專利名稱::用于鑒定可調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法和靶的制作方法用于鑒定可調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法和靶發(fā)明領域本發(fā)明涉及鑒定靶基因、蛋白、表達調(diào)節(jié)子、受體、蛋白產(chǎn)物受體的方法,以及用于調(diào)節(jié)、診斷、以及監(jiān)控鼻病毒感染的化合物。
背景技術:
:感冒癥狀主要由200種不同的病毒引起,其中大約30%至50%的感冒由鼻病毒引起。它們也是引起哮喘急性發(fā)作和慢性阻塞性肺部疾病(C0PD)的最常見的病原體。然而,鼻病毒觸發(fā)或加劇氣道疾病的機制仍未得到充分的闡明。感冒感染是如此常見以至于據(jù)估計成人可能每年患2至3次感冒,而兒童可能每年患5至7次感冒。在美國,50%的就醫(yī)情況與呼吸道疾病有關。感冒造成50%的工作和學業(yè)短期缺席。感冒的平均持續(xù)時間為7至10天。用于減輕癥狀、縮短感冒持續(xù)時間和降低感冒發(fā)生率的有效治療方法已經(jīng)成為難于達到的目標。市售的感冒治療劑對一些感冒癥狀有效,但對其他癥狀無效。鼻病毒(RV)是小的不包膜的包含正鏈RNA的病毒,屬于小核糖核酸病毒家族。RV可通過氣溶膠或直接接觸傳播。鼻病毒感染是感冒的主要原因,可是我們對感染導致疾病的機制的了解仍然有限。感染的主要位點是鼻黏膜。RV粘附到呼吸上皮并局部擴散至鼻咽,通過鼻進入體內(nèi)。多數(shù)RV病毒株通過人RV受體,即細胞間粘附分子1(ICAM-1)進入上皮細胞。RV也將ICAM-1用于后來的細胞感染期間的病毒脫殼。一旦進入細胞,病毒開始復制過程,并且在8至10小時內(nèi)發(fā)生病毒脫落。RV大量脫落,每毫升鼻洗液中存在1百萬個感染性的病毒粒子。病毒脫落可能在患者發(fā)覺感冒癥狀前幾天發(fā)生,峰值出現(xiàn)在患病2至7天時,并且可持續(xù)3至4周。感冒發(fā)病機理非常復雜。.已經(jīng)確定,培養(yǎng)的人氣道上皮細胞對人鼻病毒感染有反應,它們產(chǎn)生多種在疾病發(fā)病機理中起作用的前炎性分子和宿主防御分子。因此,專家的共識是宿主反應,而不是病毒,引起大多數(shù)感冒癥狀。已經(jīng)對炎癥介質(zhì)和感冒癥狀之間的關系進行了一些詳細的研究。感冒癥狀由多個炎性途徑作用產(chǎn)生。呼吸道中對病毒的局部炎性反應可能導致流鼻弟、鼻充血、打噴噢和咽喉刺激。不發(fā)生對鼻上皮細胞的損傷,并且炎癥由產(chǎn)生的細胞因子和其它介質(zhì)介導。這種前炎性和抗炎性細胞因子的復合混合物可早在感染后3至8小時內(nèi)產(chǎn)生。隨著時間的過去,細胞因子含量隨感冒癥狀的發(fā)展進程而增加或減少?;趩畏肿臃椒ǖ母忻爸委焺┎荒茏钄嗨羞@些途徑,僅僅能減輕部分癥狀。這是一個在其中產(chǎn)品能用于影響炎癥介質(zhì)產(chǎn)生以及隨后的感冒癥狀的區(qū)域。到患病3至5天時,由于分葉核白細胞響應于趨化因子(如白介素-8)已移至感染位點,鼻弟可能變得私膿?;疾∑陂g鼻黏膜纖毛傳送明顯減少,并且可能減弱數(shù)周。分泌型免疫球蛋白A和血清抗體介入疾病消退過程并防止再感染。因此,對鑒定感冒過程調(diào)節(jié)子的需要始終存在。然而,與鑒定用于治療感冒的化合物相關的一個問題是缺乏好的篩選靶標和好的用于鑒定此類化合物的篩選方法。當前基因組學和生物信息學領域的迅速發(fā)展使得人們能夠更全面的評估和更深入的了解與疾病相關的基本過程。發(fā)明概述本發(fā)明涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,該方法包括使至少一種化合物接觸靶,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的蛋白、由表I基因編碼的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的蛋白受體、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;確定所述化合物是否與靶結(jié)合;并且鑒定那些與靶結(jié)合的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,該方法包括使至少一種化合物接觸靶,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的表II中鑒定的蛋白、由表I基因編碼的表II中鑒定的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的表II中鑒定的蛋白受體、由表I基因編碼的表II中鑒定的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的表II中鑒定的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;確定所述化合物是否與靶結(jié)合;并且鑒定那些與耙結(jié)合的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,該方法包括將至少一種化合物接觸包含靶的鼻病毒感染模型體系,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的蛋白、表I基因的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的蛋白受體、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;進一步確定所述化合物是否調(diào)節(jié)鼻病毒感染模型體系中的鼻病毒感染;并且鑒定那些在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,該方法包括使至少一種化合物接觸靶,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的表II中筌定的蛋白、由表I基因編碼的表II中鑒定的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的表II中鑒定的蛋白受體、由表I基因編碼的表II中鑒定的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的表II中鑒定的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;確定所述化合物是否與耙結(jié)合;進一步確定所述化合物是否調(diào)節(jié)鼻病毒感染模型體系中的鼻病毒感染;并且鑒定那些在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一匕合物的方法,該方法包括使至少一種化合物接觸包含靶的鼻病毒感染模型體系,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的蛋白、表I基因的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的蛋白受體、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;進一步確定所述化合物是否在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)對鼻病毒感染的響應;并且鑒定那些在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)對鼻病毒感染響應的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法將至少一種化合物接觸表達由表I基因編碼和由表II中鑒定的蛋白的細胞群;確定并比較接觸所述化合物的細胞群中的蛋白活性水平與不接觸所述化合物的細胞群中的蛋白活性水平;并且鑒定那些與不接觸所述化合物的細胞群中的蛋白活性相比,在接觸所述化合物的細胞群中的調(diào)節(jié)蛋白活性的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,該方法包括將至少一種化合物接觸表達表I中鑒定的蛋白的細胞群;確定并比較接觸所述化合物的細胞群中的蛋白活性水平與不接觸所述化合物的細胞群中的蛋白活性水平;并且鑒定那些與不接觸所述化合物的細胞群中的蛋白活性相比,在接觸所述化合物的細胞群中的調(diào)節(jié)蛋白活性的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,該方法包括將至少一種化合物接觸表達由表I基因編碼和由表II中鑒定的蛋白的細胞群;確定并比較接觸所述化合物的細胞群中的蛋白表達水平與不接觸所述化合物的細胞群中的蛋白表達水平;并且鑒定那些與不接觸所述化合物的細胞群中的蛋白表達相比,在接觸所述化合物的細胞群中的調(diào)節(jié)蛋白表達的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,該方法包括將至少一種化合物接觸表達表I中鑒定的蛋白的細胞群;確定并比較接觸所述化合物的細胞群中的蛋白表達水平與不接觸所述化合物的細胞群中的蛋白表達水平;并且鑒定那些與不接觸所述化合物的細胞群中的蛋白表達相比,在接觸所述化合物的細胞群中的調(diào)節(jié)蛋白表達的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,該方法包括將至少一種化合物接觸表達表I中鑒定的基因的細胞群;確定并比較接觸所述化合物的細胞群中的基因表達水平與不接觸所述化合物的細胞群中的基因表達水平;并且鑒定那些與不接觸所述化合物的細胞群中的基因表達相比,在接觸所述化合物的細胞群中的調(diào)節(jié)基因表達的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及診斷鼻病毒感染的方法,該方法包括確定生物樣本中一種或多種靶的表達譜,所述靶選自涉及生物樣本中表I和表II中鑒定12的鼻病毒感染的靶;或測量生物樣本中表II中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種蛋白的表達水平或活性;比較生物樣本中鑒定的一種或多種靶的表達水平與來自對照樣本或數(shù)據(jù)庫的一種或多種靶的表達水平,或比較來自樣本的蛋白的表達水平或活性分布與來自對照樣本或數(shù)據(jù)庫的蛋白的表達水平或活性分布,其中與對照物水平的顯著差異指示鼻病毒感染的癥狀發(fā)展。本發(fā)明還涉及診斷鼻病毒感染的方法,該方法包括制備表I中鑒定的涉及鼻病毒感染的一種或多種基因的基因表達i普;或測量生物樣本中表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種蛋白的表達水平或活性;比較來自樣本的基因的表達水平與來自對照樣本或數(shù)據(jù)庫的基因的表達水平,或比較來自樣本的蛋白的表達水平或活性與來自對照樣本或數(shù)據(jù)庫的蛋白的表達水平或活性,其中與對照物水平的顯著差異指示鼻病毒感染的癥狀發(fā)展。本發(fā)明還涉及監(jiān)控鼻病毒感染進程的方法,該方法包括(a)確定生物樣本中表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種基因的基因表達譜;或制備來自合適鼻病毒感染模型體系的生物樣本中的表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種蛋白的蛋白表達譜或蛋白活性分布;(b)在實施治療方案后的合適時間之后制備類似于步驟(a)的表達譜或活性分布;在治療期間重復步驟(b)并評估數(shù)據(jù)以監(jiān)控鼻病毒感染的進程。本發(fā)明還涉及監(jiān)控鼻病毒感染進程的方法,該方法包括(a)制備生物樣本中表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種基因的基因表達譜;或制備來自合適的鼻病毒感染模型體系的表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種蛋白的蛋白表達譜或蛋白活性分布;(b)對受試者施用治療方案;(c)在實施治療方案后的合適時間之后制備類似于步驟(a)的表達i普或活性分布;(d)比較干預前后的表達譜或活性分布;并且在治療期間重復步驟(b)、(c)和(d)并評估數(shù)據(jù)以監(jiān)控鼻病毒感染的進程。