本發(fā)明屬于鱘魚遺傳育種與鱘魚分子標記輔助選育領域，具體涉及一種雌性鱘魚產(chǎn)卵量相關基因npffr1的分子標記及其應用。

背景技術：

1、魚子醬是由鱘魚卵鹽漬而成，營養(yǎng)價值和經(jīng)濟價值極高，被譽為“黑色黃金”，與松露、鵝肝并稱為世界三大美食，一直是歐美等國傳統(tǒng)的奢侈美食。因此，雌性鱘魚繁殖力高低是決定魚子醬產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的關鍵因素，早期選育具有高產(chǎn)卵量性狀的雌性鱘魚個體是當前鱘魚遺傳育種的主要任務。神經(jīng)肽ff受體1(neuropeptide?ff?receptor?1,npffr1)是促性腺激素抑制激素(gonadotropin?inhibitory?hormone,gnih)的主要受體，在調(diào)控動物生殖生理方面起著重要作用。gnih是下丘腦神經(jīng)肽的一種，也是目前發(fā)現(xiàn)的唯一一種對卵巢發(fā)育起抑制作用的神經(jīng)肽，結合g蛋白偶聯(lián)受體npffr1后通過“下丘腦-垂體-卵巢”軸直接參與性行為、發(fā)情周期調(diào)控、雌激素循環(huán)和卵泡發(fā)育等繁殖生理過程。

2、近年來，隨著現(xiàn)代分子生物學技術的迅速發(fā)展和后基因組時代的到來，單核苷酸多態(tài)性(single?nucleotide?polymorphism，snp)作為第三代分子標記技術在水產(chǎn)動物分子育種研究中得以廣泛應用，同時在優(yōu)良品種選育過程中也發(fā)揮重要作用。由此可見，開發(fā)經(jīng)濟性狀相關的分子標記，對于縮短世代間隔，提高優(yōu)良性狀早期選育效率/準確性具有重要意義。到目前為止，現(xiàn)有技術中并未記載npffr1基因調(diào)控區(qū)存在與鱘魚產(chǎn)卵量性狀相關的snp分子標記。

技術實現(xiàn)思路

1、為了便于鑒定雌性鱘魚的產(chǎn)卵量性狀，本發(fā)明提供一種雌性鱘魚產(chǎn)卵量性狀相關基因npffr1的分子標記及其在人工育種中的應用，利用該snp分子標記可以鑒定雌性鱘魚產(chǎn)卵量性狀。此snp位點與雌性鱘魚產(chǎn)卵量性狀具有明顯的關聯(lián)性，因此通過鑒定雌性鱘魚該snp位點的基因型，可實現(xiàn)早期選育具有高產(chǎn)卵量性狀的雌性鱘魚個體。

2、為實現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采取以下技術方案：

3、本發(fā)明提供一種雌性鱘魚產(chǎn)卵量相關基因npffr1的分子標記。鑒定雌性鱘魚產(chǎn)卵量高低的snp分子標記位于npffr1基因核苷酸序列片段(seq?id?no:1)的第78bp處；其多態(tài)性形式為a/g，其中，堿基突變位點的基因型包括aa、ag或gg。

4、進一步的，檢測上述snp分子標記的引物對核苷酸序列為：

5、正向引物f：5’-ttcaacacagccttcgcttac-3’，即seq?id?no:2；

6、反向引物r：5’-cggcattacagaatagcaa-3’，即seq?id?no:3。

7、一種所述分子標記或所述引物對在鑒定雌性鱘魚產(chǎn)卵量高低中的應用，包括以下步驟：

8、步驟一、從待測鱘魚鰭條組織中提取基因組dna；

9、步驟二、使用上述引物對對鱘魚基因組dna進行pcr擴增得到npffr1基因核苷酸序列片段，即seq?id?no:1；

10、步驟三、檢測pcr擴增產(chǎn)物第78bp處的基因型；其中，基因型為aa的雌性個體屬于高產(chǎn)卵量個體(卵重/體重>0.2)，基因型為ag、gg的雌性個體屬于低產(chǎn)卵量個體(卵重/體重<0.15)。

11、與現(xiàn)有技術相比，本發(fā)明的有益效果是：

12、本發(fā)明提供了一種與雌性鱘魚產(chǎn)卵量性狀相關聯(lián)的snp分子標記，所述snp分子標記位于鱘魚nc_081234.1號染色體npffr1基因的第11249bp處，即npffr1基因核苷酸序列片段(seq?id?no:1)的第78bp處；該分子標記上存在a/g堿基突變，與雌性鱘魚產(chǎn)卵量性狀具有顯著相關性，其中aa基因型的個體產(chǎn)卵量性狀顯著高于ag、gg基因型，同時此snp分子標記位點基因分型結果與實際產(chǎn)卵量性狀匹配率可高達81.16％。本發(fā)明提供的分子標記能夠用于雌性鱘魚產(chǎn)卵量性狀的早期選育，可以在施氏鱘、達氏鰉、西伯利亞鱘和雜交鱘等多種雌性鱘魚個體中進行篩選，鱘魚產(chǎn)卵量性狀相關基因npffr1的該snp分子標記為分子標記輔助選擇具有高產(chǎn)卵量性狀的鱘魚品系奠定基礎，可顯著加快高產(chǎn)卵量品種選育的人工育種進程。

13、本發(fā)明通過檢測snp分子標記的優(yōu)勢等位基因型，能夠明顯縮短人工選育高產(chǎn)卵量雌性鱘魚的育種時間，從而降低繁殖成本，有效提高鱘魚養(yǎng)殖業(yè)的經(jīng)濟效益，以促進鱘魚繁殖力性狀遺傳改良的進展。

技術特征：

1.一種雌性鱘魚產(chǎn)卵量相關基因npffr1的分子標記，其特征在于：鑒定鱘魚產(chǎn)卵量高低的snp分子標記位于npffr1基因核苷酸序列片段seq?id?no:1的第78bp處；其多態(tài)性形式為a/g，其中，堿基突變位點的基因型包括aa、ag或gg。

2.一種檢測權利要求1所述的雌性鱘魚產(chǎn)卵量相關基因npffr1分子標記的引物對，其特征在于：檢測上述snp分子標記的引物對的核苷酸序列為：

3.一種權利要求1所述的分子標記或權利要求2所述的引物對在鑒定雌性鱘魚產(chǎn)卵量高低中的應用。

4.根據(jù)權利要求3所述的應用，其特征在于，包括以下步驟：

技術總結
一種雌性鱘魚產(chǎn)卵量相關基因npffr1的分子標記及其應用，屬于鱘魚遺傳育種與鱘魚分子標記輔助選育領域。鑒定鱘魚產(chǎn)卵量高低的SNP分子標記位于npffr1基因核苷酸序列片段的第78bp處；其多態(tài)性形式為A/G，其中，堿基突變位點的基因型包括AA、AG或GG。其中，基因型為AA的雌性個體屬于高產(chǎn)卵量個體，基因型為AG、GG的雌性個體屬于低產(chǎn)卵量個體。本發(fā)明提供的分子標記能夠用于雌性鱘魚產(chǎn)卵量性狀的早期選育，可以在施氏鱘、達氏鰉、西伯利亞鱘和雜交鱘等多種鱘魚雌性群體中進行篩選，能夠顯著加快高產(chǎn)卵量鱘魚品種選育的人工育種進程。

技術研發(fā)人員：李禹韜,王若愚,張穎,馬波
受保護的技術使用者：中國水產(chǎn)科學研究院黑龍江水產(chǎn)研究所
技術研發(fā)日：
技術公布日：2025/1/6