基于三螺旋DNA分子開關(guān)檢測(cè)啶蟲脒的方法,屬于分析化學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
啶蟲脒(acetamiprid)屬于氯化煙酰亞胺類高效殺蟲劑,它多用于控制多種農(nóng)產(chǎn)品,如果蔬、茶葉等上的半翅目、鞘翅目及鱗翅目害蟲。啶蟲脒是一種神經(jīng)性殺蟲劑,它通過作用害蟲的中樞神經(jīng)系統(tǒng),達(dá)到殺蟲的效果。研究表明低濃度啶蟲脒對(duì)蜜蜂的長(zhǎng)期記憶有損傷并且會(huì)影響蜜蜂對(duì)刺激的靈敏度。同時(shí)體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)啶蟲脒對(duì)人體外周血淋巴細(xì)胞存在基因毒性以及細(xì)胞毒性,對(duì)哺乳動(dòng)物細(xì)胞存在慢性毒性,表明了它可能誘發(fā)DNA損傷。啶蟲脒在日本、南美洲和歐洲等不同國(guó)家和地區(qū)不同作物中官方規(guī)定的最大殘留劑量(MRL)也不同。鑒于啶蟲脒對(duì)于多數(shù)昆蟲以及其人體細(xì)胞的影響,需要對(duì)其使用量進(jìn)行有效的監(jiān)控,控制其使用量和使用方法從而減少或避免濫用致使對(duì)益蟲和人類造成不良影響。
目前,國(guó)內(nèi)外關(guān)于啶蟲脒的檢測(cè)方法主要有:氣相色譜分析-電子捕獲檢測(cè)器(GC-ECD)的檢測(cè)方法、高效液相色譜法(HPLC)、酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA),以及基質(zhì)固相分散-液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜法。
高效液相色譜法(HPLC)和氣相色譜分析(GC)能滿足分析要求,但所用儀器通常較為昂貴且復(fù)雜,對(duì)操作人員的儀器操作技能要求比較高,與此同時(shí)樣品準(zhǔn)備耗時(shí)較高、成本高;酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)雖然較為快速簡(jiǎn)單,但抗干擾能力差;電化學(xué)法具有反應(yīng)快速,成本較低的優(yōu)點(diǎn),但由于啶蟲脒是一種電化學(xué)惰性分子,故而實(shí)驗(yàn)靈敏度不高。以上所述的GC-ECD和ELISA,雖然這些檢測(cè)方法具有很好的靈敏度,但是它們?nèi)狈^高的實(shí)時(shí)檢測(cè)性能。因此十分有必要進(jìn)一步研究靈敏簡(jiǎn)便、易于操作、選擇性高且適用于實(shí)際樣品快速檢測(cè)的方法。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是基于三螺旋DNA分子開關(guān)檢測(cè)啶蟲脒,利用核酸適體的特異性識(shí)別和熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)的優(yōu)勢(shì)從而提供一種快速檢測(cè)啶蟲脒的方法,達(dá)到快速、簡(jiǎn)單、靈敏的檢測(cè)啶蟲脒的殘留量。
技術(shù)問題:基于三螺旋DNA分子開關(guān)檢測(cè)啶蟲脒的方法主要為下述原理:
在STP的5’和3’端分別標(biāo)記熒光基團(tuán)(carboxyfluorescein,FAM)和猝滅基團(tuán)(black hole quencher 1,BHQ1)。在自然狀態(tài)下,STP序列折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu),標(biāo)記熒光基團(tuán)的5’端和標(biāo)記猝滅基團(tuán)的3’端靠近,由于熒光共振能量轉(zhuǎn)移FAM的熒光會(huì)被猝滅;由于核酸適配體(核酸適配體)的兩端延長(zhǎng)部分可以與STP環(huán)部的堿基序列通過Watson-Crick和Hoogsteen堿基配對(duì)結(jié)合,形成一個(gè)能特異性結(jié)合目標(biāo)物的三螺旋分子開關(guān),STP探針部分修飾的熒光基團(tuán)和猝滅基團(tuán)分離,從而使FAM的熒光恢復(fù);當(dāng)加入目標(biāo)物之后,核酸適配體能夠特異性的識(shí)別目標(biāo)物并與目標(biāo)物作用形成特殊的二級(jí)結(jié)構(gòu),這個(gè)三螺旋DNA將會(huì)解開,STP將從中脫離,恢復(fù)為發(fā)夾結(jié)構(gòu),由于標(biāo)記熒光基團(tuán)的5’端與標(biāo)記猝滅基團(tuán)的3’端靠近,F(xiàn)AM的熒光因被猝滅而減弱。本研究所建立的基于三螺旋DNA分子開關(guān)的傳感方法,通過目標(biāo)物與識(shí)別元件的作用,調(diào)控三螺旋DNA以及信號(hào)探針的構(gòu)型來控制FAM與BHQ1的距離,實(shí)現(xiàn)熒光信號(hào)的變化,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)物啶蟲脒的檢測(cè)。