本發(fā)明還涉及監(jiān)控具有鼻病毒感染癥狀發(fā)展的患者的疾病治療或進程的方法,該方法包括(a)確定生物樣本中表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種基因的基因表達譜;或制備受試者生物樣本中的表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種蛋白的蛋白表達譜或蛋白活性分布;(b)對受試者施用治療方案;(c)在實施治療方案后的合適時間之后制備來自受試者生物樣本的蛋白的類似于步驟(a)的表達譜或活性分布;(d)比較治療前后的表達語或活性分布;并且在治療或疾病期間重復步驟(b)、(c)和(d)并評估數(shù)據(jù)以監(jiān)控治療效果或疾病進程。本發(fā)明還涉及監(jiān)控具有鼻病毒感染癥狀發(fā)展的患者的疾病治療或進程的方法,該方法包括(a)制備表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種基因的基因表達譜;或制備來自受試者的表II中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種蛋白的蛋白表達譜或蛋白活性分布;(b)對受試者施用治療方案;(c)在實施治療方案后的合適時間之后制備來自受試者細胞或組織樣本的蛋白的類似于步驟(a)的表達譜或活性分布;(d)比較治療前后的表達譜或活性分布;并且在治療或疾病期間重復步驟(b)、(c)和(d)并評估數(shù)據(jù)以監(jiān)控治療效果或疾病進程。本發(fā)明還涉及藥用組合物,所述組合物包含安全和有效量的至少一種化合物,所述化合物通過以下方法鑒定使至少一種化合物接觸靶,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的蛋白、表I基因的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的蛋白受體、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;確定所述化合物是否與靶結(jié)合;并且鑒定那些與靶結(jié)合的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物;和一種藥用的載體。本發(fā)明還涉及藥用組合物,所述組合物包含表I中鑒定的、涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的安全和有效量的蛋白激動劑或拮抗劑;和一種藥用的載體。本發(fā)明還涉及用于在需要此類調(diào)節(jié)的受試者中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的方法,該方法包括鑒定需要調(diào)節(jié)鼻病毒感染的受試者;并且給受試者施用安全和有效量的化合物,所述化合物通過以下方法鑒定使至少一種化合物接觸靶,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的蛋白、表I基因的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的蛋白受體、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;確定所述化合物是否與靶結(jié)合;并且鑒定那些與靶結(jié)合的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物;或通過以下方法鑒定將至少一種化合物接觸包含耙的鼻病毒感染模型體系,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的蛋白、表I基因的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的蛋白受體、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;進一步確定所述化合物是否調(diào)節(jié)鼻病毒感染模型體系中的鼻病毒感染;并且鑒定那些在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本發(fā)明還涉及用于在需要此類調(diào)節(jié)的受試者中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的方法,該方法包括鑒定需要調(diào)節(jié)鼻病毒感染的受試者;給受試者施用安全和有效量的化合物,所述化合物是由表I鑒定的基因編碼的蛋白的激動劑、拮抗劑、和活化劑或抑制劑。在表II中鑒定了能由表I中鑒定的基因編碼的蛋白、表達調(diào)節(jié)子、蛋白產(chǎn)物、蛋白受體的非限制性實例。發(fā)明詳述發(fā)明的分子本發(fā)明包括多種分子DNA基因;RM轉(zhuǎn)錄物;調(diào)節(jié)它們的表達的核酸如反義分子、siRNA、小RNA;可用于檢測它們的分子如DNA或RNA探針;可用于鑒定和分離相關基因的引物;和蛋白質(zhì)與多肽,以及抑制或活化它們的化合物。因此,本文使用術語分子描述本發(fā)明的所有或一些實體。應根據(jù)它被使用的上下文對它進行解釋。通過轉(zhuǎn)錄(例如通過控制啟動、RNA前體供應、RNA加工)或翻譯控制改變不同基因的表達可實現(xiàn)多種生物學功能。例如,基本的生物過程如細胞周期、細胞分化和細胞凋亡,其特征常常在于基因組表達水平和它們的翻譯產(chǎn)物含量的差異?;虮磉_的改變也可能與發(fā)病機理有關。例如,功能性肺瘤抑制子基因的表達不足或癌基因/原癌基因的過度表達可能導致腫瘤發(fā)生或細胞增生性生長。因此,特定基因或基因家族的表達水平的改變可作為多種疾病存在和發(fā)展的信號。監(jiān)控基因表達的改變在藥物篩選中也可以提供某些益處。篩選藥物時經(jīng)常只針對它與主要靶相互作用的能力,而不考慮藥物對細胞的其他作用。此類其他作用常常在完全哺乳動物中引起毒性反應,這阻止了潛在藥物的用途。本發(fā)明人已經(jīng)檢查了鼻病毒感染的多個模型以鑒定鼻病毒感染期間的基因表達的總體變化?;虮磉_的總體變化,也稱為表達譜,也提供了用于鼻病毒感染治療的新型靶。它們也可提供用于診斷的標記物以及用于監(jiān)控疾病狀態(tài)、疾病進程、毒性、藥物功效、和藥物代謝的標記物。表達譜可用于鑒定在不同條件下差異表達的基因。此外,本發(fā)明也可用于鑒定差異表達的基因家族。如本文所用,"基因家族"包括但不限于由本文保藏編號鑒定的特定基因以及相關序列。相關序列可以是例如與已鑒定序列在核苷酸含量或氨基酸含量上具有高度序列同源性的序列。高度序列同源性被認為是在核苷酸含量上與已鑒定的序列有至少約65%的序列同一性;優(yōu)選地至少約80%,或更優(yōu)選地至少約85%,或更優(yōu)選地至少約90°/。,或更優(yōu)選地至少約95%,或更優(yōu)選地至少約98%或更高的序列同一性。關于氨基酸同一性,高度同源性被認為是與已鑒定的序列有至少約50%的序列同一性,或更優(yōu)選地至少約75%,或更優(yōu)選地至少約85%,或更優(yōu)選地至少約95%,或更優(yōu)選地至少約98%或更高的序列同一性。用于確定不同序列間同源性和同一性的方法是本領域已知的,其中一些方法將在下文中描述。具體地講,相關的序列包括來自不同生物的同源物和直向同源物。例如,假如已鑒定的基因來自非人類的哺乳動物,基因家族將包基因是人類基因,基因家族將包括來自其他生物的同源基因。本領域的技術人員將認識到同源基因可以是不同的長度,并且可以包括具有與特定的已鑒定序列序列同一性不同的區(qū)域。本領域技術人員也將認識到來自那些序列列表之外的物種(尤其是脊推動物)的基因和蛋白也能用于本發(fā)明。此類物種包括但不限于大鼠、豚鼠、兔子、狗、豬、山羊、牛、猴子、黑猩猩、綿羊、倉鼠和斑馬魚。本16領域的技術人員將進一步認識到通過使用來自已知物種的序列的探針,與已知序列同源的cDNA或基因組序列能夠通過已知的克隆方法從相同或替"變體"是指相似序列。例如,保守變體可包括那些因為遺傳密碼簡并而編碼本發(fā)明其中一種多肽的氨基酸序列的序列。天然存在的等位變體和剪接變體可使用已知技術進行鑒定,例如使用聚合酶鏈反應(PCR)、單核苷酸多態(tài)性(SNP)分析、和雜交技術進行鑒定。為了分離直向同源物和同源物,一般利用由特異序列、序列長度、鳥嘌呤+胞嘧啶(GC)含量和其他參數(shù)所規(guī)定的嚴謹雜交條件。變體核苷酸序列也包括合成來源的核苷酸序列,例如使用定點誘變獲得的核苷酸序列。變體可包含來自單獨的基因組位置的序列或與其他序列結(jié)合的附加序列。本方面的分子也包括平截的和/或突變的蛋白,其中無需配體結(jié)合或信號轉(zhuǎn)導的蛋白區(qū)域已經(jīng)被刪除或修飾。同樣的,它們也可以發(fā)生突變以改變配體結(jié)合或信號轉(zhuǎn)導活性。此類突變可涉及非保守型突變、刪除、或添加氨基酸或蛋白結(jié)構(gòu)域。變體蛋白可以保留也可以不保留生物活性。此類變體可由例如遺傳性多態(tài)現(xiàn)象或由人為操縱產(chǎn)生。本發(fā)明也包括本發(fā)明的基因和蛋白的片段和變體。"片段"是指一部分核苷酸或蛋白序列。片段可保留天然蛋白的生物活性。核苷酸序列片段也可用作雜交探針和引物,或用于調(diào)節(jié)基因表達,例如調(diào)節(jié)反義基因、siRNA或小RNA的表達。也可通過分離一部分核苦酸序列、表達所分離的序列(例如通過重組表達)、和評估所編碼蛋白的活性來制備生物活性部分。也設想了將蛋白或蛋白片段與不同的多肽融合。使用已知方法,本領域的技術人員將能夠制造融合蛋白,融合蛋白不同于天然形式的蛋白,將是有用的。例如,融合對象可以是信號(或前導)多肽序列,它在翻譯的同時或在翻譯后引導蛋白從其合成位點轉(zhuǎn)移到另一位點(例如酵母a-因子前導肽)。作為另外一種選擇,也可將其加入以利于本發(fā)明蛋白的純化或鑒定(例如多聚組氨酸poly-His、Flag肽、或熒光蛋白)。也可通過多種方法制備本發(fā)明的分子,所述方法包括但不限于本領域已知的克隆、基于PCR的克隆、定點誘變、誘變、DNA改組、和核苷酸序歹'J文造。參見侈寸^口MolecularCloning:ALaboratoryManual,第2片反,Sambrook,Fristch,和Maniatis(1989),ColdSpringHarborLaboratoryPress;CurrentProtocolsinMolecularBiology,Ausubel等人,(1996)和更新資料,JohnWiley和Sons;MethodsinMolecularBiology(series),巻158和182。HumanaPress;PCRProtocols:AguidetoMethodsandApplications,Innis,Gelfand,Sninsky,和White,1990,AcademicPress。重組多核苦酸文庫也可由一組相關序列生成,所述相關序列包括具有基本一致的序列同一性并且可以進行體外或體內(nèi)重組的區(qū)域。例如,使用此方法,編碼受關注結(jié)構(gòu)域的序列基序可以在本發(fā)明的基因和其他已知基因之間進行改組以獲得編碼具有受關注的改性蛋白的新基因,例如顯性負突變(0hba等人(1998)Mol.Cell.Biol.18:51199-51207,Matsumoto等人(2001)J.Biol.Chem.276:14400-14406)。"百分比同一性,,或"序列同一性,,可通過在比較窗口上比對兩個序列或亞序列進行確定,其中比較窗口中的序列部分可任選地與參比序列(它可包括添加或刪除)相比包括添加或刪除(即間隙)以達到最佳的兩序列比對效果。百分比通過以下方法進行計算確定兩序列中具有相同殘基(例如,核酸堿基或氨基酸)的位置的數(shù)目,將該匹配位置的數(shù)目除以比較窗口中位置的總數(shù),并且所得結(jié)果乘以100來獲得序列同一性的百分比。