本發(fā)明涉及肌醇的制備方法,尤其涉及體外多酶催化將淀粉或纖維素以及它們的衍生物轉(zhuǎn)化為肌醇的方法,屬于肌醇的酶催化生產(chǎn)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
肌醇又名環(huán)已六醇,是水溶性維生素B族中的一種。肌醇是人、動物與微生物生長的必需物質(zhì),廣泛應(yīng)用于醫(yī)藥、食品、飼料等行業(yè)。目前全球的需求量大概在每年5,000噸左右,由于目前肌醇的高售價,使得肌醇的市場前景還未得到充分的開發(fā),例如2013年全球飼料產(chǎn)量為9.6億噸,如果都加入0.2-0.5%的肌醇,那么飼料工業(yè)所需肌醇的產(chǎn)量應(yīng)該達到每年190-480萬噸。在這種情況下,目前中國國內(nèi),甚至全世界的產(chǎn)量都遠遠不能滿足需求。
目前肌醇的生產(chǎn)主要還是傳統(tǒng)的高溫加壓水解植酸(六磷酸肌醇)。該工藝設(shè)備材質(zhì)要求嚴格,一次性投資大,操作壓力只能控制在一定的范圍內(nèi),限制了原材料利用率的提高,且粗產(chǎn)品精制工藝復雜,損失較多,生產(chǎn)成本較高,而且該工藝會產(chǎn)生大量的磷酸污染物,對水源,環(huán)境污染嚴重。近些年,為了減少能耗和污染開發(fā)了常壓水解法。目前研究肌醇生產(chǎn)的熱點在化學合成法和微生物酶解法,然而均不同程度的存在成本高、產(chǎn)率低等問題。
因此,亟待開發(fā)一種低成本,低污染,高產(chǎn)率的生產(chǎn)肌醇的新方法。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供一種肌醇的酶催化轉(zhuǎn)化方法,通過體外多酶催化淀粉或纖維素以及它們的衍生物和葡萄糖生產(chǎn)肌醇的方法,該方法具有肌醇產(chǎn)率和轉(zhuǎn)化率高,生產(chǎn)成本低,無污染等優(yōu)點。
為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明所采取的技術(shù)方案是:
本發(fā)明首先公開了一種肌醇的制備方法,包括以下步驟:
(1)以淀粉或淀粉衍生物為底物,加入葡聚糖磷酸化酶(α-Glucan phosphorylase,EC 2.4.1.1),葡萄糖磷酸變位酶(Phosphoglucomutase,EC 5.4.2.2),肌醇-3-磷酸合成酶(Inositol-3-phophate synthase,EC 5.5.1.4)和肌醇單磷酸酶(Inositol monophosphatase,EC 3.1.3.25)建立多酶反應(yīng)體系,進行酶催化反應(yīng);(2)將反應(yīng)產(chǎn)物進行分離、純化,即得。
其中,步驟(1)所述底物的濃度為10g/L;所述葡聚糖磷酸化酶的用量為0.05U/mL,所述葡萄糖磷酸變位酶的用量為1U/mL,所述肌醇-3-磷酸合成酶的用量為0.05U/mL,所述肌醇單磷酸酶的用量為2U/mL;所述酶催化反應(yīng)的條件是在40-80℃反應(yīng)10-100小時;優(yōu)選為,在60℃反應(yīng)40小時。
在所述多酶反應(yīng)體系中加入淀粉去分支酶和麥芽糖磷酸化酶(EC2.4.1.8),或者,淀粉去分支酶和葡聚糖轉(zhuǎn)移酶(EC 2.4.1.25),能夠有效提高肌醇的得率和轉(zhuǎn)化率;優(yōu)選的,所述淀粉去分支酶的用量為1U/mL,所述麥芽糖磷酸化酶(maltose phosphorylase,EC 2.4.1.8)或葡聚糖轉(zhuǎn)移酶的用量為1U/mL;其中,所述去分支酶為異淀粉酶(isoamylase,EC3.2.1.68)或普魯蘭酶(pullulanase,EC 3.2.1.41)中的任意一種或兩種;
更優(yōu)選的,所述底物的濃度為10g/L;所述葡聚糖磷酸化酶的用量為5U/mL,所述葡萄糖磷酸變位酶的用量為1U/mL,所述肌醇-3-磷酸合成酶的用量為5U/mL,所述肌醇單磷酸酶的用量為2U/mL,所述淀粉去分支酶的用量為1U/mL,所述麥芽糖磷酸化酶或葡聚糖轉(zhuǎn)移酶的用量為1U/mL;
所述酶催化反應(yīng)在40-100℃反應(yīng)10-100小時;優(yōu)選的,所述酶催化反應(yīng)在40-80℃反應(yīng)40小時;最優(yōu)選的,所述酶催化反應(yīng)在80℃反應(yīng)40小時。
