本發(fā)明涉及松材線蟲(chóng)的分子檢測(cè),尤其涉及用于檢測(cè)松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)的lamp引物組和試劑盒,還涉及所述lamp引物組、試劑盒在檢測(cè)松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)中的應(yīng)用,屬于松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)的分子檢測(cè)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
松材線蟲(chóng)病(pinewiltdisease),又被稱(chēng)為松樹(shù)萎蔫病、枯萎病,該病由松材線蟲(chóng)[bursaphelenchusxylophilus(steiner&buhrer)nickle]引起,主要通過(guò)墨天牛屬(monochamus)昆蟲(chóng)在松樹(shù)上取食和產(chǎn)卵進(jìn)行自然傳播以及病木、病木加工木的運(yùn)輸進(jìn)行長(zhǎng)距離傳播。林區(qū)內(nèi)松材線蟲(chóng)的傳播主要靠松墨天牛,可為害包括松屬(pinusspp.)、落葉松屬(larixspp.)、云杉屬(piceaspp.)、黃杉屬(pseudotsugaspp.)、冷杉屬(abiesspp.)和雪松屬(cedrusspp.)的36種松屬植物和8種非松屬植物,其中松屬植物是最主要的寄主。由于其危害極其嚴(yán)重而目前又缺乏有效的防治方法,被多個(gè)國(guó)家列為頭號(hào)檢疫對(duì)象。
形態(tài)學(xué)是線蟲(chóng)種類(lèi)常規(guī)鑒定的標(biāo)準(zhǔn)方法,松材線蟲(chóng)的鑒定主要依靠成蟲(chóng)的形態(tài)特征。但是,通過(guò)形態(tài)學(xué)準(zhǔn)確鑒定松材線蟲(chóng)成蟲(chóng)對(duì)于非專(zhuān)業(yè)人員相當(dāng)困難,且無(wú)法對(duì)幼蟲(chóng)進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定。由于形態(tài)學(xué)的限制,免疫學(xué)、生理生化和分子生物學(xué)方法被應(yīng)用到松材線蟲(chóng)的鑒定上。
松墨天牛是松材線蟲(chóng)病最重要的傳播媒介,攜帶的是松材線蟲(chóng)幼蟲(chóng),且攜帶的線蟲(chóng)有多種,難以根據(jù)形態(tài)學(xué)特征來(lái)區(qū)分和鑒定松材線蟲(chóng)幼蟲(chóng)。準(zhǔn)確診斷松墨天牛攜帶的松材線蟲(chóng)是監(jiān)測(cè)松材線蟲(chóng)病發(fā)生蔓延過(guò)程中急需解決的難題。分子生物學(xué)技術(shù)的引入,克服了形態(tài)學(xué)的一些限制,實(shí)現(xiàn)快速鑒定。松墨天牛攜帶的松材線蟲(chóng)分子檢測(cè)技術(shù)的開(kāi)發(fā),對(duì)于及時(shí)發(fā)現(xiàn)早期疫點(diǎn),有效的將松材線蟲(chóng)病控制在一定的范圍內(nèi),縮小松材線蟲(chóng)病的發(fā)生,降低防治成本,具有重要的意義;同時(shí)為松材線蟲(chóng)病的總體預(yù)警與控制策略提供依據(jù)。
目前,松材線蟲(chóng)的檢測(cè)與鑒定主要以分子生物學(xué)的方法為主。其中,dna探針技術(shù)雖能有效地鑒定松材線蟲(chóng),但費(fèi)用較高,具有放射性;rapd技術(shù)分析松材線蟲(chóng)與近似種的關(guān)系,結(jié)果重復(fù)性較差;rflp技術(shù)區(qū)分松材線蟲(chóng)和擬松材線蟲(chóng),內(nèi)切酶價(jià)格昂貴、耗時(shí);熒光pcr靈敏、快速,但較昂貴;pcr技術(shù)操作簡(jiǎn)便、花費(fèi)較少,但所需時(shí)間也較長(zhǎng)。
