本發(fā)明涉及生物中一種通過抑制水稻中ostrxh1基因的表達(dá)提高水稻稻瘟病抗性的方法。
背景技術(shù):
1、稻瘟病是水稻生產(chǎn)中的重要真菌病害,嚴(yán)重影響了水稻產(chǎn)量和品質(zhì),威脅糧食安全。培育抗病品種是防治稻瘟病最經(jīng)濟(jì)有效的措施,r基因賦予水稻較高的抗性,也一直是科學(xué)家研究的熱點。但是r基因在育種中也存在一些問題,如大部分r基因抗譜較窄,在高選擇壓下,小種變異加快,導(dǎo)致抗性品種在幾年內(nèi)喪失抗性。多個r基因疊加雖然能增加抗譜,降低被快速克服的概率,但是也通常會引起產(chǎn)量或品質(zhì)的代償作用。因此,需要挖掘抗譜寬,且對產(chǎn)量影響較小的基因資源。
2、近年來,crispr/cas9基因編輯技術(shù)迅速發(fā)展,該系統(tǒng)可以利用一段短rna(single-guide?rna,sgrna)引導(dǎo)核酸內(nèi)切酶cas9對靶序列進(jìn)行切割,實現(xiàn)對靶標(biāo)基因的突變,大大拓展了研究人員對基因功能的研究,被science評為2013年度十大科技進(jìn)展之一。目前,該系統(tǒng)已成功應(yīng)用于水稻、水稻、高粱、玉米等糧食作物,為保障糧食安全和創(chuàng)制非轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品提供了新的契機。
3、在植物與病原菌互作過程中,病原菌分泌的效應(yīng)蛋白通過不同的方式“劫持”或“利用”植物基因,最終實現(xiàn)對植物的進(jìn)一步侵染,這類植物基因被稱為感病基因(s基因)。如果效應(yīng)蛋白在不同的病原菌中保守,可能調(diào)控不同的病害。利用crispr/cas9基因編輯技術(shù)對這類s基因進(jìn)行突變,可使植物獲得對多種病原菌的抗性,這些基因多數(shù)情況下不影響作物的關(guān)鍵農(nóng)藝性狀,這也成為一種新的培育抗病品種的方法。目前已報道多個感病基因,如水稻tapsipk1是一個感病基因,crispr/cas9介導(dǎo)的tapsipk1基因編輯突變體可以在不影響農(nóng)藝性狀的情況下,增強水稻對條銹病的廣譜抗性。此外,玉米的zmnanmt、水稻的rod1、番茄的sldmr6-1也被證明是感病基因,這些基因突變后均能賦予植物對不同病原菌的抗性。綜上所述,挖掘更多的感病新基因,解析相關(guān)作用通路,可以為通過基因編輯技術(shù)獲得抗病植物新品種提供候選基因資源。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是如何提高水稻對稻瘟病的抗性。
2、為了解決以上技術(shù)問題,本發(fā)明的第一個目的是提供了一種提高水稻稻瘟病抗性的方法,包括如下步驟:抑制受體水稻中ostrxh1基因的表達(dá),得到稻瘟病抗性高于所述受體水稻的目的水稻;所述ostrxh1基因為編碼ostrxh1蛋白的基因;所述ostrxh1蛋白是如下a1、a2或a3的蛋白質(zhì):
3、a1、氨基酸序列是序列表中seq?id?no.2所示的氨基酸序列的蛋白質(zhì);
4、a2、將序列表中seq?id?no.2所示的氨基酸序列經(jīng)過氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加得到的與a1所示的蛋白質(zhì)具有80%以上的同一性且與水稻稻瘟病抗性相關(guān)的蛋白質(zhì);
5、a3、在a1或a2的n末端或/和c末端連接蛋白標(biāo)簽得到的融合蛋白質(zhì)。
6、上述方法中,所述蛋白質(zhì)標(biāo)簽(protein-tag)是指利用dna體外重組技術(shù),與目的蛋白質(zhì)一起融合表達(dá)的一種多肽或者蛋白質(zhì),以便于目的蛋白質(zhì)的表達(dá)、檢測、示蹤和/或純化。所述蛋白質(zhì)標(biāo)簽可為flag標(biāo)簽、his標(biāo)簽、mbp標(biāo)簽、ha標(biāo)簽、myc標(biāo)簽、gst標(biāo)簽和/或sumo標(biāo)簽等,部分可用標(biāo)簽的氨基酸序列見表1。
7、表1標(biāo)簽的序列
8、 標(biāo)簽 殘基 序列 poly-arg 5-6(通常為5個) rrrrr poly-his 2-10(通常為6個) hhhhhh flag 8 dykddddk strep-tag?ii 8 wshpqfek c-myc 10 eqkliseedl
9、上述方法中,seq?id?no.2由122個氨基酸殘基組成。
10、上述方法中,同一性是指氨基酸序列的同一性??墒褂脟H互聯(lián)網(wǎng)上的同源性檢索站點測定氨基酸序列的同一性,如ncbi主頁網(wǎng)站的blast網(wǎng)頁。例如,可在高級blast2.1中,通過使用blastp作為程序,將expect值設(shè)置為10,將所有filter設(shè)置為off,使用blosum62作為matrix,將gap?existence?cost,per?residue?gap?cost和lambda?ratio分別設(shè)置為11,1和0.85(缺省值)并進(jìn)行檢索一對氨基酸序列的同一性進(jìn)行計算,然后即可獲得同一性的值(%)。