為了進一步提高肌醇的得率,將冗余的葡萄糖轉(zhuǎn)化為肌醇,在所述多酶反應(yīng)體系中加入聚磷酸葡萄糖激酶(polyphosphate glucokinase,EC2.7.1.63)和聚磷酸鹽;優(yōu)選的,所述聚磷酸葡萄糖激酶的用量為1U/mL,所述聚磷酸鹽的用量為10mM;其中,所述聚磷酸鹽優(yōu)選為聚磷酸鈉。
所述多酶反應(yīng)體系還含有以下各成分:緩沖液、無機磷酸根、二價鎂離子和鋅離子或錳離子;優(yōu)選的,各成分的用量為:緩沖液100mM,無機磷酸根10mM,二價鎂離子5mM,鋅離子或錳離子0.5mM;其中,所述緩沖液優(yōu)選為HEPES緩沖液,更優(yōu)選的,HEPES緩沖液的pH值7.2。
反應(yīng)結(jié)束后,殘余的淀粉殘渣將是純的直鏈淀粉,此時可加入少量的α淀粉酶(EC 3.2.1.1)促進淀粉殘渣的水解,進一步提高肌醇的產(chǎn)量。優(yōu)選的,α淀粉酶的用量為0.1U/ml。
本發(fā)明以淀粉或淀粉衍生物為底物,加入葡聚糖磷酸化酶,葡萄糖磷酸變位酶,肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶,配制多酶反應(yīng)體系,多酶催化途徑包括:由葡聚糖磷酸化酶將淀粉或淀粉衍生物中的一個葡萄糖單元轉(zhuǎn)化為葡萄糖-1-磷酸;由葡萄糖磷酸變位酶將葡萄糖-1-磷酸轉(zhuǎn)化為葡萄糖-6-磷酸;由肌醇-3-磷酸合成酶將葡萄糖-6-磷酸轉(zhuǎn)化為肌醇-3-磷酸,由肌醇單磷酸酶將肌醇-3-磷酸轉(zhuǎn)化為肌醇。由于由肌醇-3-磷酸合成酶將葡萄糖-6-磷酸轉(zhuǎn)化為肌醇-3-磷酸和由肌醇單磷酸酶將肌醇-3-磷酸轉(zhuǎn)化為肌醇的兩個酶催化反應(yīng)是不可逆反應(yīng),所以該酶催化體系能夠得到很高的轉(zhuǎn)化率。而高得率和高轉(zhuǎn)化率可以大大降低最終肌醇的分離成本。
由于淀粉是直鏈淀粉(20-30%)和支鏈淀粉(70-80%)的混合物。支鏈淀粉中的支鏈是以α-1,6糖苷鍵與主鏈相連的,而葡聚糖磷酸化酶并不能分解α-1,6糖苷鍵。為了提高肌醇的轉(zhuǎn)化率,本發(fā)明在多酶反應(yīng)體系中加入了能夠分解淀粉中α-1,6糖苷鍵的去分支酶—異淀粉酶或普魯蘭酶。由于葡聚糖磷酸化酶水解淀粉的最終產(chǎn)物是麥芽糖,為了利用麥芽糖, 本發(fā)明還在反應(yīng)體系中加入麥芽糖磷酸化酶,將麥芽糖分解為葡萄糖-1-磷酸和葡萄糖;更優(yōu)選的,本發(fā)明在多酶反應(yīng)體系中再加入聚磷酸和聚磷酸葡萄糖激酶,將葡萄糖轉(zhuǎn)化為葡萄糖-6-磷酸,由肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶轉(zhuǎn)化為肌醇,最終將淀粉及其衍生物中所有的葡萄糖單元轉(zhuǎn)化為肌醇,從而提高肌醇的得率和轉(zhuǎn)化率。在這里,麥芽糖磷酸化酶可被葡聚糖轉(zhuǎn)移酶(4-a-glucanotransferase,EC.2.4.1.25)替換,該酶可以將短鏈的寡聚糖聚合成為長鏈的寡聚糖,而該長鏈的寡聚糖又可被葡聚糖磷酸化酶重新利用,從而能夠提高淀粉的利用率。
本發(fā)明所述淀粉優(yōu)選為可溶性淀粉;所述淀粉衍生物包括部分水解淀粉、淀粉糊精、麥芽糊精、麥芽多糖或麥芽糖中的任意一種或多種。
本發(fā)明還公開了另一種肌醇的制備方法,包括以下步驟:
(1)以纖維素或纖維素衍生物為底物,加入纖維素酶,纖維多糖磷酸化酶(cellodextrin phosphorylase,EC 2.4.1.49)、纖維二糖磷酸化酶(cellobiose phosphorylase,EC 2.4.1.20)、葡萄糖磷酸變位酶(EC 5.4.2.2)、肌醇-3-磷酸合成酶(EC 5.5.1.4)和肌醇單磷酸酶(EC 3.1.3.25)建立多酶反應(yīng)體系,進行酶催化反應(yīng);(2)將反應(yīng)產(chǎn)物分離、純化,即得。
本發(fā)明以纖維素為底物,加入纖維素酶,纖維多糖磷酸化酶、纖維二糖磷酸化酶、葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶,配制多酶反應(yīng)體系,該多酶催化途徑包括:由纖維素酶水解纖維素生成纖維多糖和纖維二糖;由纖維多糖磷酸化酶、纖維二糖磷酸化酶將纖維多糖或纖維二糖的一個葡萄糖單元轉(zhuǎn)化為葡萄糖-1-磷酸;由葡萄糖磷酸變位酶將葡萄糖-1-磷酸轉(zhuǎn)化為葡萄糖-6-磷酸;由肌醇-3-磷酸合成酶將葡萄糖-6-磷酸轉(zhuǎn)化為肌醇-3-磷酸,由肌醇單磷酸酶將肌醇-3-磷酸轉(zhuǎn)化為肌醇。