環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(loop-mediatedisothermalamplification,簡(jiǎn)稱(chēng)lamp)是2000年日本榮研化學(xué)株式會(huì)的notomit等開(kāi)發(fā)的一種新的核酸擴(kuò)增方法,該方法針對(duì)靶基因的6個(gè)區(qū)域設(shè)計(jì)了2對(duì)特異的引物,引物在鏈置換dna聚合酶(bstdnapolymerase)的作用下在恒溫條件(65℃左右)下保溫幾十分鐘,因其獨(dú)特的反轉(zhuǎn)設(shè)計(jì),對(duì)自身進(jìn)行鏈置換無(wú)限擴(kuò)增;整個(gè)反應(yīng)過(guò)程1個(gè)小時(shí)內(nèi)即可完成,其間不需要模板的熱變性、退火、溫度循環(huán)等過(guò)程,擴(kuò)增具有高特異性、等溫快速的特點(diǎn)。因此,相較以上幾種分子檢測(cè)技術(shù),lamp擴(kuò)增不需要昂貴的儀器和試劑,更利于在一些基層機(jī)構(gòu)的應(yīng)用。
syg-2基因是編碼多功能細(xì)胞粘附因子的基因。syg-1和syg-2存在于所有動(dòng)物類(lèi)群中,從突觸的形成到過(guò)濾防御屏障的建立,參與多種主要的生理功能。以松材線蟲(chóng)的syg-2基因?yàn)榘袠?biāo)設(shè)計(jì)特異性引物,對(duì)松墨天牛攜帶的松材線蟲(chóng)進(jìn)行l(wèi)amp快速擴(kuò)增,將對(duì)于松材線蟲(chóng)的快速鑒定及有效防控具有重要意義。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明所要解決的第一個(gè)技術(shù)問(wèn)題是提供用于檢測(cè)松材線蟲(chóng)的lamp引物組;
本發(fā)明所要解決的第二個(gè)技術(shù)問(wèn)題是提供一種松材線蟲(chóng)的lamp檢測(cè)試劑盒;
本發(fā)明所要解決的第三個(gè)技術(shù)問(wèn)題是建立一種松材線蟲(chóng)的lamp快速檢測(cè)方法。
為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明所采取的技術(shù)方案是:
本發(fā)明首先公開(kāi)了用于檢測(cè)松材線蟲(chóng)的lamp引物組,所述lamp引物組選自以下2組引物中的任意一組:
引物組(1):包括一對(duì)外引物和一對(duì)內(nèi)引物;所述外引物對(duì)由核苷酸序列為seqidno.1所示上游外引物和seqidno.2所示下游外引物組成;所述內(nèi)引物對(duì)由核苷酸序列為seqidno.3所示上游內(nèi)引物和seqidno.4所示下游內(nèi)引物組成;
引物組(2):包括一對(duì)外引物、一對(duì)內(nèi)引物和一對(duì)環(huán)引物;所述外引物對(duì)由核苷酸序列為seqidno.1所示上游外引物和seqidno.2所示下游外引物組成;所述內(nèi)引物對(duì)由核苷酸序列為seqidno.3所示上游內(nèi)引物和seqidno.4所示下游內(nèi)引物組成;所述環(huán)引物對(duì)由核苷酸序列為seqidno.5所示上游環(huán)引物和seqidno.6所示下游環(huán)引物組成。
優(yōu)選的,所述檢測(cè)樣品是松墨天牛。
本發(fā)明經(jīng)ncbi比對(duì)松材線蟲(chóng)和擬松材線蟲(chóng)的syg-2基因片段,發(fā)現(xiàn)該段基因在松材線蟲(chóng)種內(nèi)保守,與擬松材線蟲(chóng)種間差異極其大。因此,本發(fā)明以松材線蟲(chóng)的syg-2基因?yàn)榘谢?,設(shè)計(jì)了16組lamp引物。對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果證明,16號(hào)引物組不加環(huán)引物(即本發(fā)明所述引物組(1)),擴(kuò)增不出擬松材線蟲(chóng),對(duì)松材線蟲(chóng)檢測(cè)的特異性好;而且16號(hào)引物組不加環(huán)引物,檢測(cè)松材線蟲(chóng)bx的出峰時(shí)間為25-30min,擴(kuò)增效率較高。16號(hào)引物組在加環(huán)引物的情況下(即本發(fā)明所述引物組(2)),可以擴(kuò)增出擬松材線蟲(chóng),對(duì)松材線蟲(chóng)檢測(cè)的特異性不好。
