本發(fā)明屬于基因分型技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種檢測人類CYP1A2基因分型的引物及探針、試劑盒、方法。
背景技術(shù):
細(xì)胞色素P450超家族中,與藥物代謝相關(guān)的代謝酶主要是CYP1、CYP2、CYP3家族。CYP1A2是CYP1A亞家族的重要成員,是人肝臟中最重要的CYP酶之一,占肝臟CYP酶總量的13~15%。CYP1A2在肝組織中有特異性表達(dá),芳胺、雜環(huán)胺及一些含鹵烴化物均是其重要底物。具有遺傳多態(tài)性,存在個(gè)體、種族差異性,導(dǎo)致不同個(gè)體、種族的藥物代謝能力存在差異。CYP1A2*1F(-163C>A)位于1號內(nèi)含子,突變會(huì)增加CYP1A2的活性。CYP1A2的不同基因型直接影響藥物療效和毒副作用的強(qiáng)弱,因此根據(jù)CYP1A2的基因型來指導(dǎo)準(zhǔn)確、安全用藥具有重要的臨床意義。
用于檢測基因多態(tài)性的方法主要有測序法、PCR-RFLP(聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性)、基因芯片法、熒光定量PCR法。測序法結(jié)果準(zhǔn)確,但成本高、耗時(shí)長。PCR-RFLP通過酶切電泳的方法檢測基因多態(tài)性,成本低、結(jié)果直觀,但操作過程易受污染,導(dǎo)致錯(cuò)誤結(jié)果。基因芯片法通過核酸雜交檢測基因型,優(yōu)點(diǎn)是通量高,缺點(diǎn)是成本較高,操作繁瑣,結(jié)果難判讀。傳統(tǒng)熒光定量PCR法依據(jù)其原理不同可分為熒光PCR探針法和熒光PCR熔解曲線法。前者針對目標(biāo)SNP位點(diǎn)設(shè)計(jì)兩種探針,分別和野生型與突變型匹配,利用擴(kuò)增的Ct值差異來判讀基因型。后者針對目標(biāo)SNP位點(diǎn)設(shè)計(jì)一種探針,基于探針與目標(biāo)核酸之間雜交的準(zhǔn)確性(即SNP位點(diǎn)上不同堿基造成熔解溫度的差異)來判讀基因型。傳統(tǒng)的熒光定量PCR法檢測的準(zhǔn)確度依賴于探針與對應(yīng)的等位基因之間的親和程度的差別,即其溶解溫度(Tm)的差別,當(dāng)這種差別并不是很大時(shí),往往導(dǎo)致最終的檢測結(jié)果存在偏差,準(zhǔn)確度不高。隨著技術(shù)的不斷創(chuàng)新,一種基于瓣?duì)詈怂醿?nèi)切酶及雙熒光標(biāo)記探針的新型SNP檢測技術(shù)被開發(fā)出來。該方法采用具有瓣?duì)詈怂醿?nèi)切酶活性的DNA聚合酶,并利用這種聚合酶在切除瓣?duì)罱Y(jié)構(gòu)中的5’端單鏈時(shí)的切割位置位于瓣?duì)罱Y(jié)構(gòu)的雙鏈部分的第一個(gè)堿基和第二個(gè)堿基之間這一特性,結(jié)合修飾有雙重?zé)晒鈽?biāo)記及淬滅基團(tuán)的DNA探針,實(shí)現(xiàn)了用一個(gè)熒光探針檢測目標(biāo)核酸SNP位點(diǎn)上的分型。
目前針對CYP1A2基因分型的檢測方法局限上述基因芯片法、傳統(tǒng)熒光定量PCR探針法,其缺點(diǎn)越來越難以滿足臨床檢驗(yàn)的要求。在利用雙熒光標(biāo)記探針的新型SNP檢測技術(shù)檢測CYP1A2基因分型的研究,還沒有人報(bào)道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,通過自主設(shè)計(jì)引物和探針,并結(jié)合基于瓣?duì)詈怂醿?nèi)切酶及雙熒光標(biāo)記探針的新型SNP檢測技術(shù),提供一種檢測人類CYP1A2基因分型的引物及探針、試劑盒、方法,以解決目前針對CYP1A2基因分型檢測的局限性問題。
為了實(shí)現(xiàn)上述發(fā)明目的,本發(fā)明采用的技術(shù)方案如下:
