本發(fā)明申請涉及豬分子標記篩選，具體涉及一種影響豬體長性狀的snp分子標記及應用。

背景技術：

1、豬體長是衡量豬體型和評估其生產(chǎn)性能的關鍵指標，它反映了豬的遺傳多樣性，與豬的生長速度、飼料轉(zhuǎn)化效率和瘦肉率等生產(chǎn)性能指標緊密相關。長期以來，人們通過對豬體長進行傳統(tǒng)的表型選擇，以改良豬的生產(chǎn)性能，這種方式使豬體長性狀在一定程度上得到了改良，但體長是數(shù)量性狀，在遺傳上受多基因調(diào)控，單純的表型選擇方法往往會造成選擇效應有限、效果緩慢的問題。

2、公開于該背景技術部分的信息僅用于加深對本公開的背景技術的理解，而不應當被視為承認或以任何形式暗示該信息構(gòu)成本領域技術人員所公知的現(xiàn)有技術。

技術實現(xiàn)思路

1、本發(fā)明的目的在于提供一種影響豬體長性狀的snp分子標記，并將其應用在基因型鑒定、遺傳育種等方面，旨在解決當前對豬體長相關性狀缺乏基因研究進而導致育種進展緩慢的技術問題。

2、利用豬全基因組重序列（whole?genome?sequencing，wgs），基于豬全基因組關聯(lián)分析策略（genome-wide?association?study，gwas）檢測、發(fā)現(xiàn)了影響豬體長性狀的snp分子標記，該snp分子標記為基于國際豬基因組11.1版本參考序列第17號染色體第16624558位堿基處存在g/a突變；將該snp分子標記運用到分子標記輔助選擇和基因組選擇中，能夠推進豬的遺傳改良進程以提高養(yǎng)殖的經(jīng)濟效益。

3、本申請公開的第一方面，涉及一種影響豬體長性狀的snp分子標記，基于國際豬基因組11.1版本參考序列，于17號染色體第16624558位堿基存在g/a轉(zhuǎn)換類型的單核苷酸多態(tài)性變異，記為突變位點g.16624558。

4、本申請公開的第二方面，將所述snp分子標記應用在制備選育/鑒定有關體長性狀的豬品種/品系的試劑中。

5、本申請公開的第三方面，將所述snp分子標記應用在選育/鑒定有關豬體長性狀的品種/品系中。

6、本申請公開的第四方面，涉及一種利用所述snp分子標記選擇/鑒定有關豬體長性狀的方法，包括以下步驟：

7、（1）通過豬的耳組織樣品提取全基因組dna；

8、（2）利用豬全基因組重測序?qū)λ鋈蚪Mdna進行掃描；

9、（3）獲取重測序數(shù)據(jù)，基于國際豬基因組11.1版本參考序列，查看17號染色體上第16624558個位點的基因型，判斷該位點的g/a多態(tài)性，基于aa基因型個體比ga或gg基因型個體具有更長體長的特征對豬體長性狀進行選擇/鑒定。

10、本申請公開的第五方面，涉及一種用于鑒定上述的snp分子標記的引物對，包含引物primer-f和primer-r，其核苷酸序列如下：

11、上游引物primer-f：5’-aactgtcacaacttggagg-3’；

12、下游引物primer-r：5’-tgtttttcctcaggtgtca-3’。

13、本申請公開第六方面，涉及一種提高生豬體長的品種/品系選育方法，包括如下步驟：

14、（1）基于國際豬基因組11.1版本參考序列，檢測確定豬群體17號染色體第16624558位點的基因型；

15、（2）選擇第16624558個位點為aa基因型的種豬個體，淘汰該位點為ga或gg基因型的種豬個體，以逐代提高該位點的等位基因a的頻率，從而提高后代豬的體長。

16、在本公開的一些實施例中，所述種豬為杜洛克豬、長白豬、大白豬及其合成系。

17、本申請實施例中提供的一個或多個技術方案，至少具有如下任一技術效果或優(yōu)點：

18、本申請確定了影響豬體長性狀的snp分子標記，基于國際豬基因組11.1版本參考序列，于17號染色體第16624558位點堿基處存在處g/a轉(zhuǎn)換類型的單核苷酸多態(tài)性變異，驗證了其對豬體長性狀的影響效應，通過優(yōu)選該分子標記的優(yōu)勢等位基因，提供了一種提高豬體長的品種/品系選育方法，最終建立了對豬體長性狀進行快速改良的分子標記輔助選擇育種技術，極大地改善了杜洛克豬、長白豬、大白豬及其合成系的選育進程，縮短了杜洛克、長白豬和大白豬改良的時間，適應種豬市場的需求，有效提高了種豬育種的經(jīng)濟效益。

技術特征：

1.一種影響豬體長性狀的snp分子標記，其特征在于，基于國際豬基因組11.1版本參考序列，于17號染色體上第16624558bp處存在g/a突變轉(zhuǎn)換類型的單核苷酸多態(tài)性變異。

2.權(quán)利要求1所述snp分子標記在制備選育/鑒定有關體長性狀的豬品種/品系的試劑中的應用。

3.權(quán)利要求1所述snp分子標記在選育/鑒定有關豬體長性狀的品種/品系中的應用。

4.一種利用權(quán)利要求1所述snp分子標記選擇/鑒定有關豬體長性狀的方法，其特征在于，包括以下步驟：

5.一種用于鑒定權(quán)利要求1所述的snp分子標記的引物對，其特征在于，包含引物primer-f和primer-r，其核苷酸序列如下：

6.一種提高生豬體長的品種/品系選育方法，其特征在于，包括如下步驟：

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的選育方法，其特征在于，所述種豬為杜洛克豬、長白豬、大白豬或其合成系。

技術總結(jié)
本發(fā)明申請公開了一種影響豬體長性狀的SNP分子標記及應用，旨在解決當前對豬體長相關性狀缺乏基因研究導致育種緩慢的技術問題。本申請利用豬全基因組序列，基于豬全基因組關聯(lián)分析策略檢測、發(fā)現(xiàn)了一種影響豬體長性狀的SNP分子標記，該分子標記基于國際豬基因組11.1版本參考序列17號染色體上第16624558bp處存在G/A突變轉(zhuǎn)換類型的單核苷酸多態(tài)性變異。檢測豬群體17號染色體上第16624558位點的基因型，可知該SNP位點（chr17:16624558）AA基因型個體比GG/GA基因型個體具有更長的體長，通過選擇有利基因型個體留種，淘汰不利基因型個體，可顯著提高豬體長，從而達到加快豬體長性狀遺傳進展的目的。

技術研發(fā)人員：喬瑞敏,朱紅倩,吳相哲,王小女,李新建,王子怡,朱玉峰,胡潘陽,張犇,方遠洋,余彤
受保護的技術使用者：河南農(nóng)業(yè)大學
技術研發(fā)日：
技術公布日：2025/1/2