本發(fā)明屬分子生物學(xué)領(lǐng)域,具體涉及大豆類枯草桿菌蛋白酶基因(Gmsbt1.6-3)及應(yīng)用。
背景技術(shù):
絲氨酸蛋白酶(Serine protease)是一類功能域以絲氨酸為活性中心的蛋白水解酶,通過對(duì)蛋白酶原的激活或抑制起調(diào)節(jié)因子的作用。絲氨酸蛋白酶是重要的蛋白水解酶,約有30個(gè)家族,分屬于六大類:糜蛋白酶、類枯草桿菌蛋白酶、羧肽酶C、丙氨酸蛋白酶、阻遏蛋白LexA、三磷酸腺苷依賴型絲氨酸蛋白酶。其中,類枯草桿菌蛋白酶家族,是絲氨酸蛋白酶中最大的家族之一。
類枯草桿菌蛋白酶(Subtilisin-like protease)廣泛存在于細(xì)菌、真菌和寄生蟲等生物中。這類蛋白酶在結(jié)構(gòu)上具有典型的 Asp/Ser/His 催化結(jié)構(gòu)域,具有廣泛的生理學(xué)功能。研究表明,類枯草桿菌蛋白酶與病原性細(xì)菌、真菌的致病性相關(guān),在真菌孢子形成過程中的蛋白質(zhì)充分降解及細(xì)胞自噬過程等方面起非常重要的作用。木麻黃中的cg12基因在根瘤形成早期受弗蘭克氏菌(Frankia)誘導(dǎo)表達(dá),參與粗枝木麻黃和弗蘭克氏菌的共生過程。番茄P69B和P69C在丁香假單胞菌(Pseudomonas syrin-gae)感染和水楊酸(Salicylic acid)誘導(dǎo)下表達(dá),P69E和P69F也參與對(duì)病原入侵的抵御。鐘云等以黃龍?。℉LB)侵染的紅橘根系為材料,通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)一個(gè)類枯草桿菌蛋白酶基因(CICLE-v10027863mg, CcSubtilisin)的表達(dá)上調(diào)達(dá)5.53倍,通過iTRAQ分析發(fā)現(xiàn)該基因編碼的蛋白水平上調(diào)3.9倍,研究表明該基因及其蛋白受 HLB侵染誘導(dǎo),可能在柑橘宿主與黃龍病菌的互作中起重要作用。但關(guān)于大豆中類枯草桿菌蛋白酶基因的功能研究及與疫霉根腐病相互關(guān)系方面的研究目前還未有報(bào)道。
本研究通過基因工程技術(shù),從大豆中分離克隆了大豆類枯草桿菌蛋白酶基因Gmsbt1.6-3,并構(gòu)建該基因的植物過表達(dá)載體和RNAi表達(dá)載體,通過對(duì)大豆植株的轉(zhuǎn)化,驗(yàn)證新基因Gmsbt1.6-3的功能,為該基因的利用奠定了基礎(chǔ),為抗大豆疫霉根腐病新品種的培育提供基因資源和基礎(chǔ)材料。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是為提高植物的抗病性,而提供一種大豆類枯草桿菌蛋白酶基因Gmsbt1.6-3。
大豆類枯草桿菌蛋白酶基因Gmsbt1.6-3,它的堿基序列如SEQ ID NO.1所示;
它來源于大豆根系突變體材料M18;
大豆類枯草桿菌蛋白酶基因Gmsbt1.6-3在培育抗疫霉根腐病植物品種的應(yīng)用;
所述的疫霉根腐病為大豆疫霉根腐??;
本發(fā)明提供了大豆類枯草桿菌蛋白酶基因Gmsbt1.6-3,它是從大豆根系突變體材料M18中分離克隆的大豆類枯草桿菌蛋白酶基因Gmsbt1.6-3,并構(gòu)建該基因的植物過表達(dá)載體和RNAi表達(dá)載體,通過對(duì)大豆植株的轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化植株具有抗疫霉根腐病的功能,為抗大豆疫霉根腐病新品種的培育提供基因資源和基礎(chǔ)材料。
附圖說明
圖 1 Gmsbt1.6-3基因核心片段的 PCR 擴(kuò)增電泳圖; M: DNA 標(biāo)準(zhǔn)分子量; 1:PCR 產(chǎn)物;
圖2 Gmsbt1.6-3蛋白三維結(jié)構(gòu)模擬;
圖3 Gmsbt1.6-3蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹;
圖4 植物過表達(dá)載體的構(gòu)建;A.植物表達(dá)載體pCAMBIA3301的雙酶切;B. 目標(biāo)片段的PCR擴(kuò)增;
圖5 植物過表達(dá)載體的構(gòu)建及驗(yàn)證,A.雙酶切驗(yàn)證;B. PCR驗(yàn)證;
圖6 植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301- Gmsbt1.6-3的T-DNA區(qū)結(jié)構(gòu);
圖7 植物干擾表達(dá)載體的構(gòu)建;A. 植物表達(dá)載體pCAMBIA3301的雙酶切;B. 目標(biāo)片段的PCR擴(kuò)增;