序歹寸同一性百分比可通過Smith&Waterman,Adv.Appl.Math.2:482-485(1981)的局部同源性算法進行計算;或通過Needleman&Wunsch,J.Mol.Biol.48:443-445(1970)的同源比對算法進行計算;用人工或計算機具體實施這些算法(GAP&BESTFIT,GCGWisconsinSoftwarePackage,GeneticsComputerGroup;多種BLAST,來自NationalCenterforBiotechnologyInformation(NCBI),NIH)。確定同源性或序列同一性的優(yōu)選方法是通過BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool,基本的基于局部對準的搜索工具)分析,該分析使用由程序blastp、blastn、blastx、tblastn和tblastx(Karlin等人(1990)Proc.Natl.Acad.Sci.USA87,2264-2268和Altschul,(1993)J.Mol.Evol.36,290-300)所用的算法,它們被定制用于序列相似性搜索。如本文所述,這些不同的基因和蛋白、它們的等位基因和其他變體(例如剪接變體)、它們來自其他物種的同源物和直向同源物、以及不同的片段和突變型可表現(xiàn)出序列變異。需要進行比較的序列的長度可小于全長序列的長度。除非另外指明,如本文所用,術語"表達調(diào)節(jié)子"是指上調(diào)或下調(diào)基因表達的蛋白、DNA或其他分子。除非另外指明,如本文所用,術語"受體"是指由表I中基因編碼的蛋白受體(例如CCR5是CCL5的受體)。除非另外指明,如本文所用,術語"蛋白產(chǎn)物"是指由表I中基因編碼的蛋白酶生成的或動員的產(chǎn)物(例如PGE2是基因PTGE2編碼的蛋白C0X的"蛋白產(chǎn)物")。除非另外指明,如本文所用,術語"蛋白產(chǎn)物受體"是指上文定義的蛋白產(chǎn)物的受體(例如EP2受體用于蛋白產(chǎn)物PGE2)如本文所用,術語"哺乳動物"指人、狗、貓、馬、牛、綿羊、豬、兔子、豚鼠、倉鼠、沙鼠、雪貂、'動物園哺乳動物、小鼠等。除非另外指明,如本文所用,術語"結(jié)合"是指與任何蛋白或兩種或多種蛋白的復合物的選擇性相互作用,所述蛋白復合物可包括其他非蛋白分子;受到刺激后發(fā)生的細胞或生物的狀態(tài)或活性的改變;與任何核酸分子的選擇性相互作用;在轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)中起到作用;與細胞外或細胞內(nèi)信使結(jié)合以啟動細胞活性的改變;以及與另一分子上的一個或多個位點發(fā)生選擇性的,常??苫瘜W計量的,分子相互作用。細胞系、載體、克隆、以及重組分子的表達可制備本發(fā)明的分子用于多種用途,包括但不限于用于純化蛋白或核酸產(chǎn)品、用于生成抗體、用作篩選分析中的試劑、以及用作藥物組合物。使用分離基因或蛋白可完成一些實施方案,然而其他實施方案可能需要使用表達它們的細胞。分子來源于細胞系,細胞可內(nèi)源表達分子;可對其進行刺激以^R高內(nèi)源性表達;或?qū)ζ溥M行遺傳工程改造以表達所述分子。受關注的蛋白的表19達可通過以下方法確定例如,用合適抗體4全測多肽(例如Westernblot)、用DNA探針檢測編碼蛋白的mRNA(例如,northernblot或多種基于PCR的技術)、或測量對所關注的多肽具有選擇性的試劑的結(jié)合情況(例如,一種帶合適標記的選擇性配體)。本發(fā)明還提供包含本發(fā)明分子的編碼序列或變體形式的重組分子。在重組DNA分子中,將編碼DNA序列可4喿縱地連接到其他受關注的DNA序列上,包括但不限于多種用于整合、復制、轉(zhuǎn)錄、表達和修飾的控制序列。將本發(fā)明的基因序列可操縱地連接到其上的載體和控制序列的選擇取決于所需的功能性特征(例如蛋白表達,需進行轉(zhuǎn)化的宿主細胞)。本發(fā)明的載體能夠引導復制或插入宿主染色體,并優(yōu)選地表達基因。用于調(diào)節(jié)基因表達的控制元件是本領域已知的,包括但不限于誘導型或組成型啟動子、分泌信號、增強子、中止信號、核糖體結(jié)合位點、和其他調(diào)節(jié)元件。作為最佳選擇,誘導型啟動子易于控制,如對營養(yǎng)物質(zhì)或抗生素作出響應。在一個實施方案中,包含核酸分子的載體可包括原核復制子,即,具有在原核宿主細胞中引導自主復制和保持染色體外重組DNA分子的能力的DNA序列,如細菌宿主細胞。此外,包括原核復制子的載體也可包括其表達具有可檢測特征的基因(例如,氨千青霉素抗性)。載體還可包括原核或噬菌體啟動子,該啟動子能夠引導細菌宿主細胞(如大腸桿菌)中的編碼基因序列的表達(轉(zhuǎn)錄和翻移)。與細菌宿主相容的啟動子序列可在包含限制性內(nèi)切位點的質(zhì)粒載體中提供,所述內(nèi)切位點用于插入本發(fā)明的DNA序列,例如pCDNAl、pCDNA3。與真核細胞相容的表達載體也可用于構(gòu)建包含所關注序列的重組分子。可商購獲得的載體常常包含原核和真核復制子以及控制序列,用于容易地從原核細胞轉(zhuǎn)換到真核細胞及ES細胞以生成轉(zhuǎn)基因細胞或哺乳動物(例^口,來自Invitrogen的pCNA系歹'J)。用于構(gòu)建本發(fā)明的重組分子的真核細胞表達載體還可包括在真核細胞中有效的選擇性標記(例如新霉素抗性)。作為另外一種選擇,選擇性標記可存在于分離質(zhì)粒上、通過共轉(zhuǎn)染宿主細胞導入的兩個載體上、和通過在合適藥物中培養(yǎng)的選擇得到的轉(zhuǎn)染子上。載體也可包含融合蛋白,或有利于純化或表達蛋白檢測的標記序列。本發(fā)明還提供用本發(fā)明的重組分子轉(zhuǎn)化的宿主細胞。宿主細胞可以是原核細月包,例如細菌,或真核細月包,例如酵母、昆蟲或脊4食動物細月包,包括但不限于來自小鼠、猴子、青蛙、人類、大鼠、豚鼠、兔子、狗、豬、山羊、牛、黑猩猩、綿羊、倉鼠或斑馬魚的細胞。常用的真核宿主細胞包括但不限于CHG細胞、ATCCCCL61、NIH-3T3、和BHK細胞。在許多實例中,可優(yōu)選來自哺乳動物的原代細胞培養(yǎng)物。含有本發(fā)明分子的合適宿主細胞的轉(zhuǎn)化可通過已知的方法完成,所述方法取決于所用的宿主體系。就轉(zhuǎn)化原核宿主細胞而言,可使用電穿孔和鹽處理方法,當轉(zhuǎn)化真核細胞時,可使用電穿孔、陽離子脂質(zhì)、或鹽處理方法(參見Sambrook等人(1989),前文已述)。也已經(jīng)發(fā)展了有利于轉(zhuǎn)染原代或終分化細胞的病毒載體,包括但不限于逆轉(zhuǎn)錄病毒和腺病毒載體。其他技術也可用于將DNA導入細胞,例如脂質(zhì)體、膠體金顆粒、或?qū)荜P注基因的DNA表達載體(射彈形式)直接注射到人組織中??蓪⒊晒D(zhuǎn)化過的細胞進行克隆以生產(chǎn)穩(wěn)定的克隆??墒褂靡阎椒ㄊ斋@來自這些克隆的細胞,將其溶解并檢查其內(nèi)容物以確定重組分子是否存在。生物樣本對本領域的普通技術人員來說顯而易見的是,本發(fā)明的方法和檢測分析法中使用的核酸樣本(可以是DNA和/或RNA)可以通過可利用的方法制備。分離總mRNA的方法是已知的。例如,分離和純化核酸的方法詳細描述于Chapter3ofTijssen(199:3)LaboratoryTechniquesinBiochemistryandMolecularBiology:HybridizationwithNucleicAcidProbes,ElsevierPress。此類樣本包括RNA才羊本,但是也可以包括從受關注的細胞或組織中分離的mRNA樣本合成的cDNA。此類樣本也包括從cDNA擴增的DNA,以及乂人擴增DNA轉(zhuǎn)錄出的RNA。包含核酸或蛋白的生物樣本可以是來自任何生物以及體外生長細胞的任何生物組織或組織液或細胞,諸如細胞系和組織培養(yǎng)細月包。樣本可以是"臨床樣本",它是來源于患者的樣本。典型的臨床樣本包括但不限于唾液、鼻洗液、血液、血細胞(例如白細胞)、多種組織或器官或它們的部分、或細針穿刺活檢樣本、尿液、腹腔液、和胸膜液、或它們的細胞。生物樣本也可包括組織切片,如用于組織學目的的冰凍切片或曱醛固定切片。鼻洗液方法鼻洗液樣本可通過將5mL鹽水溶液灌輸?shù)矫總€鼻孔中進行收集??蓪⒋讼匆毫⒓磁湃胂灱埍校洳夭⑦M行制備處理供分析用。為了評估病毒和鼻病毒是否存在,一部分鼻洗液樣本可以與4X濃度的病毒收集肉湯混合。將大約2mL處理后的樣本置于旋蓋冷凍管中并凍存于-70°C直至對其進行評估。就生物標記物濃度評估而言,一部分鼻洗液樣本可以與5%的牛白蛋白混合。然后將一(1)mL處理后的樣本置于2mL冷凍管中并凍存于-70°C直至對其進行評估。鼻刮擦方法鼻刮擦樣本可從下鼻甲骨的前部直接目測采集。它們可以用一次性細胞采集刮器(Rhinoprobe,ArlingtonScientific,Inc.,Springville,UT)輕輕刮擦鼻曱骨表面五次進行采集。然后用第二個刮器重復此程序。將兩個刮器放入無RNA酶的旋蓋冷凍管中,管中包含TRIzol試劑(InvitrogenCorp.,Carlsbad,CA)以保存RNA。冷凍管可進行渴旋處理以從刮器上移除細胞物質(zhì),然后凍存于-70°C用于基因表達水平的檢測分析。.基因芯片分析總RNA分離可包括將細胞懸浮在~500ulRNA-STAT60(Tel-Test,Friendswood,TX)中并使用5mm不銹鋼珠在Retsch(W面iedel,Bavaria)MM300Bead-BeaterMill中進行均質(zhì)化處理。將氯仿加入到細胞溶解液中并振搖混合物1至2分鐘。將包含粗制核酸的含水相移除并用異丙醇沉淀。離心沉淀核酸并用70%乙醇洗滌沉淀物,然后將其重懸于DEPC水中。然后使用QIAgen(Hilden,Germany)RNEasyCleanupminicolumns,按照制造商推薦的規(guī)程純化RNA。RNA通過UV光譜法進行定量,用Agilent(PaloAlto,CA)Bioanalyzer2100進^亍定性?;蛐酒液铣珊突蛐酒幚砜缮婕笆褂肁ffymetrix提供的規(guī)程將純化總RNA轉(zhuǎn)化成cRNA基因芯片靶。按照AffymetrixExpressionAnalysis規(guī)程將cRNA靶片段化并進行雜交、洗滌和掃描。用于革巴合成和基因芯片處理的完整規(guī)程參見www.affymetrix.com/support/download/manuals/expressions2一manua1.pdf最后,涉及基因芯片掃描的基因芯片分析可使用AffymetrixMAS5.0算法轉(zhuǎn)換成表列數(shù)據(jù),該算法描述于www.affymetrix.com/Auth/support/downloads/manuals/mas_manual.zip。一旦確認了數(shù)據(jù)質(zhì)量,可使用多種可商購獲得的工具對其進行分析和可視化處理,所述工具包括AffymetrixDataMiningTool(DMT)、Spotfire(Sommervi1le,MA)'和Omniviz(Maynard,MA)。其他相關核酸分子的分離如上所述,表I和/或表II的人核酸分子的鑒定允許技術人員分離編碼除本文所述序列之外的基因家族的其他成員的分子。此外,目前公開的核酸分子允許技術人員分離編碼基因家族其他成員的核酸分子。技術人員可使用表II的蛋白或其片段來生成抗體探針以'滯選從合適細胞制備的表達文庫。在一個實施方案中,片段可包含氨基酸插入和取代。來自用純化蛋白免疫過的哺乳動物如兔子的多克隆抗血清或單克隆抗體可用于4企測哺乳動物cDNA或基因組表達文庫,如Agtll文庫,以獲取蛋白家族其他成員的合適編碼序列??蓪⒖寺DNA序列表達成融合蛋白,使用它自身的控制序列進行表達,或使用適合特定宿主的控制序列通過構(gòu)建體進行表達,所述宿主用于表達蛋白。作為另外一種選擇,可以合成本文所述的一部分編碼序列并將其用作探針以檢索編碼來自任何生物的蛋白家族成員的DNA。低聚物,例如包含18至20個核苷酸,可以被制備并用于篩選基因組DNA或cDNA文庫以在嚴謹條件下或嚴謹程度足以消除非預期假陽性結(jié)果的條件下獲得雜交結(jié)果。此外,可以制備寡核苷酸引物用于聚合酶鏈式反應(PCR)以克隆核酸分子。不同的PCR形式是本領域已知的,并且可對其進行調(diào)節(jié)以用于分離其他核酸分子。