其中,步驟(1)優(yōu)選為,先將10g/L纖維素或纖維素衍生物和5U/ml纖維素酶在冰水浴上混合,放置于冰水浴中5分鐘,然后4oC離心,去上清,得到纖維素酶和纖維素的混合物;該處理能夠去除商業(yè)化纖維素酶中幾乎所有的葡萄糖苷酶,這樣可以避免葡萄糖苷酶水解纖維二糖生成大量的葡萄糖,從而使主要的水解產(chǎn)物是纖維二糖和纖維多糖。
在多酶反應(yīng)體系中,所述纖維素酶和纖維素的混合物的濃度為10g/L;所述纖維多糖磷酸化酶的用量為5U/mL,所述纖維二糖磷酸化酶的用量為5U/mL,所述葡萄糖磷酸變位酶的用量為1U/mL,所述肌醇-3-磷酸合成酶的用量為5U/mL,所述肌醇單磷酸酶的用量為2U/mL;所述酶催化反應(yīng)是在20-100℃反應(yīng)10-100小時;優(yōu)選為,在40-80℃反應(yīng)72小時;最優(yōu)選為,在50℃反應(yīng)72小時。
為了進一步提高肌醇的得率,步驟(1)中的多酶反應(yīng)體系加入聚磷酸葡萄糖激酶(EC 2.7.1.63)和聚磷酸鹽;優(yōu)選的,所述聚磷酸葡萄糖激酶的用量為5U/mL,所述聚磷酸鹽的用量為10mM;其中,所述聚磷酸鹽優(yōu)選為聚磷酸鈉。
為了提高酶催化反應(yīng)的效率和產(chǎn)品的收率,所述多酶反應(yīng)體系還含有 以下各成分:緩沖液、無機磷酸根、二價鎂離子和鋅離子或錳離子;優(yōu)選的,各成分的用量為:緩沖液100mM,無機磷酸根10mM,二價鎂離子5mM,鋅離子或錳離子0.5mM;其中,所述緩沖液優(yōu)選為100mM HEPES緩沖液;進一步優(yōu)選的,所述HEPES緩沖液的pH值是7.2。
本發(fā)明在多酶反應(yīng)體系中再加入聚磷酸葡萄糖激酶和聚磷酸,將纖維素水解后的最終產(chǎn)物葡萄糖轉(zhuǎn)化為葡萄糖-6-磷酸,再由肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶催化轉(zhuǎn)化為肌醇,最終將纖維素及其衍生物中所有的葡萄糖單元轉(zhuǎn)化為肌醇。
本發(fā)明所述纖維素衍生物包括纖維素經(jīng)過預(yù)處理后的產(chǎn)物,纖維多糖或纖維二糖中的任意一種;
其中,纖維素預(yù)處理方法有多種,例如酸水解法、酶水解法、物理法等;本發(fā)明所述纖維素經(jīng)過預(yù)處理后的產(chǎn)物,優(yōu)選為纖維素經(jīng)過濃磷酸處理后的產(chǎn)物。
本發(fā)明多酶反應(yīng)體系中的任何一種酶還可以為任何一種具有同等功能的酶所替換,優(yōu)選為通過蛋白質(zhì)工程改造所獲得的具有同等功能的突變酶。
本發(fā)明體外多酶催化將淀粉轉(zhuǎn)化為肌醇試驗中,在一個反應(yīng)體系中,以可溶性淀粉為原料,加入葡聚糖磷酸化酶,葡萄糖磷酸變位酶,肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶,進行催化反應(yīng),最終肌醇的轉(zhuǎn)化率為16%。在上述反應(yīng)體系中另外加入異淀粉酶,麥芽糖磷酸化酶,聚磷酸葡萄糖激酶和聚磷酸鈉,同時提高葡聚糖磷酸化酶和肌醇-3-磷酸合成酶的用量,最終肌醇的轉(zhuǎn)化率達到72%,轉(zhuǎn)化率顯著提高。
本發(fā)明體外多酶催化將纖維素轉(zhuǎn)化為肌醇實驗中,在一個反應(yīng)體系中,以微晶形的纖維素(Avicel)為底物,加入纖維素酶、纖維多糖磷酸化酶,纖維二糖磷酸化酶,葡萄糖磷酸變位酶,肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶,進行催化反應(yīng),最終肌醇的轉(zhuǎn)化率為14%;以重生的非晶形的纖維素為底物,加入纖維素酶、纖維多糖磷酸化酶,纖維二糖磷酸化酶,葡萄糖磷酸變位酶,肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶,進行催化反應(yīng),最終肌醇的轉(zhuǎn)化率為48%。在上述反應(yīng)體系中另外加入聚磷酸葡萄糖激酶和聚磷酸鈉,最終肌醇的轉(zhuǎn)化率達到65%,轉(zhuǎn)化率顯著提高。
本發(fā)明技術(shù)方案與現(xiàn)有技術(shù)相比,具有以下有益效果:
本發(fā)明在一個多酶反應(yīng)體系中,以淀粉或纖維素以及它們的衍生物為原料,通過體外多酶催化轉(zhuǎn)化為肌醇,并通過過程優(yōu)化,添加能促進淀粉或纖維素水解的酶以及利用副產(chǎn)物(葡萄糖)的酶,使轉(zhuǎn)化效率顯著提高,高得率和高轉(zhuǎn)化率又大大降低肌醇的分離成本。本發(fā)明方法具有簡便,原料利用率高、肌醇產(chǎn)率高,生產(chǎn)成本低,污染低等優(yōu)點,可以實現(xiàn)肌醇的規(guī)?;a(chǎn)。