本發(fā)明的技術(shù)方案:
包括以下步驟:STP的解旋;三螺旋DNA分子開關(guān)的組裝;通過測(cè)定熒光光譜圖觀察STP、核酸適配體、三螺旋DNA分子開關(guān)和目標(biāo)物啶蟲脒體系的反應(yīng);利用目標(biāo)物對(duì)三螺旋DNA分子開關(guān)的熒光作用效果檢測(cè)啶蟲脒并進(jìn)行實(shí)際樣品的檢測(cè)。
(1)STP的解旋
將合成好的引物STP用純凈水溶解成濃度為1μM的溶液,取50μL,在60℃的水浴鍋里水浴10min,取出后冷卻到室溫條件下,待用。
(2)三螺旋DNA分子開關(guān)(THMS)的組裝
離心管中加入1μM解旋的STP溶液50μL、6μM核酸適配體50μL以及10mM的磷酸鹽緩沖溶液400μL(磷酸鹽緩沖溶液中含有300mM NaCl,2.5mM MgCl2和0.1mM EDTA),該混合體系放置在30℃的水浴鍋中水浴20min,取出后冷卻至室溫。
利用RF-5301熒光分光光度儀測(cè)定未解旋的STP以及THMS的熒光信號(hào)強(qiáng)度,熒光信號(hào)分別為F0和F1
(3)通過測(cè)定熒光光譜圖觀察適配體、三螺旋分子開關(guān)和啶蟲脒體系的反應(yīng)
取3個(gè)2.0mL的離心管,編號(hào)為a,b,c,分別依次加入,a管(1μM STP 50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液450μL),b管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液400μL),c管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM啶蟲脒50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL),在480nm的激發(fā)波長(zhǎng)條件下測(cè)定熒光吸收光譜。(注:a管為未解旋的STP,b管為組裝的THMS)
(4)利用目標(biāo)物對(duì)三螺旋DNA分子開關(guān)的熒光作用效果檢測(cè)啶蟲脒所用體系的制備
向含有1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL的混合體系中,分別加入不同濃度的啶蟲脒標(biāo)準(zhǔn)溶液,室溫條件下反應(yīng)12min后,測(cè)定該體系的熒光信號(hào)強(qiáng)度,THMS的熒光信號(hào)強(qiáng)度將隨著啶蟲脒濃度的不同而發(fā)生變化。根據(jù)F1-F2與啶蟲脒的濃度建立標(biāo)準(zhǔn)曲線。(F1和F2分別為加入啶蟲脒之前和之后的熒光信號(hào)強(qiáng)度)
所用的啶蟲脒標(biāo)準(zhǔn)品濃度依次為:1,2,4,6,8,10,12μM(終濃度分別為100,200,400,600,800,1000,1200nM)。本發(fā)明中,啶蟲脒的檢出限為9.12nM,線性范圍為1-12nM。
(5)選擇性實(shí)驗(yàn)的測(cè)定:
取9個(gè)2.0mL的離心管,編號(hào)為a~i,分別依次加入,a~i管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM待測(cè)物質(zhì)50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL,待測(cè)物質(zhì)依次為吡蟲啉、毒死蜱、2,4-D,草銨膦,甲胺磷,西維因,莠去津,尼古丁和啶蟲脒),在480nM的激發(fā)波長(zhǎng)條件下測(cè)定熒光吸收光譜。
(6)干擾性實(shí)驗(yàn)的測(cè)定:
取10個(gè)2.0mL的離心管,編號(hào)為1-10,分別依次加入,1管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM啶蟲脒50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL),2~10管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM啶蟲脒50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL,除此之外分別加入抗壞血酸(0.18mol·L-1);Na+(0.26mol·L-1);Mg2+(0.08mol·L-1);Ca2+(0.42mol·L-1);Fe3+(3.20mol·L-1);K+(0.44mol·L-1);4-羥基苯甲酸(0.20mol·L-1);龍膽酸(0.18mol·L-1);沒食子酸(0.26mol·L-1)),在480nm的激發(fā)波長(zhǎng)條件下測(cè)定熒光吸收光譜。
