專利名稱:利用熱激和四環(huán)素調(diào)控的ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)、重組表達(dá)載體及其制備方法和應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及基因工程領(lǐng)域,特別涉及利用熱激和四環(huán)素調(diào)控的ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)和應(yīng)用,還涉及含有ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)的重組表達(dá)載體及其制備方法和應(yīng)用。
背景技術(shù):
在獲得轉(zhuǎn)基因中,往往需要轉(zhuǎn)入目的基因,同時為了能將轉(zhuǎn)基因細(xì)胞和非轉(zhuǎn)基因細(xì)胞分開,還需要引入選擇標(biāo)記基因,選擇標(biāo)記基因一般為抗性基因。一方面,引入的抗性基因會因為基因漂移而帶來基因污染,例如形成超級雜草;另一方面,人們擔(dān)心轉(zhuǎn)基因食品中的抗性基因會影響人類的健康,因此刪除轉(zhuǎn)基因植物中的靶基因,特別是抗性基因成為轉(zhuǎn)基因植物研究的熱點。目前主要采用基因刪除系統(tǒng)刪除轉(zhuǎn)基因植物中的靶基因,主要有Cre/loxP、FLP/ FRT、R/RS等位點特異重組系統(tǒng)和轉(zhuǎn)座子刪除系統(tǒng),使用這些刪除系統(tǒng)刪除抗性基因存在周期長,工作量大,可控性差等問題。大腸桿菌TnlO轉(zhuǎn)座子中的四環(huán)素調(diào)控系統(tǒng)能夠通過四環(huán)素調(diào)控基因的表達(dá),目前已有將四環(huán)素調(diào)控系統(tǒng)用于調(diào)控真核基因的表達(dá),因此可以應(yīng)用于調(diào)控基因刪除系統(tǒng),但是該系統(tǒng)用于調(diào)控真核表達(dá)存在表達(dá)嚴(yán)密性和適應(yīng)性問題。植物熱激啟動子HSP為誘導(dǎo)型啟動子,在熱激條件下能被激活。擬南芥的熱激啟動子HSP18. 2 能夠通過控制溫度控制下游基因的表達(dá),但是多數(shù)熱激啟動子存在泄漏問題,同時對應(yīng)用環(huán)境要求高,因此用于控制基因刪除系統(tǒng)并不理想。理想的刪除系統(tǒng)不僅需要具有刪除周期短,工作量小,操作簡單等特點,還需要具有可控性好,精確度高等優(yōu)點。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明目的之一在于提供熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控系統(tǒng),通過溫度和四環(huán)素來調(diào)控 ntCre重組酶基因表達(dá),表達(dá)的ntCre重組酶能夠特異識別LoxP位點,從而刪除LoxP位點之間核酸序列,具有刪除周期短、能夠大大減少了工作量、可控性好等優(yōu)點。為了實現(xiàn)上述目的,技術(shù)方案為利用熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控的ntCre/LoxP刪除系統(tǒng),所述ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)包括ntCre重組酶特異識別的2個LoxP位點和位于2個LoxP位點之間的靶基因部分,所述2個LoxP位點分別為位于靶基因3’端的第一 LoxP位點和位于靶基因5’端的第二 LoxP 位點;還包括HSF70m啟動子調(diào)控的Iihsf基因表達(dá)盒和0m35S啟動子調(diào)控的ntCre重組酶基因表達(dá)盒部分,所述0m35S啟動子由Iihsf基因調(diào)控,所述HSF70m啟動子核酸序列如SEQ ID NO. 1所示,所述Misf基因核酸序列如SEQ ID N0. 24所示,所述0m35S啟動子核酸序列如SEQ ID N0. 8所示,所述LoxP位點核酸序列如SEQ ID N0. 25所示,所述ntCre重組酶基因核酸序列如SEQID N0. 26所示。進一步,所述ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)是所述第一 LoxP位點,靶基因,0m35S啟動子調(diào)控的ntCre重組酶基因表達(dá)盒,HSF70m啟動子調(diào)控的Iihsf基因表達(dá)盒和第二 LoxP位點順序串聯(lián)。進一步,所述靶基因為抗性標(biāo)記基因。本發(fā)明目的之二在于提供含ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)的重組表達(dá)載體,技術(shù)方案為含有所述ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)的重組表達(dá)載體。本發(fā)明目的之三在于提供重組表達(dá)載體的制備方法,技術(shù)方案為重組表達(dá)載體的制備方法,具體步驟如下將含有HSF70m啟動子調(diào)控的Iihsf基因表達(dá)盒和0m35S啟動子調(diào)控的ntCre重組酶基因表達(dá)盒部分連入pVCT2231載體的酶切位點處;所述pVCT2231載體由pCAMBIA1320載體、pVCT1191載體和pBIN19載體制備,具體步驟為從PVCT1191載體中克隆npt nm基因,并在npt nm基因3 ’端加上LoxP位點,獲得 npt II m-LoxP組件,然后將npt II m_LoxP組件替換pCAMBIA1302載體上的潮霉素抗性基因hptll,并將含LoxP位點的序列反向插入pCAMBIA1302載體,替換pCAMBIA1302載體的 35S啟動子和mGFP5基因編碼區(qū);同時從pBIN19載體中克隆Pnos啟動子,替換pCAMBIA1302 載體上調(diào)控hptll基因的2X35S啟動子,即得pVCT2231載體;所述pVCT1191載體由pCR2. 1-T0P0載體改造而來,具體為,刪除pCR2. 1-T0P0載體上氨芐抗性基因并自環(huán)化連接構(gòu)建的載體,即PVCT1191載體。進一步,所述pVCT2231載體制備具體步驟為(1)將所得npt II m-LoxP基因連入pMD18_T載體中,得pVCT1202載體,并用Mil 和B10I雙酶切所得的pVCT1202載體,瓊脂糖凝膠電泳并回收nptllm-LoxP組件,將回收的 npt II m-LoxP組件連入pCAMBIA1302載體的2個XhoI酶切位點之間,得pVCT2071載體;(2)克隆的所述Pnos啟動子,用Ml I和EcoR I酶切,瓊脂糖凝膠電泳并回收,將所得的Pnos啟動子連入所得pVCT2071載體的Bio I和EcoR I酶切位點之間,得pVCT2072 載體;(3)用NotI酶切所得pVCT1202載體,用Klenow Fragment酶補為平末端,再用)CbaI酶切,回收含LoxP位點的pVCT1202載體片段,同時用PmaCI和)(baI酶切所得 PVCT2072載體,回收含npt II m基因的pVCT2072載體片段,將回收的pVCT1202載體片段與pVCT2072載體片段連接,得pVCT2231載體。進一步,所述npt II m-LoxP組件的制備,具體步驟為(1)以所得pVCT1191載體為模板,上游引物如SEQ ID N0. 19所示核酸序列,下游引物如SEQ ID N0. 20所示核酸序列,進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性2分鐘, 95 0C變性10秒,52 0C退火20秒,72 °C延伸1分鐘20秒,3個循環(huán),再經(jīng)95 °C變性10秒,60 V 退火20秒,72°C延伸1分鐘20秒,27個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘,得nptnm基因;(2)以所得nptnm基因為模板,上游引物如SEQ ID N0. 19所示核酸序列,下游引物如SEQ ID N0. 21所示核酸序列,進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性2分鐘,95°C 變性10秒,46°C退火20秒,72°C延伸1分鐘20秒,3個循環(huán),再經(jīng)95°C變性10秒,60°C退火20秒,72°C延伸1分鐘20秒,27個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘,得npt I Im-LoxP組件。進一步,所述Pnos啟動子制備方法,具體步驟為以PBIN19載體為模板,上游引物為如SEQ ID N0. 22核酸序列,下游引物如SEQ ID N0. 23核酸序列,進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件為94°C預(yù)變性3分鐘,94°C變性20秒,57°C退火20秒,72°C延伸1分鐘30秒,35個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘,得Pnos啟動子。本發(fā)明目的之四在于提供ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)在植物轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用,技術(shù)方案為所述ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)在植物轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用。本發(fā)明目的之五在于提供重組表達(dá)載體在植物轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用,技術(shù)方案為所述重組表達(dá)載體在植物轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用。本發(fā)明有益效果在于本發(fā)明公開了利用熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控的ntCre/LoxP 刪除系統(tǒng),能夠在溫度和四環(huán)素調(diào)控下精確刪除LoxP位點之間的核酸序列,刪除周期短, 能夠在10周內(nèi)徹底刪除LoxP位點之間的核酸序列;便于控制,可以直接在不含四環(huán)素的培養(yǎng)基上調(diào)節(jié)溫度就能成功的刪除;并且同時利用熱激啟動子和四環(huán)素操縱子雙重調(diào)控, 克服了熱激啟動子表達(dá)泄露的缺點和溫度意外升高導(dǎo)致的實驗失敗,使用改造后的四環(huán)素操縱子克服了四環(huán)素操縱子在真核生物中表達(dá)嚴(yán)密性和適應(yīng)性的缺陷;本發(fā)明還公開了 ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)的重組載體及其制備方法,制備方法簡單,制得的重組載體使用方便, 可以使用農(nóng)桿菌介導(dǎo),轉(zhuǎn)化不同的植物,為植物轉(zhuǎn)基因提供了刪除靶基因的有利工具,特別是刪除抗性基因。
為了使本發(fā)明的目的、技術(shù)方案和優(yōu)點更加清楚,下面將結(jié)合附圖對本發(fā)明作進一步的詳細(xì)描述,其中圖1 pVCT2027載體構(gòu)過程圖;圖2熱激啟動子HSF70m在功能驗證圖(分別為在4°C、20°C、25°C、30°C、35°C、 40°C、40°C處理12小時,再用⑶S染液染色);圖3 HSF70m調(diào)控的Iihsf基因表達(dá)盒構(gòu)建過程圖;圖4熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控系統(tǒng)的構(gòu)建過程圖;圖5熱激和四環(huán)素雙重控制系統(tǒng)功能驗證圖(A-G,在MS培養(yǎng)基上,分別在5°C、 20°C、25°C、28°C、30°C、35°C、4(rC條件下處理12小時,H為在含有1. Omg/L四環(huán)素的MS培養(yǎng)基上,35°C條件下處理12小時);圖6熱激和四環(huán)素雙重控制系統(tǒng)調(diào)控效率驗證圖(A-E依次為在35°C條件下處理 1小時、2小時、3小時、4小時、5小時,再用GUS染液染色)圖7 pVCT2117載體構(gòu)建過程圖;圖8 pVCT2219載體構(gòu)建過程圖;圖9 pVCT2072載體構(gòu)建過程圖;圖10 pVCT2262載體構(gòu)建過程圖;圖11煙草中ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)驗證圖(圖A為只含150mg/L卡那霉素的培養(yǎng)基上培養(yǎng),圖B為在含有l(wèi)mg/L四環(huán)素和150mg/L卡那霉素的培養(yǎng)基培養(yǎng),在35°C條件下處理10周,圖C和D為轉(zhuǎn)基因煙草刪除后35°C條件下恢復(fù)10周)。
具體實施例方式以下將參照附圖,對本發(fā)明的優(yōu)選實施例進行詳細(xì)的描述。優(yōu)選實施例中未注明具體條件的實驗方法,通常按照常規(guī)條件,例如分子克隆實驗指南(第三版,J.薩姆布魯克等著,黃培堂等譯,科學(xué)出版社,2002年)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。實施例1、熱激啟動子HSP70m的構(gòu)建根據(jù)報道的擬南芥(Arabidopsis thaliana)熱激蛋白基因AtHSP70b (GenBank登錄號AC010924),對AtHsp70b基因的啟動子序列進行分析,分析發(fā)現(xiàn)AtHsp70b存在2個結(jié)構(gòu)上的問題(l)AtHsp70b中有一個生長素反應(yīng)元件(AuxRE),序列為TGTCTC,還有一個脫落酸(ABA)反應(yīng)元件(ABRE)的核心序列ACGT,因此在AtHsp70b:⑶S導(dǎo)入煙草后,在常溫下有表達(dá)泄漏;O)AtHsp70b中有一個熱激元件(HSF),但熱激元件的結(jié)構(gòu)不完善。因此對 AtHSP70b基因進行改進,構(gòu)建含有兩個標(biāo)準(zhǔn)熱激元件(HSE),兩個HSE之間含有59bp的序列,同時去除了 AtHSP70b上的AuxRE元件和ABRE元件,并將AtHSP70b中結(jié)構(gòu)不完善的熱激元件改造成nnGAAnnTTCnnGAAnn結(jié)構(gòu)的HSE,并與35S啟動子的核心序列,構(gòu)建為AtHSP70b 改造的熱激啟動子,命名為HSP70m啟動子,序列為5,-ggactgcaggtcgacgatttatatcccggt cggt gaatcttccagaactttc ttgtactttcgcgattactccacctttgcacaatcccctgggttgtgccacgaccttt t ttctcgaaatttctcgaaitRcatRacccttcctctatataaRRaaRttcatttcatttRRaRaRaacacRRRRRactcta 臓-3,(SEQ ID NO. 1),劃單線處分別為I^st I和Xba I位點,劃雙線處為標(biāo)準(zhǔn)熱激元件, 加粗tatata為35S啟動子的TATA盒。用EcoRI和HindIII雙酶切pUC18載體和pBI121載體,回收pUC18載體2635bp 片段,得pUC18載體酶切片段,回收PBI121載體的含β -葡萄糖苷酸酶基因GUS的表達(dá)盒, 得ρΒΙ121載體酶切片段,將pUC18載體酶切片段與Gus的表達(dá)盒用Τ4 DNA連接酶連接,反應(yīng)條件為16°C過夜,得pVCT2006載體。用)(ba I和I^st I酶切pVCT2006載體,瓊脂糖凝膠電泳,回收4810bp的pVCT2006載體骨架,同時人工合成如SEQ ID NO. 1所示序列的HSP70m 啟動子雙鏈DNA,并用)(ba I和I3St I酶切HSP70m啟動子,回收180bp的HSP70m啟動子,將 PVCT2006載體骨架與HSP70m啟動子用"Γ4 DNA連接酶于16°C連接過夜,得pVCT2027載體, 如圖1所示。PVCT2027載體測序結(jié)果表明在pVCT2027載體中⑶S基因的表達(dá)由HSP70m啟動表達(dá),Tnos終止子終止表達(dá),并將⑶S表達(dá)盒命名為HSP70m:⑶S。根據(jù)報道的pBmi9載體序列(GenBank accession U09365),設(shè)計含Pnos啟動子和nptll編碼區(qū)(簡稱Pnos: :nptll基因)的特異引物,上游引物序列為5,-G^aattcaggg agtcacgttatgac-3,(SEQ ID NO. 2),下劃線為EcoR I酶切位點,下游弓I物序列為5’ -cgctcg agtcccgctcagaagaac-3' (SEQ ID NO. 3),劃線處為 Xho I 酶切位點,使用 Prin^tar HS DNA 聚合酶,進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件95°C變性2分鐘,1個循環(huán);95°C變性10秒,退火 20秒,72°C延伸1分10秒,30個循環(huán);72°C延伸10分鐘。經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定回收,回收片段經(jīng)EcoR I和Xho I酶切后,回收1107bp的Pnos::nptII基因;同時用EcoR I和Xho I酶消化pCAMBIA1302載體,回收842^3ρ的pCAMBIA1302載體骨架;連接Pnos: :nptll基因和PCAMBIA1302載體骨架,得pVCT2020載體。用EcoR I和Hind III酶切所得pVCT2020 載體多克隆酶切位點處,回收9481bp的pVCT2020載體骨架,同時用EcoR I和Hind III酶切載體PVCT2027,回收2363bp的⑶S表達(dá)盒,將回收的⑶S表達(dá)盒與pVCT2020載體骨架用T4 DNA連接酶于16°C連接過夜,即將⑶S表達(dá)盒插入pVCT2020載體的多克隆位點處,得 PVCT2028 載體。將pVCT2(^8載體采用凍融法轉(zhuǎn)化根癌農(nóng)桿菌EHA105感受態(tài)細(xì)胞,得含pVCT2(^8
7載體的EHA105,將含pVCT2(^8載體的EHA105葉盤法轉(zhuǎn)化煙草,在含2. 5mg/L 6-BA和 150mg/L卡那霉素在MS培養(yǎng)基上進行抗性篩選,得抗卡那霉素的轉(zhuǎn)基因煙草。用打孔機將轉(zhuǎn)基因煙草葉片打取直徑約Icm大小的圓片,分別置于MS固體培養(yǎng)基上,將放有煙草葉片的培養(yǎng)基平均分成6個小組,分別在4°C、20°C、25°C、30°C、35°C、4(TC的條件下處理12小時。處理后的葉片用GUS染液進行染色檢測GUS酶活性,結(jié)果如圖2所示。結(jié)果表明在30°C 組和35°C組在處理后能被GUS染液染成藍(lán)色,而其他組不能被GUS染液染成藍(lán)色,表明熱激啟動子HSF70m在30 35 °C啟動能力強烈,熱激啟動子HSF70m在低于25 °C時不能誘導(dǎo) ⑶S基因表達(dá),在溫度高于40°C時也不能誘導(dǎo)⑶S基因表達(dá)。實施例2、構(gòu)建HSF70m啟動子調(diào)控Iihsf基因的表達(dá)盒根據(jù)報道的四環(huán)素阻遏蛋白基因(TetR)序列(GenBank accessionNo. J01830), 設(shè)計引物,上游引物為 5,-cctaggaattaatgatgtctagattag-3,(SEQ ID NO. 4),劃線處為內(nèi)切酶 Avr II 識別位點,下游引物為:5,-ggatccactttcacatttaagttg-3,(SEQ ID NO. 5), 劃線處為內(nèi)切酶BamH I識別位點,以大腸桿菌XLl-blue為模板,用高保真進行PCR擴增, PCR反應(yīng)條件為98°C預(yù)變性1分鐘;98°C變性10秒,50°C退火15秒,72°C延伸1分鐘,3個循環(huán);98°C變性10秒,55°C退火15秒,72°C延伸1分鐘,27個循環(huán),72°C延伸10分鐘。PCR 產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳,回收的TetR基因片段,回收片段加A后與pMD18_T載體 (Sangon,上海)連接,連接反應(yīng)用T4 DNA連接酶于16°C連接過夜,得pVCT1147載體,如圖3 所示。由于在設(shè)計引物時不含TetR基因3’端的taa終止密碼子,因此PCR擴增所得TetR 基因3’端不含taa終止密碼子,即不含終止密碼子的TetR基因。根據(jù)報道的擬南芥Columbia生態(tài)型的熱激轉(zhuǎn)錄因子基因,即HSFl基因(GenBank accession No. NC_003075),設(shè)計弓 |物,上游弓 |物為 5‘ -agatctcagcaattatctcagggtcaagg-3 ,(SEQ IDN0. 6),劃線處為內(nèi)切酶Bgl II識別位點,下游引物為S'-gagctctagtgttctgtttc tgatgtgag-3' (SEQID NO. 7),劃線處為內(nèi)切酶Sac I識別位點,以擬南芥Columbia基因組 DNA為模板,用高保真進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件為98°C預(yù)變性Imin ;98°C變性10s,50°C 退火15s,72°C延伸1. 