本申請(qǐng)涉及借助于測(cè)定材料的化學(xué)或物理性質(zhì)來(lái)測(cè)試或分析材料，尤其涉及一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)和多維環(huán)境大數(shù)據(jù)的遺傳分析方法。

背景技術(shù)：

1、遺傳分析是測(cè)定有關(guān)某一遺傳性狀的基因數(shù)目、基因性質(zhì)、屬于哪一連鎖群及其在染色體上的座位等的過(guò)程?，F(xiàn)有技術(shù)環(huán)境，黑條矮縮病毒會(huì)引起玉米粗縮病，但對(duì)于粗縮病的遺傳分析，尤其是遺傳變異分析多采用單獨(dú)的生物學(xué)方法，雖然可以對(duì)一定的遺傳特性有效分析，但是分析過(guò)程繁雜，過(guò)程中所需要的分析手段、材料等也十分復(fù)雜，這就導(dǎo)致單獨(dú)的生物學(xué)分析方法無(wú)法實(shí)現(xiàn)快速且準(zhǔn)確地玉米遺傳分析。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、發(fā)明人通過(guò)研究發(fā)現(xiàn)：玉米粗縮病是由水稻黑條矮縮病毒引起的一種世界范圍的重要病害，黑條矮縮病毒能夠侵染多種作物，包括水稻、玉米和小麥，各地爆發(fā)情況屢見(jiàn)報(bào)道，給當(dāng)?shù)赜衩咨a(chǎn)和全國(guó)的糧食安全帶來(lái)非常嚴(yán)重的破壞。

2、本申請(qǐng)的目的在于提供一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)和多維環(huán)境大數(shù)據(jù)的遺傳分析方法，通過(guò)病種分析模型、反轉(zhuǎn)錄模型以及生物學(xué)模型，來(lái)解決現(xiàn)有技術(shù)無(wú)法提供一種對(duì)于玉米粗縮病進(jìn)行快速且準(zhǔn)確地遺傳分析方法的技術(shù)問(wèn)題。

3、據(jù)本申請(qǐng)的一個(gè)方面，提供一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)和多維環(huán)境大數(shù)據(jù)的遺傳分析方法，該方法由處理器執(zhí)行，包括：

4、獲取目標(biāo)作物樣本，獲得第一樣本集；

5、對(duì)第一樣本集執(zhí)行篩選預(yù)設(shè)樣本，獲得預(yù)設(shè)樣本數(shù)據(jù)集，上報(bào)預(yù)設(shè)樣本數(shù)據(jù)集至云端數(shù)據(jù)庫(kù)；

6、對(duì)預(yù)設(shè)樣本執(zhí)行輸入分析模型，獲得分析數(shù)據(jù)集；

7、對(duì)分析數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入處理模型，獲得處理數(shù)據(jù)集；

8、對(duì)處理數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入生物學(xué)模型，獲得生物學(xué)數(shù)據(jù)集；

9、對(duì)生物學(xué)數(shù)據(jù)集執(zhí)行數(shù)據(jù)清洗，獲得純化數(shù)據(jù)集；

10、對(duì)純化數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入測(cè)序模型，獲得測(cè)序結(jié)果；

11、對(duì)測(cè)序結(jié)果執(zhí)行比對(duì)，依據(jù)比對(duì)結(jié)果，執(zhí)行遺傳分析。

12、在一些實(shí)施例中，所述目標(biāo)作物樣本至少包括玉米樣本。

13、在一些實(shí)施例中，所述的分析數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入處理模型，獲得處理數(shù)據(jù)集，具體為：對(duì)分析數(shù)據(jù)集基于目標(biāo)核苷酸序列的引物執(zhí)行反轉(zhuǎn)錄。

14、在一些實(shí)施例中，所述處理模型中配置有預(yù)設(shè)核苷酸序列的首引物。

15、在一些實(shí)施例中，所述的對(duì)處理數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入生物學(xué)模型，獲得生物學(xué)數(shù)據(jù)集，具體為：對(duì)生物學(xué)數(shù)據(jù)集輸入生物學(xué)模型，基于核苷酸序列的引物執(zhí)行rt-pcr，得到生物學(xué)數(shù)據(jù)集。

16、在一些實(shí)施例中，所述的生物學(xué)模型中配置有預(yù)設(shè)核苷酸序列的子引物和預(yù)設(shè)核苷酸序列的首引物。

17、在一些實(shí)施例中，所述的對(duì)生物學(xué)數(shù)據(jù)集執(zhí)行數(shù)據(jù)清洗至少包括：數(shù)據(jù)集純化處理。

18、在一些實(shí)施例中，所述的對(duì)測(cè)序結(jié)果執(zhí)行比對(duì)，至少包括采用多序列比對(duì)工具，分析比對(duì)出可信序列。