圖8 植物干擾表達(dá)載體的構(gòu)建及驗(yàn)證;A. 雙酶切驗(yàn)證;B. PCR驗(yàn)證;
圖9 植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi的T-DNA區(qū)結(jié)構(gòu);
圖 10 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的大豆遺傳轉(zhuǎn)化;A:萌發(fā)階段; B:浸染后共培養(yǎng)階段;C:浸染后篩選培養(yǎng)階段;D:伸長培養(yǎng)階段;E:生根培養(yǎng)階段;F-G:移栽培養(yǎng)階段;
圖11 T0代轉(zhuǎn)化植株的PCR檢測(cè);A.篩選標(biāo)記基因bar;B. 35S啟動(dòng)子;C. NOS終止子;
圖12 T1代轉(zhuǎn)化植株的PCR檢測(cè);A.篩選標(biāo)記基因bar;B. 35S啟動(dòng)子;C. NOS終止子
M:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);P:質(zhì)粒陽性對(duì)照;N:水陰性對(duì)照;CK:未轉(zhuǎn)基因植株(陰性對(duì)照);1-3:轉(zhuǎn)基因陽性植株OEA1-OEA3;4-7:轉(zhuǎn)基因陽性植株IEA1-IEA4;
圖13 T2代轉(zhuǎn)化植株的PCR檢測(cè);A.篩選標(biāo)記基因bar;B. 35S啟動(dòng)子;C. NOS終止子
M:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);P:質(zhì)粒陽性對(duì)照;N:水陰性對(duì)照;CK:未轉(zhuǎn)基因植株(陰性對(duì)照);1-3:轉(zhuǎn)基因陽性植株OEA1-OEA3;4-7:轉(zhuǎn)基因陽性植株IEA1-IEA4;
圖14 T2代Southern blot檢測(cè);M:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);P:陽性對(duì)照;CK:陰性對(duì)照(未經(jīng)轉(zhuǎn)化的大豆植株);1-3:轉(zhuǎn)基因陽性植株OEA1-OEA3;4-7:轉(zhuǎn)基因陽性植株IEA1-IEA4;
圖15 Gmsbt1.6-3基因在轉(zhuǎn)植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301- Gmsbt1.6-3的植株中的相對(duì)表達(dá)量;
圖16 Gmsbt1.6-3基因在轉(zhuǎn)植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi的植株中的相對(duì)表達(dá)量。
具體實(shí)施方式
實(shí)施例1基因Gmsbt1.6-3的 cDNA 序列的克隆
大豆(Glycine max)品種吉農(nóng)18,大豆根系突變體材料M18,由吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)植物生物技術(shù)中心提供。
基因Gmsbt1.6-3的 cDNA 序列的克隆
使用TAKARA公司生產(chǎn)的RNAiso試劑盒從大豆M18苗期根系組織提取總RNA,以反轉(zhuǎn)錄的cDNA為模板,根據(jù)RNA-seq測(cè)序結(jié)果序列,設(shè)計(jì)特異引物sbt,采用RT-PCR方法擴(kuò)增目的片段并測(cè)序,試驗(yàn)所需PCR擴(kuò)增引物見表1。
表1 PCR引物序列
根據(jù)前期篩選得到的Gmsbt1.6-3序列片段設(shè)計(jì)擴(kuò)增長度為764bp 的特異引物sbt,經(jīng)PCR 擴(kuò)增后,得到一條與預(yù)期大小相同的核酸條帶(圖1),將 PCR 產(chǎn)物克隆至 PMD18-T 載體后進(jìn)行測(cè)序。測(cè)序結(jié)果與 NCBI中數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì),未找到與目的基因相一致的已知序列,初步判斷克隆得到的基因?yàn)槲粗男禄?。通過比對(duì)發(fā)現(xiàn),目標(biāo)基因與序列號(hào)為XM_003553760.3的序列相比同源性最高,在98%覆蓋度水平上的一致性達(dá)到 98%,且與其他的Glycine max subtilisin-like protease SBT1.6基因序列比對(duì)相似性較高,推測(cè)目標(biāo)基因是Glycine max subtilisin-like protease SBT1.6家族的成員之一,因此為該目標(biāo)基因命名為Gmsbt1.6-3。