本發(fā)明所涉及到的術(shù)語及定義
除非另外定義,否則本文所用的所有技術(shù)及科學術(shù)語都具有與本發(fā)明所屬領(lǐng)域的普通技術(shù)人員通常所了解相同的含義。
術(shù)語“酶催化反應(yīng)”意指在生物催化劑-酶作用下進行的化學反應(yīng)。
術(shù)語“葡萄糖多聚物”意指葡萄糖分子聚合而成的淀粉或纖維素。
術(shù)語“葡萄糖寡聚物”意指部分水解的淀粉、淀粉糊精、麥芽多糖、麥芽糖、纖維多糖或纖維二糖等。
附圖說明
圖1為轉(zhuǎn)化淀粉生成肌醇的體外多酶催化途徑的示意圖;其中,IA,異淀粉酶;PA,普魯蘭酶;αGP,葡聚糖磷酸化酶;PGM,葡萄糖磷酸變位酶;IPS,肌醇-3-磷酸合成酶;IMP,肌醇單磷酸酶;MP,麥芽糖磷酸化酶(該酶可被葡聚糖轉(zhuǎn)移酶替換);PPGK,聚磷酸葡萄糖激酶;
圖2為SDS-PAGE檢測4個關(guān)鍵酶;其中,第1列,葡聚糖磷酸化酶;第2列,葡萄糖磷酸變位酶;第3列,肌醇-3-磷酸合成酶;第4列,肌醇單磷酸酶;
圖3為利用HPLC分析肌醇;其中,圖3a為用HPLC方式區(qū)分肌醇、葡萄糖、葡萄糖-1-磷酸和葡萄糖-6-磷酸;圖3b為用HPLC定量分析肌醇的濃度,通過肌醇峰的強度可以定量得到肌醇的濃度;
圖4為利用HPLC檢測以可溶性淀粉為底物,經(jīng)過酶促反應(yīng)后的產(chǎn)物,箭頭所指表示肌醇的特征峰;
圖5為利用HPLC檢測以麥芽糊精為底物,經(jīng)過酶促反應(yīng)后的產(chǎn)物,箭頭所指表示肌醇的特征峰;
圖6為轉(zhuǎn)化纖維素生成肌醇的體外多酶催化途徑的示意圖;其中,Cellulase,纖維素酶;CDP,纖維多糖磷酸化酶;CBP,纖維二糖磷酸化酶;PGM,葡萄糖磷酸變位酶;IPS,肌醇-3-磷酸合成酶;IMP,肌醇單磷酸酶;PPGK,聚磷酸葡萄糖激酶;
圖7為SDS-PAGE檢測轉(zhuǎn)化纖維素生成肌醇的2個關(guān)鍵酶;其中,第1列,纖維二糖磷酸化酶,第2列,纖維多糖磷酸化酶;
圖8為利用HPLC檢測以微晶形纖維素(Avicel)為底物,經(jīng)過酶促反應(yīng)后的產(chǎn)物,箭頭所指表示肌醇的特征峰。
具體實施方式
下面結(jié)合具體實施例來進一步描述本發(fā)明,本發(fā)明的優(yōu)點和特點將會隨著描述而更為清楚。但是應(yīng)理解所述實施例僅是范例性的,不對本發(fā)明的范圍構(gòu)成任何限制。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)該理解的是,在不偏離本發(fā)明的精神和范圍下可以對本發(fā)明技術(shù)方案的細節(jié)和形式進行修改或替換,但這些修改或替換均落入本發(fā)明的保護范圍。
實驗材料
可溶性淀粉,soluble starch,ACROS公司產(chǎn)品,產(chǎn)品編號:424490020;
麥芽糊精,ALDRICH公司產(chǎn)品,產(chǎn)品編號419672;
pET20b載體,Novagen,Madison,WI;
大腸桿菌表達菌BL21(DE3),Invitrogen,Carlsbad,CA;
本發(fā)明中的大部分酶(除了肌醇單磷酸酶,聚磷酸葡萄糖激酶和葡聚糖轉(zhuǎn)移酶)能在Sigma公司購買得到;但是都可以按照基因工程方法通過原核表達獲得;
纖維素酶從Sigma公司購買,產(chǎn)品編號為C2730;
麥芽糖磷酸化酶從Sigma公司購買,產(chǎn)品編號為M8284;
α淀粉酶從Sigma公司購買,產(chǎn)品編號為10065;
Avicel,微晶形纖維素,從Sigma公司購買,產(chǎn)品編號為11365。
實驗例1體外多酶催化將淀粉轉(zhuǎn)化為肌醇
通過一個體外多酶催化體系將淀粉轉(zhuǎn)化為肌醇(圖1)。這些關(guān)鍵酶包括:(1)葡聚糖磷酸化酶(αGP,EC 2.4.1.1),從淀粉上釋放出葡萄糖-1-磷酸;(2)葡萄糖磷酸變位酶(PGM,EC 5.4.2.2),催化葡萄糖-1-磷酸到葡萄糖-6-磷酸;(3)肌醇-3-磷酸合成酶(IPS,EC 5.5.1.4),其催化葡萄糖-6-磷酸為肌醇-3-磷酸;(4)肌醇單磷酸酶(IMP,EC 3.1.3.25),其將肌醇-3-磷酸脫磷成為肌醇。由于最后兩個酶反應(yīng)是不可逆反應(yīng),所以該酶催化體系能夠得到很高的轉(zhuǎn)化率。