用于檢測人類CYP1A2基因分型的引物及探針,包含以下核苷酸序列:
上游引物SEQ ID NO:1:5’-AAACTGAGATGATGTGTGGAGG-3’;
下游引物SEQ ID NO:2:5’-CACGCATCAGTGTTTATCAAA-3’;
探針SEQ ID NO:3:5’-GTGGGCCCAGGACGCATGGTAGATGGA-3’。
本發(fā)明提供的引物和探針能準(zhǔn)確檢測到CYP1A2基因突變位點(diǎn)區(qū)域。
本發(fā)明還提出一種檢測人類CYP1A2基因分型的試劑盒,所述試劑盒包含PCR反應(yīng)液,所述PCR反應(yīng)液包括上述引物及探針。
本發(fā)明提供的試劑盒成本低,使用簡單,能準(zhǔn)確檢測CYP1A2基因分型。
本發(fā)明還提供一種利用上述試劑盒檢測人類CYP1A2基因分型的方法,其包括如下步驟:
提取人基因組DNA;
將所述DNA與所述試劑盒配成反應(yīng)體系,進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增;
根據(jù)所述擴(kuò)增結(jié)果分析所述CYP1A2基因分型。
本發(fā)明提供的檢測CYP1A2基因分型的方法,用一條熒光探針即可檢測目標(biāo)核酸SNP位點(diǎn)上的多種分型,簡化了操作過程,節(jié)約了成本,檢測結(jié)果分辨率高、迅速準(zhǔn)確。
另外,本發(fā)明還提供利用上述試劑盒在檢測CYP1A2基因分型中的用途。該用途可破除現(xiàn)有CYP1A2基因分型檢測的局限性,相對現(xiàn)有技術(shù),更易滿足臨床檢驗(yàn)的要求。
附圖說明
圖1是CYP1A2基因-163位點(diǎn)野生型檢測結(jié)果圖;
圖2是CYP1A2基因-163位點(diǎn)純合突變型檢測結(jié)果圖;
圖3是CYP1A2基因-163位點(diǎn)雜合型檢測結(jié)果圖;
圖4是CYP1A2基因-163位點(diǎn)純合突變型對比試驗(yàn)檢測結(jié)果圖。
具體實(shí)施方式
為了使本發(fā)明要解決的技術(shù)問題、技術(shù)方案及有益效果更加清楚明白,以下結(jié)合附圖及實(shí)施例,對本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步詳細(xì)說明。應(yīng)當(dāng)理解,此處所描述的具體實(shí)施例僅僅用以解釋本發(fā)明,并不用于限定本發(fā)明。
本發(fā)明實(shí)施例提供一種用于檢測人類CYP1A2基因分型的引物及探針,包含以下核苷酸序列:
上游引物SEQ ID NO:1:5’-AAACTGAGATGATGTGTGGAGG-3’;
下游引物SEQ ID NO:2:5’-CACGCATCAGTGTTTATCAAA-3’;
探針SEQ ID NO:3:5’-GTGGGCCCAGGACGCATGGTAGATGGA-3’。
該探針第7個(gè)核苷酸到3’端之間的序列與目標(biāo)核酸上相應(yīng)序列互補(bǔ),該CYP1A2基因的突變?yōu)閏.-163C>A。本實(shí)施例的引物和探針能準(zhǔn)確檢測CYP1A2基因突變位點(diǎn)區(qū)域。
具體地,在探針5’端和3’端分別用兩種不同的熒光報(bào)告基團(tuán)標(biāo)記,優(yōu)選地,熒光報(bào)告基團(tuán)選自:FAM、HEX、TET、VIC、ROX、CY5、CY3、JOE、ALEX、CAL;在探針的第8位核苷酸位點(diǎn)用熒光淬滅基團(tuán)標(biāo)記。在本實(shí)施例中,DNA探針的5’端及3’端分別有一個(gè)發(fā)出綠色熒光(FAM)及紅色熒光(VIC)的基團(tuán)雙重標(biāo)記,而在SNP位點(diǎn)的下一個(gè)堿基(沿5’端到3’端的方向地8個(gè)堿基)上修飾有一個(gè)淬滅基團(tuán)(IDT公司的ZENTM Internal Quencher),該淬滅基團(tuán)能夠同時(shí)淬滅綠色熒光基團(tuán)及紅色熒光基團(tuán)的熒光。雙重?zé)晒鈽?biāo)記DNA探針上由SNP位點(diǎn)到其3’端之間的序列與目標(biāo)核酸上相應(yīng)序列互補(bǔ),而由SNP位點(diǎn)到其5’端之間的序列與目標(biāo)核酸上相應(yīng)序列不互補(bǔ),因此形成瓣?duì)罱Y(jié)構(gòu)。