本發(fā)明所設(shè)計(jì)的8號(hào)引物組在不加環(huán)引物的情況下,也擴(kuò)增不出擬松材線蟲(chóng),其檢測(cè)松材線蟲(chóng)bx的出峰時(shí)間為15-20min,擴(kuò)增效率略?xún)?yōu)于16號(hào)引物組不加環(huán)引物。雖然4號(hào)引物組加環(huán)引物或者不加環(huán)引物,都不能擴(kuò)增出擬松材線蟲(chóng),但其擴(kuò)增效率不是最優(yōu);具體為,4號(hào)引物組加環(huán)引物檢測(cè)松材線蟲(chóng)bx的出峰時(shí)間為20-25min;4號(hào)引物組不加環(huán)引物檢測(cè)松材線蟲(chóng)bx的出峰時(shí)間為30-35min。比較可見(jiàn),在不加環(huán)引物的情況下,16號(hào)引物組的擴(kuò)增效率優(yōu)于4號(hào)引物組。另外,本發(fā)明所設(shè)計(jì)的1號(hào)、10號(hào)、13號(hào)和15號(hào)引物組加/不加環(huán)引物都能擴(kuò)增出擬松材線蟲(chóng),對(duì)松材線蟲(chóng)檢測(cè)的特異性差;3號(hào)和5號(hào)引物組在加環(huán)引物的情況下,可擴(kuò)增出擬松材線蟲(chóng),而不加環(huán)引物,均擴(kuò)增不出松材線蟲(chóng)和擬松材線蟲(chóng);其余7組引物加/不加環(huán)引物均不能擴(kuò)增出松材線蟲(chóng);可見(jiàn),上述引物組均不能用于松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)的檢測(cè)。
因此,本發(fā)明用于檢測(cè)松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)的lamp引物組優(yōu)選為16號(hào)引物組不加環(huán)引物,即引物組(1):包括一對(duì)外引物和一對(duì)內(nèi)引物;所述外引物對(duì)由核苷酸序列為seqidno.1所示上游外引物和seqidno.2所示下游外引物組成;所述內(nèi)引物對(duì)由核苷酸序列為seqidno.3所示上游內(nèi)引物和seqidno.4所示下游內(nèi)引物組成。
本發(fā)明所述的lamp引物組能夠應(yīng)用于檢測(cè)松墨天牛攜帶的松材線蟲(chóng)。
本發(fā)明進(jìn)一步公開(kāi)了一種松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)的lamp檢測(cè)試劑盒,包括:lamp引物組,2×rm(包括:tris-hcl,kcl,mgso4,(nh4)so4,tween20,betaine,dntps),sybrgreenⅰ,bstdna聚合酶和ddh2o;其中,所述lamp引物組選自本發(fā)明所述的lamp引物組,即16號(hào)引物組加環(huán)引物或者不加環(huán)引物,優(yōu)選為16號(hào)引物組不加環(huán)引物。
本發(fā)明所述的lamp檢測(cè)試劑盒能夠應(yīng)用于檢測(cè)松墨天牛攜帶的松材線蟲(chóng)。
本發(fā)明還公開(kāi)了一種松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)的lamp檢測(cè)方法,包括以下步驟:(1)提取待測(cè)松墨天牛的dna;(2)以提取的dna為模板,以本發(fā)明所述的lamp引物組(即16號(hào)引物組加環(huán)引物或者不加環(huán)引物)為擴(kuò)增引物,建立lamp反應(yīng)體系并置于實(shí)時(shí)熒光pcr儀中進(jìn)行pcr反應(yīng);(3)對(duì)反應(yīng)結(jié)果進(jìn)行判定:①收集熒光信號(hào),如果出現(xiàn)“s”型擴(kuò)增曲線,則判定為陽(yáng)性(有核酸擴(kuò)增,即待測(cè)松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng));如果無(wú)“s”型擴(kuò)增曲線,則判定為陰性(無(wú)核酸擴(kuò)增,即待測(cè)松墨天牛不攜帶松材線蟲(chóng));或者,②將pcr反應(yīng)產(chǎn)物滅活,加入顯色液混勻;如果呈現(xiàn)綠色,則判定為陽(yáng)性(有核酸擴(kuò)增,即待測(cè)松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng));如果呈現(xiàn)橙色,則判定為陰性(無(wú)核酸擴(kuò)增,即待測(cè)松墨天牛不攜帶松材線蟲(chóng))。
其中,當(dāng)所述lamp引物組為16號(hào)引物組不加環(huán)引物時(shí),lamp反應(yīng)體系包括:反應(yīng)體系的總體積為25μl;其中,2×rm12.5μl(包括:ph8.8的tris-hcl40mm,kcl20mm,mgso416mm,(nh4)so420mm,tween200.2%,betaine1.6m,dntps(2.8mm每種)),sybrgreeni0.5μl,40μm的上游內(nèi)引物1μl,40μm的下游內(nèi)引物1μl,10μm的上游外引物0.5μl,10μm的下游外引物0.5μl,8u/μl的bstdna聚合酶1μl,dna模板1μl,余量為ddh2o?;蛘?,當(dāng)所述lamp引物組為16號(hào)引物組加環(huán)引物時(shí),所述lamp反應(yīng)體系包括:反應(yīng)體系的總體積為25μl;其中,2×rm12.5μl,sybrgreeni0.5μl,40μm的上游內(nèi)引物1μl,40μm的下游內(nèi)引物1μl,10μm的上游外引物0.5μl,10μm的下游外引物0.5μl,20μm的上游環(huán)引物0.5μl,20μm的下游環(huán)引物0.5μl,8u/μl的bstdna聚合酶1μl,dna模板1μl,余量為ddh2o。
本發(fā)明所述lamp檢測(cè)方法中,所述pcr反應(yīng)的程序包括:63℃15s,63℃45s作為一個(gè)循環(huán);于63℃45s處收集熒光信號(hào)。所述滅活是85℃滅活3min。
應(yīng)用本發(fā)明所建立的松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)的lamp檢測(cè)方法,對(duì)江蘇南京采集的攜帶松材線蟲(chóng)的松墨天牛的檢出率分別為28.60%和43.75%。
本發(fā)明技術(shù)方案與現(xiàn)有技術(shù)相比,具有以下有益效果:
本發(fā)明以松材線蟲(chóng)種內(nèi)保守的syg-2基因?yàn)榘谢?,設(shè)計(jì)并篩選獲得能夠特異性區(qū)分松材線蟲(chóng)和擬松材線蟲(chóng)的lamp引物組。本發(fā)明進(jìn)一步利用該特異性lamp引物組建立一種松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)的lamp檢測(cè)方法,該方法能夠?qū)λ赡炫y帶的松材線蟲(chóng)進(jìn)行快速檢測(cè),不僅特異性高,而且操作簡(jiǎn)便、耗時(shí)短,成本低。本發(fā)明方法對(duì)于準(zhǔn)確診斷松墨天牛攜帶的松材線蟲(chóng),監(jiān)控松材線蟲(chóng)病的發(fā)生與蔓延以及對(duì)松材線蟲(chóng)病的總體預(yù)警與控制策略等均具有重要的意義。
附圖說(shuō)明
圖1為1號(hào)、4號(hào)和15號(hào)引物組不加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果;
圖2為8號(hào)和16號(hào)引物組不加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx的檢測(cè)結(jié)果;
圖3為8號(hào)和16號(hào)引物組不加環(huán)引物,對(duì)天牛檢測(cè)的結(jié)果;其中,nj1代表從江蘇南京采集的天牛攜帶松材線蟲(chóng)(6月21日批);nj2代表從江蘇南京采集的天牛攜帶松材線蟲(chóng)(6月24日批);
圖4為10號(hào)和13號(hào)引物組不加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果;
圖5為1號(hào)、8號(hào)、13號(hào)和15號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果;
圖6為3號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果;
圖7為4號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和天牛的檢測(cè)結(jié)果;其中,nj1代表從江蘇南京采集的天牛攜帶松材線蟲(chóng)(6月21日批);nj2代表從江蘇南京采集的天牛攜帶松材線蟲(chóng)(6月24日批);sd-1代表從山東采集的松材線蟲(chóng);js代表從江蘇采集的松材線蟲(chóng);jst-10代表從江蘇采集的松材線蟲(chóng);js和jst-10代表不同的株系;
圖8為5號(hào)和16號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果;
圖9為10號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合具體實(shí)施例來(lái)進(jìn)一步描述本發(fā)明,本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)和特點(diǎn)將會(huì)隨著描述而更為清楚。但是應(yīng)理解所述實(shí)施例僅是范例性的,不對(duì)本發(fā)明的范圍構(gòu)成任何限制。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)該理解的是,在不偏離本發(fā)明的精神和范圍下可以對(duì)本發(fā)明技術(shù)方案的細(xì)節(jié)和形式進(jìn)行修改或替換,但這些修改或替換均落入本發(fā)明的保護(hù)范圍。
實(shí)施例1松墨天牛攜帶松材線蟲(chóng)的lamp快速檢測(cè)方法的建立
1、材料與方法
1.1松墨天牛dna的提取
取松墨天牛成蟲(chóng)頭部及胸部組織0.2g放入2mlep管中,放入鋼珠研磨儀研磨5min(60hz);加入600μl3m異硫氰酸胍提取緩沖液,室溫裂解1h,期間顛倒混勻;加入600μltris-酚氯仿異戊醇(25:24:1),12000r/min離心10min;吸取上清液,加入600μl氯仿異戊醇(24:1),12000r/min離心10min;吸取上清液,加入600μl異丙醇-20℃沉淀20min,12000r/min離心10min;棄上清,70%乙醇清洗沉淀2次,每次12000r/min離心3min;吸干乙醇徹底干燥后,用60μlbufferte溶解dna,備用。
1.2lamp引物設(shè)計(jì)
經(jīng)ncbi比對(duì)松材線蟲(chóng)和擬松材線蟲(chóng)的syg-2基因片段,發(fā)現(xiàn)該段基因在松材線蟲(chóng)種內(nèi)保守,與擬松材線蟲(chóng)種間差異極其大。因此,syg-2可以作為松材線蟲(chóng)lamp檢測(cè)的新靶基因。
以syg-2基因?yàn)榘谢?,通過(guò)榮研公司的lamp引物在線設(shè)計(jì)軟件http://primerexplorer.jp/e/進(jìn)行了lamp引物設(shè)計(jì)。所設(shè)計(jì)的lamp引物組見(jiàn)表1。
表1以syg-2為靶基因設(shè)計(jì)的lamp引物
1.3lamp反應(yīng)
lamp反應(yīng)方法參照l(shuí)oopampdna擴(kuò)增試劑盒(eikenchemical),按下表反應(yīng)液配比構(gòu)建25μl的lamp反應(yīng)體系(表2)。
表2lamp反應(yīng)體系
上述試劑混勻后,加入20μl密封液,混勻離心,蓋緊管蓋。
1.4lamp反應(yīng)結(jié)果檢測(cè)
1.4.1實(shí)時(shí)熒光法
將反應(yīng)管放入實(shí)時(shí)熒光pcr儀,反應(yīng)程序?yàn)?3℃15s,63℃45s作為一個(gè)循環(huán),于63℃45s處收集熒光信號(hào),若有“s”型擴(kuò)增曲線,則判斷為陽(yáng)性(有核酸擴(kuò)增),若無(wú)“s”型擴(kuò)增曲線,則判斷為陰性(無(wú)核酸擴(kuò)增)。
1.4.2染色法
從實(shí)時(shí)熒光pcr儀中拿出反應(yīng)管,85℃滅活3min,然后將1μl顯色液滴在pcr管蓋中間,蓋緊管蓋。顛倒反應(yīng)管數(shù)次,使反應(yīng)混合液與顯色液充分混勻,觀察反應(yīng)液顏色。若呈現(xiàn)綠色則為陽(yáng)性(有核酸擴(kuò)增),呈現(xiàn)橙色則為陰性(無(wú)核酸擴(kuò)增)。
2、結(jié)果與分析
2.1lamp引物對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果
以syg-2為靶基因設(shè)計(jì)的lamp引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)表3。
表3lamp引物對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果
本發(fā)明所設(shè)計(jì)的16組引物,其中9組引物對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm進(jìn)行l(wèi)amp檢測(cè),結(jié)果為:
1號(hào)、10號(hào)、13號(hào)和15號(hào)引物組加/不加環(huán)引物都能擴(kuò)增出擬松材線蟲(chóng);
3號(hào)和5號(hào)引物組在加環(huán)引物的情況下,可擴(kuò)增出擬松材線蟲(chóng),而不加環(huán)引物,擴(kuò)增不出松材線蟲(chóng)和擬松材線蟲(chóng);
8號(hào)、16號(hào)引物組在加環(huán)引物的情況下,可擴(kuò)增出擬松材線蟲(chóng),而不加環(huán)引物,擴(kuò)增不出擬松材線蟲(chóng)。
4號(hào)引物組加/不加環(huán)引物都不能擴(kuò)增出擬松材線蟲(chóng),但擴(kuò)增效率不算最優(yōu)。
具體的,1號(hào)、4號(hào)和15號(hào)引物組不加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果(實(shí)時(shí)熒光擴(kuò)增曲線)見(jiàn)圖1;
8號(hào)和16號(hào)引物組不加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖2;8號(hào)和16號(hào)引物組不加環(huán)引物,對(duì)天牛的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖3;
10號(hào)和13號(hào)引物組不加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖4;
1號(hào)、8號(hào)、13號(hào)和15號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖5;
3號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖6;
4號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和天牛的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖7;
5號(hào)和16號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖8;
10號(hào)引物組加環(huán)引物,對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖9。
采用另外7組引物(即:2號(hào)、6號(hào)、7號(hào)、9號(hào)、11號(hào)、12號(hào)和14號(hào)引物組)對(duì)松材線蟲(chóng)bx和擬松材線蟲(chóng)bm進(jìn)行l(wèi)amp檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn),這7組引物無(wú)論加環(huán)引物或不加環(huán)引物都不能擴(kuò)增出松材線蟲(chóng)。
2.2攜帶松材線蟲(chóng)的松墨天牛檢出率
應(yīng)用本發(fā)明所述的16號(hào)引物組不加環(huán)引物,分別對(duì)2批松墨天牛進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果松墨天牛中松材線蟲(chóng)的檢出率分別為28.60%和43.75%(表4)。
表4松墨天牛中松材線蟲(chóng)的檢出率
sequencelisting
<110>中國(guó)林業(yè)科學(xué)院森林生態(tài)環(huán)境與保護(hù)研究所
<120>用于檢測(cè)松材線蟲(chóng)的lamp引物組、試劑盒及檢測(cè)方法
<130>bj-2003-170425a
<160>6
<170>patentinversion3.5
<210>1
<211>20
<212>dna
<213>artificalsequence
<400>1
gcctctttgtttcgcttaga20
<210>2
<211>18
<212>dna
<213>artificalsequence
<400>2
cgatcttggctttctccc18
<210>3
<211>42
<212>dna
<213>artificalsequence
<400>3
attgtcagcaagtgagtcttcccgcttgacatgtctctgtaa42
<210>4
<211>40
<212>dna
<213>artificalsequence
<400>4
aagtacggagcgaagatcacttaagcgtcggcttcacatt40
<210>5
<211>21
<212>dna
<213>artificalsequence
<400>5
atttcccaagtttctgctcct21
<210>6
<211>19
<212>dna
<213>artificalsequence
<400>6
aaggactctgtggtgcttg19