(7)實(shí)際樣品的檢測(cè):取大白菜進(jìn)行實(shí)際樣品的檢測(cè)
稱取5g(精確到0.01g)大白菜勻漿,置于30mL具塞離心管中,加入5mL乙酸-乙腈溶液,搖勻,超聲提取15min,加入5g氯化鈉,蓋上塞子,震蕩5min,4000r/min離心5min,旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)至干,溶解在2mL娃哈哈純凈水中,水溶液用于實(shí)際樣品的分析;分析中,將提取的水溶液稀釋20倍,進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。如權(quán)利要求4所述的方法,加入不同濃度的啶蟲脒標(biāo)準(zhǔn)溶液進(jìn)行測(cè)定。
本發(fā)明的有益效果:
本發(fā)明組裝了三螺旋NDA分子開關(guān),并建立了一個(gè)簡(jiǎn)單、快速、靈敏的基于熒光共振能量轉(zhuǎn)移原理的方法,能夠快速檢測(cè)啶蟲脒,為今后的監(jiān)管提供了方便。
附圖說明
圖1不同體系的熒光光譜圖:a,STP;b,STP-核酸適配體;c,STP-核酸適配體-啶蟲脒;STP 1μM 50μL,核酸適配體6μM 50μL,啶蟲脒2μM 50μL;
圖2含有不同濃度的啶蟲脒(1,2,4,6,8,10,12μM)的三螺旋DNA分子開關(guān)體系的熒光光譜圖以及以該體系為參照的啶蟲脒標(biāo)準(zhǔn)曲線圖。
圖3三螺旋DNA分子開關(guān)體系對(duì)不同種農(nóng)藥的熒光信號(hào)強(qiáng)度響應(yīng)圖譜:a~i管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM待測(cè)物質(zhì)50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL,待測(cè)物質(zhì)依次為吡蟲啉、毒死蜱、2,4-D,草銨膦,甲胺磷,西維因,莠去津,尼古丁和啶蟲脒)
圖4三螺旋DNA分子開關(guān)體系對(duì)白菜提取液中干擾物質(zhì)的熒光信號(hào)強(qiáng)度響應(yīng)圖譜:1管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM啶蟲脒50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL),2~10管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM啶蟲脒50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL,除此之外分別加入抗壞血酸(0.18mol·L-1);Na+(0.26mol·L-1);Mg2+(0.08mol·L-1);Ca2+(0.42mol·L-1);Fe3+(3.20mol·L-1);K+(0.44mol·L-1);4-羥基苯甲酸(0.20mol·L-1);龍膽酸(0.18mol·L-1);沒食子酸(0.26mol·L-1))
圖5實(shí)際樣品白菜提取液中含有不同濃度的啶蟲脒(1,2,4,6,8,10μM)的三螺旋DNA分子開關(guān)體系的熒光光譜圖以及以該體系為參照的實(shí)際樣品工作曲線圖。
具體實(shí)施方式
STP的解旋
材料/試劑:STP由生工生物(上海)試劑公司合成
方法:將合成好的引物STP用純凈水溶解成濃度為1μM的溶液,取50μL,在60℃的水浴鍋里水浴10min,取出后冷卻到室溫條件下,待用。
結(jié)果:發(fā)夾結(jié)構(gòu)的STP打開后,具有一定強(qiáng)度的熒光信號(hào)
三螺旋DNA分子開關(guān)(THMS)的組裝
材料/試劑:STP、啶蟲脒核酸適配體:由生工生物(上海)試劑公司合成;NaCl,MgCl2:購(gòu)買于生工生物(上海)試劑公司;EDTA:購(gòu)買于西格瑪奧德里奇試劑公司
方法:離心管中加入1μM解旋的STP溶液50μL、6μM的啶蟲脒適配體50μL以及10mM的磷酸鹽緩沖溶液400μL(磷酸鹽緩沖溶液中含有300mM NaCl,2.5mM MgCl2和0.1mM EDTA),該混合體系放置在30℃的水浴鍋中水浴20min,取出后冷卻至室溫。
結(jié)果:經(jīng)測(cè)定未解旋的STP和組裝好的THMS的熒光信號(hào)強(qiáng)度F0和F1可以發(fā)現(xiàn),F(xiàn)1遠(yuǎn)大于F0,由此說明,核酸適配體與STP環(huán)部堿基配對(duì)結(jié)合,形成一個(gè)能特異性結(jié)合目標(biāo)物的三螺旋分子開關(guān),STP探針部分修飾的熒光基團(tuán)和猝滅基團(tuán)分離,從而使FAM的熒光恢復(fù)。
