技術(shù)特征：

1.一種浙江省地方豬種tagSNP鑒定方法，所述方法包括：

(1)提取樣本基因組DNA；

(2)根據(jù)特異性SNP座位所在染色體和位置信息設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物，依次分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增，擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳：

各豬種特異性SNP座位如下：

碧湖豬特異性SNP座位：

序號所在染色體所在位置參考基因組突變位點(diǎn)1chr1162145327GT2chr15151642291TC3chr57987665GA4chr57987678GA5chr511991156GA

淳安花豬特異性SNP座位：

序號所在染色體所在位置參考基因組突變位點(diǎn)1chr113969970CT2chr1468345209AG3chr14135018196AT4chr82228395CT

岔路黑豬特異性SNP座位：

序號所在染色體所在位置參考基因組突變位點(diǎn)1chr1850634190CG2chr1857736749CT3chr374403769GA4chr476217102GA5chr637444222CT

金華兩頭烏特異性SNP座位：

序號所在染色體所在位置參考基因組突變位點(diǎn)1chr1257635960GA2chr1394944468GA3chr1734662047CT4chr1853715725GA5chr713107153CT

嘉興黑豬特異性SNP座位：

序號所在染色體所在位置參考基因組突變位點(diǎn)1chr115214978CT2chr1122873017TA3chr136763069GC4chr24585814GA5chr231124306AG

蘭溪花豬特異性SNP座位：

序號所在染色體所在位置參考基因組突變位點(diǎn)1chr1388462451CA2chr13201999446CT3chr1656032490CT4chr1761813810CT5chr621197790TC

嵊縣花豬特異性SNP座位：

序號所在染色體所在位置參考基因組突變位點(diǎn)1chr1061186504CT2chr1261412548TC3chr13213292913CA4chr1423522515CG5chr14130678090TG

(3)結(jié)果判斷：根據(jù)PCR擴(kuò)增結(jié)果，參照上述各豬種特異性SNP座位進(jìn)行判定：若檢測到有一個以上座位與上述特異性SNP座位相符，則判定為具有該特異性座位的品種。