在本發(fā)明中,葡聚糖磷酸化酶來源于Thermotoga maritima,基因在KEGG上的編號為TM1168,葡萄糖磷酸變位酶也來源于Thermotoga maritima,基因在KEGG上的編號為TM0769,肌醇-3-磷酸合成酶來源于Archaeoglobus fulgidus,基因在KEGG上的編號為AF1794,肌醇單磷酸酶也來源于Thermotoga maritima,基因在KEGG上的編號為TM1415,這些基因組DNA都可從ATCC的官方網(wǎng)站(www.atcc.org)上獲得。這四個基因分別用不同的引物從相應(yīng)的基因組DNA中通過PCR獲取,并通過Simple Cloning(You,C.,et al.(2012)."Simple Cloning via Direct Transformation of PCR Product(DNA Multimer)to Escherichia coli and Bacillus subtilis."Appl.Environ.Microbiol.78(5):1593-1595.)的方法克隆至pET20b載體((Novagen,Madison,WI)中,獲得相應(yīng)的表達載體pET20b-TmαGP,pET20b-AfIPS,pET20b-TmPGM和pET20b-TmIMP。這四個質(zhì)粒都轉(zhuǎn)化至大腸桿菌表達菌BL21(DE3)(Invitrogen,Carlsbad,CA)中,并進行蛋白質(zhì)表達與純化,蛋白質(zhì)純化的結(jié)果如圖2所示。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,0.05U/mL的葡聚糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,0.05U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,10g/L的可溶性淀粉,在60℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)40個小時。
根據(jù)保持時間的不同,HPLC可以用來區(qū)分反應(yīng)液中的肌醇、葡萄糖、葡萄糖-1-磷酸或葡萄糖-6-磷酸(圖3a);并且可以對肌醇進行定量,如圖3b所示,肌醇的濃度與HPLC中肌醇特征峰的強度是成正比的;HPLC的流動相為5mM的稀硫酸。
反應(yīng)結(jié)束后,最終肌醇(圖4)的終濃度是1.6g/L,轉(zhuǎn)化率為16%。
實驗例2體外多酶催化將淀粉轉(zhuǎn)化為肌醇
葡聚糖磷酸化酶、葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,0.05U/mL的葡聚糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,0.05U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,10g/L的可溶性淀粉,在40℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)40個小時。
反應(yīng)結(jié)束后,最終肌醇的終濃度是0.9g/L,轉(zhuǎn)化率為9%。
實驗例3體外多酶催化將淀粉轉(zhuǎn)化為肌醇
葡聚糖磷酸化酶、葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,0.05U/mL的葡聚糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,0.05U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,10g/L的可溶性淀粉,在80℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)40個小時。
反應(yīng)結(jié)束后,最終肌醇的終濃度是3.6g/L,轉(zhuǎn)化率為36%。
實驗例4通過過程優(yōu)化和添加促進淀粉水解的酶,利用體外多酶催化將淀粉轉(zhuǎn)化為肌醇
