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雞外周血單核淋巴細胞pd-l2重組質(zhì)粒的構(gòu)建、基因豐度實時檢測方法及其應(yīng)用的制作方法

文檔序號:469311閱讀:179來源:國知局
雞外周血單核淋巴細胞pd-l2重組質(zhì)粒的構(gòu)建、基因豐度實時檢測方法及其應(yīng)用的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明屬于分子病理學與免疫學【技術(shù)領(lǐng)域】,涉及雞外周血單核淋巴細胞PD-L2重組質(zhì)粒的構(gòu)建、基因豐度實時檢測方法及其應(yīng)用。通過采集雛雞淋巴細胞的總RNA,將總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA;采用普通PCR擴增PD-L2目的基因片段,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,并回收純化;將PD-L2目的基因片段與pMD18-T載體連接,轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細胞DH5α中,提取重組質(zhì)粒;經(jīng)克隆篩選后進行測序分析,選取與目的基因片段相同序列的陽性質(zhì)粒作為標準品質(zhì)粒,按拷貝濃度繪制成標準曲線;根據(jù)熒光信號變化及標準曲線測出PD-L2的基因豐度;本發(fā)明的PD-L2基因豐度實時檢測方法具有檢測通量高、敏感性高、特異性強、操作簡便、成本低及定量準確等優(yōu)點。
【專利說明】雞外周血單核淋巴細胞PD-L2重組質(zhì)粒的構(gòu)建、基因豐度實時檢測方法及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明屬于分子病理學與免疫學【技術(shù)領(lǐng)域】,具體涉及雞外周血單核淋巴細胞PD-L2重組質(zhì)粒的構(gòu)建、基因豐度實時檢測方法及其應(yīng)用。
【背景技術(shù)】[0002]雞傳染性法氏囊病(infectious bursal disease, IBD)是由傳染性法氏囊病病毒(infectious bursal disease virus, IBDV)引起雛雞的一種急性、高度接觸性傳染病。研究表明,IBDV感染后可引起機體的免疫抑制狀態(tài)和持續(xù)性感染。病毒感染的靶器官為法氏囊,病毒在B細胞內(nèi)復(fù)制導(dǎo)致法氏囊淋巴濾泡損傷、破壞,B淋巴細胞溶解。同時,病毒在法氏囊單核-巨噬細胞系統(tǒng)內(nèi)復(fù)制導(dǎo)致炎性介質(zhì)的大量分泌、病毒擴散和損傷加劇,形成敗血性休克綜合征,導(dǎo)致嚴重的B細胞免疫反應(yīng)抑制,并加劇了病雞的死亡。另外,IBDV感染后前B淋巴細胞增殖的抑制和凋亡的發(fā)生,也是造成體液免疫抑制的重要原因。
[0003]程序性死亡配體(PD-L2)及其程序性死亡受體-1 (PD-1)是⑶28 / B7超家族成員,其表達相對較局限,主要表達在抗原遞呈細胞上,如活化的巨噬細胞、DC等。有研究證明,人和鼠的TO-L2 mRNA在胎盤、肝癌細胞、乳癌細胞、和神經(jīng)母細胞中呈高表達。但在脾臟、淋巴結(jié)、胸腺和成纖維組織中呈低表達,這使得其和I3D-Ll與其他B7家族成員在表達譜上有很大的差異。在免疫調(diào)節(jié)方面,PD-L2與其受體TO-1共同介導(dǎo)ro-l:PD-L信號通路的激活,在中樞免疫和外周免疫反應(yīng)中傳遞免疫耐受和免疫抑制信號,對抗原特異性T、B細胞的功能、T細胞的增殖、細胞因子的分泌和殺傷能力都有抑制作用,阻斷該通路后可以恢復(fù)T細胞的大部分功能。經(jīng)相關(guān)研究證實,一些病毒的感染可以誘導(dǎo)ro-L2及其受體ro-1的表達,從而影響ro-1: PD-Ls通路,使病毒逃避免疫系統(tǒng)的監(jiān)視與殺傷,引起機體產(chǎn)生免疫抑制和持續(xù)性感染。因此,PD-L2及其受體ro-1近年來逐漸成為人們在慢性持續(xù)性病毒感染、免疫耐受性疾病、腫瘤等免疫抑制性疾病研究中所關(guān)注的熱點,而在動物免疫抑制性疾病或病毒持續(xù)性感染方面,T細胞免疫抑制通路ro-1=PD-Ls的研究才剛剛起步,特別是在家禽類方面的研究還少見報道。
