一種基于核糖體dna its1基因檢測華支睪吸蟲囊蚴的pcr擴(kuò)增試劑盒及擴(kuò)增引物的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及寄生蟲檢測技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及一種基于核糖體DNA ITS1基因檢測華 支睪吸蟲囊蝴的PCR擴(kuò)增試劑盒及擴(kuò)增引物。
【背景技術(shù)】
[0002] 華支睪吸蟲?。–lonorchiasis)是由于感染華支睪吸蟲(Clonorchis sinensis, Cs)引起的食源性人獸共患寄生蟲病,嚴(yán)重危害人類的健康。該病主要分布在東亞、東南亞 和東歐的部分國家,如中國、韓國、老撾和越南等。據(jù)統(tǒng)計全球約有3 500萬人感染這種吸 蟲,其中1500萬人分布在我國的各個省市區(qū)(除內(nèi)蒙古、青海、西藏和新疆外均有發(fā)現(xiàn)), 以廣東、廣西和東北三省尤為嚴(yán)重。目前,華支睪吸蟲的鑒定方法還沒有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),目前 對華支睪吸蟲囊蝴的診斷依賴于顯微鏡檢查。眾所周知,顯微鏡檢查耗費(fèi)時間長,檢查效率 低,對檢查者臨床工作經(jīng)驗(yàn)要求較高,而且對于與華支睪吸蟲親緣關(guān)系相近的囊蝴,蟲卵形 態(tài)相似,普通光鏡無法區(qū)分,使用這種方法往往會出現(xiàn)誤判。免疫診斷法雖然較顯微鏡檢查 法效率高,但也常常為靈敏度和特異性所局限。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0003] 本發(fā)明的目的在于提供一種基于核糖體DNA ITS1基因檢測華支睪吸蟲囊蝴的 PCR擴(kuò)增試劑盒,靈敏度高,特異性強(qiáng),檢測快速、準(zhǔn)確,為華支睪吸蟲感染的診治和預(yù)防提 供有效的技術(shù)手段。
[0004] 本發(fā)明還提供了一種基于核糖體DNA ITS1基因檢測華支睪吸蟲囊蝴的擴(kuò)增引物, 特異性強(qiáng)。
[0005] 本發(fā)明解決其技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案是:
[0006] -種基于核糖體DNA ITS1基因檢測華支睪吸蟲囊蝴的PCR擴(kuò)增試劑盒,包括 PCR擴(kuò)增反應(yīng)液,所述PCR擴(kuò)增反應(yīng)液包括:Tris-HCl 10mmol/L,KC1 50mmol/L,MgCl2 1. 5mmol/L, dNTPs 0. 8mmol/L,正向引物 0? 4 y mol/L,反向引物 0? 4 y mol/L,DNA 模板 20ng/ 1^,了39酶 0.0751]/1^。
[0007] 本發(fā)明以華支睪吸蟲核糖體DNA內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)基因-ITS1為目標(biāo),專門設(shè) 計了針對性的特異性引物,進(jìn)一步的設(shè)計了檢測試劑盒,檢測結(jié)果特異,結(jié)果易判斷,靈敏 度高,特異性強(qiáng),檢測快速、準(zhǔn)確,為華支睪吸蟲感染的診治和預(yù)防提供有效的技術(shù)手段。
[0008] 作為優(yōu)選,所述正向引物序列為:5' -CTAGTTCCGTCATCTGTCTTGC-3'(SEQ ID NO. 1) 〇
[0009] 作為優(yōu)選,所述反向引物序列為:5' -ACCGAGGCGTTATCAGTCGTA-3'(SEQ ID NO. 2)。
[0010] 作為優(yōu)選,所述Tris-HCl的pH為8. 3。
[0011] -種基于核糖體DNA ITS1基因檢測華支睪吸蟲囊蝴的擴(kuò)增引物所述擴(kuò)增引物包 括正向引物和反向引物,所述正向引物序列為:5'-CTAGTTCCGTCATCTGTCTTGC-3'(SEQ ID NO. 1),所述反向引物序列為:5'-ACCGAGGCGTTATCAGTCGTA-3'(SEQ ID NO. 2)。采用本發(fā)明 設(shè)計的特異性擴(kuò)增引物,檢測靈敏度高,特異性強(qiáng)。
[0012] 本發(fā)明的有益效果是:靈敏度高,特異性強(qiáng),檢測快速、準(zhǔn)確,為華支睪吸蟲感染的 診治和預(yù)防提供有效的技術(shù)手段。
【附圖說明】
[0013] 圖1是本發(fā)明試劑盒對華支睪吸蟲DNA的PCR擴(kuò)增結(jié)果圖,
[0014] 圖中:M : 100bp DNA marker,1-2:目的擴(kuò)增條帶。
[0015] 圖2是本發(fā)明試劑盒的特異性試驗(yàn)結(jié)果圖,
[0016] 圖中:M :100bp DNA marker ;1:目的擴(kuò)增條帶;2-4:簡單異尖線蟲、刺激隱核蟲和 棘顎口線蟲。
[0017] 圖3是本發(fā)明試劑盒的敏感性試驗(yàn)結(jié)果圖,
[0018] 圖中:M :100bp DNA Marker ;1 :40ng/ y L華支睪吸蟲 DNA ;2 :4ng/ y L 華支睪吸蟲 DNA ;3 :400pg/ y L華支睪吸蟲DNA ;4 :40pg/ y L華支睪吸蟲DNA ;5 :4pg/ y L華支睪吸蟲 DNA ;6 :0? 4pg/ y L 華支睪吸蟲 DNA。
【具體實(shí)施方式】
[0019] 下面通過具體實(shí)施例,并結(jié)合附圖,對本發(fā)明的技術(shù)方案作進(jìn)一步的具體說明。
[0020] 本發(fā)明中,若非特指,所采用的原料和設(shè)備等均可從市場購得或是本領(lǐng)域常用的。 下述實(shí)施例中的方法,如無特別說明,均為本領(lǐng)域的常規(guī)方法。
[0021] 本發(fā)明實(shí)施如下:
[0022] 1、材料與方法
[0023] 1. 1 材料:
[0024] 囊蝴和華支睪吸蟲DNA陽性對照來源:2013年5月底采集舟山市場上銷售的麥穗 魚,用消化法從魚肉組織中分離獲得華支睪吸蟲囊蝴。華支睪吸蟲DNA陽性對照品由舟山 出入境檢驗(yàn)檢疫局提供。簡單異尖線蟲、刺激隱核蟲和棘顎口線蟲由舟山出入境檢驗(yàn)檢疫 局提供。
[0025] dNTPs、Taq酶均購自大連寶生物公司。
[0026] 1. 2 方法
[0027] 1. 2. 1囊蝴的分離
[0028] 將麥穗魚用清水洗凈,去除魚頭、魚尾、魚鰭、魚刺及內(nèi)臟,將魚肉用絞肉機(jī)加工 成肉泥,放入玻璃杯。按每克魚肉加入10mL人工胃液(鹽酸濃度為8mL/L,胃蛋白酶濃 度8g/L,氯化鈉濃度為9g/L),37°C孵箱作用2h,將消化完全的魚肉消化液經(jīng)80目分離篩 過濾集中于2L的分液漏斗中沉淀0. 5h,放出約300mL的消化液至500mL的燒杯中,沉淀 10-30min后,棄去上面的濁液,用清水反復(fù)清洗至液體清亮,隨后將含蟲體的液體轉(zhuǎn)移至 15mL尖底離心管內(nèi),沉淀lmin后將含囊蝴的上清液體吸至另一新管內(nèi),反復(fù)沉淀幾次,顯 微鏡下檢查囊蝴純凈度。將剩余的囊蝴保存在Alsever' s溶液(Alsever's Solution,市 售)中,置于4°C冰箱備用。
[0029]1. 2. 2囊蝴的形態(tài)學(xué)和DNA提取
[0030] 取少量上述收集到的囊蝴置于顯微鏡下觀察,并對其進(jìn)行了形態(tài)學(xué)鑒定。隨后按 照Takara universal Genomic DNA Extraction kit (市售,購自大連寶生物公司)說明書 中提供的方法提取囊蝴的基因組DNA。
[0031] 1.2.3引物設(shè)計與合成
[0032] 針對華支睪吸蟲rDNA ITSl(GenBank:KF740423)基因序列設(shè)計特異性引物1 對:正向引物序列為:5' -CTAGTTCCGTCATCTGTCTTGC-3'(SEQ ID NO. 1),反向引物序列為: 5'-ACCGAGGCGTTATCAGTCGTA-3'(SEQ ID N0. 2)。引物設(shè)計采用 DNASTAR5. 0 軟件程序設(shè)計 完成,由生工生物(上海)有限公司合成,對上述2. 2提取的DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得528kb 目標(biāo)產(chǎn)物。
[0033] 1.2.4目的基因擴(kuò)增與序列測定
[0034] 20 y L的PCR反應(yīng)體系中組分如下:
[0035] pH8. 3 的 Tris-HCl 10mmol/L, KC1 50mmol/L, MgCl2 1. 5mmol/L, dNTPs 0. 8mmo 1 / 1,正向引物(5£0 10勵.1)0.4以111〇1/1,反向引物(5£0 10勵.2)0.411111〇1/1,0嫩模板 (1. 2. 2 節(jié)提取獲得)20ng/ y L,Taq 酶 0? 075U/ y L,ddH20 補(bǔ)足至 20 y L。
[0036] PCR 擴(kuò)增條件:94°C 5min - 94°C 30sec,(54。(:、56。(: