本發(fā)明涉及細(xì)胞檢測(cè),尤其涉及一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法。
背景技術(shù):
1、細(xì)胞是組成生命的基本單元,主要由蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、核酸等分子構(gòu)成,不同細(xì)胞以及相同細(xì)胞不同發(fā)育階段存在分子成分及含量差異,例如在細(xì)胞癌變的過(guò)程中通常存在代謝差異。拉曼光譜是分子散射光譜,可以反映分子共價(jià)鍵本征振動(dòng)信息,進(jìn)而通過(guò)細(xì)胞拉曼光譜,獲取細(xì)胞的分子種類和含量信息。單細(xì)胞拉曼光譜技術(shù)具有無(wú)標(biāo)無(wú)損的檢測(cè)優(yōu)勢(shì),在細(xì)胞鑒別、癌癥診斷、癌癥預(yù)后判斷等領(lǐng)域具有潛在應(yīng)用價(jià)值。當(dāng)前細(xì)胞拉曼光譜檢測(cè)與顯微鏡聯(lián)用,將分析樣本置于顯微鏡下,由顯微鏡將拉曼激發(fā)光斑聚焦在細(xì)胞上,激發(fā)細(xì)胞拉曼信號(hào)后由物鏡收集,將散射信號(hào)傳輸至光譜儀中獲取細(xì)胞拉曼光譜,用于后續(xù)的分析。
2、現(xiàn)有的拉曼顯微分析系統(tǒng)中,依靠白光顯微鏡來(lái)尋找和定位細(xì)胞,尋找激發(fā)的位置。但是細(xì)胞是一個(gè)空間三維結(jié)構(gòu),并且細(xì)胞空間形態(tài)各異,不同結(jié)構(gòu)具有顯著的成分差異。顯微物鏡將拉曼激發(fā)光聚焦的光斑尺寸通常小于細(xì)胞尺寸,并且傳統(tǒng)顯微鏡獲取的是細(xì)胞中某一層的平面結(jié)構(gòu)圖像,通過(guò)振鏡或者平移臺(tái)將細(xì)胞樣品置于聚焦光斑位置上來(lái)進(jìn)行水平方向(橫向)定位。在水平方向,細(xì)胞輪廓與外部環(huán)境有較為清晰的邊界,可以輔助細(xì)胞定位,但是在顯微鏡光軸方向,通過(guò)檢測(cè)人員手動(dòng)調(diào)節(jié)顯微鏡焦距來(lái)對(duì)細(xì)胞不同層進(jìn)行成像和軸向(縱向)定位,細(xì)胞內(nèi)部是近乎透明的樣本,染色、增加熒光標(biāo)記的方法均會(huì)破壞拉曼光譜無(wú)標(biāo)記檢測(cè)優(yōu)勢(shì),染料、熒光標(biāo)記物的信號(hào)均會(huì)對(duì)樣本拉曼光譜造成干擾,乃至無(wú)法進(jìn)行拉曼光譜檢測(cè)。在不標(biāo)記、不染色的情況下,細(xì)胞內(nèi)部結(jié)構(gòu)對(duì)比度低,細(xì)胞內(nèi)部結(jié)構(gòu)對(duì)比度低,各層之間的差別幾乎不能分辨,
3、因此常規(guī)拉曼檢測(cè)不能有效分辨軸向即不同層面上激光光斑聚焦位置,軸向分辨率低,僅僅只能依靠實(shí)驗(yàn)者的經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行判斷,導(dǎo)致細(xì)胞拉曼激發(fā)光斑軸向定位精度低,激發(fā)光譜的一致性無(wú)法保障,在后續(xù)的分析中引入采樣誤差,導(dǎo)致當(dāng)前整體技術(shù)分析精度下降。目前尚沒(méi)有無(wú)標(biāo)記、不染色、客觀、定量的進(jìn)行細(xì)胞拉曼光譜檢測(cè)軸向定位的方法,用于保證細(xì)胞拉曼光譜軸向采樣的一致性。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明為解決上述問(wèn)題,提供一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法。
2、本發(fā)明目的在于提供一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,具體包括如下步驟:
3、s1.選擇拉曼光譜存在差異的兩種不同材質(zhì)的玻片,分別作為載玻片和蓋玻片;通過(guò)測(cè)試,分別得到載玻片和蓋玻片的歸一化標(biāo)準(zhǔn)拉曼光譜;
4、s2.將待測(cè)細(xì)胞樣本固定于載玻片和蓋玻片中間,制成檢測(cè)樣本;將檢測(cè)樣本放置于顯微物鏡之下,在普通白光照明下調(diào)節(jié)焦距,尋找目標(biāo)細(xì)胞位置;
5、s3.找到目標(biāo)細(xì)胞后,將光源切換為激光,在細(xì)胞樣本上形成激發(fā)拉曼信號(hào)的聚焦光斑,檢測(cè)此時(shí)樣本的拉曼光譜;
6、s4.利用回歸算法求解出蓋玻片和載玻片拉曼光譜的強(qiáng)度系數(shù),構(gòu)造相關(guān)線性方程組,計(jì)算得到細(xì)胞樣本的拉曼光譜;
7、s5.根據(jù)蓋玻片和載玻片拉曼光譜的強(qiáng)度系數(shù),構(gòu)造光斑軸向的歸一化定位系數(shù);
8、s6.構(gòu)建判別模型;將已知類型細(xì)胞樣本采集得到的拉曼光譜作為訓(xùn)練集數(shù)據(jù)庫(kù),訓(xùn)練判別模型;用訓(xùn)練好的判別模型對(duì)待測(cè)細(xì)胞樣本進(jìn)行判別,得到判別結(jié)果。
9、優(yōu)選的,步驟s4中的回歸算法為最小二乘法;細(xì)胞樣本的拉曼光譜的表達(dá)式如下:
10、;
11、式中,s為檢測(cè)得到的測(cè)試總和拉曼光譜,s1、s2分別為蓋玻片和載玻片的歸一化標(biāo)準(zhǔn)拉曼光譜,a1、a2分別為檢測(cè)時(shí)蓋玻片和載玻片拉曼光譜的強(qiáng)度系數(shù),r為細(xì)胞樣本的拉曼光譜。
12、優(yōu)選的,蓋玻片拉曼光譜的強(qiáng)度系數(shù)a1或載玻片拉曼光譜的強(qiáng)度系數(shù)a2的取值最小為0。
13、優(yōu)選的,步驟s4中相關(guān)線性方程組表達(dá)式如下:
14、;
15、式中,s為檢測(cè)得到的測(cè)試總和拉曼光譜,s1、s2分別為蓋玻片和載玻片的歸一化標(biāo)準(zhǔn)拉曼光譜,a1、a2分別為檢測(cè)時(shí)蓋玻片和載玻片拉曼光譜的強(qiáng)度系數(shù),r為細(xì)胞樣本的拉曼光譜,ωi為拉曼頻移,n為拉曼光譜中的光譜通道數(shù)。
16、優(yōu)選的,步驟s2中尋找目標(biāo)細(xì)胞位置的方法是在水平成像面上移動(dòng)檢測(cè)樣本至聚焦光斑。
17、優(yōu)選的,樣本的拉曼光譜包括蓋玻片的拉曼光譜、細(xì)胞樣本的拉曼光譜和載玻片的拉曼光譜。
18、優(yōu)選的,歸一化定位系數(shù)如下式所示:
19、;
20、式中,c1表征拉曼測(cè)試蓋玻片與激發(fā)光斑的軸向距離,c2表征拉曼測(cè)試載玻片與激發(fā)光斑的距離。
21、優(yōu)選的,步驟s6中構(gòu)建判別模型的方法具體包括:選擇歸一化定位系數(shù)ci取值在0.4~0.6范圍的數(shù)據(jù)建立訓(xùn)練集數(shù)據(jù)庫(kù);基于主成分分析對(duì)訓(xùn)練集數(shù)據(jù)進(jìn)行降維,選取主成分?jǐn)?shù)量,使選擇的主成分對(duì)應(yīng)方差占總量的80%以上,再基于線性判別分析方法建立判別模型。
22、優(yōu)選的,步驟s6中訓(xùn)練判別模型采用機(jī)器學(xué)習(xí)方法;判別方法具體包括:采集待測(cè)細(xì)胞樣本的拉曼光譜,選擇選擇歸一化定位系數(shù)ci取值在0.4~0.6范圍的數(shù)據(jù)作為測(cè)試集數(shù)據(jù),將測(cè)試集數(shù)據(jù)帶入訓(xùn)練好的判別模型,得到判別結(jié)果。
23、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明能夠取得如下有益效果:
24、本發(fā)明提出了一種新型的細(xì)胞拉曼顯微檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位判斷方法,通過(guò)在顯微拉曼測(cè)試中,在細(xì)胞樣本制作過(guò)程中引入兩種不同材質(zhì)玻片,測(cè)定玻片的標(biāo)準(zhǔn)拉曼光譜后,將細(xì)胞樣本置于兩個(gè)玻片中間,測(cè)試獲得樣本整體光譜后,通過(guò)最小二乘法等回歸算法計(jì)算兩玻片對(duì)整體測(cè)試?yán)庾V強(qiáng)度的貢獻(xiàn)量,據(jù)此創(chuàng)新性地給出了細(xì)胞激發(fā)光斑歸一化定位系數(shù),據(jù)此可以在不進(jìn)行樣本染色、不標(biāo)記的情況下,避免對(duì)細(xì)胞拉曼測(cè)試產(chǎn)生干擾的情況,可以精確實(shí)現(xiàn)細(xì)胞拉曼光譜顯微檢測(cè)中,細(xì)胞拉曼軸向激發(fā)位置的客觀定位判斷、校準(zhǔn)。本發(fā)明可以實(shí)現(xiàn)細(xì)胞拉曼光譜檢測(cè)中,對(duì)于聚焦光斑在細(xì)胞軸向(垂直于顯微成像面)方向上激發(fā)位置的定位及判斷的客觀方法,擺脫人為經(jīng)驗(yàn)觀測(cè)引入的采樣誤差,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞拉曼軸向激發(fā)位置的歸一化,確保數(shù)據(jù)采集的準(zhǔn)確性,為后續(xù)的精準(zhǔn)分析打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
1.一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,其特征在于,具體包括如下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,其特征在于:所述步驟s4中的回歸算法為最小二乘法;細(xì)胞樣本的拉曼光譜的表達(dá)式如下:
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,其特征在于:蓋玻片拉曼光譜的強(qiáng)度系數(shù)a1或載玻片拉曼光譜的強(qiáng)度系數(shù)a2的取值最小為0。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,其特征在于:所述步驟s4中相關(guān)線性方程組表達(dá)式如下:
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,其特征在于:所述步驟s2中尋找目標(biāo)細(xì)胞位置的方法是在水平成像面上移動(dòng)檢測(cè)樣本至聚焦光斑。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,其特征在于:所述樣本的拉曼光譜包括蓋玻片的拉曼光譜、細(xì)胞樣本的拉曼光譜和載玻片的拉曼光譜。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,其特征在于:所述歸一化定位系數(shù)如下式所示:
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,其特征在于:所述步驟s6中構(gòu)建判別模型的方法具體包括:選擇歸一化定位系數(shù)ci取值在0.4~0.6范圍的數(shù)據(jù)建立訓(xùn)練集數(shù)據(jù)庫(kù);基于主成分分析對(duì)訓(xùn)練集數(shù)據(jù)進(jìn)行降維,選取主成分?jǐn)?shù)量,使選擇的主成分對(duì)應(yīng)方差占總量的80%以上,再基于線性判別分析方法建立判別模型。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的一種細(xì)胞顯微拉曼檢測(cè)軸向精準(zhǔn)定位及判斷方法,其特征在于:所述步驟s6中訓(xùn)練判別模型采用機(jī)器學(xué)習(xí)方法;判別方法具體包括:采集待測(cè)細(xì)胞樣本的拉曼光譜,選擇選擇歸一化定位系數(shù)ci取值在0.4~0.6范圍的數(shù)據(jù)作為測(cè)試集數(shù)據(jù),將測(cè)試集數(shù)據(jù)帶入訓(xùn)練好的判別模型,得到判別結(jié)果。