本發(fā)明實(shí)施例還提供一種檢測人類CYP1A2基因分型的試劑盒,該試劑盒包含由上述引物及探針組成的PCR反應(yīng)液,其中:上游引物濃度為:0.1-0.5μM;下游引物濃度為:0.1-0.5μM;探針濃度為:0.1-0.5μM。具體在本實(shí)施例中,上游引物0.5μM;下游引物0.5μM;探針0.5μM。該試劑盒成本低,使用簡單,能準(zhǔn)確檢測CYP1A2基因分型。
具體地,該試劑盒還含有dNTPs,MgCl2。其中dNTPs濃度為:0.2-0.5mM;MgCl2濃度為:0.5-2.5mM;本實(shí)施例中,優(yōu)選dNTPs 0.5mM;MgCl2 2.5mM。具體地,該試劑盒還包含UNG酶和DNA聚合酶,該DNA聚合酶具有瓣?duì)詈怂醿?nèi)切酶活性。
由于DNA聚合酶具有瓣?duì)詈怂醿?nèi)切酶活性,當(dāng)正向引物被延伸至熒光探針處時(shí),熒光探針上不與目標(biāo)核酸互補(bǔ)的序列會(huì)被聚合酶切除。切割位置在瓣?duì)罱Y(jié)構(gòu)的雙鏈部分的第一個(gè)堿基和第二個(gè)堿基之間。當(dāng)目標(biāo)核酸上SNP位點(diǎn)的堿基與熒光探針上的對應(yīng)堿基互補(bǔ)時(shí),則在SNP位點(diǎn)和下一個(gè)堿基之間切除。因此,綠色熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,從而產(chǎn)生綠色熒光。隨著聚合酶繼續(xù)切割熒光探針上與目標(biāo)核酸互補(bǔ)的序列,淬滅基團(tuán)也與另一端的紅色熒光基團(tuán)分離,從而產(chǎn)生紅色熒光。因此,在綠色熒光基團(tuán)與紅色熒光基團(tuán)的發(fā)光效率大致上相同的情況下,若目標(biāo)核酸上的SNP位點(diǎn)的堿基與熒光探針上的對應(yīng)堿基互補(bǔ),測得的綠色熒光的強(qiáng)度與紅色熒光的強(qiáng)度大致上相等。當(dāng)目標(biāo)核酸的SNP位點(diǎn)上的堿基與熒光探針上相應(yīng)位置的堿基不互補(bǔ)時(shí),聚合酶在熒光探針上進(jìn)行切割的位置在修飾有淬滅基團(tuán)的堿基之后。因此,在熒光探針上不與目標(biāo)核酸互補(bǔ)的序列被切除下來之后,綠色熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)仍保留在該被切除下來的序列上,因此綠色熒光基團(tuán)的熒光仍舊被淬滅基團(tuán)淬滅,從而不產(chǎn)生綠色熒光,但淬滅基團(tuán)與紅色熒光基團(tuán)分離,從而產(chǎn)生紅色熒光,此時(shí)測得的綠色熒光的強(qiáng)度與紅色熒光的強(qiáng)度相比可忽略不計(jì)。當(dāng)核酸樣本中同時(shí)含有一半的SNP位點(diǎn)的堿基與熒光探針上的對應(yīng)堿基互補(bǔ)的目標(biāo)核酸和另一半的SNP位點(diǎn)的堿基不與熒光探針上的對應(yīng)堿基互補(bǔ)的目標(biāo)核酸,在這種情況下,SNP位點(diǎn)的堿基與熒光探針上的對應(yīng)堿基互補(bǔ)的目標(biāo)核酸同時(shí)產(chǎn)生綠色熒光和紅色熒光,而SNP位點(diǎn)的堿基不與熒光探針上的對應(yīng)堿基互補(bǔ)的目標(biāo)核酸只產(chǎn)生紅色熒光。由于兩種目標(biāo)核酸的含量相等,在綠色熒光基團(tuán)與紅色熒光基團(tuán)的發(fā)光效率大致上相同的情況下,測得的所述綠色熒光的強(qiáng)度約為紅色熒光的強(qiáng)度的一半。
