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β地中海貧血突變檢測試劑盒的制作方法

文檔序號:566669閱讀:429來源:國知局
專利名稱:β地中海貧血突變檢測試劑盒的制作方法
技術領域
本發(fā)明涉及一種β地中海貧血突變檢測試劑盒,特別是涉及利用一種不對稱擴 增的方法檢測β -地中海貧血核苷酸多態(tài)性的試劑盒,該試劑盒包含一套特異性核苷酸多 態(tài)性探針和擴增樣品中靶基因的PCR引物,用于檢測由于點突變引起的β -地中海貧血。
背景技術
地中海貧血分為α -地中海貧血和β -地中海貧血(簡稱β _地貧)。β _地貧 是一種由β珠蛋白基因異常導致肽鏈表達失衡而產(chǎn)生的單基因遺傳血液病,多由珠蛋 白基因點突變所致,是我國南方各省最常見、危害最大的遺傳病之一,也是世界上最常見的 遺傳性之一,據(jù)統(tǒng)計全世界約有1億多人攜帶地中海貧血基因。我國廣東、廣西、四川、 香港、臺灣北部、云南、貴州、海南、福建、湖南、湖北是地中海貧血的高發(fā)省區(qū),在新疆 也有發(fā)現(xiàn)。我國部分省份的β-地中海貧血發(fā)生率見表1。表1我國部分省份的β -地中海貧血發(fā)生率
權(quán)利要求
1.一種β地中海貧血突變檢測試劑盒,由PCR試劑、以尼龍膜為載體的低密度芯片、雜 交試劑組成,其特征在于PCR試劑中三對PCR引物序列分別為IF-β :5’ -AGTAGCAATTTGTACTGATGGTATGG-3’ 1R- β 5 ’ -CCCAGTTTCTATTGGTCTCCTTAAACC-3’ 2F- β 5,-GATAGGCACTGACTCTCTCTGC-3’ 2R- β 5,-GAACTTAACCATAGAAAAGAAGG-3, 3F- β 5 ’ -GTATCATGCCTCTTTGCACCATTC-3’ 3R-0 :5, -CACACAGACCAGCACGTTGCCCAGGAGC-3,。
2.根據(jù)權(quán)利要求1的試劑盒,其特征還在于點在低密度芯片上的特異性探針的序列TATA32--N:5,-TGGGCATAAAAGTCAGTG-3’TATA32--M:5,-TGGGAATAAAAGTCAGGTG-3,TATA30--N:5,-GGCATAAAAGTCAGGGCTA-3,TATA30--M:5,-GGCACAAAAGTCAGGGCTA-3,TATA29--N:5,-GCATAAAAGTCAGGGCATG-3,TATA29--M:5,-GCATGAAAGTCAGGGCATG-3,TATA28--N:5,-GCATAAAAGTCAGGGCAGATG--3TATA28--M:5,-GCATAGAAGTCAGGGCAGATG--3Cap+I-N :5,-CTATCTATTGCTTACATTTG-3, Cap+I-M :5,-CTATCTATTGCTTCCATTTG-3, Cap40-43-N :5’ -GCAACCTCAAACAGACA-3’ Cap40-43-M :5’ -GCAACCTCAGACACCAT-3, Innitiation-N :5’ -CTAAACAGACACCATGGTG-3 Innitiation-M :5’ -CTAAACAGACACCAGGGTG-3 CD8-N :5’ -CTGAGGAGAAGTCTGC-3’ CD8-M :5’ -CTGAGGAGGTCTGCCG-3’CD8/9-N5’ -CTGAGGAGAAGTCTGC-3’CD8/9-M5’ -TGAGGAGAAGGTCTGC-3’CD14,/15-N5 ’ -TTACTGCCCTGTGGG-3’CD14,/15-M5 ’ -TTACTGCCCTGGTGG-3’CD17--N 5,-CTCCTGTGGGGCAAGGTGA-3‘CD17--M 5,-CTCCTGTGGGGCTAGGTGA-3‘CD19--N 5,-GGTGAACGTGGATGAAGTTAG--3CD19--M 