受試化合物的選擇—汰迎訂師迅日31化5、鄉(xiāng)巴搭1旦小限丁U辨化合物的文庫,包括天然產(chǎn)物如植物或哺乳動物提取物。也包括合成化學品、生物活性物質(zhì)例如蛋白質(zhì)、核酸和肽,包括但不限于隨機肽庫成員和由D-或L-構(gòu)型氨基酸制造的組合化學來源的分子文庫、和磷酸肽、抗體(包括但不限于多克隆抗體、單克隆抗體、嵌合抗體、人抗體、抗獨特型抗體或單鏈抗體、和Fab、F(ab,)2和Fab表達庫片段、以及它們的表位結(jié)合片段);以及其他有機或無機分子。除了較傳統(tǒng)來源的受試化合物之外,計算機建模和搜索技術還允許通過利用來自本發(fā)明蛋白配體結(jié)合位點的結(jié)構(gòu)信息來理性化選擇受試化合物。此類受試化合物的理性化選擇可減少受試化合物的數(shù)目,為了鑒定治療化合物,必須對受試化合物進行篩選。對本發(fā)明蛋白序列的了解可允許生成它們的結(jié)合位點的模型,這可用于篩選潛在的配體。這一過程可通過本領域已知的方法完成。優(yōu)選的方法涉及生成蛋白序列對模板(書f生自相似蛋白的晶體結(jié)構(gòu)或基于應R的才莫型)的序列比對、氨基酸結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化和通過分子力學和視覺檢查精修模型。如果不能獲得強序列比對,也可通過疏水螺旋建模生成模型。也可使用針對接觸殘基的突變數(shù)據(jù)定位彼此相對的螺旋結(jié)構(gòu)以便完成這些接觸。在此過程中,也可將已知配體導入螺旋結(jié)構(gòu)中的結(jié)合位點空穴,以通過能穩(wěn)定配體結(jié)合的發(fā)展相互作用來幫助定位螺旋結(jié)構(gòu)。通過使用分子力學的精修方法和使用標準同源建模技術的建環(huán)方法來完成模型。關于建模的綜合信息可參見Schoneberg,T.等人,MolecularandCellularEndocrinology,151:181-193(1999),Flower,D.,BiochimBiophysActa,1422,207-234(1999),和Sexton,P.M.,Curr.Opin.DrugDiscoveryandDevelopment,2,440-448(1999)。一旦完成模型,它可以與幾個計算機程序中的其中一個協(xié)同使用以減少想要篩選的化合物的數(shù)目,例如DOCK程序(UCSFMolecularDesignInstitute,533ParnassusAve,U-64,Box0446,SanFrancisco,California94143-0446)或FLEXX(TriposInc.,1699SouthHanleyRd.,St.Louis,M0)。技術人員也可以問位點立體配合及粗略靜電互補的專有化合物'對鑒定化合物的篩選4全測分^f斤法已發(fā)現(xiàn),本發(fā)明的基因可在調(diào)節(jié)、監(jiān)控和/或治療鼻病毒感染過程中起作用,這使得我們能夠使用多種方法篩選一種或多種化合物以鑒定可用于鼻病毒感染預防或治療的化合物。當選擇適用于預防、監(jiān)控或治療的化合物時,優(yōu)選對本發(fā)明的蛋白表達調(diào)節(jié)子、蛋白產(chǎn)物和蛋白受體具有選擇性的化合物。就最初的篩選而言,優(yōu)選使用本發(fā)明的蛋白與氨基酸序列一起進行體外篩選,所述氨基酸序列是例如與表II所述蛋白序列至少約80%相同,優(yōu)選至少約90%相同,更優(yōu)選相同的序列。優(yōu)選地,受試化合物對脊推動物蛋白進行篩選,更優(yōu)選人類蛋白。就篩選化合物而言,優(yōu)選使用來自考慮對其進行治療的物種的蛋白。本發(fā)明的方法可適用于高通量應用;然而,術語"篩選"包括僅使用一種化合物。這種體外篩選提供一種選擇化合物范圍的方法,即,值得進行進一步研究的化合物。例如,在小于200nM的濃度下活化本發(fā)明的蛋白的化合物可在哺乳動物模型中進行進一步檢測,然而那些超出閥值的化合物不必進行進一步檢測??蓪⑾率龅臋z測分析體系配制成試劑盒,所述試劑盒包括本發(fā)明的蛋白或表達本發(fā)明蛋白的細胞,可將它們包裝在多種容器中,例如小瓶、管、微孔板、瓶等。試劑盒可包括其他試劑例如陽性或陰性對照樣本,以及緩沖液。在一個實施方案中,本發(fā)明提供一種鑒定與本發(fā)明的蛋白結(jié)合的化合物的方法。確定化合物與蛋白結(jié)合的方法是本領域已知的。所述檢測分析法包括在受試化合物存在或不存在的情況下分別與標記化合物一起培養(yǎng)本發(fā)明的蛋白,標記化合物已知是結(jié)合所述蛋白的,然后確定標記化合物的結(jié)合量。本發(fā)明的蛋白來源可以是表達蛋白的細胞或一些分離的蛋白形式。標記化合物可以是標記的已知配體或配體類似物,以使得可對它進行測量,優(yōu)選定量測量(例如,用)25I、35S-曱硫氨酸、或熒光標記物、或肽或熒光融合蛋白進行標記)。此類標記方法是本領域已知的。結(jié)合本發(fā)明的蛋白的受試化合物可減少結(jié)合蛋白的配體,因此與對照樣本相比降低了信號水平。此4支術的變型已經(jīng)^皮描述于Keen,M.,RadioligandBindingMethodsforMembranePreparationsandIntactcellsinReceptorSignalTransductionProtocols,R.A.J.Challis,(編輯),HumanaPressInc.,Totoway,N.J.(1997)。在另一個實施方案中,本發(fā)明提供用于篩選受試化合物以鑒定活化本發(fā)明蛋白的化合物的方法。此檢測分析法是基于細胞的方法。然而,能夠區(qū)分激動劑和拮抗劑結(jié)合的非細胞檢測分析法是已知的。基于細胞的檢測分析法包括使表達本發(fā)明的蛋白的細胞接觸受試化合物或?qū)φ瘴镔|(zhì),并通過測量受影響信號轉(zhuǎn)導途徑的組分的表達或活性來測量蛋白活化程度。例如,在與受試化合物一起合適培養(yǎng)后,可制備細胞溶解產(chǎn)物并檢測分析轉(zhuǎn)錄、翻譯、或蛋白改性,例如磷酸化、或糖基化、或第二信使(如cAMP)誘導。此外,可使用許多高通量檢測分析法在無需溶解細胞的情況下測量響應,例如4丐成1象。在一個實施方案中,可使用重組構(gòu)建體測量cAMP誘導,重組構(gòu)建體包含連接到多種報道基因的任何一種上的cAMP響應元件。此類報道基因包括但不限于氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶(CAT)、熒光素酶、葡糖苷酸合成酶、生長激素、熒光蛋白、或堿性磷酸酶。在細胞暴露于受試化合物后,可對報道基因表達水平進行定量以確定受試化合物提高cAMP水平的能力并因此確定受試化合物活化本發(fā)明蛋白的能力。在另一個實施方案中,可利用特異性磷酸酪氨酸或磷酸絲氨酸抗體來測量信號蛋白暴露于受試化合物后的磷酸化水平,由此磷酸化水平與對照樣本的顯著差異將指示本發(fā)明蛋白的活化情況。在某些情況下,蛋白(例如受體)響應在長期暴露于激動劑后下調(diào)或變得不敏感。在許多情況下,受關注的蛋白可以是一種酶,因此受試化合物的結(jié)合效果可根據(jù)酶活性的改變進行測量。同樣的,細胞內(nèi)4丐濃度[Ca21的改變一般指示許多級聯(lián)信號的活化?;诩毎氖荏w結(jié)合檢測分析法作為評估新化合物潛在生物活性的有用工具,基于細胞的受體結(jié)合檢測分析法常用于制藥和生物工藝學領域。事實上,這種高通量篩選(HTS)方法已經(jīng)變成了用于藥物開發(fā)的新先導化合物的主要來源。藥物發(fā)明和基礎研究程序需要更迅速可靠的程序來處理和篩選大量未知的活性化合物。已經(jīng)開發(fā)了幾種專門的檢測技術以利于成本和時間均高效地篩選幾百萬種化合物。其中一種最頻繁使用的檢測分析技術可以是親近閃爍檢測法(SPA)??墒褂眠@種技術確定多種藥物對受體的親和力以及受體家族的結(jié)合位點密度和它們在不同組織或樣本中的亞型。抑制劑可通過竟爭受體結(jié)合位點降低特異性化學發(fā)光或放射性強度。這些研究可有助于確定是否藥物在不同亞型時將具有治療效果或不利影響。一般的檢測分析法程序涉及將細胞或細胞膜與所需靶受體一起加入到檢測分析板中??杉尤胍环N最小化非特異性結(jié)合的阻滯劑并在RT(室溫)下培養(yǎng)30分鐘??蓪⑹茉嚮衔?、試劑、標記配體、連同讀數(shù)緩沖液一起加入并培養(yǎng)一定時間??筛鶕?jù)需要的頻率進行強度讀數(shù)。不表達受體的細胞將顯示無特異性結(jié)合。竟爭結(jié)合曲線可產(chǎn)生受試化合物的活性程度排序。NF-kB活化檢測分析法許多前炎性試劑(例如細胞因子、趨化因子和環(huán)加氧酶)的轉(zhuǎn)錄受轉(zhuǎn).錄因子NF-kB的調(diào)節(jié)。本發(fā)明人發(fā)現(xiàn),NF-kB和許多趨化因子及細胞因子在鼻病毒(RV)感染后發(fā)生上調(diào),這指示抑制NF-kB將是減輕癥狀的關鍵干預點。核因子-kb(NF-kB)是關鍵的核轉(zhuǎn)錄因子,它調(diào)節(jié)大量對炎癥至關重要的基因的表達,包括細胞因子和趨化因子轉(zhuǎn)錄。當活化時,NF-kB從細胞質(zhì)轉(zhuǎn)移到核中并活化其啟動子用于轉(zhuǎn)錄。來自文獻和本發(fā)明人實驗室的結(jié)果都證實鼻病毒感染后大量基因發(fā)生轉(zhuǎn)錄,這指示NF-kB是一個潛在的關鍵干預點。因此,用于監(jiān)控NF-kB活化和轉(zhuǎn)移的檢測分析法將對評估潛在抗炎劑的技術有用。Cellomics,Inc.(Pittsburgh,PA)已經(jīng)開發(fā)了一種基于抗體的斗全測分析法,它顯示了NF-kB的亞細胞定位,因此允許對NF-kB從細胞質(zhì)至核的轉(zhuǎn)移進行定量。因為NF-kB必須在核中才能誘導基因表達,它的轉(zhuǎn)移是其活化的可靠量度,并且標志著比報道基因表達更早的事件的發(fā)生。此檢測分析法是96孔中等通量技術的實例,該技術能在幾種細胞型中檢測NF-kB轉(zhuǎn)移。這種基于細胞的檢測分析法具有預測呼吸有益效果的潛力??梢栽跇藴矢呙芏任逯羞M行檢測分析,其中NF-KB轉(zhuǎn)移速率和程度的測量在完整細胞中進行,完整細胞提供更多的生物代表性信息。CellomicsNF-kB活化試劑盒(目錄號#K01-001-1)可與熒光試劑和用于最優(yōu)化樣本制備及檢測分析的規(guī)程聯(lián)合應用,并且不需要細胞溶解、純化或過濾步驟。經(jīng)固定后,所述板在避光4。C條件下可長期保持穩(wěn)定。技術人員可基于cell-by-cell方法進行全自動篩選以鑒別抑制或活化NF-kB的化合物。制備的細胞可使用標準熒光顯微鏡法或Celiomics的全自動HCSReader結(jié)合質(zhì)核轉(zhuǎn)移生物分析軟件進行分析,HCSReader提供自動板處理、調(diào)焦、圖象采集、分析、定量、和數(shù)據(jù)儲存功能。COX抑制劑篩選片企測分析法環(huán)加氧酶(COX,也稱為前列洛泉素H合酶或PGHS)包含環(huán)加氧酶和過氧化物酶活性。C0X催化前列腺素(PG)、血栓素、和環(huán)前列腺素生物合成的第一步;將花生四烯酸轉(zhuǎn)化成PGH2。目前已確定有兩種不同類型的C0X。環(huán)加氧酶-l(C0X-1)在多種細胞型中組成型表達,并且涉及正常細胞動態(tài)平衡。多種促有絲分裂刺激如佛波醇酯、脂多糖和細胞因子導致第二種C0X,環(huán)加氧酶-2(C0X-2)的誘導型表達。C0X-2負責急性炎癥條件下的PG生物合成。這種誘導型C0X-2據(jù)信是非類固醇抗炎藥物的抗炎劑活性的耙向酶。C0X抑制劑篩選沖企測分析法(目錄號#560101,產(chǎn)自CaymanChemicalCompany,AnnHarbor,Michigan)的一個實例直才妻測量由SnC12還原COX來源的PGH2產(chǎn)生的PGF2。前列腺素產(chǎn)物可使用廣特異性的抗體通過酶免疫測定(EIA)進行定量,所述廣特異性抗體結(jié)合所有主要前列腺素化合物。因此,COX檢測分析法比基于過氧化物酶抑制的檢測分析法更準確可靠。為了篩選同功酶特異性抑制劑,CaymanCOX抑制劑篩選檢測分析法包括綿羊C0X-1和人重組C0X-2酶。這一檢測分析法是一種優(yōu)良的工具,能用于一般抑制劑的篩選,或用于消除由特異性不強的方法產(chǎn)生的假陽性結(jié)果。