專利名稱::使用分類預測物鑒別胖和瘦動物的方法
技術領域:
:本發(fā)明一般地涉及在動物中差別表達的基因,尤其與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因。相關領域的描述在科學界普遍接受的是,基因在動物發(fā)育中起作用,且基因表達的調節(jié)在有些影響動物的健康和舒適的疾病或狀況的發(fā)展中起關鍵作用。類似地,基因的差別表達是這樣的疾病和狀況的發(fā)展中的一個因素,已經(jīng)認為基因表達^t式的評價對于在分子水平理解這樣的疾病和狀況的發(fā)展和控制是至關重要的。為了進一步理解基因和它們與疾病的關系,已經(jīng)為研究差別基因表達開發(fā)了許多方法,例如,DNA微陣列、表達標記測序(EST)、基因表達的系列分析(SAGE)、減除雜交法、mRNA的減除克隆和差異展示(DD)、RNA-任意引發(fā)的PCR(RAP-PCR)、代表性差別分析(RDA)、二維凝膠電泳、質譜法和基于抗體蛋白結合的蛋白微陣列。尚未徹底研究與瘦動物相比胖動物中的基因表達。因此,仍然需要鑒別與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因和由這些基因編碼的蛋白。這些基因、蛋白和它們的片段可以用于預測動物可能變胖,診斷動物為肥胖,篩選物質以確定它們是否可能用于調控動物脂肪組織的量,和使用這樣的物質來調控動物脂肪組織的量。胖動物可以定義為具有多余的身體脂肪組織的那些動物。一般而言,重量超過它們理想體重的15%的人、犬(canines)和貓(felines)等動物^皮認為是肥胖的。動物肥胖的最常見原因是食物的過量消耗,后者導致卡路里的過量攝入。但是,存在增加動物肥胖的機會的其它因素,例如,生活方式、健康、飲食習慣、品種、卵巢切除和閹割。并且,由于代謝速率和體育活動的普遍減少,動物變胖的發(fā)生率通常隨著年齡而增加。調查估計,在美國25%的就診獸醫(yī)診所的狗胖至過>11巴胖點。研究已經(jīng)證實,胖動物明顯更易處于關節(jié)炎、心臟病、呼吸系統(tǒng)疾病、糖尿病、膀胱癌、甲狀腺功能減退癥和胰腺炎等疾病的危險中。難以調控動物脂肪組織的量,包括預防動物變胖或治療胖動物以減少動物的脂肪組織的量或治療痩動物以增加動物的脂肪組織的量。增加動物脂肪組織的量通常包含增加消耗的食物的量。最有效且最容易的預防動物變胖或減少動物脂肪的量的方式是飲食限制和鍛煉。但是,經(jīng)常難以確保飲食和鍛煉計劃的依從性。其它方法包括使用藥物例如苯丁胺、芬氟拉明、西布曲明、奧利司他和苯丙醇胺。不幸地,這些藥物具有副作用。例如,施用芬氟拉明和苯丁胺來治療人肥胖癥,可以導致人的心臟瓣膜損害。西布曲明可以增加血壓,奧利司他可能具有使人不快的胃腸副作用。鑒于處理動物脂肪組織的現(xiàn)有方法的問題,仍然需要新的方法和組合物,它們可以用于預測動物可能變胖,i貪斷動物為月巴胖,篩選物質以確定它們是否可能用于調控動物脂肪組織的量,和使用這樣的物質來調控動物脂肪組織的量。發(fā)明概述因此,本發(fā)明的一個目的是,提供與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因或基因片l爻。本發(fā)明的另一個目的是,提供與瘦動物相比在胖動物中差別表達的兩種或多種多核苷酸或多肽的組合。本發(fā)明的另一個目的是,提供適用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達的兩種或多種多核苷酸或多肽探針的組合物,和含有這些探針的裝置例如基質陣列。ii本發(fā)明的另一個目的是,提供用于檢測樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的差別表達的方法和組合物。本發(fā)明的另一個目的是,提供測量測試物質對與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達鐠(profile)的影響的方法,作為篩選測試物質以確定它是否可能用于調控動物脂肪組織的量的方法。本發(fā)明的另一個目的是,提供預測動物可能變胖或診斷動物為肥胖的方法。本發(fā)明的另一個目的是,提供用于調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達或用于調控動物脂肪組織的量的方法和組合物。使用295個多核普酸探針的新穎組合,實現(xiàn)了一個或多個這樣的其它目的,這些探針代表254種與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因和基因片段。這些多核苷酸用于生產組合物、探針、基于探針的裝置,和測定與瘦動物相比在胖動物中差別表達的多核苷酸的狀態(tài)的方法,所述方法用于實現(xiàn)上述目的,例如,預測和診斷與動物脂肪組織有關的狀況,和篩選物質以確定它們是否可能用于調控動物脂肪組織的量。這樣的物質在鑒別出來以后,可以用于調控動物脂肪組織的量。本發(fā)明也提供了包含探針組合、使用探針的裝置、以及物質的不同試劑盒。本發(fā)明的另一個目的是,提供使用"分類預測物(classpredictor)"基因語來區(qū)分胖和瘦動物的方法。分類預測物技術可以用于促進動物體型的臨床診斷,例如,分類預測可以用于基于血液的測試中,以作出關于動物是胖還是瘦或具有變胖或變瘦的傾向的陽性測定。使用本文鑒定的65個多核苷酸探針的新穎組合,可以實現(xiàn)本文公開的這個和其它目的,使用從胖和瘦動物采取的血樣,這些探針可以作為胖和瘦動物的分類預測物。這些分類預測物基因可以用于例如開發(fā)基于血液的測試試劑盒,以預測動物是否胖或具有變胖的傾向,或它們可以用于預測瘦動物是否可以維持它的痩度。分類預測物也可以用于定義動物的身體狀況評分,這樣可以在獸醫(yī)臨床中具有多種有用用途。本發(fā)明的另一個目的是,提供使用分類預測物基因譜來精確鑒別胖動物、并在生化水平跟隨它們的進展、并指示它們的基因表達譜是否與胖瘦一致的方法。本發(fā)明的另一個目的是,提供通過施用一種或多種活性成分來體內調12控動物中脂肪組織的量的方法,所述活性成分體外證實會調控參與脂肪代謝的基因的表達。本發(fā)明的其它目的包括,本文公開的多核苷酸、探針、活性成分和分類預測物數(shù)據(jù)在生產本文所述的組合物、裝置和試劑盒中的應用,所述組合物、裝置和試劑盒例如用于調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達,或用于調控動物脂肪組織的量,用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達,和用于預測或診斷動物的身體狀況評分,包括將瘦動物與胖動物區(qū)分開,和在用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達的方法中,用于調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達,用于測量測試物質對與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達譜的影響,用于篩選測試物質以確定它是否可能用于調控動物脂肪組織的量,用于預測動物可能變胖或診斷動物為肥胖,或用于調控動物脂肪組織的量。本領域技術人員可以容易地明白本發(fā)明的其它和進一步的目的、特征和優(yōu)點。發(fā)明詳述定義術語"動物"是指具有脂肪組織的人或其它動物,包括禽、牛、犬、馬、貓、hicrine、鼠、羊和豬。當該術語用于比4支胖和瘦動物的上下文中時,比較的動物是相同物種的動物,且可能屬于相同的種族或品種。在優(yōu)選的實施方案中,動物是犬或貓,最優(yōu)選犬。術語"抗體"是指結合特定抗原的任意免疫球蛋白,包括IgG,IgM,IgA,IgD,和IgE抗體。該術語包括多克隆的、單克隆的、單價的、人源化的、異綴合物,具有多表位特異性的抗體組合物,嵌合的、雙特異性的抗體,雙抗體(diabodies),單鏈抗體,和抗體片段例如Fab、Fab,、F(ab,)2和Fv,其它抗原-結合片段。術語"陣列"是指基質上至少兩個探針的有序排列。至少一個探針是對照或標準品,且至少一個探針是診斷探針?;|上約2至約40,000個探針的排列確保探針和樣品多核苷酸或多肽之間形成的每個標記的復合物的大小和信號強度各自是可區(qū)分的。術語"身體狀況評分,,(BCS)是指基于動物的身體大小和形狀進行身體組成分析的方法。幾種方法是技術人員已知的,例如,在美國專利號6,691,639和標題為"小動物臨床營養(yǎng)(SmallAnimalClinicalNutrition)"的參考文獻第4版第13章(ISBN0-945837-05-4)中公開的方法。術語"體重指數(shù)"(BMI)是指動物的體重(按kg計算)除以它的身高(按米計算)的平方。本文使用的術語"分類預測物"是指使用監(jiān)督的(supervised)學習方法建立的基因組、蛋白組(proteomic)或代謝組(metabolomeic)-潘,所述監(jiān)督的學習方法采用下述算法,例如,4旦不限于,來自一組預定樣品("訓練集合,,)的WeightedVoting、ClassNeighbors、K-NearestNeighbors和SupportVectorMachines,以建立然后可以用于分類新樣品("測試集合"的預測規(guī)則。術語"DEXA"是指身體組成分析雙能量X射線吸收光度法。術語"差別表達,,或"差別表達的,,是指增加的或增量調節(jié)的基因表達,或指減少的或減量調節(jié)的基因表達,如通過樣品中轉錄的信使RNA或翻譯的蛋白的量的缺乏、存在或至少2倍變化所測得的。應用于動物的術語"胖"是指使用保健提供者和其它技術人員已知的技術和方法測得具有多余量的身體脂肪組織的任意動物,或易于發(fā)展多余量的身體脂肪組織的動物。如果與普通群體中的平均動物相比,動物具有發(fā)展多余的脂肪組織的傾向或更高的可能性,則該動物易于變胖。一般而言,不限制該定義,在下述情況下認為動物肥胖(l)動物具有25或更高(認為在一些表征動物狀況的方法中包括"超重,,和"過度月巴胖,,的數(shù)字)的BMI,(2)動物的重量比保健專業(yè)人員或相關技術人員定義的它的"理想"體重高15%或更多,(3)通過DEXA測得動物的身體脂肪百分比是27o/。或更高,或(4)技術人員使用在"小動物臨床營養(yǎng),,第4版第13章(ISBN其它Bcs方法測得的它的等同:標。g、'、;"5'術語"胖相關基因"是指由SEQIDNO:l-295答別的(identified)所有基因或基因的子集,尤其在本文中鑒別為與瘦動物相比在胖動物中差別表達的254種基因。當用作差別基因表達的度量時,術語"倍"是指動物中的基因表達量,它與相比較的動物中的基因表達量相比,是基因表達的多倍或分數(shù),例如,胖動物與瘦動物相比較。例如,在動物中的表達量是在相比較的動物中的314倍的基因具有3倍差別基因表達,在動物中的表達量是在相比較的動物中的1/3的基因也具有3倍差別基因表達。術語"片段"是指(l)寡核苷酸或多核苷酸序列,它是完整序列的一部分,且對于特定用途具有與完整多核普酸序列相同或類似的活性,或(2)肽或多肽序列,它是完整序列的一部分,且對于特定用途具有與完整多肽序列相同或類似的活性。這樣的片段可以包含任意數(shù)量的認為適用于特定用途的核苷酸或氨基酸。一般而言,寡核普酸或多核苷酸片段含有至少約10、50、100或1000個來自完整序列的核香酸,多肽片段含有至少約4、10、20或50個來自完整序列的連續(xù)氨基酸。該術語包括片段的多核普酸和多肽變體。術語"基因"是指參與產生多肽的DNA的完整或部分片段,包括在編碼區(qū)之前和之后的區(qū)域(先導物和尾)和在各個編碼片段(外顯子)之間的插入序列(內含子)。該術語包括可與基因編碼序列的互補序列雜交的任意DNA序列。術語"在胖動物中差別表達的基因"是指,與瘦動物相比,該基因在胖動物的組織中表達的mRNA的量或從mRNA翻譯的基因產物的量或多或少地可才全測到不同。術語"同源物"是指(l)多核苷酸,包括來自相同或不同動物物種的多核苷酸,其與SEQIDNO:1-295鑒別的多核苷酸具有大于30%、50%、70%、或90%序列相似性,且具有相同或基本上相同的性質,其執(zhí)行與完整多核苷酸相同或基本上相同的功能,或具有在嚴格條件下與SEQIDN〇:l-295鑒別的多核苷酸特異性雜交的能力,或(2)多肽,包括來自相同或不同動物物種的多肽,其與通過SEQIDNO:l-295鑒別的多核普酸的表達鑒別的多肽具有大于30%、50%、70%、或90%序列相似性,且具有相同或基本上相同的性質,其執(zhí)行與完整多肽相同或基本上相同的功能,或具有特異性地結合通過SEQIDNO:l-295筌別的多核苷酸的表達鑒別的多肽的能力。使用技術人員已知的方法,例如Karlin和Altschul的算法(Proc.Natl.Acad.Sci.USA87:2264-2268(1990)),可以測定兩個多肽序列或兩個多核苷酸序列的序列相似性。這樣的算法整合在Altschul等人的NBLAST和XBLAST程序中(J.Mol.Biol.215:403-410(1990》。為了得到用于比較目的的有空位的比對,可以如Altschul等人(Nucl.AcidsRes.25:3389-3402(1997))所述使用GappedBlast。當使用BLAST和GappedBLAST程序時,使用各個程序(例如,XBLAST和NBLAST)的缺省參數(shù)。參見http:〃麗.ncbi.nlm.nih.gov。術語"雜交復合物"是指,當一個多核苷酸的噤呤與互補多核苷酸的嘧啶進行氫鍵鍵合,例如,5'-A-G-T-C-3,堿基與3'-T-C-A-G-5,配對時,在樣品多核苷酸之間形成的復合物。互補程度和核香酸類似物的使用,會影響雜交反應的效率和嚴才各性。術語"與......相結合"是指,在下述情況下將藥物、食品或其它物質施用給動物(l)在組合物、尤其食品組合物中一起,或(2)在大致相同的時間或周期地,使用相同或不同的施用途徑,以相同或不同的頻率,分開地。"周期地"是指,以對于特定物質可接受的劑量日程施用該物質。"大致相同的時間"通常是指在相同的時間或在彼此約72小時內施用該物質(食品或藥物)。"與......相結合"特別包括這樣的施用方案,其中施用藥物等物質規(guī)定的期間,并不確定地施用本發(fā)明的組合物。應用于動物的術語"瘦"是指使用保健提供者和其它技術人員已知的技術和方法測得不胖的任意動物。一般而言,不限制該定義,在下述情況下認為動物是痩的(l)動物具有小于25的BMI,或(2)動物的重量比保健專業(yè)人員或相關技術人員定義的它的"理想"體重小15%或更多,(3)通過DEXA測得動物的身體脂肪百分比小于27%,或(4)技術人員使用在"Sma11AnimalClinicalNutrition"第4版第13章(ISBN0-945837-05-4)中公開的方法測得動物具有3或更低的身體狀況評分,或使用其它BCS方法測得的它的等同指標。術語"調控動物脂肪組織的量"是指,造成動物丟失脂肪組織,造成動物增加脂肪組織,或如果動物易于增加或丟失脂肪組織,造成動物維持動物脂肪組織的量。因而,調控動物脂肪組織的量包括,預防瘦動物變胖,和治療胖動物以減少動物脂肪組織的量,以及在適當情況下治療瘦動物以增加脂肪組織,例如,當治療技術人員測得體重過輕需要增加脂肪組織的痩動物時??梢允褂贸R?guī)方法來評判動物脂肪組織的量,以及測定動物的瘦肌肉質量和/或骨礦物質含量,在這樣的評判中可能關心的信息。術語"多核苷酸"或"寡核苷酸"是指核苷酸的聚合物。該術語包括DNA和RNA(包括cDNA和mRNA)分子,無論是單鏈的還是雙鏈的,如果是單鏈的,包括它的線性或環(huán)狀形式的互補序列。在適用于序列時,該術語也包括片段、變體、同源物和等位基因,它們具有與原始序列相同或基本上相同的性質,并執(zhí)行相同或基本上相同的功能。當比對時序列可以是完全互補的(沒有錯配),或可以具有最高達約30%的序列錯配。優(yōu)選地,對于多核苷酸,鏈含有約50至10,000個核苷酸、更優(yōu)選約150至3,500個核苷酸。優(yōu)選地,對于寡核香酸,鏈含有約2至100個核苷酸、更優(yōu)選約6至30個核苷酸。多核苦酸或寡核苦酸的精確大小依賴于多種因素和多核苷酸或寡核苷酸的特定用途和用法。該術語包括合成的、從天然來源分離和純化的核苷酸聚合物。術語"多核苦酸"包括"寡核普酸"。術語"多肽"、"肽,,或"蛋白"是指氨基酸的聚合物。該術語包括天然存在的和非天然存在的(合成的)聚合物,和其中將一個或多個M酸置換為人工化學才莫仿物的聚合物。該術語也包括片段、變體和同源物,它們具有與原始序列相同或基本上相同的性質,并執(zhí)行相同或基本上相同的功能。該術語包括任意長度的聚合物,優(yōu)選含有約2至1000個氨基酸的聚合物、更優(yōu)選約5至500個氨基酸。該術語包括合成的、從天然來源分離和純化的氨基酸聚合物。術語"探針"是指(l)寡核普酸或多核苷酸,無論是RNA還是DNA,在純化的限制酶消化物中天然存在或合成地生成,其能用具有與探針互補的序列的多核苷酸退火或特異性雜交,或(2)肽或多肽,其能特異性結合特定蛋白或蛋白片段,基本上排除其它蛋白或蛋白片段。寡核苷酸或多核苷酸探針可以是單鏈或雙鏈的。探針的精確長度依賴于許多因素,包括溫度、來源和用途。例如,對于診斷用途,依賴于耙序列的復雜性,寡核苷酸探針通常含有約10-100、15-50或15-25個核苷酸。在某些診斷用途中,多核苷酸探針含有約100-1000、300-600個核苷酸,優(yōu)選約300個核苷酸。選擇的本文的探針與特定靶序列的不同鏈"基本上"互補。這意味著探針必須因此,探針序列不需要反映耙物的精確互補序列。例如,非互補的核普酸片段可以結合在探針的5,或3,末端,探針序列的剩余部分與靶序列互補?;蛘?,非互補的堿基或更長的序列可以散布在探針中,條件是,探針序列與耙多核香酸的序列具有足夠的互補性,以與靶多核苷酸特異性地退火。肽或多肽探針可以是蛋白或肽特異性結合的任意分子,包括DNA(對于DNA結合蛋白)、抗體、細胞膜受體、肽、輔因子、凝集素、糖、多糖、細胞、細胞膜、細胞器和細胞器膜。術語"樣品"是指含有例如多核苷酸、多肽、抗體、代謝物等的任意動物組織或流體,包括含有DNA和RNA的細胞和其它組織。實例包括脂17肪、血液、軟骨、結締組織、上皮、淋巴、肌肉、神經(jīng)、唾液等。樣品可以是固體或液體,可以是DNA、RNA、cDNA、體液例如血液或尿、細胞、細胞制品或可溶級分或其介質等分試樣、染色體、細胞器等。術語"單個包裝"是指,試劑盒的組分物理地伴有一個或多個容器,且視作生產、分配、銷售或使用的單位。容器包括、但不限于,袋、盒子、瓶子、收縮罩包裝、釘上的(stapled)或以其他方式添附(affixed)的組分,或它們的組合。單個包裝可以是物理伴隨的單個食品組合物的容器,使得它們被視作生產、分配、銷售或使用的單位。術語"有用的變化,,是指(l)對于多核苷酸,該多核苷酸的互補序列;該多核苷酸和它的互補序列的同源物;該多核苷酸的變體,它的互補序列,和它的同源物;和該多核苷酸的片l殳,它的互補序列,它的同源物,和它的變體,和(2)對于多肽,該多肽的同源物;該多肽和它的同源物的變體;和該多肽的片段,它的同源物,和它的變體。術語"虛擬包裝"是指,試劑盒的組分伴有一種或多種物理或虛擬試劑盒組分的說明,它指導使用者如何得到其它組分,例如,在含有一種組分的袋子中,和指導使用者訪問網(wǎng)站、交流記錄的信息、觀察可視信息或聯(lián)系保健提供者或教員以得到如何使用試劑盒的說明的指南。術語"標準品"是指(l)在測試胖動物時含有來自瘦動物的組織的對照樣品,或在測試瘦動物時含有來自胖動物的組織的對照樣品,或(2)含有來自瘦或胖實驗動物的組織的對照樣品,所述實驗動物尚未暴露于在對應的瘦或胖動物中檢測的測試物質,以測定測試物質是否會造成差別基因表達,在它應用的上下文中適用時。術語"嚴格條件,,是指(l)在42。C,在含有0.1%牛血清白蛋白、0.1%Ficoll、0.1%聚乙烯吡咯烷酮、50mM磷酸鈉緩沖液pH6.5(含有750mMNaCl,75mM檸檬酸鈉)的50%(體積/體積)甲酰胺中雜交,(2)在42。C,在50%曱酰胺、5xSSC(0.75MNaCl,0.075M檸檬酸鈉)、50mM磷酸鈉(pH6.8)、0.1%焦磷酸鈉、5x登哈特溶液、聲處理的鮭精DNA(50lug/ml)、0.1%SDS和10%硫酸葡聚糖中雜交;在42°C在0.2xSSC和0.1%SDS中洗滌,或在50。C用0.015MNaCl、0.0015M檸檬酸鈉、0.1%Na2SO4洗滌,或采用類似的低離子強度和高溫洗滌劑和類似的變性劑的類似方法。術語"物質,,是指潛在地可用于診斷、預測或調控動物脂肪組織的量的元素、化合物、分子或其混合物或任意其它物質,包括任意藥物、化學18實體或生物學實體。術語"siRNA"是指,當siRNA與基因在相同細胞中表達時,可以形成減少或抑制該基因的表達的雙鏈RNA的多核苷酸。該術語包括由互補鏈形成的雙鏈RNA。雜交形成雙鏈分子的siRNA互補部分通常具有實質的或完全的一致性。通常,siRNA含有至少約15-50個核苷酸,雙鏈siRNA含有約15-50個》咸基對,優(yōu)選約20-30個核苷酸和^咸基對。術語"特異性結合"是指兩個分子之間特殊的且精確的相互作用,這依賴于它們的結構、尤其它們的分子側基。例如,調節(jié)蛋白向DNA分子的大溝中的嵌入,兩個單鏈核酸之間沿著主鏈的氫鍵結合,或蛋白表位和激動劑、拮抗劑或抗體之間的結合。術語"特異性雜交"是指充分互補序列(有時稱作"基本上互補的")的兩個單鏈多核苦酸之間的結合,以在本領域通常使用的預定條件下允許這樣的雜交。例如,該術語可以指多核苷酸探針與在根據(jù)本發(fā)明的一個方除多核苷酸探針^與非互補序列的單鏈;核苷酸的雜交。'i術語"變體"是指(l)多核苷酸序列,其含有來自(或針對)多核苷酸序列的一個或多個核苷酸的任意置換、變化、修飾、替換、缺失或添加,且具有與原始序列相同或基本上相同的性質,并執(zhí)行相同或基本上相同的功能,和(2)多肽序列,其含有來自(或向)多肽序列的一個或多個氨基酸的任意置換、變化、修飾、替換、缺失或添加,且具有與原始序列相同或基本上相同的性質,并執(zhí)行相同或基本上相同的功能。該術語因此包括單核苷酸多態(tài)性(SNPs)和等位基因變體,并包括多肽中的保守和非保守的氨基酸置換。該術語也包括多核苷酸或多肽的化學衍生作用,和在適當時用非天然存在的核香酸或氨基酸置換核苷酸或氨基酸。本發(fā)明不限于本文所述的特定方法、方案和試劑,因為它們可以變化。此外,本文使用的術語僅用于描述特定實施方案的目的,無意限制本發(fā)明的范圍。如在本文和所附權利要求書中所使用的,單數(shù)形式"一個(a,an)"、"一種,,和"該,,包括復數(shù)形式,除非上下文另有清楚說明,例如,"一個變體"包括多個變體。此外,定義的術語包括在適當?shù)恼Z法上下文中使用的術語的變化,例如,術語"特異性地結合"包括"特異性結合"和該術語的其它形式。類似地,詞語"包含,,、"包括"應當包括性地而不是排除性地解釋。除非另有定義,本文使用的所有技術和科學術語和任意縮寫字具有與本發(fā)明領域的普通技術人員的通常理解相同的含義。盡管與本文所述類似或等同的任意組合物、方法、產品或其它工具或材料可以用于實現(xiàn)本發(fā)明,在本文中描述了優(yōu)選的組合物、方法、產品或其它工具或材料。在本文中引用或提及的所有專利、專利申請、出版物和其它參考文獻以法律允許的程度通過參考引用并入本文。這些參考文獻的討論僅意在總結其中作出的斷言。沒有承認任何這樣的專利、專利申請、出版物或參考文獻或其任意部分與本發(fā)明的現(xiàn)有技術相關,特別地保留置疑這樣的專利、專利申請、出版物和其它參考文獻的準確度和適當性的權利。在一個方面,本發(fā)明提供了與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因或基因片段(本文中定義的"基因")。本發(fā)明是基于295個多核苦酸的發(fā)現(xiàn),它們代表254個與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因。通過使用AffymetrixGeneChip⑧技術比較來自診斷為胖的動物的脂肪組織中基因的表達和來自診斷為瘦的動物的脂肪組織中基因的表達,鑒別出了所述基因。多核苷酸顯示在序列表中,且在表1中描述為SEQIDNO:l-295。表1也在第2列顯示了Affymetrix探針標識號(本文中"APIN"),在第3列顯示了表達倍數(shù)(胖/瘦),在第4列顯示了最高BLAST命中的登錄號,在第5列顯示了人序列的最高BLAST命中的登錄號(列描述也適用于表2和3)。使用技術人員已知的方法,可以從BLAST數(shù)據(jù)庫得到推定的或實際的基因功能的描述。一般而言,通過下述方式測定推定的或實際的基因功能(l)鑒別與瘦動物相比在胖動物中具有2倍或更大的基因表達的每個基因的APIN,(2)通過將APIN輸入可公開得到的Affymetrix數(shù)據(jù)庫(它將AIPN號與序列相關聯(lián)),測定每個這樣的基因的核苷酸序列,和(3)將核苷酸序列輸入國立衛(wèi)生研究院提供的BLAST數(shù)據(jù)庫,并從得到的與數(shù)據(jù)庫中的同源序列的序列匹配,確定推定的或實際的基因功能。表4顯示了為對應的SEQIDNO的最高BLAST命中登錄號得到的基因描述,表5顯示了對應的SEQIDNO的人序列登錄號的最高BLAST命中的基因描述。基于幾個標準,將多核苷酸分組。首先,基于表達分析將多核苷酸分成3組,所述表達分析測定胖和瘦動物之間的差別基因表達量或倍數(shù)差別基因表達。組1對應由SEQIDNO:l-295鑒別的多核苷酸。這些多核苷酸與瘦動物相比在胖動物中差別表達了至少2倍。組2對應由SEQIDNO:1-70鑒別的多核苷酸。這些多核苷酸與瘦動物相比在胖動物中差別表達了至少202.5倍。組3對應由SEQIDNO:l-25鑒別的多核普酸。這些多核苦酸與瘦動物相比在胖動物中差別表達了至少3倍。其次,基于它們的功能將多核苷酸分組。組4對應在表2中鑒別的多核苷酸。這些多核苷酸與動物中的脂類和葡萄糖代謝途徑有關。第三,基于它們的關聯(lián)性將多核苷酸分組。組5對應在表3中鑒別的多核苷酸。與瘦動物相比,這些多核苷酸被鑒別為與胖動物特別相關,因為當進行差別表達分析時,通過超過一個探針鑒別出它們。通過測量鑒別為胖的犬的脂肪組織中基因表達與鑒別為瘦的犬的脂肪組織中基因表達的差異,鑒別多核苷酸和基因?;虮磉_的變化可以通過技術人員已知的任意方法來測定。一般而言,通過測量轉錄(測定基因生成的mRNA的量)或測量翻譯(測定基因生成的蛋白的量),測定基因表達的變化。為了定量多核苷酸和蛋白,可以使用技術人員已知的任意方法,測定由基因生成的RNA或蛋白的量。一般而言,使用聚合酶鏈式反應(PCR)(包括、但不限于,反轉錄-PCR(RT-PCR)和定量實時PCR(qPCR))、RNA酶保護術、RNA印跡法和其它雜交方法,測定RNA表達。測量的RNA通常是mRNA或反轉錄的mRNA形式。使用各種比色和光譜測定和諸如lowry測定、雙縮脲測定、熒光測定、比濁方法、雙金雞寧酸(bicinchoninic)測定、蛋白芯片技術、紅外吸收、水合茚三酮、bradford測定、和紫外吸收等方法,測定蛋白或多肽表達。在一個優(yōu)選的方法中,使用可從Affymetrix公司購買的Affymetrix犬-1和犬-2基因芯片和關于使用這樣的芯片測定基因表達的說明書,測定基因表達的變化。一般而言,通過測量至少一個基因的表達,測定與瘦動物相比胖動物中的差別基因表達。優(yōu)選地,測量兩個或多個差別表達的基因的表達,以提供基因表達模式或基因表達圖譜。更優(yōu)選地,測量許多差別表達的基因的表達,以提供關于更重要的基因表達^t式或圖譜的額外信息。多核苷酸、基因、由多核苷酸和基因編碼的蛋白和基于所述序列的互補序列、同源物、變體或片段可用于與動物脂肪組織的量有關的許多預測和-珍斷測定中,并可用于篩選測試物質以測定該物質是否可用于調控動物脂肪組織的量。從本文包含的發(fā)明描述可以明白其它用途。在另一個方面,本發(fā)明提供了一種組合,其包含與瘦動物相比在胖動物中差別表達的兩種或多種多核苷酸、或通過與瘦動物相比在胖動物中差別表達的兩種或多種多核苷酸的表達而生成的兩種或多種蛋白。在一個實施方案中,該組合包含兩種或多種多核苷酸或從選自SEQIDNO:l-295的多核苷酸表達的蛋白。在另一個實施方案中,該組合包含兩種或多種多核苦酸或從選自SEQIDNO:1-70的多核苷酸表達的蛋白。在另一個實施方案中,該組合包含兩種或多種多核苷酸或/人選自SEQIDNO:l-25的多核苷酸表達的蛋白。在另一個實施方案中,該組合包含兩種或多種多核苷酸或從選自在表2中鑒別的SEQIDNO的多核苷酸表達的蛋白。在另一個實施方案中,該組合包含兩種或多種多核苷酸或從選自在表3中鑒別的SEQIDNO的多核苷酸表達的蛋白。在另一個實施方案中,該組合包含這樣的多核普酸的有用的變化。優(yōu)選地,該組合包含多種多核苷酸或從多核苷酸表達的蛋白,在適用于特定組和用途時,通常約10、20、50、100、200或更多種多核苷酸或蛋白。當該組合包含一種或多種片段時,片段可以是保留原始多核苷酸或蛋白的性質和功能的任意大小,優(yōu)選原始多核苷酸或蛋白的約30%、60%、或90%。多核普酸和蛋白可以來自任意動物,優(yōu)選犬和貓,最優(yōu)選犬。在另一個方面,本發(fā)明提供了一種組合物,其包含兩種或多種適用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達的寡核苷酸或多核苷酸探針。在一個實施方案中,所述探針包含選自SEQIDNO:l-295的多核苷酸。在另一個實施方案中,所述探針包含選自SEQIDNO:1-70的多核苷酸。在另一個實施方案中,所述揮:4十包含選自SEQIDNO:l-25的多核苷酸。在另一個實施方案中,所述探針包含選自在表2中鑒別的SEQIDNO的多核苷酸。在另一個實施方案中,所述探針包含選自在表3中鑒別的SEQIDNO的多核苷酸。在另一個實施方案中,所述探針包含這樣的多核苷酸的有用的變化。所述探針含有足夠數(shù)量的核苷酸,以基本上排它地特異性地與適當?shù)幕パa多核苷酸雜交。優(yōu)選地,所述探針包含至少約10、15、20、25或30個核苷酸。在有些實施方案中,所述探針含有多個核苷酸,且包含至少約30、50、70、90或100個核苦酸,或更多。探針可以包含本發(fā)明的全長功能基因。優(yōu)選地,該組合物包含適用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的多個多核苷酸探針,通常約10、50、200、500、IOOO或2000,或更多個探針。多核普酸探針使用技術人員已知的方法制備或得到,例如,從核苷酸體外合成,從天然來源分離和純化,或本發(fā)明基因的酶切割。在另一個方面,本發(fā)明提供了一種裝置,其適用于檢測與瘦動物相比22在胖動物中差別表達的多種基因的表達。該裝置包含基質,所述基質具有多個在已知位置添附(affixed)到基質上的本發(fā)明的寡核苷酸或多核苷酸探針。該裝置基本上是本文所述寡核苷酸或多核苷酸探針的固定化形式。該裝置可用于基因和多核苷酸和它們的表達模式和圖譜的快速且特異性的檢測。通常,這樣的探針連接在基質或類似的固體支持物上,將含有一種或多種多核苷酸(例如,基因、PCR產物、連接酶鏈反應(LCR)產物、使用擴增技術已經(jīng)合成的DNA序列,或其混合物)的樣品暴露于探針,使得樣品多核苦酸可以與探針雜交??梢詷擞浱结槨悠范嗪塑账?、或二者,通常使用熒光團或其它標記例如抗生蛋白鏈菌素,并使用技術人員已知的方法;險測。如果標記樣品多核苷酸,通過4企測結合的焚光,可以;險測雜交。如果標記一果針,雜交通常通過標記淬滅來4企測。如果標記纟笨針和樣品多核普酸二者,雜交通常通過監(jiān)視由兩個結合的標記的接近產生的顏色轉移來檢測。許多種標記策略和標記是技術人員已知的,尤其對于萸光標記。優(yōu)選地,將探針固定化在基質上,所述基質適用于形成與本領域已知的那些相當?shù)年嚵?已知幾種名稱,包括DNA微陣列、基因芯片、生物芯片、DNA芯片和基因陣列)。