技術(shù)特征：

1.一種大規(guī)模標(biāo)注lncRNA功能的方法，其特征在于，包括如下步驟：

步驟1、根據(jù)lncRNA與蛋白質(zhì)的共表達(dá)數(shù)據(jù)、相互作用數(shù)據(jù)計(jì)算lncRNA和蛋白質(zhì)的皮爾遜相關(guān)系數(shù)，并根據(jù)相關(guān)系數(shù)構(gòu)造lncRNA-蛋白質(zhì)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)；

步驟2、根據(jù)lncRNA在人類24個(gè)組織或者細(xì)胞類型中的表達(dá)譜計(jì)算lncRNA之間的皮爾遜相關(guān)系數(shù)，據(jù)此構(gòu)造lncRNA相似性網(wǎng)絡(luò)；

步驟3、根據(jù)蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)構(gòu)造蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，并結(jié)合lncRNA-蛋白質(zhì)和lncRNA相似性網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建全局網(wǎng)絡(luò)；

步驟4、利用上述構(gòu)建的全局網(wǎng)絡(luò)，根據(jù)公式(1)計(jì)算lncRNA節(jié)點(diǎn)和蛋白質(zhì)節(jié)點(diǎn)的Katz度量，此Katz度量代表lncRNA節(jié)點(diǎn)和蛋白質(zhì)節(jié)點(diǎn)的相似性度量，Katz度量值越大，說(shuō)明這個(gè)蛋白質(zhì)與lncRNA越相似；

步驟5、對(duì)上述步驟得到的lncRNA和蛋白質(zhì)相似矩陣進(jìn)行降序排列，按照分值選擇其中前N個(gè)蛋白質(zhì)，分別找出前N個(gè)蛋白質(zhì)中每個(gè)蛋白質(zhì)所對(duì)應(yīng)的功能注釋，對(duì)每個(gè)功能注釋，根據(jù)公式(2)計(jì)算此lncRNA具有該功能的概率。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的大規(guī)模標(biāo)注lncRNA功能的方法，其特征在于，步驟1具體為：根據(jù)lncRNA-蛋白質(zhì)的共表達(dá)數(shù)據(jù)及相互作用數(shù)據(jù)，采用樸素貝葉斯方法計(jì)算lncRNA和蛋白質(zhì)的相關(guān)性：

其中，C(l,p)是lncRNA基因d和編碼基因p之間的整體相關(guān)系數(shù)，C_d(l,p)代表l和p在數(shù)據(jù)集d上的相關(guān)分?jǐn)?shù)，D是基因?qū)和p的個(gè)數(shù)，然后結(jié)合計(jì)算出的lncRNA和蛋白質(zhì)的相關(guān)性構(gòu)造lncRNA-蛋白質(zhì)的關(guān)系網(wǎng)絡(luò)，并用鄰接矩陣LP表示。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的大規(guī)模標(biāo)注lncRNA功能的方法，其特征在于，所述lncRNA-蛋白質(zhì)的共表達(dá)數(shù)據(jù)及相互作用數(shù)據(jù)包括從GENCODE數(shù)據(jù)庫(kù)中下載的lncRNA基因和編碼基因，從COXPRESdb、ArrayExpress數(shù)據(jù)庫(kù)下載的共表達(dá)數(shù)據(jù)，從NPInter數(shù)據(jù)庫(kù)下載的lncRNA-蛋白質(zhì)作用數(shù)據(jù)。

4.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的大規(guī)模標(biāo)注lncRNA功能的方法，其特征在于，步驟2具體為：根據(jù)lncRNA在人類24種組織或者細(xì)胞類型中的表達(dá)譜數(shù)據(jù)計(jì)算lncRNA之間的表達(dá)相關(guān)性，具體采用皮爾遜相關(guān)系數(shù)公式計(jì)算每對(duì)lncRNA之間的表達(dá)相關(guān)性，然后根據(jù)這些表達(dá)相關(guān)性構(gòu)造lncRNA相似性網(wǎng)絡(luò)，用鄰接矩陣L表示。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的大規(guī)模標(biāo)注lncRNA功能的方法，其特征在于，步驟3：根據(jù)蛋 白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)，構(gòu)造蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，記作P，結(jié)合步驟1、步驟2計(jì)算出的矩陣LP、L，構(gòu)造全局異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)，用鄰接矩陣表示。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的大規(guī)模標(biāo)注lncRNA功能的方法，其特征在于，步驟4具體為：利用步驟3構(gòu)造的全局網(wǎng)絡(luò)的鄰接矩陣A，計(jì)算lncRNA節(jié)點(diǎn)和蛋白質(zhì)節(jié)點(diǎn)的Katz度量，計(jì)算公式為：

S_LP＝βLP+β²(L*LP+LP*P)+β³(LP*LP^T*LP+L²*LP+L*LP*P+LP*P²) (1)

其中，β是不同長(zhǎng)度路徑的權(quán)重系數(shù)，滿足β＜1/||A||₂。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的大規(guī)模標(biāo)注lncRNA功能的方法，其特征在于，步驟5具體為：對(duì)于給定的lncRNA l，從S_lp中降序排列的分值中選擇前N個(gè)蛋白質(zhì)，然后對(duì)于每一個(gè)GO術(shù)語(yǔ)，計(jì)算它被指定給lncRNA的概率P_l(T_i)，計(jì)算公式為：

其中，S_lp是lncRNA l和它的鄰近編碼基因的Kazt相似性分?jǐn)?shù)，Ind(T_i)是一個(gè)指示函數(shù)，定義如下：

P_l(T_i)越大，則lncRNA l越可能具有該功能。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的大規(guī)模標(biāo)注lncRNA功能的方法，其特征在于，N在35至50之間取值。