本發(fā)明屬于生物醫(yī)學(xué)或生物制藥技術(shù)領(lǐng)域,涉及針對(duì)于PI3K的納米抗體及其編碼序列。
背景技術(shù):
1993年比利時(shí)科學(xué)家Hamers.R在駱駝體內(nèi)發(fā)現(xiàn),與傳統(tǒng)抗體相比,在駱駝血液中的抗體,有一半沒(méi)有輕鏈,只包含一個(gè)重鏈可變區(qū)(VHH)和兩個(gè)常規(guī)的CH2與CH3區(qū),是目前已知的可結(jié)合目標(biāo)抗原的最小單位??寺≡撝劓溈贵w的可變區(qū)得到最小的抗原結(jié)合片段,即納米抗體(Nanobody,Nb)。納米抗體的單域性質(zhì)使其較普通抗體具有以下獨(dú)特性能:1)分子量小,可穿透血腦屏障,較易作用于病灶區(qū);2)在原核或者真核系統(tǒng)中可高表達(dá);3)特異性強(qiáng)、親和力高;4)高耐熱性和化學(xué)穩(wěn)定性;5)對(duì)人的免疫原性弱。其在腫瘤、感染性疾病、腸炎、淀粉樣變疾病、血栓以及動(dòng)脈粥樣硬化病變的診斷和治療方面具有良好的應(yīng)用效果,同時(shí)可以顯著降低成本。納米抗體的以上特性使其在診斷檢測(cè)領(lǐng)域展現(xiàn)出廣闊的應(yīng)用前景。
乳腺癌是女性最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,全世界每年約有100多萬(wàn)婦女患有乳腺癌,平均每13分鐘就有一位女性死于乳腺癌。平均每?jī)煞职腌娂从幸晃慌员辉\斷為乳腺癌患者。我國(guó)女性乳腺癌發(fā)病率以每年3%-4%的速度遞增,其死亡率排在女性癌癥死亡率之首,患者明顯趨向年輕化。調(diào)查顯示,每8位女性中就有1位遭受乳腺癌的威脅。面對(duì)這一嚴(yán)峻形勢(shì),我國(guó)已將篩查乳腺癌疾病納入全民公共衛(wèi)生服務(wù)項(xiàng)目,以此來(lái)降低患病率及死亡率。在乳腺癌中PI3K-AKT通路的活化率高達(dá)70%,并且其在原發(fā)性和轉(zhuǎn)移性乳腺癌中發(fā)生都比較頻繁。目前常規(guī)檢測(cè)是對(duì)患者的活檢組織進(jìn)行定性、半定量方法免疫組化(IHC),但此法耗時(shí)較長(zhǎng)且操作繁瑣。因此為了及時(shí)對(duì)乳腺癌PI3K表達(dá)的特異性檢測(cè)過(guò)表達(dá)患者進(jìn)行個(gè)體化、靶向性有效的治療,制備乳腺癌PI3K的納米抗體來(lái)進(jìn)行疾病檢測(cè)及治療具有廣闊的前景。
目前,也沒(méi)有針對(duì)乳腺癌PI3K為靶標(biāo)的特異性納米抗體及臨床檢測(cè)試劑的研究報(bào)道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
發(fā)明目的:本發(fā)明所要解決的技術(shù)問(wèn)題是提供一種針對(duì)PI3K的納米抗體,同時(shí)提供該納米抗體的編碼序列及該納米抗體在制備檢測(cè)的應(yīng)用。
技術(shù)方案:本發(fā)明的技術(shù)方案為:
本發(fā)明的第一方面,提供了一種針對(duì)PI3K重鏈抗體VHH,包括框架區(qū)FR和互補(bǔ)決定區(qū)CDR,所述框架區(qū)FR選自下組的FR的氨基酸序列:SEQ ID NO:1所示的FR1,SEQ ID NO:2所示的FR2,SEQ ID NO:3所示的FR3,SEQ ID NO:4所示的FR4。
所述互補(bǔ)決定區(qū)CDR選自下組的CDR的氨基酸序列:SEQ ID NO:5所示的CDR1,SEQ ID NO:6所示的CDR2,SEQ ID NO:7所示的CDR3。
優(yōu)選地,所述的PI3K納米抗體的VHH鏈,它具有SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
