本發(fā)明涉及生物檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因芯片檢測(cè)用試劑盒及方法。
背景技術(shù):
呼吸道感染是世界范圍內(nèi)最常見的疾病之一,發(fā)病率在各國(guó)居民發(fā)病率總體結(jié)構(gòu)中占據(jù)主要地位,每年的流行高峰期約有10%的居民患有呼吸道感染。呼吸道感染會(huì)導(dǎo)致鼻炎,流涕,鼻塞,咳嗽,輕度咽炎,全身發(fā)熱等癥狀,嚴(yán)重的會(huì)導(dǎo)致呼吸困難甚至死亡。據(jù)世界衛(wèi)生組織2002年統(tǒng)計(jì)報(bào)告,呼吸道感染居全球十大死亡原因中第三位,全球每年近四百萬人死于呼吸道感染。
基因芯片技術(shù)是近年來興起的生物高新技術(shù),集成了探針固相原位合成技術(shù)、照相平板印刷技術(shù)、精密控制技術(shù)、激光共聚焦顯微技術(shù)和高分子合成技術(shù)。該技術(shù)的原型是80年代中期提出的,1991年Stephen Fodor博士首次將該技術(shù)定義為基因芯片,到1995年它在《Science》雜志刊登的一篇關(guān)于研究分析基因表達(dá)圖譜的文章中再次被提及,目前該技術(shù)在研究癌癥和檢測(cè)微生物方面得到廣泛的應(yīng)用。我們通常所提到的基因芯片(又稱DNA芯片、寡核苷酸芯片等)是指根據(jù)經(jīng)過特殊處理技術(shù),將核酸分子(寡聚核苷酸、DNA、RNA等)固定于硅片、玻璃、尼龍膜等固相載體上,利用生物分子間特異相互作用的原理,將生化反應(yīng)及分析過程集成于芯片表面,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA、RNA的高通量快速檢測(cè)。其突出特點(diǎn)在于高度并行性、多樣性、微型化和高度自動(dòng)化。
目前國(guó)內(nèi)已有許多檢測(cè)呼吸道病原體的試劑。主要是針對(duì)于病毒類的PCR熒光檢測(cè)試劑或者血清免疫檢測(cè)試劑,而對(duì)于細(xì)菌類病原體還是采取了比較傳統(tǒng)的細(xì)菌培養(yǎng)板培養(yǎng)的方法。熒光PCR雖然能夠得到較好的靈敏度和特異性,但是由于儀器采集信號(hào)通道的限制,每次反應(yīng)都只能檢測(cè)幾種病原體,通量較低,而采取多管檢測(cè)的時(shí)候又會(huì)極大增加檢測(cè)的經(jīng)濟(jì)成本和時(shí)間成本;而血清免疫檢測(cè)試劑雖然可以獲得較大的檢測(cè)通量,但是由于血清免疫檢測(cè)的是血清中的所產(chǎn)生的抗體,因此存在著一個(gè)較長(zhǎng)的空窗期,并且靈敏度相對(duì)也較低;而對(duì)于細(xì)菌類病原體的檢測(cè)則是更加困難,細(xì)菌培養(yǎng)法雖然準(zhǔn)確率高,但是周期長(zhǎng),培養(yǎng)效果差,很多細(xì)菌無法培養(yǎng),延誤了最佳的治療時(shí)機(jī)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的發(fā)明目的在于提供一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因芯片檢測(cè)用試劑盒及方法,以實(shí)現(xiàn)同時(shí)檢測(cè)16種呼吸道病原體的檢測(cè)需要。
根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,第一方面示出一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因檢測(cè)試劑盒,所述試劑盒包括:PCR緩沖溶液、逆轉(zhuǎn)錄酶、dNTPs、引物、探針以及Taq酶和金屬陽離子;
所述探針包括雜交探針和內(nèi)標(biāo)探針;
所述引物包括16種呼吸道病原體引物和2種內(nèi)標(biāo)引物和1種通用引物;
所述引物的序列為:SEQ ID NO:1-37;所述探針的序列為SEQ ID NO:38-55。
進(jìn)一步,每條所述雜交探針的5’末端都經(jīng)過氨基與多聚polyT修飾。
進(jìn)一步,每條所述雜交探針的5’端oligodT的C6位置進(jìn)行氨基化修飾。
本發(fā)明第二方面示出一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因檢測(cè)方法,包括:
篩選出16種呼吸道病原體的保守區(qū)域,分別得到16對(duì)引物,在所述16種呼吸道病原體的保守區(qū)域設(shè)計(jì)出16條雜交探針;
