本申請(qǐng)實(shí)施例涉及圖像處理領(lǐng)域,具體涉及一種mri圖像分割模型訓(xùn)練方法、mri圖像分割方法及相關(guān)裝置。
背景技術(shù):
1、磁共振成像(magnetic?resonance?imaging,mri)是一種非侵入性成像技術(shù),能清晰顯示軟組織病變,廣泛應(yīng)用于腦腫瘤疾病的診斷和治療。不同的mri成像序列(例如flair、t1、t1ce和t2)能夠從不同角度或形態(tài)展示同一組織,這些不同模態(tài)的mri圖像能反映腫瘤區(qū)域的不同特征。
2、目前,大部分腦腫瘤分割工作還依賴(lài)于醫(yī)生的人工勾畫(huà),這種方法不僅費(fèi)時(shí)費(fèi)力,而且受個(gè)人經(jīng)驗(yàn)的影響,不同專(zhuān)家或同一專(zhuān)家在不同時(shí)間對(duì)同一病人的分割結(jié)果可能不一致,因此,利用多模態(tài)模型實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化的腦瘤分割是目前腦腫瘤臨床治療的重要方向。其中,腦腫瘤分割的準(zhǔn)確度是決定能否將深度學(xué)習(xí)引入臨床治療的關(guān)鍵因素。
3、相較于傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)方法,計(jì)算機(jī)視覺(jué)中的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和transformer近年來(lái)的技術(shù)發(fā)展為提高腦腫瘤分割精度提供了新的方法。然而在相關(guān)方案中,基于卷積操作和u-net的分割網(wǎng)絡(luò)模型對(duì)mri圖像進(jìn)行處理,由于該方式基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),而卷積操作的固定感受野導(dǎo)致了u-net難以捕捉多模態(tài)圖像的長(zhǎng)距離依賴(lài),無(wú)法利用mri數(shù)據(jù)集提供的多模態(tài)信息,導(dǎo)致腦腫瘤的分割精度不高,限制了自動(dòng)化腦瘤分割的應(yīng)用。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本申請(qǐng)實(shí)施例提供了一種mri圖像分割模型訓(xùn)練方法、mri圖像分割方法及相關(guān)裝置,使得訓(xùn)練得到的分割模型繼承u-net的高效結(jié)構(gòu)并通過(guò)融入交叉模態(tài)模塊使傳統(tǒng)u-net擁有對(duì)多模態(tài)mri圖像數(shù)據(jù)集的特征提取能力,從而提升分割精度和避免過(guò)擬合。
2、本申請(qǐng)實(shí)施例第一方面提供了一種mri圖像分割模型訓(xùn)練方法,所述方法包括:
3、獲取圖像訓(xùn)練集,所述圖像訓(xùn)練集包括多組訓(xùn)練樣本,每組所述訓(xùn)練樣本包括多模態(tài)mri圖像以及每個(gè)mri圖像的標(biāo)注,所述標(biāo)注用于表示所述mri圖像中目標(biāo)對(duì)象的真實(shí)區(qū)域;
4、獲取初始分割模型,所述初始分割模型包括u-net網(wǎng)絡(luò)和交叉模態(tài)模塊;
5、將所述圖像訓(xùn)練集輸入至所述初始分割模型,則,
6、所述u-net網(wǎng)絡(luò)的編碼器對(duì)每組所述訓(xùn)練樣本中的多模態(tài)mri圖像進(jìn)行下采樣,得到每個(gè)模態(tài)的mri圖像的特征圖;
7、所述交叉模態(tài)模塊對(duì)每組所述訓(xùn)練樣本中的多模態(tài)mri圖像的多個(gè)所述特征圖進(jìn)行融合,得到融合特征矩陣;
8、所述u-net網(wǎng)絡(luò)的解碼器對(duì)所述融合特征矩陣進(jìn)行上采樣,得到上采樣特征矩陣,并使用預(yù)設(shè)尺寸的矩陣將所述上采樣特征矩陣映射為目標(biāo)特征圖,對(duì)所述目標(biāo)特征圖進(jìn)行處理得到預(yù)測(cè)分割結(jié)果,所述預(yù)測(cè)分割結(jié)果用于表示所述mri圖像中所述目標(biāo)對(duì)象的預(yù)測(cè)區(qū)域;
9、根據(jù)所述預(yù)測(cè)分割結(jié)果表示的所述預(yù)測(cè)區(qū)域以及所述標(biāo)注表示的所述真實(shí)區(qū)域構(gòu)建損失函數(shù),并根據(jù)所述損失函數(shù)的損失值調(diào)整所述初始分割模型的模型參數(shù),直至滿足收斂條件時(shí)停止模型訓(xùn)練,得到目標(biāo)分割模型。
10、本申請(qǐng)實(shí)施例第二方面提供了一種mri圖像分割方法,所述方法包括:
11、獲取待處理的目標(biāo)多模態(tài)mri圖像;
12、獲取目標(biāo)分割模型,所述目標(biāo)分割模型包括u-net網(wǎng)絡(luò)和交叉模態(tài)模塊;
13、將所述目標(biāo)多模態(tài)mri圖像輸入至所述目標(biāo)分割模型,則,
14、所述u-net網(wǎng)絡(luò)的編碼器對(duì)所述目標(biāo)多模態(tài)mri圖像進(jìn)行下采樣,得到每個(gè)模態(tài)的mri圖像的特征圖;
15、所述交叉模態(tài)模塊對(duì)所述目標(biāo)多模態(tài)mri圖像的多個(gè)所述特征圖進(jìn)行融合,得到融合特征矩陣;
16、所述u-net網(wǎng)絡(luò)的解碼器對(duì)所述融合特征矩陣進(jìn)行上采樣,得到上采樣特征矩陣,并使用預(yù)設(shè)尺寸的矩陣將所述上采樣特征矩陣映射為目標(biāo)特征圖,對(duì)所述目標(biāo)特征圖進(jìn)行處理得到預(yù)測(cè)分割結(jié)果,所述預(yù)測(cè)分割結(jié)果用于表示所述目標(biāo)多模態(tài)mri圖像中目標(biāo)對(duì)象的預(yù)測(cè)區(qū)域。
17、本申請(qǐng)實(shí)施例第三方面提供了一種計(jì)算機(jī)設(shè)備,包括存儲(chǔ)器和處理器,所述存儲(chǔ)器存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序,所述處理器執(zhí)行所述計(jì)算機(jī)程序時(shí)實(shí)現(xiàn)前述第一方面的方法。
18、本申請(qǐng)實(shí)施例第四方面提供了一種計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)介質(zhì),計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)介質(zhì)中存儲(chǔ)有指令,該指令在計(jì)算機(jī)上執(zhí)行時(shí),使得計(jì)算機(jī)執(zhí)行前述第一方面的方法。
19、從以上技術(shù)方案可以看出,本申請(qǐng)實(shí)施例具有以下優(yōu)點(diǎn):
20、通過(guò)使用u-net網(wǎng)絡(luò)的編碼器對(duì)每組訓(xùn)練樣本中的多模態(tài)mri圖像進(jìn)行下采樣,得到每個(gè)模態(tài)的mri圖像的特征圖,交叉模態(tài)模塊對(duì)每組訓(xùn)練樣本中的多模態(tài)mri圖像的多個(gè)特征圖進(jìn)行融合,得到融合特征矩陣,u-net網(wǎng)絡(luò)的解碼器對(duì)融合特征矩陣進(jìn)行上采樣,得到上采樣特征矩陣,并使用預(yù)設(shè)尺寸的矩陣將上采樣特征矩陣映射為目標(biāo)特征圖,對(duì)目標(biāo)特征圖進(jìn)行處理得到預(yù)測(cè)分割結(jié)果,根據(jù)預(yù)測(cè)分割結(jié)果表示的預(yù)測(cè)區(qū)域以及標(biāo)注表示的真實(shí)區(qū)域調(diào)整模型參數(shù),得到目標(biāo)分割模型。其中,交叉模態(tài)模塊具有處理多模態(tài)mri圖像的能力,可以捕獲多模態(tài)mri圖像輸入的長(zhǎng)距離依賴(lài)關(guān)系,很大程度上提高了對(duì)mri圖像的腦腫瘤區(qū)域的分割精度。并且,在u-net網(wǎng)絡(luò)上采樣和下采樣都采用的是輕量化的卷積操作,從而在不復(fù)雜化模型結(jié)構(gòu)和增加參數(shù)量的前提下,有效降低了過(guò)擬合的風(fēng)險(xiǎn)。
1.一種mri圖像分割模型訓(xùn)練方法,其特征在于,所述方法包括:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述u-net網(wǎng)絡(luò)的編碼器對(duì)每組所述訓(xùn)練樣本中的多模態(tài)mri圖像進(jìn)行下采樣,得到每個(gè)模態(tài)的mri圖像的特征圖,包括:
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述交叉模態(tài)模塊對(duì)每組所述訓(xùn)練樣本中的多模態(tài)mri圖像的多個(gè)所述特征圖進(jìn)行融合,得到融合特征矩陣,包括:
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征在于,所述u-net網(wǎng)絡(luò)的解碼器對(duì)所述融合特征矩陣進(jìn)行上采樣,得到上采樣特征矩陣,包括:
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,所述解碼器接收所述交叉模態(tài)模塊對(duì)所述編碼器每一次下采樣得到的多個(gè)特征圖分別進(jìn)行處理得到的所述融合特征矩陣,在每一次上采樣中,所述解碼器根據(jù)至少一個(gè)所述融合特征矩陣進(jìn)行上采樣操作,得到所述上采樣特征矩陣,包括:
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:
7.根據(jù)權(quán)利要求1至6任一項(xiàng)所述的方法,其特征在于,所述目標(biāo)對(duì)象為腦部,所述目標(biāo)對(duì)象的真實(shí)區(qū)域包括腦部mri圖像的背景、腦部mri圖像中的整個(gè)腫瘤區(qū)域、腦部mri圖像中的腫瘤核心區(qū)域、腦部mri圖像中的增強(qiáng)型腫瘤區(qū)域中的一種或多種。
8.一種mri圖像分割方法,其特征在于,所述方法包括:
9.一種計(jì)算機(jī)設(shè)備,包括存儲(chǔ)器和處理器,所述存儲(chǔ)器存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序,其特征在于,所述處理器執(zhí)行所述計(jì)算機(jī)程序時(shí)實(shí)現(xiàn)如權(quán)利要求1至8中任一項(xiàng)所述的方法。
10.一種計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)介質(zhì),其特征在于,所述計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)介質(zhì)中存儲(chǔ)有指令,所述指令在計(jì)算機(jī)上執(zhí)行時(shí),使得所述計(jì)算機(jī)執(zhí)行如權(quán)利要求1至8中任一項(xiàng)所述的方法。