專利名稱：一段淋球菌dna序列(3)特異性的確定及其應用的制作方法
技術領域：
本發(fā)明涉及一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)DNA序列(3)特異性確定及其應用，屬于生物醫(yī)學技術領域。
本發(fā)明的技術方案為本發(fā)明利用現(xiàn)有的方法確定了長度為190bp的一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)特異DNA序列(3)及其PCR引物，用引物進行PCR擴增，其序列如下cgggggatta ctccaaaact tccgctcaga aaatgattta aagacacttg gtaaatggat 60taaaggtcgt ttggaaagtc atggctgcct gcaaaataac gagaagatta cgcatgaaac 120cctacgcgaa tacggtaacg atcattttga gttacgttca accgataatc ctgatgtttg 180gctgctctca190引物序列為1. 5’-cgggggattactccaaaact-3’2. 5’-tgagagcagccaaacatcag-3’上述的淋球菌特異DNA序列作為基因芯片診斷的探針及PCR擴增檢測序列，用于淋球菌的臨床診斷。
用本發(fā)明建立的臨床檢測技術所使用的方法具有快速、準確、操作簡便、成本低等優(yōu)點。
圖2、圖2續(xù)是測序圖。其中圖2是測定的序列、圖2續(xù)是原始測序圖譜。
圖3是用Blast軟件對PCR擴增產物的測序結果與預計序列的比較分析。
圖4、圖4續(xù)是基因數(shù)據(jù)庫中Blast搜索結果。
圖5為基因芯片雜交結果。
本發(fā)明可用于PCR方法或基因芯片方法進行淋球菌的臨床檢測。用本發(fā)明提供的序列進行PCR擴增，根據(jù)PCR方法獲得產物是否出現(xiàn)和大小判斷是否為淋球菌感染。也可用本序列為探針，作為基因芯片中的一個檢測位點，然后用本發(fā)明中的PCR引物序列擴增臨床標本，并標記后進行雜交檢測。
說明書序列表<110>昆明寰基生物芯片開發(fā)有限公司<120>一段淋球菌DNA序列(3)特異性的確定及其應用<140><141><160>1<210>1<211>190<212>DNA<213>淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)<220><221>gene<222>(1)…(190)<400>1cgggggatta ctccaaaact tccgctcaga aaatgattta aagacacttg gtaaatggat 60taaaggtcgt ttggaaagtc atggctgcct gcaaaataac gagaagatta cgcatgaaac 120cctacgcgaa tacggtaacg atcattttga gttacgttca accgataatc ctgatgtttg 180gctgctctca190
權利要求
1.一段淋球菌DNA序列(3)特異性的確定，其特征在于該序列的長度為190bp，用引物進行PCR擴增，其序列如下cgggggatta ctccaaaact tccgctcaga aaatgattta aagacacttg gtaaatggat 60taaaggtcgt ttggaaagtc atggctgcct gcaaaataac gagaagatta cgcatgaaac 120cctacgcgaa tacggtaacg atcattttga gttacgttca accgataatc ctgatgtttg 180gctgctctca190引物序列為1. 5’-cgggggattactccaaaact-3’2. 5’-tgagagcagccaaacatcag-3’
2.一段淋球菌DNA序列(3)特異性的應用，其特征在于該序列用于診斷淋球菌的基因芯片的探針序列，并通過上述的引物序列進行PCR擴增，標記后進行雜交檢測或直接用于PCR診斷。
全文摘要
本發(fā)明涉及一段淋球菌DNA序列(3)特異性的確定及其應用，屬于生物醫(yī)學技術領域。本發(fā)明通過基因數(shù)據(jù)庫資料的搜尋和分析，確定了一段淋球菌DNA序列(3)的特異性及PCR擴增引物，該序列長度為190bp。通過對人類生殖道淋球菌感染標本的PCR擴增，克隆，獲得該序列，測序證明與預計序列一致。再經(jīng)生物信息學方法分析，基因芯片雜交分析，結果證實了該序列對于淋球菌的特異性。本發(fā)明作為基因芯片診斷的探針及PCR擴增檢測序列，用于淋球菌的診斷。用本發(fā)明建立的臨床檢測技術所使用的方法具有快速、準確、操作簡便、成本低等優(yōu)點。
文檔編號C07H21/04GK1465716SQ0213337
公開日2004年1月7日 申請日期2002年6月26日 優(yōu)先權日2002年6月26日
發(fā)明者譚德勇, 朱寶生 申請人:昆明寰基生物芯片開發(fā)有限公司