本發(fā)明第二方面,一種針對(duì)PI3K重鏈抗體VHH,此抗體特異性識(shí)別PI3K抗原,包括一條具有SEQ ID NO:8所示氨基酸序列的VHH鏈。
本發(fā)明第三方面,提供了一種DNA分子,它編碼選自下組的蛋白質(zhì):本發(fā)明所述的PI3K重鏈抗體VHH。
優(yōu)選地,所述的DNA分子,其特征在于,它具有選自下組的DNA序列:SEQ ID NO:9。
有益效果:與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)如下:本發(fā)明將血液中提取的PI3K免疫新疆單峰駝,隨后利用該駱駝外周血淋巴細(xì)胞建立了針對(duì)于PI3K的納米抗體基因庫(kù),試驗(yàn)中將PI3K偶聯(lián)在酶標(biāo)板上,以此形式的抗原利用噬菌體展示技術(shù)篩選免疫性的納米抗體基因庫(kù)(駱駝重鏈抗體噬菌體展示基因庫(kù)),從而獲得了針對(duì)PI3K特異性的納米抗體基因,將此基因轉(zhuǎn)至大腸桿菌中,從而建立了能在大腸桿菌中高效表達(dá)的納米抗體株。
附圖說(shuō)明
圖1是PI3K納米抗體的基因電泳圖;其中泳道1是DNA分子標(biāo)準(zhǔn),泳道2是PCR擴(kuò)增重鏈抗體引導(dǎo)肽和抗體CH2之間的片段,PCR產(chǎn)物條帶約為700bp。
圖2是PI3K納米抗體的DNA瓊脂糖凝膠電泳圖,從左到右凝膠孔的DNA條帶分別是:第一道為1000bp的分子標(biāo)記,其余孔道為PCR擴(kuò)增重鏈抗體可變區(qū)片段產(chǎn)物,PCR產(chǎn)物條帶約為500bp;
圖3是是構(gòu)建的單域抗體文庫(kù)的插入率檢測(cè)結(jié)果,從左到右凝膠孔的DNA條帶分別是:第一道為DNA分子標(biāo)記,其余孔道為檢測(cè)插入片段的PCR產(chǎn)物,經(jīng)檢測(cè),該文庫(kù)的插入率達(dá)到90%以上。
圖4是用噬菌體的酶聯(lián)免疫方法(ELISA)篩選特異性單個(gè)陽(yáng)性克隆的模式圖;其中1是將PI3K蛋白偶聯(lián)在酶標(biāo)板上,2是納米抗體,3是鼠抗HA抗體,4是山羊抗小鼠堿性磷酸酶標(biāo)記的抗體,5是堿性磷酸酶顯色液。
圖5是表達(dá)的PI3K納米抗體,經(jīng)鎳柱樹(shù)脂凝膠親和層析純化后的SDS-PAGE的電泳圖;其中泳道1是蛋白分子標(biāo)準(zhǔn),其余泳道是 250毫摩爾咪唑洗脫液所洗脫下來(lái)的納米抗體,結(jié)果顯示PI3K納米抗體經(jīng)過(guò)該純化過(guò)程,其純度可達(dá)到95%以上。
圖6是PI3K納米抗體在不同環(huán)境溫度下的耐受性檢測(cè)。
具體實(shí)施方式
本發(fā)明首先將PI3K的可溶性蛋白作為抗原免疫一只新疆單峰駝,經(jīng)過(guò)5次免疫之后提取該單峰駝外周血淋巴細(xì)胞并構(gòu)建了PI3K特異的單域重鏈抗體文庫(kù)。將PI3K偶聯(lián)在NUNC酶標(biāo)板上,展示蛋白質(zhì)的正確空間結(jié)構(gòu),使得PI3K的抗原表位得以暴露出來(lái),以此形式的抗原利用噬菌體展示技術(shù)篩選PI3K免疫性的納米抗體基因庫(kù)(駱駝重鏈抗體噬菌體展示基因庫(kù)),而獲得了能在大腸桿菌中高效表達(dá)的納米抗體株。
下面結(jié)合具體實(shí)施例,進(jìn)一步闡述本發(fā)明。
實(shí)施例1
針對(duì)于PI3K的納米抗體文庫(kù)的構(gòu)建:
(1)首先合成抗原PI3K,用于免疫所用的PI3K的濃度為500μg/mL,每次免疫將0.5mgPI3K與弗氏佐劑等體積混合,免疫一只新疆單峰駝(句容圣龍家畜養(yǎng)殖廠),每周一次,共免疫5次,除第一次使用完全的弗氏佐劑(購(gòu)自sigma),剩余幾次全部使用弗式不全佐劑(購(gòu)自sigma),免疫過(guò)程中刺激B細(xì)胞表達(dá)抗原特異性的納米抗體。(2)5次免疫結(jié)束后,提取駱駝外周血淋巴細(xì)胞100mL并提取總RNA參照QIAGEN公司提供的RNA提取試劑盒。(3)按照Super-Script III FIRST STRANDSUPERMIX試劑盒說(shuō)明書,將提取的RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。用巢式PCR擴(kuò)增重鏈抗體的可變區(qū)片段:
第一輪PCR:
上游引物GTCCTGGCTGCTCTTCTACAAGGC
下游:GGTACGTGCTGTTGAACTGTTCC
擴(kuò)增重鏈抗體引導(dǎo)肽和抗體CH2之間的片段,54℃退火,25個(gè)循環(huán);結(jié)果如圖1顯示該片段的大小約為700bp,即從左到右的DNA條帶分別是:第一為DNA的分子Marker,第二單域抗體基因電泳帶約為700bp。
第二輪PCR:
以第一輪PCR產(chǎn)物作模板,
上游引物:GATGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGRGGAGG
下游引物:GGACTAGTGCGGCCGCTGGAGACGGTGACCTGGGT
擴(kuò)增重鏈抗體FR1區(qū)和長(zhǎng)、短鉸鏈區(qū)之間的片段(長(zhǎng)片段和短片段),60℃退火,17個(gè)循環(huán),回收目的片段,結(jié)果如圖2顯示,該片段的大小約為500bp,即從左到右的DNA條帶分別是:第一為DNA分子Marker,第二納米抗體基因電泳帶約為500bp。(4)使用限制性的內(nèi)切酶(購(gòu)自NEB)PstI及NotI酶切20μg pComb3噬菌體展示載體(Biovector供應(yīng))及10μg VHH并用T4 DNA連接酶(購(gòu)自TaKaRa公司)連接兩個(gè)片段。(5)將連接產(chǎn)物電轉(zhuǎn)化至電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞TG1(北京神州紅葉科技有限公司)中,構(gòu)建PI3K的納米抗體噬菌體展示文庫(kù)并測(cè)定庫(kù)容,庫(kù)容的大小為3.1×108。與此同時(shí),通過(guò)菌落PCR檢測(cè)引物使用第二輪PCR引物,Tm55℃。文庫(kù)構(gòu)建完成后,為檢測(cè)文庫(kù)的插入率,隨機(jī)選取24顆克隆做菌落PCR。結(jié)果顯示插入率已達(dá)到90%以上。
實(shí)施例2
針對(duì)PI3K的納米抗體篩選過(guò)程:
(1)將溶解在PBS中的100μg/mL的PI3K包被在NUNC酶標(biāo)板上,4℃放置過(guò)夜,同時(shí)設(shè)立負(fù)對(duì)照。(2)第二天兩個(gè)孔中分別加入200μL1%牛奶,室溫封閉2小時(shí)。(3)2小時(shí)后,加入100μL噬菌體(8×1011tfu免疫駱駝納米抗體噬菌展示基因庫(kù)),在室溫下作用1小時(shí)。(4)用 PBST(PBS中含有0.05%吐溫20)洗5遍,以洗掉不結(jié)合的噬菌體。(5)用三乙基胺(100mM)將與PI3K特異性結(jié)合的噬菌體解離下,并感染處于對(duì)數(shù)期生長(zhǎng)的大腸桿菌TG1,產(chǎn)生并純化噬菌體用于下一輪的篩選,相同篩選過(guò)程重復(fù)2輪。結(jié)果如圖4顯示:在不斷地篩選的過(guò)程中,陽(yáng)性的克隆將不斷的被富集,從而達(dá)到了利用噬菌體展示技術(shù)篩取抗體庫(kù)中PI3K特異抗體的目的。
實(shí)施例3
用噬菌體的酶聯(lián)免疫方法(ELISA)篩選特異性單個(gè)陽(yáng)性克隆:
該實(shí)驗(yàn)的原理模式圖如圖4所示,具體檢測(cè)如下:
(1)從3-4輪篩選后含有噬菌體的細(xì)胞培養(yǎng)皿中,挑選96個(gè)單個(gè)菌落并接種于含有100μg/mL的氨芐青霉素的TB培養(yǎng)基(1L TB培養(yǎng)基中含有2.3g磷酸二氫鉀,12.52g磷酸氫二鉀,12g蛋白胨,24g酵母提取物,4mL甘油)中,生長(zhǎng)至對(duì)數(shù)期后,加終濃度1mmol的IPTG,28℃培養(yǎng)過(guò)夜。(2)利用滲透法獲得粗提抗體,并將抗體轉(zhuǎn)移到經(jīng)抗原包被的ELISA板中,在室溫下放置1小時(shí)。(3)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入一抗mouse anti-HA tag antibody(抗鼠抗HA抗體,購(gòu)自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司),在室溫下放置1小時(shí)。(4)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入二抗anti-mouse alkaline phosphatase conjugate(山羊抗小鼠堿性磷酸酶標(biāo)記抗體,購(gòu)自艾美捷科技有限公司),在室溫下放置1小時(shí)。(5)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入堿性磷酸酶顯色液,于ELISA儀上,在405nm波長(zhǎng),讀取吸收值。(6)當(dāng)樣品孔OD值大于對(duì)照孔OD值3倍以上時(shí),判為陽(yáng)性克隆孔。(7)將陽(yáng)性克隆孔的菌轉(zhuǎn)搖在含有100μg/mL的LB液體中以便提取質(zhì)粒并進(jìn)行測(cè)序。
根據(jù)序列比對(duì)軟件Vector NTI分析各個(gè)克隆株的基因序列,把CDR1,CDR2,CDR3序列相同的株視為同一克隆株,而其序列不同的株視為不同克隆株,最終得到氨基酸序列SEQ ID NO:8所示的納米抗體
實(shí)施例4
納米抗體在宿主菌大腸桿菌中表達(dá)、純化:
(1)將前面測(cè)序分析所獲得兩種納米抗體亞克隆至表達(dá)性的載體PET32a中,并將測(cè)序鑒定正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到表達(dá)型宿主菌DE3中,其涂布在含有100μg/mL氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基的板上,37℃過(guò)夜。(2)挑選單個(gè)菌落接種在15mL含有氨芐青霉素的LB培養(yǎng)液中,37℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜。(3)接種1mL的過(guò)夜菌種至330mLLB培養(yǎng)基中,37℃搖床培養(yǎng),培養(yǎng)到OD值達(dá)到0.6-1時(shí),加入IPTG,28℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜。(4)第二天,離心收菌。(5)將菌體破碎以獲得抗體粗提液。(6)經(jīng)鎳柱離子親和層析純化抗體蛋白,為獲得高純度的抗體,采用咪唑梯度洗脫法,低濃度咪唑洗脫液(50mmol)用于洗去雜帶,高濃度咪唑洗脫液(250mmol,500mmol)最終可制備純度達(dá)90%以上的蛋白。圖5所示從左到右的條帶分別是:第一為標(biāo)準(zhǔn)蛋白分子,第二第三250mmol咪唑的洗脫液洗脫的蛋白樣品;結(jié)果顯示,納米抗體經(jīng)過(guò)該純化后,其純度可達(dá)到95%以上。
實(shí)施例5
生物素化納米抗體及其純化方法:
(1)將針對(duì)PIK3的納米抗體基因片段亞克隆至pBAD載體上,隨后構(gòu)建好的質(zhì)粒pBAD與質(zhì)粒BirA共轉(zhuǎn)至大腸桿菌WK6中,并將其涂布在含有氨芐青霉素、氯霉素和葡萄糖的LB培養(yǎng)平板上,37℃培養(yǎng)過(guò)夜;(2)挑選單個(gè)菌落接種在5mL含有氨芐青霉素和氯霉素的LB培養(yǎng)液中,37℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜;(3)接種1mL的過(guò)夜菌種至330mL含氨芐青霉素和氯霉素的TB培養(yǎng)液中,37℃搖床培養(yǎng),培養(yǎng)到OD值達(dá)到0.4-0.5時(shí),加入330μl50mM的D-生物素(D-biotion)溶液,37℃慢搖1h;(4)加入終濃度為1mMIPTG,28℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜;(4)離心,收菌;(5)利用滲透法,獲得抗體粗提液;(6)使用鏈霉親和素磁珠純化偶聯(lián)生物素的納米抗體。
實(shí)施例6
PI3K納米抗體溫度耐受性檢測(cè):
(1)將PI3K納米抗體分別放置于不同溫度條件下:25℃ 24h,30℃ 24h,37℃ 24h,45℃ 24h,75℃ 1h,95℃ 1h;(2)將PI3K蛋白經(jīng)碳酸鹽透析后包被在酶標(biāo)板上,同時(shí)做空白孔對(duì)照(只包被NaHCO3);(3)將不同處理的PI3K納米抗體分別轉(zhuǎn)移到經(jīng)抗原包被的ELISA板中,在室溫下放置1h;(4)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入一抗mouse anti-HA tag antibody(抗鼠抗HA抗體,購(gòu)自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司),在室溫下放置1h;(5)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入二抗anti-mouse alkaline phosphatase conjugate(山羊抗小鼠堿性磷酸酶標(biāo)記抗體,購(gòu)自艾美捷科技有限公司),在室溫下放置1h;(6)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入堿性磷酸酶顯色液,放置于ELISA酶標(biāo)儀上,在405nm波長(zhǎng)讀取吸光度值。結(jié)果如圖6所示,PI3K納米抗體有較好的溫度耐受性,PI3K納米抗體的耐高溫特性也為我們之后結(jié)合光電化學(xué)免疫傳感器進(jìn)行高特異性和高靈敏度的檢測(cè)提供了可能。
實(shí)施例7
利用電阻抗檢測(cè)PIK3
(1)將玻碳電極先后用0.3和0.05μm的氧化鋁打磨,超聲,待用;(2)運(yùn)用傳統(tǒng)的三電極系統(tǒng),首先將電極放置在0.5M的H2SO4中反應(yīng),使之修飾帶有羧基官能團(tuán);之后用1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亞胺鹽酸鹽(EDC)和N-羥基琥珀酰亞胺(NHS)處理電極表面,使其在電極表面形成酰胺鍵。(3)在電極上滴加20μL溶解在pH7.4PBS中(100μg/mL)鏈霉親和素,室溫放置1h,在電 極上修飾鏈霉親和素。(4)在電極上孵育0.5%的BSA,室溫放置0.5h。(5)在電極表面修飾20μL上述添加生物素的納米抗體(100μg/mL),室溫放置1h。(6)在不同電極上分別滴加20μL梯度稀釋的PIK3(抗原濃度為0.05ng/mL、0.1ng/mL、0.5ng/mL、1ng/mL、100ng/mL、5ng/mL、10ng/mL),室溫孵育1小時(shí);(6)通過(guò)電化學(xué)工作站,測(cè)量不同濃度抗原所對(duì)應(yīng)的循環(huán)伏安(CV)和電阻抗值(EIS)。對(duì)電阻抗數(shù)據(jù)進(jìn)行擬合,得到PIK3的檢測(cè)線性?;诒緦?shí)驗(yàn),本發(fā)明所制備的納米抗體可以應(yīng)用于制備醫(yī)學(xué)檢測(cè)和診斷試劑用于定性或定量的檢測(cè)PIK3含量。