19、在一些實(shí)施例中，分析比對(duì)出的可信序列與預(yù)設(shè)序列執(zhí)行遺傳分析，具體包括：基于預(yù)設(shè)的水稻黑條矮縮病毒的序列，選用多序列比對(duì)工具，執(zhí)行遺傳分析。

20、在一些實(shí)施例中，所述的可信序列與預(yù)設(shè)序列執(zhí)行比對(duì)還可以采用dnaman執(zhí)行比對(duì)。

21、本申請(qǐng)與現(xiàn)有技術(shù)相比：本申請(qǐng)的方法聚焦于將生物化的分析方法轉(zhuǎn)化為模型智能化分析，突破傳統(tǒng)的生化分析方法，但完全基于現(xiàn)有的遺傳的分析邏輯與理論，實(shí)現(xiàn)對(duì)于目標(biāo)作物的高效準(zhǔn)確地遺傳分析，也即提供了一種高效的，面向作物的遺傳分析過(guò)程。

技術(shù)特征：

1.一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)和多維環(huán)境大數(shù)據(jù)的遺傳分析方法，該方法由處理器執(zhí)行，其特征在于，包括：

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的遺傳分析方法，其特征在于，所述目標(biāo)作物樣本至少包括玉米樣本。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的遺傳分析方法，其特征在于，所述的分析數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入處理模型，獲得處理數(shù)據(jù)集，具體為：對(duì)分析數(shù)據(jù)集基于目標(biāo)核苷酸序列的引物執(zhí)行反轉(zhuǎn)錄。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的遺傳分析方法，其特征在于，所述處理模型中配置有預(yù)設(shè)核苷酸序列的首引物。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的遺傳分析方法，其特征在于，所述的對(duì)處理數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入生物學(xué)模型，獲得生物學(xué)數(shù)據(jù)集，具體為：對(duì)生物學(xué)數(shù)據(jù)集輸入生物學(xué)模型，基于核苷酸序列的引物執(zhí)行rt-pcr，得到生物學(xué)數(shù)據(jù)集。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的遺傳分析方法，其特征在于，所述的生物學(xué)模型中配置有預(yù)設(shè)核苷酸序列的子引物和預(yù)設(shè)核苷酸序列的首引物。

7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的遺傳分析方法，其特征在于，所述的對(duì)生物學(xué)數(shù)據(jù)集執(zhí)行數(shù)據(jù)清洗至少包括：數(shù)據(jù)集純化處理。

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的遺傳分析方法，其特征在于，所述的對(duì)測(cè)序結(jié)果執(zhí)行比對(duì)，至少包括采用多序列比對(duì)工具，分析比對(duì)出可信序列。

9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的遺傳分析方法，其特征在于，分析比對(duì)出的可信序列與預(yù)設(shè)序列執(zhí)行遺傳分析，具體包括：基于預(yù)設(shè)的水稻黑條矮縮病毒的序列，選用多序列比對(duì)工具，執(zhí)行遺傳分析。

10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的遺傳分析方法，其特征在于，所述的可信序列與預(yù)設(shè)序列執(zhí)行比對(duì)還可以采用dnaman執(zhí)行比對(duì)。

技術(shù)總結(jié)
本申請(qǐng)涉及借助于測(cè)定材料的化學(xué)或物理性質(zhì)來(lái)測(cè)試或分析材料技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)和多維環(huán)境大數(shù)據(jù)的遺傳分析方法，該方法由處理器執(zhí)行，包括獲取目標(biāo)作物樣本，獲得第一樣本集；篩選預(yù)設(shè)樣本，獲得預(yù)設(shè)樣本數(shù)據(jù)集；對(duì)預(yù)設(shè)樣本執(zhí)行輸入分析模型，獲得分析數(shù)據(jù)集；對(duì)分析數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入處理模型，獲得處理數(shù)據(jù)集；對(duì)處理數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入生物學(xué)模型，獲得生物學(xué)數(shù)據(jù)集；對(duì)生物學(xué)數(shù)據(jù)集執(zhí)行數(shù)據(jù)清洗，獲得純化數(shù)據(jù)集；對(duì)純化數(shù)據(jù)集執(zhí)行輸入測(cè)序模型，獲得測(cè)序結(jié)果；對(duì)測(cè)序結(jié)果執(zhí)行比對(duì)，依據(jù)比對(duì)結(jié)果，執(zhí)行遺傳分析。本申請(qǐng)突破傳統(tǒng)生化分析方法，基于現(xiàn)有的遺傳的分析邏輯與理論，實(shí)現(xiàn)對(duì)于目標(biāo)作物的高效準(zhǔn)確地遺傳分析。

技術(shù)研發(fā)人員：李慧慧,何坤輝
受保護(hù)的技術(shù)使用者：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所
技術(shù)研發(fā)日：
技術(shù)公布日：2024/12/26