本發(fā)明屬于疾病檢測(cè)試劑盒技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種丙型肝炎病毒基因分型定量檢測(cè)試劑盒。
背景技術(shù):
現(xiàn)有技術(shù)中的丙型肝炎病毒檢測(cè)試劑盒多為abbottmolecular、上海星耀醫(yī)學(xué)、福州泰普、湖南圣湘和李艷等人的產(chǎn)品,其中,abbottmolecular的試劑盒采用熒光定量pcr,可以鑒定基因型1~6及亞型1a和1b,具有內(nèi)標(biāo)監(jiān)測(cè)體系和防污染系統(tǒng),檢測(cè)時(shí)間為2h,不能進(jìn)行定量;上海星耀醫(yī)學(xué)的試劑盒采用熒光定量pcr,只能鑒定基因型1和2,具有內(nèi)標(biāo)監(jiān)測(cè)體系和防污染系統(tǒng),檢測(cè)時(shí)間為2h,可以進(jìn)行定量;福州泰普的試劑盒采用pcr+雜交,可以鑒定基因型1a、1b、2a、2b、3a、3b和6a,具有內(nèi)標(biāo)監(jiān)測(cè)體系,無(wú)防污染系統(tǒng),檢測(cè)時(shí)間為4~5h,不能進(jìn)行定量,由于pcr后需要開(kāi)管后取出pcr產(chǎn)物再進(jìn)行雜交,容易造成pcr污染從而增加了產(chǎn)生假陽(yáng)性的風(fēng)險(xiǎn);湖南圣湘的試劑盒采用熒光定量pcr,只能鑒定基因型1、2、3和6,具有內(nèi)標(biāo)監(jiān)測(cè)體系,無(wú)防污染系統(tǒng),檢測(cè)時(shí)間為2h,不能進(jìn)行定量;李艷等人的試劑盒采用測(cè)序法,可以鑒定到亞型,但需要測(cè)序測(cè)序后比對(duì)獲得具體型別信息,無(wú)內(nèi)標(biāo)監(jiān)測(cè)體系和防污染系統(tǒng),檢測(cè)時(shí)間為4~5h,不能進(jìn)行定量,操作復(fù)雜、成本高。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)缺陷,提供一種丙型肝炎病毒基因分型定量檢測(cè)試劑盒。
本發(fā)明的技術(shù)方案如下:
一種丙型肝炎病毒基因分型定量檢測(cè)試劑盒,包括第一至第八檢測(cè)組件,每一檢測(cè)組件均包括pcr緩沖液、mgcl2、dntps、taq酶、ung酶、逆轉(zhuǎn)錄酶、tmac、熒光檢測(cè)探針、檢測(cè)引物、內(nèi)標(biāo)熒光探針dip、內(nèi)標(biāo)正向引物dif和內(nèi)標(biāo)反向引物dir,第一至第八檢測(cè)組件的熒光定量pcr反應(yīng)程序均一致,dntps由等量的datp、dctp、dgtp和dutp組成,內(nèi)標(biāo)熒光探針dip包括如seqidno01所示的序列,內(nèi)標(biāo)正向引物dif包括如seqidno02所示的序列,內(nèi)標(biāo)反向引物dir包括如seqidno03所示的序列;
第一檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型1、基因型2和基因型3,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-1、p-2a/c、p-2b和p-3,檢測(cè)引物包括f-3、r-1和r-3;
第二檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型1a,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-1a/g,檢測(cè)引物包括f-1和r-1a;
第三檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型1b,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-1b,檢測(cè)引物包括f-1b和r-1b;
第四檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型2a/c和基因型3a,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-2a/c和p-3a,檢測(cè)引物包括f-1、f-4、r-3a和r-5;
第五檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型4a,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-4,檢測(cè)引物包括f-4和r-3b/4a;
第六檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型5a,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-5,檢測(cè)引物包括f-5和r-5;
第七檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型6a、基因型2b和基因型3b,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-3b、p-6a和p-2b,檢測(cè)引物包括f-1b、f-3b、r-3b/4a和r-2b/c;
第八檢測(cè)組件用以hcv陽(yáng)性,其中,熒光檢測(cè)探針包括cp3,檢測(cè)引物包括cf和cr2;
上述熒光檢測(cè)探針p-1、p-1a/g、p-1b、p-2a/c、p-2b、p-3、p-3a、p-3b、p-4、p-5、p-6a和cp3依次包括如seqidno04至15所示的序列;上述檢測(cè)引物f-1、f-1b、f-3b、f-4、f-5、r-1、r-1a、r-1b、r-2b/c、r-3、r-3a、r-3b/4a、r-5、cf和cr2依次包括如seqidno16~30所示的序列。
在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,所述內(nèi)標(biāo)熒光探針dip如seqidno01所示,內(nèi)標(biāo)正向引物dif如seqidno02所示,內(nèi)標(biāo)反向引物dir如seqidno03所示。
在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,所述熒光檢測(cè)探針p-1、p-1a/g、p-1b、p-2a/c、p-2b、p-3、p-3a、p-3b、p-4、p-5、p-6a和cp3依次如seqidno04至15所示。
在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,所述檢測(cè)引物f-1、f-1b、f-3b、f-4、f-5、r-1、r-1a、r-1b、r-2b/c、r-3、r-3a、r-3b/4a、r-5、cf和cr2依次如seqidno16~30所示。