由于淀粉是有分支鏈,單純采用葡聚糖磷酸化酶并不能完全將淀粉水解,因為葡聚糖磷酸化酶只會作用于α-1,4糖苷鍵,而分支鏈是以α-1,6糖苷鍵與主鏈連接的。這需要加入異淀粉酶(isoamylase,EC 3.2.1.68)水解α-1,6糖苷鍵。最后,淀粉被這兩種酶水解的最終產(chǎn)物是麥芽糖和葡萄糖,為了將這些最終產(chǎn)物轉(zhuǎn)化為肌醇,還需要加入麥芽糖磷酸化酶(maltose phosphorylase,EC 2.4.1.8)和聚磷酸葡萄糖激酶(polyphosphate glucokinase,EC 2.7.1.63)。
在本發(fā)明中,異淀粉酶來源于Sulfolobus tokodaii,基因在KEGG上的編號為ST0928,該菌株的基因組DNA是德國Albert-Ludwigs-Freiburg的Georg Fuchs教授友情提供。聚磷酸葡萄糖激酶來源于Thermobifida fusca,基因在KEGG上的編號為Tfu1811,該菌株的基因組 DNA是美國康奈爾大學的David Wilson教授友情提供。葡聚糖轉(zhuǎn)移酶來源于Thermococcus litoralis,基因在KEGG上的編號為OCC_10078,該菌株的基因組DNA可從ATCC的官方網(wǎng)站(www.atcc.org)上獲得。這三個基因分別用不同的引物從相應(yīng)的基因組DNA中通過PCR獲取,并通過Simple Cloning(You,C.,et al.(2012)."Simple Cloning via Direct Transformation of PCR Product(DNA Multimer)to Escherichia coli and Bacillus subtilis."Appl.Environ.Microbiol.78(5):1593-1595.)的方法克隆至pET20b載體中,獲得相應(yīng)的表達載體pET20b-StIA,pET20b-TfuPPGK和pET20b-Ti4GT,這三個質(zhì)粒都轉(zhuǎn)化至大腸桿菌表達菌BL21(DE3)中,并進行蛋白質(zhì)表達與純化。
葡聚糖磷酸化酶、葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1;麥芽糖磷酸化酶從Sigma公司購買,產(chǎn)品編號為M8284。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,5U/mL的葡聚糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,5U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,1U/mL的異淀粉酶,1U/mL的麥芽糖磷酸化酶,1U/mL的聚磷酸葡萄糖激酶,10mM聚磷酸鈉,10g/L的可溶性淀粉,在80℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)40個小時。最終肌醇(圖4)的終濃度為7.2g/L,轉(zhuǎn)化率達到了72%。
實驗例5通過過程優(yōu)化和添加促進淀粉水解的酶,利用體外多酶催化將淀粉轉(zhuǎn)化為肌醇
葡聚糖磷酸化酶、葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1;聚磷酸葡萄糖激酶的制備同實驗例4,普魯蘭酶(pullulanase,EC 3.2.1.41)從Sigma公司購買,產(chǎn)品編號為P1067;麥芽糖磷酸化酶從Sigma公司購買,產(chǎn)品編號為M8284。
由于從sigma公司購買的普魯蘭酶不能在高溫(80℃)下反應(yīng),因此先在37℃用普魯蘭酶處理可溶性淀粉,隨后再加入其他的酶,再在80℃反應(yīng)。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,1U/mL的普魯蘭酶,10mM聚磷酸鈉,10g/L的可溶性淀粉,在37℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)10個小時后加入5U/mL的葡聚糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,5U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,1U/mL的麥芽糖磷酸化酶,1U/mL的聚磷酸葡萄糖激酶,在80℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)40個小時。最終肌醇(圖4)的終濃度為7.3g/L,轉(zhuǎn)化率達到了73%。
