qPCR方法進行定量，并使用人全基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品采用擴增Mbp產(chǎn)物的擴增引物進行標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制；S3，每個樣本分別采用上述兩對引物進行擴增，根據(jù)Mbp產(chǎn)物的濃度確定DNA的有效濃度，根據(jù)Mbp產(chǎn)物與Nbp產(chǎn)物的CT差值判斷DNA的降解程度；以及S4，根據(jù)樣本的檢測結(jié)果及建庫信息分析結(jié)果確定量化的判定標(biāo)準(zhǔn)。應(yīng)用本發(fā)明的技術(shù)方案，能夠精準(zhǔn)測定FFPE?DNA的有效濃度，并且量化其降解程度。

技術(shù)研發(fā)人員：李宗梅;夏赟;蔣智;師文霞
受保護的技術(shù)使用者：天津諾禾醫(yī)學(xué)檢驗所有限公司
文檔號碼：201710024016
技術(shù)研發(fā)日：2017.01.12
技術(shù)公布日：2017.05.31