前列腺素E2;險測分析法環(huán)氧合酶能參與前列腺素的生成,前列腺素可以是炎癥和疼痛的調(diào)節(jié)子。C0X2(環(huán)加氧酶-2)是由病毒感染誘導的蛋白(由基因PTGS2編碼),PGE2(前列腺素E2)是能導致癥狀樣不適、頭痛、喉嚨痛的產(chǎn)物。抑制PGE2生成或C0X活性的化合物能減輕病毒感染的癥狀。前列腺素的生成起始于磷脂酶A2響應炎性刺激從膜磷脂釋放花生四烯酸。環(huán)加氧酶C0X-1和C0X-2然后將花生四烯酸轉(zhuǎn)化成PGH2(前列腺素H2)。C0X-1發(fā)生組成型表達并且它起著維持穩(wěn)態(tài)功能如粘液分泌的作用,然而C0X-2響應炎性刺激發(fā)生誘導型表達。在更下游,細胞特異性前列腺素合酶將PGH2轉(zhuǎn)化成一系列前列腺素,包括PGI2、PGF2、PGD2和PGE2。PGE2是花生四烯酸代謝的主要產(chǎn)物,由幾種細胞類型產(chǎn)生,包括巨噬細胞、纖維原細胞和一些惡性細胞。它通過4種受體發(fā)揮作用EP1、EP2、EP3和EP4。它的生產(chǎn)是斥企測C0X-1和C0X-2調(diào)節(jié)和前列腺素合酶的通用方法。有幾種可用于定量PGE2的標準方法。HTRFPGE2;險測分析法(由CisbioInternational開發(fā),目錄號#62P2APEB)是用于定量PGE2的高敏感方法的實例。它的原理基于HTRF技術(均相時間分辨焚光,HomogeneousTime—ResolvedFluorescence)。它的才乘4乍能句多在纟田月包上清液中執(zhí)行,或直接在完整細胞存在的情況下執(zhí)行。此方法是一種竟爭性的免疫測定法,其中細胞產(chǎn)生的天然PGE2和d2標記的PGE2竟爭結(jié)合到穴狀化合物標記的MAb抗PGE2上。HTRF信號與校準品或才羊本中的PGE2濃度成反比。加入HTPF^r測試劑后的培養(yǎng)時間和溫度對;險測結(jié)果影響不大,這從另一水平上為檢測分析法提供了靈活性。簡而言之,可使用稀釋劑制備連續(xù)稀釋樣本(在0至5000pg/mL范圍內(nèi))。將試劑分配(按照規(guī)程略述的方法)到384孔低容量板中(20ul)。包括陰性和陽性對照。用板密封蓋覆蓋板,并且在室溫下培養(yǎng)5小時或在4'C培養(yǎng)過夜。來自樣本的游離PGE2與XL665標記的PGE2竟爭結(jié)合綴合穴狀化合物的抗PGE2抗體。然后所述板在相容的HTRF閱讀器上讀數(shù)。使用鼻病毒的細胞培養(yǎng)物、組織和哺乳動物模型篩選化合物對于選自一種或多種由如上所述體外檢測分析法分析的受試化合物的化合物,可進一步測試其調(diào)節(jié)鼻病毒的能力。此類模型包括體外細胞培養(yǎng)模型和體內(nèi)哺乳動物模型。此類附加水平的篩選可用于進一步縮小候選化合物的范圍,所述候選化合物值得進行進一步的研究,例如臨床試驗。此類模型體系可包括但不限于支氣管上皮細胞前列腺素和趨化因子釋放檢測分析法、P函C增殖/存活檢測分析法、PBMC趨化性檢測分析法、趨化因子受體結(jié)合檢測分析法、RV感染的支氣管上皮細胞中的鼻病毒滴度、和人RV誘導的感冒模型。趨化性檢測分析法表I中的多種趨化因子當RV感染(例如IPIO、MCP1)時被誘導。趨化因子是由受感染細胞釋放的小蛋白分子,它在其他免疫細胞(例如淋巴細胞)上起受體作用并誘導趨化性,因此啟動炎性過程。因此,病毒感染能受此類活性物質(zhì)的控制1)下調(diào)趨化因子;或2)阻遏趨化因子受體。趨化因子受體拮抗劑能夠通過趨化性檢測分析法進行鑒定。趨化性檢測分析的目的是為了確定受關注的蛋白或小分子是否具有對特異細胞型的趨化活性。趨化性是蛋白引導特異細胞遷移的能力。這種檢測分析法是基于以下前提制造趨化劑梯度,并允許細胞穿過膜向趨化劑遷移。如果該試劑不是細胞趨化性的,那么大部分細胞會停留在膜上。如果該試劑是細胞趨化性的,那么細胞將遷移穿過膜并停留在趨化性板的孔底。這種4企測分析法可使用多孔室(例如NeuroProbe)對其中24、96、384個白細胞或其他遷移細胞的樣本進行平行評估。其優(yōu)點是幾個平行樣本在相同條件下進行檢測分析。通過包含相同大小的孔的過濾器分離多孔室。被研究的白細胞的大小決定了所述過濾器的孔徑大小。必須選擇允許活性轉(zhuǎn)移的孔徑。將包含趨化因子或向化因子的溶液置于室底部,并將白細胞懸浮液置于室上部。細胞能夠遷移通過孔,穿過過濾器并朝趨化因子源(較低的室)遷移。對遷移通過過濾器并粘附在下側(cè)的細胞進行計數(shù)。常常將數(shù)據(jù)表達成術語遷移指數(shù)響應于激動劑遷移的細胞數(shù)目相對于無規(guī)則遷移的細胞數(shù)目,即,僅加入緩沖液時發(fā)生的遷移。為了檢測細胞,常用染色技術(例如臺盼藍)或特異性探針技術(例如用MTT檢測分析法進行的mt-脫氫酶4企測)。也4吏用標記(例如熒光染#牛,如CellTrackerGreen)過的細胞。炎癥調(diào)節(jié)子的多重檢測分析多重檢測分析已經(jīng)成為用于測量單個樣本中的多個蛋白含量和/或活性的非常有用的工具。它們是定量的、基于板的抗體芯片,該芯片基于傳統(tǒng)的ELISA(酶聯(lián)免疫吸附檢測分析法)技術和壓電打印技術。能對它們進行最優(yōu)化以定量測量血清中的多個分析物(蛋白);EDTA、肝素和血漿檸檬酸鈉;培養(yǎng)上清液;以及其他樣本類型。在所提供的每個微板孔中預置了能捕集特異分析物的抗體,標準品和樣本也被加入板中。在洗滌去除非結(jié)合性蛋白后,加入生物素化的檢測抗體,它會結(jié)合到靶蛋白的第二位點。每個抗體點可捕集一個特異性細胞因子、趨化因子或其他生物標記物,它們用生物素化的混合抗體檢測,然后加入鏈親和素-辣才艮過氧化物酶(SA-HRP)和SuperSignalELISA化學發(fā)光底物??梢瞥嘤嗟腲r測抗體并加入SA-HRP或SA-DyLight800Fluor。酶-底物(HRP-SuperSignal)反應產(chǎn)生光信號,可使用SearchLightPlusCCDImagingSystem4企測光信號。就紅外芯片而言,來自DyLight800Fluor的信號可以用來自LI-CORBiosciences的Odyssey或AeriusInfraredImagingSystem進行測量。每個點產(chǎn)生的信號量與最初的標準品或樣本中的每個特異蛋白量成比例。產(chǎn)生自HRP催化的底物氧化的光可以通過用冷卻的CCD相機通過板成像進行測量。使用重組芯片蛋白的混合物生成標準曲線。樣本中的蛋白濃度可通過比較點密度與對應的標準曲線進行定量。轉(zhuǎn)基因哺乳動物和基因療法許多種哺乳動物,優(yōu)選脊推動物,包括但不限于小鼠、大鼠、兔子、豚鼠、豬、山羊、狗、青蛙、以及除人之外的靈長類動物,可用于生成表達本發(fā)明蛋白的轉(zhuǎn)基因哺乳動物。本領域已知的幾種技術可用于將轉(zhuǎn)基因?qū)氩溉閯游镆援a(chǎn)生轉(zhuǎn)基因哺乳動物的奠基品種。此類技術包括但不限于原核注射、逆轉(zhuǎn)錄病毒介導的基因轉(zhuǎn)入生殖系、基因靶向進入胚胎干細胞、胚胎電穿孔和精子介導的轉(zhuǎn)基因。本發(fā)明蛋白的總體活性可以通過過表達該蛋白的基因來提高。過表達將提高細胞蛋白的總體活性并因此提高蛋白功能。將基因或受關注的基因插入到適于在受試者中表達的載體中。這些載體包括但不限于腺病毒、腺病毒相關的病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒和皰疹病毒載體。其他技術也可用于將DNA導入細胞,例如脂質(zhì)體、膠體金顆粒、或?qū)荜P注基因的DNA表達載體(射彈形式)直接注射到人組織中。鼻病毒感染的治療本發(fā)明的基因、蛋白、表達調(diào)節(jié)子、蛋白產(chǎn)物、和受體(靶),以及一種或多種活化或抑制靶的化合物,包括但不限于至少一種化合物,至少兩種化合物,至少三種化合物,可用于治療鼻病毒感染的方法。術語"調(diào)節(jié)"包括但不限于通過多種方法上調(diào)或下調(diào)、固定、整頓或統(tǒng)一、管理、或引導。在一個方面,在用于治療"鼻病毒感染"的方法中可使用化合物。本發(fā)明可治療的鼻病毒感染和與鼻病毒感染相關的疾病的非限制性實例如下文所述。本發(fā)明的靶和化合物可用于治療、監(jiān)控或診斷上呼吸道感染(URI),包括但不限于感冒和流感。這包括但不限于鼻病毒、副流感病毒、冠狀病毒、腺病毒、翁病毒、人腸道孤病毒、呼吸道合胞病毒、柯薩奇病毒、和引起大部分URI的流感病毒。藥物制劑和使用方法可施用如本文所述的篩選方法鑒定的化合物于哺乳動物以治療或預防疾病或失調(diào),所述疾病或失調(diào)可由本發(fā)明的基因、蛋白、表達調(diào)節(jié)子、蛋白產(chǎn)物、和受體(靶)調(diào)節(jié)。本文所用術語"治療"是指施用本發(fā)明的化合物減輕宿主的疾病或失調(diào)。因此,術語"治療"包括預防宿主發(fā)生的疾病,尤其是當宿主容易患病,但仍未被診斷出患病的時候;抑制疾??;和/或減輕或逆轉(zhuǎn)疾病。就本發(fā)明的用于預防疾病的方法而言,應當理解術語"預防"不需要完全阻止疾病狀態(tài)。(參見Webster'sNinthCollegiateDictionary。)如本文所用,術語預防更適當?shù)氖侵笡_支術人員識別易感人群,以便在疾病發(fā)作前施用本發(fā)明的化合物的能力。該術語并不意味著完全避免疾病狀態(tài)。由本發(fā)明的篩選方法鑒定的化合物可以與其他化合物聯(lián)合施用。已鑒定的化合物的安全性和治療功效可通過標準程序使用體外或體內(nèi)技術進行確定。優(yōu)選表現(xiàn)出較高治療指標的化備物,盡管治療指標較低的32化合物,如果其副作用水平可以接受,也可能是有用的。獲取自體外和體內(nèi)的毒理和藥理技術數(shù)據(jù)可用于確定劑量范圍?;衔锏男Я稍诓溉閯游锬P突虮遣《靖腥净颊叩呐R床研究中進一步進行評估。如本文所用,"藥用載體"是指包括所有溶劑、分散介質(zhì)、包衣、抗菌和抗真菌劑、等滲和吸收延遲劑等,適于藥物施用。用于藥物活性物質(zhì)的此類介質(zhì)和試劑的用途是本領域已知的。除了迄今與活性化合物不相容的一些常規(guī)介質(zhì)或試劑外,可在本發(fā)明的組合物中使用此類介質(zhì)。也可以將補充活性化合物摻入所述組合物中。將本發(fā)明的藥物組合物配制成與其設想的給藥途徑相容。給藥途徑的實例包括腸胃外給藥,例如靜脈注射、皮內(nèi)注射、皮下注射、口服(例如吸入)、透皮(局部用)、透粘膜、以及經(jīng)直腸給藥。用于腸胃外給藥、皮內(nèi)注射、或皮下注射應用的溶液或懸浮液可包括以下組分無菌稀釋劑如注射用水、鹽水溶液、不揮發(fā)性油、聚乙二醇、丙二醇或其他合成溶劑;抗菌劑如千醇或?qū)αu基苯曱酸曱酯;抗氧化劑如抗壞血酸或亞硫酸氫鈉;螯合劑如乙二胺四乙酸;緩沖液如乙酸鹽、檸檬酸鹽或磷酸鹽以及用于緊張調(diào)節(jié)的試劑如氯化鈉或右旋糖。pH可以用酸或堿調(diào)節(jié),如鹽酸或氫氧化鈉。可以將腸胃外給藥制劑包封在由玻璃或塑料制成的安瓿、一次性注射器或多劑量瓶中。適于注射用的藥物組合物包括無菌水溶液(水溶性的),或分散體及無菌粉末,無菌粉末用于臨時制備無菌注射液或分散體。就靜脈注射給藥而言,合適的載體包括生理鹽水、抑菌水、CremophorEL(BASF,Parsippany,N.J.)或磷酸緩沖鹽水(PBS)。在任何情況下所述組合物必須無菌并且應有一定程度的流動性以便于注射。它在制造和貯藏條件下必須穩(wěn)定,并且保存應防止微生物如細菌和真菌的污染。所述載體可以是溶劑或分散介質(zhì),它們包含例如水、乙醇、多羥基化合物(例如甘油、丙二醇和聚乙二醇液體等)、以及它們的合適混合物。應保持合適的流動性,例如,通過使用包衣如卵磷脂、通過在分散體情況下維持所需的粒度和通過使用表面活性劑。可通過多種抗菌和抗真菌劑預防微生物污染,例如對羥基苯曱酸脂、氯代丁醇、苯酚、抗壞血酸、乙基汞硫代水楊酸鈉等。在許多情況下,在組合物中將優(yōu)選包括等滲劑,例如糖、多元醇如甘露糖醇、山梨醇和氯化鈉。通過在組合物中包括吸收延遲劑延長注射型組合物的吸收,例如單硬脂酸鋁和明膠。無菌注射液可通過在合適溶劑中摻入所需量的活性化合物進行制備,如需要的話可同時摻入一種上文列舉的成分或它們的組合,隨后進行過濾除菌。