技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明提供一種基于結(jié)構(gòu)拓?fù)涞腉蛋白偶聯(lián)受體跨膜螺旋三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測方法,包括:(1)構(gòu)建跨膜螺旋的結(jié)構(gòu)拓?fù)淠P停合葮?gòu)建G蛋白偶聯(lián)受體的7個(gè)跨膜螺旋的幾何結(jié)構(gòu)拓?fù)淠P?;?)預(yù)測所述跨膜螺旋的結(jié)構(gòu)拓?fù)淠P?,分為四個(gè)階段:(21)第一階段為識(shí)別跨膜螺旋區(qū)域;(22)第二階段為優(yōu)化跨膜螺旋間的相對(duì)位置;(23)第三階段為優(yōu)化每個(gè)螺旋在膜內(nèi)的自轉(zhuǎn)朝向;(24)第四階段為優(yōu)化每個(gè)螺旋與膜的傾斜角度;(3)Loop重建:用Loop片段插入連結(jié)7個(gè)螺旋,最后將整體結(jié)構(gòu)進(jìn)行小幅度的優(yōu)化。本發(fā)明方法針對(duì)跨膜螺旋的空間結(jié)構(gòu)特點(diǎn),建立兼顧保守性與多樣性的結(jié)構(gòu)拓?fù)淠P?,并利用該模型形成了四階段的結(jié)構(gòu)優(yōu)化方法,試圖獲得采樣廣度與深度的平衡。
技術(shù)研發(fā)人員:呂強(qiáng);吳宏杰;權(quán)麗君;李海鷗
受保護(hù)的技術(shù)使用者:蘇州大學(xué)
文檔號(hào)碼:201310381447
技術(shù)研發(fā)日:2013.08.28
技術(shù)公布日:2016.11.30