[0004]近年來,實時熒光定量PCR (Real-Time PCR)技術(shù)為基因豐度檢測提供了全新的方法,和傳統(tǒng)的方法相比,具有敏感性高、特異性強、操作簡便、成本低以及定量準確等優(yōu)點被廣泛應(yīng)用,它可以通過檢測目標序列PCR擴增的熒光信號強度達到實時監(jiān)控的目的。然而對雞外周血單核細胞中ro-L2基因的豐度的Real-Time PCR檢測體系建立及應(yīng)用的研究尚未見報道。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0005]本發(fā)明要解決的技術(shù)問題在于:本發(fā)明提供了一種雞外周血單核淋巴細胞ro-L2實時熒光定量PCR陽性標準重組質(zhì)粒的構(gòu)建方法;
在此基礎(chǔ)上本發(fā)明建立了一種ro-L2基因豐度的實時熒光定量PCR檢測方法,該方法具有敏感性高、特異性強等優(yōu)點;
本發(fā)明通過研究外周血單核細胞中PD-L2的變化規(guī)律,為雞H)-L2分子檢測的定量分析提供了技術(shù)平臺,并能用于分析雞感染免疫抑制性疾病如IBD后TO-L2基因的轉(zhuǎn)錄水平的變化規(guī)律中。
[0006]本發(fā)明的技術(shù)方案:
雞外周血單核淋巴細胞PD-L2實時熒光定量PCR陽性標準重組質(zhì)粒的構(gòu)建方法,包括以下步驟:
采集雛雞的外周血,分離出淋巴細胞,提取淋巴細胞的總RNA,將總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,將cDNA保存于-20°C,采用普通PCR方法擴增TO-L2目的基因片段;
采用普通PCR方法擴增PD-L2目的基因片段,將該目的基因片段經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,并回收純化;然后將TO-L2目的基因純化片段與pMD 18-T載體連接,轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細胞DH5 α中,提取重組質(zhì)粒,經(jīng)克隆篩選后進行測序分析,得到與目的基因片段相同序列的陽性標準重組質(zhì)粒;
其中普通PCR擴增時的反應(yīng)體系為25 μ L,反應(yīng)體系如下:2 μ L樣品cDNA模板,2.5 μ L10XPCR Buffer,2y L dNTP,濃度為20Mmol/L的正向引物和反向引物各0.5 μ L,0.5 μ L的TaqDNA聚合酶,其余為無菌三蒸水;
正向引物 F: 5' - CCGCAATGGGAAAGCAC -3',
反向引物 R: 5' - TGACGCTGGTAATGTGAAGGA -3'。
[0007]所述目的基因片段為序列表的SEQ ID N0.1序列。
[0008]其中普通PCR反應(yīng)程序:95°C熱啟動Imin ;94°C變性30s ;55°C退火30s ;72°C延伸30s, 30個循環(huán),最后72°C延伸lOmin。
[0009]一種雞外周血單核淋巴細胞H)-L2基因的豐度實時檢測方法,包括以下步驟:
(1)將回收純化的ro-L2目的基因片段與pMD 18-T載體連接,然后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細胞DH5a中,提取重組質(zhì)粒;經(jīng)克隆篩選后進行測序分析,選取與H)- L2目的基因片段相同序列的陽性質(zhì)粒作為標準品質(zhì)粒,測定標準品質(zhì)粒的DNA濃度,并換算成質(zhì)粒的拷貝濃度,按I: 10倍的濃度梯度稀釋陽性質(zhì)粒;
(2)以稀釋的陽性質(zhì)粒為模板,進行實時熒光定量PCR擴增反應(yīng),用實時熒光定量PCR儀檢測熒光信號,反應(yīng)結(jié)束后繪制出標準曲線,然后根據(jù)熒光信號的變化及標準曲線測出樣品DNA中H)- L2的基因豐度;
其中實時熒光定量PCR擴增的反應(yīng)體系為20 μ L,包括2 μ L質(zhì)粒模板,濃度為20Mmol/L的正向引物F和反向引物R各0.2 μ L,SYBR Green I PreMix ΙΟμ?,三蒸水7.6 μ L ;其中,正向引物 F: 5' - CCGCAATGGGAAAGCAC -3',
反向引物 R: 5' - TGACGCTGGTAATGTGAAGGA -3'。
[0010]所述目的基因片段為序列表的SEQ ID N0.1序列。
[0011]其中熒光定量PCR反應(yīng)程序為:95°C熱啟動30s ;94°C變性5s ;60°C退火和延伸34s,60 V時收集熒光信號,再40個循環(huán)。
[0012]所述的實時熒光定量PCR儀為ABI 7500 Fast型熒光定量PCR儀。
[0013]所述稀釋的陽性質(zhì)粒濃度范圍為為4.95X 1010-4.95X 101 copies/μ L ;所述標準曲線的相關(guān)系數(shù)R2=0.995,斜率為-3.808。[0014]所述的檢測方法在分析雞感染免疫抑制性疾病后ro-L2基因的轉(zhuǎn)錄水平變化規(guī)律中的應(yīng)用。
[0015]本發(fā)明的積極有益效果:
本發(fā)明建立了雞外周血單核細胞中PD-L2基因豐度的實時熒光定量PCR的方法,為更好的對雞免疫抑制狀態(tài)下H)-L2的轉(zhuǎn)錄水平進行準確定量,進而研究外周血單核細胞中PD- L2的變化規(guī)律,為雞TO-L2分子檢測的定量分析提供了技術(shù)平臺,并為TO-L2在雞免疫抑制性疾病中發(fā)揮的生物學功能及其應(yīng)用機制奠定基礎(chǔ)。
[0016]本發(fā)明所公開的技術(shù)方案與傳統(tǒng)技術(shù)相比,敏感性較高,利用所建立的方法對IO9~IO1 copies/yL的9組不同濃度的標準陽性質(zhì)粒進行檢測,結(jié)果顯示:本發(fā)明中TO-L2的檢測下限為10 copies/μ L,其濃度與Ct值之間有較好的線性關(guān)系,相關(guān)系數(shù)R2=0.995 ;利用建立的方法進行重復(fù)性試驗,組內(nèi)和組間重復(fù)性試驗結(jié)果表明,變異系數(shù)均在3%以內(nèi),本發(fā)明具有較好的重復(fù)性;從溶解曲線圖可知,PD-L2分子溶解曲線出現(xiàn)單一狹窄峰(圖4),且瓊脂糖凝膠電泳分析表明,Real-time RT-PCR擴增結(jié)果為單一特異性目的片段(圖5),說明本發(fā)明具有較好的特異性;另外本發(fā)明還具有檢測通量高、操作簡便、成本低以及定量準確等特點。
[0017]本發(fā)明通過實驗證實,雞傳染性法氏囊病病毒IBDV感染后,隨著病毒在機體內(nèi)復(fù)制ro- L2的表達量逐漸升高,說明IBDV的感染及病毒載量與雞ro-L2基因豐度的變化關(guān)系十分密切;并證實了雞IBDV感染后ro-L2表達變化與IFN-Y、IL-2細胞因子的表達變化之間存在一定關(guān)系,雞ro-L2表達升高后激活了 ro-1 =PD-Ls信號通路,引起了雞T細胞免疫功能和增殖活性的下降,導(dǎo)致康復(fù)雞或亞臨床感染雞免疫抑制反應(yīng)的持續(xù)存在。
[0018]本發(fā)明的雞ro-L2基因?qū)崟r熒光定量PCR檢測方法,為檢測雞感染免疫抑制性疾病(如雞傳染性法氏囊病IBD、雞馬立克氏病MD、雞傳染性貧血CIA,雞白血病ALD和雞網(wǎng)狀內(nèi)皮組織增生病RE等)所導(dǎo)致的免疫抑制狀態(tài)中TO-L2的表達變化規(guī)律提供了一種技術(shù)平臺,從而進一步豐富了雞免疫抑制性疾病`引起免疫抑制的機理。
【專利附圖】

【附圖說明】
[0019]圖1為瓊脂糖凝膠檢測雞ro-L2基因擴增結(jié)果;
圖2為雞ro-L2實時熒光定量分析擴增曲線;
圖3為雞ro-L2實時熒光定量分析標準曲線;
圖4為雞ro-L2實時熒光定量分析標準品溶解曲線;
圖5為雞ro- L2實時熒光定量產(chǎn)物特異性分析結(jié)果;
圖6為雞感染IBDV不同時期T細胞中ro-L2基因的拷貝數(shù);
圖7為雞感染IBDV不同時期體內(nèi)IBDV病毒載量半定量PCR檢測結(jié)果;
圖8為雞感染IBDV不同時期IFN-Y基因的拷貝數(shù);
圖9為雞感染IBDV不同時期IL-2基因的拷貝數(shù);
圖10為實驗組雞感染IBDV康復(fù)后胸腺T細胞增殖活檢測;
圖11為對照組雞感染IBDV康復(fù)后胸腺T細胞增殖活檢測。
【具體實施方式】[0020]在本發(fā)明中,基因拷貝數(shù)、基因豐度代表同樣的概念;Real-time PCR、實時熒光定量PCR表示同樣的概念;ddH20表示雙蒸水;IBDV表示雞傳染性法氏囊病病毒;CFSE為一種可以標記活體細胞的熒光染料。
[0021]實施例中的實驗動物和菌種:1日齡健康雛雞,SPF隔離器中飼養(yǎng)至4周齡;IBDV,LD50IOV0.1 mL,為本實驗室分離并保存;大腸桿菌感受態(tài)細胞DH5 α,為本實驗室保存。
[0022]主要試劑和儀器:淋巴細胞分離液,購自天津灝陽生物制品科技有限公司;IBDV快速檢測試紙條,購自河南百奧生物工程有限公司;PCR產(chǎn)物純化回收試劑盒,購自上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司;Taq DNA聚合酶、反轉(zhuǎn)錄試劑盒、pMD 18-T載體,均購自大連寶生物工程有限公司;SYBR Green I,購自Invitrogen公司。
[0023]實施例1:雞H)-L2實時熒光定量PCR陽性標準重組質(zhì)粒的構(gòu)建
采集4周齡雛雞的外周血,參照淋巴細胞分離液的說明書分離外周血的淋巴細胞,參照Invitrogen公司TRIzol試劑盒說明書和相關(guān)文獻進行總RNA的提取。提取的總RNA參照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書反轉(zhuǎn)錄成cDNA,保存于-20°C備用,用于擴增TO-L2目的基因片段的模板。
[0024]采用普通PCR方法擴增TO-L2目的基因片段,將該目的基因片段經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,并回收純化;然后將ro-L2目的基因純化片段與pMD 18-T載體連接,轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細胞DH5ci中,提取重組質(zhì)粒,經(jīng)克隆篩選后進行測序分析,得到與目的基因片段相同序列的陽性標準重組質(zhì)粒;
所述目的基因片段為序列表中 的SEQ ID N0.1序列:
CCGCAATGGGAAAGCACTCACTTCATCCCAACATCATGATTACATGGGAAGAGCAGCACTGTTACGCAACGAA
TTGAAATTGGGACGTGCAATCCTTCACATTACCAGCGTCA。
[0025]用以構(gòu)建TO-L2實時熒光定量PCR陽性標準重組質(zhì)粒的普通PCR反應(yīng)體系:
普通PCR反應(yīng)體系為25 μ L,反應(yīng)體系如下:2 μ L樣品DNA模板,陰性對照以無菌三蒸
水為模板,2.5μ L IOXPCR Buffer,2y L dNTP,正、反向引物各 0.5 μ L(20Mmol/L),0.5 μ LTaqDNA聚合酶(大連寶生物工程公司),其余體積以無菌三蒸水補足;反應(yīng)體系輕柔混合,于普通PCR儀進行擴增反應(yīng)。
[0026]普通PCR程序為:95°C熱啟動Imin ;94°C變性30s ;55°C退火30s ;72°C延伸30s,30個循環(huán)。最后72°C延伸IOmin0
[0027]雞H)-L2實時熒光定量PCR引物由某生物公司合成,引物序列如下:
正向引物 F: 5' - CCGCAATGGGAAAGCAC -3',
反向引物 R: 5' - TGACGCTGGTAATGTGAAGGA -3'。
[0028]將普通PCR產(chǎn)物進行2%瓊脂糖電泳分析,電壓100V,35min后在紫外燈下觀察產(chǎn)物,結(jié)果顯示擴增出單一條帶,片段大小在IOObp左右。
[0029]擴增結(jié)果見附圖1,圖中M為DL2000分子量標準,I為H)-L2基因的擴增產(chǎn)物,擴增條帶教清晰,無引物二聚體影響。擴增序列經(jīng)克隆、測序后,在GenBank中進行核酸同源性的比對,結(jié)果顯示,獲得的序列SEQ ID N0.1與GenBank中雞PD- L2基因(XM424812)的序列同源性為100%,說明引物及擴增產(chǎn)物都正確,可用于下一步實驗研究。
[0030]將特異性片段進行瓊脂糖凝膠回收后,進行克隆轉(zhuǎn)化,將獲得的陽性克隆交由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司進行測序分析。[0031]實施例2:雞PD-L2實時熒光定量PCR體系的建立
(I)質(zhì)粒DNA模板的制備
利用實施例1瓊脂糖凝膠回收后的ro- L2目的基因片段與pMD 18-T載體(TaKaRa,大連)連接,然后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細胞DH5ci中,提取重組質(zhì)粒;克隆篩選后進行測序分析,測序結(jié)果顯示與GenBank中PD-L2基因的序列100%同源,說明所獲得序列正確,陽性質(zhì)??捎糜谫|(zhì)粒標準品的制作。使用微量核酸蛋白分光光度儀測定該標準品質(zhì)粒DNA濃度為152.1 μ g/mL,將初始標準品質(zhì)粒溶液進行1:10倍的倍比稀釋。
[0032](2)標準質(zhì)粒濃度的計算和H)-L2標準曲線的制作
提取經(jīng)過測序驗證的陽性克隆的質(zhì)粒,將獲得的質(zhì)粒DNA濃度換算成拷貝數(shù)。
[0033]質(zhì)??截悢?shù)的計算方法為:拷貝數(shù)(copies/μ L)=濃度(μ g/μ L) X 6.02 X IO23 (copies/ μ L) / MW (g/mol)。
[0034]其中MW=(克隆載體長度+目的片段長度)(bp) X660 g/mol/ bp。
[0035]已知:cDNA=104.6 μ g/mL。質(zhì)粒PMD18-T序列長度為2692bp,PD- L2基因插入片段長度為113 bp,單個堿基的平均摩爾質(zhì)量為660 g/mol,計算公式為:
分子量(MW)= (2692+113) X660=1.85X IO6 g/mol。
[0036]質(zhì)粒拷貝濃度:6.02X IO23X ( 152.1 X 10_9)+ (1.85X 106)=4.95X IO10 copies/μ L0
[0037]將上述已知拷 貝濃度的質(zhì)粒溶液作為標準質(zhì)粒,在進行Real-time PCR標準曲線繪制時按1:10倍梯度稀釋(濃度范圍為4.95X 1010-4.95 X IO1 copies/μ L)。
[0038]將已知拷貝數(shù)的質(zhì)粒進行10倍梯度稀釋,獲得質(zhì)粒標準品。
[0039]以稀釋好的質(zhì)粒為模板,進行實時熒光定量PCR擴增反應(yīng),反應(yīng)采用Real-timePCR試劑盒SYBR PremixExTaqTM (Invitrogen公司),反應(yīng)體系為20μ L:2μ L標準質(zhì)粒模板,F(xiàn)、R 引物(20Mmol/L)各 0.2μ L,SYBR Green I PreMix (Real-time PCR 試劑盒 SYBRPremixExTaqTM, Invitrogen 公司)10KL,三蒸水 7.6 μ L。每次 Real-time PCR 反應(yīng)中均設(shè)置陰性對照(模板為2 μ LddH2O), Real-time PCR程序為:95°C熱啟動30s ;94°C變性5s;60°C退火和延伸34s,60°C時收集熒光信號,40個循環(huán)。其中的F、R引物與實施例1相同。
[0040]標準曲線及所有待測樣品均設(shè)置3個平行反應(yīng)。反應(yīng)在ABI 7500定量PCR儀(美國Life Technologies)中進行,利用ABI 7500軟件檢測和收集熒光信號,并進行數(shù)據(jù)分析。
[0041]ABI 7500軟件實時熒光定量分析軟件自行繪制出反應(yīng)的擴增曲線(見附圖2)。擴增曲線顯示,從左至右6條曲線依次代表標準品107、106、105、104、IO3UO2的梯度稀釋液的擴增曲線,6個質(zhì)粒標準品擴增曲線較光滑,呈現(xiàn)典型的S型,且各循環(huán)閾值(Ct值)間隔均勻。
[0042]根據(jù)擴增曲線提供的標準品各濃度梯度及反應(yīng)的循環(huán)閾值(Ct值),ABI 7500軟件自行繪制出反應(yīng)的標準曲線(見附圖3)。該標準曲線的相關(guān)系數(shù)R2=0.995,斜率為-3.808,標準曲線為Y=-3.808Χ + 45.293,其中Y為熒光實時定量PCR反應(yīng)的Ct值,X為PD-L2基因構(gòu)建的標準質(zhì)??截悢?shù)對數(shù)值。計算其擴增效率Eff%=83.074%,符合ABI 7500熒光定量分析對標準曲線的要求。
[0043]測定各濃度稀釋梯度的標準品在熒光定量PCR過程中的溶解溫度并繪制溶解曲線(見附圖4)。標準品及樣品的溶解曲線型峰單一,且標準品溶解溫度相同(80.0±0.5°C),表明擴增反應(yīng)產(chǎn)物溶解溫度均一,特異性好且無引物二聚體。
[0044]根據(jù)熒光信號的變化及標準曲線即可測出樣品DNA中H)- L2的基因豐度。
[0045]實施例3:雞TO-L2實時熒光定量PCR體系敏感性、特異性及重復(fù)性分析
采用實施例1構(gòu)建的雞ro-L2重組質(zhì)粒作為陽性重組標準質(zhì)粒,采用實施例2所建立的雞ro-L2實時熒光定量PCR檢測體系,實時熒光定量PCR儀采用Life Technologies公司(美國)生產(chǎn)的ABI 7500熒光定量PCR儀進行。
[0046]用10倍系列稀釋的IO1~IO9 copies/μ L雞TO-L2陽性重組標準質(zhì)粒做敏感性試驗,結(jié)果表明Η)-?2的檢測下限為10 copies/ μ L。
[0047]對雞H)-L2分子Real-time -PCR溶解曲線(見附圖4)及產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳做特異性分析,結(jié)果表明,溶解曲線出現(xiàn)單一狹窄峰,能夠擴增到與預(yù)期目的片段同樣大小的特異性片段,沒有生成非特異性產(chǎn)物和引物二聚體(見附圖5)。
[0048]用建立的方法分別進行批內(nèi)和批間重復(fù)性檢測,結(jié)果顯示,批內(nèi)和批間的變異系數(shù)小于3%,重復(fù)性良好(見附表1)。
[0049]表1雞H)-L2實時熒光定量PCR方法批內(nèi)與批間重復(fù)性評價結(jié)果
【權(quán)利要求】
1.雞外周血單核淋巴細胞ro-L2實時熒光定量PCR陽性標準重組質(zhì)粒的構(gòu)建方法,其特征在于:該方法包括以下步驟: 采集雛雞的外周血,分離出淋巴細胞,提取淋巴細胞的總RNA,將總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,將cDNA保存于-20°C,采用普通PCR方法擴增TO-L2目的基因片段; 采用普通PCR方法擴增TO-L2目的基因片段,將該目的基因片段經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,并回收純化;然后將TO-L2目的基因純化片段與pMD 18-T載體連接,轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細胞DH5a中,提取重組質(zhì)粒,經(jīng)克隆篩選后進行測序分析,得到與目的基因片段相同序列的陽性標準重組質(zhì)粒; 其中普通PCR擴增時的反應(yīng)體系為25 μ L,反應(yīng)體系如下'2 μ L樣品cDNA模板,2.5 μ LIOXPCR Buffer,2y L dNTP,濃度為20Mmol/L的正向引物和反向引物各0.5 μ L,0.5 μ L的TaqDNA聚合酶,其余為無菌三蒸水; 其中,正向引物 F: 5' - CCGCAATGGGAAAGCAC -3', 反向引物 R: 5' - TGACGCTGGTAATGTGAAGGA -3'。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的構(gòu)建方法,其特征在于:所述目的基因片段為序列表的SEQID N0.1 序列。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的構(gòu)建方法,其特征在于:其中普通PCR反應(yīng)程序:95°C熱啟動Imin ;94°C變性30s ;55°C退火30s ;72°C延伸30s, 30個循環(huán),最后72°C延伸IOmin。
4.一種雞外周血單核淋巴細胞TO-L2基因的豐度實時檢測方法,其特征在于:該方法包括以下步驟: (1)將回收純化的H)-L2目的基因片段與pMD 18-T載體連接,然后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細胞DH5a中,提取重組質(zhì)粒;經(jīng)克隆篩選后進行測序分析,選取與H)- L2目的基因片段相同序列的陽性質(zhì)粒作為標準品質(zhì)粒,測定標準品質(zhì)粒的DNA濃度,并換算成質(zhì)粒的拷貝濃度,按I: 10倍的濃度梯度稀釋陽性質(zhì)粒; (2)以稀釋的陽性質(zhì)粒為模板,進行實時熒光定量PCR擴增反應(yīng),用實時熒光定量PCR儀檢測熒光信號,反應(yīng)結(jié)束后繪制出標準曲線,然后根據(jù)熒光信號的變化及標準曲線測出樣品DNA中H)- L2的基因豐度; 其中實時熒光定量PCR擴增的反應(yīng)體系為20 μ L,包括2 μ L質(zhì)粒模板,濃度為20Mmol/L的正向引物F和反向引物R各0.2 μ L,SYBR Green I PreMix 10μl,三蒸水7.6 μ L ; 其中,正向引物 F: 5' - CCGCAATGGGAAAGCAC -3', 反向引物 R: 5' - TGACGCTGGTAATGTGAAGGA -3'。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的豐度實時檢測方法,其特征在于:所述目的基因片段為序列表的SEQ ID N0.1序列。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的豐度實時檢測方法,其特征在于:其中熒光定量PCR反應(yīng)程序為:95°C熱啟動30s ;94°C變性5s ;60°C退火和延伸34s,60°C時收集熒光信號,再40個循環(huán)。
7.根據(jù)權(quán)利要求4所述的豐度實時檢測方法,其特征在于:所述的實時熒光定量PCR儀為ABI 7500 Fast型熒光定量PCR儀。
8.根據(jù)權(quán)利要求4-7任一項所述的豐度實時檢測方法,其特征在于:所述稀釋的陽性質(zhì)粒濃度范圍為為4.95Χ1010Χ101 copies/μ L ;所述標準曲線的相關(guān)系數(shù)R2=0.995,斜率為-3.808。
9.權(quán)利要求4-7任一項所述的檢測方法在分析雞感染免疫抑制性疾病后TO-L2基因的轉(zhuǎn)錄水平變化規(guī)律中的應(yīng)用。`
【文檔編號】C12N15/63GK103820481SQ201410037328
【公開日】2014年5月28日 申請日期:2014年1月26日 優(yōu)先權(quán)日:2014年1月26日
【發(fā)明者】王選年, 孫國鵬, 王愛國, 張艷芳, 朱艷平, 李鵬, 岳鋒, 張萬方, 李博文, 楊媛, 阮濤, 王軍 申請人:新鄉(xiāng)學院
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