在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,其熒光定量pcr反應(yīng)程序如下:95℃,5min;95℃,5s,60℃,35s,72℃,30s,15個(gè)循環(huán);95℃,5s,60℃,35s,72℃,30s,35個(gè)循環(huán)。
本發(fā)明的有益效果:
1、本發(fā)明采用分子信標(biāo)作為探針對(duì)各hcvrna基因型及亞型進(jìn)行熒光定量pcr閉管檢測(cè),第一至第七檢測(cè)組件實(shí)現(xiàn)對(duì)多達(dá)6種基因型(多達(dá)10種亞型)的鑒定;第八檢測(cè)組件表征hcv陽(yáng)性并通過(guò)對(duì)照標(biāo)準(zhǔn)曲線可進(jìn)行定量。
2、本發(fā)明的試劑盒均為閉管操作,盡可能地避免了pcr污染。
3、本發(fā)明操作簡(jiǎn)便,只需將提取好的hcvrna核酸依次加入到第一至第八檢測(cè)組件中,放入熒光定量pcr中反應(yīng)并檢測(cè)即可讀取分析結(jié)果,判斷基因型及亞型。
附圖說(shuō)明
圖1為本發(fā)明實(shí)施例1的第一檢測(cè)組件的檢測(cè)結(jié)果圖。
圖2為本發(fā)明實(shí)施例1的第二檢測(cè)組件的檢測(cè)結(jié)果圖。
圖3為本發(fā)明實(shí)施例1的第三檢測(cè)組件的檢測(cè)結(jié)果圖。
圖4為本發(fā)明實(shí)施例1的第四檢測(cè)組件的檢測(cè)結(jié)果圖。
圖5為本發(fā)明實(shí)施例1的第五檢測(cè)組件的檢測(cè)結(jié)果圖。
圖6為本發(fā)明實(shí)施例1的第六檢測(cè)組件的檢測(cè)結(jié)果圖
圖7為本發(fā)明實(shí)施例1的第七檢測(cè)組件的檢測(cè)結(jié)果圖
圖8為本發(fā)明實(shí)施例1的第八檢測(cè)組件的檢測(cè)結(jié)果圖
具體實(shí)施方式
以下通過(guò)具體實(shí)施方式結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明的技術(shù)方案進(jìn)行進(jìn)一步的說(shuō)明和描述。
實(shí)施例1:
一種丙型肝炎病毒基因分型定量檢測(cè)試劑盒,包括第一至第八檢測(cè)組件,每一檢測(cè)組件均包括pcr緩沖液、mgcl2、dntps、taq酶、ung酶、逆轉(zhuǎn)錄酶、tmac、熒光檢測(cè)探針、檢測(cè)引物、內(nèi)標(biāo)熒光探針dip、內(nèi)標(biāo)正向引物dif和內(nèi)標(biāo)反向引物dir,第一至第八檢測(cè)組件的熒光定量pcr反應(yīng)程序均一致,dntps由等量的datp、dctp、dgtp和dutp組成,內(nèi)標(biāo)熒光探針dip如seqidno01所示,內(nèi)標(biāo)正向引物dif如seqidno02所示,內(nèi)標(biāo)反向引物dir如seqidno03所示;
第一檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型1、基因型2和基因型3,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-1、p-2a/c、p-2b和p-3,檢測(cè)引物包括f-3、r-1和r-3;
第二檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型1a,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-1a/g,檢測(cè)引物包括f-1和r-1a;
第三檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型1b,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-1b,檢測(cè)引物包括f-1b和r-1b;
第四檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型2a/c和基因型3a,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-2a/c和p-3a,檢測(cè)引物包括f-1、f-4、r-3a和r-5;
第五檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型4a,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-4,檢測(cè)引物包括f-4和r-3b/4a;
第六檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型5a,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-5,檢測(cè)引物包括f-5和r-5;
第七檢測(cè)組件用以檢測(cè)基因型6a、基因型2b和基因型3b,其中,熒光檢測(cè)探針包括p-3b、p-6a和p-2b,檢測(cè)引物包括f-1b、f-3b、r-3b/4a和r-2b/c;
第八檢測(cè)組件用以hcv陽(yáng)性,其中,熒光檢測(cè)探針包括cp3,檢測(cè)引物包括cf和cr2;
上述熒光檢測(cè)探針p-1、p-1a/g、p-1b、p-2a/c、p-2b、p-3、p-3a、p-3b、p-4、p-5、p-6a和cp3依次如seqidno04至15所示;上述檢測(cè)引物f-1、f-1b、f-3b、f-4、f-5、r-1、r-1a、r-1b、r-2b/c、r-3、r-3a、r-3b/4a、r-5、cf和cr2依次如seqidno16~30所示。
具體的探針和引物的序列如下表所示:
將上述第一至第八檢測(cè)組件分別置于第一直第八管中進(jìn)行熒光定量pcr檢測(cè),具體反應(yīng)體系如下:
1、第一管
2、第二管
3、第三管
4、第四管
5、第五管
6、第六管
7、第七管
8、第八管
上述第一至第八關(guān)的反應(yīng)程序均如下表所示:
上述第一至第八管的檢測(cè)的熒光信號(hào)如下表所示,結(jié)果依次如圖1至圖8所示:
以上所述,僅為本發(fā)明的較佳實(shí)施例而已,故不能依此限定本發(fā)明實(shí)施的范圍,即依本發(fā)明專利范圍及說(shuō)明書(shū)內(nèi)容所作的等效變化與修飾,皆應(yīng)仍屬本發(fā)明涵蓋的范圍內(nèi)。
<110>英科新創(chuàng)(蘇州)生物科技有限公司
<120>一種丙型肝炎病毒基因分型定量檢測(cè)試劑盒
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