以上所述僅是本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方式,應(yīng)當(dāng)指出:對(duì)于本技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來(lái)說(shuō),在不脫離本發(fā)明原理的前提下,還可以做出若干改進(jìn)和潤(rùn)飾,這些改進(jìn)和潤(rùn)飾也應(yīng)視為本發(fā)明的保護(hù)范圍。
本發(fā)明提供一個(gè)PI3K納米抗體,每個(gè)納米抗體提供骨架區(qū)和互補(bǔ)決定區(qū),其中所述的骨架區(qū)FR1、FR2、FR3、FR4和互補(bǔ)決定區(qū)CDR1、CDR2、CDR3的核苷酸和氨基酸序列分別為:
PI3K納米抗體
骨架區(qū)和互補(bǔ)決定區(qū)的核苷酸序列:
FR1:CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGAGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCT
FR2: TGGTTCCGACAGGCTCCAGGGAAGCAGCGCGAGTGGGTCGCAGGT
FR3:TGCAGTGCCGCCTCCGTGAAGGGCCGGTTCACCATCTTCCAAGACGTCGCCAAGAACACGGTGTATCTCCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACTGCCGTATACTACTGT
FR4: TGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
CDR1: GGATACACCTCCAGTAGCAACTACATGGGA
CDR2: ATTGAAGCTCGTGCTGGTGGCACA
CDR3:GCGGCAGATTGGGTCCGGGGTGATTTTTGCTCAGGCGATGTTGACTTTCGTTAT
骨架區(qū)和互補(bǔ)決定區(qū)的氨基酸序列:
FR1: QVQLQESGGGSVQAGGSLRLSCAAS
FR2: WFRQAPGKQREWVAG
FR3: CSAASVKGRFTIFQDVAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYC
FR4: WGQGTQVTVSS
CDR1: GYTSSSNYMG
CDR2: IEARAGGT
CDR3: AADWVRGDFCSGDVDFRY
整體核苷酸序列:
CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGAGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATACACCTCCAGTAGCAACTACATGGGATGGTTCCGACAGGCTCCAGGGAAGCAGCGCGAGTGGGTCGCAGGTATTGAAGCTCGTGCTGGTGGCACATGCAGTGCCGCCTCCGTGAAGGGCCGGTTCACCATCTTCCAAGACGTCGCCAAGAACACGGTGTATCTCCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACTGCCGTATACTACTGTGCGGCAGATTGGGTCCGGGGTGATTTTTGCTCAGGCGATGTTGACTTTCGTTATTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
整體氨基酸序列: QVQLQESGGGSVQAGGSLRLSCAASGYTSSSNYMGWFRQAPGKQREWVAGIEARAGGTCSAASVKGRFTIFQDVAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYC AADWVRGDFCSGDVDFRY WGQGTQVTVSS