本發(fā)明涉及生物醫(yī)學,尤其涉及一種shank3基因敲除小鼠模型及其構建方法和應用。
背景技術:
1、shank3基因編碼一種突觸后支架蛋白,主要存在于神經元的突觸后密度區(qū)(postsynaptic?density,psd),在突觸的形成、成熟和維持中起重要作用。shank3基因的突變或缺失與多種神經發(fā)育障礙,如asd、精神分裂癥和智力障礙等密切相關。shank3基因的缺失或突變被認為是asd的重要致病因素之一。小鼠模型可以為asd的基本生物學機制提供獨特的見解,但現(xiàn)有的相關模型開發(fā)具有一定缺陷。
2、現(xiàn)有技術中已經公開了多種亞型特異性shank3小鼠模型,然而多個基因內啟動子和可變剪接的外顯子負責形成許多亞型,現(xiàn)有的shank3基因敲除模型多為部分外顯子敲除,大多數(shù)只破壞了一些亞型,可能存在shank3蛋白的殘留表達,相比之下,在患者中發(fā)現(xiàn)的絕大多數(shù)已知shank3突變涉及破壞所有亞型的缺失,影響對基因功能和疾病機制的全面理解。由于基因內的多個基因內啟動子和可變剪接的編碼外顯子,點突變通常會導致shank3亞型特異性表達的有限破壞。然而在asd中發(fā)現(xiàn)的絕大多數(shù)shank3突變是整個基因的缺失,大多數(shù)攜帶22q13.3缺失或phelan-mcdermid綜合征(pms)中整個shank3基因缺失的患者被診斷為asd。
3、現(xiàn)有技術1公開了一種采用傳統(tǒng)基因敲除技術,利用同源重組在shank3基因中引入突變,導致基因部分失活(半合子)的基因敲除策略(bozdagi?o,et?al.,haploinsufficiency?of?the?autism-associated?shank3?gene?leads?to?deficits?insynaptic?function,social?interaction,and?social?communication.molautism.2010;1(1):15),但是其主要是基于半合子缺失模型,僅是部分失活,這與人類孤獨癥譜系障礙(asd)患者的基因缺陷程度不完全一致,可能無法完全模擬人類疾病的表型。此外,該模型只模擬了一種基因缺陷類型,未能涵蓋shank3基因其他類型的突變或缺失所導致的行為和功能變化。
4、現(xiàn)有技術2公開了一種改進的小鼠模型,該模型完全敲除了shank3基因,以模擬phelan-mcdermid綜合征(pms)的一些行為表型(drapeau?e,etal.,behavioralphenotyping?of?an?improved?mouse?model?of?phelan-mcdermid?syndrome?with?acomplete?deletion?of?the?shank3?gene.eneuro.2018may-jun;5(3):eneuro.0046-18.201)。但是仍是外顯子4-22的缺失,不完全反映人類pms患者的多樣性情況。這些患者的基因缺失程度和影響可能有較大變異性,因此該模型可能無法涵蓋所有可能的臨床表型。
技術實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的在于提供一種shank3基因敲除小鼠模型及其構建方法和應用,能夠實現(xiàn)shank3整個基因的完整敲除,所構建的模型具有更優(yōu)的應用前景。
2、為了實現(xiàn)上述發(fā)明目的,本發(fā)明提供以下技術方案:
3、本發(fā)明提供了一種靶向敲除小鼠shank3基因的sgrna,包括sgrna-1和sgrna-2;
4、所述sgrna-1的核苷酸序列如seq?id?no.1所示;
5、所述sgrna-2的核苷酸序列如seq?id?no.2所示。
6、本發(fā)明還提供了一種靶向敲除小鼠shank3基因的crispr/cas9系統(tǒng),所述crispr/cas9系統(tǒng)包括上述sgrna。
7、本發(fā)明還提供了一種靶向敲除小鼠shank3基因的試劑盒,所述試劑盒包括上述crispr/cas9系統(tǒng)。