5min, 3個循環(huán);98°C變性10s, 55°C退火15s,72°C延伸lmin, 27個循環(huán),72°C延伸IOmin PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳,回收l(^8bp的HSFl基因片段,回收片段加A后與pMDIS-T載體連接,連接反應(yīng)用T4 DNA連接酶于16°C連接過夜,得pVCT1148載體,如圖3所示。由于在設(shè)計HSFl基因擴增引物時不包含5,端DNA結(jié)合域(DNA Binding domain),因此擴增所得HSFl基因不含有5,端DNA結(jié)合域。用BamH I和Mc I酶切所得pVCT1147載體,瓊脂糖凝膠電泳,回收3302bp的 PVCT1147載體骨架;同時用Bgl II和Mc I酶切pVCT1148載體,瓊脂糖凝膠電泳,回收 1026bp的HSFl基因片段;將回收的PVCT1147載體骨架和HSFl基因片段連接,連接反應(yīng)用 T4 DNA連接酶于16°C連接過夜,得pVCT1150載體,如圖3所示。連接過程中TetR基因片段連入HSFl基因5,端構(gòu)成嵌合基因,即形成由TetR負(fù)調(diào)控HSFl基因的轉(zhuǎn)錄激活因子,并命名為Rhsf,核酸序列如SEQ ID N0. 24所示。用)(ba I和Me I酶切所得pVCT2027載體,瓊脂糖凝膠電泳,切去⑶S基因編碼區(qū),回收含HSF70m啟動子的pVCT2027載體骨架;同時用Avr II和&ic I酶切所得pVCT1150 載體,瓊脂糖凝膠電泳,回收1647bp的Iihsf片段;將回收的pVCT2027載體與Iihsf基因用T4 DNA連接酶于16°C連接過夜,即用Iihsf基因替換pVCT2027載體上的Gus基因,得pVCT2033載體,如圖3所示。所得pVCT2033載體中Iihsf基因由HSF70m啟動子調(diào)控表達(dá),終止子為 iTnos,將此結(jié)構(gòu)為HSF70m: :Rhsf: :Tnos,命名為HSF70m調(diào)控的Rhsf基因表達(dá)盒。實施例3、熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控系統(tǒng)的建立用Ml I和)(ba I酶切所得pVCT2027載體,瓊脂糖凝膠電泳,棄HSF70m啟動子,回收4820bp的pVCT2027載體骨架;同時根據(jù)四環(huán)素操縱子(TetO)中四環(huán)素阻遏蛋白(TetR)結(jié)合區(qū)(簡稱為Tet02-Tet01),將Tet02_Tet01替換HSF70m啟動子的2個HSE標(biāo)準(zhǔn)熱激元件,然后與35S微啟動子連接構(gòu)成0m35S啟動子,序列為 5,-agKtcgacgattcccggtCggt actctatcattgatagagttaactccctatcagtgatagagai ttgtacctttgcgcgat
tactccacctttgcacaatcccctgggttgtgccacgacctttt:i£l£lal£aflgaia£a^iM£l£££lal£ail£aia£Ma
tgcatgacccttcctctatataaggaagttcatttcatttggagagaacacgggggactctagagg-3, (SEQ ID NO. 8)劃單線處分別為Ml I和)(ba I位點,劃雙線處為四環(huán)素操縱子序列,tatata為TATA 盒。人工合成(SEQ ID NO. 8)所示0m35S啟動子雙鏈核苷酸,并用Ml I和)(ba I進行雙酶切,回收0m35S啟動子,將回收的0m35S啟動子與所得的pVCT2027載體骨架用T4 DNA連接酶在16 °C連接過夜,即用0m35S啟動子替換pVCT2027載體上的HSF70m啟動子,得pVCT2034 載體,如圖4所示。pVCT2034載體中0m35S啟動子由于含有jTetC^-iTetOl,因此Rhsf表達(dá)的蛋白質(zhì)能夠與0m35S啟動子結(jié)合,在不含有四環(huán)素條件下,能夠啟動0m35S啟動子調(diào)控的基因表達(dá)。用EcoR I和Hind III酶切所得pVCT2034載體,瓊脂糖凝膠電泳,回收M08bp的 0m35S啟動子調(diào)控的⑶S基因表達(dá)盒;將回收的⑶S基因表達(dá)盒與實施例1中回收的帶EcoR I和Hind III酶切位點的PVCT2020載體骨架連接,連接條件為用T4 DNA連接酶在16°C連接過夜,即用⑶S基因表達(dá)盒插入pVCT2034載體的多克隆酶切位點處,得PVCT2035載體, 如圖4所示。用Ml I和PmaC I酶切所得pVCT2035載體,瓊脂糖凝膠電泳,棄35S啟動子和 mGFP5基因編碼區(qū),回收10358bp的含0m35S啟動子調(diào)控的⑶S基因表達(dá)盒的pVCT2035載體骨架;同時用Ml I和Me I的同裂酶Ecll36 II酶切PVCT2033載體,瓊脂糖凝膠電泳, 回收M08bp的HSP70m啟動子和Iihsf基因片段,命名為HSP70m: :Rhsf ;將回收的pVCT2035 載體骨架與HSP70m: Ahsf片段連接,連接反應(yīng)在T4 DNA連接酶作用下16°C連接過夜,即將 HSP70m啟動子和Rhsf基因替換pVCT2035載體上的35S啟動子和mGFP5基因,得pVCT2041 載體,如圖4所示。所得pVCT2041載體中⑶S基因由0m35S啟動子調(diào)控表達(dá),還含有HSP70m 啟動子調(diào)控的Misf基因表達(dá)盒。至此,熱激和四環(huán)素雙重控制系統(tǒng)構(gòu)建成功。將pVCT2041載體采用凍融法轉(zhuǎn)化轉(zhuǎn)化根癌桿菌EHA105感受態(tài)細(xì)胞,得含 PVCT2041載體的EHA105。將煙草將含pVCT2041載體的EHA105菌液侵染葉盤法轉(zhuǎn)化煙草, 在含1. Omg/L四環(huán)素、150mg/L卡那霉素、2mg/L 6-BA的MS培養(yǎng)基固體培養(yǎng)基上進行抗性篩選,得抗卡那霉素的轉(zhuǎn)基因煙草。用打孔機將轉(zhuǎn)基因煙草葉片打取直徑約Icm的圓片, 分別置于MS培養(yǎng)基上,將放有煙草葉片的培養(yǎng)基平均分成7個組,分別在5°C、20°C、25°C、 觀°C、30°C、35°C、40V條件下處理12小時。并以放置在含1. Omg/L四環(huán)素的MS培養(yǎng)基35°C 處理12小時為對照,將處理后的葉片用GUS染液進行染色檢測GUS酶活性,結(jié)果顯示5°C、 20°C和25°C處理后不能檢測到⑶S活性,而在^°C、30°C、35°C和40°C處理能檢測到了⑶S 酶活性,對照組也不能檢測到GUS酶活性,結(jié)果如圖5所示。結(jié)果表明在溫度為條件下,在不含四環(huán)素的培養(yǎng)中GUS基因被成功誘導(dǎo)表達(dá),在含有四環(huán)素的培養(yǎng)基中不能被誘導(dǎo)表達(dá)。取轉(zhuǎn)基因煙草葉片,用在35°C條件下處理12小時,再用打孔機將轉(zhuǎn)基因煙草葉片打取直徑約Icm的圓片,置于不含1. Omg/L四環(huán)素MS培養(yǎng)基上,在35°C條件下分別處理1 小時、2小時、3小時、4小時、5小時,處理后的葉片用GUS染液進行染色檢測GUS酶活性,處理1小時、2小時、3小時均能檢測到GUS酶活性,處理4小時、5小時不能檢測到GUS酶活性,結(jié)果如圖6所示。結(jié)果表明,在HSF70m熱激啟動在溫度下在4小時內(nèi)能夠誘導(dǎo) ⑶S基因的表達(dá),其原因是四環(huán)素阻遏蛋白轉(zhuǎn)錄因子融合基因Misf表達(dá),融合基因Misf中的TetR基因與0m35S啟動子結(jié)合,誘導(dǎo)⑶S基因的表達(dá),因此能夠檢測到⑶S酶活性。在含有1. Omg/L四環(huán)素條件下,35°C誘導(dǎo)四環(huán)素阻遏蛋白轉(zhuǎn)錄因子融合基因Misf表達(dá)后與四環(huán)素結(jié)合并發(fā)生結(jié)構(gòu)改變,而不能與0m35S啟動子結(jié)合,因此不能誘導(dǎo)⑶S基因的表達(dá),而不能檢測到GUS酶活性。表明了熱激啟動子和四環(huán)素雙重調(diào)控系統(tǒng)的靈敏性較高,能夠?qū)⒁鸭せ畹南到y(tǒng)在4小時內(nèi)完全關(guān)閉。實施例4、熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控的ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)的構(gòu)建根據(jù)Pl噬菌體的Cre重組酶基因(GenBank accession X03453)序列,設(shè)計引物, 上游引物為5,-accatggccaatttactgaccgtacacc-3,(SEQ ID NO. 9),劃線處為 Nco I 位點;下游引物為 5,-gagctctaatcgccatcttccagca-3,(SEQ ID NO. 10),劃線處為 Sac I 位點。以大腸桿菌菌株BM25. 8(Clontech,美國)基因組DNA為模板,用I^rin^tar HS DNA聚合酶(TaKaRa,日本)進行PCR擴增,反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性2分鐘,95°C變性10秒,50°C 退火20秒,72 0C延伸1分鐘10秒,3個循環(huán),95 0C變性10秒,60 V退火20秒,72 °C延伸1分鐘10秒,27個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘;PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳,回收1040bp的 Cre重組酶基因,回收Cre基因加“A”尾后,連接pMD18_T載體,得pVCT1251載體,如圖7所不。用Xba I和Nco I酶切所得pVCT1251載體,回收3727bp的pVCT1251載體骨架; 同時人工合成含有擬南芥At4g01735基因內(nèi)含子和猴SV40病毒外殼蛋白T抗原核定位信
Wi^^ll IEIii5' -ctagaaccatggtccatacttggattgattttgaagcccaagaagaagagaaagct ggc-3’ (SEQ IDN0. 11),劃線部分為內(nèi)含子編碼序列,反義鏈為5’-catggccagctttctcttct tcttRRRcttcaaaatcaatccaaRtatRRaccatRRtt-3,(SEQ ID Ν0· 12),劃線部分為內(nèi)含子編碼序列,將人工合成的正義鏈和反義鏈在94°C變性3分鐘,退火至60°C保溫2分鐘,構(gòu)成上游含有)(ba I粘性末端,下游含有內(nèi)切酶Nco I粘性末端,中間為擬南芥At4g01735基因內(nèi)含子和猴SV40病毒外殼蛋白T抗原核定位信號的雙鏈DNA,將獲得的雙鏈DNA與回收的 PVCT1251載體骨架用T4 DNA連接酶在16°C條件下過夜連接,得pVCT1252載體,如圖7所示。pVCT1252載體中Cre基因上游插入了擬南芥At4g01735基因內(nèi)含子和猴SV40病毒外殼蛋白T抗原核定位信號,Cre基因表達(dá)的Cre重組酶能夠成功定位于細(xì)胞核中。用Xba I和Me I酶切所得pVCT2027載體,棄⑶S基因編碼區(qū),回收3106bp的 PVCT2027載體骨架;同時用)(ba I和Mc I酶切所得pVCT1252載體,回收含內(nèi)含子和核定位信號的Cre基因片段;將回收的PVCT2027載體骨架與Cre基因用T4 DNA連接酶在16°C 條件下過夜連接,即用含內(nèi)含子和核定位信號的Cre基因替換pVCT2027載體上的⑶S編碼區(qū),得PVCT2136載體,如圖7所示。
用EcoRV單酶切pVCT2136載體,從pVCT2136載體的Cre基因中間切開,瓊脂糖凝膠電泳,回收PVCT2136載體骨架;同是根據(jù)PCAMBIA1301載體序列,設(shè)計⑶S基因內(nèi)含子引物,上游引物為 5,-gtaaatttctagtttttctccttc-3’ (SEQ ID NO. 13),下游引物為 5,_ct gtaactatcatcatcatcatag-3’ (SEQ ID NO. 14),以 pCAMBIA1301 載體為模板進行 PCR 擴增, PCR反應(yīng)條件為反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性2分鐘,95°C變性10秒,53°C退火20秒,72°C延伸I分鐘10秒,3個循環(huán),95°C變性10秒,60°C退火20秒,72°C延伸I分鐘10秒,27個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘,回收190bp的內(nèi)含子片段;將回收的內(nèi)含子與PVCT2136載體骨架連接,連接反應(yīng)在為用T4 DNA連接酶在16°C條件下過夜連接,得pVCT2117載體,如圖7 所示。pVCT2117載體中⑶S基因內(nèi)含子插入pVCT2136載體的Cre基因內(nèi)部,形成擬南芥 At4g01735基因內(nèi)含子、猴SV40病毒外殼蛋白T抗原核定位信號和內(nèi)部含Gus內(nèi)含子的Cre 基因的結(jié)構(gòu),命名為ntCre基因,核苷酸序列如SEQ ID NO. 26所示。pVCT2117載體中ntCre 基因由HSP70m啟動子調(diào)控表達(dá),將ntCre基因和HSP70m啟動子命名為HSP70m: :ntCre。在 Cre基因前加核定位信號是為了將Cre基因表達(dá)的蛋白質(zhì)定位于細(xì)胞核中,添加At4g01735 基因內(nèi)含子和Gus基因內(nèi)含子避免原核細(xì)胞中表達(dá)的Cre酶具有活性,在構(gòu)建載體時發(fā)生刪除。用Sal I和Xba I酶切所得pVCT2117載體,瓊脂糖凝膠電泳,回收ntCre基因片段;同時用Sal I和Xba I酶切pVCT2034載體,瓊脂糖凝膠電泳,回收含有0m35S啟動子的 PVCT2034載體骨架。將回收的ntCre與pVCT2034載體骨架用T4 DNA連接酶在16°C條件下過夜連接,即將ntCre基因替換pVCT2034載體上的⑶S基因,得pVCT2139載體,如圖8所示。pVCT2139載體中,ntCre基因由0m35S啟動子調(diào)控表達(dá),終止子為Tnos,命名為0m35S 啟動子調(diào)控的ntCre基因表達(dá)盒。用SalI和SacI酶切所得pVCT2139載體,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定,回收1501bp 的0m35S啟動子和ntCre基因片段;同時用Sal I和Sac I酶切所得pVCT2041載體,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定,回收含HSP70m啟動子調(diào)控的Rhsf基因表達(dá)盒的pVCT2041載體骨架; 將回收的PVCT2041載體骨架與0m35S啟動子調(diào)控的ntCre基因表達(dá)盒連接,連接反應(yīng)用 T4 DNA連接酶16°C過夜連接,得pVCT2219載體,如圖8所示。所得pVCT2219載體中含有 0m35S啟動子調(diào)控的ntCre基因表達(dá)盒和HSP70m啟動子調(diào)控的Rhsf基因表達(dá)盒,命名為 0m35S::ntCre::Tnos/HSP70m::Rhsf::Tnos。根據(jù)報道的擬南芥生態(tài)型Columbia(Arabidopsis thaliana L. Ecotype Columbia) AtCBF3 基因(GenBank accession No. AB013815)序列,設(shè)計引物,上游引物為 5,-ccataccaacaaaaaagacagag-3,(SEQ ID NO. 15),下游弓 I物為5,-gtactaaaaatggaaata ataatctgag-3’ (SEQ ID NO. 16),以從擬南芥生態(tài)型Columbia基因組DNA為模板,進行PCR 擴增。反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性2分鐘,95°C變性10秒,51°C退火20秒,72°C延伸I分鐘, 30個循環(huán);72°C延伸10分鐘;回收755bp大小的目的片段,回收片段連接pCR2. 1-T0P0載體(Invitrogen,US),得 pCR2. l_AtCBF3 載體。用 EcoR I 酶切所得 pCR2. l_AtCBF3 載體, 瓊脂糖凝膠電泳,棄AtCBF3基因片段,回收載體骨架;將回收片段用T4 DNA連接酶自環(huán)化連接,連接反應(yīng)在T4 DNA連接酶作用下16°C連接過夜,得pCR2. Im載體。根據(jù)所得pCR2. Im載體,設(shè)計引物,上游引物為5’ _tcatgaccaaaatccct_3’ (SEQ ID NO. 17)(位于pCR2. Im載體的原核基因終止子上游),下游引物為5’-ttcagaagaactcgtcaagaagg-3’ (SEQ ID NO. 18)(位于 pCR2. Im 載體的 Kan 抗性基因 CDS 的下游);以 pCR2. Im 載體為模板,進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件95°C預(yù)變性2分鐘,95°C變性10秒,50°C退火20 秒,72°C延伸3分鐘,30個循環(huán);72°C延伸10分鐘;PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定, 回收1240bp條帶,用T4 DNA連接酶16°C自環(huán)化過夜連接,得pVCT1191載體,如圖9所示。 所得PVCT1191載體中去除了 pCR2. Im載體中的Amp編碼區(qū),含有卡那霉素原核抗性基因 (nptll,新霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因)、fl復(fù)制子、LacZ基因、大腸桿菌復(fù)制子ColEl和原核抗性基因終止子,nptll上游含有原核啟動子,下游與終止子連接,命名為nptllm基因,在原核細(xì)胞中具有卡那霉素抗性。根據(jù)所得pVCT1191載體設(shè)計nptllm基因引物,上游引物為5’ —atactcgagctact gggctatctgg-3’ (SEQ ID NO. 19)(位于nptllm基因的啟動子上游,劃線處為XhoI位點), 下游弓I物為5 _c&tt&t&cg&>t&tcctgc&ggcggccgccc&gggccctggt&gctcttg&tccggc_3^ ( SEQID NO. 20)(劃線部分與nptllm基因的原核終止子末端正鏈序列互補),以pVCT1191載體為模板,進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性2分鐘,95°C變性10秒,52°C退火 20秒,72°C延伸I分鐘20秒,3個循環(huán),再經(jīng)95°C變性10秒,60°C退火20秒,72°C延伸I 分鐘20秒,27個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘,PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,回收1265bp的 nptllm基因。將回收的nptllm基因用下游帶LoxP位點的引物進行再擴增,上游引物為如 SEQ ID NO. 19 所TK序列,下游引物為 5,-ataacttcgtatagcatacattatacgaagttatcc-3> (SEQ IDNO. 21),P劃線部分為Lox位點,核酸序列如SEQ ID NO. 25所示;PCR反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性2分鐘,95 °C變性10秒,46°C退火20秒,72°C延伸I分鐘20秒,3個循環(huán),再經(jīng)95°C變性10秒,60°C退火20秒,72°C延伸I分鐘20秒,27個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘,PCR產(chǎn)物命名為nptIIm-LoxP組件,將回收的nptIIm-LoxP組件與pMD18_T載體連接,得pVCT1202 載體,如圖9所示。用Xho I酶切pCAMBIA1302載體(此載體由本實驗室保存,GenBank accession No.AF234298),棄潮霉素抗性基因(hptll),回收pCAMBIA1302載體骨架;同時用Xho I和 SalI酶切所得pVCT1202載體,回收含有nptllm-LoxP組件片段,將回收的pCAMBIA1302 載體骨架與nptllm-LoxP組件連接,連接反應(yīng)在T4 DNA連接酶作用下16°C連接過夜,SP npt I Im-LoxP組件替換pCAMBIA1302載體上的hptll基因,得pVCT2071載體。所得pVCT2071 載體中含有nptllm-LoxP組件序列,LoxP位點位于nptllm基因3’端,命名為第一 LoxP位點,同時nptllm基因由2個35S啟動子控制表達(dá)。用Xho I和EcoR I酶切所得pVCT2071載體,瓊脂糖凝膠電泳鑒定,棄pCAMBIA1302 載體中的hptll基因的2個35S啟動子,回收pVCT2071載體骨架片段;同時根據(jù)pBIN19載體序列設(shè)計Pnos啟動子引物,上游引物為5’ -cggaattcagggagtcacgttatgac-3J (SEQ ID NO. 22),劃線處為 EcoR I 位點,下游引物為 -gttgtcgacgatccagatccggtgca-3> (SEQ ID NO. 23),劃線處為Sal I位點,以pBIN19載體為模板進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件為94°C預(yù)變性3分鐘,94 °C變性20秒,57 °C退火20秒,72 °C延伸I分鐘30秒,35個循環(huán),最后72 °C 延伸10分鐘,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定,回收303bp的Pnos啟動子,回收片段經(jīng)Sal I和 EcoRI雙酶切,回收299bp的Pnos啟動子酶切片段,將回收的pVCT2071載體骨架與Pnos啟動子酶切片段連接,連接反應(yīng)在T4 DNA連接酶作用下16°C連接過夜,即Pnos啟動子替換 PCAMBIA1302載體中的2個35S啟動子,得pVCT2072載體,如圖9所示。所得pVCT2072載體中nptllm基因由Pnos啟動子啟動表達(dá)。用PmaC I和XbaI酶切所得pVCT2072載體,瓊脂糖凝膠電泳鑒定,棄35S啟動子和mGFP5基因,回收pVCT2072載體骨架片段;同時Not I酶切所得的pVCT1202載體,經(jīng) Klenow Fragment酶補為平末端,再用EcoRI酶切,瓊脂糖凝膠電泳鑒定,回收含ColEl復(fù)制子和LoxP位點的pVCT1202載體骨架,將回收的pVCT2072載體骨架與pVCT1202載體骨架連接,連接反應(yīng)在T4 DNA連接酶作用下16°C連接過夜,得pVCT2102載體,如圖10所示。 所得pVCT2102載體中在真核表達(dá)框的左邊界和右邊界之間含有2個LoxP位點,分別為第一 LoxP位點和第二 LoxP位點,位于nptllm基因3’端的為第一 LoxP位點和位于nptllm 基因5’端的為第二 LoxP位點。用EcoR I和Sal I酶切所得的pVCT2102載體,瓊脂糖凝膠電泳鑒定,回收含有2 個LoxP位點的pVCT2102載體骨架;同時用EcoR I和Sal I酶切所得的pVCT2117載體,瓊脂糖凝膠電泳鑒定,回收HSP70m啟動子調(diào)控的ntCre基因表達(dá)盒;將回收的pVCT2102載體骨架與ntCre基因表達(dá)盒連接,連接反應(yīng)在T4 DNA連接酶作用下16°C連接過夜,得pVCT2231 載體,如圖10所示。用Sal I酶切pVCT2231載體,然后用Klenow酶補為平末端,再用Sac I酶切, 瓊脂糖凝膠電泳鑒定,回收含有LoxP位點的pVCT2231載體骨架;同時用BstE II酶切載體pVCT2219后用Klenow酶補為平末端,再用Sac I酶切,瓊脂糖凝膠電泳鑒定,回收含有 0m35S: :ntCre: :Tnos/HSP70m: :Rhsf: :Tnos 結(jié)構(gòu)的序列;將回收的 pVCT2231 載體骨架與 0m35S: :ntCre: :Tnos/HSP70m: :Rhsf: :Tnos結(jié)構(gòu)連接,連接反應(yīng)在T4 DNA連接酶作用下 16°C連接過夜,得含有熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控的ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)的載體,即pVCT2262 載體,如圖10所示。pVCT2262工作原理如下在不含四環(huán)素條件下在溫度高于28°CHSP70m 啟動子能夠誘導(dǎo)Rhsf基因表達(dá),Rhsf蛋白能夠調(diào)控0m35S啟動子,誘導(dǎo)ntCre基因表達(dá), ntCre基因表達(dá)的Cre重組酶能夠特異識別Lox位點,刪除Lox位點之間的序列;在含有四環(huán)素條件下,四環(huán)素能夠與Rhsf蛋白結(jié)合,改變Rhsf蛋白的結(jié)構(gòu),導(dǎo)致Rhsf蛋白不能調(diào)控 0m35S啟動子誘導(dǎo)ntCre基因表達(dá)。將PVCT2262載體采用凍融法轉(zhuǎn)化轉(zhuǎn)化根癌桿菌菌株EHA105感受態(tài)細(xì)胞,得含 PVCT2028載體的EHA105。將含pVCT2028載體的EHA105菌液葉盤法轉(zhuǎn)化煙草,在含I. Omg/ L四環(huán)素和150mg/L卡那霉素在MS附加2. 5mg/L BA的培養(yǎng)基上進行抗性篩選,得抗卡那霉素的轉(zhuǎn)基因煙草。將轉(zhuǎn)基因煙草一組轉(zhuǎn)移至只含150mg/L卡那霉素的培養(yǎng)基上培養(yǎng),經(jīng) 35°C熱激處理10周,結(jié)果如圖Il(A)所示;另一組轉(zhuǎn)移至lmg/L四環(huán)素和150mg/L卡那霉素的培養(yǎng)基培養(yǎng),經(jīng)35°C熱激處理10周,結(jié)果如圖11 (B)所示,結(jié)果顯示在含150mg/L卡那霉素的培養(yǎng)基上培養(yǎng)的煙草中出現(xiàn)白化現(xiàn)象,而在含lmg/L四環(huán)素和150mg/L卡那霉素的培養(yǎng)基上試管苗生長正常。結(jié)果表明,在含有I. Omg/L四環(huán)素和150mg/L卡那霉素的培養(yǎng)基中培養(yǎng),四環(huán)素能阻止高溫刪除LoxP位點之間的序列。將處理后的兩組轉(zhuǎn)基因煙草轉(zhuǎn)移至不含卡那霉素和四環(huán)素的MS培養(yǎng)基上培養(yǎng)經(jīng)35°C熱激處理10周,轉(zhuǎn)基因煙草恢復(fù)正常生長,結(jié)果如圖11(C和D)所示。結(jié)果表明獲得的轉(zhuǎn)基因煙草,在無四環(huán)素條件下,卡那霉素抗性基因能夠在準(zhǔn)確的刪除,在培養(yǎng)基中添加四環(huán)素能防止在轉(zhuǎn)基因植株獲得過程中出現(xiàn)的非預(yù)期高溫啟動ntCre/LoxP刪除系統(tǒng),能夠用于植物轉(zhuǎn)基因中刪除抗性基因。本實施例以卡那霉素抗性基因為例,還可以為其他抗性基因,例如鏈霉素抗性基因、氨芐霉素抗性標(biāo)記基因、潮霉素抗性基因等抗性基因;也可以為非抗性基因的其他標(biāo)記基因,如Gus基因、GFP基因等標(biāo)記基因,同樣可以ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)有效的刪除。最后說明的是,以上實施例僅用以說明本發(fā)明的技術(shù)方案而非限制,盡管通過參照本發(fā)明的優(yōu)選實施例已經(jīng)對本發(fā)明進行了描述,但本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員應(yīng)當(dāng)理解,可以在形式上和細(xì)節(jié)上對其作出各種各樣的改變,而不偏離所附權(quán)利要求書所限定的本發(fā)明的精神和范圍。
權(quán)利要求
1.利用熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控的ntCre/LoxP刪除系統(tǒng),其特征在于所述ntCre/LoxP 刪除系統(tǒng)包括ntCre重組酶特異識別的2個LoxP位點和位于2個LoxP位點之間的靶基因部分,所述2個LoxP位點分別為位于靶基因3’端的第一 LoxP位點和位于靶基因5’端的第二 LoxP位點;還包括HSF70m啟動子調(diào)控的Iihsf基因表達(dá)盒和0m35S啟動子調(diào)控的ntCre 重組酶基因表達(dá)盒部分,所述0m35S啟動子由Iihsf基因調(diào)控,所述HSF70m啟動子核酸序列如SEQID NO. 1所示,所述Iihsf基因核酸序列如SEQ ID NO. 24所示,所述0m35S啟動子核酸序列如SEQ ID NO. 8所示,所述LoxP位點核酸序列如SEQ ID NO. 25所示,所述ntCre重組酶基因核酸序列如SEQ ID NO. 26所示。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的ntCre/LoxP刪除系統(tǒng),其特征在于所述ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)是所述第一 LoxP位點,靶基因,0m35S啟動子調(diào)控的ntCre重組酶基因表達(dá)盒,HSF70m 啟動子調(diào)控的Misf基因表達(dá)盒和第二 LoxP位點順序串聯(lián)。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的ntCre/LoxP刪除系統(tǒng),其特征在于所述靶基因為抗性標(biāo)記基因。
