利用秈粳特異ssr分子標記劃分雜交稻親本優(yōu)勢群的方法
【技術領域】
[0001] 本發(fā)明涉及一種通過秈粳特異性分子標記來進行劃分雜交稻親本優(yōu)勢群體的方 法。
【背景技術】
[0002] 雜種優(yōu)勢是生物界普遍存在的一種現(xiàn)象，而雜種優(yōu)勢利用則是作物育種的主要內(nèi) 容和難點方向。雜種優(yōu)勢利用本質(zhì)上屬于配合力選擇范疇，在生產(chǎn)上絕大多數(shù)作物的雜種 優(yōu)勢利用，其雙親基本上來自不同生態(tài)類型或具有不同起源背景的地區(qū)。在我國，雜交稻的 不育系大多來自華南地區(qū)的早秈品種或其衍生系，恢復系主要來自具有東南亞遺傳背景或 其衍生系，在它們之間較容易配出強優(yōu)勢組合，在生產(chǎn)上表現(xiàn)出諸如在產(chǎn)量、米質(zhì)、抗性等 某一或某幾方面的優(yōu)勢，從而易獲得大面積推廣。以往在選擇強優(yōu)勢組合時，更多靠的是田 間經(jīng)驗和不同系譜后代廣泛測配，工作量大，但理想目標組合不多，收效甚微。水稻作為大 面積上利用的雜種優(yōu)勢自花授粉作物，全面、系統(tǒng)了解雜交親本來源的親緣關系及相互間 差異性，對于減少親本選配的盲目性，提高雜交稻育種工作的預見性具有重要意義。
[0003] 本研究運用秈粳特異性分子標記對本所收集的80份秈型水稻品種（品系）進行 遺傳差異分析，劃分不同的類群（區(qū)域群），旨在為今后引種、育種材料鑒定提供分析平臺， 為提高組合選配的預見性和育種選配效率提供參考依據(jù)。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004] 利用24對秈粳特異性分子標記對雜交稻親本進行劃分，在雜交水稻上進行應用， 旨在提高育種效率，避免盲目配組。
[0005] 本發(fā)明的技術方案
[0006] DNA提取采集苗期新鮮葉片，按照Rogers和Bendich在1988年報道的CTAB法 (Cetyl triethla mmounium bromide)略加改進后的程序進行。
[0007] 1.2. 2所用SSR引物本試驗所用的24對SSR秈粳特異性引物遍布12條染色體， 每條染色體上平均選2對（表1)。
[0008]L 2. 3PCR擴增及產(chǎn)物分離 PCR反應體系：2. 5 y L模板DNA (20ng/ y L)， 0? 18 ii LTaq 酶（5U/ ii L)，3. 0 ii LlOxbufTer (含 Mg+)，I. 4 ii Lprimer，0? 25 ii LdNTP (lOmmol/ L)，7. 74 ii L水。PCR反應程序為：94°C下預變性5min后在94°C下變性30s、55°C下退火30s、 72°C下延伸lmin，共33個循環(huán)，最后72°C下延伸7min。PCR反應在PTC-200熱循環(huán)儀上進 行。參照Chen等 [9]的方法，將PCR產(chǎn)物經(jīng)4%葡萄糖瓊脂凝膠電泳分離。
[0009] 1. 24資料處理每條SSR擴增產(chǎn)物根據(jù)Marker分子量大小來估測，將同樣大小 的片段以相同的數(shù)值付值，分別以1、2、3、4等統(tǒng)計記載并建立數(shù)據(jù)庫。按NEI等的方法計 算材料間的遺傳相似系數(shù)（GS)和遺傳距離（⑶），GS = 2NxyANx+Ny)，其中Nx、Ny是親本 X和親本y的電泳譜帶數(shù)，Nx是親本X利親本y共同出現(xiàn)的譜帶數(shù)，⑶=1-GS。用UPGMA 法進行聚類分析。
[0010] 表1所選用秈粳SSR引物特征
[0011]
【主權項】
1. 利用秈粳特異SSR分子標記劃分雜交稻親本優(yōu)勢群的方法。其特征在于：利用24對 秈粳特異性分子標記對雜交稻親本進行劃分，在雜交水稻上進行應用，旨在提高育種效率， 避免盲目配組。
2. 根據(jù)權利要求1的方法，其特征在于：在田間種植后對親本進行取樣，提取葉片組織 DNA，運用相關分子標記進行產(chǎn)物大小比較，根據(jù)產(chǎn)物大小進行多態(tài)性比較，從而將不同材 料劃分不同的類群（區(qū)域群），旨在為今后引種、育種材料鑒定提供分析平臺，為提高組合 選配的預見性和育種選配效率提供參考依據(jù)。
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種利用秈粳特異SSR分子標記劃分雜交稻親本優(yōu)勢群的方法。利用24對秈粳特異性分子標記對雜交稻親本進行劃分，在雜交水稻上進行應用，旨在提高育種效率，避免盲目配組。根據(jù)相應組群進行區(qū)別利用，減少雜交配組中的盲目利用現(xiàn)象，為今后引種、育種材料鑒定提供分析平臺，提高育種效率。
【IPC分類】A01H1-02, C12Q1-68
【公開號】CN104756852
【申請?zhí)枴緾N201310564283
【發(fā)明人】張小祥, 戴正元, 李愛宏, 黃年生, 劉廣青, 趙步洪, 王寶和, 周長海, 李育紅, 季紅娟, 潘存紅, 肖寧, 譚長樂, 張洪熙
【申請人】江蘇里下河地區(qū)農(nóng)業(yè)科學研究所
【公開日】2015年7月8日
【申請日】2014年1月4日