本實(shí)施例的試劑盒檢測SNP的特異性來源于具有瓣?duì)詈怂醿?nèi)切酶活性的DNA聚合酶切除瓣?duì)罱Y(jié)構(gòu)時(shí)的切割位置的準(zhǔn)確性,而不是基于DNA探針與目標(biāo)核酸之間的雜交的準(zhǔn)確性(即SNP位點(diǎn)上不同堿基造成熔解溫度的差異),因此,該試劑盒檢測SNP的準(zhǔn)確性和可靠性顯著地高于現(xiàn)有技術(shù)。
本發(fā)明實(shí)施例的試劑盒反應(yīng)體系采用UNG-dUTP防污染系統(tǒng),其中,所屬UNG酶可以選擇性水解斷裂含有dU的雙鏈或單鏈DNA中的尿嘧啶糖苷鍵,形成的有缺失堿基的DNA鏈,在堿性介質(zhì)以及高溫下會(huì)進(jìn)一步水解斷裂,因此在反應(yīng)體系中加入適量dUTP,在PCR擴(kuò)增前,利用UNG酶作用能有效防止實(shí)驗(yàn)室內(nèi)擴(kuò)增產(chǎn)物導(dǎo)致的污染,從而對整個(gè)檢測體系包括樣品的濃度、干擾因素進(jìn)行質(zhì)量控制。且在95℃時(shí)UNG酶可被滅活,不影響后續(xù)PCR擴(kuò)增效果。
更具體地,本發(fā)明實(shí)施例試劑盒設(shè)置有陽性對照品和陰性對照品,陽性對照品包含兩種質(zhì)粒,陰性對照品為TE緩沖液。該兩種質(zhì)粒分別包含CYP1A2基因的-163C野生型核酸序列和-163A突變型核酸序列。兩種質(zhì)粒按摩爾濃度比1:1的比例組成。通過陽性、陰性對照,使本實(shí)施例技術(shù)方法更加準(zhǔn)確真實(shí)。
本發(fā)明實(shí)施例還提供一種檢測人類CYP1A2基因分型的方法,其包括如下步驟:
提取人基因組DNA;
將DNA與上述試劑盒配成反應(yīng)體系,進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增;
根據(jù)擴(kuò)增結(jié)果分析CYP1A2基因分型。
具體地,該反應(yīng)體系為40ul。其中,DNA質(zhì)量:10-500ng,優(yōu)選100ng;PCR反應(yīng)液34.5ul,混合酶0.5ul。熒光定量PCR擴(kuò)增的反應(yīng)程序?yàn)椋?0℃2min;95℃預(yù)變性2min;95℃變性15s;62℃延伸45s;35個(gè)循環(huán)。
本方法利用瓣?duì)詈怂醿?nèi)切酶結(jié)合雙重?zé)晒鈽?biāo)記DNA探針進(jìn)行熒光PCR反應(yīng)實(shí)現(xiàn)了用一條熒光探針檢測目標(biāo)核酸SNP位點(diǎn)上的多種分型,簡化了操作、節(jié)約了成本?;谠摲椒?,準(zhǔn)確檢測CYP1A2基因分型。
最后,根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,本發(fā)明人能理所當(dāng)然想到上述試劑盒在檢測CYP1A2基因分型中的用途。該用途可破除現(xiàn)有CYP1A2基因分型檢測的局限性,相對現(xiàn)有技術(shù),更易滿足臨床檢驗(yàn)的要求。
本發(fā)明先后進(jìn)行過多次試驗(yàn),現(xiàn)舉一部分試驗(yàn)結(jié)果作為參考對發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步詳細(xì)描述,下面結(jié)合具體實(shí)施例進(jìn)行詳細(xì)說明。
實(shí)施例1檢測人類CYP1A2基因分型的試劑盒
引物和探針設(shè)計(jì)
發(fā)明人根據(jù)NCBI人CYP1A2基因序列,設(shè)計(jì)能檢測-163位點(diǎn)基因多態(tài)性的引物和探針核苷酸序列如下:
上游引物SEQ ID NO:1:5’-AAACTGAGATGATGTGTGGAGG-3’;
下游引物SEQ ID NO:2:5’-CACGCATCAGTGTTTATCAAA-3’;
探針SEQ ID NO:3:5’-GTGGGCCCAGGACGCATGGTAGATGGA-3’。
其中,探針第7個(gè)核苷酸到3’端之間的序列與目標(biāo)核酸上相應(yīng)序列互補(bǔ),探針用雙熒光報(bào)告基團(tuán)標(biāo)記,其5’端用FAM標(biāo)記,3’端用VIC標(biāo)記,探針第8位T標(biāo)記淬滅基團(tuán)ZENTMInternal Quencher。
CYP1A2熒光定量PCR反應(yīng)液的配制
本實(shí)施例PCR反應(yīng)液濃度配置如下:緩沖液,dNTPs(含dUTP)0.5mM;MgCl2 2.5mM;上游引物0.5μM;下游引物0.5μM;探針0.5μM。
混合酶
試劑盒中,所用混合酶由尿嘧啶糖基化酶(UNG酶)和DNA聚合酶混合而成,其中,DNA聚合酶為具有瓣?duì)詈怂醿?nèi)切酶活性的DNA聚合酶,選自New England Biolabs公司的Taq DNA聚合酶。該組成的混合酶活性濃度為2-4U。
對照品
根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫CYP1A2基因-163位點(diǎn)基因多態(tài)性設(shè)計(jì)陽性對照品序列,合成序列,構(gòu)建DNA重組質(zhì)粒。CYP1A2陽性對照品包括2種質(zhì)粒分別為-163C野生型、-163A突變型。具體是由-163C野生型、-163A突變型重組質(zhì)粒按1:1混合而成。且陰性對照品為TE緩沖液。
根據(jù)上述的PCR反應(yīng)液、混合酶、對照品即組成本實(shí)施例提供的用于檢測人類CYP1A2基因分型的試劑盒。
需要說明的是:PCR反應(yīng)液中各組分的含量不限于上述濃度,只要滿足如下都可用于后續(xù)試驗(yàn),即:dNTPs濃度0.2-0.5mM;MgCl2濃度0.5-2.5mM;上游引物濃度0.1-0.5μM;下游引物濃度0.1-0.5μM;探針濃度0.1-0.5μM。
實(shí)施例2CYP1A2基因分型的熒光定量PCR檢測及分析
(一)人血液樣本基因組DNA的提取
本實(shí)施例利用深圳華因康基因科技有限公司寶安分公司生產(chǎn)的血液基因組提取純化試劑盒提取樣本DNA,具體操作如下:
(1)從提取試劑盒中取出1.5ml離心管若干個(gè),每個(gè)管加入抗凝血200μl。
(2)加入500μl緩沖液CLG溶液到抗凝血中,蓋緊離心管蓋,漩渦震蕩20s以上,充分顛倒混勻,必須充分混勻或漩渦震蕩以確保釋放基因組DNA。
(3)加入100μl緩沖液PP溶液,漩渦震蕩或來回顛倒10s。
(4)12,000g離心5min。
(5)從提取試劑盒中取出DNA純化柱,將步驟(4)中的上清液轉(zhuǎn)移至純化柱,8000g離心1min。為提高DNA提取量,離心后,濾液可再回倒離心一次。
(6)倒棄過柱后濾液,將DNA純化柱放入同一收集管中,往純化柱中加入750μl緩沖液WⅠ,室溫放置2min后,8000g離心1min(確認(rèn)緩沖液WⅠ已加入無水乙醇)。
(7)倒棄過柱后濾液,往純化柱中加入750μl Buffer緩沖液WⅡ,8000g離心1min(確認(rèn)緩沖液WⅡ已加入無水乙醇)。
(8)倒棄過柱后濾液,將純化柱12,000g離心2min。
(9)將純化柱轉(zhuǎn)移至新的1.5ml離心管中,室溫放置5min充分揮發(fā)乙醇。加70~100μl收集液EB(收集液EB預(yù)熱到65℃有利于提高DNA的洗脫效率),室溫放置1min,12,000離心2min洗脫基因組DNA??蓪⑦^柱后的洗脫液吸出再加到純化柱膜上,室溫放置1min,12,000g離心1min可以提高DNA的洗脫量。
最后,基因組DNA的濃度和質(zhì)量通過微量紫外分光光度計(jì)測定OD260和OD280吸光值(德國Implen的NanoPhotometerTMP-Clas微量分光光度計(jì)、北京凱奧科技發(fā)展有限公司的K2800核酸分析儀),DNA濃度在2ng/μl~100ng/μl;OD260/OD280值在1.5~2.0之間,滿足后續(xù)試驗(yàn)要求。