4.含有權(quán)利要求1-3任一項所述ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)的重組表達(dá)載體。
5.權(quán)利要求4所述重組表達(dá)載體的制備方法,其特征在于,具體步驟如下將含有 HSF70m啟動子調(diào)控的Iihsf基因表達(dá)盒和0m35S啟動子調(diào)控的ntCre重組酶基因表達(dá)盒部分連入pVCT2231載體的酶切位點處;所述PVCT2231載體由pCAMBIA1320載體、pVCT1191載體和pBmi9載體制備,具體步驟為從PVCT1191載體中克隆nptnm基因,并在nptnm基因3’端加上LoxP位點,獲得 nptIIm-LoxP組件,然后將nptllm-LoxP組件替換pCAMBIA1302載體上的潮霉素抗性基因 hptll,并將含LoxP位點的序列反向插入pCAMBIA1302載體,替換pCAMBIA1302載體的35S 啟動子和mGFP5基因編碼區(qū);同時從pBIN19載體中克隆Pnos啟動子,替換pCAMBIA1302載體上調(diào)控hptll基因的2X35S啟動子,即得pVCT2231載體;所述PVCT1191載體由pCR2. 1-T0P0載體改造而來,具體為,刪除pCR2. 1-T0P0載體上氨芐抗性基因并自環(huán)化連接構(gòu)建的載體,即PVCT1191載體。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述重組表達(dá)載體的制備方法,其特征在于,所述pVCT2231載體制備具體步驟為(1)將所得nptllm-LoxP基因連入pMD18_T載體中,得pVCT1202載體,并用SalI和 XhoI雙酶切所得的pVCT1202載體,瓊脂糖凝膠電泳并回收nptllm-LoxP組件,將回收的 npt I Im-LoxP組件連入pCAMBIA1302載體的2個XhoI酶切位點之間,得pVCT2071載體;(2)克隆的所述Pnos啟動子,用MlI和EcoR I酶切,瓊脂糖凝膠電泳并回收,將所得的Pnos啟動子連入所得pVCT2071載體的Β ο I和EcoR I酶切位點之間,得pVCT2072載體;(3)用NotI酶切所得PVCT1202載體,用KlenowFragment酶補為平末端,再用XbaI 酶切,回收含LoxP位點的pVCT1202載體片段,同時用PmaCI和)(baI酶切所得pVCT2072載體,回收含nptnm基因的pVCT2072載體片段,將回收的pVCT1202載體片段與pVCT2072載體片段連接,得PVCT2231載體。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述重組表達(dá)載體的制備方法,其特征在于所述nptllm-LoxP組件的制備,具體步驟為(1)以所得PVCT1191載體為模板,上游引物如SEQID NO. 19所示核酸序列,下游引物如SEQ ID NO. 20所示核酸序列,進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性2分鐘,95°C 變性10秒,52°C退火20秒,72°C延伸1分鐘20秒,3個循環(huán),再經(jīng)95°C變性10秒,60°C退火20秒,72°C延伸1分鐘20秒,27個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘,得nptnm基因;(2)以所得nptnm基因為模板,上游引物如SEQID NO. 19所示核酸序列,下游引物如 SEQ ID NO. 21所示核酸序列,進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件為95°C預(yù)變性2分鐘,95°C變性 10秒,46 V退火20秒,720C延伸1分鐘20秒,3個循環(huán),再經(jīng)95 V變性10秒,60 V退火20 秒,72°C延伸1分鐘20秒,27個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘,得nptIIm-LoxP組件。
8.根據(jù)權(quán)利要求5-7任一項所述重組表達(dá)載體的制備方法,其特征在于所述Pnos啟動子制備方法,具體步驟為以PBIN19載體為模板,上游引物為如SEQ ID NO. 22核酸序列, 下游引物如SEQ ID N0. 23核酸序列,進行PCR擴增,PCR反應(yīng)條件為94°C預(yù)變性3分鐘, 94°C變性20秒,57°C退火20秒,72°C延伸1分鐘30秒,35個循環(huán),最后72°C延伸10分鐘, 得Pnos啟動子。
9.權(quán)利要求1-3任一項所述ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)在植物轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用。
10.權(quán)利要求4所述重組表達(dá)載體在植物轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用。
全文摘要
本發(fā)明公開了利用熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控的ntCre/LoxP刪除系統(tǒng),所述ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)包括ntCre重組酶特異識別的2個LoxP位點和位于2個LoxP位點之間的靶基因部分,所述2個LoxP位點分別為位于靶基因3’端的第一LoxP位點和位于靶基因5’端的第二LoxP位點;還包括HSF70m啟動子調(diào)控的Rhsf基因表達(dá)盒和Om35S啟動子調(diào)控的ntCre重組酶基因表達(dá)盒部分,所述Om35S啟動子由Rhsf基因調(diào)控;該刪除系統(tǒng)受熱激和四環(huán)素雙重調(diào)控,能夠在無四環(huán)素環(huán)境下通過熱激刪除2個LoxP位點之間的靶基因;本發(fā)明還公開了含ntCre/LoxP刪除系統(tǒng)的重組表達(dá)載體,可以應(yīng)用于植物轉(zhuǎn)基因中刪除靶基因,具有刪除周期短,操作簡單等優(yōu)點。
文檔編號C12N15/66GK102533749SQ201210032918
公開日2012年7月4日 申請日期2012年2月14日 優(yōu)先權(quán)日2012年2月14日
發(fā)明者張興國, 張香琴, 朱利泉, 杜小兵, 眭順照, 蘇承剛 申請人:西南大學(xué)