選取方形尼龍膜,使用10%EDC活化1h,將所述16條雜交探針、1種DNA內(nèi)標(biāo)探針、1種RNA內(nèi)標(biāo)探針點(diǎn)在尼龍膜上,探針排列為3×6矩陣,點(diǎn)與點(diǎn)之間的間距為100μm,得到雜交盒;
配置檢測(cè)試劑盒,設(shè)置PCR反應(yīng)擴(kuò)增的程序,進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),得到擴(kuò)增產(chǎn)物;
向所述擴(kuò)增產(chǎn)物中加入0.2mol的NaOH50uL,得到變性后的擴(kuò)增產(chǎn)物;
在雜交盒每孔內(nèi)加入500uL預(yù)雜交液,15min后取出在雜交盒中預(yù)雜交液,在雜交盒每孔內(nèi)加入雜交液400uL,同時(shí)相應(yīng)的加入所述變性后的擴(kuò)增產(chǎn)物100uL,將雜交盒放入55℃烘箱中,30min后取出移出孔內(nèi)的雜交液;在雜交盒每孔內(nèi)加入500ul雜交洗液1清洗3min,移出雜交洗液1;在雜交盒每孔內(nèi)加入300ul酶標(biāo)溶液,置于37℃烘箱中,30min后移出酶標(biāo)溶液;在雜交盒每孔內(nèi)加入500uL雜交洗液1,震蕩清洗3min,用500uL雜交洗液2,震蕩清洗3min;在雜交盒每孔內(nèi)加入400ul顯色液,室溫顯色1-2min,移出顯色液,用雜交洗液2清洗每孔,用Bio-rad顯影,得到雜交顯色結(jié)果;
將所述雜交顯色結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)卡進(jìn)行對(duì)比,得出檢測(cè)結(jié)果;
所述雜交洗液1為2x SSC與0.1%十二烷基硫酸鈉溶液的混合溶液;所述雜交洗液2為0.5x SSC與0.1%十二烷基硫酸鈉溶液的混合液溶液。
進(jìn)一步,所述PCR反應(yīng)擴(kuò)增的程序?yàn)椋?/p>
逆轉(zhuǎn)錄,逆轉(zhuǎn)錄的溫度為50℃。時(shí)間為30min;
cDNA預(yù)變性,預(yù)變性的溫度為90℃-105℃,時(shí)間為1-10min,
變性,變性的溫度為90℃-105℃,時(shí)間為10s-30s;
退火,退火的溫度為40℃-65℃,時(shí)間為10s-60s;
延伸,延伸溫度為40℃-80℃,時(shí)間為10s-5min。
進(jìn)一步,所述PCR反應(yīng)擴(kuò)增的程序?yàn)椋?/p>
所述逆轉(zhuǎn)錄的溫度為50℃。時(shí)間為30min;
所述預(yù)變性的溫度為95℃,時(shí)間為2min,
所述變性的溫度為95℃,時(shí)間為15s;
所述退火的溫度為57℃,時(shí)間為20s;
延伸溫度為72℃,時(shí)間為45s。
進(jìn)一步,在每條所述引物的5’端添加人工接頭序列。
進(jìn)一步,所述酶標(biāo)溶液為鏈霉親和素和酶標(biāo)母液的混合液;按照鏈霉親和素酶標(biāo)母液=1:200的配制。
進(jìn)一步,所述顯色液為2mg/ml TMB:顯色緩沖液:30%H2O2=500:500:1。
進(jìn)一步,所述預(yù)雜交液、所述雜交液、所述雜交洗液1,所述雜交洗液2和所述酶標(biāo)溶液使用前在55℃烘箱中預(yù)熱30min。
由以上技術(shù)方案可知,本發(fā)明實(shí)施例示出一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因芯片檢測(cè)用試劑盒及方法,所述試劑盒包括:包括:PCR緩沖溶液、逆轉(zhuǎn)錄酶、dNTPs、引物、探針以及Taq酶和金屬陽離子;所述探針包括雜交探針和內(nèi)標(biāo)探針;所述引物包括16種呼吸道病原體引物和2種內(nèi)標(biāo)引物和1種通用引物;所述引物的序列為:SEQ IDNO:1-37;所述探針的序列為SEQ ID NO:38-55。本發(fā)明基于PCR技術(shù),針對(duì)16種呼吸道病原體的保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物(SEQ ID NO:1-37)對(duì)靶核酸序列進(jìn)行擴(kuò)增,并通過基因芯片雜交技術(shù)對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行雜交和顯色,最后將基因芯片上雜交斑點(diǎn)顯色情況與標(biāo)準(zhǔn)卡進(jìn)行對(duì)比,從而對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行分析判斷,同時(shí)為了避免由于樣本提取或者試劑失效導(dǎo)致的假陰性結(jié)果,本發(fā)明設(shè)置了人源管家基因(在取樣過程中會(huì)取到人源上皮細(xì)胞)作為內(nèi)標(biāo)質(zhì)控,對(duì)靶核酸的提取和擴(kuò)增進(jìn)行監(jiān)控,從而保證檢測(cè)結(jié)果的精確性。
附圖說明
為了更清楚地說明本發(fā)明實(shí)施例或現(xiàn)有技術(shù)中的技術(shù)方案,下面將對(duì)實(shí)施例中所需要使用的附圖作簡(jiǎn)單地介紹,顯而易見地,下面描述中的附圖僅僅是本發(fā)明的一些實(shí)施例,對(duì)于本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來講,在不付出創(chuàng)造性勞動(dòng)的前提下,還可以根據(jù)這些附圖獲得其他的附圖。
圖1為根據(jù)一優(yōu)選實(shí)施例示出的一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因檢測(cè)方法。
具體實(shí)施方式
下面將結(jié)合本發(fā)明實(shí)施例中的附圖,對(duì)本發(fā)明實(shí)施例中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整的描述,顯然,所描述的實(shí)施例僅僅是本發(fā)明一部分實(shí)施例,而不是全部的實(shí)施例。基于本發(fā)明中的實(shí)施例,本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在沒有做出創(chuàng)造性勞動(dòng)前提下所獲得的所有其他實(shí)施例,都屬于本發(fā)明保護(hù)的范圍。
一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因檢測(cè)試劑盒,包括:PCR緩沖溶液、DNA聚合酶、dNTPs、引物、探針以及催化DNA聚合酶所需要的金屬陽離子;所述探針包括雜交探針和內(nèi)標(biāo)探針;
所述引物包括16種呼吸道病原體引物和2種內(nèi)標(biāo)引物和1種通用引物;
所述引物的序列為:SEQ ID NO:1-37;
所述探針的序列為SEQ ID NO:38-55。
進(jìn)一步,每條所述雜交探針的5’末端都經(jīng)過氨基與多聚polyT修飾。
進(jìn)一步,每條所述雜交探針的5’端oligodT的C6位置進(jìn)行氨基化修飾。
本發(fā)明的基因芯片上具有與所檢測(cè)的16中呼吸道病原體DNA/RNA互補(bǔ)的核苷酸序列的探針(SEQ ID NO:38-55)。為了增強(qiáng)雜交探針與基質(zhì)的結(jié)合度,有利于后續(xù)與擴(kuò)增產(chǎn)物的雜交反應(yīng)的進(jìn)行,每條雜交探針都經(jīng)過5’末端氨基與多聚polyT修飾。本發(fā)明針對(duì)16中病原體和2種內(nèi)標(biāo)18種雜交探針,每條雜交探針都有著合適的堿基成分,Tm值相對(duì)比較均一,即18種型別的雜交探針和對(duì)應(yīng)的PCR產(chǎn)物雜交時(shí)的最適雜交條件基本一致,不會(huì)因?yàn)椴煌s交探針?biāo)ヅ涞淖钸m雜交溫度不同從而影響雜交結(jié)果,保證了檢測(cè)的準(zhǔn)確性。而在擴(kuò)增方面,我們?cè)诿恳粚?duì)擴(kuò)增引物的5’末端都加入了一段人工合成的接頭序列,該序列與現(xiàn)有基因庫(kù)中基因組無特異性結(jié)合,并在接頭序列的5’末端進(jìn)行生物素標(biāo)記。先通過帶接頭序列的特異性引物將靶標(biāo)基因進(jìn)行擴(kuò)增富集,再通過接頭序列對(duì)富集的模板進(jìn)行擴(kuò)增。從而導(dǎo)致了在反應(yīng)的最后擴(kuò)增階段反應(yīng)體系中只有一對(duì)擴(kuò)增引物,避免了不同引物對(duì)之間由于擴(kuò)增效率不同而導(dǎo)致出現(xiàn)假陰性的情況,實(shí)現(xiàn)了所有靶標(biāo)的同步擴(kuò)增。
本發(fā)明實(shí)施例第二方面示出一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因檢測(cè)方法,如圖1所示所述方法包括:
S101篩選出16種呼吸道病原體的保守區(qū)域,分別得到16對(duì)引物,在所述16種呼吸道病原體的保守區(qū)域設(shè)計(jì)出16條雜交探針;
S102選取方形尼龍膜,使用10%EDC活化1h,將所述16條雜交探針、1種DNA內(nèi)標(biāo)探針、1中RNA內(nèi)標(biāo)探針點(diǎn)在尼龍膜上,探針排列為3×6矩陣,點(diǎn)與點(diǎn)之間的間距為100μm,得到雜交盒;
S103配置檢測(cè)試劑盒,設(shè)置PCR反應(yīng)擴(kuò)增的程序,進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),得到擴(kuò)增產(chǎn)物;
S104向所述擴(kuò)增產(chǎn)物中加入0.2mol的NaOH50uL,得到變性后的擴(kuò)增產(chǎn)物;
S105在雜交盒每孔內(nèi)加入500uL預(yù)雜交液,15min后取出在雜交盒中預(yù)雜交液,在雜交盒每孔內(nèi)加入雜交液400uL,同時(shí)相應(yīng)的加入所述變性后的擴(kuò)增產(chǎn)物100uL,將雜交盒放入55℃烘箱中,30min后取出移出孔內(nèi)的雜交液;在雜交盒每孔內(nèi)加入500ul雜交洗液1清洗3min,移出雜交洗液1;在雜交盒每孔內(nèi)加入300ul酶標(biāo)溶液,置于37℃烘箱中,30min后移出酶標(biāo)溶液;在雜交盒每孔內(nèi)加入500uL雜交洗液1,震蕩清洗3min,用500uL雜交洗液2,震蕩清洗3min;在雜交盒每孔內(nèi)加入400ul顯色液,室溫顯色1-2min,移出顯色液,用雜交洗液2清洗每孔,用Bio-rad顯影,得到雜交顯色結(jié)果;
S106將所述雜交顯色結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)卡進(jìn)行對(duì)比,得出檢測(cè)結(jié)果;
所述雜交洗液1為2x SSC與0.1%十二烷基硫酸鈉溶液的混合溶液;所述雜交洗液2為0.5x SSC與0.1%十二烷基硫酸鈉溶液的混合液溶液。
進(jìn)一步,在每條所述引物的5’端添加人工接頭序列。
進(jìn)一步,所述酶標(biāo)溶液為鏈霉親和素和酶標(biāo)母液的混合液;按照鏈霉親和素酶標(biāo)母液=1:200的配制。
進(jìn)一步,所述顯色液為2mg/ml TMB:顯色緩沖液:30%H2O2=500:500:1。
進(jìn)一步,所述預(yù)雜交液、所述雜交液、所述雜交洗液1,所述雜交洗液2和所述酶標(biāo)溶液使用前在55℃烘箱中預(yù)熱30min。
具體的,本發(fā)明的優(yōu)選方案配置檢測(cè)試劑盒為:
本發(fā)明的檢測(cè)方法采取RT-PCR與基因芯片相結(jié)合的方式,因此首先需要完成PCR反應(yīng)擴(kuò)增的過程。一般的RT-PCR反應(yīng)過程為:
1)逆轉(zhuǎn)錄;2)cDNA預(yù)變性,時(shí)間和長(zhǎng)度取決于靶核苷酸長(zhǎng)度及堿基組成,預(yù)變性的溫度一般為90℃-105℃,時(shí)間一般為1-10min,預(yù)變性的目的為使雙鏈核苷酸序列徹底分離為單鏈;3)變性,溫度一般為90℃-105℃,時(shí)間一般為10s-30s;4)退火,使各引物退火至呼吸道病原體或內(nèi)標(biāo)質(zhì)控核酸的靶序列上。退火的溫度通常為40℃-65℃,退火的時(shí)間可以是10s-60s;5)延伸,引物與模板結(jié)合,開始合成新的雙鏈DNA,延伸溫度一般為40℃-80℃,延伸時(shí)間可以是10s-5min。本發(fā)明由于涉及到人工接頭引物的引入和擴(kuò)增,根據(jù)需要對(duì)擴(kuò)增步驟進(jìn)行了略微的修改。本發(fā)明的優(yōu)選方案為:
本發(fā)明的關(guān)鍵內(nèi)容為靶核苷酸以及內(nèi)標(biāo)的特異性擴(kuò)增引物和接頭引物,以及后來的雜交探針。
本發(fā)明中的核苷酸序列為:
本發(fā)明中的保護(hù)點(diǎn)為本發(fā)明中提供的核苷酸序列或部分序列(引物、探針及內(nèi)標(biāo))及與其相似的序列或反向互補(bǔ)的序列,以及PCR反應(yīng)體系組分及濃度參數(shù)、PCR擴(kuò)增程序、芯片雜交反應(yīng)體系組成成分、濃度參數(shù)以及雜交反應(yīng)條件。
結(jié)果分析:
證明該發(fā)明方法的可行性,進(jìn)行了方法學(xué)研究:
⑴最低檢測(cè)限(LOD)試驗(yàn);
通過對(duì)各濃度梯度的樣本進(jìn)行檢測(cè),表明本檢測(cè)方法的檢測(cè)靈敏度(LOD)為1000copies/mL。
(2)特異性實(shí)驗(yàn)與其它疾病的交叉反應(yīng)情況;
通過用本發(fā)明中的檢測(cè)方法對(duì)16種呼吸道病原體以外的其它病原體進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果表明本發(fā)明中的方法對(duì)EB病毒、HPV病毒、STD等病原體感染樣本無交叉反應(yīng),表明其具有高特意性。
(3)對(duì)潛在內(nèi)源物質(zhì)的抗干擾性;
試驗(yàn)表明,當(dāng)檢驗(yàn)人中含有以下濃度的藥物,不會(huì)影響到試劑盒對(duì)樣本檢測(cè)結(jié)果的判定:0.2mg/L倍氯米松、0.15mg/L地塞米松、12mg/L曲安西龍、0.4mg/L布地奈德、0.05mg/L莫美達(dá)松、0.5mg/L氟替卡松、75mg/L苯佐卡因、5mg/L扎那米韋、37.5mg/L奧司他韋、75mg/L妥布霉素、50mg/L金剛烷胺、75mg/L硫磺、150mg/L金英、50mg/L鹽酸金剛乙胺、0.125mg/L腎上腺素、25mg/L薄荷腦、0.05%羥甲唑啉、500mg/L氟尼縮松、500mg/L莫匹羅星。
(4)對(duì)潛在外源物質(zhì)的抗干擾性
試驗(yàn)表明,常見干擾物質(zhì),如血液、唾液、鼻分泌物在分別在10%時(shí),不會(huì)對(duì)試劑盒檢測(cè)結(jié)果產(chǎn)生影響。但考慮上述干擾物質(zhì)中的RNA酶的影響,仍提醒采樣時(shí)應(yīng)盡量避免上述物質(zhì)的干擾。
由以上技術(shù)方案可知,本發(fā)明實(shí)施例示出一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因芯片檢測(cè)用試劑盒及方法,所述試劑盒包括:包括:PCR緩沖溶液、逆轉(zhuǎn)錄酶、dNTPs、引物、探針以及Taq酶和金屬陽離子;所述探針包括雜交探針和內(nèi)標(biāo)探針;所述引物包括16種呼吸道病原體引物和2種內(nèi)標(biāo)引物和1種通用引物;所述引物的序列為:SEQ IDNO:1-37;所述探針的序列為SEQ ID NO:38-55。本發(fā)明基于PCR技術(shù),針對(duì)16種呼吸道病原體的保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物(SEQ ID NO:1-37)對(duì)靶核酸序列進(jìn)行擴(kuò)增,并通過基因芯片雜交技術(shù)對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行雜交和顯色,最后將基因芯片上雜交斑點(diǎn)顯色情況與標(biāo)準(zhǔn)卡進(jìn)行對(duì)比,從而對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行分析判斷。同時(shí)為了避免由于樣本提取或者試劑失效導(dǎo)致的假陰性結(jié)果,本發(fā)明設(shè)置了人源管家基因(在取樣過程中會(huì)取到人源上皮細(xì)胞)作為內(nèi)標(biāo)質(zhì)控,對(duì)靶核酸的提取和擴(kuò)增進(jìn)行監(jiān)控,從而保證檢測(cè)結(jié)果的精確性。
本領(lǐng)域技術(shù)人員在考慮說明書及實(shí)踐這里公開的發(fā)明后,將容易想到本發(fā)明的其它實(shí)施方案。本申請(qǐng)旨在涵蓋本發(fā)明的任何變型、用途或者適應(yīng)性變化,這些變型、用途或者適應(yīng)性變化遵循本發(fā)明的一般性原理并包括本發(fā)明未公開的本技術(shù)領(lǐng)域中的公知常識(shí)或慣用技術(shù)手段。說明書和實(shí)施例僅被視為示例性的,本發(fā)明的真正范圍和精神由下面的權(quán)利要求指出。
應(yīng)當(dāng)理解的是,本發(fā)明并不局限于上面已經(jīng)描述并在附圖中示出的精確結(jié)構(gòu),并且可以在不脫離其范圍進(jìn)行各種修改和改變。本發(fā)明的范圍僅由所附的權(quán)利要求來限制。
SEQUENCE LISTING
<110> 湖南圣湘生物科技有限公司
<120> 一種檢測(cè)16種呼吸道病原體的基因芯片及檢測(cè)用試劑盒
<130> 1
<160> 55
<170> PatentIn version 3.5
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<212> DNA
<213> Influenza virus A
<400> 1
tacgactcac tatagggaag tcttctaacc gaggtcgaaa c 41
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000
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<213> Influenza virus B
<400> 3
gtacgactca ctatagggaa aaccagtgga aatgctttca t 41
<210> 4
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<213> Influenza virus B
<400> 4
gtacgactca ctatagggat tttgttgatt taataatcga ggtc 44
<210> 5
<211> 44
<212> DNA
<213> Respiratory Syncytial Virus
<400> 5
gtacgactca ctatagggaa cacaaccaca tcaaaacaaa caat 44
<210> 6
<211> 40
<212> DNA
<213> Respiratory Syncytial Virus
<400> 6
gtacgactca ctatagggat tgagggatca cggttctctg 40
<210> 7
<211> 38
<212> DNA
<213> Human adenovirus
<400> 7
gtacgactca ctatagggat tatgggaatg cggttgtg 38
<210> 8
<211> 43
<212> DNA
<213> Human adenovirus
<400> 8
gtacgactca ctatagggat ttatagccyt tgggtttrtt tam 43
<210> 9
<211> 42
<212> DNA
<213> Chlamydiales pneumoniae
<400> 9
gtacgactca ctatagggag ttggtaggga actcgtttta gc 42
<210> 10
<211> 40
<212> DNA
<213> Chlamydiales pneumoniae
<400> 10
gtacgactca ctatagggac cgtagggtgt gaagagttgc 40
<210> 11
<211> 41
<212> DNA
<213> Human Legionella pneumophila
<400> 11
gtacgactca ctatagggaa cactggtcgt ctgattgatg g 41
<210> 12
<211> 39
<212> DNA
<213> Human Legionella pneumophila
<400> 12
gtacgactca ctatagggaa acgctacggg gtccataag 39
<210> 13
<211> 44
<212> DNA
<213> human Mycoplasmal Pneumonia
<400> 13
gtacgactca ctatagggat cactcaagga tgtgyagata tagg 44
<210> 14
<211> 42
<212> DNA
<213> Human Mycoplasmal Pneumonia
<400> 14
gtacgactca ctatagggar gagcataact grtaaccyct tg 42
<210> 15
<211> 42
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus 1
<400> 15
gtacgactca ctatagggac tgcyatacca ggaggytgtr tc 42
<210> 16
<211> 44
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus 1
<400> 16
gtacgactca ctatagggag tcthagttca gctagrtcag tygt 44
<210> 17
<211> 40
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus 2
<400> 17
gtacgactca ctatagggac aagargtgyc wccacaaaga 40
<210> 18
<211> 41
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus 2
<400> 18
gtacgactca ctatagggag ayggrgttct racacagcca t 41
<210> 19
<211> 42