一般來講,分散體通過將活性化合物摻入無菌載體中進行制備,無菌載體包含基本的分散介質(zhì)和所需的其他成分。在用于制備無菌注射液的無菌粉末的情況下,優(yōu)選的制備方法是通過真空干燥和冷凍干燥從先前的活性成分和任何附加所需成分的無菌過濾溶液得到它們的粉末。口腔組合物一般包括惰性稀釋劑或可食用載體。可將它們包封在明膠膠嚢中或壓制成片劑。就口服而言,可將所述劑包含在腸溶劑型中以通過胃,或通過已知的方法進一步包被或混合以在GI道的特定區(qū)域釋放。為了口服治療劑,可以將活性化合物與賦形劑一起摻入并以片劑、藥片、或膠嚢形式使用。口腔組合物也可以使用載液制備成漱口水,其中載液中的化合物被用于口腔、漱口后吐出或咽下。組合物也可包括藥物相容的結(jié)合劑和/或輔劑材料。片劑、藥丸、膠嚢、藥片等可包含任何以下成分或性質(zhì)相似的化合物粘合劑如微晶纖維素、黃蓍膠粉或明膠;賦形劑如淀粉或乳糖,崩解劑如藻酸,Primoge廣,或玉米淀粉;潤滑劑如硬脂酸鎂;助流劑如力交態(tài)二氧化硅;甜味劑如蔗糖或糖精;或調(diào)p未劑如胡扭又薄荷、水楊酸甲酯或橙味劑。就吸入給藥而言,化合物以氣溶膠噴霧的形式從加壓容器或分配器中進行遞送,所述容器包含合適的拋射劑,例如氣體如二氧化碳,或噴霧器。全身給藥也可通過透粘膜的或透皮的方法完成。就透粘膜或透皮給藥而言,適于透過屏障的滲透劑被用于制劑中。此類滲透劑通常是本領域已知的,并且包括例如用于透粘膜給藥的洗滌劑、膽汁鹽、和梭鏈孢酸衍生物??墒褂帽菄妱┗蛩▌┩瓿赏刚衬そo藥。就透皮給藥而言,活性化合物被配制成本領域通常已知的油膏劑、藥膏、凝膠、或霜膏。也可將化合物制成栓劑(例如用常規(guī)栓劑基質(zhì)如椰子油和其他甘油酯)或保留灌腸劑用于直腸給藥的遞送。34在一個實施方案中,活性化合物與載體一起制備,載體將保護化合物不被人體迅速消除,如緩釋制劑,包括灌裝和微膠嚢化遞送體系??墒褂媚苌锝到獾?、生物相容的聚合物,如乙烯乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、膠原、聚原酸酯和聚乳酸。制備此類制劑的方法對本領域的技術人員來"i兌^l奪是顯而易見的。才才4+也可商購自AlzaCorporation禾口NovaPharmaceuticals,Inc.。脂質(zhì)體懸浮液(包括靶向受感染細胞的脂質(zhì)體和抗病毒抗原的單克隆抗體)也可用作藥用的載體。可按照本領域的技術人員已知的方法制備這些載體,例如如美國專利公開4,522,811所述的方法。將口服或腸胃外給藥組合物配制成易于給藥的劑量單位形式和相同劑量是尤其有利的。如本文所用,"劑量單位形式"是指用于接收治療的受試者的適于單劑量的離散單位,每單位包含預先確定量的活性化合物和所需的藥物載體,該活性化合物的量經(jīng)計算能產(chǎn)生所需的治療效果。劑量單位的規(guī)格由以下幾個因素規(guī)定并直接取決于它們活性化合物的特性、想要達到的特定治療效果和本領域配混此類活性化合物用于個體治療時固有的限制。診斷用途如上所述,表I提供的基因和基因表達信息可用作診斷標記物用于預測或鑒定樣本組織的疾病狀態(tài)。例如,組織樣本可通過上述的任何方法進行檢測分析,并且表I的基因或基因家族成員的表達水平可與正常受試者的表達水平進行比較。表達水平也可以與在表現(xiàn)出相似疾病狀態(tài)的樣本組織中觀察到的表達水平進行比較,這可有助于它的診斷。表達數(shù)據(jù)以及可所述的計算機和數(shù)據(jù)庫完成。此類方法可用于診斷或鑒定特征在于表I中所述的基因非正常表達的病癥。本發(fā)明的方法對診斷或監(jiān)控治療方案的效力尤其有用。調(diào)節(jié)一種或多種表I和/或II中鑒定的基因或基因家族或蛋白或表達調(diào)節(jié)子或蛋白產(chǎn)物或蛋白受體,和/或調(diào)節(jié)由表I中鑒定的一種或多種基因或基因家族成員編碼的一種或多種蛋白或表達調(diào)節(jié)子或蛋白產(chǎn)物或蛋白受體的活性的化合物將可用于診斷、監(jiān)控、和評估患者對治療方案的響應。實施例實施例A可將BEAS-2B細胞的體外細胞系用鼻病毒RV-16感染。然后將細胞暴露于多種化合物和提取物,隨后檢測分析呼吸生物標記蛋白的含量。通過在將受感染細胞暴露于提取物和化合物后監(jiān)控呼吸生物標記蛋白的含量并與未暴露于提取物和化合物的受感染細胞中的呼吸生物標記蛋白含量比較,可將提取物和化合物鑒定為調(diào)節(jié)呼吸生物標記蛋白的物質(zhì)。在所述實施例中,測試成分是草本穿心蓮提取物或其主要組分穿心蓮內(nèi)酯。測試成分經(jīng)測試穿心蓮內(nèi)酯含量為5^iM。呼吸生物標記蛋白為IP-10(CXCL10),一種趨化劑。測試成分IP-IO(CXCL10)(5^M穿心蓮內(nèi)酯含量)pg/mL對照物61.99穿心蓮內(nèi)酯18.07穿心蓮A0.46穿心蓮B2.34穿心蓮A來源于Sabinsa,Piscataway,NJ。穿心蓮B來源于GNC,Pittsburgh,PA。測試成分與對照物相比,能觀察到趨化蛋白含量的大幅降低。實施例B可通過監(jiān)控呼吸蛋白生物標記含量來評估受試化合物在人自然誘發(fā)感冒的鼻病毒感染期間的功效。從表現(xiàn)出感冒最初癥狀的受試者處采集鼻洗液。然后治療受試者并在隨后幾天中釆集鼻洗液樣本。治療劑由含20mg總穿心蓮內(nèi)酯的標準化穿心蓮提取物、28.8mg刺五加提取物和65Gmg姜黃素(姜黃提取物)組成。此組合物每日服用三次。呼吸生物標記蛋白為IP-IO(CXCL10),一種趨化劑。在治療后的幾天中檢測分析呼吸生物標記蛋白的含量,并用治療前的基線值進行統(tǒng)計學校正。測試成分IP-10(CXCL10)pg/mL對照物8183穿心蓮、刺五加、姜黃素組合3584穿心蓮禾口刺五力口4尋自SwedishHerbalInstitute,G6teborg,Sweden。姜黃素得自Sabinsa,Piscataway,NJ。測試成分與對照物相比,能觀察到趨化蛋白含量的大幅降低。實施例C可通過監(jiān)控呼吸蛋白生物標記含量來評估受試化合物在人自然誘發(fā)感冒的鼻病毒感染期間的功效。從表現(xiàn)出感冒最初癥狀的受試者處采集鼻洗液。然后治療受試者并在隨后幾天中采集鼻洗液樣本。治療劑由400mg布洛芬和4mg馬來酸氯苯那敏組成。組合物每日服用三次。呼吸生物標記蛋白為MCP1(CCL2),—種趨化劑。在治療后的幾天中檢測分析呼吸生物標記蛋白的含量,并用治療前的基線值進行統(tǒng)計學校正。測試成分MCP1(CCL2)pg/mL對照物271布洛芬和馬來酸氯苯那敏組合。163布洛芬得自WyethConsumerHealthcare,WilmingtonDE。馬來酸氯苯那每丈得自ScheringPlough,KenilworthNJ。測試成分與對照物相比,能觀察到趨化蛋白含量的大幅降低。實施例D、E和F下列實施例進一步描述和證明了本發(fā)明范圍內(nèi)的實施方案。所給的這些實施例僅僅是說明性的,不可理解為是對本發(fā)明的限制,因為在不背離本發(fā)明的實質(zhì)和保護范圍的情況下可以進行許多改變。除非另外指明,所有示例濃度均為重量-重量百分比。姜黃才是取物可4尋自SabinsaCorporation,Piscataway,NJ。刺五力口和穿心蓮提取物可得自DanskDroge,De歸rk。實施例D<table>tableseeoriginaldocumentpage38</column></row><table>*51.Omg穿心蓮包含5mg穿心蓮內(nèi)酯。**166.7mg姜黃提取物包含158.3mg姜黃素。***7.2mg刺五加才是取物等同于120mg刺五力口才艮提取物。將穿心蓮、姜黃、刺五加、胡椒堿和纖維素粉末混合在一起。然后加入硬脂酸鎂并將全部共混物一起混合。將所得粉末共混物分配到膠嚢中,每粒膠嚢含量400mg。劑量為每天M^三次,每次服四片。實施例E<table>tableseeoriginaldocumentpage38</column></row><table>*102mg穿心蓮包含10mg穿心蓮內(nèi)酯。**333.3mg姜黃提取物包含316.7mg姜黃素。***14.4mg刺五加提取物等同于240mg刺五加根提取物。將穿心蓮、姜黃、刺五加、胡祐iL喊和纖維素粉末混合在一起。然后加入硬脂酸鎂并將全部共混物一起混合。將所得粉末共混物分配到膠嚢中,每粒膠嚢含量為600mg。劑量為每天服三次,每次服兩片。實施例F組分每片含量穿心蓮提取物102.Omg*姜黃提取物333.3mg**刺五加提取物14.4mg***胡椒堿2.4mg聚乙烯吡咯烷酮18.Omg交聯(lián)羧曱纖維素鈉12.Omg微晶纖維素,AvicelPH200114.9mg硬脂酸鎂3.Omg*102mg穿心蓮包含10mg穿心蓮內(nèi)酯。**3".!3mg姜黃提取物包含316.7mg姜黃素。***14.4mg刺五加提取物等同于240rag刺五加根提取物。將穿心蓮、姜黃、刺五加、胡椒堿、聚乙烯吡咯烷酮、纖維素和一半量的交聯(lián)羧曱基纖維素納與少量水混合至成顆粒。將顆粒烘干以移除水分,然后研磨該共混物。然后加入剩余一半量的交聯(lián)羧曱基纖維素納和硬脂酸鎂并混合全部共混物。將所得粉末共混物壓制成片劑,每片含量為600mg。該片劑可任選地涂覆有糖或膜包衣。劑量為每天服三次,每次服兩片。實施例G因為鼻病毒感染后多個趨化因子可能發(fā)生上調(diào),用于阻遏趨化性的方法為使用廣譜趨化因子受體拮抗劑。PBMC通常為單核細胞和淋巴細胞的混合物,即,已分離并移除了粒細胞的血液白細胞。P腦C能用熒光染料標i己,^口CellTrackerGreen,4尋自LonzaGroupLtd.,Basel,Switzerland,并能監(jiān)控響應于趨化因子的遷移抑制。趨化性遷移可由SDFla(Stromal來源的因子-lcx)誘導,SDFla得自USBiological,Swampscott,Massachusetts。SDFla可通過結(jié)合到發(fā)生在PBMC,s上的趨化性受體上誘導趨化性遷移,如CXCR4和其他可發(fā)生在PBMC,s上的受體。當應用潛在的趨化抑制劑時可觀察到趨化性遷移的抑制,趨化抑制劑如vMIP-II(病毒巨噬細月包炎性蛋白-II),得自Sigma-Aldrich,St.Louis,Missouri.vMIP-II能結(jié)合到趨化性受體上,如CCR2、CCR5和其他可發(fā)生在PBMC,s上的受體。趨化抑制劑可顯示對趨化現(xiàn)象的部分或完全抑制,并且可顯示出劑量依賴性。vMIP-II(濃度pg/mL)%抑制SDFla誘導的趨化作用0.0156450%0.22100%實施例H受試化合物如乙氧喹啉、丁子香酚或二氫丁子香酚,得自Sigma-Aldrich,St.Louis,Missouri,能使用純化酶^企測分析其對環(huán)加氧酶活性的抑制。受試化合物可通過使它們分別接觸鼻病毒感染的細胞來檢測分析它們對前列腺素生成的抑制。用于前列腺素的檢測分析法得自CisbioInternational,BedfordMassachusetts。——種適合鼻病毒感染6力纟田月包系是A549(ATCC命名CCL-185),—種人肺癌上皮細胞,得自ATCC,Manassas,Virginia。可將測試結(jié)果才艮道為IC50(抑制劑濃度50%),PGE2形成或COX-1或COX-2活性濃度是它最大值的二分之一。COX檢測分析法得自CaymanChemical,AnnArbor,Michigan?;衔颕C50(uM)PGE2形成C0X-1活性COX-2活性乙氧喹啉0.0345954丁子香酚0.424215二氫丁子香酚0.38827540實施例I受試化合物如姜黃素(得自Sigma-Aldrich,St.LouisMissouri)和Rol069920(得自CalBiochera,EMDBiosciences,DarmstadtGermany)能通過4吏用NF—kBActivationHitKitHCSReagentKit"尋自Cellomics,Pittsburgh,PA)測量NF-kB遷移的減少來檢測分析其對NF-kB活性的抑制。受試化合物可通過使它們分別接觸已感染鼻病毒的細胞或已用IL1(3活化的細胞來檢測分析其對NF-kB轉(zhuǎn)移的抑制。兩種適于感染鼻病毒的細胞系是A549(人肺癌上皮細胞,ATCCCCL-185)和BEAS-2B(人支氣管上皮細胞系,ATCCCRL-9609)。