實(shí)施例2Gmsbt1.6-3基因的生物信息學(xué)分析及系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
將Gmsbt1.6-3基因全序列連入克隆載體pMD18-T Vector,對(duì)重組載體進(jìn)行測(cè)序后進(jìn)行生物信息學(xué)分析,測(cè)序由北京三博遠(yuǎn)志生物技術(shù)有限公司完成。
利用在線分析程序ORF finder (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)對(duì)新基因序列進(jìn)行可能的開放閱讀框分析,通過 DNAMAN 軟件將新基因ORF翻譯成氨基酸序列;利用ProtParam軟件(http//www. web. expasy. org / protparam/ ) 預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)序列理論參數(shù);利用SWISS-MODEL在線軟件構(gòu)建Gmsbt1.6-3基因的蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu);利用Protscale軟件( http: / /web. expasy. org / /protscale /預(yù)測(cè)蛋白的親疏水性。
在 NCBI 網(wǎng)站中下載所有已知sbt基因序列,通過 DNAMAN 軟件對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行多重比對(duì),分析同源性,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
通過在線分析程序 ORF FINDER對(duì)新基因Gmsbt1.6-3的核酸序列進(jìn)行分析,并預(yù)測(cè)理論上的編碼區(qū)的位置。分析結(jié)果表明,Gmsbt1.6-3基因理論上的開放閱讀框?yàn)?91可編碼197個(gè)氨基酸殘基。
ProtParam軟件分析其相對(duì)分子量為19731.98,理論等電點(diǎn)(PI) 為4.64,正電荷氨基酸殘基總數(shù)(Arg+Lys) 為11,負(fù)電荷氨基酸殘基總數(shù)(Asp+Glu)為17,分子式為C859H1326N234O280S10。氨基酸組分析表明: 甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、絲氨酸(Ser)含量較高分別占14.3%、12.2%、11.2%??偲骄杷笖?shù)Grand average of hydropathicity (GRAVY)為0.002。
利用ProMod version 3.70 軟件構(gòu)建Gmsbt1.6-3蛋白3D 立體結(jié)構(gòu)圖,其中含有類枯草桿菌蛋白酶家族典型的 Asp/Ser/His 催化結(jié)構(gòu)域(圖2)。
搜索NCBI網(wǎng)站上植物已知的全部大豆sbt基因的氨基酸序列,利用DNAMAN軟件建立Gmsbt1.6-3蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹(見圖2)。使用 Neighbor-Joining 統(tǒng)計(jì)法,根據(jù)各Gmsbt1.6-3蛋白的序列同源性將進(jìn)化分析結(jié)果分為三組,蛋白Gmsbt1.6-3與大豆Gmsbt1.6-1、Gmsbt1.6-2的同源性最高,遺傳距離最近,推測(cè)Gmsbt1.6-3有可能是大豆Gmsbt1.6基因家族中還未發(fā)現(xiàn)的新基因成員。
實(shí)施例3植物表達(dá)載體的構(gòu)建及遺傳轉(zhuǎn)化
利用限制性內(nèi)切酶BglII和PmlI對(duì)植物表達(dá)載體pCAMBIA3301進(jìn)行雙酶切,利用Seamless Assembly Clonng Kit試劑盒,將克隆得到的Gmsbt1.6-3全長基因替換3301上原有的GUS基因。構(gòu)建以Bar為篩選標(biāo)記,CaMV35S啟動(dòng)子啟動(dòng)目標(biāo)基因Gmsbt1.6-3的pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3植物過表達(dá)載體。
