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一種代謝物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法及系統(tǒng)

文檔序號(hào):40522803發(fā)布日期:2024-12-31 13:32閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種基于非負(fù)矩陣分解和zinb圖自動(dòng)編碼器的代謝物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法,其特征在于,包括:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于非負(fù)矩陣分解和zinb圖自動(dòng)編碼器的代謝物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法,其特征在于,所述疾病綜合相似性由疾病語義相似性、疾病高斯核相似性和基于信息熵的疾病相似性整合而成;

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種基于非負(fù)矩陣分解和zinb圖自動(dòng)編碼器的代謝物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法,其特征在于,計(jì)算疾病語義相似性,包括:利用醫(yī)學(xué)主題詞構(gòu)建出有向無環(huán)圖作為疾病的描述符,從中計(jì)算出疾病的語義相似性;

4.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的一種基于非負(fù)矩陣分解和zinb圖自動(dòng)編碼器的代謝物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法,其特征在于,所述疾病綜合相似性由疾病語義相似性、疾病高斯核相似性和基于信息熵的疾病相似性整合而成,包括:

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于非負(fù)矩陣分解和zinb圖自動(dòng)編碼器的代謝物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法,其特征在于,還包括:測試所述模型。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于非負(fù)矩陣分解和zinb圖自動(dòng)編碼器的代謝物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法,其特征在于,測試所述模型,包括:

7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于非負(fù)矩陣分解和zinb圖自動(dòng)編碼器的代謝物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法,其特征在于,在預(yù)測之前,還包括:采用1:1的抽樣方法,隨機(jī)抽取與正樣本數(shù)量相同的負(fù)樣本。

8.一種基于非負(fù)矩陣分解和zinb圖自動(dòng)編碼器的代謝物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測系統(tǒng),其特征在于,包括:


技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明提供了一種代謝物?疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法及系統(tǒng),涉及生物信息學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,包括:構(gòu)建基于NMF和ZINB圖自動(dòng)編碼器的代謝物?疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測模型;模型包括:非負(fù)矩陣分解NMF模塊用于將代謝物?疾病關(guān)聯(lián)矩陣分解為兩個(gè)低秩的矩陣,得到疾病和代謝物低維特征;基于ZINB的圖自動(dòng)編碼器包括:GCN編碼器與ZINB解碼器,GCN對代謝物綜合相似性矩陣、疾病綜合相似性矩陣和代謝物?疾病關(guān)聯(lián)矩陣進(jìn)行編碼,輸出作為疾病和代謝物包含圖結(jié)構(gòu)和數(shù)據(jù)特點(diǎn)的特征;雙線性解碼器基于疾病和代謝物低維特征和包含圖結(jié)構(gòu)和數(shù)據(jù)特點(diǎn)的特征進(jìn)行預(yù)測;利用模型,得到代謝物和疾病有關(guān)聯(lián)或無關(guān)聯(lián)的預(yù)測結(jié)果。本發(fā)明能夠提高預(yù)測的準(zhǔn)確性和可靠性。

技術(shù)研發(fā)人員:寧喬,劉延鵬
受保護(hù)的技術(shù)使用者:大連海事大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2024/12/30
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