本發(fā)明屬于植物分子生物學(xué)與植物遺傳工程領(lǐng)域,具體涉及一種正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的基因及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、白菜類作物屬于十字花科蕓薹屬,其遺傳資源豐富,包括多種重要的蔬菜和油料作物,是我國(guó)分布區(qū)域最廣、栽培種植面積最大且具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的作物。
2、葉片是植物最重要的器官之一,具有光合作用、蒸騰作用、營(yíng)養(yǎng)供給和水分運(yùn)輸?shù)裙δ?,影響作物的生理特性甚至產(chǎn)量。葉片形態(tài)變化影響植株葉面溫度、水分利用效率和光合作用強(qiáng)度,是植物對(duì)環(huán)境的一種適應(yīng)性表現(xiàn),是長(zhǎng)期自然選擇所形成的。裂葉性狀有助于密植從而有效利用光能,適當(dāng)?shù)拿苤彩翘岣咦魑锂a(chǎn)量的重要措施。此外,一些研究還表明,葉片形狀與植物抗逆性有關(guān),如抗旱性、抗寒性和耐鹽性。因此對(duì)葉緣裂刻相關(guān)基因的挖掘和功能驗(yàn)證,不僅對(duì)白菜類作物葉緣裂刻形成的分子機(jī)制研究具有重要意義,也將為其它相關(guān)作物葉緣性狀的遺傳改良提供參考。
3、在蕓薹屬植物中,葉緣裂刻性狀的遺傳分析和基因定位一直是研究的重點(diǎn)。rco作為hd-zip轉(zhuǎn)錄因子擬南芥同源分生組織identity1(lmi1)的串聯(lián)重復(fù)基因,與擬南芥at5g03790同源,已被證明在模式作物碎米薺和甘藍(lán)型油菜中可以調(diào)控植物復(fù)葉的形成,在arabidopsis?thaliana中表達(dá)rco增加了葉子的復(fù)雜性,對(duì)rco上游序列的分析表明,rco中的一個(gè)特定的增強(qiáng)子元件通過(guò)改變基因的遠(yuǎn)端表達(dá)從而改變了葉子形狀。
4、與傳統(tǒng)育種方式相比,crispr/cas9編輯技術(shù)的最大優(yōu)勢(shì)在于其精確性。傳統(tǒng)育種往往通過(guò)雜交、選擇和突變來(lái)改變物種特征,但這些方法往往費(fèi)時(shí)費(fèi)力并且會(huì)導(dǎo)致一些意外的變異。而基因編輯通過(guò)精準(zhǔn)的基因修飾,實(shí)現(xiàn)對(duì)特定基因的刪除、替換或轉(zhuǎn)錄調(diào)控等操作,從而達(dá)到精確質(zhì)的改良。同時(shí),基因編輯技術(shù)還大大節(jié)約時(shí)間和降低成本,通過(guò)選擇合適的基因編輯工具,可以將目標(biāo)基因的編輯時(shí)間從幾年縮短到幾個(gè)月或幾周。通過(guò)基因編輯技術(shù),減少了繁瑣的篩選步驟,降低了育種成本,為農(nóng)業(yè)領(lǐng)域研究的快速發(fā)展提供了可能。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的不足,本發(fā)明提供了一種正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的基因brrco的核苷酸序列及其編碼的氨基酸序列,構(gòu)建brrco基因的crispr/cas9敲除載體,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法侵染野生型白菜子葉柄,對(duì)白菜中該基因進(jìn)行敲除,從而對(duì)白菜brrco基因進(jìn)行功能驗(yàn)證,證明該基因?qū)Π撞巳~緣裂刻形成起到正向調(diào)控作用;本發(fā)明對(duì)正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的基因brrco的應(yīng)用,可以豐富白菜類作物葉緣裂刻遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為分子育種及提高此類作物品種適應(yīng)性提供技術(shù)支持。
2、為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明的技術(shù)方案為:
3、本發(fā)明第一方面,提供了一種正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的基因brrco,所述基因brrco的核苷酸序列如seq?id?no.1所示。
4、本發(fā)明第二方面,提供一種上述的正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的基因brrco編碼的蛋白質(zhì),所述蛋白質(zhì)的氨基酸序列如seq?id?no.2所示。
5、本發(fā)明第三方面,提供了包含所述基因brrco的重組質(zhì)粒。
6、本發(fā)明第四方面,提供了包含所述基因brrco的重組表達(dá)載體;或所述重組表達(dá)載體的工程菌或宿主細(xì)胞。