由于實(shí)驗(yàn)所用的體系受到啶蟲脒適配體鏈長(zhǎng)度的影響,所以需要研究適配體鏈長(zhǎng)度對(duì)反應(yīng)體系的影響。材料/試劑:不同鏈長(zhǎng)度的啶蟲脒核酸適配體:由生工生物(上海)試劑公司合成
方法:取7個(gè)2.0mL的離心管,編號(hào)為a~g,分別加入:a管(1μM STP 50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液450μL),b管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體1 50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液400μL),c管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體2 50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液400μL),d管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體3 50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液400μL),e管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體4 50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液400μL),f管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體3 50μL,2μM啶蟲脒50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL),g管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體4 50μL,2μM啶蟲脒50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL),b~g管中需要先將STP在60℃的水浴鍋里水浴10min,取出后冷卻到室溫,再加入核酸適配體和磷酸鹽緩沖溶液,混合體系放置在30℃的水浴鍋中水浴20min,取出后冷卻至室溫,測(cè)定七支管的熒光信號(hào)強(qiáng)度。
結(jié)果:實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),啶蟲脒核酸適配體4可以作為最優(yōu)的適配體
除核酸適配體鏈長(zhǎng)度外,核酸適配體的濃度同樣會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)體系產(chǎn)生一定的影響,因此需要研究適配體的濃度的作用效果。
材料/試劑:啶蟲脒核酸適配體:由生工生物(上海)試劑公司合成
方法:取7個(gè)2.0mL的離心管,標(biāo)號(hào)為a~g,分別加入:a管(1μM STP 50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液450μL),b~g管(1μM STP 50μL,核酸適配體4 50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液400μL,核酸適配體4的濃度分別為1,2,4,6,8和10μM),b~g管中需要先將STP在60℃的水浴鍋里水浴10min,取出后冷卻到室溫條件下,再加入不同濃度的核酸適配體溶液和緩沖溶液,混合體系放置在30℃的水浴鍋中水浴20min,取出后冷卻至室溫,測(cè)定七支管的熒光信號(hào)強(qiáng)度。
結(jié)果:實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),核酸適配體4的濃度為6μM(終濃度為600nM)為最優(yōu)的適配體濃度
除此之外,緩沖溶液的pH也會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)產(chǎn)生作用效果,因此需要對(duì)pH條件進(jìn)行優(yōu)化與選擇
材料/試劑:磷酸一氫鈉,磷酸氫二鈉,NaCl,MgCl2:購(gòu)買于生工生物(上海)試劑公司;EDTA:購(gòu)買于西格瑪奧德里奇試劑公司