隨后在反應(yīng)體系中加入少量的α淀粉酶促進殘渣淀粉的水解,提高肌醇的產(chǎn)量,α淀粉酶的用量為0.1U/ml,反應(yīng)先在37℃反應(yīng)6小時,隨后 繼續(xù)在80℃反應(yīng)24小時,最終肌醇(圖4)的終濃度為8.8g/L,轉(zhuǎn)化率達到了88%。
實驗例6體外多酶催化將麥芽糊精轉(zhuǎn)化為肌醇
葡聚糖磷酸化酶、葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1;異淀粉酶、聚磷酸葡萄糖激酶的制備同實驗例4,麥芽糖磷酸化酶從Sigma公司購買,產(chǎn)品編號為M8284;
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,5U/mL的葡聚糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,5U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,1U/mL的異淀粉酶,1U/mL的麥芽糖磷酸化酶,1U/mL的聚磷酸葡萄糖激酶,10mM聚磷酸鈉,10g/L的麥芽糊精(ALDRICH公司產(chǎn)品,產(chǎn)品編號419672),在80℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)40個小時。最終肌醇(圖5)的終濃度為7.8g/L,轉(zhuǎn)化率達到了78%。
實驗例7體外多酶催化將纖維素轉(zhuǎn)化為肌醇
通過一個體外多酶催化體系將纖維素轉(zhuǎn)化為肌醇的示意圖見圖6。
纖維素酶是來自于Sigma公司的產(chǎn)品,產(chǎn)品編號為C2730;葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1。
纖維多糖磷酸化酶(Cthe_2989)和纖維二糖磷酸化酶(Cthe_0275)都是來源于Clostridium thermocellum。這兩個基因分別用不同的引物從相應(yīng)的基因組DNA(基因組DNA可從ATCC的官方網(wǎng)站(www.atcc.org/)上獲得)中通過PCR獲取,并通過Simple Cloning(You,C.,et al.(2012))的方法克隆至pET20b載體中,獲得相應(yīng)的表達載體pET20b-CthCDP和pET20b-CthCBP。這兩個質(zhì)粒都轉(zhuǎn)化至大腸桿菌表達菌BL21(DE3)中,并進行蛋白質(zhì)表達與純化,蛋白質(zhì)純化的結(jié)果如圖7所示。
本實驗采用微晶形纖維素(Avicel)為底物。首先將商業(yè)化的纖維素酶(5U/ml)和纖維素(10g/L)在冰水浴上混合,放置于冰水浴中5分鐘,在4℃離心,去上清。沉淀為纖維素和能與纖維素結(jié)合的纖維素酶的混合物。該處理能夠去除商業(yè)化纖維素酶中幾乎所有的葡萄糖苷酶,這樣可以避免葡萄糖苷酶水解纖維二糖生成大量的葡萄糖,從而使主要的水解產(chǎn)物是纖維二糖和纖維多糖。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,5U/mL的纖維多糖磷酸化酶,5U/mL纖維二糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,5U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,10g/L的如上所述的纖維素和纖維素酶的混合物,在50℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)72個小時。最終肌醇的終濃度是1.4g/L,轉(zhuǎn)化率為14%,如圖8所示。
實驗例8體外多酶催化將纖維素轉(zhuǎn)化為肌醇
纖維素酶是來自于Sigma公司的產(chǎn)品,產(chǎn)品編號為C2730;葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶、肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1;纖維多糖磷酸化酶和纖維二糖磷酸化酶的制備同實驗例7。