利用BglII和PmlI限制性內(nèi)切酶對(duì)植物表達(dá)載體pCAMBIA3301進(jìn)行雙酶切,得到大小為10kb的3301載體大片段和2029bp的GUS基因片段;利用引物sbt-over對(duì)克隆載體Pmd18-T- Gmsbt1.6-3進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到大小591bp的Gmsbt1.6-3基因ORF全長片段(圖4),利用T4連接酶將Gmsbt1.6-3基因ORF全長片段連入植物表達(dá)載體pCAMBIA3301。
對(duì)構(gòu)建成功的植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3進(jìn)行PCR和雙酶切鑒定,均得到與預(yù)期大小相符的Gmsbt1.6-3基因ORF全長片段591bp(圖5),對(duì)其進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果正確,說明植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301- Gmsbt1.6-3構(gòu)建成功(圖6)。
采用同樣方法,將3301上原有的GUS基因替換為Gmsbt1.6-3正義+內(nèi)含子+Gmsbt1.6-3反義片段,構(gòu)建pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi植物干擾表達(dá)載體。
利用BglII和PmlI限制性內(nèi)切酶對(duì)植物表達(dá)載體pCAMBIA3301進(jìn)行雙酶切,得到大小為10kb的3301載體大片段和2029bp的GUS基因片段;利用引物sbtZ、SSR、sbtF分別對(duì)克隆載體Pmd18-T-Gmsbt1.6-3和Pmd18-T-SSR進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到大小為591bp的目的基因正義片段、205bp的SSR內(nèi)含子片段、和591bp的目的基因反義片段(圖7),利用無縫克隆連接酶將Gmsbt1.6-3正義片段、內(nèi)含子SSR和Gmsbt1.6-3反義片段同時(shí)連入植物表達(dá)載體pCAMBIA3301,得到植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi。
對(duì)構(gòu)建成功的植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi進(jìn)行雙酶切和PCR鑒定。用BglII和PmlI雙酶切該質(zhì)粒,得到一條大小約為1387bp的sbtZ-SSR-sbtF干擾片段;分別對(duì)Gmsbt1.6-3正義片段、反義片段、SSR內(nèi)含子、進(jìn)行特異性擴(kuò)增,得到的擴(kuò)增條帶都與預(yù)期大小相符,得到大小為591bp的Gmsbt1.6-3正義片段、205bp的SSR內(nèi)含子片段、591bp的Gmsbt1.6-3反義片段(圖8)。對(duì)其進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果正確,說明植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301- Gmsbt1.6-3-RNAi構(gòu)建成功(圖9)。
將構(gòu)建好的植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3和植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi,采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化大豆材料M18。
實(shí)施例4轉(zhuǎn)化植株的分子檢測(cè)
采用改良的CTAB法,從大豆葉片中提取基因組DNA,將其作為模板,以載體質(zhì)粒為陽性對(duì)照,以未轉(zhuǎn)化植株為陰性對(duì)照,分別以篩選標(biāo)記基因bar、35S啟動(dòng)子和NOS終止子的特異性引物(表1)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
對(duì)PCR檢測(cè)為陽性的轉(zhuǎn)基因植株,進(jìn)行Southern雜交檢測(cè)。以純化的篩選標(biāo)記基因bar為模板制備探針,采用隨機(jī)引物標(biāo)記法進(jìn)行標(biāo)記,雜交及檢測(cè)的其他步驟均按照DIG High Prime DNA Labeling and Detection Starter KitII試劑盒的說明書操作。