方法:取14個(gè)2.0mL的離心管,均分為兩組,分別標(biāo)號(hào)為a1~g1和a2~g2,先在a1~g1管中分別加入1μM STP50μL和pH為5.5~8.5的磷酸鹽緩沖溶液450μL(pH間隔為0.5);在a2~g2管中先分別加入1μM STP 50μL,于60℃的水浴鍋里水浴10min后,再分別加入6μM核酸適配體4 50μL和pH為5.5~8.5的磷酸鹽緩沖溶液400μL,混合體系放置在30℃的水浴鍋中水浴20min,取出后冷卻至室溫,測(cè)定兩組的熒光信號(hào)強(qiáng)度,F(xiàn)0和F1分別為加入適配體之前和之后的熒光信號(hào)強(qiáng)度值。
結(jié)果:通過計(jì)算F1/F0可以發(fā)現(xiàn),pH為6.5的磷酸鹽緩沖溶液為最優(yōu)的pH實(shí)驗(yàn)條件
該方法用于啶蟲脒檢測(cè):
材料/試劑:三螺旋DNA分子開關(guān);啶蟲脒購(gòu)自西格瑪奧德里奇試劑公司;大白菜購(gòu)自于當(dāng)?shù)夭耸袌?chǎng)
方法:
(1)利用三螺旋DNA分子開關(guān)檢測(cè)啶蟲脒:向含有1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL的混合體系中,分別加入不同濃度的啶蟲脒標(biāo)準(zhǔn)溶液,室溫條件下反應(yīng)12min后,測(cè)定該體系的熒光信號(hào)強(qiáng)度,THMS的熒光信號(hào)強(qiáng)度將隨著啶蟲脒濃度的不同而發(fā)生變化。
(2)所用的啶蟲脒標(biāo)準(zhǔn)品濃度依次為:1,2,4,6,8,10,12μM,通過測(cè)定熒光信號(hào)強(qiáng)度F1和F2,根據(jù)F1-F2與啶蟲脒的濃度建立標(biāo)準(zhǔn)曲線。F1為加入目標(biāo)物啶蟲脒之前的熒光信號(hào)值,F(xiàn)2為加入目標(biāo)物啶蟲脒之后的熒光信號(hào)值。
(3)實(shí)際樣品的檢測(cè):取大白菜進(jìn)行實(shí)際樣品的檢測(cè)
稱取5g(精確到0.01g)大白菜勻漿,置于30mL具塞離心管中,加入5mL乙酸-乙腈溶液,搖勻,超聲提取15min,加入5g氯化鈉,蓋上塞子,震蕩5min,4000r/min離心5min,旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)至干,溶解在2mL娃哈哈純凈水中,水溶液用于實(shí)際樣品的分析;分析中,將提取的水溶液稀釋20倍,進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。如權(quán)利要求4所述的方法,加入不同濃度的啶蟲脒標(biāo)準(zhǔn)溶液進(jìn)行測(cè)定。同時(shí),將本實(shí)驗(yàn)方法與國(guó)標(biāo)中的啶蟲脒檢測(cè)方法進(jìn)行對(duì)照。
(4)實(shí)驗(yàn)體系的驗(yàn)證:
(a).選擇性實(shí)驗(yàn):
取9個(gè)2.0mL的離心管,編號(hào)為a~i,分別依次加入,a~i管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM待測(cè)物質(zhì)50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL,待測(cè)物質(zhì)依次為吡蟲啉、毒死蜱、2,4-D,草銨膦,甲胺磷,西維因,莠去津,尼古丁和啶蟲脒),在480nm的激發(fā)波長(zhǎng)條件下測(cè)定熒光信號(hào)強(qiáng)度F1和F2,F(xiàn)1和F2分別為加入待測(cè)物質(zhì)之前和之后的熒光信號(hào)值。
(b).干擾性實(shí)驗(yàn):
取10個(gè)2.0mL的離心管,編號(hào)為1-10,分別依次加入,1管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM啶蟲脒50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL),2~10管(1μM STP 50μL,6μM核酸適配體50μL,2μM啶蟲脒50μL,pH 6.5的磷酸鹽緩沖液350μL,除此之外分別加入抗壞血酸(0.18mol·L-1);Na+(0.26mol·L-1);Mg2+(0.08mol·L-1);Ca2+(0.42mol·L-1);Fe3+(3.20mol·L-1);K+(0.44mol·L-1);4-羥基苯甲酸(0.20mol·L-1);龍膽酸(0.18mol·L-1);沒食子酸(0.26mol·L-1)),在480nm的激發(fā)波長(zhǎng)條件下測(cè)定熒光信號(hào)強(qiáng)度F1和F2,F(xiàn)1和F2分別為加入啶蟲脒之前和之后的熒光信號(hào)值。
結(jié)果:根據(jù)F1-F2與啶蟲脒的濃度建立標(biāo)準(zhǔn)曲線,啶蟲脒的檢出限為9.12nM,線性范圍為1-12nM。
本實(shí)驗(yàn)方法和國(guó)標(biāo)液質(zhì)方法檢測(cè)啶蟲脒的加標(biāo)回收試驗(yàn)結(jié)果見下表