本發(fā)明屬于分子檢測(cè),具體是涉及一種用于急性髓系白血病診斷的trna修飾分子標(biāo)志物及應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、急性髓系白血病(acute?myeloid?leukemia,aml)是一組以髓系起源,幼稚細(xì)胞在骨髓、外周血或其他組織中惡性增殖,并引起發(fā)熱、貧血、出血和腫瘤浸潤(rùn)等臨床表現(xiàn)的造血系統(tǒng)腫瘤?,F(xiàn)有micm評(píng)估分層體系主要依靠形態(tài)學(xué)、免疫學(xué)、細(xì)胞遺傳學(xué)和分子生物學(xué)對(duì)aml患者進(jìn)行診斷、治療和預(yù)后評(píng)估,雖可以有效的指導(dǎo)臨床診斷,但是缺乏表觀修飾類的分子生物學(xué)診斷標(biāo)志物,不能滿足臨床上對(duì)于精準(zhǔn)診斷的需求。此外,aml診斷需要進(jìn)行骨髓穿刺和活檢,有一定創(chuàng)傷;二代測(cè)序技術(shù)檢測(cè)dna或mrna層面的基因異常和染色體核型檢測(cè)細(xì)胞遺傳學(xué)異常需要的實(shí)驗(yàn)室輪轉(zhuǎn)時(shí)間較長(zhǎng),檢驗(yàn)科檢驗(yàn)項(xiàng)目報(bào)告時(shí)限(tat)均為7-14天,實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣且成本高。
2、隨著分子診斷技術(shù)在白血病領(lǐng)域的應(yīng)用,白血病的診斷已從過(guò)去以形態(tài)為主的診斷體系,正逐步向以精確分子診斷為核心的個(gè)體化診斷體系發(fā)展。近年來(lái)研究表明,表觀遺傳學(xué)影響白血病的發(fā)生、發(fā)展,因此,dna甲基化修飾、rna甲基化修飾、trna修飾等表觀修飾,有望作為新型分子標(biāo)志物輔助疾病的診斷,提高患者的生存概率。
3、trna是一種非編碼rna,一般長(zhǎng)度為76-90個(gè)核苷酸,是蛋白質(zhì)高效和準(zhǔn)確翻譯的關(guān)鍵。trna上的核苷酸存在廣泛修飾,這些修飾對(duì)于trna在細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮功能起著重要作用。臨床上期待發(fā)現(xiàn)更多特異而敏感的trna修飾,作為aml精準(zhǔn)診斷的分子標(biāo)志物。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、基于此,本發(fā)明的目的是一種用于急性髓系白血病診斷的特異性分子標(biāo)志物及其在急性髓系白血病檢測(cè)中的應(yīng)用,所述分子標(biāo)志物為總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾,基于所述分子標(biāo)志物可簡(jiǎn)單、快速地實(shí)現(xiàn)急性髓系白血病的輔助診斷。
2、本發(fā)明的第一個(gè)方面,是提供總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷(n6-threonylcarbamoyladenosine,t6a)修飾作為分子標(biāo)志物在制備急性髓系白血病檢測(cè)試劑中的應(yīng)用。
3、本發(fā)明的第二個(gè)方面,是提供檢測(cè)總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾水平的試劑在制備急性髓系白血病檢測(cè)試劑盒中的應(yīng)用。
4、在其中一些實(shí)施例中,所述檢測(cè)試劑盒用于色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)檢測(cè)。
5、在其中一些實(shí)施例中,所述試劑為n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷。n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷作為對(duì)照品使用。
6、在其中一些實(shí)施例中,所述試劑還包括流動(dòng)相,所述流動(dòng)相包括a相和b相,所述a相為0.05%~2.0%甲酸水溶液,優(yōu)選為0.1%~2.0%甲酸水溶液,更優(yōu)選為0.1%~1.0%甲酸水溶液;所述b相為0.05%~2.0%甲酸甲醇溶液,優(yōu)選為0.1%~2.0%甲酸甲醇溶液,更優(yōu)選為0.1%~1.0%甲酸甲醇溶液。
7、本發(fā)明的第三個(gè)方面,是提供一種非診斷目的的檢測(cè)急性髓系白血病的方法,包括以下步驟:獲取待測(cè)樣品的總trna,檢測(cè)所述總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾水平。
8、在其中一些實(shí)施例中,使用色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)檢測(cè)所述總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾水平。
9、在其中一些實(shí)施例中,色譜檢測(cè)條件包括:流動(dòng)相:包括a相和b相,所述a相為0.05%~2.0%甲酸水溶液,優(yōu)選為0.1%~2.0%甲酸水溶液,更優(yōu)選為0.1%~1.0%甲酸水溶液;所述b相為0.05%~2.0%甲酸甲醇溶液,優(yōu)選為0.1%~2.0%甲酸甲醇溶液,更優(yōu)選為0.1%~1.0%甲酸甲醇溶液。
10、在其中一些實(shí)施例中,色譜檢測(cè)條件包括:色譜柱:waters?acquity?beh?c18;柱溫:35℃~55℃;進(jìn)樣量:1μl~40μl;采用梯度洗脫。
11、在其中一些實(shí)施例中,所述待測(cè)樣品包括組織樣本、含白細(xì)胞的體液樣本;優(yōu)選地,所述體液樣本為血液。
12、本發(fā)明經(jīng)過(guò)研究發(fā)現(xiàn)總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾可作為急性髓系白血病檢測(cè)的特異性分子標(biāo)志物。與健康人相比,急性髓系白血病患者生物樣本中總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾水平顯著提升;進(jìn)一步的診斷效能分析結(jié)果顯示其在用于急性髓系白血病檢測(cè)檢測(cè)時(shí),當(dāng)閾值為0.0555,auc為0.955,靈敏度為96.77%,特異性為85.29%,具有較高的診斷準(zhǔn)確性和價(jià)值。因此,總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾可作為急性髓系白血病檢測(cè)的特異性分子標(biāo)志物,輔助急性髓系白血病的精準(zhǔn)診斷。
13、此外,基于總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾檢測(cè)可采用待測(cè)者的血液等作為檢測(cè)樣品,取樣方便無(wú)創(chuàng),操作相對(duì)簡(jiǎn)單、成本低,速度快,tat為2-4天。
1.總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾作為分子標(biāo)志物在制備急性髓系白血病檢測(cè)試劑中的應(yīng)用。
2.檢測(cè)總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾水平的試劑在制備急性髓系白血病檢測(cè)試劑盒中的應(yīng)用。
3.如權(quán)利要求2所述的應(yīng)用,其特征在于,所述檢測(cè)試劑盒用于色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)檢測(cè)。
4.如權(quán)利要求2~3任一項(xiàng)所述的應(yīng)用,其特征在于,所述試劑為n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷。
5.如權(quán)利要求4所述的應(yīng)用,其特征在于,所述試劑還包括流動(dòng)相,所述流動(dòng)相包括a相和b相,所述a相為0.05%~2.0%甲酸水溶液,所述b相為0.05%~2.0%甲酸甲醇溶液。
6.一種非診斷目的的檢測(cè)急性髓系白血病的方法,其特征在于,包括以下步驟:獲取待測(cè)樣品的總trna,檢測(cè)所述總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾水平。
7.如權(quán)利要求6所述的方法,其特征在于,使用色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)檢測(cè)所述總trna的n6-蘇氨酰氨基甲酰腺苷修飾水平。
8.如權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,色譜檢測(cè)條件包括:流動(dòng)相:包括a相和b相,所述a相為0.05%~2.0%甲酸水溶液,所述b相為0.05%~2.0%甲酸甲醇溶液。
9.如權(quán)利要求7或8所述的方法,其特征在于,色譜檢測(cè)條件包括:色譜柱:watersacquity?beh?c18;柱溫:35℃~55℃;進(jìn)樣量:1μl~40μl;采用梯度洗脫。
10.如權(quán)利要求6所述的方法,其特征在于,所述待測(cè)樣品包括組織樣本、含白細(xì)胞的體液樣本;優(yōu)選地,所述體液樣本為血液。