本發(fā)明屬于生物標(biāo)志物,具體涉及基于質(zhì)譜的阿爾茨海默癥早期診斷的血漿脂質(zhì)檢測(cè)方法。
背景技術(shù):
1、脂質(zhì)不僅是細(xì)胞膜組成成分,同時(shí)作為細(xì)胞功能的重要執(zhí)行者參與調(diào)控多種生物學(xué)過(guò)程,如細(xì)胞增殖、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等,對(duì)人體健康和大腦功能起著重要作用。大腦中富含大量脂質(zhì),脂質(zhì)平衡的破壞與阿爾茨海默病(alzheimer's?disease,ad)等神經(jīng)退行性疾病有關(guān)。
2、研究發(fā)現(xiàn),ad患者的腦組織中脂質(zhì)代謝發(fā)生顯著變化,尤其是在與神經(jīng)元膜組成和功能相關(guān)的磷脂和膽固醇方面,如脂筏改變和脂質(zhì)過(guò)氧化可能通過(guò)影響細(xì)胞膜的流動(dòng)性、信號(hào)傳導(dǎo)、能量代謝等途徑,參與ad的病理進(jìn)程。因此,解析脂質(zhì)與ad之間的聯(lián)系對(duì)于揭示疾病的代謝問(wèn)題至關(guān)重要。
3、脂質(zhì)結(jié)構(gòu)具有復(fù)雜多樣性,通常由骨架結(jié)構(gòu)、脂肪酰基鏈和頭部集團(tuán)組成。因?yàn)樗鼈兊慕M合性質(zhì),碳原子數(shù)量、不飽和程度、脂肪酸含量和頭部基團(tuán)的變化等均對(duì)脂質(zhì)的鑒定提出了挑戰(zhàn)。在實(shí)際檢測(cè)時(shí),研究者通常只針對(duì)一個(gè)前體離子及對(duì)應(yīng)骨架結(jié)構(gòu)的碎片離子進(jìn)行檢測(cè),忽略了其結(jié)構(gòu)異質(zhì)性對(duì)于鑒定準(zhǔn)確性的影響。因此,建立準(zhǔn)確鑒定脂質(zhì)分子的方法對(duì)于充分探索、了解異質(zhì)性脂質(zhì)的功能具有重要意義。
4、近年來(lái)脂質(zhì)分析方法取得長(zhǎng)足進(jìn)步,特別是基于質(zhì)譜(mass?spectrometry,ms)的脂質(zhì)組學(xué),可對(duì)生物樣本中的脂質(zhì)進(jìn)行高通量分析,不僅具有較高的準(zhǔn)確性和靈敏度,而且還可以提供結(jié)構(gòu)信息。
5、如今,脂質(zhì)組學(xué)分析常用的技術(shù)是lc-esi-ms/ms,可區(qū)分同分異構(gòu)體的同時(shí)減少電離抑制,但其有限的電離和碎裂條件不能適用于所有脂類。“shotgun脂質(zhì)組學(xué)”則是另一種補(bǔ)充方法,在直接輸注樣品的過(guò)程中,可從恒定的溶液濃度中獲得感興趣的脂類分子對(duì)應(yīng)的離子信息,以揭示脂質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)和種類。此外,為了更精確地表征和定量樣品中的分子,須采用高分辨率/高質(zhì)量精度的平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)/多重反應(yīng)監(jiān)測(cè)(multiple?reactionmonitoring,mrm)方法對(duì)脂質(zhì)進(jìn)行靶向定量分析。因而,利用lc-mrm/ms技術(shù)可系統(tǒng)解析ad中脂質(zhì)分子變化特征,有助于我們提高對(duì)ad病理機(jī)制的理解,同時(shí)支持基于血液生物標(biāo)志物的開發(fā)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的在于提供基于質(zhì)譜的阿爾茨海默癥早期診斷的血漿脂質(zhì)檢測(cè)方法,以解決上述背景技術(shù)中提出的問(wèn)題。
2、為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:
3、基于質(zhì)譜的阿爾茨海默癥早期診斷的血漿脂質(zhì)檢測(cè)方法,包括以下步驟:
4、步驟一,shotgun脂質(zhì)組學(xué)確定血漿脂質(zhì)表達(dá)譜:
5、用注射泵將脂質(zhì)提取物以8μl/分鐘的流速推入三重四極桿線性離子阱質(zhì)譜儀,分別在正、負(fù)電噴霧電離模式下,針對(duì)脂質(zhì)的骨架結(jié)構(gòu)進(jìn)行前體離子和中性丟失掃描,包括脂肪酸、甘油磷脂、甘油酯、鞘脂、甾醇;脂質(zhì)分子的確定是基于質(zhì)譜數(shù)據(jù),在lipid?mspredict?tool輔助下手動(dòng)注釋;
6、步驟二,lc-mrm/ms進(jìn)行脂質(zhì)定量分析:
7、基于步驟一獲取的脂質(zhì)分子的m/z,骨架結(jié)構(gòu)和脂肪酸鏈結(jié)構(gòu)的離子信息,建立lc-mrm/ms掃描方法,即設(shè)置脂質(zhì)分子名稱,前體離子m/z,兩個(gè)特征性碎片離子的m/z,去簇電壓(ce),射入電壓(ep),碰撞能(ce),碰撞室射出電位(cxp),掃描時(shí)間(time),利用三重四極桿液質(zhì)聯(lián)用質(zhì)譜儀qtrap?6500系統(tǒng)進(jìn)行數(shù)據(jù)采集,通過(guò)監(jiān)測(cè)分別對(duì)應(yīng)骨架結(jié)構(gòu)和脂肪酸鏈結(jié)構(gòu)的兩個(gè)特征性離子在相同保留時(shí)間內(nèi)共流出以確定同一個(gè)脂質(zhì)分子;
8、步驟三,數(shù)據(jù)分析
9、在skyline中導(dǎo)入原始數(shù)據(jù),根據(jù)內(nèi)標(biāo)或已知標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行峰校準(zhǔn),然后導(dǎo)出各個(gè)碎片離子的峰面積,每個(gè)脂質(zhì)分子的含量可用兩個(gè)碎片離子的峰面積總和表示;為進(jìn)一步排除個(gè)體差異或進(jìn)樣體積的影響,數(shù)據(jù)經(jīng)峰面積歸一化后,獲得各個(gè)脂質(zhì)分子的相對(duì)含量,明確兩組間脂質(zhì)變化特征,將各個(gè)脂質(zhì)分子相對(duì)含量的數(shù)據(jù)進(jìn)行過(guò)濾、預(yù)處理,并利用metaboanalyst?5.0進(jìn)行多變量統(tǒng)計(jì)分析;
10、在此外,偏最小二乘法判別分析(pls-da)算法對(duì)特征進(jìn)行分類和篩選以獲取生物標(biāo)志物;
11、步驟四,機(jī)器學(xué)習(xí)
12、使用支持向量機(jī)(svm)對(duì)脂質(zhì)分子進(jìn)行分類和重要性排序,從中挑選出最具判別力的脂質(zhì)分子作為生物標(biāo)志物。
13、優(yōu)選的,所述步驟一中使用三重四極桿線性離子阱質(zhì)譜系統(tǒng)(qtrap?4000,sciex)進(jìn)行脂質(zhì)骨架結(jié)構(gòu)掃描。
14、優(yōu)選的,所述步驟二中使用三重四極桿線性離子阱質(zhì)譜qtrap?6500系統(tǒng)進(jìn)行mrm掃描。
15、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的有益效果是:
16、1、利用同時(shí)監(jiān)測(cè)脂質(zhì)分子的前體離子對(duì)應(yīng)的兩個(gè)特征性碎片離子在相同的保留時(shí)間共流出的lc-mrm/ms方法,可增加脂質(zhì)分子鑒定的準(zhǔn)確性。
17、2、基于質(zhì)譜定量數(shù)據(jù)和多變量統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果,利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法,可以對(duì)健康人群和阿爾茨海默癥患者進(jìn)行準(zhǔn)確分類,提高分類準(zhǔn)確率。
1.基于質(zhì)譜的阿爾茨海默癥早期診斷的血漿脂質(zhì)檢測(cè)方法,其特征在于,包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于質(zhì)譜的阿爾茨海默癥早期診斷的血漿脂質(zhì)檢測(cè)方法,其特征在于,所述步驟一中使用三重四極桿線性離子阱質(zhì)譜系統(tǒng)(qtrap?4000,sciex)進(jìn)行脂質(zhì)骨架結(jié)構(gòu)掃描。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于質(zhì)譜的阿爾茨海默癥早期診斷的血漿脂質(zhì)檢測(cè)方法,其特征在于,所述步驟二中使用三重四極桿線性離子阱質(zhì)譜qtrap?6500系統(tǒng)根據(jù)兩個(gè)特征性離子信息進(jìn)行多反應(yīng)監(jiān)測(cè)(mrm)。