以大豆突變體材料M18作為受體,將構(gòu)建好的植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301- Gmsbt1.6-3和植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化大豆子葉節(jié),經(jīng)萌發(fā)培養(yǎng)、恢復(fù)培養(yǎng)、共培養(yǎng)、選擇培養(yǎng)、伸長培養(yǎng)、生根、煉苗、移栽培養(yǎng),獲得抗性轉(zhuǎn)化植株,并在溫室內(nèi)進(jìn)行培養(yǎng)和加代。
通過遺傳轉(zhuǎn)化,共獲得抗性苗10株,其中4株為轉(zhuǎn)植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301- Gmsbt1.6-3的轉(zhuǎn)化植株,對(duì)篩選標(biāo)記Bar基因、35S啟動(dòng)子、NOS終止子三個(gè)外源片段進(jìn)行PCR檢測(cè),均檢測(cè)為陽性的有3株,分別標(biāo)號(hào)OEA1-OEA3(OEA,over expression- agrobacterium-mediated method)。6株轉(zhuǎn)植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301- Gmsbt1.6-3-RNAi的抗性植株中,均檢測(cè)為陽性的有4株,分別標(biāo)號(hào)IEA1-IEA4(IEA,interference expression- agrobacterium-mediated method)(圖11)。
將檢測(cè)為陽性的植株在人工氣候室內(nèi)培養(yǎng)至成熟,收獲籽粒,在溫室內(nèi)進(jìn)行加代,對(duì)T1代植株進(jìn)行PCR檢測(cè),Gmsbt1.6-3基因過表達(dá)植株OEA1-OEA3、干擾表達(dá)植株IEA1-IEA4的T1代植株均檢測(cè)到了篩選標(biāo)記基因bar、35S啟動(dòng)子和NOS終止子(圖12)。
將檢測(cè)為陽性的T1代植株在人工氣候室內(nèi)培養(yǎng)至成熟,收獲籽粒,在溫室內(nèi)進(jìn)行加代,對(duì)T2代植株進(jìn)行PCR檢測(cè),Gmsbt1.6-3基因過表達(dá)植株OEA1-OEA3、干擾表達(dá)植株IEA1-IEA4的T2代植株均檢測(cè)到了篩選標(biāo)記基因bar、35S啟動(dòng)子和NOS終止子(圖13)。
對(duì)T2代轉(zhuǎn)基因陽性植株進(jìn)行southern雜交檢測(cè),選用HindⅢ限制性內(nèi)切酶,對(duì)外源篩選標(biāo)記基因bar進(jìn)行Southern雜交分析,檢測(cè)外源基因在大豆M18的整合情況,進(jìn)一步驗(yàn)證轉(zhuǎn)化事件的準(zhǔn)確性。雜交結(jié)果顯示PCR檢測(cè)為陽性的7株轉(zhuǎn)基因植株均有明顯的雜交信號(hào),且雜交帶的大小、位置互不相同(圖14),說明外源基因bar已經(jīng)整合到大豆的基因組中,且整合形式均為單拷貝。
實(shí)施例5接菌處理后對(duì)大豆Gmsbt1.6-3基因相對(duì)表達(dá)量的影響
采用“下胚軸侵染法”對(duì)轉(zhuǎn)化陽性材料進(jìn)行疫霉根腐病的接菌處理,鑒定標(biāo)準(zhǔn)依據(jù)大豆種質(zhì)資源數(shù)據(jù)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行。選擇生長初期的大豆植株,對(duì)生真葉長出至完全平展后,接種大豆疫霉根腐病病原菌,接種后對(duì)傷口進(jìn)行保濕處理7天,溫度控制在20-25℃、濕度保持在90%以上。接種后5天,提取大豆的根部組織總 RNA,對(duì)目的基因Gmsbt1.6-3進(jìn)行相對(duì)表達(dá)水平的檢測(cè)。
溫室內(nèi)種植T2代轉(zhuǎn)基因陽性株系OEA1-OEA3和IEA1-IEA4,幼苗期通過“下胚軸侵染法”接種大豆疫霉根腐病病菌。接菌后進(jìn)行保濕處理,環(huán)境溫度控制在20-25℃,濕度保持在90%以上,接菌處理5天后,提取根部組織總RNA,對(duì)目的基因Gmsbt1.6-3進(jìn)行Real-time PCR測(cè)定。采用2-ΔΔCT法計(jì)算數(shù)據(jù),分析目的基因的相對(duì)表達(dá)量。
在大豆根部中,設(shè)定對(duì)照植株M18未侵染疫霉根腐病菌的Gmsbt1.6-3表達(dá)量為1,其他轉(zhuǎn)化材料及其他處理的表達(dá)水平都對(duì)比于這個(gè)設(shè)定值。如圖15所示,未接菌條件下,轉(zhuǎn)植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3的陽性植株OEA1-OEA3的Gmsbt1.6-3基因相對(duì)表達(dá)量分別為2.56、3.0467、2.81,都明顯高于對(duì)照M18。接種大豆疫霉根腐病病原菌5天后,各植株的Gmsbt1.6-3基因相對(duì)表達(dá)量有顯著增加,Gmsbt1.6-3基因在對(duì)照M18植株中的相對(duì)表達(dá)量上升到了2.8867,在轉(zhuǎn)植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3的陽性植株OEA1-OEA3中,分別為5.2、6.123、5.243。說明Gmsbt1.6-3基因受大豆疫霉根腐病病原菌侵染誘導(dǎo)表達(dá)。
未接菌條件下,與對(duì)照植株M18相比,轉(zhuǎn)植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi的陽性植株Gmsbt1.6-3基因的相對(duì)表達(dá)量都受到了明顯的抑制,IEA1-IEA4植株中Gmsbt1.6-3基因分別被抑制了37.33%、57.67%、50.67%、33.67%。接種大豆疫霉根腐病病原菌5天后,各植株的Gmsbt1.6-3基因相對(duì)表達(dá)量有顯著增加,對(duì)照M18植株中該基因的相對(duì)表達(dá)量上升到了2.563,轉(zhuǎn)植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi植株的干擾效果受病原菌侵染影響有所下降,Gmsbt1.6-3基因在陽性植株IEA1-IEA4中分別被抑制了23%、37%、22.667%、16%,進(jìn)一步說明Gmsbt1.6-3基因受大豆疫霉根腐病病原菌侵染誘導(dǎo)表達(dá)(圖16)。
實(shí)施例6轉(zhuǎn)化植株的抗病性鑒定
采用“下胚軸侵染法”對(duì)轉(zhuǎn)化陽性材料進(jìn)行疫霉根腐病的接菌處理,鑒定標(biāo)準(zhǔn)依據(jù)大豆種質(zhì)資源數(shù)據(jù)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行。選擇生長初期的大豆植株,對(duì)生真葉長出至完全平展后,接種大豆疫霉根腐病病原菌,接種后對(duì)傷口進(jìn)行保濕處理7天,溫度控制在20-25℃、濕度保持在90%以上。接種后5天,調(diào)查轉(zhuǎn)基因株系和對(duì)照受體品種的死亡率。株系或品種有 70%或以上的植株死亡則為感病(susceptible,S);70%或以上植株正常生長則為抗病(resistant,R);31%-69%植株死亡的株系或品種為中抗 (moderately resistant,MR)。
使用假設(shè)測(cè)驗(yàn)對(duì) T2代轉(zhuǎn)基因陽性株系OEA1-OEA3和IEA1-IEA4疫霉根腐病抗病性鑒定所得數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,統(tǒng)計(jì)死亡率鑒定結(jié)果表明,轉(zhuǎn)基因陽性株系OEA1-OEA3對(duì)疫霉菌 1 號(hào)生理小種抗性水平較受體對(duì)照品種顯著提高,其中OEA2株系的接種死亡率最低,為30%,達(dá)到了抗性水平;OEA1、OEA3株系的抗性水平同對(duì)照CK都一樣,都是中感水平,但接種死亡率分別為36.67%和40%,顯著低于對(duì)照,說明轉(zhuǎn)植物過表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3的陽性植株OEA1-OEA3對(duì)大豆疫霉根腐病根腐病的抗性得到了顯著的提高(表2)。
相反的,轉(zhuǎn)基因陽性株系IEA1-IEA4對(duì)疫霉菌 1 號(hào)生理小種抗性水平較受體對(duì)照品種顯著降低,其中IEA3株系的接種死亡率最高,為76.67%,其次是IEA2為73.33%,都達(dá)到了感病水平;IEA1、IEA4株系的抗性水平同對(duì)照CK都一樣,都是中感水平,但接種死亡率分別為63.33%和66.67%,顯著高于對(duì)照,說明轉(zhuǎn)植物干擾表達(dá)載體pCAMBIA3301-Gmsbt1.6-3-RNAi植株IEA1-IEA4對(duì)大豆疫霉根腐病根腐病的抗性受到了明顯的抑制。
本試驗(yàn)采用RT-PCR的方法,從大豆苗期根系的cDNA中成功分離克隆了一個(gè)新的大豆類枯草桿菌蛋白酶基因Gmsbt1.6-3,該基因在結(jié)構(gòu)上具有類枯草桿菌蛋白酶家族典型的 Asp/Ser/His 催化結(jié)構(gòu)。研究表明,類枯草桿菌蛋白酶在結(jié)構(gòu)上雖然有相似性,但在其表達(dá)和功能上存在差異。在擬南芥中,SDD1在氣孔前體細(xì)胞中強(qiáng)烈表達(dá),與調(diào)節(jié)氣孔密度的信號(hào)傳導(dǎo)有關(guān);ALE1基因在種子萌發(fā)過程中特異表達(dá),與擬南芥胚發(fā)育過程中的角質(zhì)層形成和表皮分化時(shí)信號(hào)肽的產(chǎn)生有關(guān);AIR3在側(cè)根形成過程中表達(dá),參與調(diào)控側(cè)根原基數(shù)量;Ara12在角果、莖及葉片中表達(dá),參與植株形態(tài)建成。在番茄中,P69A 在除根和花之外的所有植物器官中表達(dá)且與細(xì)胞延伸相關(guān);P69D除不在根中表達(dá)外,在其他器官中都有表達(dá),與細(xì)胞分裂、延伸相關(guān)。大豆中,SCS1在種皮中表達(dá)量最高,與厚壁組織的分化有關(guān);SLP-1在處于發(fā)育期種子的種皮中表達(dá),而SLP-2主要在發(fā)芽種子的子葉中表達(dá),這兩個(gè)基因都參與種子萌發(fā)。粗枝木麻黃中,cg12在根瘤形成早期受弗蘭克氏菌(Frankia)誘導(dǎo)表達(dá),參與粗枝木麻黃和弗蘭克氏菌的共生過程。
本研究通過在大豆植株中對(duì)Gmsbt1.6-3基因進(jìn)行過量表達(dá)和干擾表達(dá),鑒定新基因功能。接種大豆疫霉根腐病病原菌,進(jìn)行熒光定量PCR分析結(jié)果表明,大豆類枯草桿菌蛋白酶基因Gmsbt1.6-3受大豆疫霉根腐病病原菌侵染誘導(dǎo)表達(dá),該基因在大豆抗病反應(yīng)中的作用及調(diào)控機(jī)制有待于進(jìn)一步研究與驗(yàn)證。
<110> 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)
<120> 大豆類枯草桿菌蛋白酶基因及應(yīng)用
<160> 1
<210> 1
<211> 764
<212> DNA
<213> 人工
<400> 1
aagtggaagg gccactgcgt tgctgctaaa gactttcccc ccacctcctg caaccggaaa 60
ctcatcggag ctcgctactt ctgcgctggc tacgaagcca ccaacggcaa aatgaacgac 120
actttggagt cccgttcccc gagagactcc gacggtcacg gcacccacac ggcttccatc 180
gccgccggca ggtacgtctt cccggcctcc accatgggct acgccaaagg aatgggcgcc 240
gggatggctc ccaaggctcg cctcgccgtc tacaaggtct gctggaacgc cggctgctac 300
gactccgaca tcctcgccgc gttcgacgcc gccgtggccg acggcgtcga cgtggtcacc 360
tcagcgtcgg gggcgtggtg gtgccctacc acctcgacgt catcgccgtc ggggccttcg 420
gagcctccga ggctggcgtc ttcgtgtctg gcctcggcgg gtaacggcgg tcccggcggc 480
ctcacggtga ccaatgtggc accctgggtc accactgtgg gcgccggaac cttagacaga 540
gatttcccgg cggatgttgt gctggggaac ggcaaggtga ttggcgggat gagtgtgtac 600
ggtggaccgg gtctgactcc aggtcggctc tatcctctgg tgtatgcggg ttcggatggt 660
tactcttcct ctctttgctt ggaagattcg ttggatccct agtctgtgtc aaaaaagatt 720
aatgtttgtg gtcgaggcgt caattcaaga gcagccgctt aaaa 764