本發(fā)明申請涉及豬標(biāo)記輔助選擇（mas），具體涉及一種影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的snp分子標(biāo)記及應(yīng)用。

背景技術(shù)：

1、大白豬又稱約克夏豬，原產(chǎn)于英國約克郡及英格蘭北部。大白豬是我國引進(jìn)的優(yōu)良瘦肉型豬種。我國引進(jìn)的大白豬繁殖力強(qiáng)，平均窩產(chǎn)仔數(shù)可達(dá)14頭以上，但軀干普遍不長，平均乳頭數(shù)多在七對以下。

2、隨著養(yǎng)豬技術(shù)和豬育種的發(fā)展，母豬的產(chǎn)仔數(shù)量逐年提高，但母豬的乳頭數(shù)卻相對固定，因而出現(xiàn)母豬的有效乳頭數(shù)不能滿足哺乳需要的現(xiàn)象。乳頭數(shù)這一性狀與其他繁殖性狀相比，更易受先天遺傳的影響。哺乳仔豬有固定乳頭的生理特點(diǎn)。如果有效乳頭數(shù)不能滿足仔豬需要，會(huì)出現(xiàn)仔豬營養(yǎng)缺乏，甚至爭搶乳頭的現(xiàn)象。因此通過育種提高母豬乳頭數(shù)愈發(fā)關(guān)鍵。

3、豬乳頭數(shù)性狀遺傳力較低（約為0.3），而挖掘影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的snp分子標(biāo)記技術(shù)，是豬繁殖性狀遺傳方向的創(chuàng)新性突破。這一技術(shù)相較于傳統(tǒng)的育種改良技術(shù)，遺傳效果更加顯著，性狀改良速度更加迅速。這一技術(shù)提供了豬繁殖性狀遺傳改良方向的新思路，也促進(jìn)了豬養(yǎng)殖方面的發(fā)展。

4、公開于該背景技術(shù)部分的信息僅用于加深對本公開的背景技術(shù)的理解，而不應(yīng)當(dāng)被視為承認(rèn)或以任何形式暗示該信息構(gòu)成本領(lǐng)域技術(shù)人員所公知的現(xiàn)有技術(shù)。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明的目的在于提供一種影響大白豬總?cè)轭^數(shù)相關(guān)的snp分子標(biāo)記，并將其應(yīng)用在基因型鑒定、遺傳育種等方面，旨在解決當(dāng)前對母豬總?cè)轭^數(shù)相關(guān)性狀缺乏基因研究的技術(shù)問題。

2、利用豬全基因組序列以及高密度snp(single?nucleotide?polymorphism，單核苷酸多態(tài))芯片數(shù)據(jù)，基于豬全基因組關(guān)聯(lián)分析策略(genome-wide?association?study，gwas)檢測到了與大白豬總?cè)轭^數(shù)顯著相關(guān)的分子標(biāo)記，該snp分子標(biāo)記為基于國際豬基因組11?.1版本參考序列第13號染色體第10512725個(gè)堿基存在c/g突變；如將該snp分子標(biāo)記運(yùn)用到分子標(biāo)記輔助選擇和基因組選擇中，則可推進(jìn)豬的遺傳改良進(jìn)程以提高養(yǎng)殖的經(jīng)濟(jì)效益。

3、本申請公開的第一方面，涉及一種影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的snp分子標(biāo)記，基于國際豬基因組11?.1版本參考序列13號染色體第10512725個(gè)堿基存在一個(gè)c/g轉(zhuǎn)換類型的單核苷酸多態(tài)性變異。

4、本申請公開的第二方面，涉及一種影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的snp分子標(biāo)記在選擇/鑒定有關(guān)大白豬總?cè)轭^數(shù)性狀的方法，包括以下步驟：

5、（1）取待測豬只的組織樣品并提取全基因組dna；

6、（2）利用豬全基因組重測序?qū)λ鋈蚪Mdna進(jìn)行掃描；

7、（3）獲取重測序數(shù)據(jù)，基于國際豬基因組11?.1版本參考序列，查看13號染色體上第10512725個(gè)位點(diǎn)的基因型，判讀該位點(diǎn)的c/g多態(tài)性，基于基因型為cg和gg的總?cè)轭^數(shù)比基因型cc的總?cè)轭^數(shù)高的特征對大白豬總?cè)轭^數(shù)性狀進(jìn)行選擇/鑒定。

8、本申請公開的第三方面，將影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的snp分子標(biāo)記應(yīng)用在選育/輔助選育有關(guān)總?cè)轭^數(shù)性狀的大白豬品種/品系的試劑中。

9、本申請公開的第四方面，將影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的snp分子標(biāo)記應(yīng)用在選育有關(guān)大白豬總?cè)轭^數(shù)性狀的品種/品系中。

10、本申請公開第五個(gè)方面，一種提高生豬總?cè)轭^數(shù)的選育方法，包括如下步驟：

11、（1）基于國際豬基因組11.1版本參考序列，檢測確定豬群體的種豬13號染色體第10512725位點(diǎn)的基因型；

12、（2）選擇第10512725個(gè)位點(diǎn)為cg或gg基因型的種豬個(gè)體，淘汰該位點(diǎn)為cc基因型的種豬個(gè)體，以逐代提高該位點(diǎn)的等位基因g的頻率，從而提高后代種豬總?cè)轭^數(shù)。

13、在本公開的一些實(shí)施例中，所述豬種為大白豬及其合成系。

14、本申請實(shí)施例中提供的一個(gè)或多個(gè)技術(shù)方案，至少具有如下任一技術(shù)效果或優(yōu)點(diǎn)：

15、本申請確定了影響大白豬總?cè)轭^數(shù)相關(guān)的分子標(biāo)記位于豬的13號染色體上的核苷酸序列第10512725個(gè)堿基存在c/g轉(zhuǎn)換類型的單核苷酸多態(tài)性變異，驗(yàn)證了其對總?cè)轭^數(shù)性狀的影響效應(yīng)，通過優(yōu)選該分子標(biāo)記的優(yōu)勢等位基因，提出了一種提高生豬總?cè)轭^數(shù)的選育方法，建立了準(zhǔn)確高效的分子標(biāo)記輔助選擇方法，能夠?qū)Υ蟀棕i的總?cè)轭^數(shù)這一數(shù)量性狀加以遺傳改良，提高后代豬的繁殖性能，并縮短了改良時(shí)間，有效提高養(yǎng)豬行業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益。

技術(shù)特征：

1.一種影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的snp分子標(biāo)記，其特征在于，基于國際豬基因組11?.1版本參考序列，于13號染色體第10512725個(gè)堿基存在c/g轉(zhuǎn)換類型的單核苷酸多態(tài)性變異。

2.一種利用權(quán)利要求1所述snp分子標(biāo)記選擇/鑒定有關(guān)大白豬總?cè)轭^數(shù)性狀的方法，其特征在于，包括以下步驟：

3.權(quán)利要求1所述影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的snp分子標(biāo)記在制備選育/鑒定有關(guān)總?cè)轭^數(shù)性狀的大白豬品種/品系的試劑中的應(yīng)用。

4.權(quán)利要求1所述影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的snp分子標(biāo)記在選育有關(guān)大白豬總?cè)轭^數(shù)性狀的品種/品系中的應(yīng)用。

5.一種提高生豬總?cè)轭^數(shù)的選育方法，其特征在于，包括如下步驟：

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的選育方法，其特征在于，所述種豬為大白豬及其合成系。

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明申請公開了一種影響大白豬總?cè)轭^數(shù)的SNP分子標(biāo)記及應(yīng)用，旨在解決當(dāng)前對母豬總?cè)轭^數(shù)相關(guān)性狀缺乏基因研究的技術(shù)問題。本發(fā)明申請利用豬全基因組序列以及高密度SNP芯片數(shù)據(jù)，基于豬全基因組關(guān)聯(lián)分析策略檢測到了與一種與大白豬總?cè)轭^數(shù)顯著相關(guān)的分子標(biāo)記，該分子標(biāo)記基于國際豬基因組11?.1版本參考序列第13號染色體第10512725位存在C/G突變。通過逐代篩選該SNP位點(diǎn)的優(yōu)勢等位基因，能夠提高優(yōu)勢等位基因頻率，進(jìn)而提升豬總?cè)轭^數(shù)，加快豬遺傳改良進(jìn)度，從而以有效提高豬養(yǎng)殖的經(jīng)濟(jì)效益。

技術(shù)研發(fā)人員：喬瑞敏,凌占業(yè),杜明遠(yuǎn),胡潘陽,吳相哲,石麗丹,張孟浩,王小女,余彤,柏峻,王一寧,韓雪蕾,王克君,李秀領(lǐng),楊峰,李新建
受保護(hù)的技術(shù)使用者：河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日：
技術(shù)公布日：2025/1/6