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus 3
<400> 19
gtacgactca ctatagggac gctrgayatg ayttttgagg tg 42
<210> 20
<211> 39
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus 3
<400> 20
gtacgactca ctatagggag caggtasacg gyctcgatg 39
<210> 21
<211> 41
<212> DNA
<213> Human Rhinovirus
<400> 21
gtacgactca ctatagggag agtcgctgga cagtcgtaag g 41
<210> 22
<211> 40
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus
<400> 22
gtacgactca ctatagggag tgttccgtca gaatgggtgc 40
<210> 23
<211> 42
<212> DNA
<213> Pertussis
<400> 23
gtacgactca ctatagggaa cagttcctta ccacggatga ca 42
<210> 24
<211> 43
<212> DNA
<213> Pertussis
<400> 24
gtacgactca ctatagggac ctgaaaccaa agacttgttg acc 43
<210> 25
<211> 44
<212> DNA
<213> Chlamydia trachomatis
<400> 25
gtacgactca ctatagggac ctcttcgttg accgatgtac tctt 44
<210> 26
<211> 42
<212> DNA
<213> Chlamydia trachomatis
<400> 26
gtacgactca ctatagggag ctaccatttc tttctcccag ct 42
<210> 27
<211> 40
<212> DNA
<213> HaemoPhilus influenza
<400> 27
gtacgactca ctatagggag gcattagccg tgagcagttt 40
<210> 28
<211> 41
<212> DNA
<213> HaemoPhilus influenza
<400> 28
gtacgactca ctatagggac ttcatggcac cttcttcgtt g 41
<210> 29
<211> 42
<212> DNA
<213> Moraxella Catarrhalis
<400> 29
gtacgactca ctatagggaa actggaagcc ttatggcaac ga 42
<210> 30
<211> 42
<212> DNA
<213> Moraxella Catarrhalis
<400> 30
gtacgactca ctatagggaa gttcacgcca acacggaaat ca 42
<210> 31
<211> 39
<212> DNA
<213> Streptococcus Pneumoniae
<400> 31
gtacgactca ctatagggat ggcggttact ctgtttctg 39
<210> 32
<211> 40
<212> DNA
<213> Streptococcus Pneumoniae
<400> 32
gtacgactca ctatagggag ttgacctaac gcgatgttgt 40
<210> 33
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 33
gtacgactca ctatagggac aaatgtaaac actgtgcctg at 42
<210> 34
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 34
gtacgactca ctatagggag taagtcaact tcaatgtcgg att 43
<210> 35
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 35
gtacgactca ctatagggac tgggtttcat ccatccgaca tt 42
<210> 36
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 36
gtacgactca ctatagggac acggcaggca tactcatctt tt 42