5,-GGTGGACGTGGATGAAGTTAG--3CD26--N 5,-GTAAGTTGGTGGTGAGGC-3’CD26--M 5,-GTAAGTTGGTGGTAAGGC-3’CD27,/28-N5' -TGGTGAGGCCCTGG-3’CD27,/28-M:5’ -TGGTGAGGCCCCTG-3’CD30--N 5,-CTTAGGCTGCTGGTGGTCTAC--3CD30--M :5,-CTTAGGCTGCTGGTGGTCTAC-3CD31--N :5,-CTTAGGCTGCTGGTGGTC-3’CD31--M :5,-CCTTAGGTGCTGGTGGTC-3’CD37--N :5,-CCTTGGACCCAGAGGTTAC-3’CD37--M :5,-CCTTAGACCCAGAGGTTAC-3’CD41--N :5,-TGGACCCAGAGGTTCTTTG-3’CD41--M :5,-TGGACCCAGAGGTTTCTTTG-3’CD41,/42-N:5, -GGTTCTTTGAGTCCTTTG-3CD41,/42-M:5’ -GGTTGAGTCCTTTGGGGA-3CD43--N :5,-CTTTGAGTCCTTTGGGGACT-3’CD43--M :5,-CTTTTAGTCCTTTGGGGACT-3,71/72-Ν5’ -GGTGCCTTTAGTGATGG-3’71/72-Μ5’ -TCGGTGCCTTTTAGTGATG-3’CD95--N :5,-ACTGTGACAAGCTGCAC-3’CD95--M :5,-ACTGTGACAAAGCTGCAC-3,IVSI-I-N :5’ -GGCAGGTTGGTATCAAGT-3’ IVSI-I-M :5’ -GGCAGTTTGGTATCAAGT-3’ IVSII-I-N :5’ -GTTGGTATCAAGGTTACTA-3’ IVSII-I-M :5’ -GTTGCTATCAAGGTTACAA-3’ IVSII-5-N :5’ -GTAACTTCAGGGTGAGTCT-3’ IVSII-5-M :5’ -GTAACTTCAGGGTGACTCT-3’ IVSII-nt654-N :5’ -TAAGGCAATAGCAATATAC-3’ IVSII-nt654-M :5’ -TAAGGTAATAGCAATATAC-3’ 顯色控制點5,-GCCGTAACCGTCACAATCCGT-3,。
3.根據(jù)權(quán)利要求1的試劑盒,其特征還在于PCR試劑中上游引物lF-β、2F-i3、3F-i3 的終濃度為ΙμΜ,下游引物IR-β、2R-i3、3R-i3的終濃度為10 μ Μ。
4.根據(jù)權(quán)利要求1的試劑盒,其特征還在于點在低密度芯片上的特異性探針的濃度為 5 μ M0
5.根據(jù)權(quán)利要求1的試劑盒,其特征還在于雜交試劑中雜交液I的組成為2XSSC, 0. 5% SDS,雜交液II的組成為0. 5XSSC,0. 5% SDS,辣根過氧化物酶的用量為0. IU。
6.根據(jù)權(quán)利要求1的試劑盒,其特征還在于雜交試劑中顯色底物包括TMB或0PD。
全文摘要
本發(fā)明涉及一種β地中海貧血突變檢測試劑盒,特別是涉及利用一種不對稱擴增的方法檢測β-地中海貧血核苷酸多態(tài)性的試劑盒,該試劑盒包含一套特異性核苷酸多態(tài)性探針和擴增樣品中靶基因的PCR引物,可以檢測27種β-地中海貧血突變,并且檢測過程更加快速,檢測結(jié)果也更為準確。
文檔編號C12Q1/68GK102115781SQ20091021439
公開日2011年7月6日 申請日期2009年12月30日 優(yōu)先權(quán)日2009年12月30日
發(fā)明者張帆, 李明, 林炳生, 程鋼, 陳華云 申請人:中山大學達安基因股份有限公司
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