11、上述方法中,所述80%以上的同一性可為至少81%、85%、90%、91%、92%、95%、96%、98%、99%或100%的同一性。
12、上述方法中,所述提高水稻稻瘟病抗性,具體可表現(xiàn)為感染稻瘟病病原菌后目的水稻葉片上的病斑長度(病斑面積)較受體水稻短(小),目的水稻葉片上稻瘟病病原菌生物量較受體水稻少。
13、上述方法中,所述ostrxh1基因具體可為如下e1或e2所示的基因:
14、e1、編碼鏈的編碼序列是seq?id?no.1的dna分子;
15、e2、核苷酸序列是seq?id?no.3第3001-4990位的dna分子。
16、上述方法中,所述抑制水稻中ostrxh1基因的表達(dá)是通過對受體水稻中ostrxh1基因進(jìn)行基因編輯實現(xiàn)的。所述基因編輯是借助crispr/cas9系統(tǒng)實現(xiàn)的。
17、上述方法中,所述crispr/cas9系統(tǒng)包括表達(dá)含有cas9和sgrna的載體,所述sgrna的靶序列為序列表中seq?id?no.3第3119-3138位和seq?id?no.3第4330-4349位。
18、為了解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明還提供了抗稻瘟病的植物試劑,所述試劑的活性成分為抑制編碼所述ostrxh1蛋白的基因的表達(dá)、降低所述ostrxh1蛋白的豐度、和/或敲除編碼所述ostrxh1蛋白的基因的物質(zhì)。
19、上述抗稻瘟病的試劑中,所述物質(zhì)含有下述f1、f2或f3:
20、f1、靶向所述基因的sgrna、sirna、shrna、mirna或反義rna;
21、f2、產(chǎn)生靶向所述基因的sgrna的dna分子、產(chǎn)生靶向所述基因的sirna的dna分子、產(chǎn)生靶向所述基因的shrna的dna分子、產(chǎn)生靶向所述基因的mirna的dna分子或產(chǎn)生靶向所述基因的反義rna的dna分子;
22、f3、產(chǎn)生靶向所述基因的sgrna的表達(dá)載體、產(chǎn)生靶向所述基因的sirna的表達(dá)載體、產(chǎn)生靶向所述基因的shrna的表達(dá)載體、產(chǎn)生靶向所述基因的mirna的表達(dá)載體或產(chǎn)生靶向所述基因的反義rna的表達(dá)載體。
23、上述抗稻瘟病的試劑的活性成分還可含有其他生物成分或/和非生物成分,上述藥劑的其他活性成分本領(lǐng)域技術(shù)人員可根據(jù)植物的抗病效果確定。
24、本發(fā)明還提供ostrxh1蛋白,所述ostrxh1蛋白是如下a1、a2或a3的蛋白質(zhì):
25、a1、氨基酸序列是序列表中seq?id?no.2所示的氨基酸序列的蛋白質(zhì);
26、a2、將序列表中seq?id?no.2所示的氨基酸序列經(jīng)過氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加得到的與a1所示的蛋白質(zhì)具有80%以上的同一性且與水稻稻瘟病抗性相關(guān)的蛋白質(zhì);
27、a3、在a1或a2的n末端或/和c末端連接蛋白標(biāo)簽得到的融合蛋白質(zhì)。
28、本發(fā)明還提供與ostrxh1蛋白相關(guān)的生物材料,為下述b1至b5中的任一種:
29、b1、編碼所述蛋白質(zhì)ostrxh1的核酸分子;
30、b2、含有b1所述核酸分子的表達(dá)盒;
31、b3、含有b1所述核酸分子的重組載體、或含有b2所述表達(dá)盒的重組載體;
32、b4、含有b1所述核酸分子的重組微生物、或含有b2所述表達(dá)盒的重組微生物、或含有b3所述重組載體的重組微生物;
33、b5、含有b1所述核酸分子的轉(zhuǎn)基因植物細(xì)胞系、轉(zhuǎn)基因植物細(xì)胞系、轉(zhuǎn)基因植物組織或轉(zhuǎn)基因植物器官、或含有b2所述表達(dá)盒的轉(zhuǎn)基因植物細(xì)胞系、轉(zhuǎn)基因植物細(xì)胞系、轉(zhuǎn)基因植物組織或轉(zhuǎn)基因植物器官。
34、其中,所述核酸分子可以是dna分子,如cdna、基因組dna或重組dna;所述核酸分子也可以是rna分子,如mrna或hnrna等。
35、上述生物材料中,b1所述核酸分子為如下e1或e2所示的基因:
36、e1、編碼鏈的編碼序列是seq?id?no.1的dna分子;
37、e2、核苷酸序列是seq?id?no.3第3001-4990位的dna分子。
38、本發(fā)明還保護(hù)crispr/cas9系統(tǒng),所述crispr/cas9系統(tǒng)包括表達(dá)含有cas9和sgrna的載體,所述sgrna的靶序列為序列表中seq?id?no.3第3119-3138位和seq?id?no.3第4330-4349位。
39、接種實驗表明,與受體水稻相比,ostrxh1敲除水稻株系對稻瘟病的抗性增強,ostrxh1過表達(dá)水稻株系對稻瘟病的抗性減弱,說明ostrxh1是與植物抗病相關(guān)的基因。本發(fā)明的方法操作簡單,成本低,大大加快了育種進(jìn)程,具有廣泛的應(yīng)用前景。