8、本發(fā)明還提供了所述crispr/cas9系統(tǒng)或所述試劑盒在制備敲除小鼠shank3基因的細胞株中的應用。
9、本發(fā)明還提供了所述crispr/cas9系統(tǒng)或所述試劑盒在制備敲除小鼠shank3基因小鼠模型中的應用。
10、本發(fā)明還提供了一種shank3基因敲除小鼠模型的構建方法,包括以下步驟:
11、將所述靶向敲除小鼠shank3基因的crispr/cas9系統(tǒng)轉染至小鼠受精卵中,經過陽性篩選得到shank3基因敲除小鼠的受精卵,得到shank3基因敲除小鼠模型。
12、優(yōu)選的,還包括以下步驟:
13、將所述shank3基因敲除小鼠的受精卵培養(yǎng)得到f0小鼠;
14、將f0小鼠與野生型小鼠雜交,通過擴繁傳代得到純合小鼠和雜合小鼠;
15、所述f0小鼠、純合小鼠或雜合小鼠作為shank3基因敲除小鼠模型進行應用。
16、本發(fā)明還提供了通過所述構建方法得到的shank3基因敲除小鼠模型。
17、本發(fā)明還提供了所述shank3基因敲除小鼠模型在作為孤獨癥譜系障礙、精神分裂癥或智力障礙研究材料中的應用。
18、本發(fā)明還提供了一種雙sgrna位點靶向敲除小鼠shank3基因的鑒定方法,包括以下步驟:
19、提取待測細胞基因組dna;
20、以所述基因組dna為模板,用擴增引物對進行pcr擴增,所得pcr擴增產物進行檢測;
21、如與野生型相比,基因敲除后基因組片段長度缺失76kb,則實現(xiàn)雙sgrna位點靶向敲除小鼠shank3基因;
22、在所述擴增引物對中,上游引物的核苷酸序列如seq?id?no.3所示;下游引物的核苷酸序列如seq?id?no.4所示;
23、所述雙sgrna位點包括sgrna-1和sgrna-2;
24、所述sgrna-1的核苷酸序列如seq?id?no.1所示;
25、所述sgrna-2的核苷酸序列如seq?id?no.2所示。
26、本發(fā)明的有益效果:
27、本發(fā)明提供的crispr/cas9基因編輯系統(tǒng)能夠實現(xiàn)shank3整個基因的完整敲除,能夠用于構建shank3基因完整敲除的模型。
28、本發(fā)明提供的shank3?ko小鼠模型中,由于shank3整個基因的完整敲除,純合子已無shank3蛋白表達,雜合子表達量也較wt型降低,在shank3基因的功能開發(fā)或相關疾病的研究方面具有重要意義。
29、將本發(fā)明提供的shank3基因敲除小鼠模型用于孤獨癥譜系障礙研究中,其可涵蓋純合子、雜合子等多種表型,與人類孤獨癥譜系障礙(asd)患者的基因缺陷程度相似度更高,能夠更恰當?shù)挠糜谀M人類疾病可能的臨床表型,具有更廣泛的應用前景。
1.一種靶向敲除小鼠shank3基因的sgrna,其特征在于,包括sgrna-1和sgrna-2;
2.一種靶向敲除小鼠shank3基因的crispr/cas9系統(tǒng),其特征在于,所述crispr/cas9系統(tǒng)包括權利要求1所述sgrna。
3.一種靶向敲除小鼠shank3基因的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權利要求2所述crispr/cas9系統(tǒng)。
4.權利要求2所述crispr/cas9系統(tǒng)或權利要求3所述試劑盒在制備敲除小鼠shank3基因的細胞株中的應用。
5.權利要求2所述crispr/cas9系統(tǒng)或權利要求3所述試劑盒在制備敲除小鼠shank3基因小鼠模型中的應用。
6.一種shank3基因敲除小鼠模型的構建方法,其特征在于,包括以下步驟:
7.根據(jù)權利要求6所述的shank3基因敲除小鼠模型的構建方法,其特征在于,還包括以下步驟:
8.通過權利要求6或7所述的構建方法得到的shank3基因敲除小鼠模型。
9.權利要求8所述的shank3基因敲除小鼠模型在作為孤獨癥譜系障礙、精神分裂癥或智力障礙研究材料中的應用。
10.一種雙sgrna位點靶向敲除小鼠shank3基因的鑒定方法,其特征在于,包括以下步驟: