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一種葡萄斑點(diǎn)病毒熒光定量PCR檢測(cè)的專用引物和方法與流程

文檔序號(hào):12250097閱讀:來(lái)源:國(guó)知局

技術(shù)特征:

1.一種葡萄斑點(diǎn)病毒熒光定量PCR檢測(cè)的專用引物,其特征在于,包括引物GFkV23和引物GFkV24;其中,所述引物GFkV23的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述引物GFkV24的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

2.一種葡萄斑點(diǎn)病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法,其特征在于,通過(guò)PCR擴(kuò)增、克隆獲得陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品,然后以已知濃度的目的基因作為模板進(jìn)行熒光定量PCR反應(yīng),作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,用于測(cè)算出待測(cè)樣品中的病毒含量。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的葡萄斑點(diǎn)病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法,其特征在于,包括以下步驟:

1)提取GFkV毒源材料的總RNA,用Oligo(dT)反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,以該cDNA為模板,以GFkV23和GFkV24為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳后割膠回收,連接克隆載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,篩選并挑取含陽(yáng)性克隆的大腸桿菌進(jìn)行培養(yǎng),提取質(zhì)粒得到陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品;

2)陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品分別梯度稀釋至108,107,106,105,104copy/μL為模板,以GFkV23和GFkV24為引物進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增,以Ct值為縱坐標(biāo),以質(zhì)粒拷貝數(shù)為橫坐標(biāo),繪制得到標(biāo)準(zhǔn)曲線;

3)提取待測(cè)樣品的總RNA,以O(shè)ligo(dT)為引物反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,以該cDNA為模板,按照與步驟2)中完全相同的條件進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增,所得Ct值代入標(biāo)準(zhǔn)曲線公式得到待測(cè)樣品中GFkV基因組RNA的含量。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的葡萄斑點(diǎn)病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法,其特征在于,在步驟1)中,所述PCR反應(yīng)體系為:2×Ex Taq Mix 12.5μL,10μMGFkV23和GFkV24引物各1.0μL,cDNA 2.0μL,雙蒸水補(bǔ)足至25μL。

5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的葡萄斑點(diǎn)病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法,其特征在于,在步驟1)中,所述PCR反應(yīng)條件為:94℃3min;94℃30s,60℃30s,72℃20s,35cycles;72℃10min。

6.根據(jù)權(quán)利要求3所述的葡萄斑點(diǎn)病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法,其特征在于,在步驟2)中,陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品拷貝數(shù)與濃度的換算方式按照如下公式:拷貝數(shù)=濃度×10-9×6.02×1023/(質(zhì)粒堿基數(shù)×660),其中,拷貝數(shù)的單位為copy/μL,濃度的溫單位為ng/μL。

7.根據(jù)權(quán)利要求3所述的葡萄斑點(diǎn)病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法,其特征在于,在步驟2)中,所述熒光定量PCR反應(yīng)體系為:2×SYBR Green qPCR Mix10.0μL,10μM GFkV23和GFkV24各1.4μL,模板1.0μL,雙蒸水補(bǔ)足至20μL。

8.根據(jù)權(quán)利要求3所述的葡萄斑點(diǎn)病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法,其特征在于,在步驟2)中,所述熒光定量PCR反應(yīng)條件為:94℃3min;94℃5s,60℃15s,72℃20s,read,40cycles;65℃to 94℃,0.5℃/10s,read。

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