7、本發(fā)明第五方面,提供了上述基因brrco在正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的應(yīng)用;或者選育葉緣裂刻白菜的應(yīng)用;或者鑒定葉緣裂刻白菜的應(yīng)用。
8、本發(fā)明第六方面,提供了上述蛋白在正向調(diào)控白菜葉緣裂刻形成中的應(yīng)用;或者選育葉緣裂刻白菜的應(yīng)用;或者鑒定葉緣裂刻白菜的應(yīng)用。
9、上述技術(shù)方案中,進(jìn)一步地,正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的方法,包括以下(1)或(2)中任一:
10、(1)使白菜包含前述基因;
11、(2)使白菜表達(dá)前述蛋白。
12、本發(fā)明構(gòu)建正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的基因brrco的crispr/cas9編輯載體,命名為crispr-brrco,將構(gòu)建的基因brrco的crispr/cas9敲除載體,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法侵染野生型白菜子葉柄,對(duì)白菜中該基因進(jìn)行敲除,從而對(duì)白菜brrco基因進(jìn)行功能驗(yàn)證,證明該基因?qū)Π撞巳~緣裂刻形成起到正向調(diào)控作用。
13、上述技術(shù)方案中,進(jìn)一步地,選育葉緣裂刻白菜的方法,包括以下(1)或(2)中任一:
14、(1)過(guò)表達(dá)白菜中包含前述基因;
15、(2)過(guò)表達(dá)白菜中包含的表達(dá)前述蛋白的基因。
16、上述技術(shù)方案中,進(jìn)一步地,鑒定葉緣裂刻白菜的方法,包括以下(1)或(2)中任一:
17、(1)檢測(cè)白菜中是否包含前述基因,如果包含前述基因,則鑒定為葉緣裂刻白菜;
18、(2)檢測(cè)白菜中是否包含表達(dá)前述蛋白的基因,如果包含表達(dá)前述蛋白的基因,則鑒定為葉緣裂刻白菜。
19、上述技術(shù)方案中,進(jìn)一步地,所述白菜為白菜型油菜。
20、與現(xiàn)有的技術(shù)相比,本發(fā)明的有益效果是,本發(fā)明首次提出了brrco基因及其編碼的蛋白具有正向調(diào)控白菜葉緣裂刻形成的功能,為深入了解白菜類作物葉緣裂刻形成機(jī)制,白菜類作物的遺傳育種和種質(zhì)資源改良奠定基礎(chǔ)。本發(fā)明通過(guò)crispr/cas9基因編輯手段對(duì)白菜葉緣裂刻關(guān)鍵基因brrco進(jìn)行轉(zhuǎn)基因功能驗(yàn)證,并且brrco敲除陽(yáng)性植株的葉緣裂刻消失,進(jìn)一步經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn)brrco基因?qū)Π撞巳~緣裂刻呈現(xiàn)正向調(diào)控,brrco基因在篩選或培育葉緣裂刻白菜中具有重要應(yīng)用價(jià)值。
1.一種正向調(diào)控白菜葉緣裂刻基因brrco,其特征在于,所述正向調(diào)控白菜葉緣裂刻基因brrco的核苷酸序列如seq?id?no.1所示。
2.一種正向調(diào)控白菜葉緣裂刻基因brrco編碼的蛋白,其特征在于,所述正向調(diào)控白菜葉緣裂刻基因brrco編碼的蛋白的氨基酸序列如seq?id?no.2所示。
3.一種包含權(quán)利要求1所述的正向調(diào)控白菜葉緣裂刻基因brrco的重組質(zhì)粒。
4.一種包含權(quán)利要求1所述的正向調(diào)控白菜葉緣裂刻基因brrco的重組表達(dá)載體、或所述重組表達(dá)載體的工程菌或宿主細(xì)胞。
5.權(quán)利要求1所述的基因brrco在正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的應(yīng)用;或者選育葉緣裂刻白菜的應(yīng)用;或者鑒定葉緣裂刻白菜的應(yīng)用。
6.權(quán)利要求2所述的蛋白在正向調(diào)控白菜葉緣裂刻形成中的應(yīng)用;或者選育葉緣裂刻白菜的應(yīng)用;或者鑒定葉緣裂刻白菜的應(yīng)用。
7.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的應(yīng)用,其特征在于,正向調(diào)控白菜葉緣裂刻的方法,包括以下(1)或(2)中任一:
8.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的應(yīng)用,其特征在于,選育葉緣裂刻白菜的方法,包括以下(1)或(2)中任一:
9.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的應(yīng)用,其特征在于,鑒定葉緣裂刻白菜的方法,包括以下(1)或(2)中任一:
10.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的應(yīng)用,其特征在于,所述白菜為白菜型油菜。