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基于RNAErnie預(yù)訓(xùn)練模型的RNAN4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法及系統(tǒng)

文檔序號:40613045發(fā)布日期:2025-01-07 20:59閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法,其特征在于,所述方法還包括:

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法,其特征在于,所述方法還包括:

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法,其特征在于,采集rna序列數(shù)據(jù)集之后,所述方法還包括:

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法,其特征在于,所述rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型建立在通過知識集成增強(qiáng)表示框架的基礎(chǔ)上,且結(jié)合transformer層和多頭自注意機(jī)制;其中:

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法,其特征在于,將所述rna序列數(shù)據(jù)集中的每條rna序列分別輸入至rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型中進(jìn)行多級掩碼,包括:

7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法,其特征在于,將所述編碼后的高維特征輸入至深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型中進(jìn)行特征降維,得到降維后的特征,包括:

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法,其特征在于,通過所述軟投票集成模型集成不同分類器的預(yù)測結(jié)果,得到rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測結(jié)果,包括:

9.一種基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測系統(tǒng),其特征在于,所述系統(tǒng)包括:

10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的基于rnaernie預(yù)訓(xùn)練模型的rnan4-乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測系統(tǒng),其特征在于,所述系統(tǒng)還包括模型評估模塊,用于確定評估指標(biāo),并根據(jù)所述評估指標(biāo)使用十折交叉驗(yàn)證方式對所述軟投票集成模型進(jìn)行性能評估,得到評估結(jié)果;其中,所述評估指標(biāo)包括靈敏性、特異性、準(zhǔn)確性、馬修斯相關(guān)系數(shù)、曲線下面積。


技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明涉及一種基于RNAErnie預(yù)訓(xùn)練模型的RNAN4?乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測方法及系統(tǒng)。所述方法包括:采集RNA序列數(shù)據(jù)集輸入至RNAErnie預(yù)訓(xùn)練模型中捕捉上下文依賴關(guān)系并提取出全局特征;通過RNAErnie預(yù)訓(xùn)練模型結(jié)合六種傳統(tǒng)特征編碼方法進(jìn)行特征編碼;通過深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型中進(jìn)行特征降維后輸入至軟投票集成模型中集成不同分類器的預(yù)測結(jié)果,得到RNAN4?乙酰胞苷修飾位點(diǎn)預(yù)測結(jié)果。通過RNAErnie預(yù)訓(xùn)練模型進(jìn)行多級掩碼,并結(jié)合六種傳統(tǒng)特征編碼方式可以捕捉到序列的細(xì)節(jié)和物理化學(xué)屬性;利用深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)自動進(jìn)行特征降維,減少了計(jì)算復(fù)雜度并保留了關(guān)鍵信息;將降維后的特征輸入軟投票集成模型,通過集成多個分類器得到最終預(yù)測結(jié)果,顯著提升了預(yù)測的準(zhǔn)確性和魯棒性。

技術(shù)研發(fā)人員:張子龍,賈艷娜,崔菲菲,耿奧運(yùn),付修豪
受保護(hù)的技術(shù)使用者:海南大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2025/1/6
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