在這個實施例中,兩種類型的細胞都用ILlb(0.05ng/mL用于A549細胞,0.5ng/mL用于BEAS-2B細胞)預處理30分鐘以刺激NF-kB在加入測試抑制劑前轉(zhuǎn)移到核中。在加入測試抑制劑后,將所述細胞再培養(yǎng)30分鐘。固定細胞并使用CellomicsNFKBActivationHitKitHCSReagentKit片企測分4斤??蒦夸測試結(jié)果報道為IC50(抑制劑濃度50%),NF-kB的轉(zhuǎn)移濃度是它最大值的二分之一。ILlb誘導的NFkB核轉(zhuǎn)運的IC50(uM)化合物A549BEAS-2BRol0699206.70.8姜黃素37.55.9實施例J可將來自綠茶(茶)提取物的組分如表沒食子兒茶素和表沒食子兒茶素沒食子酸酯置于接近ICAM-1(由表I基因編碼的人鼻病毒受體)處。所述組分與ICAM-1表達物的結(jié)合程度可以通過標準竟爭性結(jié)合檢測分析法確定??筛鶕?jù)這些牢固結(jié)合ICAM-1的組分抑制病毒結(jié)合及攝入的效應,將其鑒定為涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。本文所公開的量綱和值不旨在被理解為嚴格地限于所述的精確值。相反,除非另外指明,每個這樣的量綱旨在表示所引用的數(shù)值和圍繞該數(shù)值的功能上等同的范圍。例如,公開為"40mm"的量綱旨在表示"約40mm',。引用均不可解釋為承認其是本發(fā)^的現(xiàn)'有技術。、^八鄉(xiāng)'°'''雖然已經(jīng)舉例說明和描述了本發(fā)明的具體實施方案,但是對于本領域技術人員來說顯而易見的是,在不脫離本發(fā)明實質(zhì)和范圍的情況下可以估支出多個其他改變和變型。因此,旨在在隨附權(quán)利要求書中包括屬于本發(fā)明范圍內(nèi)的所有這些改變和變型。表I:<table>tableseeoriginaldocumentpage42</column></row><table>205640一at醛脫氫酶3家族成員BlALDH3B1211004—s—at醛脫氫酶3家族成員BlALDH3B1203609一s一at醛脫氫酶5家族成員Al(琥珀酸半醛脫氫酶)ALDH5A1209901丄at同種異體移植炎癥因子1AIF1213095_x_at同種異體移植炎癥因子1AIF1215051—x_at同種異體移植炎癥因子1AIF11552698—ata類微管蛋白MGC16703205156—S-at阿米洛利敏感陽離子通道2,神經(jīng)元ACCN21555284—at肌萎縮性側(cè)索硬化2(青少年)ALS2211110—s一at雄性激素受體(二氫睪酮受體;睪丸雌性化;脊髓延髓肌萎縮癥;甘乃迪氏癥)AR219962_at血管緊張素I轉(zhuǎn)化酶(肽酰-二肽酶A)2ACE2210486—at錨蛋白重復域和MYND域1ANKMY1238439—at錨蛋白重復域22ANKRD22239196—at錨蛋白重復域22ANKRD22211712—s—at膜聯(lián)蛋白A9AMA9210873丄at載脂蛋白BmRNA編輯酶,催化多肽樣3AAP0BEC3A轉(zhuǎn)錄物ID名稱首字母縮寫209546-s—at載脂蛋白L,1AP0L1221653丄at栽脂蛋白L,2AP0L2221087—s_at載脂蛋白L,3AP0L31555600-s—at載脂蛋白L,4AP0L4223801—s-at載脂蛋白L,4AP0L4219716—at載脂蛋白L,6AP0L6241869—at載脂蛋白L,6AP0L6221241—s—at凋亡調(diào)節(jié)子BCL-GBCLG204446-s—at花生四烯酸5-脂氧合酶AL0X5214366—s—at花生四烯酸5-脂氧合酶AL0X5204445—s—at花生四烯酸5-脂氧合酶AL0X5213952—s—at花生四烯酸5-脂氧合酶AL0X5238878-at無芒相關同源框ARX223794—at含犰狳蛋白重復4ARMC4205969-at芳香乙酰胺脫乙?;?酯酶)AADAC215407墨s一at星形肌動蛋白2ASTN2213138—atAT富含結(jié)合結(jié)構(gòu)域5A(MRF1樣)ARID5A232265—at失調(diào)蛋白.ataxin7樣1ATXN7L1237400—atATP合酶,H+轉(zhuǎn)運,線粒體FG復合物,亞基s(因子B)ATP5S239859—x_atATP合酶,H+轉(zhuǎn)運,.線粒體FQ復合物,亞基s(因子B)ATP5S214255—atATP酶,V類,10A型ATP10A207583—atATP結(jié)合盒,亞家族D(ALD),成員2ABCD2206076—atB7基因B7205662_atB9蛋白EPPB9210534-S—atB9蛋白EPPB9210538一s一at含桿狀病毒IAP重復3BIRC3221530-s-at含堿性螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)域,B類,3BHLHB3220766—atB細胞轉(zhuǎn)位基因4BTG4203728—atBCL2拮抗劑/殺傷劑1BAK1221241丄atBCL2樣14(促凋亡劑)BCL2L14220087—atP胡蘿卜素15,15'-單氧酶lBCM0143<table>tableseeoriginaldocumentpage44</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage45</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage46</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage47</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage48</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage49</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage50</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage51</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage52</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage53</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage54</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage55</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage56</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage57</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage58</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage59</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage60</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage61</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage62</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage63</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage64</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage65</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage66</column></row><table>表n:蛋白、受體、酶、蛋白產(chǎn)物、蛋白產(chǎn)物受體和表達調(diào)節(jié)子的種<table>tableseeoriginaldocumentpage66</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage67</column></row><table>權(quán)利要求1.一種用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,所述方法包括a.使至少一種化合物接觸靶,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的蛋白、表I基因的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的蛋白受體、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;b.確定所述化合物是否與所述靶結(jié)合;以及c.鑒定那些與所述靶結(jié)合的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。2.如權(quán)利要求l所述的方法,所述方法包括至少兩種化合物。3.—種用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,所述方法包括a.使至少一種化合物接觸包含靶的鼻病毒感染模型體系,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的蛋白、表I基因的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的蛋白受體、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;b.進一步確定所述化合物是否調(diào)節(jié)鼻病毒感染模型體系中的鼻病毒感染;以及c.鑒定那些在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。4.如權(quán)利要求3所述的方法,所述方法包括至少兩種化合物。5.如權(quán)利要求1所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求1的步驟(c)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)所述哺乳動物的鼻病毒感染,其中調(diào)節(jié)所述哺乳動物鼻病毒感染的化合物被鑒定為用于體內(nèi)調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。6.如權(quán)利要求1所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求1的步驟(c)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)對所述哺乳動物的鼻病毒感染的響應,其中調(diào)節(jié)對所述哺乳動物鼻病毒感染的響應的化合物被筌定為用于體內(nèi)調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。7.如權(quán)利要求3所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求3的步驟(c)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)所述哺乳動物的鼻病毒感染,其中調(diào)節(jié)所述哺乳動物鼻病毒感染的化合物被鑒定為用于體內(nèi)調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。8.—種用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,所述方法包括a.