在另一個方面,本發(fā)明提供了一種組合物,其包含兩種或多種適用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達的肽或多肽探針。在一個實施方案中,所述探針包含肽或多肽,其特異性結合由一種或多種多核苷酸的表達而生成的蛋白,所述多核苷酸包含選自SEQIDNO:l-295的序列。在另一個實施方案中,所述探針包含肽或多肽,其特異性結合由一種或多種多核苷酸的表達而生成的蛋白,所述多核苷酸包含選自SEQIDNO:1-70的序列。在另一個實施方案中,所述探針包含肽或多肽,其特異性結合由一種或多種多核苷酸的表達而生成的蛋白,所述多核苷酸包含選自SEQIDNO:l-25的序列。在另一個實施方案中,所述探針包含肽或多肽,其特異性結合由一種或多種多核苷酸的表達而生成的蛋白,所述多核苷酸選自在表2中鑒別的SEQIDNO。在另一個實施方案中,所述探針包含肽或多肽,其特異性結合由一種或多種多核苷酸的表達而生成的蛋白,所述多核苷酸選自在表3中鑒別的SEQIDNO。在另一個實施方案中,所述探針包含肽或多肽,其特異性結合由這樣的多肽的一種或多種有用的變化的表達而生成的蛋白。所述探針含有足夠數(shù)量的氨基酸,以特異性地結合適當多肽。優(yōu)選地,所述撰:針包含至少約4、10、20、40或80個氨基酸。在有些實施方案中,所述探針含有多個氨基酸,且包含至少約100個或更多個氨基酸。探針可以包含從本發(fā)明鑒別的全長功能基因的表達衍生的全長功能蛋白。優(yōu)選地,本發(fā)明提供了適用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的多個多肽探針,更優(yōu)選約10、50、100、500或1000或更多個這樣的探針的集合。在一個實施方案中,所述探針是抗體,優(yōu)選單克隆抗體。多肽探針可以根據(jù)常規(guī)方法制備,例如,使用為本發(fā)明的多核苷酸提供的核苷酸序列數(shù)據(jù)和本領域已知的方法。這樣的方法包括、但不限于,從細胞直接分離多肽,分離或合成編碼多肽的DNA或RNA并使用DNA或RNA生產重組產物,從單個氨基酸化學合成多肽,和通過化學切割已有的多肽來生產多肽片段。在另一個方面,本發(fā)明提供了一種裝置,其適用于檢測與痩動物相比在胖動物中差別表達的多個基因的表達。該裝置包含基質,所述基質具有多個在已知位置固定到基質上的本發(fā)明的肽或多肽探針。該裝置基本上是本文所述肽或多肽探針的固定化形式。該裝置可用于蛋白和它們的表達才莫式的快速且特異性的檢測。通常,這樣的探針連接在基質上,將含有一種或多種蛋白的樣品暴露于探針,使得樣品蛋白可以與探針雜交??梢詷擞浐蜋z測探針、樣品蛋白、或二者,通常使用技術人員已知的熒光團或其它試劑。一般而言,用于閱讀多核苷酸微陣列的相同方法和儀器使用可用于蛋白陣列。優(yōu)選地,將探針固定化在適用于形成陣列的基質上。測定樣品中蛋白的量或濃度的方法是技術人員已知的。這樣的方法包括放射免疫測定、竟爭-結合測定、蛋白印跡分析和ELISA測定。就使用抗體的方法而言,多克隆和單克隆抗體是合適的。這樣的抗體可以是對蛋白、蛋白表位或蛋白片段免疫特異性的。本發(fā)明的有些實施方案使用抗體來檢測和定量由本發(fā)明的多核苷酸的表達生產的蛋白。盡管蛋白可以通過免疫沉淀、親和分離、蛋白印跡分析、蛋白陣列等來檢測,優(yōu)選的方法使用ELISA技術,其中將抗體固定化在固體支持物上,并將靶蛋白或肽暴露于固定化的抗體。可以使用已知的方法來標i己纟采4十或l&物或二者。在有些實施方案中,使用用于檢測多核苷酸或多肽的探針陣列,觀察與痩動物相比在胖動物中差別表達的多個基因的表達^t式或圖譜。在一個實施方案中,可以使用寡核苷酸或多核苷酸探針的陣列,然而另一個實施24方案可以使用特異性結合本發(fā)明的差別表達的基因產物的抗體或其它蛋白的陣列。這樣的陣列可以商業(yè)上得到,或它們可以使用技術人員已知的方法定制,例如,在固體支持物上原位合成,或通過微印刷技術將預先合成的探針結合在固體支持物上。在不同的實施方案中,定制多核苷酸或多肽探針陣列,以特異性地檢測由本發(fā)明的差別表達的基因生成的轉錄物或蛋白。在一個實施方案中,定制多核苷酸或多肽探針陣列,以特異性地檢測由在表2中鑒別的兩種或多種多核苷酸或基因生成的轉錄物或蛋白。這些探針用于檢測動物中與脂類和葡萄糖代謝途徑有關的基因。在另一個實施方案中,定制多核苷酸或多肽探針陣列,以特異性地^r測由在表3中鑒別的兩種或多種多核苦酸或基因生成的轉錄物或蛋白。這些探針用于檢測與瘦動物相比與胖動物特別有關的基因。在另一個方面,本發(fā)明提供了檢測樣品中與痩動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的差別表達的方法。該方法包t:(a)使包含多個與瘦動物相比在胖動物中差別表達的多核苷酸探針的組合與樣品中的多核苷酸雜交,以形成一種或多種雜交復合物;(b)任選地,使包含多個與痩動物相比在胖動物中差別表達的多核苷酸探針的組合與標準品中的多核苷酸雜交,以形成一種或多種雜交復合物;(c)檢測來自樣品和任選的來自步驟(b)的標準品的雜交復合物;和(d)比較來自樣品的雜交復合物和來自標準品的雜交復合物,其中標準品和樣品之間雜交復合物的量的差異指示著樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的差別表達。在不同的實施方案中,多個多核苷酸採:針選自SEQIDNO:l-295(具有2倍或更多的差異),SEQIDN〇:l-70(具有2.5倍或更多的差異),SEQIDNO:l-25(具有3倍或更多的差異),在表2中鑒別的多核苷酸(具有2倍或更多的差異),在表3中鑒別的多核苷酸(具有2倍或更多的差異),和這樣的多核苷酸的有用的變化(組具有適當倍數(shù))。這些多核苷酸用于制備探針,所述探針與樣品多核苷酸雜交形成雜交復合物,檢測后者,并與標準品的雜交復合物相比較。在有些實施方案中,在雜交之前擴增樣品多核苷酸。在有些實施方案中,探針與基質結合,優(yōu)選在陣列中。步驟(b)和步驟(c)的一部分是任選的,并在要進行兩個或多個測試系統(tǒng)的相對同時比較時使用。但是,在一個優(yōu)選的實施方案中,用于比較的標準品是基于以前使用該方法得到的數(shù)據(jù)。將這些探針暴露于樣品,以形成雜交復合物,檢測后者,并與標準品的雜交復合物相比較。來自樣品和標準品的雜交復合物的之間的差異指示著樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的多核苷酸和基因的差別表達。在一個優(yōu)選的實施方案中,制備探針,以特異性地檢測由本發(fā)明鑒別的一種或多種基因或基因片段生成的多核苷酸或其片段。檢測雜交復合物的方法是技術人員已知的。在一個實施方案中,所述方法另外包含,在雜交之前將動物或樣品暴露于測試物質。然后,比較指示著測試物質是否改變了樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因、尤其胖相關基因的表達。在另一個方面,本發(fā)明提供了檢測樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的差別表達的方法。該方法包含(a)在允許探針和蛋白之間發(fā)生特異性結合的條件下,使包含多個多肽探針的組合與樣品中的蛋白反應,其中探針結合的蛋白與瘦動物相比在胖動物中差別表達;(b)任選地,在允許探針和蛋白之間發(fā)生特異性結合的條件下,使包含多個多肽探針的組合與標準品中的蛋白反應,其中探針結合的蛋白與瘦動物相比在胖動物中差別表達;(c)檢測樣品和任選的來自步驟(b)的標準品中的特異性結合;和(d)比較樣品和標準品中的特異性結合,其中標準品和樣品中的特異性結合之間的差異指示著樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的差別表達。在不同的實施方案中,多個多肽探針是特異性地結合由選自下述SEQIDNO的一種或多種多核苷酸的表達而生成的蛋白的探針SEQIDNO:l-295(具有2倍或更多的差異),SEQIDNO:1-70(具有2.5倍或更多的差異),SEQIDNO:l-25(具有3倍或更多的差異),在表2中鑒別的多核苷酸(具有2倍或更多的差異),在表3中鑒別的多核苷酸(具有2倍或更多的差異),和這樣的多核苷酸的有用的變化(組具有適當倍數(shù))。這些多核苷酸用于制備探針,所述探針特異性地結合蛋白,檢測后者,并與標準品的蛋白相比較。在有些實施方案中,所述探針結合基質,優(yōu)選在陣列中。在一個實施方案中,所述探針是抗體。步驟(b)和步驟(c)的一部分是任選的,并在要進行兩個或多個測試系統(tǒng)的相對同時比較時使用。但是,在一個優(yōu)選的實施方案中,用于比較的標準品是基于以前使用該方法得到的數(shù)據(jù)。將這些探針暴露于樣品,以形成特異性結合,一企測后者,并與標準品的特異性結合相比較。來自樣品和標準品的特異性結合之間的差異指示著樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的蛋白和基因、尤其胖相關基因的差別表達。在一個優(yōu)選的實施方案中,制備探針,以特異性地檢測由本發(fā)明鑒別的一種或多種基因或基因片段生成的多核苷酸或其片段。在一個實施方案中,所述方法另外包含,在使多肽與蛋白反應之前,將動物或樣品暴露于測試物質。然后,比較指示著測試物質是否改變了樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因、尤其胖相關基因的表達。在另一個方面,當嘗試響應于脂肪組織調控方案來調控動物脂肪組織的量時,檢測樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達的方法用于監(jiān)視動物的進展。在調控方案期間,間隔地、優(yōu)選設置間隔(setinterval)地進行該方法,并通過比較在調控方案期間兩個或多個點時該方法的結果,監(jiān)視動物的進展。從比較得到的與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因、尤其胖相關基因的表達的變化,或基因表達^f莫式的變化,或任何變化的缺失,指示著調控方案的功效。例如,可以監(jiān)^L用于減少動物脂肪組織的量的脂肪組織調控方案,如果與痩動物相比在胖動物中差別表達的基因、尤其胖相關基因的基因表達量響應于方案中的刺激而隨時間下降,則證實是有效的。類似地,增加瘦或過瘦動物的脂肪組織的方案會增加這樣的基因的表達。調控方案可以是調控動物脂肪組織的量的任意計劃,例如飲食、鍛煉、藥物或其它類似的方案。在另一個方面,本發(fā)明提供了測量測試物質對與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的影響的方法,和篩選測試物質以確定它是否可能用于調控動物脂肪組織的量的方法。所述方法包含,(a)通過測量在沒有測試物質存在下測試系統(tǒng)中選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的兩種或多種多核苷酸的轉錄或翻譯產物,測定第一表達語;(b)通過測量在有測試物質存在下測試系統(tǒng)中選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的兩種或多種多核苷酸的轉錄或翻譯產物,測定第二表達譜;和(c)比較第一表達譜和第二表達譜。與第一表達譜相比第二表達譜變化了2倍或更多,指示著所述測試物質會影響與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達,且所述測試物質可能用于調控動物脂肪組織的量。在一個優(yōu)選的實施方案中,與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因是胖相關基因,所述變化是第一表達譜和第二表達譜之間至少兩個基因的表達變化了2倍或更多。本發(fā)明也提供了27使用該方法鑒別的物質。在一個實施方案中,所述多核普酸選自SEQIDNO:1-70或其有用變化,所述變化是2.5倍或更高。在另一個實施方案中,所述多核苷酸選自SEQIDNO:l-25或其有用變化,所述變化是3倍或更高。在另一個實施方案中,所述多核苷酸是在表2或表3中鑒別的那些或其有用變化,所述變化是2倍或更高。在一個實施方案中,測試系統(tǒng)是體外測試系統(tǒng)例如組織培養(yǎng)物、細胞提取物或細胞系。在另一個實施方案中,測試系統(tǒng)是體內測試系統(tǒng),即動物例如犬。在其它實施方案中,測試系統(tǒng)是間接體內(exvivo)組織系統(tǒng)或計算機(insilico)系統(tǒng)。測試物質可以是可能對與瘦動物相比在胖動物中差別表達的多核苦酸或基因、尤其胖相關基因具有影響的任意物質。測試物質包括、但不限于,氨基酸;蛋白,肽,多肽,核酸,寡核苷酸,多核苷酸,小分子,大分子,維生素,礦物質,單糖;復合糖;多糖;碳水化合物;中鏈甘油三酉旨(MCTs);三?;视王?TAGs);n-3(co-3)脂肪酸,包括DHA、EPA、ALA;n-6(co-6)脂肪酸,包括LA、Y-亞麻酸(GLA)和ARA;SA,綴合的亞油酸(CLA);膽堿來源例如卯磷脂;脂溶性維生素,包括維生素A和其前體例如類胡蘿卜素(例如P-胡蘿卜素),維生素D來源例如維生素D2(麥角鈣化醇)和維生素D3(膽釣化甾醇),維生素E來源例如生育酚(例如a-生育酚)和生育三烯酚類,和維生素K來源例如維生素&(葉綠醌)和維生素K2(曱萘醌);水溶性維生素包括B維生素例如核黃素,煙酸(包括煙酰胺和煙酸),維生素B6,泛酸,葉酸,生物素和維生素B12;和維生素C(抗壞血酸);抗氧化劑,包括有些在上面列出的維生素,尤其維生素E和C;以及生物類黃酮例如兒茶素,槲皮素和茶黃素;醌例如泛醌;類胡蘿卜素例如番茄紅素和番茄黃質;白藜蘆醇;和a-硫辛酸;L-肉毒堿;D-杼檬烯;葡糖胺;S-腺苷基蛋氨酸;和殼聚糖。在一個優(yōu)選的實施方案中,測試物質是可以加入食品中或作為添加劑消費的營養(yǎng)物。實例包括、但不限于,脂肪酸例如co-3脂肪酸(例如,DHA和EPA)和co-6脂肪酸(例如ARA)、肉毒堿、蛋氨酸、維生素C、維生素E和維生素D。在一個優(yōu)選的實施方案中,使用在2005年3月2日提交的共同未決的美國臨時專利申請?zhí)?0/657980和要求它的優(yōu)先權的任意后續(xù)美國或外國專利申請中公開的方法,可以鑒別出用于影響與瘦動物相比在胖動物中28差別表達的基因、尤其胖相關基因的表達的物質。在另一個方面,本發(fā)明提供了預測動物可能變胖或診斷動物為肥胖的方法。該方法包含,測定與一種或多種瘦動物相比在該動物中是否差別表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸、或一種或多種特異性結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸生產的蛋白的多肽。如果比較指示著與瘦動物相比多核苷酸在該動物中差別表達了2倍或多倍,則測定該動物可能變胖或測定為肥胖。在不同的實施方案中,預測或診斷是基于選自下述的多核苷酸SEQIDNO:1-70,SEQIDNO:l-25,在表2中鑒別的序列,在表3中筌別的序列,或這些多肽的有用變化。用于比較的瘦動物的表達譜可以從一種或多種瘦動物得到,其與來自瘦動物表達譜數(shù)據(jù)庫的待測動物的表達i普同時得到。優(yōu)選地,隨時間積累的瘦動物表達譜數(shù)據(jù)庫可用作參照。使用技術人員已知的方法(其中的一些在本文中描述),通過^^測多核苷酸或多肽,可以測定多核苷酸或多肽是否差別表達。在另一個方面,本發(fā)明提供了操作基因組或動物、尤其非人動物的基因組的表達的方法。該方法包含,破壞與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達,優(yōu)選使用用選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸構建的寡核普酸或多核苷酸。本領域技術人員已知操作基因組的方法。這樣的方法包括,轉基因的和敲除的動物的生產,和轉錄或翻譯的破壞。在一個實施方案中,一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸用于制備可用于破壞或"敲除,,動物中的對應的內源基因的構建體。該方法會生成具有該基因座的無效突變的動物。在其它實施方案中,所述動物表現(xiàn)出與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因、尤其胖相關基因的表達的減少或完全消除。本發(fā)明也提供了使用該方法生成的動物。在不同的實施方案中,使用一種或多種選自SEQIDNO:l-70、SEQIDNO:l-25、在表2中鑒別的序列、在表3中鑒別的序列、或這些序列的有用變化的多核苷酸,操作基因組。轉基因動物優(yōu)選地是哺乳動物,例如,嚙齒動物例如小鼠和大鼠,但是可以是其它哺乳動物例如貓和犬。本領域技術人員已知操作基因組的表達的方法。這樣的方法包括,使用反義或siRNA分子,和使用這樣的分子破壞基因組的翻譯或轉錄。在一個實施方案中,一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷可以用于在功能上破壞翻譯的短(小)干擾RNA(siRNA)。簡而言之,反義分子通過結合DNA和阻止轉錄,siRNA通過RNA干擾(RNAi)或轉錄后基因沉默(PTGS),可以抑制基因表達。siRNA分子靶向同源mRNA分子,通過切割siRNA分子所跨區(qū)域內的mRNA分子進行破壞。因此,能耙向和切割從胖相關基因轉錄的mRNA的siRNA可以用于降低或消除一個或多個這樣的基因的表達。在其它實施方案中,能結合DNA的反義分子和能靶向和切割從選自組2、組3、組4或組5多核苷酸或基因的一個或多個多核普酸或基因轉錄的mRNA的siRNA,可以用于降低或消除一個或多個這樣的基因的表達。在優(yōu)選的實施方案中,從選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸的轉錄物,構建siRNA。在另一個方面,本發(fā)明提供了適用于操作動物的基因組的組合物。該組合物包含一種或多種物質,后者干擾與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因、尤其胖相關基因的表達。優(yōu)選地,所述物質包含結合一種或多種基因或它們的轉錄產物、并干擾它們的復制、轉錄或翻譯的寡核苷酸或多核苷酸,最優(yōu)選使用選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸構建的寡核苷酸或多核香酸。在不同的實施方案中,所述物質包含反義分子或siRNA。在另一個方面,本發(fā)明提供了調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因、尤其胖相關基因的表達的方法,或調控動物脂肪組織的量的方法,其包含,給動物施用基因表達或組織調控量的組合物,其包含DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一種或多種。在優(yōu)選的實施方案中,所述組合物包含,按每千克體重每天的毫克(mg/kg/天)計算,DHA的量為約1至約30,優(yōu)選約3至約15;EPA的量為約1至約30,優(yōu)選約3至約15;EPA/DHACombo(1.5:1比例)的量為約4/2至約30/45,優(yōu)選約9/6至約18/12;ALA的量為約10至約100,優(yōu)選約30至約60;LA的量為約30至約600,優(yōu)選約60至約300;ARA的量為約5至約50,優(yōu)選約15至約30;SA的量為約3至約60,優(yōu)選約6至約30;和CLA(作為對照)的量為約6至約120,優(yōu)選約12至約60。組合物可以以該組合物適合的任意方式或形式施用給動物。優(yōu)選地,組合物以食物組合物或添加劑的形式經(jīng)口施用給動物。食物組合物可以是任意形式,例如,30本領域已知的營養(yǎng)平衡的食物組合物,例如動物的干食物、半濕食物和濕食物,所述動物尤其是伴侶動物例如貓和犬動物。添加劑包括諸如片劑、膠凝劑和類似形式的劑型。在另一個方面,組合物與一種或多種調控動物脂肪組織的量的藥物或其它物質聯(lián)合施用。所述藥物或物質包括、但不限于,抑制食欲、增加代謝或干擾特定營養(yǎng)物(尤其來自食物)的吸收的物質。實例包括、但不限于,奧利司他(阻斷脂肪分解和吸收),減食名臾劑例如疏酸右苯丙胺(抑制食欲),厭食劑例如芬氟拉明和苯丁胺、西布曲明和苯丙醇胺。在另一個方面,本發(fā)明提供了適用于調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因、尤其胖相關基因的表達、或調控動物脂肪組織的量的組合物。該組合物包含基因表達或組織調控量的DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一種或多種。在不同的實施方案中,所述組合物包含,按mg/kg/天計算,DHA的量足以施用給動物約1至約30;EPA的量足以施用給動物約1至約30;EPA/DHACombo(1.5:1比例)的量足以施用給動物約4/2至約30/45;ALA的量足以施用給動物約10至約100;LA的量足以施用給動物約30至約600;ARA的量足以施用給動物約5至約50;SA的量足以施用給動物約3至約60;和CLA(作為對照)的量足以施用給動物約6至約120。這樣的物質可以用于調控動物脂肪組織的量。優(yōu)選地,所述物質影響多個這樣的基因的表達。在一個實施方案中,所述組合物另外包含一種或多種調控動物脂肪組織的量的藥物或其它物質。在另一個方面,本發(fā)明提供了篩選用于包含在一個或多個組或小組中的動物的方法。該方法包含,測定動物的下述表達(a)選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸,或(b)多肽,其中的每一種多肽特異性地結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸生成的蛋白,和基于表達圖譜將動物分配到組中。所述組可以是任意有用的組,優(yōu)選在研究實驗、試驗、臨床試驗或其它類似范疇中涉及的那些組。例如,所述組可以是在需要一個或多個對照組和一個或多個治療組的研究實驗或臨床試-驗中涉及的組。在一個實施方案中,所述對照組包含瘦動物,所述治療組包含胖動物,或在另一個實施方案中反之??梢詼y定許多動物的表達圖譜,基于圖譜的結果將動物分配到對照組或治療組中,即,將與標準相比差別表達了2倍或更多的動物分配到胖組,將與標準相比差別表達了231倍或更少的動物分配到瘦組。當測試潛在的藥物或其它物質的減少動物脂肪組織的量的能力時,該方法特別適用于將動物分配到臨床試驗中。在另一個方面,本發(fā)明提供了計算機系統(tǒng),其適用于操作關于與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因、尤其胖相關基因的數(shù)據(jù)。該系統(tǒng)包含,含有信息的數(shù)據(jù)庫,所述信息可以鑒別瘦動物和/或胖動物中一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苦酸的表達水平、和/或特異性地結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸生成的蛋白的多肽的表達水平,和與數(shù)據(jù)庫交互作用的用戶界面,尤其用于輸入、操作和觀察不同動物或分類或動物(例如瘦或胖動物)的信息。在一個實施方案中,數(shù)據(jù)庫另外含有鑒別由一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸編碼的一種或多種多肽的活性水平的信息。在另一個實施方案中,所述數(shù)據(jù)庫另外包含一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸的序列信息。在其它實施方案中,所述數(shù)據(jù)庫含有描述一個或多個動物物種中的基因的推定描述的其它信息。該計算機系統(tǒng)是能含有和操作數(shù)據(jù)并與用戶交互作用的任意電子裝置,例如,典型的計算機或設計成便于使用本發(fā)明和輸出關于動物的狀態(tài)的結果的分析儀器。在另一個方面,本發(fā)明提供了使用計算機系統(tǒng)或本發(fā)明來呈現(xiàn)信息的方法,所述信息會鑒別與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因、尤其胖相關基因的表達。該方法包含,比較來自樣品的從選自SEQIDNO:l-295的多核普酸表達的兩種或多種多核苷酸或蛋白的表達水平與計算機系統(tǒng)中該多核苷酸或蛋白的表達。在另一個方面,本發(fā)明提供了試劑盒,其適用于測定測試系統(tǒng)中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因、尤其胖相關基因的差別表達。該試劑盒包含,在單個包裝中的分離的容器中或在一個虛擬包裝中的分離的容器中的、與用途和試劑盒組分相適宜的、兩個或多個適用于才企測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達的探針,所述探針包含(a)選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸,或(b)多肽,其特異性地結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸生成的蛋白,和下述的至少一種(l)關于如何使用本發(fā)明的探針的說明書;(2)使用探針必需的試劑和儀器;(3)適用于調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的組合物;(4)適用于破壞與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的組合物;(5)適用于調控動物脂肪組織的量的食物組合物;和(6)—種或多種調控動物脂肪組織的量的藥物或其它物質。在一個優(yōu)選的實施方案中,所述探針與基質結合,優(yōu)選在陣列中。當所述試劑盒包含虛擬包裝時,試劑盒限于在虛擬環(huán)境中的說明書以及一種或多種物理的試劑盒組分。在一個實施方案中,試劑盒含有揮:針和/或其它物理組分,關于使用探針和其它組分的說明書可以通過因特網(wǎng)得到。試劑盒可以含有其它項目,例如用于混合樣品的裝置、探針和試劑和使用該試劑盒的裝置,例如,試管或混合器具。在另一個方面,本發(fā)明提供了用于交流信息或說明的工具,所述信息和說明是關于下述(1)至(13)中的一種或多種(l)使用本發(fā)明的多核苷酸,檢測樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達,(2)使用本發(fā)明的多核苷酸,測量測試物質對與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的影響,(3)使用本發(fā)明的多核苷酸,篩選測試物質以確定它是否可能用于調控動物脂肪組織的量,(4)使用本發(fā)明的多核苷酸,預測動物可能變胖或診斷動物為肥胖,(5)使用本發(fā)明的多核苷酸,操作非人動物的基因組或動物基因組的表達,(6)使用本發(fā)明的多核苷酸,調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因、尤其胖相關基因的表達,或調控動物脂肪組織的量,(7)使用本發(fā)明的多核苷酸,篩選用于包含在一個或多個組中的動物,(8)使用本發(fā)明的多核苷酸,使用計算機系統(tǒng)操作關于與痩動物相比在胖動物中差別表達的基因、尤其胖相關基因的數(shù)據(jù),(9)單獨地或與本發(fā)明的其它要素組合地,給動物施用本發(fā)明的物質(10)使用本發(fā)明的物質,調控動物脂肪組織的量,(ll)使用本發(fā)明的計算機系統(tǒng),(12)使用本發(fā)明的試劑盒,和(13)使用本發(fā)明的方法和組合物以及一種或多種調控動物脂肪組織的量的藥物或其它物質。該工具包含含有信息或說明的文件、數(shù)字存儲介質、光存儲介質、聲音呈現(xiàn)或視覺顯示。在某些實施方案中,交流工具是含有這樣的信息或說明的顯示網(wǎng)站、視覺顯示、報攤、小冊子、產品標簽、包裝說明、廣告、傳單、公告、錄音磁帶、錄像帶、DVD、CD-ROM、計算機可讀芯片、計算機可讀卡、計算機可讀盤、計算機內存或它們的組合。有用的信息包括下述的一種或多種(l)促進動物的健康和痊愈的方法,和(2)如果動物保健提供者具有關于本發(fā)明和它的使用的問題,他們使用的交流信息。有用的說明包括關于使用探針的技術,關于進行基因表達測定的說明,和物質的施用量和頻率。交流工具可以用于指示使用本發(fā)明的利益。本文公開了本發(fā)明的典型優(yōu)選實施方案,盡管采用了特定的術語,它們僅僅普通的且描述性的含義使用,不用于限制目的,因為在考慮本文包含的教導后,可能實現(xiàn)本發(fā)明的許多改進和變化。下面的實施例可以進一步解釋本發(fā)明,盡管應當理解,這些實施例僅僅為了解釋目的而包括,無意限制本發(fā)明的范圍,除非另有特別說明。實施例材料和方法/人組織分離核糖核酸(RNA)將已經(jīng)收集、在液氮中冷凍并融化的組織樣品勻漿化,并使用TRIzolRNA提取方法進行處理,以生成良好質量RNA,然后進行進一步基因組分析。材料水,液氮,冷凍的犬或貓組織,TRIzol裂解試劑,氯仿最小量99%、異丙醇,70%乙醇(用無水乙醇和去離子的、無RNA酶的水制備),RNA酶Zap⑧,去離子水,RNA貯藏溶液⑧,購自Ambion。裝置Ultra-TurraxT25功率勻漿器,BeckmanCoulterAllegra25R離心機,Eppendorf離心機,鑷子,解剖刀,硬切面即切板,1.5mL無DNA酶和RNA酶的/無菌的微量離心管,50mL無DNA酶和RNA酶的/無菌的一次性聚丙烯試管,P1000、P200、P20、P10和P2RaininPipetman吸量管,用于P1000、P200、P20、P10和P2吸量管的過濾器吸管端,無DNA酶和RNA酶的/無菌的、且無絨的抹布。準備用4mLTRIzol⑧準備50mL聚丙烯試管(為RNA分離選擇的每種組織各一個試管)。組織勻漿化給能容納液氮的容器裝上3-4勺子液氮。立即將一片冷凍的組織置于前述容器中(組織應當大約是豌豆大小),將組織置于適當標記的50mL聚丙烯試管中(其已經(jīng)含有4mLTRIzol)。立即使用Ultra-TurraxT25Power勻漿器開始勻漿化。在最高設置(6)勻漿化10-15秒。在水上冷卻樣品另外10-15秒,然后重復。繼續(xù)到組織充分勻漿化,溶液成渾法狀。完全勻漿化后,蓋好50mL試管,返回水上。在室溫溫育勻漿化的組織5分鐘,然后進行分離操作。34RNA分離通常遵循與TRIzol⑧試劑一起提供的Invitrogen說明書中的操作。在4個1.5mL微量離心管中,將勻漿化的樣品分離成4個lmL等分試樣。向每個lmL等分試樣中加入200uL氯仿。蓋好試管,渦旋15秒,然后上下?lián)u動。得到粉紅色乳狀液體。在室溫溫育試管2-3分鐘。在14,000rpm和4。C離心試管15分鐘。將水相(頂層)轉移至無菌的1.5mL微量離心管。要轉移至新試管的水相的典型體積是約500uL。確信不要轉移任何中間相或下相。通過向含有水層的每個微量離心管中加入500uL異丙醇,從溶液中沉淀RNA。上下?lián)u動試管至少20秒。在室溫溫育樣品10分鐘。在14,000rpm、在4°C離心樣品10分鐘。通過抽吸液體并確信不會丟失沉淀,小心地取出上清液。加入lmL70。/。乙醇來洗滌沉淀。通過輕打試管(或在工作臺上面輕敲試管)來移動沉淀,并晃動來混合。在8,200rpm、在4°C離心5分鐘。通過抽吸液體并確信不會丟失沉淀,小心地取出上清液。使用無絨抹布小心地吸收多余的乙醇,確保沉淀物是干燥的。將沉淀物重新懸浮于30uLRNA貯藏溶液。通過洗液輕輕混合,直到RNA回到溶液中,然后保藏在-80。C??赡苄枰诘退贉u旋樣品幾秒,以促進RNA的重新懸浮。如果這是必要的,在冷凍之前使用微量離心機沉淀樣品。RNA清潔遵循在RNeasyMini手冊中給出的操作。使用RNeasyMini試劑盒從在OptiCell室中培養(yǎng)的細胞分離RNA使用從哺乳動物細胞系培養(yǎng)的細胞來分離良好質量的RNA,然后用于將來的下游基因組分析。與細胞培養(yǎng)有關的所有工作都在嚴格的無菌條件下進行。試劑10XPBS,去離子的1120,無水乙醇,RNA貯藏溶液,卩-巰基乙醇,RNA酶Zap,緩沖液RLT,和緩沖液RWl和緩沖液RPE(在RNeasyMmi試劑盒中提供)。裝置/材料RNeasyMini試劑盒,QIAshredder旋轉柱,OptiCell刀,20mL無菌注射器,OptiCell尖,細胞刮棒,P1000Pipetman吸量管,Rainin,P200Pipetman吸量管,Rainin,100-lOOuL過濾式吸量管尖,l-200uL過濾式吸量管尖,無菌轉移吸量管,55mL無菌溶液盆,1.5mL無菌微量離心管,和Eppendorf微量離心機。溶液緩沖液RLT(在RNeasyMini試劑盒中提供的原液);-在開始實驗前,每lOmL緩沖液RLT加入lOOuLP-疏基乙醇。70%乙醇通過將3535mL無水乙醇加入15mL去離子的、無RNA酶的水中,制備50mL70l乙醇。1XPBS:無RNA酶的水。使用.22um過濾器過濾溶液。操作從OptiCell室取出細胞(一次處理一個OptiCell)。在顯微鏡下檢查細胞,以確保細胞在分離RNA之前是活的。取出并拋棄細胞培養(yǎng)基。使用OptiCell刀切掉頂膜,將細胞暴露于下膜上。用1XPBS洗滌細胞粘附的膜3次。吸量600uL緩沖液RLT溶液(含有p-巰基乙醇)到細胞粘附的膜的中心。使用細胞刮棒,將緩沖液RLT輕輕涂布在膜的整個表面上,然后將液體收集在一個角中。吸出整個體積的緩沖液RLT,并置于QIAshredder旋轉柱中。RNA分離在14,000rpm離心QIAshredder旋轉柱2分鐘。排空旋轉柱,但是保留收集管和它的內容物。將600uL70%乙醇加入收集管,并通過洗液混合均勻(現(xiàn)在的總體積=1.2mL)。將600uL細胞裂解物轉移至RNeasymini柱,在14,000rpm離心15秒。拋棄流出物,但是保留收集管和旋轉柱。將剩余體積的細胞裂解物(600uL)轉移至旋轉柱,重復離心。拋棄流出物,但是保留收集管和旋轉柱。將700uL緩沖液RWl加入旋轉柱。在14,000rpm離心15秒來洗滌柱子。拋棄流出物和收集管。將旋轉柱轉移至一個新的2mL收集管,向柱中加入500uL緩沖液RPE。在14,000rpm離心15秒。拋棄流出物,保留收集管/柱。向柱中加入另外500uL緩沖液RPE。在14,000rpm離心2分鐘。將旋轉柱轉移至1.5mL收集管。向^圭膠膜直接添加30uLRNA貯藏溶液,在14,000rpm離心1分鐘,以洗脫RNA。在-70。C貯存最終的RNA。RNA6000Nano測定使用Agilent2100生物分析儀和RNA6000Nano測定,分析從培養(yǎng)的哺乳動物細胞、淋巴細胞或組織分離的RNA的質量。試劑RNA6000Nano凝膠基質,RNA6000Nano染料濃縮物,RNA6000Nano標記,(所有上述試劑都包含在Agilent的RNA6000Nano測定試劑盒中),RNA6000梯度劑(ladder),RNA酶Zap和無RNA酶的水,購自Ambion。裝置/其它材料AgilentChipPrimingStation,Agilent,RNA6000芯片,Agilent,電極清潔劑,P2,P10、P200,和P1000RaininPipetman吸量管,無菌的、無DNA酶/RNA酶的過濾式吸量管尖,1.5mL樣史量離心管,無菌的、渦旋式IKA渦旋混合儀,微量離心機,和加熱塊。操作操作提供在ReagentKitGuide,RNA6000Nano測定,2003年11月版,AgilentTechnologies中。遵循指南給出的操作,采用下述改進制備凝膠,第17頁-而不是將過濾的凝膠分離成各65uL的等分試樣,將原料過濾的凝膠保持在原始的微量離心管中,根據(jù)需要等分65uL。裝載RNA6000Nano標記,第22頁-向將來不含有樣品的每個樣品孔加入luL無RNA酶的水(替代RNA6000Nano標記)。這不僅保留使用的標記的量,而且用作陰性對照,以觀察試劑未被污染,包括無RNA酶的水。裝載梯度劑和樣品,第23頁-在71。C熱變性樣品和RNA6000梯度劑另外30秒(共2.5分鐘)。開始ChipRun,第26頁-從測定菜單中選擇"EukaryoteTotalRNANano"選項。AffymetrixGenechip表達分析4吏用可從Affymetrix,Inc.,SantaClara,CA95051商業(yè)得到的Affymetrix犬1和犬2GeneChip⑧陣列,分析基因表達。將全RNA逆轉錄成cDNA。cDNA用于制備cRNA,將后者分段,用作GeneChip雜交的探針。洗滌基因芯片,用Affymetrix激光掃描儀測量雜交信號。然后驗證和標準化雜交數(shù)據(jù),用于將來分析。材料Affymetrix提供了大部分試劑和試劑盒。在Affymetrix手冊中列出但是沒有在試劑盒中提供的其它試劑可以個別地得到(細節(jié)參見GeneChipExpressionAnalysisTechnicalManual(701021Rev.4)),RNA酶Zap⑧和去離子水。裝置Eppendorf微量離心機,1.5mL無DNA酶和RNA酶的/無菌的微量離心管,50mL無DNA酶和RNA酶的/無菌的一次性聚丙烯試管,P1000、P200、P20、P10和P2RaininPipetman吸量管,無DNA酶和RNA酶的/無菌的、用于P1000、P200、P20、P10和P2吸量管的過濾器吸管端,和Peltier熱循環(huán)儀PTC-200。操作完全遵循在GeneChipExpressionAnalysisTechnicalManual(AffymetrixCopyright1999-2003)中描述的所有操作。使用5微克總RNA用于第一鏈cDNA合成。使用Peltier熱循環(huán)儀PTC-200或加熱塊用于反應和探針變性中的溫度控制。使用具有BioAnalyer2100的RNANanoDrop芯片進行質量控制。使用100格式(Midi陣列)用于M因芯片。實施例1測定來自胖和瘦動物的脂肪組織樣品之間的差別基因表達從使用常規(guī)方法診斷為"胖,,或"瘦"的16(3瘦和13胖)只犬動物得到脂肪組織樣品?;谑褂贸R?guī)方法的DEXA測量,或基于5點身體狀況評分系統(tǒng),確定動物的"胖度"或"瘦度"。例如,如果具有2或2.5的身體狀況評分和/或27%或更低的DEXA總身體脂肪百分比,認為該動物是瘦的。如果具有4或更高的身體狀況評分和30%或更高的總身體脂肪百分比,認為該動物肥胖。所有組織樣品在從動物取出后,立即在液氮中快速冷凍。根據(jù)常規(guī)方法,使用Affymetrix"犬-2"M因芯片分析組織,以便確定哪個基因(如果存在的話)與瘦動物相比在胖動物中差別表達。使用GeneSpring和R-Bioconductor軟件,比較和分析來自胖和瘦樣品的數(shù)據(jù)。對于要指定為"存在"的任意給定基因,必須表現(xiàn)出有待進一步詳察的表達水平的2-倍變化。此外,也選擇僅在一種條件下存在且在其它組中"缺少"或"邊緣的"的基因用于進一步詳察。在下表中提供了結果表1:與瘦動物相比在胖動物脂肪組織中差別表達至少2倍的基因且123451Cfa.6562.1.A1—at6.48XM—516142BC0652712CfaAffx.26065.1.S1—at3.94XM畫—547914AF1111673CfaAffx.2782.1.S1—s—at3.78XM_—538649AJ2434254CfaAffx.2790.1.S1—s—at3.66XM_538649BC073983Cfa.18367.1.SI—at3.19NM—001032284AC0134186Cfa.90391.Al—at3.07XM—547914BX6471047CfaAffx.7975.1.SI—at3.06NM一182490NM—1824908CfaAffx.24964.1.S1—at3.05XM-543892NM—0328039Cfa.3011.1.Al一a—at0.33XM-畫782177AC00522710CfaAffic.14652.1.SI—at0.33XM848392BT02009811Cfa.15689.1.A1—at0.33XM—_844220AC02055012CfaAffx.2909.1.S1—at0.33XM-53888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3.Al一s—at0.44L36871AY647979250Cfa.16500.1.SI—at0.44XM—531940AB070011251Cfa.l8258.3.S1—at0.44XM—844019AB169867252CfaAffx.11992.l.Sl一s一at0.44XM—535094NM—024790253CfaAffx.4328.1.S1—at0.44XM—848235NM—005014254Cfa.l9653.1.A1—at0.44BC081135AC112777255CfaAffx.27578.1.S1—at0.44XM—547618NM—022751256CfaAffx.30551丄S1—at0.44XM一546802AF302109257Cfa.13268.1.A1—at0.44AB126596AC026778258Cfa.l8183.1.Sl一at0.44XM一857210AC008387259Cfa.6019.1.Alat0.44XM724777AC14700445260Cfa.93.1.S1—at0.44CR860955AL137918261CfaAffx.25065丄Sl一s—at0.44麗_-001003220AF030428262Cfa.l3033.1.A1—at0.43CR858688NA263Cfa.5688.1.A1—at0.43畫—015336AL158196264Cfa.l5343.1.A1—a—at0.43XM_—843630NM—144583265CfaAffx.25467.1.Sl一at0.43XM_537659NM—006310266CfaAffk.4613.1.S1—at0.43XM_538986XM—498111267CfaAffx.2014.1.S1—at0.43XM一—214555AC008591268Cfa.9659.1.Al_at0.43AB051389AC108046269Cfa.l465.2.A1—at0.43麗-—213992AC106768270Cfa.ll205.1.A1—at0.43NM畫000216S60088271CfaAffx.3085U.Sl—s—at0.43XM畫—537071BC056667272CfaAffx.10452.1.S1—s—at0.43XM畫590483AC009194273CfaAffx.6374.1.S1—s一at0.43XM畫851910AB168681274CfaAffx.805l.l.Sl一at0.43XM844206BC102460275CfaAffx.9808.1.SI—at0.43XM534351AL035668276Cfa.7153丄A1—s一at0.43XM534351AL035668277Cfa.151361.Sl—at0.43NM畫001206AL162390278Cfa.52771.Al—s—at0.42XM畫—532120NM—145028279CfaAffx.3288.1.S1—at0.42XM_—846150AL138898280CfaAffx.14664.1.Sl_s—at0.42XM844773AF374726281Cfa.l3412.1.Al一at0.42XM__854906BC028421282Cfa.20984.1.S1—at0.42XM-539525AB169259283CfaAffic.8004.1.Sls一at0.42XM—850120XM—371174284Cfa.5715.1.S1—at0.42XM—532133AL133404285Cfa.l286.1.A1—at0.42XM-—583309CR599853286Cfa.l7433.1.Sl一s—at0.42XM548431NM—004059287CfaAffe.ll552丄S1—s_at0.41XM_533773BC017772288Cfa.13150.1.A1—at0.41麗-177737AC044787289CfaAffx.ll212.1.S1—s—at0.41XM—540544AL832391290CfaAffx.1928.l.Sl一at0.41XM-541178NM—032532291Cfa.ll092.1.A1—at0.41NM—021197AC009123292CfaAffx.19304.1.SI—at0.41XM846272AC079151293CfaAffx.5035.1.Sl—s一at0.41XM858105CR625459294Cfa.3648.1.Slat0.41XM517428AC006320295Cfa.lll04.1.Slat0.41XM535184AC083886表2:與瘦動物相比在胖動物的脂肪組織中差別表達的與脂類和葡萄糖代謝有關的基因1234555CfaAffx.929U.Sl—s一at0,,38AB020887CR62650860Cfa.8843.1.A1—s—at0.■37XM—8474卯AY88909081Cfa.l6947丄A1—at2..31XM—543596AL512286112Cfa.825.1.S2—at2..08AY357941AL606517133CfaAffx.25283.1.Sl_.at0,,5XM—846648AF186379204Cfa.204.1.S1—s—at0..49U91844U01120188CfaAffx.2004.1.S1—s—at0.47XM—531894NM一OO1017372212CfaAffx.27879.1.S1—■s—at0.46XM—542108BC047591216Cfa.14057.1.A1—at0..46XM—536086麗一003413232CfaAffx.15436.1.SI—.at0.45XM—543027BC019898240CfaAffx.22832.1.S1—.s—at0.45XM—536069麗—032726274CfaAffe.8051.1.S1—at0.43XM—844206BC102460295Cfa.lll04.1.S1—at0.41XM—535184AC08388611Cfa.15689.1.A1—at0.■33XM—844220AC020550241Cfa.2282.1.Sl一at0.■45XM—539427A譜642815CfaAffx.4097.1.Sl一s一at0.32XM—539427BC04023944Cfa.7478.1.A1—s一at0,.4BC028417NM一00109318CfaAffx.l7336.1.Sl_—s_at0.28AJ575592麗一00109365CfaAffx.l7376.1.Sl一-S一at0.36AJ575592NM一00109366Cfa.l5138.1.A1—at0.36NM—001093AC007637124Cfa.3358.1.S1—at2.03NM—024090AK02703136CfaAffx.17954.l.Sl一—at2.6XM—545023NM一024090285Cfa.l286.1.A1—at0.42XM—583309CR59985367Cfa.lOl.l.Sl—s—at0.35XM—533208BC00018562CfaAffx.l6813.1.S1——at0.37XM—533208NM一00187670CfaAffx.22979.1.Sl一管s一at0.34XM—533208AJ420748182Cfa.ll839.1.A1—s—at0.48XM—535129BC064978157CfaAffk.l4411.1.Sl_—at0.49XM—535129BC064978183Cfa.l2915.1.Alat0.48NM145693AC01245647243Cfa.10854.1.SI—at0.45XM—532878AL513550273CfaAfk.6374.1.Slsat0.43XM851910AB168681表3:鑒別為相對于瘦動物與胖動物特別相關的基因(組5)123456Cfa.9039.1.A1—at3.07XM_—547914BX6471042CfaAffx.26065.1.Sl一at3.94XM_—547914AF1111673CfaAffk.2782.1.S1—s—at3.78XM_—538649AJ2434254CfaAffk.2790.LSl—s—at3.66XM_—538649BC073983274CfaAffx.8051.1.Sl一at0.43XM_844206BC102460295Cfa.lll04.1.S1—at0.41XM_—535184AC08388611Cfa.15689.l.Al—at0.33XM—844220AC02055068Cfa.12375.l.Al—at0.35XM——538880BC04260512CfaAffx.2909.1.S1—at0.33XM_—538880雇—004117241Cfa.2282.1.S1—at0.45XM_—539427AK09642815CfaAffx.4097.1.Sl一s—at0.32XM539427BC04023944Cfa.7478.1.Al一s—at0.4BC028417雇—00109318CfaAffx.l7336.1.S1—s—at0.28AJ575592NM—00109365CfaAffx.l7376.1.Sl一s—at0.36AJ575592雇—00109366Cfa.15138.l.Al—at0.36NM—001093AC00763713CfaAffic.4844丄S1—s—at0.33XM一538481BT01976619CfaAffx.4844.1.S1—at0.26XM—_538481BT019766138Cfa.12746.1.SIat0.5XM——538481AC09384025CfaAffx.732.1.S1—at0.12NM—181756NM—18175624CfaAffk.732.1.S1—x—at0.14雇-畫181756AK095351124Cfa.3358.1.S1—at2.03NM-匿0240卯AK02703136CfaAffx.l7954.1.S1—at2.6XM-545023NM—02409056CfaAffx.25065.LSl—at0.38畫-001003220NM—00647445Cfa.3749.1.S1—at0.4雇-001003220NM—001006624261CfaAffx.25065.1.S1—s—at0.44麗-_001003220AF03042849CfaAffx.4308.1.S1—at0.39XM_—861344NM—00149857CfaAffx.4309.1.Sl一s一at0.38XM_—861358NM—00149863CfaAffx.7431.1.Slat0.37XM_533636BC08055148244CfaAffx.7437.1.S1—s—at0.45XM—.533636AB054067285Cfa.l286.1.Al一at0.42XM—.583309CR59985367Cfa.lOl.l.Sl—s—at0.35XM—533208BC00018562CfaAffx.l6813.1.S1—at0.37XM__533208NM—00187670CfaAffx.22979.1.S1—s—at0.34XM—匿533208AJ42074878Cfa.l5094.1.S1—a_at2.37XM一533973AL13696285Cfa.l5094.2.Sl一a一at2.22XM-—847625AC10746492CfaAffx.l8323.1.Sl_at2.17XM_—536545NM—00310579Cfa.20568丄S1—at2.36NM一003105NM—003105125CfaAffic.l8323.1.S1—s一at2.03XM_—536545U6097594CfaAffe.11365.lSl—at2.16XM畫—535242AF059617114CfaAffx.ll365.1.S1—s—at2.07XM—854900NM—006622158Cfa.12167.l.Al—at0.49XM_-857472CR614711159CfaAffx.9452.1.Sl一s一at0.49XM_-857591U06117182Cfa.11839.l.Al一s一at0.48XM_535129BC064978157CfaAffx.l4411.1.S1—at0.49XM一—535129BC064978185Cfa.4590丄Sl一s一at0.48XM——848228NM—017680186Cfa.533.1.S1—at0.48麗畫001034309AY358329205CfaAffx.3284.1.S1—at0.47XM_—846138NM_018965206CfaAffx.3283.1.S1—at0.47XM_—874820AY204749184Cfa.4465.2.S1—s—at0.48XM845215NA230CfaAffx.21066.1.S1—s—at0.46XM8442%NA207Cfa.18689.l.Sl一at0.47XM—534893CR749334231Cfa.l8689.1.S1—s—at0.46XM—_534893BC040071160Cfa.6037.1.S1—s—at0.49XM—534893CR749334242CfaAffx.26949.1.S1—at0.45XM-—547958AL137735228CfaAffe.26949.1.S1—s—at0.46XM——547958AL132642245Cfa.3664.1.S1—s—at0.45NM-001003173AC004485246Cfa.15462.l.Al—at0.45雨-001003173AL161729183Cfa.l2915丄A1—at0.48NM-145693AC012456243Cfa.l0854.1.S1—at0.45XM532878AL513550273CfaAffx.6374丄S1—s—at0.43XM—851910AB168681275CfaAffx.9808.1.S1—at0.43XM534351AL035668276Cfa.7153.1.A1—s—at0.43XM—534351AL035668187CfaAffx.3714.1.Slat0.48XM541288AL16239049277Cfa.l5136.1.Sl一at0.43畫—匿001206AL162390208Cfa.l6744.1.Sl一at0.47XM-—873620AL162390203Cfa.1213U.Al—at0.47XM--548431Y17448229CfaAffic.30657.1.Sl一at0.46XM-匿548431畫—004059204CfaAffx.30657.1.S1—s—at0.47XM-—548431畫—004059286Cfa.l7433.1.Slsat0.42XM548431NM004059表4:基因描述-最高BLAST命中登錄號SEOIDNO基因描述-最高BLAST命中登錄號1預測的黑猩猩,類似于假定蛋白ARM(LOC460002),mRNA2預測的家犬,類似于原癌基因蛋白c-fos(細胞癌基因fos)(GO/Gl開關調節(jié)蛋白7),轉錄物變體1(LOC490792),mRNA3預測的家犬,類似于早期生長響應蛋白1(EGR-l)(Krox-24蛋白)(ZIF268)(神經(jīng)生長因子-誘導的蛋白A)(NGFI-A)(轉錄因子ETR103)(鋅指蛋白225)(AT225),轉錄物變體2(LOC481528),mRNA4預測的家犬,類似于早期生長響應蛋白1(EGR-1)(Krox-M蛋白)(ZIF268)(神經(jīng)生長因子-誘導的蛋白A)(NGFI-A)(轉錄因子ETR103)(鋅指蛋白225)(AT225),轉錄物變體2(LOC481528),mRNA5人類胸腺生成素(TMPO),轉錄物變體3,mRNA6預測的家犬,類似于原癌基因蛋白c-fos(細胞癌基因fos)(G0/G1開關調節(jié)蛋白7),轉錄物變體1(LOC490792),mRNA7人類鋅指蛋白227(ZNF227),mRNA8預測的家犬,類似于溶質載體家族7(陽離子氨基酸運載體,y+系統(tǒng)),成員3(LOC486765),mRNA9預測的紫色球海膽,類似于CG31108-PA(LOC582217),部分mRNA10預測的家犬,類似于血清/糖皮質激素調節(jié)的激酶2同種型卩(LOC610835),mRNA11預測的家犬,類似于植烷酰-輔酶A羥化酶前體(LOC478001),mRNA12預測的家犬,類似于FK506-結合蛋白5(肽酰-脯氨酰順反式異構酶)(PPIase)(旋轉異構酶)(51kDaFK506-結合蛋白)(FKBP-51)(54kDa孕酮受體-相關的的親免素)(FKBP54)(P54)(FF1抗原)(HSP90-結合親免素)(..。(LOC481759),mRNA13預測的家犬,類似于肝瘤-相關的鈣信號轉導物1前體(主要胃腸腫瘤-相關的蛋白GA733-2)(上皮細胞表面抗原)(上皮糖蛋白)(EGP)(腺癌-相關的抗原)(KSA)(KS1/4抗原)..。(LOC481360),mRNA14人類,克隆IMAGE:5171802,mRNA5015預測的家犬,類似于[丙酮酸脫氫酶[硫辛酰胺]]激酶同工酶4,線粒體前體(丙酮酸脫氫酶激酶同種型4)(LOC482310),mRNA16預測的家犬,類似于niban蛋白同種型2(LOC480041),mRNA17秀麗隱桿線蟲BMP受體相關的蛋白家族成員(bra-l)(bra-l)mRNA,完整cds18乙酰-輔酶A羧化酶2的人類mRNA(ACACB基因)19預測的家犬,類似于腫瘤-相關的鈣信號轉導物1前體(主要胃腸腫瘤-相關的蛋白GA733-2)(上皮細胞表面抗原)(上皮糖蛋白)(EGP)(腺癌-相關的抗原)(KSA)(KS1/4抗原)..。(LOC481360),mRNA20小鼠Murrl和U2afl-rsl基因,部分和完整cds21空腸彎曲桿菌81-176(pflA)基因,完整cds,orfl和orf2,部分cds22預測的家犬,類似于suprabasin(LOC612650),mRNA23約氏瘧原蟲yoelii菌林17XNL假定蛋白(PY04060)mRNA,部分cds24人類鋅指蛋白233(ZNF233),mRNA25人類鋅指蛋白233(ZNF233),mRNA26預測的家犬假定LOC130733(LOC475737),mRNA27人類bcl6基因,5,側翼區(qū)28人類G蛋白-偶聯(lián)的受體51(GPR51),mRNA29預測的家犬,類似于具有EGF-樣和兩個卵泡抑素-樣結構域1的跨膜蛋白,轉錄物變體1(LOC612942),mRNA30孤細胞核受體dNGFI-B蛋白的家犬mRNA31預測的牛推定的MIP1-卩蛋白(L0C414347),mRNA32小GTP-結合蛋白的L.japonicusmRNA,RAB7C33家犬趨化因子(C-C基序)配體2(CCL2),mRNA34家犬誘導型T-細胞輔助刺激因子(ICOS)mRNA,完整cds35預測的家犬層粘連蛋白(33(LOC442953),mRNA36預測的家犬,類似于ELOVL家族成員6,長鏈脂肪酸(FEN1/Ek)2,SUR4/Elo3-樣,酵母)(LOC487900)的延伸,mRNA37細胞周期蛋白D3.1蛋白(CycD3.1)的煙草mRNA38預測的家犬,類似于蛋白C14orfl19(LOC607014),mRNA39家犬趨化因子(C-C基序)酉己體8(CCL8),mRNA40稻(日本品種-組)染色體11克隆B1"6E08,完整序列41人類跨膜4L6家族成員18,mRNA(cDNA克隆MGC:23935IMAGE:3828466),完整cds42裂殖酵母972h-異亮氨酸-tRNA連接酶(SPBC8D2.06),部分mRNA43預測的家犬,類似于原肌球調節(jié)蛋白1,轉錄物變體1(LOC474771),mRNA44人類乙酰-輔酶A羧化酶P,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4824130),完整cds514546474849505152535455565758596061626364656667686970家犬podoplanin(PDPN),mRNA人類cDNAFLJ13037fis,克隆NT2RP3001268,高度類似于人類鋅指蛋白ZNF228(ZNF228)mRNA人類絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶Kp78剪接變體CTAK75amRNA,完整cds家犬IgA重鏈恒定區(qū)基因,部分cds預測的家犬,類似于谷氨酸-半胱氨酸連接酶催化亞基(y-谷氨?;腚装彼岷铣擅?(y-ECS)(GCS重鏈),轉錄物變體3(LOC609822),mRNA人類細胞周期蛋白-依賴性的激酶抑制劑mRNA,部分cds預測的家犬,類似于ATP酶,H+運輸,溶酶體42kDa,VI亞基C同種型2,轉錄物變體4(LOC475667),mRNA預測的牛,類似于千擾素調節(jié)因子4(IRF-4)(淋巴細胞特異性的千擾素調節(jié)因子)(LSIRF)(NF-EM5)(多發(fā)性骨髓瘤癌基因1),轉錄物變體2(LOC506141),mRNA預測的家犬,類似于ARV1同源物,轉錄物變體1(LOC488975),mRNA預測的家犬視網(wǎng)膜母細胞瘤1(RBI),mRNA家犬解偶聯(lián)蛋白2的ucp2mRNA,完整cds家犬podoplanin(PDPN),mRNA預測的家犬,類似于谷氨酸-半胱氨酸連接酶催化亞基(y-谷氨酰基半胱氨酸合成酶)(y-ECS)(GCS重鏈),轉錄物變體4(LOC609822),mRNA家犬免疫球蛋白y重鏈CmRNA,完整cds預測的家犬,類似于X-連接的neuroligin4,轉錄物變體1(LOC607406),mRNA預測的家犬,類似于載脂蛋白C-I前體(Apo-CI)(ApoC-I),轉錄物變體2(LOC476437),mRNA預測的小鼠假定蛋白LOC628198(LOC628198),mRNA預測的家犬肉毒i威棕櫚酰轉移酶I同種型(CPT1),mRNA預測的家犬,類似于缺氧-可誘導的因子-3a同種型a(LOC476429),mRNA預測的家犬,類似于claudin10同種型b,轉錄物變體1(LOC476963),mRNA乙酰-輔酶A羧化酶2的人類mRNA(ACACB基因)人類乙酰-輔酶A羧化酶(3(ACACB),mRNA預測的家犬肉毒石威棕櫚酰轉移酶I同種型(CPT1),mRNA預測的家犬,類似于FK506-結合蛋白5(肽酰-脯氨酰順反式異構酶)(PPIase)(旋轉異構酶)(51kDaFK506-結合蛋白)(FKBP-51)(54kDa孕酮受體-相關的的親免素)(FKBP54)(P54)(FF1抗原)(HSP90-結合親免素)(..。(LOC481759),mRNA預測的家犬,類似于NOV蛋白同源物前體(NovH)(腎胚細胞瘤過表達的基因蛋白同源物)(LOC475083),mRNA預測的家犬肉毒石成棕櫚酰轉移酶I同種型(CPT1),mRNA5271NitellajaponicaATP合酶(3亞基的色質體atpB基因,部分cds,菌林:S09072人類溶質載體家族26,成員7(SLC26A7),轉錄物變體1,mRNA73預測的家犬,類似于NHP2-樣蛋白1(高遷移率組-樣核蛋白2同源物1)([U4/U6.U5]三-snRNP15.5kDa蛋白)(精子特異性的抗原1)(受精抗原1)(FA-1),轉錄物變體2(LOC609886),mRNA74預測的家犬,類似于轉錄因子j皿-B(LOC484927),mRNA75預測的家犬,類似于膠原a1(III)鏈前體,轉錄物變體3(LOC478835),mRNA76預測的家犬,類似于細胞分裂周期7有關的蛋白激酶(CDC7有關的激酶)(HsCdc7)(huCdc7)(LOC479955)'mRNA77人類含有亮氨酸富集重復序列的17(LRRC17),轉錄物變體1,mRNA78預測的家犬,類似于在非轉移性細胞1中表達的,蛋白(NM23A)(核苷二磷酸激酶)(LOC476767),mRNA79人類sortilin有關的受體,含有L(DLR類)A重復序列的(SORLl),mRNA80家犬抗肌萎縮蛋白(DMD)mRNA,5'非翻譯區(qū),或者剪接的81預測的家犬,類似于膽固醇25-羥化酶(LOC486470),mRNA82預測的家犬假定蛋白LOC612422(LOC612422),mRNA83預測的家犬醛縮酶C,轉錄物變體4(LOC480622),mRNA84豌豆核糖體蛋白L34同源物(RPL34)mRNA,完整cds85預測的家犬,類似于在非轉移性細胞1中表達的,蛋白(NM23A)(核苷二磷酸激酶)(LOC609873),mRNA86家犬血清淀粉狀蛋白A蛋白(SAA)mRNA,部分cds87TPA:人類染色體17中間SMS-REP低-拷貝重復序列,基因組序列88預測的牛,類似于肝素-結合EGF-樣生長因子(LOC522921),mRNA89人類含有BTB(POZ)結構域的11(BTBD11),轉錄物變體3,mRNA卯預測的家犬,類似于G-蛋白信號傳遞l(RGSl)的調節(jié)物(早期響應蛋白1R20)(B-細胞激活蛋白BL34),轉錄物變體2(LOC488585),mRNA91預測的牛,類似于核分布基因E同源物1(LOC508088),mRNA92預測的家犬,類似于含有sortilin有關的受體的LDLR類A重復序列的前蛋白原(LOC479408),mRNA93預測的家犬,類似于錨蛋白重復序列結構域26(LOC609691),mRNA94預測的家犬,類似于馬球樣激酶2,轉錄物變體1(LOC478063),mRNA95預測的家犬,類似于跨膜4L6家族成員l(腫瘤-相關的抗原L6)(膜組分,表面標記1)(M3S1)(LOC477107),mRNA96預測的家犬,類似于含有亮氨酸富集重復序列的39,轉錄物變體1(LOC"0141),mRNA97人類核纖層蛋白Bl(LMNB1),mRNA98預測的家犬,類似于reelin同種型b,轉錄物變體1(LOC483273),mRNA99預測的家犬,類似于含有egf-樣模塊的,粘蛋白-樣,激素受體-樣序列2同種型d(LOC484897),mRNA100預測的牛,類似于BTG2蛋白(NGF-可誘導的蛋白TIS21)(LOC539364),mRNA101預測的家犬,類似于錨蛋白重復序列結構域26(LOC491592),mRNA102食蟹猴睪丸cDNA克隆QtsA-13105,類似于人含有犰狳重復序列的2(ARMC2),mRNA,RefSeq:NM—032131.3103預測的牛,類似于含有甘油磷酸二酯磷酸二酯酶結構域的4(LOC525172),mRNA104預測的家犬,類似于立即早期響應2(LOC484917),mRNA105預測的家犬,類似于干擾素y誘導型蛋白47(LOC481471),mRNA106人類KIAA0040(KIAA0040),mRNA107預測的家犬假定蛋白LOC612422(LOC612422),mRNA108預測的家犬,類似于小誘導型細胞因子A3-樣1前體(扁桃體淋巴細胞LD78卩蛋白)(LD78-p(1-70))(G0/G1開關調節(jié)蛋白19-2)(G0S19-2蛋白)(PAT464.2)(LOC480600),mRNA109人類曱狀腺激素受體,卩(成紅細胞白血病病毒(v-erb-a)癌基因同源物2,禽類),mRNA(cDNA克隆MGC:126110IMAGE:40033200),完整cds110約氏癡原蟲yoelii菌抹17XNL假定蛋白(PY01308)mRNA,部分cds111預測的家犬,類似于絲裂原-激活的蛋白激酶激酶6同種型1,轉錄物變體3(LOC480454),mRNA112人類葡萄糖運載體14短同種型mRNA,完整cds;或者剪接的113預測的牛,類似于LAG1長壽保證同源物5,轉錄物變體2(LOC530T76),mRNA114預測的家犬,類似于馬球-樣激酶2,轉錄物變體3(LOC478063),mRNA115玉蜀黍黑粉菌521假定蛋白(UM05082.1),mRNA116推定的分泌的、鬈毛有關的蛋白2的家犬mRNA(sfrp2基因)117來自4的人類BAC克隆RP11-216H12,完整序列118家犬MHC類Ib基因(DLA-79)基因,完整CDS119預測的家犬,類似于過氧化物酶體的肌氨酸氧化酶(PSO)(L-哌啶酸鹽氧化酶)(L-哌啶酸氧化酶)(LOC491177),mRNA120預測的家犬,類似于紡錘體裝配異常蛋白6(LOC490142),mRNA121預測的家犬,類似于中性粒細胞明膠酶-相關的lipocalin前體(NGAL)(P25)(MMP-9的25kDaa-2-微球蛋白有關的亞基)(lipocalin2)(癌基因24p3),轉錄物變體2(LOC491320),mRNA122預測的家犬,類似于骨髓的/淋巴的或混合性白血病5,轉錄物變體11(LOC476542),mRNA頁123人類claudin4,mRNA(cDNA克隆MGC:1778IMAGE:3349211),完整cds124人類ELOVL家族成員6,長鏈脂肪酸(FEN1/Ek)2,SUR4/Elo3-樣,酵母)的延伸(ELOVL6),mRNA125預測的家犬,類似于含有sortilin有關的受體的LDLR類A重復序列前蛋白原(LOC479408),mRNA126預測的家犬,類似于fem-l同源物b(LOC478352),mRNA127預測的家犬,類似于含有FXYD結構域的離子轉移調節(jié)劑6(LOC610831),mRNA128預測的家犬假定LOC481916(LOC481916),mRNA129預測的家犬,類似于F46E10.1a(LOC480551),mRNA130人類基因組DNA,染色體18克隆:RP11-883A18,完整序列131預測的家犬,類似于BE10.2(LOC475247),mP、NA132家犬T細胞受體卩鏈hcvb3(hcvb3)mRNA,部分cds133預測的家犬,類似于過氧化物酶體增殖激活的受體,y,共活化物1a,轉錄物變體1(LOC479127),mRNA134預測的家犬,類似于LIM和衰老細胞抗原-樣結構域1,轉錄物變體1(LOC474540),mRNA135預測的牛,類似于硫酸乙酰肝素D-葡糖氨基3-0-磺基轉移酶2(LOC532099),部分mRNA136預測的牛,類似于磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶,I型,(3同種型2,轉錄物變體1(LOC537654),mRNA137家犬二氫二醇脫氫酶(二聚的)(DHDH),mRNA138預測的家犬,類似于腫瘤-相關的鉤信號轉導物1前體(主要胃腸腫瘤-相關的蛋白GA733-2)(上皮細胞表面抗原)(上皮糖蛋白)(EGP)(腺癌-相關的抗原)(KSA)(KS1/4抗原)..。(LOC481360),mRNA139家犬葡萄糖-6-磷酸酶mRNA,完整cds140寬吻海豚IgM重鏈mRNA,完整cds141預測的家犬,類似于肌酸激酶,線粒體1B前體,轉錄物變體3(LOC478277),mRNA142預測的黑猩猩激酶有關的蛋白,telokin(LOC460640),mRNA143人類血清/糖皮質激素調節(jié)的激酶2,mRNA(cDNA克隆IMAGE:2988475),含有移碼錯-口妖144爪蟾遍在轉錄的tetratricopeptide重復序列基因,Y-連接的,mRNA(cDNA克隆MGC:82191IMAGE:3401210),完整cds145預測的家犬,類似于互補序列組分1,q亞組分,y多肽(LOC487382),mRNA146預測的家犬,類似于ARV1同源物,轉錄物變體1(LOC488975),mRNA147家犬氧化亞氮合酶2A(可誘導的,肝細胞)(NOS2A),mRNA55148預測的牛,類似于F-框蛋白44同種型1(LOC505957),mRNA149預測的家犬,類似于PRKC,細胞祠亡,WT1,調節(jié)劑(LOC611487),mRNA150預測的家犬,類似于互補序列Clq亞組分,A鏈前體(LOC478194),mRNA151家犬triadin同種型3mRNA,完整cds152預測的家犬,類似于CG13624-PC,同種型C,轉錄物變體2(LOC612888),mRNA153預測的家犬,類似于CG4774-PA,同種型A,轉錄物變體2(LOC607530),mRNA154人類neuropilin2(NRP2)基因,完整cds,或者剪接的155預測的家犬,類似于Tetraspanin-5(Tspan-:5)(跨膜4超家族成員9)(Te仃aspanNET-4),轉錄物變體2(LOC478486),mRNA156預測的家犬,類似于IgX鏈恒定區(qū)(LOC607541),mRNA157預測的家犬,類似于丙酮酸脫氫酶磷酸酶前體(LOC477941),mRNA158預測的家犬,類似于黃噤呤脫氫酶/氧化酶,轉錄物變體3(LOC483028),mRNA159預測的家犬,類似于黃。票呤脫氫酶/氧化酶,轉錄物變體8(LOC483028),mRNA160預測的家犬,類似于a-2-巨球蛋白前體(a-2-M)(LOC477699),mRNA161預測的家犬假定LOC480209(LOC480209),mRNA162預測的家犬磺基轉移酶家族,胞質的,IB,成員I(SULTIBI),mRNA163預測的家犬,類似于水通道3(LOC611792),mRNA164Petuniaintegrifolia亞種inflataS2自交不親和性核糖核酸酶(S2-RNA酶)和S2-基因座F-框蛋白(SLF2)基因,完整cds165預測的家犬,類似于蛋白C14orfl03同源物(LOC480428),mRNA166人類mRNA;cDNADKFZp686G0638(來自克隆DKFZp686G0638)167人類含有B-框和SPRY結構域的(BSPRY),mRNA168預測的褐鼠細胞凋亡染色質凝聚誘導物1(預測的)(Acini—預測的),mRNA169預測的家犬,類似于Elafin前體(彈性酶-特異性的抑制齊'])(ESI)(皮膚-衍生的antileukoproteinase)(SKALP)(WAP4-二硫化物核心結構域蛋白14)(蛋白酶抑制劑WAP3)(LOC477241),mRNA170預測的家犬,類似于半胱氨酸蛋白酶抑制劑9-樣前體(LOC485559),mRNA171稻(日本品種-組)基因組DNA,染色體1,完整序列172預測的173預測的174預測的家犬dystonin,轉錄物變體16(DST),mRNA家犬,類似于酸性磷酸酯酶6,溶血磷脂酸的(LOC475822),mRNA家犬,類似于含有2同種型2的視紫紅質抑制蛋白結構域,轉錄物變體3(LOC609柳),mRNA175預測的176預測的177預測的家犬,類似于ATP-結合盒,亞家族A成員1(LOC481651),mRNA家犬,類似于前髓細胞性白血病鋅指蛋白,轉錄物變體3(LOC489398),mRNA家犬,類似于蛋白C9orf72同源物,轉錄物變體1(LOC481569),mRNA56178預測的家犬,類似于絲裂原-激活的蛋白激酶激酶激酶5(LOC491765),mRNA179預測的家犬,類似于鋅指蛋白403,轉錄物變體4(LOC480594),mRNA180人類tetratricopeptide重復序列結構域25,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4831078),完整cds181層粘連蛋白a2亞基前體變體蛋白的人類mRNA182預測的家犬,類似于丙酮酸脫氫酶磷酸酶前體(LOC477941),mRNA183人類脂質1(LPIN1),mRNA184預測的家犬,類似于免疫球蛋白X-樣多肽1前體(免疫球蛋白有關的14.1蛋白)(免疫球蛋白co多肽)(X5)(CD179b抗原)(LOC608248),mRNA185預測的家犬,類似于Asporin前體(LOC610685),mRNA186牛,類似于Asporin前體(牙周膜相關的蛋白1)(PLAP-1)(MGC128677),mRNA187預測的家犬,類似于轉錄因子BTEB1(基礎轉錄元件結合蛋白l)(BTE-結合蛋白l)(GC框結合蛋白1)(Krueppel-樣因子9)(LOC484n2),mRNA188預測的家犬,類似于溶質栽體家族27(脂肪酸運載體),成員6(LOC474666),mRNA189構巢曲霉FGSCA4假定蛋白(AN4185.2),mRNA190預測的家犬,類似于NADP-依賴性的視黃醇脫氫酶/還原酶(LOC488391),mRNA191野豬表皮生長因子前體(EGF)mRNA,完整cds192家犬IgA重鏈恒定區(qū)基因,部分cds193金屬硫蛋白-II的家犬mRNA,完整cds194預測的家犬,類似于互補序列組分1,q亞組分,(3多肽前體(LOC487381),mRNA195預測的家犬,類似于鋅指蛋白660(LOC491422),mRNA1%預測的家犬,類似于SH3結構域蛋白D19,轉錄物變體1(LOC482645),mRNA197預測的家犬,類似于DRE1蛋白(LOC478647),mRNA198食蟹猴mRNA,克隆QnpA-12979:類似于人類神經(jīng)上皮細胞轉化基因1(NET1),mRNA,NM—005863.2199人類亮氨酰/半胱氨酰氨肽酶(LNPEP),轉錄物變體2,mRNA200人類腺苷一磷酸脫氨酶(同種型E)(AMPD3),轉錄物變體l,mRNA201預測的家犬生育酚(a)轉移蛋白(TTPA),mRNA202預測的家犬,類似于原肌球調節(jié)蛋白1,轉錄物變體1(LOC474771),mRNA203預測的家犬,類似于犬尿素--酮戊二酸轉氨酶I(犬尿素氨基轉移酶I)(KATI)(谷氨酰胺-苯基丙酮酸轉氨酶)(谷氨酰胺轉氨酶K)(GTK)(半胱氨酸-S-綴合物p-裂合酶)(LOC491310),mRNA204預測的家犬,類似于犬尿素-酮戊二酸轉氨酶I(犬尿素氨基轉移酶I)(KATI)(谷氨酰胺--苯基丙酮酸轉氨酶)(谷氨酰胺轉氨酶K)(GTK)(半胱氨酸-S-綴合物卩-裂合酶)(LOC491310),mRNA205預測的家犬,類似于在髓樣細胞2前體上表達的觸發(fā)受體(在單核細胞2上表達的觸發(fā)受體)(TREM-2)(LOC608965),mRNA206預測的牛,類似于在髓樣細胞2前體上表達的觸發(fā)受體(在單核細胞2上表達的觸發(fā)受體)(TREM-2),轉錄物變體2(LOC506467),mRNA207預測的家犬,類似于a-2-巨球蛋白前體(a-2-M)(LOC477699),mRNA208預測的牛,類似于轉錄因子BTEB1(基礎轉錄元件結合蛋白1)(BTE-結合蛋白1)(GC框結合蛋白1)(Krueppel-樣因子9),轉錄物變體3(LOC539139),mRNA209CBF表達2(ICE2)基因的大麥亞種vulgare品種Morex誘導物,部分cds210預測的家犬,類似于Y54E10A.6(LOC489622),mRNA211猩猩mRNA;cDNADKFZp469L0319(來自克隆DKFZp469L0319)212預測的家犬,類似于胰島素受體前體(IR)(CD220抗原)(LOC484990),mRNA213預測的家犬,類似于環(huán)指蛋白150(LOC607611),mRNA214人類cDNA克隆MGC:51010IMAGE:5270267,完整cds215預測的家犬基質金屬蛋白酶-2(MMP-2),mRNA216預測的家犬,類似于?;o酶A合成酶長鏈家族成員3,轉錄物變體1(LOC478927),mRNA217黑腹果蠅CG18211-PA①Try)mRNA,完整cds218預測的家犬,類似于視黃酸受體響應物(他佐羅汀誘導的)1同種型1(LOC612298),mRNA219在轉移性前列腺癌mRNA中增量調節(jié)的人類蛋白,完整cds220預測的家犬,類似于Krueppel-樣因子5(腸富集的krueppel-樣因子)(結腸krueppel-樣因子)(轉錄因子BTEB2)(基礎轉錄元件結合蛋白2)(BTE-結合蛋白2)(GC框結合蛋白2)...,轉錄物變體3(LOC612788),mRNA221預測的家犬,類似于NOV蛋白同源物前體(NovH)(腎胚細胞瘤過表達的基因蛋白同源物)(LOC475083),mRNA222預測的家犬,類似于干擾素有關的發(fā)育調節(jié)劑1,轉錄物變體2(LOC482408),mRNA223預測的家犬,類似于BTG3蛋白(Tob5蛋白)(在神經(jīng)上皮區(qū)域蛋白中富含的),轉錄物變體2(LOC487695),mRNA224牛僅同源結構域的蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:127764IMAGE:7963031),完整cds225預測的家犬,類似于蛋白C9orf72同源物,轉錄物變體1(LOC481569),mRNA226預測的家犬,類似于解蛋白酶激活的受體3前體(PAR-3)(凝血酶受體-樣2)(凝結因子II受體-樣2)(LOC607963),mRNA227碩大利什曼原蟲菌林Friedlin假定蛋白(LMJ—1048)mRNA,部分cds228預測的家犬,類似于含有錨蛋白重復序列和SOCS框的蛋白2(預測的),轉錄物變體1(LOC490836),mRNA229預測的家犬,類似于犬尿素-酮戊二酸轉氨酶I(犬尿素氨基轉移酶I)(KATI)(谷氨酰胺-苯基丙酮酸轉氨酶)(谷氨酰胺轉氨酶K)(GTK)(半胱氨酸-S-綴合物P-裂合酶)(LOC491310),mRNA230預測的家犬,類似于免疫球蛋白X-樣多肽1前體(免疫球蛋白有關的14.1蛋白)(免疫球蛋白co多肽)(X5)(CD179b抗原)(LOC607558),mRNA231預測的家犬,類似于a-2-巨球蛋白前體(a-2-M)(LOC477699),mRNA232預測的家犬,類似于磷脂轉移蛋白前體(脂質轉移蛋白II)(LOC485903),mRNA233預測的家犬,類似于WD重復序列結構域66,轉錄物變體2(LOC477466),mRNA234人類丙氨酸-乙醛酸氨基轉移酶2-樣1,mRNA(cDNA克隆MGC:26665IMAGE:4797767),完整cds235家犬IgA重鏈恒定區(qū)基因,部分cds236貓CD8抗原,卩多肽(CD8B),mRNA237預測的黑猩猩RAN結合蛋白2(LOC459477),mRNA238預測的家犬,類似于ERBB2相互作用蛋白同種型7(LOC478082),mRNA239丙氨酸乙醛酸氨基轉移酶2同源物1的人類mRNA,剪接形式1(AGXT2L1基因)240預測的家犬,類似于磷脂酶C,54(LOC478910),mRNA241預測的家犬,類似于[丙酮酸脫氫酶[硫辛酰胺]]激酶同工酶4,線粒體前體(丙酮酸脫氳酶激酶同種型4)(LOC482310),mRNA242預測的家犬,類似于含有錨蛋白重復序列和SOCS框的蛋白2(預測的),轉錄物變體1(LOC490836),mRNA243預測的家犬,類似于脂質1,轉錄物變體1(LOC475670),mRNA244預測的家犬,類似于缺氧-可誘導的因子-3a同種型a(LOC476429),mRNA245家犬金屬硫蛋白1X(MT1X),mRNA246家犬金屬碌^蛋白1X(MT1X),mRNA247預測的家犬,類似于UDP-N-乙酰基-a-D-半乳糖胺:多肽N-乙?;被肴樘腔D移酶-樣2(LOC477056),mRNA248人類WNK賴氨酸缺陷的蛋白激酶3(WNK3),轉錄物變體2,mRNA249家犬IgA重鏈恒定區(qū)基因,部分cds250預測的家犬,類似于肌球蛋白-3(肌球蛋白重鏈A)(MHCA)(LOC474713),mRNA251預測的家犬,類似于在腎細胞癌(LOC607380)中減量調節(jié)的,mRNA252預測的家犬,類似于中心體紡錘極有關的蛋白(LOC477902),mRNA253預測的家犬,類似于骨調控蛋白前體(Osteoadherin)(OSAD)(硫酸角質素蛋白聚糖骨調控蛋白)(KSPG骨調控蛋白)(LOC610693),mRNA254爪蟾MGC83953蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:83953IMAGE:6862234),完整cds255預測的家犬假定LOC4卯496(LOC4卯496),mRNA256預測的家犬,類似于WAP4-二硫化物核心結構域1前體(LOC489682),mRNA257互補序列組分6的猩猩C6基因,部分cds258預測的家犬,類似于錨蛋白重復序列,家族A(RFXANK-樣),2,轉錄物變體3(LOC47,7),mRNA259約氏癡原蟲yoelii菌林17XNL假定蛋白(PY02022)mRNA,部分cds260猩猩mRNA;cDNADKFZp470P1633(來自克隆DKFZp470P1633)261家犬podoplanin(PDPN),mRNA262猩猩mRNA;cDNADKFZp46810813(來自克隆DKFZp46810813)263含有人類鋅指DHHC-型的17(ZDHHC17),mRNA264預測的家犬,類似于ATP酶,H+運輸,溶酶體42kDa,VI亞基C同種型2,轉錄物變體3(LOC475667),mRNA265預測的家犬,類似于氨肽酶噪呤霉素敏感的(LOC480538),mRNA266預測的家犬,類似于CG7245-PA(LOC481865),mRNA267預測的褐鼠,類似于DDI(預測的)(LOC291580),mRNA268VSGP/F-spondin的牛mRNA,完整cds269野豬雌激素磺基轉移酶(STE),mRNA270人類Kallmann綜合征1序歹'J(KALl),mRNA271預測的家犬,類似于肉瘤抗原NY-SAR-41(LOC479946),mRNA272預測的牛,類似于鋅指蛋白420(LOC512882),mRNA273預測的家犬,類似于脂質1,轉錄物變體4(LOC475670),mRNA274預測的家犬,類似于植烷酰-輔酶A羥化酶前體(LOC607509),mRNA275預測的家犬,類似于骨形態(tài)形成蛋白2前體(BMP-2)(BMP-2A),轉錄物變體1(LOC477162),mRNA276預測的家犬,類似于骨形態(tài)形成蛋白2前體(BMP-2)(BMP-2A),轉錄物變體1(LOC477162),mRNA277人類Kmppel-樣因子9(KLF9),mRNA278預測的279預測的280預測的家犬假定LOC474886,轉錄物變體2(LOC474886),mRNA家犬,類似于在髓樣細胞-樣4上表達的觸發(fā)受體(LOC608975),mRNA家犬,類似于解蛋白酶激活的受體3前體(PAR-3)(凝血酶受體-樣2)(凝結因子II受體-樣2)(LOC607963),mRNA281預測的282預測的283預測的284預測的285預測的家犬,類似于WD重復序列結構域66,轉錄物變體2(LOC477466),mRNA家犬,類似于干擾素有關的發(fā)育調節(jié)劑1,轉錄物變體1(LOC482408),mRNA家犬,類似于鋅指蛋白283(LOC613011),mRNA家犬,類似于在髓樣細胞-樣1上表達的觸發(fā)受體(LOC474898),mRNA牛,類似于肉毒城O-棕櫚酰轉移酶I,線粒體肝同種型(CPTI)(CPTI-L)(肉毒堿棕櫚酰轉移酶1A)(LOC506812),部分mRNA60286預測的家犬,類似于犬尿素-酮戊二酸轉氨酶I(犬尿素氨基轉移酶I)(KATI)(谷氨酰胺-苯基丙酮酸轉氨酶)(谷氨酰胺轉氨酶K)(GTK)(半胱氨酸-S-綴合物p-裂合酶)(LOC491310),mRNA287預測的家犬假定LOC476569(LOC476569),mRNA288小鼠表達的序列AI854703(AI854703),mRNA289預測的家犬,類似于再生有關的肌肉蛋白酶同種型b(LOC483426),mRNA290預測的家犬,類似于含有纖連蛋白III型結構域1(LOC484061),mRNA291人類WAP4-二硫化物核心結構域1(WFDC1),mRNA292預測的家犬,類似于CG1530-PA(LOC609071),mRNA293預測的家犬,類似于糖蛋白(跨膜)nmb同種型b前體,轉錄物變體3(LOC482355),mRNA294預測的黑猩猩,類似于sprouty同源物l,FGF信號傳遞的拮抗劑;sprouty,果蠅,同源物1(FGF信號傳遞的拮抗劑);sprouty(果蠅)同源物1(FGF信號傳遞的拮抗劑)(LOC461476),mRNA295預測的家犬,類似于植烷酰-輔酶A羥化酶前體(LOC478000),mRNA表5:基因描述-人序列登錄號的最高BLAST命中SEOIDNO基因描述-人序列登錄號的最高BLAST命中1人類含有犰狳重復序列9,mRNA(cDNA克隆MGC:74894IMAGE:6165433),完整cds2人類jun二聚化蛋白基因,部分cds;cfos基因,完整cds;和未知基因3早期生長響應蛋白1的人類EGR1基因4人類早期生長響應1,mRNA(cDNA克隆MGC:88036IMAGE:6188360),完整cds5人類12BACRPU-181C3(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列6人類mRNA;cDNADKFZp686J04124(來自克隆DKFZp686J04124)7人類鋅指蛋白227(ZNF227),mRNA8人類溶質載體家族7(陽離子氨基酸運載體,y+系統(tǒng)),成員3(SLC7A3),mRNA9來自14q24.3的人類PAC克隆RP5-1003N18,完整序列10人類血清/糖皮質激素調節(jié)的激酶2mRNA,完整cds11來自2的人類BAC克隆RP11-198M19,完整序列12人類FK506結合蛋白5(FKBP5),mRNA13合成構建體人類腫瘤-相關的鈣信號轉導物1mRNA,部分cds14染色體6上的來自克隆RP3-510O8的人DNA序列含有FK506結合蛋白5(FKBP51)的FKBP5基因的5'末端,4個新基因(包括FLJ25390),1個UMP-CMP(尿甙一磷酸-胞啶一磷酸)激酶假基因,胰腺輔脂肪酶的CLPS基因,1個新基因和兩個CpG島的5'末端,61完整序列15人類丙酮酸脫氫酶激酶,同工酶4,mRNA(cDNA克隆MGC:5281IMAGE:3047987),完整cds16來自4的人類BAC克隆RP11-617I14,完整序列17人類染色體3克隆RP11-6B7,完整序列18人類乙酰-輔酶A羧化酶卩(ACACB),mRNA19合成構建體人類腫瘤-相關的鈣信號轉導物1mRNA,部分cds20人類12BACRP11-451H11(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列21來自2的人類BAC克隆RP11-398G12,完整序列22人類suprabasin(SBSN),mRNA23人類3BACRP11-1D19(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列24人類cDNAFLJ38032fis,克隆CTONG2013352,中等類似于鋅指蛋白22825人類鋅指蛋白233(ZNF233),mRNA26人類(人)胎盤Cot25-標準化的全長cDNA克隆CS0DI004YK2427人類3BACRP11-211G3(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列28染色體9上的來自克隆RP11-199C17的人DNA序列含有TBC1結構域家族的TBC1D2基因的5,末端,成員2(PARIS1,PARIS-1,DKFZP761D1823,DKFZp761D1823),G蛋白-偶聯(lián)的受體51的GPR51基因的3'末端(HG20,GABBR2,GPRC3B,GABABR2)和I個CpG島,完整序列29人類具有EGF-樣和兩個卯泡抑素-樣結構域1的跨膜蛋白(TMEFF1),mRNA30人類細胞核受體亞家族4,組A,成員1,轉錄物變體l,mRNA(cDNA克隆MGC:9485IMAGE:3921259),完整cds31人LAG-lmRNA32人類cDNAFLJ39913fis,克隆SPLEN2018643,高度類似于可能的G蛋白-偶聯(lián)的受體APJ33編碼單核細胞分泌蛋白mRNA的人JE基因,完整cds34激活-可誘導的淋巴細胞免疫調節(jié)分子AILIM的人類mRNA,完整cds35人類cDNA克隆IMAGE:5175186,含有移碼錯誤36人類ELOVL家族成員6,長鏈脂肪酸(FEN1/Ek)2,SUR4/Elo3-樣,酵母)的延伸(ELOVL6),mRNA37來自4的人類BAC克隆RP11-384E2,完整序列38人類染色體14開放讀碼框119,mRNA(cDNA克隆MGC:74723IMAGE:5532778),完整cds39人類趨化因子(C-C基序)配體8(CCL8),mRNA40染色體Xpll.3-11.4上的來自克隆RP5-1172N10的人DNA序列含有X染色體泛素特異性的蛋白酶9的USP9X基因的3,末端(fatfacets-樣果蠅),1個新基因和1個CpG島,完整序列41人類跨膜4L6家族成員18(TM4SF18),mRNA42染色體13上的來自克隆RP11-520F24的人DNA序列含有HNRPA1(異源核內核糖核蛋白Al)假基因,ELL有關的RNA聚合酶II,延伸因子(ELL2)假基因和核糖體蛋白L37(RPU7)假基因,完整序列43人類克隆25081原肌球調節(jié)蛋白inRNA序列44人類乙酰-輔酶A羧化酶(3(ACACB),mRNA45人類podoplanin(PDPN),轉錄物變體3,mRNA46人類鋅指蛋白228(ZNF228),mRNA47人18S核糖體RNA48人類cDNA克隆MGC:88772IMAGE:4765168,完整cds49人類谷氨酸-半胱氨酸連接酶,催化亞基(GCLC),mRNA50pl6/CDKN2A的人類基因,完整cds51人類ATP酶,H+運輸,溶酶體42kDa,VI亞基C同種型2(ATP6V1C2),mRNA52人類干擾素調節(jié)因子4,mRNA(cDNA克隆MGC:23069IMAGE:4861223),完整cds53人類ARVI同源物(酵母)(ARV1),mRNA54染色體13上的來自克隆RP11-174I10的人DNA序列含有視網(wǎng)膜母細胞瘤1(包括骨肉瘤)的RB1基因的3'末端和1個新基因的5'末端,完整序列55人類(人)T細胞(Jurkat細胞系)CotlO-標準化的全長cDNA克隆CS0DJ010YA1556人類podoplanin(PDPN),轉錄物變體1,mRNA57人類谷氨酸-半胱氨酸連接酶,催化亞基(GCLC),mRNA58NA59人類克隆DNA44205NLGN4(UNQ365)mRNA,完整cds60合成構建體人類克隆FLH025847.01X栽脂蛋白C-I(APOCl)mRNA,完整cds61來自2的人類BAC克隆RP11-197H3,完整序列62人類肉毒堿椋櫚酰轉移酶1A(肝)(CPT1A),編碼線粒體蛋白的核基因,轉錄物變體l,mRNA63人類缺氧謙導因子3,a亞基,mRNA(cDNA克隆MGC:99497IMAGE:6250259),完整cds64人類claudm10(CLDN10),轉錄物變體l,mRNA65人類乙酰-輔酶A羧化酶p(ACACB),mRNA66人類12q24BACRCPI11-443D10(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列67人類肉毒堿棕櫚酰轉移酶1A(肝),轉錄物變體2,mRNA(cDNA克隆MGC:1772IMAGE:3352642),完整cds6368人類FK506結合蛋白5,mRNA(cDNA克隆MGC:34489IMAGE:4539929),完整cds69人類NOVH蛋白mRNA,完整cds70肉毒堿O-棕櫚酰轉移酶1的人類部分CPT1A基因,啟動子區(qū),CDS和剪接變體a和b71人類染色體19,粘粒R31341,完整序列72人類溶質載體家族26,成員7(SLC26A7),轉錄物變體1,mRNA73小鼠17天胚胃cDNA,RIKEN全長富集的文庫,克隆:I920056H18產物:NHP2-樣蛋白1(高遷移率組-樣核蛋白2同源物1)([U4/U6.U5]三-snRNP15.5kDa蛋白)(OTK27)同源物[人類],全插入序列74人類junB原癌基因(JUNB),mRNA75人類染色體8,克隆RP11-734H6,完整序列76Cdc7有關的激酶的人類mRNA,完整cds77人類含有亮氨酸富集重復序列的17(LRRC17),轉錄物變體l,mRNA78染色體13上的來自克隆RP11-273F15的人DNA序列含有類似于NADH脫氫酶3(NADH脫氳酶,亞基3(復合物I))(MTND3)的一部分的假基因和在(NME1)(NM23,NM23-H1)中表達的非轉移性細胞1蛋白(NM23A)假基因,完整序列79人類sortilin有關的受體,L(DLR類)含有A重復序列的(S0RL1),mRNA80抗肌萎縮蛋白(5'區(qū),或者剪接的}[人,小腦Purkinje神經(jīng)元,mRNA部分,320核苷酸]81染色體X上的來自克隆RP11-45J1的人DNA序列含有prefoldin4(PFDN4)假基因,1個新基因和1個CpG島的5'末端,完整序列82人類染色體8,克隆CTD-3071K10,完整序列83食蟹猴腦cDNA,克隆QccE-21970,類似于人醛縮酶C,果糖-二璘酸(ALDOC),mRNA,RefSeq:畫—005165.184人類染色體17,克隆193hl8,完整序列85來自4的人類BAC克隆RP11-1191J2,完整序列86基因SAA1、血清淀粉狀蛋白Al的人類完整開放讀碼框cDNA克隆RZPDo834A0126D;完整cds,沒有終止密碼子87TPA:人類染色體17鄰近的SMS-REP低-拷貝重復序列,基因組序列88人類白喉毒素受體(肝素-結合表皮生長因子-樣生長因子)(DTR)基因,完整cds89人類含有BTB(POZ)結構域的11(BTBD11),轉錄物變體3,mRNA90G-蛋白信號傳遞1的人類調節(jié)劑,mRNA(cDNA克隆MGC:9198IMAGE:3916789),完整cds91人類nudE核分布基因E同源物1(構巢曲霉),mRNA(cDNA克隆MGC:1075IMAGE:3140369),完整cds92人類sortilin有關的受體,L(DLR類)含有A重復序列的(S0RL1),mRNA93人類染色體5克隆RP11-1152B5,完整序列94人類血清-可誘導的激酶mRNA,完整cds95人類mRNA;cDNADKFZp313N1532(來自克隆DKFZp313N1532)96人類含有亮氨酸富集重復序列的39(LRRC39),mRNA97人類核纖層蛋白Bl(LMNB1),mRNA98人類reelin(RELN),轉錄物變體2,mRNA99人類cDNAFLJ41271fis,克隆BRAMY2036396100染色體1上的來自克隆RP11-134P9的人DNA序列含有1個新基因的3'末端,1個新基因,BTG家族的BTG2基因,成員2和l個CpG島,完整序列101染色體10上的來自克隆RP11-145E8的人DNA序列含有l(wèi)個新基因(KIAA1074),YME1-樣1(釀酒酵母)的YME1L1基因的3,末端和1個CpG島,完整序列102食蟹猴睪丸cDNA克隆QtsA-13105,類似于人含有犰狳重復序列的2(ARMC2),mRNA,RefSeq:蘭—032131.3103人類染色體17,克隆CTD-3193K9,完整序列104人轉錄因子ETR101mRNA,完整cds105染色體22上的來自克隆CTA-343C1的人DNA序列,完整序列106人類(人)的胎盤Cot25-標準化的全長cDNA克隆CS0DI069YJ22107染色體20上的來自克隆RP4-727110的人DNA序列含有1個新基因,ESTs,STSs和GSSs,完整序列108人類CC趨化因子配體4L2f(CCL4L)mRNA,CCL4L-2等位基因,完整cds,或者剪接的109人類曱狀腺激素受體,p(成紅細胞白血病病毒(v-erb-a)癌基因同源物2,禽類),mRNA(cDNA克隆MGC:126110IMAGE:40033200),完整cds110人類3BACRP11-211G3(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列111人MAP激酶激酶MEK6(MEK6)mRNA,完整cds112染色體1上的來自克隆RP11-182110的人DNA序列含有肛門激酶1(一種蛋白酪氨酸激酶)的JAK1基因的5,末端,NADH脫氫酶(泛醌)1a亞復合物49kDa(NDUFA4)假基因,SIPL蛋白(SIPL)假基因,l個新基因的一部分,溶質栽體家族2(促進的葡萄糖運載體)成員14(SLC2A14)假基因和1個CpG島,完整序列113人類12BACRP4-605O3(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列114人類馬球-樣激酶2(果蠅)(PLK2),mRNA115染色體6上的來自克隆RP11-497F24的人DNA序列,完整序列116人類cDNAFLJ36603fis,克隆TRACH2015180,高度類似于綣曲蛋白-2117來自4的人類BAC克隆RP11-216H12,完整序列118MHC類I抗原的人類HLA-C基因,CW*15021等位基因,外顯子1-865119人類L-哌梵酸氧化酶(LPIPOX)mRNA,完整cds120人類mRNA;cDNADKFZp686C24224(來自克隆DKFZp686C24224)1"合成構建體人類lipocalin2(癌基因24p3)mRNA,部分cds122預測的人類假定蛋白FLJ10707(FLJ10707),mRNA123人類claudin4,mRNA(cDNA克隆MGC:1778IMAGE:3349211),完整cds124人類cDNA:FLJ23378fis,克隆HEP16248125人類gp250前體,mRNA,完整cds126人類fem-1同源物b(秀麗隱桿線蟲),mRNA(cDNA克隆MGC:19792IMAGE:3840453),完整cds127人XIST基因,多噪呤-嘧啶重復序列區(qū)128人類氨基酰化酶1-樣2,mRNA(cDNA克隆IMAGE:5262663),部分cds129人類假定蛋白FLJ20920,mRNA(cDNA克隆MGC:19867IMAGE:4577089),完整cds130人類基因組DNA,染色體18克隆:RP11-883A18,完整序列131人類假定蛋白LOC392636,mRNA(cDNA克隆MGC:131748IMAGE:6152531),完整cds132的T-細胞受體p可變區(qū)的人類部分BV03SlJ2.2基因133人類配體效應調控物-6(LEM6)mRNA,完整cds134預測的人類,類似于LIM和衰老細胞抗原-樣結構域1(LOC440895),mRNA135人類染色體16克隆CTA-237H1,完整序列136人類磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶,I型,P(PIP5K1B),轉錄物變體2,mRNA137人類二氫二醇脫氫酶(二聚的)(DHDH),mRNA138來自4的人類BAC克隆RPll-43303,完整序列139人葡萄糖-6-磷酸酶mRNA,完整cds140人類(人)成神經(jīng)細胞瘤的人全長cDNA克隆CS0DD006YL02141人類肌酸激酶,線粒體1B(CKMT1B),編碼線粒體蛋白的核基因,mRNA142人類cDNAFLJ45560fis,克隆BRTHA3003417143染色體20ql3.12上的來自克隆RPl-138B7的人DNA序列含有1(3)mbt-樣(果蠅)的L3MBTL基因的3'末端,血清/糖皮質激素調節(jié)的激酶2的SGK2基因,C20orf9基因的5'末端(NGD5,CGI-53),1個HSPC194假基因和1個CpG島,完整序列144人類染色體15,克隆RP11-253M7,完整序列145人類Clq-CmRNA,完整cds146人類ARV1同源物(酵母)(ARV1),mRNA147染色體ll上的來自克隆RP23-215H18的小鼠DNA序列含有1個新基因和人動力蛋白基因絲重多肽9(DNAH9)的可能定向進化同源基因的3'末端,完整序列148人類mRNA;cDNADKFZp781J0852(來自克隆DKFZp781J0852)149基因PAWR、PRKC、細胞凋亡的、WT1調節(jié)劑的人類完整開放讀碼框cDNA克隆RZPDo834F0920D;完整cds,包括終止密碼子150人類互補序列組分1,q亞組分,a多肽,mRNA(cDNA克隆MGC:294卯IMAGE:4850418),完整cds151NA152人類cDNAFLJ16122fis,克隆BLADE2008995153人類染色體20開放讀碼框155(C20orfl55),mRNA154人類neuropilin2(NRP2)基因,完整cds,或者剪接的155人類染色體4克隆RP11-603B8,完整序列156NA157人類蛋白磷酸酶2C,鎂-依賴性的,催化亞基,mRNA(cDNA克隆IMAGE:6158636),部分cds158人類(人)胎盤Cot25-標準化的全長cDNA克隆CS0DI070YL04159人黃噪呤脫氫酶(XDH)mRNA,完整cds160人類mRNA;cDNADKFZp779B086(來自克隆DKFZp779B086)161人類(人)胎盤Cot25-標準化的全長cDNA克隆CS0DI068YG02162人類磺基轉移酶家族,胞質的,1B,成員1(SULT1B1),mRNA163染色體9^ji的來自克隆RPll-311H10的人DNA序列含有X-框結合核轉錄因子1的NFX1基因的3'末端,水通道7和3的AQP7和AQP3基因,l個新基因,核仁RNA-相關的蛋白a,p和Y的基因,和l個CpG島,完整序列164染色體6p21.2-21.3上的來自克隆RP3-340B19的人DNA序列含有桶狀蛋白1的TULP1基因,l個新基因,核糖體蛋白S15A(RPS15A)和L36(RPL36)假基因,F(xiàn)K506結合蛋白5(FKBP51)的FKBP5基因的3'末端和兩個CpG島,完整序列165人類cDNAFLJ30638fis,克隆CTONG2002721,輕微類似于空泡蛋白分選有關的蛋白VPS13166人類細胞色素P450,家族26,亞家族B,多肽1(CYP26B1),mRNA167來自4的人類BAC克隆RP11-678H22,完整序列168人類染色體ll,克隆RP13-25N22,完整序列169染色體20ql2-13.12上的來自克隆RP1-172H20的人DNA序列含有皮膚-衍生的蛋白酶抑制劑3(SKALP)的PI3基因,精液凝固蛋白I的SEMG1基因,精液凝固蛋白II的SEMG2基因,完整序列170人類半胱氨酸蛋白酶抑制劑9-樣(小鼠),mRNA(cDNA克隆MGC:34724IMAGE:5163974),完整cds171NA172人類dystonin(DST),轉錄物變體leA,mRNA173人類(人)B細胞(Ramos細胞系)Cot25-標準化的全長cDNA克隆CS0DL009YM2067174含有人類視紫紅質抑制蛋白結構域的2,轉錄物變體l,mRNA(cDNA克隆MGC:26574IMAGE:4817429),完整cds175人類cDNAFLJ14958fis,克隆PLACE4000052,高度類似于人類ATP盒結合運栽體1(ABCl)mRNA176含有人類鋅指和BTB結構域的16,轉錄物變體2,mRNA(cDNA克隆MGC:24卯8IMAGE:4944546),完整cds177人類染色體9開放讀碼框72,mRNA(cDNA克隆MGC:86985IMAGE:5298741),完整cds178人類絲裂原-激活的蛋白激酶激酶激酶15(MAP3K15),mRNA179人類喉癌有關的蛋白1mRNA,完整cds180人類tetratricopeptide重復序列結構域25,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4831078),完整cds181層粘連蛋白a2亞基前體變體蛋白的人類mRNA182人類蛋白磷酸酶2C,鎂-依賴性的,催化亞基,mRNA(cDNA克隆IMAGE:6158636),部分cds183來自2的人類BAC克隆RP11-48409,完整序列184NA185人類asporin(LRR類1)(ASPN),mRNA186人類克隆DNA34392ASPN(UNQ215)mRNA,完整cds187染色體9上的來自克隆RP11-386J22的人DNA序列含有染色體5-樣1(酵母)(SMC5,KIAA0594)的SMC5結構維護的SMC5L1基因,基礎轉錄元件結合蛋白1(BTEB,KLF9)的BTEB1基因和3個CpG島,完整序列188人類溶質載體家族27(脂肪酸運載體),成員6(SLC27A6),轉錄物變體2,mRNA189人類染色體3克隆RP11-189A1,完整序列190人類脫氫酶/還原酶(SDR家族)成員9(DHRS9),轉錄物變體2,mRNA191人類截短的表皮生長因子(P-尿抑胃素)(EGF)基因,完整cds192人類cDNA克隆MGC:88772IMAGE:4765168,完整cds193來自Y的人類PAC克隆RP1-85D24,完整序列194人類互補序列組分1,q亞組分,(3多肽,mRNA(cDNA克隆MGC:17227IMAGE:4212848),完整cds195人類染色體3克隆RP11-944L7,完整序列196人類SH3結構域蛋白D19(SH3D19),mRNA197人類mRNA;cDNADKFZp686E15208(來自克隆DKFZp686E15208)198食蟹猴mRNA,克隆QnpA-12979:類似于人類神經(jīng)上皮細胞轉化基因1(NET1),mRNA,醒—005863.2199染色體20pll.21-ll.23上的來自克隆RP5-1025A1的人DNA序列含有乙酰-輔酶A合成酶(AMP形成)-樣的ACAS2L基因的5'部分,視覺系統(tǒng)同源框1(斑馬魚)同源物(CHXIO-樣)的VSX1基因,變體Ll和SI和4個CpG島,完整序列200人類染色體ll,克隆RP11-68C8,完整序列201人類生育酚(a)轉移蛋白(維生素E缺乏的共濟失調(Friedreich-樣)),mRNA(cDNA克隆IMAGE:4593015),部分cds202人類cDNAFLJ32190fis,克隆PLACE6002102203人類CCBL1基因,最后兩個外顯子204人類半胱氨酸綴合物-(3裂合酶;胞質的(谷氨酰胺轉氨酶K,kyneurenine氨基轉移酶)(CCBL1),mRNA205在髓樣細胞2(TREM2)上表達的人類觸發(fā)受體,mRNA206人類染色體21開放讀碼框24同種型7(C21orf24)mRNA,完整cds207人類mRNA;cDNADKFZp779B086(來自克隆DKFZp779B086)208染色體9上的來自克隆RP11-386J22的人DNA序列含有染色體5-樣1(酵母)(SMC5,KIAA0594)的SMC5結構維護的SMC5L1基因,基礎轉錄元件結合蛋白1(BTEB,KLF9)的BTEB1基因和3個CpG島,完整序列209來自4的人類BAC克隆RP11-642E20,完整序列210人類含有亮氨酸富集重復序列的47(LRRC47),mRNA211人類翻譯起始因子2(MTIF2)基因,外顯子6-9;線粒體產物的核基因212人類胰島素受體,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4823710),部分cds213人類環(huán)指蛋白150(RNF150),mRNA214人類染色體5克隆CTC-361G14,完整序列215人類基質金屬肽酶2(明膠酶A,72kDa明膠酶,72kDaIV型膠原酶),mRNA(cDNA克隆MGC:2313IMAGE:3161383),完整cds216人類Zic家族成員3heterotaxy1(奇數(shù)配對的同源物,果蠅)(ZIC3),mRNA217來自2的人類BAC克隆RP11-395A12,完整序列218人類基因組DNA,染色體18克隆:RP11-815J4,完整序列219在轉移性前列腺癌mRNA中增量調節(jié)的人類蛋白,完整cds220人類Kmppel-樣因子5(腸的),mRNA(cDNA克隆MGC:52153IMAGE:5454169),完整cds221人類(人)HeLa細胞Cot25-標準化的全長cDNA克隆CS0DK004YO15222人類千擾素有關的發(fā)育調節(jié)劑l(IFRDl),轉錄物變體l,mRNA223人類(人)HeLa細胞Cot25-標準化的全長cDNA克隆CS0DK0I0YA19224人類僅同源結構域的蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:20820IMAGE:4335211),完整cds225染色體9上的來自克隆RP11-27J8的人DNA序列含有千擾素k前體(IFNK)的基因,l個新基因(FLJ13204)的5,UTR,l個新基因,包括FLJ25077和FLJ11109(MGC23980)和2CpG島,完整序列226人類凝固因子1I受體-樣2(F2RL2)基因,完整cds227染色體20ql2上的來自克隆RP4-753D4的人DNA序列含有蛋白酪氨酸磷酸酶受體T型的PTPRT基因的一部分和1個新基因,完整序列228來自人類(人)染色體14的文庫RPCI-ll的人染色體14DNA序列BACR-131H24,完整序列229人類半胱氨酸綴合物-p裂合酶;胞質的(谷氨酰胺轉氨酶K,kyneurenine氨基轉移酶)(CCBIJ),mRNA230NA231人類a-2-巨球蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:47683IMAGE:6056126),完整cds232人類磷脂轉移蛋白,轉錄物變體l,mRNA(cDNA克隆MGC:30183IMAGE:4992839),完整cds233人類WD重復序列結構域66(WDR66),mRNA234丙氨酸乙醛酸氨基轉移酶2同源物1的人類mRNA,剪接形式1(AGXT2L1基因)235人類免疫球蛋白a2m(l)重鏈恒定區(qū)基因,部分cds236NA237來自2的人類BAC克隆RP11-348G16,完整序列238人類erbb2相互作用蛋白(ERBB2IP),轉錄物變體2,mRNA239丙氨酸乙醛酸氨基轉移酶2同源物1的人類mRNA,剪接形式1(AGXT2L1基因)240人類磷脂酶C,54(PLCD4),mRNA241人類cDNAFLJ39109fis,克隆NTONG2005137,高度類似于[丙酮酸脫氫酶(硫辛酰胺)]激酶同工酶4,線粒體前體(EC2.7.1.99)242人類mRNA;cDNADKFZp586M2121(來自克隆DKFZp586M2121)243染色體6上的來自克隆RP11-98I9的人DNA序列含有六異戊二烯基二羥基苯曱酸酯曱基轉移酶的基因,線粒體前體(COQ3),SR富集的蛋白的基因(FU14992),泛素特異性的蛋白酶45的USP45基因,類似于泛素羧基末端水解酶16(EC3丄2.15)的l個新蛋白的基因的3'末端和兩個CpG島,完整序列244缺氧-可誘導的因子-3a的人類HIF-3AmRNA,完整cds245來自7的人類BAC克隆CTB-118E13,完整序列246染色體9q22.1-22.33上的來自克隆RPl1-43505的人DNA序列含有修補同源物的PTCH基因,l個新基因,類似于金屬硫蛋白蛋白(MT1)的1個新蛋白的基因和3個CpG島,完整序列247人類mRNA;cDNADKFZp31312220(來自克隆DKFZp31312220);完整cds248人類WNK賴氨酸缺陷的蛋白激酶3(WNK3),轉錄物變體1,mRNA249人類免疫球蛋白a2m(l)重鏈恒定區(qū)基因,部分cds70250食蟹猴睪丸cDNA克隆:QtsA-11169,類似于人假定蛋白C9orf93,mRNA,NM—173550.1251食蟹猴腦cDNA,克隆QflA-10289,類似于人TU3A蛋白(TU3A),mRNA,RefSeq:NM—007177.1252人類中心體和紡錘極有關的蛋白1(CSPP1),mRNA253人類骨調控蛋白(OMD),mRNA254人類12BACRP11-424C20(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列255具有序列相似性59的人類家族,成員A(FAM59A),mRNA256人類ps20WAP-型4-二石克化物核心結構域蛋白mRNA,完整cds257人類染色體5克隆CTC-428111,完整序列258人類染色體5克隆CTC-229P9,完整序列259人類染色體8,克隆RP13-895A16,完整序列260來自人類(人)的染色體14的文庫RPCI-ll的人染色體14DNA序列BACR-442G21,完整序列261人類肺I型細胞膜-相關的蛋白hTla-2(hTla-2)mRNA,完整cds262NA263染色體13上的來自克隆RP11-90M2的人DNA序列含有基因FU10956,HSPC126蛋白(DRIP36)的基因,1個類似于聚合酶(RNA)II(DNA指導的)多肽K的新基因,7.0kDa(POLR2K),1個新基因和兩個CpG島,完整序列264人類ATP酶,H+運輸,溶酶體42kDa,VI亞基C同種型2(ATP6V1C2),mRNA265人類氨肽酶噤呤霉素敏感的(NPEPPS),mRNA266預測的人類,類似于dJ22117.2(具有EGF-樣和層粘連蛋白G結構域的新蛋白)(LOC442228),mRNA267人類染色體5克隆CTC-575N7,完整序列268來自4的人類BAC克隆RP11-308K2,完整序列269人類染色體5克隆RP11-270H9,完整序列270ADMLX—,定的粘附分子[人,mRNA,4121核普酸,2的區(qū)段2]271含有人類巻曲螺旋結構域的18,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4686590),部分cds272人類,克隆RP11-44B13,完整序列273食蟹猴睪丸cDNA克隆QtsA-14119,類似于人脂質1(LPIN1),mRNA,RefSeq:NM—145693.1274牛植烷酰-輔酶A鞋化酶[人雷夫敘姆病],mRNA(cDNA克隆MGC:127428IMAGE:7949271),完整cds275染色體20pl2.1-13上的來自克隆RP5-859D4的人DNA序列含有骨形態(tài)形成蛋白2的BMP2基因,1個新基因和1個CpG島,完整序列276染色體20pl2.1-13上的來自克隆RP5-859D4的人DNA序列含有骨形態(tài)形成蛋白2的71BMP2基因,1個新基因和1個CpG島,完整序列277染色體9上的來自克隆RP11-386J22的人DNA序列含有染色體5-樣1(酵母)(SMC5,KIAA0594)的SMC5結構維護的SMC5L1基因,基礎轉錄元件結合蛋白1(BTEB,KLF9)的BTEB1基因和3個CpG島,完整序列278人類染色體6開放讀碼框81(C6orf81),mRNA279染色體10上的來自克隆RP11-401F24的人DNA序列含有基因FLJ20909,1個新蛋白(MGC35403)的基因,1個新基因(LOC219731),無義轉錄物同源物(酵母)(FLJ38872)的UPF2調節(jié)劑的UPF2基因的3'末端和4個CpG島,完整序列280人類凝固因子II受體-樣2(F2RL2)基因,完整cds281人類WD重復序列結構域66,mRNA(cDNA克隆MGC:33630IMAGE:4826893),完整cds282食蟹猴睪丸cDNA,克隆QtsA-18294,類似于人千擾素有關的發(fā)育調節(jié)劑1(IFRDl),mRNA,RefSeq:NM—001550.1283預測的人類鋅指蛋白283(ZNF283),mRNA284染色體6上的來自克隆RPl-238023的人DNA序列含有1個新基因的一部分,在髓樣細胞2(TREM2)上表達的觸發(fā)受體的基因,l個新基因,l個新基因的一部分,1個類似于可溶的腺苷酸環(huán)化酶(SAC)的假基因,完整序列285人類(人)HeLa細胞Cot25-標準化的全長cDNA克隆CS0DK009YI05286人類半胱氨酸綴合物-(3裂合酶;胞質的(谷氨酰胺轉氨酶K,kyneurenine氨基轉移酶)(CCBL1),mRNA287人類染色體3開放讀碼框14,mRNA(cDNA克隆MGC:22227IMAGE:4307022),完整cds288人類染色體15克隆CTD-2270N23map15q21,完整序列289人類mRNA;cDNADKFZp667H2312(來自克隆DKFZp667H2312)2卯含有人類纖連蛋白III型結構域的1(FNDC1),mRNA291人類染色體16克隆RP11-486L19,完整序列292來自2的人類BAC克隆RP11-178D14,完整序列293人類(人)成年腦的全長cDNA克隆CS0DN005YJ09294來自7的人類PAC克隆RP5-839024,完整序列295人類3BACRP11-364F11(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列實施例2測定不同物質或成分對犬細胞系中的基因表達的影響使用Affymetrix尤基因芯片犬-1和犬-2來測定不同測試物質或成分(例如MCTs;TAGs;ALA;EPA;DHA;亞油酸;硬脂酸(SA),綴合的72亞油酸(CLA),GLA;花生四烯酸;卵磷脂;維生素A,維生素D,維生素E,維生素K,核黃素,煙酸,維生素B6,泛酸,葉酸,生物素維生素C,兒茶素,槲皮素,茶黃素;泛醌;番茄紅素,番茄黃質;白藜蘆醇;a-^L辛酸;L-肉毒堿;D-檸檬烯;葡糖胺;S-腺苷基蛋氨酸;殼聚糖,含有這些化合物中的一種或多種的不同材料和它們的不同組合)對4個犬細胞系和適當對照中的基因表達的影響。每種成分測試兩個濃度,如對表6所示的選擇的樣品成分所解釋的。在兩個濃度中的高者的溶劑用作對照。使用4個犬細胞系CCL34(腎),CRL1430(胸腺),CCL183(骨)(從美國組織培養(yǎng)物中心得到)和CTAC(甲狀腺)(參見,從犬外周淋巴細胞純化的效應纟田胞中NK活性的測量,VeterinaryImmunologyandImmunopathology,35(1993)239-251)。用特定濃度的成分處理過的細胞系稱作"處理",未處理的樣品稱作"對照"。詞語"基因"和"探針"在該方法中同義地使用。使用與Affymetrix芯片一起提供的說明書,測量處理細胞系和對照的基因表達。對于任意給定的處理,基因表達數(shù)據(jù)測得為"增量"或"減量"調節(jié)。基因被"增量"或"減量"的確定是基于倍數(shù)變化,后者計算為每個單個探針的治療強度/對照強度。如果它的值<1/1.5(對于跨所有4個細胞系的分析)或<1/2(對于細胞系內的分析),認為倍數(shù)變化是減量調節(jié)的;如果它>1.5(對于跨所有4個細胞系的分析)或>2(對于細胞系內的分析),則被增量調節(jié)。另外,如果發(fā)現(xiàn)(call)它僅存在于比較的條件(處理或對照)之一中,且在另一個中"缺少,,或"是邊緣的",且倍數(shù)變化根據(jù)使用的軟件是顯著的,認為探針對于進一步詳察是顯著的。從進一步分析中排除在兩個處理中表現(xiàn)得以相反反向調節(jié)的探針。使用GeneSpring7.0版(GS)軟件(AgilentCorporation)分析原始數(shù)據(jù),并使用R-Bioconductor(RB)免費軟件驗證。兩個軟件包用于計算來自從Affymetrix儀器產生的CEL文件的探針強度。分別使用R-Bioconductor和GeneSpring軟件,計算每個探針的存在/缺少/邊緣調用和P值。兩個方案用于數(shù)據(jù)分析。首先,"跨細胞系"和"在單個細胞系內"。在第一個方案中,選擇基因用于評分,條件是,發(fā)現(xiàn)它們在所有細胞系之間是顯著的和共同的。"跨細胞系"會產生具有最小噪音的最高置信度數(shù)據(jù),并可以提供關于哪個基因受單個成分影響的最佳可能線索。在第二個方案中,僅僅對根據(jù)兩個軟件包在單個細胞系的兩個處理中表現(xiàn)出顯著倍數(shù)變化的那些基因評分。從這些實驗得到的數(shù)據(jù)的樣品如表7所示。表7顯示了處理物質(列1)、探針(數(shù)據(jù)連接)(歹'J2)、方向(列3)、最佳BLAST注解(統(tǒng)計地測定)(歹'J4)、和人登錄號(歹'J5)之間的關聯(lián)。測試的所有成分的信息儲存在數(shù)據(jù)庫中用于參考?;谌纳項l件(診斷為胖)和來自表1-7的信息的比較,即注意受測試物質或成分的影響、且與瘦犬相比還在胖犬中差別表達的基因,認為可用于選擇和制備胖犬的食物組合物的營養(yǎng)配方含有一種或多種下述量的下述成分(按每天每千克體重的毫克數(shù)(mg/kg/天)計算的體內量)是基于從體外使用的量的外推,例如DHA-約1至約30;EPA-約1至約30;EPA/DHACombo(1.5:1比例)-約4/2至約30/45;ALA-約10至約100;LA-約30至約600;ARA-約5至約50;和SA-約3至約60?;谶@些數(shù)據(jù),可以制備含有一種或多種這樣的成分的食物組合物和有關的飲食,并用于調節(jié)與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因。這樣的調節(jié)會造成動物脂肪組織的量的調控,因此,在一個實施方案中,促進向希望的或正常的(更瘦)狀態(tài)的轉移,并促進動物的更好的健康和幸福。表6:在犬細胞系中測試的成分、物質DHAEPAEPA/DHACombo1.5:1比例(象在魚油中)a亞麻酸亞油酸花生四灘酸硬脂酸綴合的亞油酸濃度10.005mg/ml(5微克/ml)0.005mg/ml(5孩i克/ml)0.015mg/mlEPA&0.010mg/mlDHA(共計0.025mg/ml)0.05mg/ml(50微克/ml)0.1mg/ml(100微克/ml)0.025mg/ml(25孩i克/ml)0.01mg/ml(10微克/ml)0.02mg/ml(20孩吏克/ml)濃度20.025mg/ml(25微克/ml)0.025mg/ml(25微克/ml)0.030mg/mlEPA&0.02mg/mlDHA(共計0.050mg/ml)0.1mg/ml(100孩i克/ml)0.5mg/ml(500微克/ml)0.05mg/ml(50微克/ml)0.05mg/ml(50微克/ml)0.1mg/ml(100微克/ml)溶劑ETOHETOHETOHETOHETOHETOHETOHMEOH表7:在有列出的成分存在下來自犬細胞系的表達譜結果且12345DHA1582387_at減量家犬I型碘化曱狀腺氨酸脫珙酶(dioAC027016l)mRNA,完整cdsDHA1582824—at增量預測的家犬肉毒堿棕櫚酰轉移酶BC000185I同種型(CPT1),mRNADHA1584133—at增量預測的家犬,類似于動力蛋白,BC038344胞質的,重多肽2(LOC479461),mRNA74DHA1584742atDHA1584951atDHA1585355atDHADHA1586474—at1587029atDHA1587141at增量DHADHA1587268—at1587328atDHA1587418atDHADHA1587734—at1588058atDHA1588088—atDHA1589548—atDHA1590835—atDHA1591083—atDHA1591971—atDHA1592507at增量染色體9上的來自克隆AL591206RP11-151J10的人DNA序列含有1個新基因(FLJ20060)(含有FLJ12卯2,KIAA1574)的5,末端,脂肪分化有關的蛋白(ADRP)的ADFP基因增量預測的家犬,類似于親脂素CR605429(Adipophilin,脂肪分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA增量預測的家犬,類似于AdipophilinCR597463(脂肪分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA減量小鼠RIKENcDNA1500031L02基AC078834因(150003lL02Rik),mRNA增量人類12BACRP11-545P7(RoswellAC089999Park癌癥研究所人BAC文庫)完整序列預測的家犬,類似于SEC14-樣蛋CR456571白2(a-生育酚有關的蛋白)(TAP)(hTAP)(上清蛋白因子)(SPF)(鯊雄轉移蛋白)(LOC477539),mRNA增量家犬尿酸鹽氧化酶(UOX)mRNA,NA完整cds增量人類mRNA;cDNAAP001324DKFZp68601232(來自克隆DKFZp68601232)減量預測的家犬,類似于RPGR-相互AJ417060作用蛋白1同種型b(LOC475400),mRNA增量預測的家犬,類似于Na/Pi協(xié)同BC017952轉運蛋白4(LOC478741),mRNA減量含有人類toll-白介素1受體(TIR)結BCO32474構域的接頭蛋白,mRNA(cDNA克隆MGC:40573IMAGE:5216171),完整cds增量人類缺氧-可誘導的蛋白2,mRNABC008573(cDNA克隆MGC:17005IMAGE:4182067),完整cds減量小鼠染色體14克隆RP24-304G19,AC115282完整序列減量人類白介素8受體,(3假基因,AC055863mRNA(cDNA克隆IMAGE:5450999),具有表觀的受限的內含子增量人類克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds增量預測的家犬,類似于互補序列ClsAKO55183(LOC486714),mRNA減量人類強啡肽原(PDYN),mRNABC02633475DHA1593226-—at增量DHA1593388_at減量DHA15935卯—_at減量DHA1593831_at減量DHA1594976—畫at增量DHA1596448__at增量DHA1596711—_at減量DHA1597677——at增量DHA1597789_—at增量DHA1597832—_at減量DHA1598607—at減量DHA1598932_匿at減量DHA1599339—at減量DHA1599453——at減量DHA1600090—at增量DHA1601347—_at減量DHA1602156一at增量DHA16027卯__at增量DHA1602966——at減量DHA1603771—_at減量DHA1604372——at增量染色體9上的來自克隆AL358074RP11-423C15的人DNA序列含有絲裂原-激活的蛋白激酶有關的蛋白1的MAPKAP1基因的5'末端,1個新基因,PBX3基因f的5'末端預測的家犬,類似于含有SDA1BC063797結構域的1(LOC478431),mRNA人類淋巴細胞接頭蛋白,mRNAAB208911(cDNA克隆IMAGE:4861744),完整cds預測的家犬,類似于網(wǎng)才各蛋白重BC015854鏈1(CLH-17)(LOC480578),mRNA預測的牛,類似于谷氨酸受體,ALO35698metabo加pic1(LOC540485),mRNA預測的家犬,類似于精子有關的AK095036抗原16(LOC478899),mRNA人類cDNA:FLJ21199fis,克隆AK024852COL00235人類,克隆IMAGE:5271096,mRNAAC012516人類12BACRP11-337L12(RoswellAC130404Park癌癥研究所人BAC文i)完整序列人類假定蛋白LOC92558NM—207311(LOC92558),mRNA預測的家犬,類似于含有硫氧還AC099518蛋白結構域的蛋白6(硫氧還蛋白-樣蛋白2)(Txl-2)(LOC485685),mRNA預測的家犬,類似于AL354836SAP90/PSD-95有關的蛋白2(LOC488556),mRNA家犬克隆RP81-117B1,完整序列NA預測的家犬LOC475099NA(LOC475099),mRNA預測的家犬,類似于SEC22囊泡AY405366運輸?shù)鞍?樣2(LOC478590),mRNA漢森德巴利酵母CBS767,NADEHA0D14146g預測的mRNAmKIAA4184蛋白的小鼠mRNAAL590139人類芳烴受體核轉位分子(ARNT)AC115282基因,完整cds來自連鎖群21中的克隆ALWOWlDKEYP-75A7的斑馬魚DNA序列,完整序列家犬克隆RP81-117B1,完整序列NA預測的家犬LOC475665AY411810(LOC475665),mRNADHA1605486at增量EPA1583329—at減量EPA1583403at增量EPA1584742at增量EPA1584951—at增量EPA1585292—at增量EPA1585355—at增量EPA1586420—at減量EPA1587196—at增量EPA1587428—at減量EPA1588088—at增量EPA1589797—at減量EPA1589829—s—at減量EPA1590407—s—at增量EPA1591083—at增量EPA1592920—at減量EPA1593146—s—at增量EPA1593677—at減量EPA1594091—at減量EPA1594227at增量人類丙酮酸脫氫酶激酶4mRNA,3,AK096428非翻譯區(qū),部分序列人類,,類似于分泌的蜷曲有關的蛋AC018634白4,克隆IMAGE:4828181,mRNA野豬肉毒堿棕櫚酰轉移酶ImRNA,AK172798編碼線粒體蛋白的核基因,完整cds染色體9上的來自克隆AL591206RP11-151J10的人DNA序列含有1個新基因(FLJ20060)(含有FLJI2卯2,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有關的蛋白(ADRP)的ADFP基因預測的家犬,類似于親脂素(脂肪CR605429分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA人類曱基CpG結合蛋白2(Rett綜合AF030876征)(MECP2),mRNA預測的家犬,類似于親脂素(脂肪CR597463分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA人類RAB37,成員RAS癌基因家BC016615族(RAB37),mRNA預測的家犬LOC475684NM—147223(LOC475684),mRNA染色體6上的來自克隆AL589740RP11-436D23的人DNA序列含有1個新基因的一部分,完整序列人類缺氧-可誘導的蛋白2,mRNABC008573(cDNA克隆MGC:17005IMAGE:4182067),完整cds人類染色體15克隆RP1卜344A16AC0卯651map15q21.3,完整序列預測的牛,類似于ATP-依賴性的AC004486DNA螺旋酶Q4(RecQ蛋白-樣4)(RecQ4)(L0C515289),部分mRNA人類整聯(lián)蛋白-連接的激酶1(ILK)AJ404847基因,完整cds人類克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds人類12BACRP11-407P2(RoswellAC090013Park癌癥研究所人BAC文庫)完整序列人類Kruppel-樣因子11(KLF11),BC063286mRNA預測的家犬,類似于假定蛋白AB070003(LOC475308),mRNA預測的家犬,類似于FLJ23129蛋NM_024763白同種型1(LOC479538),mRNA人類RNA結合基序蛋白,X-連接的AK096015EPA1594231—at增量EPA1594415—at減量EPA1594824—at減量EPA1594939—at增量EPA1595021—at減量EPA1595265—at增量EPA1595301_at增量EPA1596553—s—at減量EPA1597390_at減量EPA1597801—at減量EPA1597802—at減量EPA1598585—at減量EPAEPAEPAEPAEPAEPAEPAEPA1599557at減量1599565—at減量1599601s—at減量1600959—at增量1601005—at減量1602471at減量1603225—at增量1603875—at減量EPA1604439—at減量EPA1604600—at減量(RBMX),mRNA野豬肽酰-脯氨酰順反式異構酶ANA(PPIA),mRNA預測的牛,類似于GTP酶,IMAPAP001675家族成員4(免疫-相關的蛋白4)(免疫-相關的核苦酸1蛋白)(hIANl)(MSTP062)(LOC510751),mRNA人類染色體16克隆CTA-233A7,AC130449完整序列人類染色體8,克隆RP11-813L8,AC090133完整序列氯化鈉協(xié)同轉運蛋白的牛mRNA,NM_000339部分YarrowialipolyticaCLIB99,NG—001333YALI0C20339g預測的mRNA骨骼肌豐富的蛋白的人mRNAACII3382人類染色體16開放讀碼框55AK056168(C16orf55),mRNA預測的家犬,類似于Ataxin-10(脊AY400068髓小腦共濟失調類型IO蛋白)(腦蛋白E46同源物)(LOC474467),mRNA人類,克隆IMAGE:4822875,mRNAAL442128來自12的小鼠BAC克隆AL078583RP23-451I11,完整序列人類S164基因,部分cds;PS1和AC011306假定蛋白基因,完整cds;和S171基因,部分cds預測的家犬,類似于假定蛋白AY414168MGC12103(LOC481489),mRNA染色體lpl3-14.3上的來自克隆AL139175RP4-615P17的人DNA序列,完整序列預測的家犬,類似于雄性增強的AY403773抗原-牛(LOC474906),mRNA預測的家犬,類似于IgA重^l恒NA定區(qū)(LOC480452),mRNA預測的家犬LOC47卯25XM—372592(LOC479025),mRNA人類cDNA克隆IMAGE:4797645,AC073120部分cds捻轉血矛線蟲小隨體Hcms51序列AC008429人類cDNAFU33460fis,克隆AC010092BRAMY2000653,高度類似于人類攪亂-樣激酶1(TLK1)mRNA人類mRNA;cDNAAL137346DKFZp761M0111(來自克隆DKFZp761M0111)人類mRNA;cDNADKFZp686K122AC01073378EPA1605028—at減量EPA1605486at增量EPA1605654at增量EPA1605669s—at增量DHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPA1582781—at增量1583031—at增量1583254—x—at減量1583403—at增量1584742at增量DHA/158495latEPA1585033—at1585339at1586172at1586287at1586614at1586695at1587254at1587413at增量減量減量1585355—at增量減量減量減量減量減量增量(來自克隆DKFZp686K122)家犬分泌的B7-l蛋白(CD80)基因,NA或者剪接的外顯子4和完整cds人類丙酮酸脫氫酶激酶4mRNA,3'AK096428非翻譯區(qū),部分序列含有小鼠mbt結構域的1,mRNAAK028503(cDNA克隆MGC:2卯00IMAGE:2646754),完整cds人類cDNAFLJ38323fis,克隆AK095642FCBBF3024623,輕微類似于人類C2H2(Kruppel-型)鋅指蛋白mRNA家犬L-型Ca通道a1亞基mRNA,AF465484部分cds家犬成纖維細胞生長因子-8NM_006119(FGF陽8)mRNA,部分cds??寺?1^八0£:7961516胸腺素0-4-X02493樣mRNA,完整cds野豬肉毒堿椋櫚酰轉移酶ImRNA,AKl72798編碼線粒體蛋白的核基因,完整cds染色體9上的來自克隆AL591206RP11-151J10的人DNA序列含有1個新基因(FU20060)(含有FLJ12902,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有關的蛋白(ADRP)的ADFP基因預測的家犬,類似于親脂素(脂肪CRM5429分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA預測的家犬,類似于KIAA2025AL121983蛋白(LOC480065),mRNAUDP-GalNAc:pGlcNAc(31,3-氨基AL672237半乳糖基轉移酶的人類mRNA,多肽2變體蛋白預測的家犬,類似于親脂素(脂肪CR597463分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA人類染色體11,克隆RP11-348A11,AC131263完整序列轉錄因子COUP-TFI的牛mRNAAC106818(COUP-TFI基因)預測的家犬,類似于F-框蛋白BC037320SEL10(LOC475465),mRNA人類RAD51-樣1(釀酒酵母)BX161515(RAD51L1),轉錄物變體2,mRNA預測的家犬雙面激酶1(JAK1),AC008785mRNAAC005996醫(yī)蛭中間絲gliarinmRNA,完整cdsDHA/1587813—s—at增量EPA—DHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPA1589293—at1589678_s—at1589929—at1590942—at1591029—at1591083—at1591601at1591782—at1592123—at1592160—at1592915—s—at1593146—s—at1593855—at1593993—at1594205at減量增量減量減量增量增量減量增量減量減量增量增量減量減量增量DHA/1594291—s—at減量EPA1594379—x—at增量1594413—at增量1594564—at增量1594848—at增量預測的黑猩猩,類似于dJ109F14.3AL160175(新穎的推定的環(huán)指蛋白)(LOC472236),mRNAKIAA1804蛋白的人類mRNA,部AB058707分cdsBK001411人類克隆almRNA序列人類溶質載體家族34(磷酸鈉),成AC145098員1,mRNA(cDNA克隆IMAGE:5182821),具有表觀的受限的內含子人神經(jīng)生長因子-2樣蛋白(NTN2L)AC106820基因,完整cds預測的人類KIAA0146蛋白AC023991(KIAA0146),mRNA人類克隆DNA22780NL2ACO10323(UNQ171)mRNA,完整cds染色體9上的來自克隆RP11-787B4AL691426的人DNA序列含有妊娠-相關的血漿蛋白A的PAPPA基因的5'末端,1個新基因和1個CpG島,完整序列預測的牛,類似于假定蛋白AC069335(LOC514986),部分mRNA預測的家犬,類似于波形蛋白AY891766(LOC477991),mRNA預測的家犬,類似于纖維蛋白原BC070246a/a-E鏈前體(LOC475473),mRNA預測的家犬,類似于假定蛋白BC004501MGC33867(LOC478228),mRNA人類Kmppel-樣因子ll(KLFll),BC063286mRNAAL353710貓克隆RP86-117J4,完整序列來自7的黑猩猩BAC克隆AC004949RP43-75I2,完整序列預測的黑猩猩,類似于推定的轉DQ048939錄因子ZNF131(LOC461893),mRNA預測的家犬,類似于曱基巴豆酰-BC014897輔酶A羧化酶2(J3)(LOC47謂l),mRNA貓生長阻止和DNA損傷-可誘導AL136120的蛋白45(GADD45),mRNA人類細胞色素P450,家族26,亞家AC007002族B,多肽1(CYP26B1),mRNA人類絲氨酸棕櫚酰轉移酶,亞基IIAF111168基因,完整cds;和未知基因預測的黑猩猩假定蛋白AC073263XP一513164(LOC456583),mRNA80DHA/1596238—atEPADHA/1594939—at增量人類染色體8,克隆RP11-813L8,AC0卯133EPA完整序列DHA/1595083—at減量預測的家犬,類似于假定蛋白AK055530EPAMGC18257(LOC474943),mRNADHA/1595280—at減量人類mRNA;cDNAAL355298EPADKFZp686N1929(來自克隆DKFZp686N1929)DHA/1595481—at減量預測的家犬LOC478639NM—002492EPA(LOC478639),mRNADHA/1595587—at減量預測的家犬,類似于copineVIIIBC048260EPA(LOC477646),mRNADHA/1595673—at減量預測的家犬,類似于含有SDA1BC048351EPA結構域的1(LOC478431),mRNADHA/1596041—at減量人類mRNA;cDNAAL354707EPADKFZp686115205(來自克隆DKFZp686115205)增量預測的家犬,類似于棕櫚酰-蛋白AL110128硫酯酶2同種型a前體(LOC474856),mRNADHA/1596301—at減量染色體4上的來自克隆RP23-440D4AC000007EPA的小鼠DNA序列,完整序列DHA/1597387—at增量預測的家犬,類似于a-N-乙?;鵅C032398EPA葡萄糖胺酶前體(N-乙?;?a-葡萄糖胺酶)(NAG)(LOC490965),mRNADHA/1597847—at增量預測的原雞,類似于泛素特異性AC098935EPA的蛋白酶37(LOC424217),mRNADHA/1599572—at減量預測的家犬,類似于ORF2NAEPA(LOC475183),mRNADHA/1599950—at減量預測的家犬,類似于雄性增強的AL136304EPA抗原-牛(LOC474906),mRNADHA/1600310—at減量預測的家犬,類似于piggyBac轉AK223"6EPA座因子衍生的1(LOC488322),mRNADHA/1600683—at減量NAEPA家犬克隆RP81-391L22,完整序列DHA/1601351—at增量NAEPA家犬,克隆XX-25A1,完整序列DHA/1601383—at增量預測的家犬,類似于推定的GTP-BT007509EPA結合蛋白RAY-樣(Rab-樣蛋白4)(LOC474517),mRNADHA/1601782—at減量人類內酰胺酶,|32,mRNA(cDNAAC022731EPA克隆IMAGE:3452575)DHA/1602033—at減量預測的牛,類似于G蛋白-偶聯(lián)的AL44M67EPA受體23(LOC539738),mRNADHA/1602162—at減量來自2的人類BAC克隆AC093850EPARP11-489P15,完整序列DHA/1603521—at減量人類cDNAFU33134fis,克隆BC017798EPAUMVEN2000453,輕樣i類似于小鼠胎兒珠蛋白誘導因子mRNA81DHA/1603534—at減量EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPADHA/EPAALA1603559—s_at減量1603658—s—at增量DHA/1603674—at減量EPA一1605317—at1605486—at1605832—at1605935—at1582455at減量增量減量減量減量ALA1584508—at減量ALA1584742at增量ALA1584951—at增量ALA1585266—at減量ALA1585355—at增量ALA1585515—at增量ALA1585553—at減量ALA1586185—at增量ALA587312—at增量ALA1587413—at增量ALA1587838—at減量預測的家犬,類似于蛋白酪氨酸AL592064磷酸酶,受體類型,Q同種型l前體(LOC482581),mRNA預測的家犬,類似于神經(jīng)活性有AY413卯5關的環(huán)指蛋白(LOC475470),mRNA人類mRNA;cDNADKFZp451E012AL834247(來自克隆DKFZp451E012);完整cds人類cDNAFLJ13648fis,克隆AK023710PLACE1011340,輕樣i類似于人類應3隱BmRNA人類染色體16克隆CTD-2337L2,AC093509完整序列人類丙酮酸脫氫酶激酶4mRNA,3'AK096428非翻譯區(qū),部分序列人類mRNA;cDNADKFZp451J152AK097112(來自克隆DKFZp451J152);完整cdsAK024964NFI-B蛋白的小鼠mRNA,完整cds家犬I型膠原前al(I)鏈(COLIAI)AB209597mRNA原,完整cds預測的黑猩猩LOC464838AK122763(LOC464838),mRNA染色體9上的來自克隆AL591206RP11-15U10的人DNA序列含有1個新基因(FU20060)(含有FLJI2卯2,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有關的蛋白(ADRP)的ADFP基因預測的家犬,類似于親脂素(脂肪CR605429分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA預測的家犬,類似于FLJ20859蛋BC005053白(LOC475396),mRNA預測的家犬,類似于親脂素(脂肪CR597463分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA預測的家犬LOC476210AF303134(LOC476210),mRNA預測的家犬,類似于結合腕蛋白BC032361-N(LOC4卯335),mRNA預測的家犬,類似于假定蛋白AC093611LOC90637(LOC480809),mRNA預測的家犬LOC491404ACI24862(LOC491404),mRNA醫(yī)蛭中間絲gliarinmRNA,完整cdsAC005996人類成纖維細胞生長因子13AL031386(FGF13),轉錄物變體1B,mRNA82ALA1588093_at減量ALA1588502—at減量ALA1589017—at增量ALA15%554—at增量ALA1591083—at增量ALA1591749—at增量ALA1592201—at增量ALA1593146—s—at增量ALA1593222—at增量ALA1593224—at增量ALA1593710—at增量ALA1593836—at增量ALA1595172—s—at增量ALA1595533—at增量ALA1595722—at增量ALA1595801—at增量ALA1596406—at增量ALA1599614—at增量ALA1600037_at減量ALA1600155—at增量ALA1600793at增量人類假定蛋白FLJ20507,mRNABC039892(cDNA克隆MGC:47628IMAGE:5725347),完整cdscAMP效應元件結合蛋白5同種型AB209262卩變體蛋白的人類mRNA微管-相關的蛋白2同種型2變體蛋AB209330白的人類mRNA預測的家犬,類似于ATP/GTP結AC025842合蛋白1(LOC479034),mRNA人類克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds家犬天然抗性有關的巨噬細胞蛋白AY400098(NRAMP1),mRNA來自Ghanagag蛋白(gag)基因的AL929410HIV-2菌林A1G1612,部分cds人類Krappel-林因子11(KLFll),BC063286mRNA染色體IO上的來自克隆AL139243RP11-439D8的人DNA序列含有1個新基因,Hermansky-Pudlak綜合征1的HPS1基因,類肝素酶2的HPSE2基因的3'末端和1個CpG烏,完整預測的家犬,類似于hemojuvelinAL138842同種型a(LOC475830),mRNA預測的牛,類似于谷胱甘肽還原AY338490酶(LOC506406),部分mRNA家犬克隆RP81-142A6,完整序列NA預測的家犬,類似于甘油醛-3-磷NA酸脫氫酶(LOC47卯78),mRNA染色體10上的來自克隆AL355315RP11-548K23的人DNA序列含有錨蛋白重復序列結構域2的ANKRD2基因(伸展響應肌肉),6個新基因,磷脂酰肌醇4-激酶的基因人類染色體17,克隆AC015920CTD-3022L24,完整序列人類cDNAFLJ34120fis,克隆AK091439FCBBF3009541猩猩mRNA;cDNADKFZp459C032AC023795(來自克隆DKFZp459C032)預測的家犬LOC477772AL365364(LOC477772),mRNA人類,克隆IMAGE:5294477,mRNAAC007163預測的家犬LOC479296AC011389(LOC479296),mRNA黑腹果蠅CG18408-PA,同種型AAL157781(CAP)mRNA,完整cdsALA1601394—x—at增量ALA1602423—at減量ALA1602589—at增量ALA1603636—at減量ALA1604861—at減量ALA1605047—at減量ALA1605187at增量ALA1605429—at減量ALA1605486at增量LA1582385—at減量LA1582824at增量LA1583273—s—at減量LA1584258at增量LA1584677—at減量LA1584742at增量LA1584951—at增量預測的家犬,類似于泛素-特異性AC022167的蛋白酶7同種型(LOC479854),mRNA預測的家犬,類似于千擾素調節(jié)AC078880因子2結合蛋白1(LOC484433),mRNAMustelavison酪氨酸氨基轉移酶基NA因,完整cds染色體20ql3.1-13.2上的來自克隆AL031674RP4-715N11的人DNA序列含有兩個推定的新基因,ESTs,STSs和GSSs,完整序列人類染色體5克隆CTB-53I9,完整AC008680序列染色體IO上的來自克隆AL713895RP11-10C13的人DNA序列含有曱狀腺激素受體相互作用物8(KIAA1380,DKFZp761F0118)的TRIP8基因的5'末端和1個新基因的3'末端(FLJ1染色體9上的來自克隆RP11-8N6的人DNA序列含有母系胚胎亮氨酸拉鏈激酶(KIAA0175)的MELK基因的3'末端,完整序列染色體1上的來自克隆RPll-45817的人DNA序列含有鋅指的ZA20D1基因的5'末端,含有A20結構域的1,核糖體蛋白L6(RPL6)假基因,VPS45A基因人類丙酮酸脫氫酶激酶4mRNA,3'非翻譯區(qū),部分序列家犬Na+-依賴性的谷氨酸運載體(GLAST),mRNA預測的家犬肉毒^s咸棕櫚酰轉移酶I同種型(CPT1),mRNA人類mRNA;cDNADKFZp761G179(來自克隆DKFZp761G179)人類calsyntenin2,mRNA(cDNA克隆IMAGE:4130487),部分cds預測的黑猩猩,類似于半胱氨酸蛋白酶抑制劑T(LOC469901),mRNA染色體9上的來自克隆RP11-151J10的人DNA序列含有1個新基因(FU20060)(含有FLJ12902,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有關的蛋白(ADRP)的ADFP基因預測的家犬,類似于親脂素(脂肪CR605429AL442063AL358073AK096428D26443BC000185BC008990BC007943BC02糊6AL591206LALA1585355at1585417at1585604at增量增量減量LA1585686_at增量LA1586295—at減量LA1588088—at增量LA1589569—at減量LA1591083at增量LA1592172at增量LA1594511—s—at增量LA1594801—at減量LA1594973—at增量LA1595021_at減量LA1595753—at減量LA1596117—at減量LA1600646—at減量LA1600703at增量LA1601942—at減量分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA預測的家犬,類似于親脂素(脂肪CR597463分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA小鼠微管有關的一氧化物酶,AC105754calponin和含有LIM結構域的3,mRNA(cDNA克隆IMAGE:30637988),部分cds染色體IO上的來自克隆AL121927RP11-175J10的人DNA序列含有轉化、含酸性巻曲螺旋的蛋白1(TACC1)假基因和線粒體NADH脫氫酶1(MTNDl)假基因預測的類似于冷-可誘導的CR625198RNA-結合蛋白(富含甘氨酸的RNA-結合蛋白CIRP)(A18hnRNP)(LOC507120),mRNA在卵巢癌1中減量調節(jié)的人類,BC027860mRNA(cDNA克隆MGC:34368IMAGE:5228947),完整cds人類缺氧-可誘導的蛋白2,mRNABC008573(cDNA克隆MGC:17005IMAGE:4182067),完整cds預測的家犬,類似于雄性精子細BC039825胞-相關的激酶(LOC478721),mRNA人類克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds來自7的人類BAC克隆AC004543CTB-17C20,完整序列人類RGM結構域家族,成員B,AK054622mRNA(cDNA克隆IMAGE:3852164)人類HMGIC融合伴侶-樣2AY309920(LHFPL2)mRNA,完整cds預測的家犬LOC478197AL031387(LOC478197),mRNA氯化鈉協(xié)同轉運蛋白的牛mRNA,NM一000339部分人類CrkRSmRNA,完整cdsCR954985小鼠piccolo(突觸前細胞基質蛋白)AP001266(Pclo),mRNA人類mRNA;cDNADKFZp547F213AC103736(來自克隆DKFZp547F213)預測的家犬,類似于未被苯并咪AC012391唑3同源物(LOC477857)抑制的出芽,mRNA預測的家犬,類似于具有序列相ACO2635885LA1603578—at減量LA1605486—at增量LA1605822—at減量ARA1582824—at增量ARA1582851—at增量ARA1582999—at減量ARA1583403—at增量ARA1584742—at增量抗原ARA1584951—at增量ARA1585355—at增量ARA1586047—s—at減量ARA1586172—at減量ARA1586185—at增量ARA1586281at增量ARA1587792—at增量ARA1588088—at增量ARA1588903—at增量似性20的家族,成員A(LOC480458),mRNA預測的家犬,類似于CD63(LOC474391),mRNA人類丙酮酸脫氫酶激酶4mRNA,3'非翻譯區(qū),部分序列人二肽酰氨肽酶樣蛋白mRNA,完整cds預測的家犬肉毒堿棕櫚酰轉移酶I同種型(CPT1),mRNA褐鼠細胞核受體亞家族l,組D,成員1,mRNA(cDNA克隆MGC:72288IMAGE:5598020),完整cds家犬細胞周期蛋白-依賴性的激酶抑制劑(WAFl)mRNA,部分cds野豬肉毒堿棕櫚酰轉移酶ImRNA,編碼線粒體蛋白的核基因,完整cds染色體9上的來自克隆RP11-151J10的人DNA序列含有1個新基因(FLJ20060)(含有FLJ12902,KIAA1574)的5'末端,脂肪分化有關的蛋白(ADRP)的ADFP基因預測的家犬,類似于親脂素分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA預測的家犬,類似于親脂素分化有關的蛋白)(ADRP)(LOC474720),mRNA染色體11上的來自克隆RP23-348N2的小鼠DNA序列含有蛋白磷酸酶3調節(jié)的亞基Ba同種型(鈣調神經(jīng)磷酸酶B,I型)的Ppp3rl基因的5'末端,核糖體蛋白人類染色體11,克隆RP11-348A11,完整序列預測的家犬,類似于假定蛋白LOC90637(LOC480809),mRNA預測的黑猩猩,類似于含有DEP結構域的蛋白5(LOC458777),mRNA預測的牛,類似于磷酸甘油酸激酶1(LOC533730),部分mRNA人類缺氧-可誘導的蛋白2,mRNA(cDNA克隆MGC:17005IMAGE:4182067),完整cds人類mRNA;cDNADKFZp68612148(來自克隆DKFZp68612148)CR609892AK096428M96859BC000185BC047875AY399342AK172798AL591206(脂肪CR605429(脂肪CR597463AL512655AC131263AC093611BX640828AL049589BC008573U3299686ARA1590656—at增量ARA1590755—at減量ARA1591083—at增量ARA1592286—s—at減量ARA1592610—at減量ARA1592947—at增量ARA1593146—s—at增量ARA1593254—at減量ARA1593907—s—at減量ARA1594108—at增量ARA1594939—at增量ARA1595334—at減量ARA1595495—s—at增量ARA1595956—at增量ARA1596476—at減量ARA1596787—at減量ARA1597116at增量ARA1598013—at增量ARA1598063at增量ARA1598902—at增量ARA1599787—at增量預測的家犬,類似于染色質clAY404349(LOC476640)的SWI/SNF有關的基質-相關的肌動蛋白-依賴性的調節(jié)劑,mRNA來自7的人類BAC克隆AC102953RP11-1246CI9,完整序列人類克隆DNA22780NL2AC010323(UNQ171)mRNA,完整cds人類克隆DNA77624SHATr/JAM3BC057284(UNQ859)mRNA,完整cds人類cDNA克隆IMAGE:4611512,BC071790部分cds人類假定蛋白FLJ11795AC016585(FLJ11795),mRNA人類Kruppel-樣因子ll(KLFll),BC063286mRNA預測的家犬,類似于6-磷酸果糖AL020"1-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶1(6PF-2-K/Fru-2,6-P2ASE肝同工酶)(LOC491903),mRNA預測的牛,類似于26S蛋白酶體ALO34553非-ATP酶調節(jié)的亞基10(26S蛋白酶體調節(jié)的亞基p28)(Gankyrin)(LOC535414),mRNA假定蛋白的原雞mRNA,克隆15klAC100847人類染色體8,克隆RP11-813L8,AC090133完整序列人類mRNA;cDNAAL031290DKFZp779M1134(來自克隆DKFZp779M1134)MustelavisonNADH脫氫酶亞基5NA(ND5)基因,完整cds;線粒體產物的線粒體基因預測的原雞,類似于KIAA1389AC025467蛋白(LOC421523),mRNA稻(日本品種-組)染色體11克隆Z84490OSJNBb0071K13,完整序列人類CASK相互作用蛋白2(CA皮AC100787月夫2),mRNA預測的家犬,類似于胞質的多腺BX538213苦酸化元件結合蛋白4(LOC479287),mRNA預測的家犬,類似于InaD-樣蛋白BC021135同種型1(LOC479550),mRNA預測的褐鼠,類似于proacrosin-AC112198結合蛋白(LOC500316),mRNA人類cDNA克隆IMAGE:3878708,BC009735部分cds人類,克隆IMAGE:4821877,AL03570387ARA1599851一atARA1601092—atARA1601561—atARA1601912—atARA1602749—atARA1603093—atARA1603151—atARA1603452—s—atARA1603454—atARA1603839—atARA1604372—atARA1604969—atARA1605486—atSACfa.10737.1.Al—atSACfa.10872.1.AlatSASACfa.12323.1.Al—atCfa.12533.1.AlatSACfa.12594.1.Al—atSACfa.12839.1.Al—atSACfa.l7.1.S1—s—atSACfa.17302.1.SIsatmRNA,邢分cds預測的原雞蜷曲-3(FZ-3),mRNAAC092040人類TRIAD1I型mRNA,完整cdsAF099149預測的家犬,類似于RIKENAL357374cDNA2010100012(LOC477215),mRNA小鼠表達的序列AW538196AL359494(AW538196),mRNA來自4的人類BAC克隆AC108866RP11-44D21,完整序列人類基因組DNA,染色體1lq克AP003083隆:RP11-179B7,完整序列褐鼠染色體20,主要組織相容性復AL033380合物,從40BACs,菌4朱BrownNorway(BN/ssNHsd)裝S己,RTln單倍型;區(qū)段7/11人類cDNA克隆IMAGE:4611044,AC006211部分cds類似于細胞色素c氧化酶亞基VIbAL158068的牛mRNA,部分cds,克隆ORCS10538預測的褐鼠轉錄因子EB(預測的)BX284687(Tcfeb—預測的),mRNA預測的家犬LOC475665AY411810(LOC475665),mRNA人類染色體17,克隆AC005332hRPK.147—L—13,完整序列人類丙酮&脫氫酶激酶4mRNA,3'AK096428非翻譯區(qū),部分序列預測的家犬,類似于HP1-BP74,AL663074轉錄物變體4(LOC478203),mRNA人類Kruppel-樣因子11,mRNACR591795(cDNA克隆MGC:71570IMAGE:30343877),完整cds預測的家犬,類似于血管生成素-ACOIO323樣4蛋白(LOC476724),mRNA預測的牛,類似于胰島素誘導的AC144438基因1同種型1(LOC511899),mRNA人類G蛋白-偶聯(lián)的受體17,mRNAAC096920(cDNA克隆MGC:35264IMAGE:5174146),完整cds預測的家犬,類似于nexilin同種AC103591型s(LOC490202),mRNA家犬器官陰離子運輸多肽ANM—134431(OATPA)mRNA,部分cds預測的家犬,類似于含有普列克NM—015549底物蛋白同源性結構域的,家族G,成員3(LOC611460),mRNA曰里曰里曰一里量旦里量旦里量量曰里量量量量量量量量量量量增增減減增增增減增減增減增減增增增增減增減SASASASASASASASASASASASASASASASASASACfa.17415.1.減量Sl—s—atCfa.l7931丄減量SI—s—atCfa.1854.1.A增量1—atCfa.18958.1.減量SIatCfa.19447.1.SI—atCfa.19635.1.SIat減量減量Cfa.19704.1.減量SI—atCfa.20892丄增量SIsatCfa.21023.1.增量SI—atCfa.2282.1.S增量1atCfa.394.1.Al增量—x—atCfa.431.1.Al增量—atCfa.431.2.Al增量—s—atCfa.5582.1.A減量1—atCfa.6339.1.A增量1—atCfa.6361.1.A減量1—atCfa.6482.1.A減量1—atCfa.6915.1.A減量1at預測的家犬,類似于調鈣素基因XM—088459啟動子區(qū)域有關的蛋白(LOC607434),mRNA預測的家犬,類似于vonNM—022834Willebrand因子A結構域有關的蛋白同種型1(LOC607112),mRNA人類脂肪酸去飽和酶1(FADS1),AP002380mRNA預測的家犬,類似于含有OCIABC003409結構域的1,轉錄物變體3(LOC475140),mRNA人類核纖層蛋白Bl(LMNB1),NM_005573mRNA假定蛋白的Lotuscomiculatusvar.AF165140japonicus基因,完整和部分cds,克隆:BAC259.12D-1預測的牛,類似于免疫有關的AC006276GTP酶家族,Ql(LOC616834),mRNA預測的家犬,類似于外切核苷三CR936765磷酸二磷酸水解酶6(NTPD酶6)(CD39抗原-樣2)(LOC485564),mRNA預測的家犬,類似于含有非-POUAL5卯762結構域的,八聚體-結合的,轉錄物變體11(LOC612773),mRNA預測的家犬,類似于[丙酮酸脫氫AK096428酶[硫辛酰胺]]激酶同工酶4,線粒體前體(丙酮酸脫氫酶激酶同種型4)(LOC482310),mRNA預測的家犬,類似于60S核糖體NM—000984蛋白L23a(LOC478212),mRNA預測的家犬,類似于親脂素(脂肪AL591206分化有關的蛋白)(ADRP),轉錄物變體4(LOC474720),mRNA預測的家犬,類似于親脂素(脂肪NM—001122分化有關的蛋白)(ADRP),轉錄物變體1(LOC474720),mRNA二重氧化酶2前體變體蛋白的人類AB209010mRNA預測的家犬,類似于親脂素(脂肪NM—001122分化有關的蛋白)(ADRP),轉錄物變體3(LOC474720),mRNA預測的家犬,類似于60S核糖體BX679664蛋白L17(L23),轉錄物變體4(LOC480221),mRNA預測的家犬假定蛋白LOC612422AL162191(LOC612422),mRNAAC073655人類12BACRP11-1105G289SACfa.7119.1.A減量1—s—atSACfa.743.2.Sl增量—a—atSACfa.7531.1.A增量1—atSACfa.7705.2.A減量1—s—atSACfa.79I.4.Al增量—atSACfa.9014.1.A減量1—atSACfa.9506.1.A增量1—atSACfa.9531.1.A減量1—atSACfa.9685.2.S增量1—a—atSACfa.9694.1.A減量1—atSACfaAffk.1102減量.l.Sl_atSACfaAffk.1296減量7.1.SI—atSACfaAffx.1359減量9.1.SI—atSACfaAffx.1447減量9.1.S1—atSACfaAffx.1459減量5.1.S1—s一atSACfaAffx.1520減量2.1.SIsatSACfaAffx.1630減量2.1.S1—x—atSACfaAffx.1649減量3.1.SIatSACfaAffx.1919增量(RoswellPark癌癥研究所人BAC文庫)完整序列預測的家犬,類似于coilinAC109357(LOC480564),mRNA預測的牛假定蛋白LOC614918BC001282(LOC614918),mRNA染色體ll上的來自克隆AC008732RP23-287B22的小鼠DNA序列含有1個CpG島,完整序列預測的家犬,類似于染色質-特異NM—007192性的轉錄延伸因子大亞基,轉錄物變體2(LOC612874),mRNA預測的家犬,類似于核糖體蛋白NM_000986L24,轉錄物變體2(LOC478547),mRNA小鼠SNF8,ESCRT-II復合物亞基,AC091133同源物(釀酒酵母),mRNA(cDNA克隆IMAGE:5372918)人類缺氧-可誘導的蛋白2(HIG2)AF144755mRNA,完整cds人類cyclophilin有關的蛋白mRNA,AC092041完整cds預測的家犬短的串聯(lián)的重復序列AL138960基因座PEZ20變體19(LOC476927),mRNA約氏瘧原蟲yoelii菌抹17XNL假定AL359317蛋白(PY00634)mRNA,部分cds預測的家犬,類似于RAB5B,成BC065298員RAS癌基因家族,轉錄物變體3(LOC474394),mRNA家犬隔離cOR5D23嗅覺感受器家AF399364族5亞家族D基因,部分cdsNicotianabenthamiana克隆6-272NA未知的mRNA預測的家犬,類似于蛋白AK223603KIAA0652(LOC483632),mRNA預測的家犬,類似于二?;视蚇M—201532激酶;(LOC611321),mRNA預測的家犬,類似于多配體聚糖-4AK222695前體(雙棲蛋白聚糖)(SYND4)(Ryudocan核心蛋白)(LOC485893),mRNA預測的家犬,類似于鋅指蛋白25AB169501(LOC611218),mRNA預測的牛,類似于磷脂酰肌醇4-AL079340激酶(3(Ptdlns4-激酶)(PI4K(3)(PI4K-卩)(NPIK)(PI4K92)(LOC613348),mRNA人類肌萎縮側索硬化2(青少年)NM_02091990SASASASASASASASASASASASASASASASASA7.1.SI—atCfaAffic.19206.1.SI—atCfaAffk.197.1.S1—s—atCfaAffx.20515丄S1satCfaAffx.2332O.l.Sl一atCfaAffx.23784丄Sl一s—atCfaAffe.23872.1.SIsatCfaAffx.25844丄Sl一atCfaAffx.2830l.l.Sl—s—atCfaAffx.2896.l.Slat減量減量增量CfaAffx.2118減量2.1.S1—s一atCfaAffic.2128減量0.1.SIatCfaAffk.2208減量2.1.S1—s—atCfaAffic.2256減量0.1.SIat減量減量增量CfaAffx.2404增量0.1.SIat增量增量減量CfaAffx.2985增量8.1.Sl_s—atCfaAffx.3314增量.1.S1—atCfaAffx.4425增量.l.Slat(ALS2),mRNA黃酮類化合物3,-羥化酶的IpomoeaBX647478nilMagenta基因,完整cds預測的家犬bZIP蛋白,轉錄物變NM—003204體1(LCR-F1),mRNA預測的家犬,類似于蛋白酪氨酸AL110210磷酸酶,非-受體類型23(LOC609220),mRNA預測的家犬,類似于CG4699-PA,BC098376同種型A,轉錄物變體4(LOC480489),mRNA預測的家犬,類似于絲裂原-激活BC035576的蛋白激酶激酶激酶14(NF-k(3-誘導的激酶)(絲氨酸/蘇氨酸-蛋白激酶NIK)(HsNIK)(LOC490926),mRNA預測的家犬,類似于含有鋅指XM—370654CCCH類型的12A(LOC489416),mRNA預測的家犬,類似于Cullin-5BC063306(CUL-5)(加壓素-激活的鈣-活動受體)(VACM-1)(LOC489422),mRNA預測的家犬,類似于RAD52BBC032114(LOC480794),mRNA預測的家犬,類似于醛脫氫酶4A1BC023600前體(LOC612452),mRNA預測的家犬,類似于切割刺激因AL136747子,3前-RNA亞基2,tau(LOC486459),mRNA預測的家犬,類似于絲氨酸/蘇氨NA酸激酶11相互作用蛋白(LOC488541),mRNA預測的家犬假定LOC22889,轉錄AK1704卯物變體1(LOC612936),mRNA預測的家犬,類似于血管生成素-AK222489樣4蛋白(LOC476724),mRNA預測的家犬,類似于絲裂原-激活NM—006116的蛋白激酶激酶激酶7相互作用蛋白l(TAKl-結合蛋白1),轉錄物變體1(LOC481245),mRNA預測的家犬,類似于黑素瘤普遍BC110874存在的突變的蛋白(LOC612320),mRNA預測的家犬,類似于親脂素(脂肪NM_001122分化有關的蛋白)(ADRP),轉錄物變體4(LOC474720),mRNA預測的家犬,類似于鋅指蛋白329NM_024620(LOC484234),mRNASASASASASASASASASASACfaAffx.4438增量.l.SlatCLACLACLACLACLACLACfaAffx.5367.l.Sl一atCfaAffx.654.1.S1—atCfaAffk.668.1.S1—atCfaAffe.67031.S1atCfaAffx.7845.1.S1—s—atCfaAfiZ8861.1.S1—atCfaAffx.9083.l.Sl_atCfaAffx.9353.l.SlsatCfa.11267.1.Al—atCfa.11358.1.Al—atCfa.11413.1.Al一atCfa.11483.1.AlatCfa.12323.1.Al—atCfa.l284.1.S1at減量增量減量減量CfaAffx.7822減量.l.Slsat增量增量增量減量SACfaAffx.9845增量.1.S1—s—atCLACfa.10478.1.增量Alat減量減量減量CLACfa.11868.1.減量Alat增量增量預測的家犬,類似于含有FERMAB023184和PDZ結構域的1(LOC481614),mRNA預測的家犬,類似于claudin6CR614114(LOC4卯048),mRNA預測的人類,類似于核糖體蛋白XM—499342S27(LOC442598),mRNA人類Kazal類型絲氨酸蛋白酶抑制NM—001001劑5-樣2(SPINK5L2),mRNA325預測的家犬,類似于pummo同源AK093847物2,轉錄物變體6(LOC607618),mRNA預測的家犬,類似于含有FYVE-BCi06940指的Rab5j支應蛋白rabenosyn-5(LOC484642),mRNAAJ222700TSC-22蛋白的人類mRNA人類假定LOC387790AK095089(LOC387790),mRNA預測的家犬,類似于FLJ20859蛋AKI55096白同種型2(LOC475396),mRNA預測的家犬,類似于染色質-特異NM_007192性的轉錄延伸因子大亞基,轉錄物變體1(LOC612874),mRNA預測的家犬,類似于含有亮氨酸NM一l44999富集重復序列的45(LOC483375),mRNA預測的牛,類似于11型肌醇-1,4,5-ACO05691三磷酸5-磷酸酶前體(磷酸肌醇5-磷酸酶)(5PTase)(75kDa肌醇多確酸-5-褲酸酶)(LOC538291),部分mRNA人類cDNA克隆IMAGE:4456146,BC024645部分cds人類溶質載體家族20(磷酸運載AF170802體),成員2(SLC20A2),mRNA來自2的人類BAC克隆AC016673RP11-17N4,完整序列DaniorerioPOU結構域,類4,轉錄AL138810因子1,mRNA(cDNA克隆MGC:77341IMAGE:6967996),完整cds預測的家犬,類似于含有普列克AL132640底物蛋白同源性結構域的,家族H(具有MyTH4結構域)成員1(LOC480363),mRNA預測的家犬,類似于血管生成素-AC010323樣4蛋白(LOC476724),mRNA人類mRNA;cDNADKFZp434C136AL133026(來自克隆DKFZp434C136)92CLACfa.13221.1.增量Al—atCLACfa.13649.1.減量Al—s一atCLACfa.13707.1.減量Al—atCLACfa.13930.1.減量Al—atCLACfa.14103.1.減量Al_atCLACfa.15679.1.增量Al—atCLACfa.19017.1.增量SI—atCLACfa.1935.1.A減量1—atCLACfa.20000.1.增量Sl一s一atCLACfa.20451.1.增量SI—atCLACfa.21599.1.增量SI—s—atCLACfa.2308.1.A增量1—atCLACfa.2586.1.S增量1—atCLACfa.3584.1.S增量l—s—atCLACfa.4761.1.S增量l一atCLACfa.4817.1.A減量l一atCLACfa.5394.1.A減量1—atCLACfa.5400.1.A減量1—atCLACfa.5759.1.A增量1at染色體Xq26.3-27.3上的來自克隆AL137840RP11-241012的人DNA序列含有1個新基因,完整序列預測的家犬,類似于鈉-和氯化物-AK074468依賴性的運載體XTRP2(溶質載體家族6成員18)(LOC478631),mRNA預測的牛,類似于Ssu72RNA聚BC008070合酶IICTD磷酸酶同源物,轉錄物變體2(LOC614837),mRNA構巢曲霉FGSCA4假定蛋白AL031779(AN0430.2),mRNA擬南芥克隆RAFL15-15-K01AC09卯53(R20657)推定的細胞色素P450(Atlgl3150)mRNA,完整cds預測的家犬,類似于C10C5.4BC039170(LOC607282),mRNA預測的家犬,類似于CG5537-PA,AL137013轉錄物變體2(LOC480960),mRNA預測的家犬假定LOC481916AL590440(LOC481916),mRNA預測的家犬,類似于精子-相關的AC021754陽離子通道2同種型1(LOC609008),mRNA小鼠泛素-樣4,mRNA(cDNA克隆AC012153MGC:19132IMAGE:4215699),完整cds預測的家犬,類似于平滑肌肌球BC040721蛋白重鏈ll同種型SMl-樣,轉錄物變體3(LOC474586),mRNA小鼠piwi-樣4(果蠅)(Piwil4),AC108065mRNA人類CDC14細胞分裂周期14同AY675321源物B(釀酒酵母)(CDC14B)基因,完整cds家犬促性腺素-釋放激素受體NM—000406(GNRHR),mRNA預測的牛,類似于含有GATA鋅AK125974指結構域的2A,轉錄物變體6(LOC508384),mRNA小鼠去氧腎上腺素NPHS1(Nphsl)AC024166基因,部分cds爪蟾MGC80410蛋白,mRNAAC012618(cDNA克隆MGC:80410IMAGE:5155047),完整cds人類谷胱甘肽過氧化物酶6(ol因子AY324826y)(GPX6),mRNA人類成纖維細胞生長因子5AC006441(FGF5)基因,完整cdsCLACfa.5949.1.A增量l—x—atCLACfa.6989.1.A減量1—atCLACfa.7584.1.A減量1—atCLACfa.7855.1.A增量1atCLACfa.8008.2.A增量1atCLACLACLACLACXACLACLACLACfa.8798.1.A1—atCaAffx.10853.1.SI—atCfaAffx.1228.1.S1—atCfaAffx.1321O.l.Sl—s—atCfaAffx.13599.1.SI—atCfaAffx.13793.1.SIatCfaAffx.18214丄Sl一s—atCfaAffx.18414.1.SIat增量增量減量增量減量減量CLACfaAffx.1700增量3丄S1sat增量減量CLACfaAffx.1892減量2.1.Sl一atCLACfaAffx.2416增量9.1.SIatCLACfaAffx.2467增量5.1.SIxat小鼠RIKENcDNA2500001K11基AC009230因(2500001KllRik),mRNAKIAA0297基因的人mRNA,部分AL589763cds家犬forssman合成酶mRNA,完整AC091826cds預測的家犬,類似于FKBP12-雷AL162595帕霉素復合物-相關的蛋白(FK506-結合蛋白12-雷帕霉素復合物-相關的蛋白l)(雷帕霉素靶蛋白)(RAPT1)(雷帕霉素的哺乳動物靶物)(MTOR),轉錄物變體2(LOC478232),mRNA預測的家犬,類似于激活Rap/RanGAP結構域-樣1同種型1(LOC490653)的GTP酶,mRNA擬南芥Atlg50920mRNA序列預測的家犬cOR2AGl嗅覺感受器家族2亞家族AG-樣(cOR2AGl),mRNALIM-同源結構域蛋白Lhx8的人類基因,部分cds人類嗅覺感受器,家族6,亞家族C,成員6(OR6C6),mRNANicotianabenthamiana克隆6-272未知的mRNA預測的紫色球海膽,類似于脫嘌呤/脫嘧咬內切核酸酶(44.7kD)(apn-l)(LOC592745),mRNA預測的家犬,類似于輔肌動蛋白,a2,轉錄物變體11(LOC479191),mRNA預測的家犬互補序列組分受體2(CR2),mRNA預測的家犬,類似于細胞色素P45024A1,線粒體前體(P450-CC24)(維生素D(3)24-鞋化酶)(1,25-二幾基維生素D(3)24-羥化酶)(24-OHase)(LOC485935),mRNA預測的家犬,類似于張力失常2,U18799扭轉(常染色體隱性)(LOC488341),mRNA小鼠溶質載體家族6(神經(jīng)遞質運U76343載體,GABA),成員13,mRNA(cDNA克隆MGC:1卯82IMAGE:4195373),完整cds預測的家犬,類似于在非轉移性BC000293細胞1中表達的,蛋白(NM"A)(核94AL137818AC007269AC090440AP002762NM—001005493NAAL391114CR593118AK223627S67623CLACLACfaAffx.2488.1.S1—atCfaAffk.29768.1.SIsat增量增量CLACfaAffx.4438增量.1.S1—atCLACfaAffic.6670增量.1.S1—atCLACfaAffic.7326減量.l.Slsat苦二磷酸激酶)(LOC611984),mRNA預測的家犬假定蛋白LOC612694AL583806(LOC612694),mRNA預測的家犬,類似于三分基序蛋BX255925白32(預測的)(LOC491233),mRNA預測的家犬,類似于含有FERMAB023184和PDZ結構域的1(LOC481614),mRNA預測的家犬,類似于^f效管有關的BC009972一氧化物酶,calponin和含有LIM結構域的1(LOC481958),mRNA預測的家犬,類似于富含F(xiàn)-框和NM—145032亮氨酸的重復序列蛋白13(LOC609997),mRNA實施例3可以用作胖和瘦動物的分類預測物的在胖和痩動物血液中差別表達的基因為了筒化臨床和科學分析,并消除對使用固體組織樣品的需要,所需固體組織樣品必須從活動物活組織檢查,可以從胖和瘦狗得到血液樣品,并用于開發(fā)可以用于區(qū)分胖和瘦動物的"分類預測物"。分類預測是一種模式識別形式,其包含使用本領域技術人員熟悉的監(jiān)督學習算法(例^口,WeightedVoting、ClassNeighbors、K-NearestNeighbors禾口SupportVectorMachines),以定義一組可以識別和區(qū)分2組或2類動物的基因或基因產物。開發(fā)分類預測物通常包含下述步驟訓練步驟在該步驟中,使用兩個明確定義的動物組或類(例如胖和瘦動物)來訓練算法,以識別和區(qū)分它們。該步驟會產生基因的"分類預測物,,集合。一旦建立并驗證了基因和/或基因產物的"分類預測物"組,它可以用于分類新的和未知的樣品(在它們可利用時)。驗證或測試步驟然后使用不同于在訓練步驟中使用的樣品的新樣品,并允許算法使用它在訓練步驟中已經(jīng)學習到的知識來預測每種新樣品所屬的類,測試分類預測物的區(qū)分兩個組的能力。95在我們的使用胖和瘦動物的研究中,根據(jù)本文上面提供的方法,使用Affymetrix犬-2GeneChip來測量從動物采取的血樣中的基因表達水平,它們被常規(guī)地鑒別為臨床上胖的(28只動物具有4或5的身體狀況評分)或瘦的(12只動物具有2或2.5的身體狀況評分)。GeneChip數(shù)據(jù)然后用于訓練在軟件程序GeneSpring(7.2版,AgilentTechnologies)中包含的訓練算法(SupportVectorMachines),以產生分類預測物。因此,數(shù)據(jù)指示出65個表現(xiàn)出在胖和痩樣品之間的差別表達水平的探針,"p"值為0.01(在應用假發(fā)現(xiàn)率校正后)(參見表8)。在表9中提供的RMA標準化的數(shù)據(jù)指示著與瘦動物相比在胖動物中的表達的倍數(shù)變化的強度,所以大于1的值指示著該基因在胖動物中增量調節(jié),1的值指示著與痩動物相比在胖動物中的表達沒有變化,小于1的值指示著該基因在瘦動物中的表達比胖動物強。因而,本文預見到這些探針和它們代表的基因和基因產物可以潛在地用作分類預測物,使用血樣來鑒別胖和瘦動物,不需要使用脂肪組織樣品。表8:代表可以使用血樣來替代脂肪組織樣品用作胖和瘦動物的分類預測物的基因的Affymetrix探針Affymetrix纟笨4十標識基于BLAST序列相似性的最高注解預測家犬,類似于a-synuclein同種型NACP140;轉錄物變1Cfa.l0128.1.Al一at體3(LOC478478);mRNA預測家犬,類似于ADP-核糖基化因子GTP酶激活蛋白3;2Cfa.l0772.1.Al一at轉錄物變體5(LOC474477);mRNA3Cfa.11444.1.Al-_at人類dkl癌基因;完整cds預測家犬,類似于泛素C-末端水解酶UCH374Cfa.ll52.1.Al一s—at(LOC478958);mRNACfa.ll624.1.Al一at預測家犬,類似于4見黃醛結合蛋白1(LOC479039);mRNA預測家犬,類似于含有巻曲螺旋-螺旋-巻曲螺旋-螺旋結構域6Cfa.l3515.1.S1—匿at的蛋白3;轉錄物變體5(LOC607574);mRNA"7Cfa.l3669.1.A1.—at沒有可得到的注解猩猩mRNA;cDNADKFZp468H0312(來自克隆8Cfa.l5521.1.Al—atDKFZp468H0312)預測家犬,類似于NADH脫氫酶(泛醌)1a亞復合物;11;9Cfa.l6699.1.S1—一s一at14.7kDa;轉錄物變體1(LOC476735);mRNA預測家犬,類似于ADP-核糖基化因子GTP酶激活蛋白3;10Cfa.l7093丄S1—_at轉錄物變體2(LOC474477);mRNA11Cfa.l8024.1.S1—_s—at預測家犬,類似于MAK31-樣蛋白(LOC479488);mRNA12Cfa.l945.1.A1—;at沒有可得到的注解13Cfa.l9577.1.Sl_—at預測褐鼠,類似于假定蛋白FLJ25439(LOC502510);mRNA14Cfa.273.3.Alsat預測家犬,類似于NADH脫氫酶(泛醌)1(3亞復合物8;轉96錄物變體1(LOC477798);mRNA15Cfa.3698.1.A1—at家犬血管緊張素II類型2受體mRNA;部分cds16Cfa.3895.1.A1—s—at家犬Sec61p亞基(Sec61b);mRNA預測家犬,類似于NADH脫氫酶(泛醌)Fe-S蛋白6;13kDa17Cfa.4245丄S1—s—at(NADH-輔酶Q還原酶)(LOC478629);mRNA預測牛,類似于mal;T-細胞分化蛋白-樣(LOC512289);18Cfa.4779.1.A1—atmRNA19Cfa.5440.1.A1—atMagnaporthegrisea70-15假定蛋白(MG04641.4)部分mRNA預測家犬,類似于生長分化因子3前體(LOC477702);20Cfa.5628.1.A1—s—atmRNA預測家犬,類似于甘油醛-3-磷酸脫氫酶(LOC481027);21Cfa.5672.1.A1—s—atmRNA人類mRNA;cDNADKFZp761M0111(來自克隆22Cfa.583.1.S1—atDKFZp761M0111)23Cfa.6307.1.A1—s—at預測家犬,類似于早老素增強子2(LOC476479);mRNA24Cfa.6307.1.A1—x—at預測家犬,類似于早老素增強子2(LOC476479);mRNA預測家犬,類似于脂聯(lián)素受體2;轉錄物變體2(LOC477732);25Cfa.7730.1.Al一atmRNA預測家犬,類似于含有Kelch重復序列和BTB結構域的蛋白10(Kelch有關的蛋白l)(Kel-樣蛋白23)(Sarcosin);轉錄物26Cfa.8497.1.Al一at變體3(LOC478784);mRNA預測家犬,類似于MADS盒轉錄增強子因子2;多肽C(肌27Cfa.卯73.1.A1—s—at細胞增強子因子2C);轉錄物變體30(LOC479155);mRNA28Cfa.9519.1.A1—at人類(人)胎兒腦的全長cDNA克隆CS0DF038YH13預測家犬,類似于溶質載體家族5(碘化物運載體);成員829CfaAffe.l1304.1.SI——at(LOC482626);mRNACfaAffx.l2600.1.Sl_-S—330tTRAM-蛋白的家犬mRNA31CfaAffx.12899.1.S1—at預測牛,類似于嗅覺感受器01r535(LOC510433);mRNACfaAffx.l3068丄Sl一—s一a32t家犬羧肽酶Bl(組織)(CPB1);mRNA33CfaAffiU3084.1.S1—_at小鼠嗅覺感受器MOR232-2基因;完整cdsCfaAffx.l3369.1.Sl—s_a34t預測家犬,類似于竭^C蛋白T(LOC612992);mRNA35CfaAffx.13927.l.Sl一—at預測家犬,類似于CG10510-PA(LOC477622);mRNACfaAffx.l3999.1.Sl一s一a預測家犬,類似于跨膜9超家族蛋白成員3前體;轉錄物變36t體5(LOC612786);mRNACfaAffx.14593.1.SI—_S—3預測家犬,類似于chromodomain螺旋酶DNA結合蛋白6;37t轉錄物變體1(LOC477230);mRNACfaAffx.16220.LSl—_s—a預測家犬,類似于跨膜4-結構域;亞家族A;成員6A同種38t型2(LOC612553);mRNACfaAffic.16368.1.SI——s一a39t信號識別蛋白受體的犬mRNACfaAffx.17233.1.SI_s—a40t預測家犬,類似于泛素-綴合酶E2G2(LOC611581);mRNA41CfaAffx.l8688.1.S1._at預測家犬假定蛋白LOC609372(LOC609372);mRNACfaAffx.l9132.1.Sl_s—a42t預測家犬,類似于uroplakin2(LOC610673);mRNA預測家犬,類似于YTH結構域蛋白1(與癌癥推定自身抗原-1同源物有關的皮肌炎)(DACA-1同源物)(LOC485968》43CfaAffx.19769.1.SIatmRNA9744CfaAffic.20665丄S1—atCfaAffic.20740丄S1—s—a45t—46CfaAffx.2I676.1.Sl_at47CfaAffic.2327.1.S1—s—at48CfaAffx.23835丄S1—atCfaAffx.24356.1.S1—s一a49t50CfaAffx.24849.1.Slat51CfaAffe.25142.1.Slsa52CfaAffx.25751.1.Sl一atCfaAffx.26483.1.S1—s一a53tCfaAffx.28078.1.S1—s一a54t一55CfaAffx.28164.1.S1—at56CfaAffx.2860.1.S1—s—at57CfaAffx.28798.1.S1—atCfaAffx.29250丄S1—s一a58t59CfaAffx.32063.1.Slat60CfaAffx.360.1.Sl_s—at61CfaAffx.3860.1.S1—s—at62CfaAffk.604.1.Sl_at63CfaAffx.6669.LSl—at64CfaAffx.7079.1.SIat預測家犬,類似于含有修飾的結構域的1;轉錄物變體l(LOC491775);mRNA預測家犬,類似于解聚素和金屬蛋白酶結構域23前蛋白原;轉錄物變體2(LOC607871);mRNA預測家犬,類似于鐵蛋白輕鏈(鐵蛋白L亞基)(LOC491829);mRNA預測家犬,類似于ADP-核糖基化因子GTP酶激活蛋白3;轉錄物變體5(LOC474477);mRNA人類鈣粘蛋白原15(PCDH15);mRNA預測家犬,類似于生長激素誘導型跨膜蛋白(真皮乳頭衍生的蛋白2);轉錄物變體3(LOC479266);mRNA預測家犬,類似于嗅覺感受器7A5(嗅覺感受器TPCR92)(LOC610545);mRNA預測家犬,類似于腎鈉-依賴性的磷酸鹽運輸?shù)鞍?(鈉/磷酸鹽協(xié)同轉運蛋白2)(Na(+)/Pi協(xié)同轉運蛋白2)(腎鈉-磷酸運輸?shù)鞍?)(腎Na(+)-依賴性的磷酸鹽協(xié)同轉運蛋白2);t食蟹猴腦cDNA;克隆:QflA-12135;類似于人妊娠素和adipoQ受體家族成員VI(PAQR6);mRNA;NM—024897.2家犬非轉移性細胞2;在(NME2)中表達的蛋白(NM23B);mRNA預測家犬,類似于CD27-結合(Siva)蛋白同種型1(LOC612693);mRNA預觀'J:家犬,類似于泛素-綴合酶E2A(泛素-蛋白連接酶A)(泛素載體蛋白A)(HR6A)(mHR6A)(LOC492095);mRNA預測家犬,類似于含有巻曲螺旋-螺旋-巻曲螺旋-螺旋結構域的蛋白3;轉錄物變體2(LOC607574);mRNA預測家犬,類似于發(fā)作相關的基因6(LOC491175);mRNA預測家犬,類似于CG4646-PA(LOC479563);mRNA沒有可得到的注解預測家犬,類似于ADAMDEC1前體(解聚素和金屬蛋白酶結構域-樣蛋白decysin1)(ADAM-樣蛋白decysin1)(LOC608742);mRNAKIAA1045蛋白的人類mRNA;部分cds預測家犬,類似于鋅指蛋白91(HPF7;HTF10)(LOC484590);mRNA預測預測預測家犬,類似于孕酮膜結合蛋白(LOC476084);mRNA家犬TATA-框結合蛋白(LOC475040);mRNA家犬,類似于線粒體核糖體蛋白L48同種型165CfaAffx.9326丄Sl丄at(LOC476812);mRNA表9與瘦動物相比在胖動物中的分類預測物基因集合表達值基因與瘦動物相比在胖動物中的倍數(shù)變化Cfa.lOm.l.Alat1.178Cfa.l0772.1.Alat0.673Cfa.ll444.1.Alat1.167Cfa.ll52.1.Alsat0.68298<table>tableseeoriginaldocumentpage99</column></row><table>CfaAffx.28798.1.Slat1.066CfaAffic.29250.1.Slsat0.789CfaAffx.32063.1.Slat1.16CfaAffic.360.1.Slsat1.141CfaAffk.3860.1.Slsat1.163CfaAffii.604.1.Slat1.154CfaAffk.6669.1.Slat0.816CfaAffx.7079.1.SIat0.709CfaAffe.9326.1.Slsat0.794實施例4含有更高量的長鏈脂肪酸的飲食會促進體重減輕,且可以用于改編動物的基因表達,所以它會反映變瘦和潛在地維持瘦度的傾向從上面討論的體外成分篩選得到的數(shù)據(jù)表明,有些富含長鏈脂肪酸的成分(參見表7)可能具有以促進動物整體的瘦度的方式影響參與脂肪代謝的基因的表達的潛力。這可以使用常規(guī)的計算機算法分析,通過分析從脂肪組織和上面討論的成分測定得到的數(shù)據(jù)來測定。可用于這方面的算法的代碼是本領域技術人員熟知的,且可以不經(jīng)過過度實驗來開發(fā)。下面提供了這樣的代碼的一個實例SELECTA.PROBE,TO—CHAR(AVG(DECODE(AEXPTDAY,'DO',GENE—NORM—INT,null))/AVG(DECODE(A.EXPTDAY,'D14',GENE—NORM—INT,null)),'99999.99999')FATLEAN—FC,STATS—T—TEST—INDEPU(A.EXPTDAY,GENE—NORM—INT)P—VALUE,B.TOPHITDEF,COUNT(DIS頂CTC.INGREDIENT),COUNT(DISTINCTD.INGREDIENT)FROMGERIATRICS—RNRM2A,TOP—PROBE—ANNOT2—3B,F(xiàn)ILT—INDIV—CELLS—2C,F(xiàn)ILT—ACROSS—4—CELLS—2DWHEREA.PROBE=B.PROBEANDA.PROBE=C.PROBE(+)ANDA.PROBE-D.PROBE(+)ANDUPPER(A.PROBE)NOTLIKE'AFFX%'GROUPBYA.PROBE,B.TOP一HIT一DEFHAVINGSTATS—T—TEST—INDEPU(A.EXPTDAY,GENE—NORM—INT)<=.01ANDAVG(DECODE(A.EXPTDAY,'DO',GENE—NORM—INT,null))/AVG(DECODE(A.EXPTDAY,'D14',GENE—NORM一INT,null))>=5ANDSUM(DECODE(PAMCALL,'P',1,0))=40ORDERBYPROBE為了證實在喂狗的飲食中包含亞麻酸或EPA/DHA(1.5:1)確實會影響狗的體重減輕,開發(fā)了3種高蛋白飲食,它們不含有添加的長鏈脂肪酸(飲食A)或含有添加的亞麻酸(基于100%干物質基礎是約1%,飲食B)或EPA/DHA(1.5:1,約0.30%:0.20%)(飲食C),用于與已知會誘導狗的體重減輕的高纖維飲食相比較。在該研究中,在開始實驗之前,45只臨床上的胖狗都首先飼喂營養(yǎng)完整的對照飲食30天。在初期30天后,將狗隨機分成4組。4組中的3組接受實-驗飲食之一,一組接受作為對照的高纖維飲食一段時間,例如,4個月。結果表明,3種實驗食物(飲食A、B和C)具有比高纖維食物明顯更高的消化率。結果也表明,約38%的消耗含有EPA/DHA的食物的狗在90天時達到它們的體重減輕目標。令人感興趣地,消耗EPA/DHA食物的狗也維持痩肌肉質量和骨礦物質含量。結果也表明,至少在臨床水平,含有EPA/DHA的飲食可以象高纖維飲食一樣有效地影響體重減輕。為了驗證分類預測物探針集合和測試它的預測動物的胖度或瘦度的能力,將分類預測物探針集合(上面實施例3所述)應用于從參與上述實驗的45只動物得到的基因表達數(shù)據(jù)(表達數(shù)據(jù)未顯示)。分類預測物分析證實,45只動物中的41只(約卯%)在實^r開始時指定為"胖,,的動物事實上肥胖(差異可能是由于目前在臨床上使用的常規(guī)身體狀況評分系統(tǒng)的主觀性質)。令人感興趣地,飼喂上述4種飲食14天后,分類預測物分析指示著所有動物都表現(xiàn)出"瘦,,基因表達,無論飲食如何。在研究結束時,對照高纖維飲食的所有動物似乎都反映出"胖"基因表達,約25。/。的實驗飲食A和B的動物反映出生化"瘦"基因表達,約40%101的飼喂含有EPA/DHA的飲食C的動物表現(xiàn)出生化"瘦"基因表達(參見表10)。表10:通過65-探針分類預測物預測的瘦動物近似百分比<table>tableseeoriginaldocumentpage102</column></row><table>實施例5可能的體重減輕維持實驗基于上面討論的體重減輕實驗的結果,假設與飼喂其它實驗和對照高纖維飲食的動物相比,飼喂含有EPA/DHA的々欠食的動物不僅體重減輕,而且會維持減輕更長的時間段。為了表征飲食A、B和C和高纖維飲食對體重減輕維持的影響,可以進行例如下述類型的實^^:可以給胖動物飼喂4種不同的飲食(如實施例4所述),直到它們達到最佳"瘦度"水平。然后可以將它們隨機分成小組,繼續(xù)飼喂與以前相同的實驗飲食,或轉換成營養(yǎng)平衡的、但是沒有設計成誘導或維持體重減輕且不包含可察覺量的亞麻酸或EPA/DHA等的維持飲食。然后觀察動物一段時間,例如,多達3個月,每天記錄它們的體重,每周測定它們的身體狀況評分,并使用常規(guī)的DEXA技術每月測定它們的身體脂肪百分比。權利要求1.一種組合,其包含(a)兩種或多種選自SEQIDNO1-295或其有用變化的多核苷酸,或(b)通過表達兩種或多種選自SEQIDNO1-295或其有用變化的多核苷酸而生成的兩種或多種蛋白。2.權利要求1的組合,其中所述多核苷酸選自SEQIDNO:1-70或其有用變化。3.權利要求1的組合,其中所述多核苷酸選自SEQIDNO:l-25或其有用變化。4.權利要求l的組合,其中所述多核苷酸選自在表2中鑒別的SEQIDNO或其有用變化。5.權利要求l的組合,其中所述多核苷酸選自在表3中鑒別的SEQIDNO或其有用變化。6.權利要求l的組合,其中所述多核苷酸是犬多核苷酸。7.—種組合物,其包含適用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達的兩個或多個探針,所述探針包含(a)選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核普酸;或(b)多肽,其特異性地結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸而生成的蛋白。8.權利要求7的組合物,其中所述多核苷酸選自SEQIDN〇:l-70或其有用變化。9.權利要求7的組合物,其中所述多核苷酸選自SEQIDNO:l-25或其有用變化。10.權利要求7的組合物,其中所述多核苷酸選自在表2中鑒別的SEQIDNO或其有用變化。11.權利要求7的組合物,其中所述多核苷酸選自在表3中鑒別的SEQIDNO或其有用變化。12.權利要求7的組合物,其中所述多核苷酸是犬多核苷酸。13.—種裝置,其適用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的多種基因的表達,該裝置包括基質,所述基質具有多個在已知位置添附到基質上的探針,所述探針包含(a)選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸;或(b)多肽,其中的每一種多肽特異性地結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核普酸而生成的蛋白。14.權利要求13的裝置,其中所述多核苷酸選自SEQIDNO:1-70或其有用變化。15.權利要求13的裝置,其中所述多核普酸選自SEQIDNO:l-25或其有用變化。16.權利要求13的裝置,其中所述多核苷酸選自在表2中鑒別的SEQIDNO或其有用變化。17.權利要求13的裝置,其中所述多核苷酸選自在表3中鑒別的SEQIDNO或其有用變化。18.權利要求13的裝置,其中所述多核苷酸是犬多核普酸。19.權利要求13的裝置,其中所述探針排列成陣列。20.權利要求13的裝置,其中所述多肽探針是抗體。21.權利要求20的裝置,其中所述抗體是單克隆抗體。22.檢測樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的差別表達的方法,其包括(a)使包含多個選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸探針的組合與樣品中的多核苷酸雜交,以形成一種或多種雜交復合物;(b)任選地,使包含多個選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸探針的組合與標準品中的多核苷酸雜交,以形成一種或多種雜交復合物;(c)檢測來自樣品和任選的來自步驟(b)的標準品的雜交復合物;和(d)比較來自樣品的雜交復合物和來自標準品的雜交復合物,其中標準品和樣品之間雜交復合物的量的2倍或更高的差異指示著樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的差別表達。23.權利要求22的方法,其中所述探針選自SEQIDNO:1-70或其有用變化,且倍數(shù)差異是2.5或更高。24.權利要求22的方法,其中所述探針選自SEQIDNO:l-25或其有用變化,且倍數(shù)差異是3或更高。25.權利要求22的方法,其中所述探針選自在表2中筌別的SEQIDNO或其有用變化,且倍數(shù)差異是2或更高。26.權利要求22的方法,其中所述探針選自在表3中鑒別的SEQIDNO或其有用變化,且倍數(shù)差異是2或更高。27.權利要求22的方法,其中所述探針與基質結合。28.權利要求27的方法,其中所述探針是在陣列中。29.權利要求22的方法,其中當嘗試響應于脂肪組織調控方案來調控動物脂肪組織的量時,間隔地對動物進行檢測,并用于監(jiān)岸見動物的進展。30.權利要求22的方法,其中所述探針是犬多核苷酸。31.權利要求22的方法,其進一步包括,在雜交之前將樣品暴露于測試物質,其中與標準品的比較指示著測試物質是否改變了樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達。32.檢測樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的差別表達的方法,其包括0)在允許探針和蛋白之間發(fā)生特異性結合的條件下,使包含多個多肽探針的組合與樣品中的蛋白反應,其中探針結合的蛋白是通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核普酸來生產的;(b)任選地,在允許探針和蛋白之間發(fā)生特異性結合的條件下,使包含多個多肽探針的組合與標準品中的蛋白反應,其中探針結合的蛋白是通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸來生產的;(c)檢測樣品和任選的來自步驟(b)的標準品中的特異性結合;和(d)比較樣品和標準品中的特異性結合,其中標準品和樣品中的特異性結合之間的2倍或更高的差異指示著樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的差別表達。33.權利要求32的方法,其中所述探針選自SEQIDNO:1-70或其有用變化,且倍數(shù)差異是2.5或更高。34.權利要求32的方法,其中所述探針選自SEQIDNO:1-25或其有用變化,且倍數(shù)差異是3或更高。35.權利要求32的方法,其中所述探針選自在表2中鑒別的SEQIDNO或其有用變化,且倍數(shù)差異是2或更高。36.權利要求32的方法,其中所述探針選自在表3中鑒別的SEQIDNO或其有用變化,且倍數(shù)差異是2或更高。37.權利要求32的方法,其中所述探針與基質結合。38.權利要求37的方法,其中所述探針是在陣列中。39.權利要求32的方法,其進一步包括,在脂肪組織調控方案期間,間隔地檢測動物中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的差別表達,并通過觀察基因表達的變化,測定該方案的有效性。40.權利要求39的方法,其中基因表達的減少指示著動物脂肪組織的減少。41.權利要求32的方法,其中所述探針是犬多肽。42.權利要求32的方法,其進一步包括,在使多肽與蛋白反應之前,將樣品暴露于測試物質,其中與標準品的比較指示著測試物質是否改變了樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達。43.測量測試物質對與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的影響的方法和篩選測試物質以確定它是否可能用于調控動物脂肪組織的量的方法,其包括(a)通過測量在沒有測試物質存在下測試系統(tǒng)中一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸的轉錄或翻譯產物,測定第一表達譜;(b)通過測量在有測試物質存在下測試系統(tǒng)中一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸的轉錄或翻譯產物,測定第二表達譜;和(c)比較第一表達譜和第二表達譜,其中與第一表達譜相比第二表達語變化了2倍或更多,指示著測試物質會影響與瘦動物相比在胖動物中差別表達的多核香酸的表達,且該測試物質可能用于調控動物脂肪組織的量。44.權利要求43的方法,其中所述多核苷酸選自SEQIDNO:1-70或其有用變化,且倍數(shù)差異是2.5或更高。45.權利要求43的方法,其中所述多核苷酸選自SEQIDNO:l-25或其有用變化,且倍數(shù)差異是3或更高。46.權利要求43的方法,其中所述多核苷酸選自在表2中鑒別的SEQIDNO或其有用變化,且倍數(shù)差異是2或更高。47.權利要求43的方法,其中所述多核苷酸選自在表3中鑒別的SEQIDNO或其有用變化,且倍數(shù)差異是2或更高。48.權利要求43的方法,其中測定表達譜使用了多種多核苷酸。49.權利要求48的方法,其中所述多核苷酸與基質結合。50.權利要求49的方法,其中所述探針是在陣列中。51.權利要求43的方法,其中從犬得到標準品和測試樣品。52.通過權利要求42的方法鑒別的物質。53.預測動物可能變胖或診斷動物為肥胖的方法,其包括,測定與一種或多種痩動物相比在該動物中是否差別表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸,或一種或多種特異性地結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸而生成的蛋白的多肽,其中如果比較結果指示著與瘦動物相比多核苷酸或多肽在該動物中差別表達了2倍或多倍,則測定該動物可能變胖或測定為肥胖。54.權利要求53的方法,其中所述多核苷酸選自SEQIDNO:1-70或其有用變化,且倍數(shù)差異是2.5或更高。55.權利要求53的方法,其中所述多核苷酸選自SEQIDNO:l-25或其有用變化,且倍數(shù)差異是3或更高。56.權利要求53的方法,其中所述多核苷酸選自在表2中鑒別的SEQIDNO或其有用變化,且倍數(shù)差異是2或更高。57.權利要求53的方法,其中所述多核苷酸選自在表3中鑒別的SEQIDNO或其有用變化,且倍數(shù)差異是2或更高。58.操作非人動物的基因組或動物基因組的表達的方法,其包括,破壞與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達。59.權利要求58的方法,其中通過"敲除"動物中的內源基因來破壞表達。60.權利要求58的方法,其中通過干擾轉錄或翻譯來破壞表達。61.權利要求58的方法,其中使用用選自SEQIDN〇:l-295或其有用變化的多核苷酸構建的多核苷酸來破壞表達。62.使用權利要求58的方法生成的轉基因動物。63.適用于操作動物的基因組的組合物,其包含一種或多種物質,所述物質干擾與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達。64.權利要求63的組合物,其中所述物質是反義分子或siRNA。65.權利要求63的組合物,其中所述物質是使用選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸構建的多核苷酸。66.調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的方法,或調控動物脂肪組織的量的方法,其包括,給動物施用基因表達或組織調控量的組合物,所述組合物包含DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一種或多種。67.權利要求66的方法,其中DHA的施用量為約1至約30;EPA的施用量為約1至約30;EPA/DHACombo(1.5:1比例)的施用量為約4/2至約30/45;ALA的施用量為約10至約100;LA的施用量為約30至約600;ARA的施用量為約5至約50;SA的施用量為約3至約60,都按mg/kg/天計算。68.權利要求66的方法,還包括給動物施用一種或多種調控動物脂肪組織的量的藥物或其它物質。69.適用于調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達或調控動物脂肪組織的量的組合物,其包含基因表達或組織調控量的DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一種或多種。70.權利要求69的組合物,其包含的DHA的量足以施用給動物約1至約30;EPA的量足以施用給動物約1至約30;EPA/DHACombo(1.5:1比例)的量足以施用給動物約4/2至約30/45;ALA的量足以施用給動物約10至約100;LA的量足以施用給動物約30至約600;ARA的量足以施用給動物約5至約50;SA的量足以施用給動物約3至約60,都按mg/kg/天計算。71.權利要求69的組合物,還包含一種或多種調控動物脂肪組織的量的藥物或其它物質。72.篩選用于包含在一個或多個組中的動物的方法,其包含測定下述物質在動物中的表達語(a)選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸,或(b)多肽,其中的每一種多肽特異性地結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸而生成的蛋白,并基于表達譜將動物分配到組中。73.權利要求72的方法,其中所述組是瘦和胖組,基于與標準品相比2倍或更多倍的差別表達將動物分配到胖組,基于與標準品相比小于2倍的差別表達將動物分配到瘦組。74.計算機系統(tǒng),其適用于操作關于與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的數(shù)據(jù),該系統(tǒng)包含,含有信息的數(shù)據(jù)庫,所述信息可以鑒別瘦動物和/或胖動物中一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸表達水平、和/或特異性地結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核苷酸而生成的蛋白的多肽的表達水平;和與數(shù)據(jù)庫交互作用的用戶界面。75.生產適用于檢測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的抗體的方法,其包括(a)在引發(fā)抗體反應的條件下,用通過表達一種或多種選自SEQIDNO:l-295或其有用變化的多核香酸而生產的多肽免疫動物;(b)分離動物抗體;和(c)用多肽篩選分離的抗體,從而鑒別出特異性地結合多肽的抗體。76.分離的和純化的使用權利要求75的方法生成的抗體。77.試劑盒,其適用于測定測試系統(tǒng)中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的差別表達,該試劑盒包含,在單個包裝中的分離的容器中或在虛擬包裝中的分離的容器中的、與用途和試劑盒組分相適宜的、兩個或多個適用于;^企測與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達的探針,所述探針包含(a)選自SEQIDN〇:l-295或其有用變化的多核苷酸,或(b)多肽,其特異性地結合通過表達一種或多種選自SEQIDNO:1-295或其有用變化的多核苷酸而生成的蛋白,和下述的至少一種(1)關于如何使用本發(fā)明的探針的說明書;(2)使用探針必需的試劑和儀器;(3)適用于調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的組合物;(4)適用于破壞與痩動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的組合物;(5)適用于調控動物脂肪組織的量的食物組合物;和(6)—種或多種調控動物脂肪組織的量的藥物或其它物質。78.權利要求77的試劑盒,其中所述探針與基質結合。79.權利要求78的試劑盒,其中所述探針是在陣列中。80.權利要求77的試劑盒,其中所述組合物包含DHA、EPA、EPA和DHA、ALA、LA、ARA和SA中的一種或多種。81.用于交流信息或說明的工具,所述信息或說明是關于下述(l)至(13)中的一種或多種(1)使用本發(fā)明的多核苷酸,檢測樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的表達,(2)使用本發(fā)明的多核苷酸,測量測試物質對與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的影響,(3)使用本發(fā)明的多核苷酸,篩選測試物質以確定它是否可能用于調控動物脂肪組織的量,(4)使用本發(fā)明的多核苷酸,預測動物可能變胖或診斷動物為肥胖,(5)使用本發(fā)明的多核苷酸,操作非人動物的基因組或動物基因組的表達,(6)使用本發(fā)明的多核苷酸,調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達或調控動物脂肪組織的量,(7)使用本發(fā)明的多核苷酸,篩選用于包含在一個或多個組中的動物,(8)使用本發(fā)明的多核苷酸,使用計算機系統(tǒng)操作關于與瘦動物相比在胖動物中差別表達的基因的數(shù)據(jù),(9)單獨地或與本發(fā)明的其它要素組合地,給動物施用本發(fā)明的物質,(10)使用本發(fā)明的物質,調控動物脂肪組織的量,(11)使用本發(fā)明的計算機系統(tǒng),(12)使用本發(fā)明的試劑盒,和(13)使用本發(fā)明的方法和組合物以及一種或多種調控動物脂肪組織的量的藥物或其它物質,該工具包含含有信息或說明的文件、數(shù)字存儲介質、光存儲介質、聲音呈現(xiàn)或視覺顯示。82.權利要求81的工具,其選自顯示網(wǎng)站、視覺顯示、報攤、小冊子、產品標簽、包裝說明、廣告、傳單、公告、錄音磁帶、錄像帶、DVD、CD-ROM、計算機可讀芯片、計算機可讀卡、計算機可讀盤、計算機內存或它們的組合。83.表1的多核苷酸數(shù)據(jù)在生產用于調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的組合物中的應用。84.表8和表9的分類預測物數(shù)據(jù)在生產用于調控與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的表達的組合物中的應用。85.表1的多核苷酸數(shù)據(jù)在生產用于診斷動物的身體狀況評分的試劑盒中的應用。86.表8和表9的分類預測物數(shù)據(jù)在生產用于診斷動物的身體狀況評分的試劑盒中的應用。全文摘要本發(fā)明公開了一種組合,其包含與瘦動物相比在胖動物中差別表達的兩種或多種多核苷酸,或通過表達這樣的多核苷酸生成的兩種或多種蛋白。所述組合和基于該組合的探針用于預測動物可能變胖、診斷動物肥胖、篩選物質以確定它們是否可用于調控動物脂肪組織的量和檢測樣品中與瘦動物相比在胖動物中差別表達的一種或多種基因的差別表達。本發(fā)明也公開了使用分類預測物基因譜來鑒別胖和瘦動物的方法。文檔編號C12Q1/68GK101490276SQ200780015879公開日2009年7月22日申請日期2007年3月2日優(yōu)先權日2006年3月2日發(fā)明者K·G·弗里森,R·M·揚卡,S·B·馬拉迪,S·W·K·阿爾-穆拉尼,W·D·舍恩赫爾,高向明申請人:希爾氏寵物營養(yǎng)品公司