<210> 37
<211> 19
<212> DNA
<213> 通用接頭
<400> 37
gtacgactca ctataggga 19
<210> 38
<211> 40
<212> DNA
<213> Influenza virus A
<400> 38
tttttttttt catcccttta gtcagaggtg acaggattgg 40
<210> 39
<211> 42
<212> DNA
<213> Influenza virus B
<400> 39
tttttttttt ataatcgagg tcatcataat cctctgctgt gt 42
<210> 40
<211> 43
<212> DNA
<213> Respiratory Syncytial Virus
<400> 40
tttttttttt ctaagcatat gactggagtt tttaagtgga att 43
<210> 41
<211> 41
<212> DNA
<213> Human adenovirus
<400> 41
tttttttttt ggtttgttta cagagaattg cgatacgtta c 41
<210> 42
<211> 40
<212> DNA
<213> Human Chlamydiales pneumoniae
<400> 42
tttttttttt gttcaggttg ctttcaagtt catcgtacag 40
<210> 43
<211> 35
<212> DNA
<213> Human Legionella pneumophila
<400> 43
tttttttttt ccatatgcaa gacctgaggg aacat 35
<210> 44
<211> 36
<212> DNA
<213> Human Mycoplasmal Pneumonia
<400> 44
tttttttttt ctgataaccc cttgttcctg cagcta 36
<210> 45
<211> 38
<212> DNA
<213> Human Rhinovirus
<400> 45
tttttttttt cagctagatc agtcgtagca taatcttc 38
<210> 46
<211> 35
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus 1
<400> 46
tttttttttt cacagccatc aacagtcgtt ggcat 35
<210> 47
<211> 29
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus 2
<400> 47
tttttttttt tgacgccgcg gtgcggctg 29
<210> 48
<211> 35
<212> DNA
<213> Human Parainfluenza Virus 3
<400> 48
tttttttttt cgtcagaatg ggtgctattg atggc 35
<210> 49
<211> 35
<212> DNA
<213> Pertussis
<400> 49
tttttttttt ccaaagactt gttgaccttg cctgt 35
<210> 50
<211> 37
<212> DNA
<213> Chlamydia trachomatis
<400> 50
tttttttttt ctcccagctt aagaaccgtc agacaga 37
<210> 51
<211> 40
<212> DNA
<213> HaemoPhilus influenza
<400> 51
tttttttttt cttcgttgaa atagtaccac ttatcagcga 40
<210> 52
<211> 35
<212> DNA
<213> Moraxella Catarrhalis
<400> 52
tttttttttt aacacggaaa tcacgacctg cccca 35
<210> 53
<211> 35
<212> DNA
<213> Streptococcus Pneumoniae
<400> 53
tttttttttt cctaacgcga tgttgtattc tggtg 35
<210> 54
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 54
tttttttttt tcaatgtcgg attgatgaaa cccag 35
<210> 55
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 55
tttttttttt ggcatactca tctttttcag tgggg 35