本實驗采用重生的非晶形的纖維素(Regenerated Amorphous cellulose(RAC),這是Avicel經(jīng)過濃磷酸處理后的產(chǎn)物)(Zhang,Y.H.P.,et al.(2006)."A Transition from Cellulose Swelling to Cellulose Dissolution by o-Phosphoric Acid:Evidence from Enzymatic Hydrolysis and Supramolecular Structure."Biomacromolecules 7(2):644-648.)為底物。首先將商業(yè)化的纖維素酶(5U/ml)和該纖維素(10g/L)在冰水浴上混合,放置于冰水浴中5分鐘,在4℃離心,去上清。沉淀為纖維素和能與纖維素結(jié)合的纖維素酶的混合物。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,5U/mL的纖維多糖磷酸化酶,5U/mL纖維二糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,5U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,10g/L的如上所述的纖維素和纖維素酶的混合物,在50℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)72個小時。最終肌醇的終濃度是4.8g/L,轉(zhuǎn)化率為48%。
實驗例9體外多酶催化將纖維素轉(zhuǎn)化為肌醇
纖維素酶是來自于Sigma公司的產(chǎn)品,產(chǎn)品編號為C2730;葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶、肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1;纖維多糖磷酸化酶和纖維二糖磷酸化酶的制備同實驗例7。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,5U/mL的纖維多糖磷酸化酶,5U/mL纖維二糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,5U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,10g/L的如實驗例8的纖維素和纖維素酶的混合物,在40℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)72個小時。最終肌醇的終濃度是2.3g/L,轉(zhuǎn)化率為23%。
實驗例10體外多酶催化將纖維素轉(zhuǎn)化為肌醇
纖維素酶是來自于Sigma公司的產(chǎn)品,產(chǎn)品編號為C2730;葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶、肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1;纖維多糖磷酸化酶和纖維二糖磷酸化酶的制備同實驗例7。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,5U/mL的纖維多糖磷酸化酶,5U/mL纖維二糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,5U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,10g/L的 如實驗例8的纖維素和纖維素酶的混合物,在80℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)72個小時。最終肌醇的終濃度是1.9g/L,轉(zhuǎn)化率為19%。
實驗例11體外多酶催化將纖維素轉(zhuǎn)化為肌醇
由于纖維素水解后的最終產(chǎn)物為葡萄糖,為了將其轉(zhuǎn)化為肌醇,還需要加入聚磷酸葡萄糖激酶和聚磷酸。
纖維素酶是來自于Sigma公司的產(chǎn)品,產(chǎn)品編號為C2730;葡萄糖磷酸變位酶、肌醇-3-磷酸合成酶和肌醇單磷酸酶的制備同實驗例1;聚磷酸葡萄糖激酶的制備同實驗例4;纖維多糖磷酸化酶、纖維二糖磷酸化酶的制備同實驗例7。
在一個0.75毫升的反應(yīng)體系中含有100mM的HEPES緩沖液(pH7.2),10mM的無機磷酸根,5mM的二價鎂離子,0.5mM鋅離子,5U/mL的纖維多糖磷酸化酶,5U/mL纖維二糖磷酸化酶,1U/mL的葡萄糖磷酸變位酶,5U/mL肌醇-3-磷酸合成酶和2U/mL的肌醇單磷酸酶,10g/L的如實驗例8的纖維素和纖維素酶的混合物,5U/mL的聚磷酸葡萄糖激酶,10mM聚磷酸鈉,在50℃進行催化反應(yīng),反應(yīng)72個小時。最終肌醇(圖8)的終濃度為6.5g/L,轉(zhuǎn)化率達到了65%。