純化的DNA樣本在4℃保存不超過7天;未能及時(shí)檢測的DNA樣本于-20℃保存,保存時(shí)間不超過3個(gè)月;純化DNA樣本反復(fù)凍融不超過5次。
(二)試劑準(zhǔn)備
從試劑盒中取出PCR反應(yīng)液,在冰上解凍,計(jì)算每個(gè)反應(yīng)體系所需要的PCR反應(yīng)管數(shù),管數(shù)為N(N=n樣本數(shù)+1陰性對照+1陽性對照,N≥3)。按下表1分別取計(jì)算量的PCR反應(yīng)液和混合酶到合適的離心管中,顛倒混勻10次,2000g離心10秒,標(biāo)記不同的反應(yīng)體系。
表1
(三)加樣
陽性對照和陰性對照取出,在冰上解凍,在渦旋振蕩器混勻,2000g離心10秒。向所設(shè)定的PCR反應(yīng)管中分別加入樣本、陽性對照、陰性對照各5ul,蓋緊管蓋,并做好記錄?;靹蚋鱌CR反應(yīng)管中的PCR反應(yīng)體系和所加的樣本。將PCR反應(yīng)管2000g離心10秒。轉(zhuǎn)移至檢測區(qū),置于PCR儀上,記錄樣本擺放順序。
需要說明的是,上述樣本、陽性對照DNA質(zhì)量濃度在2ng/μl~100ng/μl之間,即每個(gè)反應(yīng)體系為10-500ng都可以滿足試驗(yàn)要求。
(四)PCR擴(kuò)增
ABI7500熒光定量PCR儀,選擇FAM(Reporter:FAM;Quencher:none)檢測通道;VIC(Reporter:VIC;Quencher:none)檢測通道。參比熒光(Passive Reference)設(shè)置為None,閾值線設(shè)為50000。
PCR擴(kuò)增程序:50℃2min;95℃預(yù)變性2min;95℃變性15s;62℃延長45s;35個(gè)循環(huán),在62℃45s時(shí)收集熒光,即熒光收集設(shè)置在“步驟3:62℃,45s”。
(五)檢測結(jié)果分析
如反應(yīng)體系檢測結(jié)果在VIC檢測通道無Ct或Ct大于37.5,則判斷樣本的基因組DNA濃度低于檢測限。當(dāng)反應(yīng)體系檢測結(jié)果在VIC檢測通道Ct小于或等于37.5的情況下,按以下表2判斷(即比較樣本FAM通道和VIC通道的熒光強(qiáng)度),CYP1A2基因分型如下表3所示。
表2
表3
在本實(shí)施例檢測結(jié)果中,CYP1A2基因-163位點(diǎn)的檢測結(jié)果有3種。如圖1所示:FAM熒光強(qiáng)度和VIC通道熒光強(qiáng)度相近,即-163位點(diǎn)為CC野生型;如圖2所示:FAM通道熒光強(qiáng)度相比VIC通道熒光強(qiáng)度可忽略不計(jì),即-163位點(diǎn)為AA純合突變型;如圖3所示:FAM熒光強(qiáng)度為VIC通道熒光強(qiáng)度一半,即-163位點(diǎn)為CA雜合型。
本實(shí)施例設(shè)計(jì)了普通TaqMan探針進(jìn)行對比試驗(yàn),針對野生(FAM標(biāo)記)及突變位點(diǎn)(VIC標(biāo)記)分別設(shè)計(jì)普通TaqMan探針。檢測純合突變型樣本的結(jié)果如圖4所示,F(xiàn)AM標(biāo)記的野生型匹配探針有明顯擴(kuò)增信號(理論上此時(shí)應(yīng)該沒有擴(kuò)增信號或可忽略不計(jì)),其結(jié)果相對本發(fā)明所設(shè)計(jì)的雙標(biāo)記探針準(zhǔn)確性明顯降低。
由此可知,該CYP1A2基因分型檢測方法,具有操作簡單、迅速、分辨率高、結(jié)果更準(zhǔn)確的特點(diǎn)。
以上所述僅為本發(fā)明的較佳實(shí)施例而已,并不用以限制本發(fā)明,凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi)所作的任何修改、等同替換和改進(jìn)等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。