使至少一種化合物接觸包含靶的鼻病毒感染模型體系,所述靶選自下列表I中鑒定的基因、由表I基因編碼的蛋白、表I基因的表達調(diào)節(jié)子、由表I基因編碼的蛋白受體、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物、由表I基因編碼的蛋白產(chǎn)物的受體、以及它們的組合;b.進一步確定所述化合物是否在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)對鼻病毒感染的響應;以及c.鑒定那些在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)對鼻病毒感染響應的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。9.如權(quán)利要求8所述的方法,所述方法包括至少兩種化合物。10.如權(quán)利要求8所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求8的步驟(c)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)對所述哺乳動物的鼻病毒感染的響應,其中調(diào)節(jié)對所述哺乳動物鼻病毒感染的響應的化合物被鑒定為用于體內(nèi)調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。11.一種用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法a.使至少一種化合物接觸表達由表I基因編碼和由表II中鑒定的蛋白的細胞群;b.確定并比較接觸所述化合物的所述細胞群中的蛋白活性水平與不接觸所述化合物的所述細胞群中的蛋白活性水平;以及C.鑒定那些與不接觸所述化合物的所述細胞群中的蛋白活性相比,在接觸所述化合物的所述細胞群中調(diào)節(jié)蛋白活性的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。12.如權(quán)利要求11所述的方法,所述方法還包括d.進一步確定在權(quán)利要求11的步驟(c)中鑒定的所述化合物是否調(diào)節(jié)鼻病毒感染模型體系中的鼻病毒感染;以及e.鑒定那些在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物用于為調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。13.如權(quán)利要求11所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求11的步驟(c)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)所述哺乳動物的鼻病毒感染,其中調(diào)節(jié)所述哺乳動物鼻病毒感染的化合物被鑒定為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。14.如權(quán)利要求12所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求12的步驟(e)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)所述哺乳動物的鼻病毒感染,其中調(diào)節(jié)所述哺乳動物鼻病毒感染的化合物被鑒定為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。15.—種用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,所述方法包括a.使至少一種化合物接觸表達由表I基因編碼和由表II中鑒定的蛋白的細胞群;b.確定并比較接觸所述化合物的所述細胞群中的蛋白表達水平與不接觸所述化合物的所述細胞群中的蛋白表達水平;以及c.鑒定那些與不接觸所述化合物的細胞群中的蛋白表達相比,在接觸所述化合物的細胞群中調(diào)節(jié)蛋白表達的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。16.如權(quán)利要求15所述的方法,所述方法還包括d.確定在權(quán)利要求15的步驟(c)中鑒定的所述化合物是否調(diào)節(jié)鼻病毒感染模型體系中的鼻病毒感染;以及e.鑒定那些在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。17.如權(quán)利要求15所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求15的步驟(c)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)所述哺乳動物的鼻病毒感染,其中調(diào)節(jié)所述哺乳動物鼻病毒感染的化合物被鑒定為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。18.如權(quán)利要求16所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求16的步驟(e)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)所述哺乳動物的鼻病毒感染,其中調(diào)節(jié)所述哺乳動物鼻病毒感染的化合物被鑒定為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。19.一種用于鑒定調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物的方法,所述方法包括a.使至少一種化合物接觸表達表I中鑒定的基因的細胞群;b.確定并比較接觸所述化合物的所述細胞群中的基因表達水平與不接觸所述化合物的所述細胞群中的基因表達水平;以及c.鑒定那些與不接觸所述化合物的細胞群中的基因表達相比,在接觸所述化合物的細胞群中調(diào)節(jié)基因表達的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。20.如權(quán)利要求19所述的方法,所述方法還包括d.確定在權(quán)利要求19的步驟(c)中鑒定的所述化合物是否調(diào)節(jié)鼻病毒感染模型體系中的鼻病毒感染;以及e.鑒定那些在鼻病毒感染模型體系中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。21.如權(quán)利要求19所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求19的步驟(c)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)所述哺乳動物的鼻病毒感染,其中調(diào)節(jié)所述哺乳動物鼻病毒感染的化合物被鑒定為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。22.如權(quán)利要求20所述的方法,所述方法還包括給哺乳動物施用在權(quán)利要求20的步驟(e)中鑒定的所述化合物,并且確定所述化合物是否調(diào)節(jié)所述哺乳動物的鼻病毒感染,其中調(diào)節(jié)所述哺乳動物鼻病毒感染的化合物被鑒定為用于調(diào)節(jié)鼻病毒感染的化合物。23.—種用于診斷鼻病毒感染的方法,所述方法包括a.確定生物樣本中一種或多種靶的表達譜,所述靶選自涉及生物樣本中表I和表II中鑒定的鼻病毒感染的靶;或測量生物樣本中表II中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種蛋白的表達水平或活性;b.比較生物樣本中鑒定的一種或多種草巴的表達水平與來自對照樣本或數(shù)據(jù)庫的一種或多種耙的表達水平,或比較來自樣本的所述蛋白的表達水平或活性分布與來自對照樣本或數(shù)據(jù)庫的所述蛋白的表達水平或活性分布,其中與對照物水平的顯著差異指示鼻病毒感染的癥狀發(fā)展。24.—種監(jiān)控鼻病毒感染進程的方法,所述方法包括a.確定生物樣本中表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種基因的基因表達譜;或制備來自合適鼻病毒感染模型體系的生物樣本中的表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種蛋白的蛋白表達譜或蛋白活性分布;b.在實施所述治療方案后的合適時間之后制備類似于步驟(a)的表達譜或活性分布;c.在所述治療期間重復步驟(b)并評估所述數(shù)據(jù)以監(jiān)控鼻病毒感染的進程。25.—種監(jiān)控具有鼻病毒感染癥狀發(fā)展的患者的疾病治療或進程的方法,該方法包4舌a.確定生物樣本中表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種基因的基因表達譜;或制備受試者生物樣本中的表I中鑒定的涉及調(diào)節(jié)鼻病毒感染的一種或多種蛋白的蛋白表達譜或蛋白活性分布;b.對所述受試者施用治療方案;c.在實施所述治療方案后的合適時間之后制備來自所述受試者生物樣本的類似于步驟(a)的表達譜或活性分布;d.比較所述治療前和治療后的所述表達譜或活性分布;以及e.在所述治療或疾病期間重復所述步驟(b)、(c)和(d)并26.—種藥用組合物,所述組合物包含a.安全和有效量的至少一種化合物,所述化合物通過如權(quán)利要求1所述的方法鑒定;和b.藥用的載體。27.—種藥用組合物,所述組合物包含安全和有效量的通過權(quán)利要求1的方法鑒定的至少一種化合物。28.—種藥用組合物,所述組合物包含安全和有效量的通過權(quán)利要求3的方法鑒定的至少一種化合物。29.—種藥用組合物,所述組合物包含安全和有效量的通過權(quán)利要求8的方法鑒定的至少一種化合物。30.—種藥用組合物,所述組合物包含安全和有效量的通過權(quán)利要求11的方法鑒定的至少一種化合物。31.—種藥用組合物,所述組合物包含安全和有效量的通過權(quán)利要求15的方法鑒定的至少一種化合物。32.—種藥用組合物,所述組合物包含安全和有效量的通過權(quán)利要求19的方法鑒定的至少一種化合物。33.—種用于在需要此類調(diào)節(jié)的受試者中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的方法,所述方法包括a.鑒定需要調(diào)節(jié)鼻病毒感染的受試者;以及b.給所述受試者施用安全和有效量的通過權(quán)利要求1的方法鑒定的至少一種化合物。34..如權(quán)利要求33所述的方法,其中所需的鼻病毒感染調(diào)節(jié)是減輕所述受試者的鼻病毒感染。35.—種用于在需要此類調(diào)節(jié)的受試者中調(diào)節(jié)鼻病毒感染的方法,所述方法包4舌a.鑒定需要調(diào)節(jié)鼻病毒感染的受試者;以及b.給所述受試者施用安全和有效量的通過權(quán)利要求3的方法鑒定的至少一種化合物。36.如權(quán)利要求35所述的方法,其中所需的鼻病毒感染調(diào)節(jié)是減輕所述受試者的鼻病毒感染。全文摘要本發(fā)明提供用于鑒定可調(diào)節(jié)鼻病毒感染的基因、表達調(diào)節(jié)子、受體、蛋白質(zhì)產(chǎn)物受體和蛋白的方法??蓪㈣b定的基因用作疾病發(fā)作和進展的標記物并用于測量治療劑的功效。本發(fā)明也提供篩選能夠調(diào)節(jié)鼻病毒感染的試劑的方法。本發(fā)明也提供鑒定治療化合物的方法,所述治療化合物可通過調(diào)節(jié)已鑒定的基因、表達調(diào)節(jié)子、受體、蛋白產(chǎn)物受體、以及蛋白的表達和活性治療多種疾病。文檔編號G01N33/569GK101622540SQ200880006353公開日2010年1月6日申請日期2008年2月28日優(yōu)先權(quán)日2007年2月28日發(fā)明者埃米·安·瓦蘭斯基,杰弗里·沃倫·克萊默,瑪麗·林恩·江普,貝格尼亞·Y·霍,辛西婭·E·弗朗西斯申請人:寶潔公司